As Proteínas

As proteínas observadas na natureza evoluíram pela pressão selectiva

para efetuar funções específicas.

As propriedades funcionais das proteínas dependem da sua estrutura

tridimensional.

A estrutura tridimensional surge porque seqüências de aminoácidos

em cadeias polipeptídicas se enovelam a partir de uma cadeia linear em
domínios compactos com estruturas tridimensionais específicas.

Estes domínios servem como módulos para a construção de grande

agregados como partículas virais ou fibras musculares, podem formar
sítios catalíticos ou de interação encontrados em enzimas e também
proteínas que carregam oxigênio ou que regulam a função do DNA.
 Quaternária
Primária Secundária Terciária

Cadeias
polipeptídicas Empacotamento das
Algumas proteínas
estruras secundárias
Regiões da são compostas por
formando um ou
seqüência que várias estruturas
múltiplos domínios
formam estruturas terciárias
regulares
• Em geral na conformação trans
• Tem um carácter parcial de dupla ligação
(40%)
• Tem 0.133 nm, que é menor que uma ligação
simples típicas mas mais longa que uma
dupla
• Devido ao carácter de dupla ligação, os seis
átomos do grupo da ligação peptídica são
sempre planares
• N parcialmente positiva; O parcialmente
negativa
Estrutura primária de proteínas

Seqüência de aa da Ribonuclease A
 Forças fracas

• van der Waals: 0.4 - 4 kJ/mol

• Pontes de hidrogênio: 12-30 kJ/mol
• Ligações iônicas: 20 kJ/mol
• Interações hidrofóbicas: < 40 kJ/mol
Overlap de orbitais impedem algumas combinações de phi (φ) e psi
(ψ)

• phi = 0, psi = 180 é desfavorável

• phi = 180, psi = 0 é desfavorável
• phi = 0, psi = 0 é desfavorável
Diagrama de
Ramachandran
 Classes Estrutura Secundária
Todas as estruturas locais são
estabilizadas por pontes de hidrogênio
• Alfa hélice
• Outras hélices
• Folha Beta (composed of "beta strands")
• Dobras (dobras Beta)
 A Alfa Hélice
• Linus Pauling e Robert Corey em 1951
• Identificado na queratina por Max
Perutz
 A Alfa Hélice
Saiba esses números
• Resíduos por volta: 3,6
• Acréscimo por resíduos : 1,5 Angstroms
• Acréscimo por volta : 3,6 x 1,5A = 5,4 Angstroms
• O anel fechado por pontes de H numa alfa
hélice contêm 13 átomos
• phi = -60 graus, psi = -45 graus
 A folha Beta pregueada
Composta por fitas beta
• Pauling e Corey, 1951
• Fitas podem se paralelas or antiparalelas
• Acréscimo por resíduo:
•

– 3,47 Angstroms para fitas antiparalelas

– 3,25 Angstroms para fitas paralelas
– Cada fita de uma folha beta pode ser
imaginada como uma hélice com 2
resíduos por volta.
 A dobra Beta

• Permite a cadeia peptídea mudar de

direção
• A carbonila C de um resíduo faz ponte
de H com o próton amida de um resíduo
3 resíduos mais adiante
• Prolina e glicina sempre estão envolvidos
em dobras beta