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Desarrollo de Herramientas

Moleculares para el estudio de


enfermedades transmitidas por
garrapatas

Marisa Farber, PhD


Inst. Biotecnologia
INTA (National Institute for Agricultural Technology)
Buenos Aires, Argentina

Tristeza bovina (Bovine Tick-Borne Diseases)


Babesiosis: Babesia bovis, Babesia bigemina
Anaplasmosis: Anaplasma marginale.
En Argentina:

30S
33S
Boophilus microplus
Babesia enzootic area
A. marginale enzootic area

65W

Ticks & TBD free area

Las prdidas econmicas directas por reduccin de peso o mortalidad, y los


costos para el tratamiento y la prevencin de estas enfermedades, mediante
vacunas vivas en la Argentina, se han estimado en US$ 38.9 millones al ao.

Babesiosis: Babesia bovis,


Babesia bigemina

Anaplasmosis: Anaplasma marginale

Ciclo de vida

RELEVANCIA SOCIAL, ECONOMICA Y


PRODUCTIVA DEL PROBLEMA

Demanda de alimentos en el mundo

Devaluacin del peso en el 2001, la suba del tipo de cambio real,


crecimiento de la economa
Suba de precios internacionales
PRODUCCION DE CARNE VACUNA 2000-2006
Produccin (*) Exportacin (**) Expo/Prod. (%)
Ao
2000
2.489
342
12,6%
2001
2.526
152
6,1%
2002
2.664
351
13,9%
2003
3.024
392
14,7%
2004
3.132
631
20,9%
2005
3.132
771
24,6%
2006
3.030
565
18,6%
(*) miles de toneladas res
Fuente: SAGyPA

(**) miles de toneladas res con hueso

Distribucin de la produccin ganadera en


Argentina
Stock de 49.000.000 bovinos
Pampa hmeda concentra el 60%
NEA posee el 24% del stock
NOA tiene el 8,4%

LABORATORIO DE HEMOPARASITOS

Un poco de historia
Comenz por el Diagnstico
Continu con Vacunas
Se extendi a la Epidemiologa

Aprovechamiento de la informacin
genmica para el desarrollo de
herramientas aplicadas al Estudio de la
Babesiosis y Anaplasmosis Bovinas

GENOMICA FUNCIONAL:

ANTIGENOS

VACUNAS

GENOMAS

EPIDEMIOLOGIA

DIAGNOSTICO

En qu trabajamos?

Produccin de antgenos recombinantes para


determinaciones serolgicas
Desarrollo de nuevos mtodos de diagnstico
Herramientas para aplicar a estudios epidemiolgicos

Estudios bsicos
Protenas de exportacin y factores de virulencia
en Anaplasma
- Familia de Perforinas en Babesia sp.

Bsqueda de nuevos antgenos


Sistemas de expresin heterloga

En qu trabajamos?

Produccin de antgenos recombinantes para


determinaciones serolgicas
Desarrollo de nuevos mtodos de diagnstico
Herramientas para aplicar a estudios epidemiolgicos

Estudios bsicos
Protenas de exportacin y factores de virulencia
en Anaplasma
- Familia de Perforinas en Babesia sp.

Bsqueda de nuevos antgenos


Sistemas de expresin heterloga

La tcnica de Reverse Line Hybridization (RLB) puede ser


utilizada para la deteccin simultnea de diversas especies
cepas de parsitos en muestras de aislamientos.
La introduccin de la sonda general (catch all) permite la
deteccin de parsitos an no descriptos.

Se ha desarrollado este mtodo para parsitos


transmitidos por garrapata tales como Theileria ssp.,
Babesia ssp., Ehrlichia ssp. y Anaplasma ssp.
Permite la caracterizacin de numerosas muestras en un
mismo ensayo partiendo de un producto de PCR.

RLB
Primers:
Anaplasma ssp.
HER-F: AGAGTTGGATCMTGGYTCAG
EHR-R: AGAAGAAGTCCCGGCAAACT
Babesia ssp.
RLB-F2: GACACAGGGAGGTAGTGACAA
RLB-R2: B-CTAAGAATTTCACCTGTGACAGT
Sondas:
A. centrale especfica:
TCGAACGGACCATACGC
A. marginale especifica:
GACCGTATACGCAGCTTG
Anaplasma ssp. catch all:
GGGGGAAAGATTTATCGCTA

B. bovis especfica:
CAGGTTTCGCCTGTATAATTGAG
B. bigemina especfica:
CGTTTTTTCCCTTTTGTTGG
Babesia ssