FACULTAD DE CIENCIAS

EXPERIMENTALES

Estructura de la
protena VDAC-1
-Alejandro Ferreiro MoralesGrado en Biotecnologa
Curso 2014/2015

Estructura de la protena VDAC-1

Resumen
En la presente monografa se nos presenta un estudio exhaustivo de la estructura y de las funciones
de una protena mitocondrial esencial, VDAC-1. Para ello se han utilizado diversas bases de datos
que nos han servido para hacer las bsquedas y poder as desarrollar el trabajo. Con una estructura
supersecundaria de -barrel, VDAC-1 cambia su conformacin en el momento de llevar a cabo la
apoptosis para liberar el citocromo c. Su estudio actualmente es bastante interesante puesto que
interviene en enfermedades neurodegenerativas as como est presente en varios tipos de cncer.
As mismo se ha estudiado su estructura a un nivel general (estructura primaria secundaria y
terciaria) como a un nivel ms profundo para dejar de manifiesto la importancia que dijimos antes.
Finalmente concluiremos con las discusiones pertinentes que nos servirn de recapitulacin y cierre
a la monografa que aqu se ha presentado.

Introduccin
VDAC-1 (Voltage-dependent anion channel protein 1 de sus siglas en ingls) es una protena que
forma un canal a travs de la membrana mitocondrial externa y que se encuentra adems en la
membrana plasmtica. Este canal permite en la mitocondria la difusin de pequeas molculas
hidroflicas; mientras que en la membrana plasmtica participa en la regulacin del volumen celular
y de la apoptosis. Tambin se cree que puede participar en la formacin del PTCP (permeability
transition pore complex) responsable de la liberacin de productos mitocondriales (citocromo C
p.e.) que desencadenan los procesos apoptticos.
En el presente trabajo se estudiar a travs de distintas bases de datos la estructura de la protena
VDAC-1 para poder as explicar todos los procesos relacionados con ella. Adems, se recurrir a
diversos artculos cientficos que nos permitirn conocer con mayor precisin los procesos llevados
a cabo en esta protena. En conclusin, el objetivo del trabajo ser realizar un estudio estructural y
funcional de la protena VDAC-1 a partir de los estudios realizados por la comunidad cientfica.

Materiales y mtodos
En esta primera seccin del trabajo se detallarn las distintas bases de datos utilizadas a lo largo del
trabajo, as como el uso y manejo que se le ha dado a cada una de ellas. Del mismo modo, y para
asegurar el entendimiento, se realizarn dos secciones de bases de datos diferentes. A saber, una
seccin correspondiente con el estudio de la estructura de VDAC-1 y otra con el estudio de las
funciones asociadas a la misma.
(*) Los ttulos de las distintas bases de datos contienen un enlace, por lo estos no estarn presentes en la seccin de referencias.

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Bases de datos para el estudio de la estructura de VDAC -1

o UniProt. Sin duda (desde mi punto de vista), uno de los mejores motores de bsqueda y que
ms me ha servido a lo largo de la realizacin del trabajo. Adems de poseer una interfaz muy
sencilla de utilizar, contiene una gran cantidad de datos y enlaces que cubren la mayora de las
secciones a cumplimentar del estudio de protenas. Como sabemos, esta base de datos
contiene los datos del Swiss-Prot y del TrEMBL lo que nos permite conocer adems de las
secuencias nucleotdica y aminoacdica, las homologas entre organismos, predicciones de
estructuras tridimensionales, motivos de estructuras secundarias, dominios de interaccin,
conservacin de secuencias.
o ExPASy. Esta web (igual de completa que la anterior) proporciona acceso a bases de datos
cientficas y a distintas herramientas de software (recursos) en diferentes reas de las ciencias
biolgicas, incluida la protemica, genmica, filogenia, biologa de sistemas, gentica de
poblaciones, transcriptmica Su uso es muy sencillo pues una vez introducido el nombre de la
protena podremos elegir una de las secciones expuestas anteriormente y una vez dentro
encontraremos distintas opciones. Los servicios ms carac-tersticos que encontramos aqu son
los siguientes:

UniProtKB: informacin sobre la funcionalidad de las protenas

UniProt: Base de datos comentada anteriormente
STRING: Nos proporciona informacin acerca de las interacciones protena-protena
PDB (Protein Data Bank): En concreto, la seccin PDBsum nos permite conocer motivos
de estructura secundaria, as como el ploteo de Ramachandran y los datos
correspondientes con los ngulos de torsin de los aminocidos de la protena.

o EBI (European Bioinformatics Institute). Esta ltima base de datos ha sido utilizada para trabajar
con la estructura tridimensional de la protena pues cuenta con una amplia gama de modelos
tridimensionales muy tiles para el estudio realizado. Su uso es muy simple, simplemente
tendremos que introducir el nombre de la protena en cuestin en la barra de bsqueda,
seleccionar la especie deseada para el estudio y ya podremos acceder a toda la informacin.
Bases de datos para el estudio de las funciones de VDAC -1
o PubMed. Esta seccin de NCBI (National Center for Biotechnology Information) es una excelente
base de datos para la bsqueda de artculos cientficos y publicaciones encuadrados en una
amplia gama de temas diferentes. Su uso es muy simple, pues solo tendramos que acceder a
travs del enlace adjuntado al ttulo de la base e introducir en la barra de bsqueda un ttulo,
palabra clave, autor en funcin de lo que deseemos encontrar. Una vez hecho esto no saldr
el listado de todos los artculos que posee el servidor y solo tendremos que seleccionar el que
nos interese u ordenarlos segn nuestras preferencias (por relevancia, fecha).

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o Scopus. Esta segunda (y ltima) base de datos utilizada para el conocimiento de las funciones de
VDAC-1 tiene un funcionamiento muy similar a la anterior con dos notables diferencias. En
cuanto a la bsqueda de informacin, nos permite acotar el criterio de bsqueda de una
manera ms eficaz pues adems de permitirnos buscar por diferentes campos al igual que
PubMed, nos permite realizar ms de un campo de bsqueda, por ejemplo, buscar un artculo
con una determinada palabra clave, de un autor concreto y publicado en un ao especificado (3
campos de bsqueda diferentes). La segunda diferencia notable, y es quizs la ms pertinente,
es la forma de acceder. Mientras que para realizar bsquedas en PubMed slo tenamos que
acceder al enlace y realizar la bsqueda, Scopus es un servicio con un carcter menos pblico y
solo para personal determinado. Sin embargo, accediendo desde los servidores de la biblioteca
de la UPO y con nuestro usuario y contrasea se puede realizar cualquier tipo de bsqueda.

Resultados
A lo largo de esta seccin se desglosar en distintas partes el anlisis estructural y funcional de la
protena VDAC-1. En primer lugar se desarrollarn, de menor a mayor complejidad, los temas que
se encuadran en la estructura proteica para acabar esta seccin de resultados con los datos que se
corresponden con las funciones asociadas a la protena.
(a) Secuencia nucleotdica. En primer lugar nos encontramos con el nivel estructural ms bsico
que tiene relacin con una protena y es la secuencia de nucletidos que dar lugar a un ARN m
que una vez realizada la traduccin, ser traducido a la protena en cuestin. En la Fig. 1 se nos
muestra la secuencia nucleotdica de la protena. En la misma se aprecian zonas coloreadas de
azul, que muestran exones unidos a otros mediante un proceso de splicing alternativo, que permite descartar los intrones del transcrito primario antes de la traduccin [1].
ATG
TTC
TCT
ACC
CTG
ACT
TTC
CGG
TCC
CAG
GTT
ACA
GCT
GCA
AAC
AAA
CAC

GCT
ACC
GAG
AAA
ACG
GTG
TCA
GAG
ATC
ATG
GGC
GAG
GTC
GCC
TCC
CTG
AAG

GTG
AAG
AAT
GTG
TTT
GAA
CCT
CAC
CGG
AAT
TAC
TTT
AAT
AAG
AGC
ACA
CTT

CCA
GGC
GGA
ACG
ACA
GAT
AAC
ATT
GGT
TTT
AAG
GGC
CTT
TAT
CTG
CTG
GGT

CCC
TAT
TTG
GGC
GAG
CAG
ACT
AAC
GCT
GAG
ACT
GGC
GCC
CAG
ATA
TCA
CTA

ACG
GGA
GAA
AGT
AAA
CTT
GGG
CTG
CTG
ACT
GAT
TCC
TGG
ATT
GGT
GCT
GGA

TAT
TTT
TTT
CTG
TGG
GCA
AAA
GGC
GTG
GCA
GAA
ATT
ACA
GAC
TTA
CTT
CTG

GCC
GGC
ACA
GAA
AAT
CGT
AAA
TGC
CTA
AAA
TTC
TAC
GCA
CCT
GGA
CTG
GAA

GAT
TTA
AGC
ACC
ACC
GGA
AAT
GAC
GGT
TCC
CAG
CAG
GGA
GAC
TAC
GAT
TTT

CTT
ATA
TCA
AAG
GAC
CTG
GCT
ATG
TAC
CGA
CTT
AAA
AAC
GCC
ACT
GGC
CAA

GGC
AAG
GGC
TAC
AAT
AAG
AAA
GAT
GAG
GTG
CAC
GTG
AGT
TGC
CAG
AAG
GCA

AAA
CTT
TCA
AGA
ACA
CTG
ATC
TTC
GGC
ACC
ACT
AAC
AAC
TTC
ACT
AAC
TAA

TCT
GAT
GCC
TGG
CTA
ACC
AAG
GAC
TGG
CAG
AAT
AAG
ACG
TCG
CTA
GTC

GCC
TTG
AAC
ACT
GGC
TTC
ACA
ATT
CTG
AGC
GTG
AAG
CGC
GCT
AAG
AAT

AGG
AAA
ACT
GAG
ACC
GAT
GGG
GCT
GCC
AAC
AAT
TTG
TTC
AAA
CCA
GCT

GAT
ACA
GAG
TAC
GAG
TCA
TAC
GGG
GGC
TTT
GAC
GAG
GGA
GTG
GGT
GGT

GTC
AAA
ACC
GGC
ATT
TCC
AAG
CCT
TAC
GCA
GGG
ACC
ATA
AAC
ATT
GGC

Fig.1. Secuencia nucleotdica de VDAC-1

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(b) Secuencia aminoacdica. El segundo grado de complejidad en la estructura de una protena lo

encon-tramos en su estructura primara, es decir, en la secuencia de aminocidos unidos por

enlace peptdico. En el caso de VDAC-1, la secuencia aminoacdica est formada por 283
aminocidos que resultan de la traduccin de 852 nucletidos del ARN m. En la Fig. 2, al igual
que en el caso anterior, se muestran en un color azul los aminocidos traducidos de exones
diferentes antes de realizarse el splicing para eliminar los intrones. Adems, en rojo se
encuentran sealados los aminocidos codificados a travs de una splice junction o nudo de
empalme, es decir, los aminocidos traducidos entre un exn y el siguiente [1].
MAVPPTYADL
KYRWTEYGLT
EHINLGCDMD
HTNVNDGTEF
SLIGLGYTQT

GKSARDVFTK
FTEKWNTDNT
FDIAGPSIRG
GGSIYQKVNK
LKPGIKLTLS

GYGFGLIKLD
LGTEITVEDQ
ALVLGYEGWL
KLETAVNLAW
ALLDGKNVNA

LKTKSENGLE
LARGLKLTFD
AGYQMNFETA
TAGNSNTRFG
GGHKLGLGLE

FTSSGSANTE
SSFSPNTGKK
KSRVTQSNFA
IAAKYQIDPD
FQA

TTKVTGSLET
NAKIKTGYKR
VGYKTDEFQL
ACFSAKVNNS

Fig. 2. Secuencia aminoacdica de VDAC-1

Una vez conocidas las informaciones bsicas acerca de la estructura de VDAC-1, hemos de
adentrarnos en lo referente a su estructura secundaria, ploteo de Ramachandran, estructura
tridimensional Sin embargo, para todo esto debemos empezar conociendo los dominios que
posee la protena. En nuestro caso, es muy sencillo debido a que VDAC-1 contiene un solo dominio
(Eukaryotic porin domain type 3), tal y como podemos ver en la Fig. 3 [2].

Fig.3. Dominio estructural de VDAC-1

Al ser conocido ya para nosotros el dominio estructural de VDAC-1 nos centraremos en aspectos a
desarrollar de diversos temas en cuanto a los arreglos tridimensionales de nuestra protena.
(c) Ploteo de Ramachandran. En el ploteo (Fig. 4), observamos tres zonas coloreadas rojo que se
corresponden con las conformaciones permitidas donde no hay impedimento estrico dentro
de la protena. Estas tres regiones se corresponden con la zonas A, B y L. La zona A representa
los puntos que se corresponden con las hlices- ya que los ngulos psi y phi varan entre los 50 y los -60. En la zona B, se recogen las conformaciones en forma de hoja-, debido a que los
ngulos se mueven entre los 130 psi y los -140 phi. Por ltimo, la zona L se correspondera con
las hlices- de giro levgiro.

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Observando el ploteo correspondiente a VDAC-1 podemos deducir que la estructura secundaria

de la misma contendr un alto contenido de hojas- y un nmero bastante menor de hlices-
debido a la gran acumulacin de puntos en la zona roja marcada con la letra B [3]

Fig.4 Ploteo de Ramachandran VDAC-1

(d) Estructura secundaria. Gracias a la informacin proporcionada con el ploteo de Ramachandran,

se ha podido deducir experimentalmente la estructura secundaria de VDAC-1. En la Fig. 5 se
muestra grficamente la estructura secundaria de la protena a medida que avanzamos por su
secuencia de aminocidos. Adems, incluye adems junto a esta respresentacin una leyenda
que explica el significado de casa smbolo as como un recuadro que recoge las estructuras que
se presentan [4]. As mismo, en la Fig. 6 se representa la topologa de la protena, es decir, una
representacin de sus arreglos de estructura secundaria de una manera sencilla para poder as
facilitar su comprensin [5].

Fig.5 Esquema estructura secundaria de VDAC-1

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Fig.6 Esquema de la topologa de VDAC-1

(e) Estructura tridimensional. En este ltimo apartado correspondiente a la estructura terica de la
protena que nos acontece podremos encontrar distintas imgenes correspondientes a la forma
tridimensional de la misma, gracias a la utilizacin de programas informticos de prediccin de
estructura terciaria con tan slo introducir la secuencia aminoacdica en formato FASTA. Todo
ello queda recogido en la Fig. 7 [6]. Como podemos observar una vez vista las imgenes es que
nuestra protena tiene una estructura supersecundaria en forma de -barrel.

Fig.7 Estructura terciaria de VDAC-1

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Llegados a este punto conocemos a grosso modo todas las particularidades generales que presenta
la estructura de VDAC-1. Es a partir de este momento de la monografa donde empezaremos a
tocar los aspectos relacionados con las particularidades pertenecientes a esta estructura como lo
son tres bloques fundamentales. A saber:

Conservacin de la secuencia aminoacdica

Homologa con otras especies
Interaccin con otras protenas
Modificacin de los aminocidos
Modificaciones postraduccionales
Sitios de inters
Regiones de inters

(f) Conservacin de los aminocidos de la estructura primaria. En el mundo de la bioinformtica,

la conservacin de aminocidos nos permite comparar dos o ms secuencias de aminocidos
para resaltar sus zonas de similitud, que podran informarnos acerca de relaciones evolutivas o
funcionales entre las mismas. En la Fig. 8 podemos observar la secuencia primaria de VDAC-1 en
la que los aminocidos estn coloreados segn una escala de menor a mayor conservacin que
encontraremos en una leyenda bajo ella [7]. As mimo, en la Fig. 9 podemos encontrar una
estimacin tridimensional de la protena que nos acontece en la que se sealan las zonas ms y
menos conservada dentro de la misma [8].
MAVPPTYADL
KYRWTEYGLT
EHINLGCDMD
HTNVNDGTEF
SLIGLGYTQT

GKSARDVFTK
FTEKWNTDNT
FDIAGPSIRG
GGSIYQKVNK
LKPGIKLTLS

GYGFGLIKLD
LGTEITVEDQ
ALVLGYEGWL
KLETAVNLAW
ALLDGKNVNA

LKTKSENGLE
LARGLKLTFD
AGYQMNFETA
TAGNSNTRFG
GGHKLGLGLE

FTSSGSANTE
SSFSPNTGKK
KSRVTQSNFA
IAAKYQIDPD
FQA

TTKVTGSLET
NAKIKTGYKR
VGYKTDEFQL
ACFSAKVNNS

Fig.8 Conservacin de aminocidos de VDAC-1

Fig.9 Conservacin de aminocidos de VDAC-1 (forma tridimensional)

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(g) Homologa con otras especies. Puesto que VDAC-1 es una protena con un inters especial
dentro de todos los organismos al desarrollar procesos apoptticos, mltiples son las especies
que presentan esta protena. Sin embargo, dos son los organismos con una homologa mayor,
es decir, especies en las que la similitud es casi mxima. Es el caso de Mus musculus y Rattus
norvegicus [9, 10]
(h) Interaccin con otras protenas. La VDAC-1 establece diferentes relaciones con otras protenas
cercanas como podemos ver en la Fig. 10 [11].

Fig.10 Interacciones de VDAC-1 con otras protenas

UBC: Ubiquitina C.
BCL2L1: Inhibidor potente de la muerte celular, que inhibe la activacin de las caspasas.
Parece regular la muerte celular mediante el bloqueo de VDAC mediante la unin a la
misma y la prevencin de la liberacin del activador de caspasas, CYC1, de la membrana
mitocondrial. Tambin acta como un regulador de punto de control de G2 y la progresin
a la citocinesis durante la mitosis.
SLC25A6: Transportador mitocondrial que cataliza el intercambio de ADP citoplasmtico
con ATP mitocondrial a travs de la membrana mitocondrial interna. Participan adems en
la formacin del complejo de poro de transicin de permeabilidad (PTVC) responsable de la
liberacin de los productos mitocondriales que desencadenan la apoptosis.
PPIF: Interviene en la regulacin del poro de transicin de permeabilidad mitocondrial
(MPTP). Se propone que su asociacin con el MPTP est enmascarando un sitio de unin
para la inhibicin de fosfato inorgnico (Pi) y promueve la apertura de la MPTP que
conduce a la apoptosis o a la necrosis.
BAX.
BAK1: En presencia de un estmulo apropiado, acelera la muerte celular programada
mediante la unin a, y antagonizando la accin apopttica de anti- BCL2.

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 PRKCE: Juega un papel esencial en la regulacin de mltiples procesos celulares vinculados

a protenas del citoesqueleto, tales como la adhesin celular, la motilidad, la migracin y el

ciclo celular, las funciones en el crecimiento de la neurona y la regulacin de los canales
inicos, y est implicado en la respuesta inmune, la invasin y la regulacin de la apoptosis
de clulas de cncer.
HK1: Hexoquinasa 1.
MCL1: Secuencia de leucemia de clulas mieloides 1.
TOMM22: Componente del receptor central de la translocasa de la membrana externa de la
mitocondria (complejo TOM) responsable del reconocimiento y la translocacin de preprotenas mitocondriales sintetizadas en el citosol. Junto con Tom20, funciona como un
receptor perifrico en la recepcin del pptido de trnsito y facilita el movimiento de preprotenas en el poro de translocacin.
(i) Modificaciones de los residuos de aa. Las modificaciones de los aminocidos juegan con
frecuencia un papel de gran importancia en la correcta funcionalidad de la protena. En la Tabla
1 se recogen las principales modificaciones de los residuos de la protena especificndose el
residuo afectado as como el tipo de la modificacin acontecida en cada caso [12].

Tabla 1. Modificaciones de los aminocidos de VDAC-1

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(j) Modificaciones postraduccionales de la protena. La modificacin postraduccional de una

protena es un cambio qumico ocurrido en sta despus de su sntesis. Las modificaciones
postraduccionales ocurren mediante cambios qumicos de los aminocidos que constituyen las
protenas y pueden ser de muchos tipos [12].
La fosforilacin en Ser-193 por NEK1 promueve el estado conformacional abierto
evitando la excesiva permeabilidad de la membrana mitocondrial y la posterior muerte
celular por apoptosis despus de la lesin.
Ubiquitinacin por PARK2 durante mitofagia, lo que lleva a su degradacin y mejora de
mitofagia. Desubiquitinada por USP30.
(k) Sitios de inters. Los sitios de inters son aminocidos en la secuencia que no estn definidos
en ninguna otra subseccin de la protena. En esta subseccin se puede mostrar en distintas
secciones dependiendo de su contenido. En la Tabla 2 se recogen los sitios de inters de la
protena que estamos tratando [12].

Tabla 2. Sitios de inters de VDAC-1

(l) Regiones de inters. En VDAC-1 encontramos des regiones de unin a nucletidos fosfatos.
Siempre est incluida en ms de un aminocido, incluidos todos los residuos envueltos en la
unin del nucletido. En la Tabla 3 se recogen todos los datos de estas zonas de unin a
nucletidos. Adems, en la Fig. 11 podemos encontrar el estado conformacional abierto de
nuestra protena para permitir la unin a nucletidos descrita anteriormente [12].

Tabla 3. Regiones de inters de VDAC-1

Fig.11Estado conformacional abierto de VDAC-1 para la interaccin con NAD

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Una vez terminado el anlisis estructural de la protena VDAC-1, hemos de pasar al apartado en el
que tocaremos todo lo referente a los procesos y enfermedades en los que nuestra protena se
encuentra presente, que en su mayor parte tienen que ver con procesos apoptticos y producen
diversas enfermedades como es el caso del cncer y el Alzheimer.

VDAC-1 se encuentra participando de lleno en las rutas metablicas y de supervivencia de nuestro

organismo. Adems controla la diafona metablica entre las mitocondrias y el resto de la clula
permitiendo la afluencia y el flujo de salida de metabolitos, iones, nucletidos, Ca 2+ La ubicacin
de VDAC-1 en la membrana mitocondrial externa permite su interaccin con protenas que median
y regulan la integracin de las funciones mitocondriales con actividades celulares. Como
transportador de metabolitos, VDAC-1 contribuye al fenotipo metablico de las clulas cancerosas.
De hecho, esta protena se sobre-expresa en muchos tipos de cncer, y el silenciamiento de la
expresin de sta induce una inhibicin del desarrollo del tumor. Al mismo tiempo, junto con la
regulacin de la produccin de energa celular y el metabolismo, VDAC-1 est involucrada en el
proceso de la apoptosis mediada por mitocondrias por la mediacin de la liberacin de protenas
apoptticas y la interaccin con protenas anti-apoptticas. La participacin de VDAC-1 en la
liberacin de protenas apoptticas ubicadas en el espacio intermembranoso implica la
oligomerizacin de nuestra protena que media la liberacin del citocromo c al citosol, conduciendo
posteriormente a la muerte celular por apoptosis. La apoptosis tambin puede ser regulada por
VDAC-1, sirviendo como un punto de anclaje para las protenas mitocondriales de interaccin, tales
como la Hexoquinasa (HK), Bcl2 y Bcl-xL, algunos de los cuales tambin son expresados en muchos
tipos de cncer. Al unirse con VDAC-1, HK proporciona tanto un beneficio metablico como un
aumento de la apoptosis supresora que ofrecen a la clular una ventaja proliferativa y aumentar su
resistencia a la quimioterapia. Por lo tanto, estas y otras funciones apuntan a VDAD-1 como un
excelente objetivo para alterar el metabolismo reprogramado de las clulas cancerosas y su
capacidad para evadir la apoptosis [13,14].

La disfuncin mitocondrial y el dao sinptico se han descrito como eventos tempranos en la

patognesis del Alzheimer. Las investigaciones recientes usando cerebros postmortem de ratones
afectados con Alzheimer y modelos celulares, revelaron que el amiloide y la hiperfosforilacin de
tau estn involucrados en la disfuncin mitocondrial y el dao sinptico en el Alzheimer. Adems,
tambin se ha revelado que los niveles de VDAC-1 son elevados en las regiones afectadas con esta
enfermedad dentro de los tejidos corticales de ratones transgnicos. En adicin, las nuevas
investigaciones con cerebros afectados por Alzheimer, revelaron que VDAC-1 est vinculada al
amiloide y a tau fosforilada, que bloquea el poro de transicin de permeabilidad mitocondrial e
interrumpe el transporte de protenas y metabolitos mitocondriales, causando defectos en la
fosforilacin oxidativa, lo que lleva a la disfuncin mitocondrial en las neuronas del cerebro [15].

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La enfermedad de Parkinson es el trastorno neurodegenerativo del movimiento ms comn. Las

mutaciones en PINK1 y PARKIN son las causas ms frecuentes de enfermedad recesiva de
Parkinson. Sin embargo, su contribucin a la patognesis molecular sigue siendo poco clara. Se han
investigado en los ltimos tiempos, pasos mecanicistas de una va PINK1/PARKIN enlazando daos
mitocondriales, ubiquitinacin y autofagia en clulas neuronales y no-neuronales. La actividad
quinasa de PINK1 a su secuencia de localizacin mitocondrial son los requisitos previos para inducir
la translocacin del Parkin ligasa E3 a las mitocondrias despolarizadas. Posteriormente, Parkin
media la formacin de dos cadenas de poliubiquitina distintas, unidas a travs de residuos de lisina.
Sorprendentemente, se ha identificado a VDAC-1 como un objetivo para la poliubiquitinacin de
lisina mediada por Parkin y para la mitofagia. Por otra parte, las mutaciones patognicas de Parkin
interfieren con pasos distintos de translocacin mitocondrial y final a travs de mitofagia. Por lo
tanto, podemos concluir que la ruta metablica PINK1/PARKIN induce a la activacin de la mitofagia
por parte de la protena VDAC-1 [16].

Discusin
Una vez terminado el estudio de la protena VDAC-1, es el momento de discutir los resultados
obtenidos. En una anlisis conjunto (estructural-funcional) hemos de concluir que VDAC-1 es una
protena esencial para el organismo y que no slo est implicada en rutas metablicas, sino en el
desencadenamiento de la apoptosis y favoreciendo en casos extremos la formacin de cncer o
enfermedades neurodegenerativas tales como el Alzheimer y el Parkinson. Es por ello que el
conocimiento de esta protena es esencial para entender los procesos apoptticos de muerte
celular programada que tienen lugar en la clula, al ser fenmenos fundamentales.
Tras hacer un estudio bastante completo, podemos concluir adems que hemos llegado a nuestro
objetivo, en otras palabras, conocer con mayor profundidad esta protena que sin duda alguna es
una de las ms caractersticas dentro de la mitocondria y, si cabe, dentro de la clula.

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Referencias
[1] www.ncbi.nlm.nih.gov/CCDS/CcdsBrowse.cgi?REQUEST=CCDS&DATA=CCDS4168
[2] http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/cgibin/pdbsum/GetPage.pl?pdbcode=2jk4&template=wirpfam.html&r=wiring&l=1&chain=A&pfam=TRUE&for
m=TRUE&nres=500
[3] http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/cgibin/pdbsum/GetPage.pl?pdbcode=2jk4&template=procheck_summary.html
[4] http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/cgibin/pdbsum/GetPage.pl?pdbcode=2jk4&template=wirlarge.html&r=wiring&l=1&large=TRUE&chain=A
[5] http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/cgibin/pdbsum/ShowTopoldia.pdf?pdb=2jk4&pdf=YES&file=domA01.plt
[6] http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/cgi-bin/pdbsum/ViewFigs.pl?pmid=18832158&figure=2
[7] http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/cgibin/pdbsum/GetPage.pl?pdbcode=2jk4&template=wirlarge.html&r=wiring&l=1&large=TRUE&chain=A&o=R
ESCONS
[8] http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/cgi-bin/pdbsum/RunContour.pl
[9] http://www.informatics.jax.org/marker/MGI:106919
[10] http://rgd.mcw.edu/rgdweb/report/gene/main.html?id=RGD:621575
[11] http://string-db.org/newstring_cgi/show_network_section.pl
[12] http://www.uniprot.org/uniprot/P21796
[13] Shoshan-Barmatz V, Ben-Hail D, Admoni L, Krelin Y, Tripathi SS. The mitochondrial voltage-dependent
anion channel 1 in tumor cells. Biochim Biophys Acta. 2014 Nov 4.
[14] Keinan N, Pahima H, Ben-Hail D, Shoshan-Barmatz V. The role of calcium in VDAC1 oligomerization and
mitochondria-mediated apoptosis. Biochim Biophys Acta. 2013;1833:17451754
[15] Reddy PH. Is the mitochondrial outermembrane protein VDAC1 therapeutic target for Alzheimer's
disease? Biochim Biophys Acta. 2013 Jan;1832(1):67-75.
[16] Geisler, S., Holmstrm, K.M., Skujat, D., Fiesel, F.C., Rothfuss, O.C., Kahle, P.J. , Springer, W.
PINK1/Parkin-mediated mitophagy is dependent on VDAC1 and p62/SQSTM1. Nature Cell Biology. Volume
12, Issue 2, February 2010, Pages 119-131

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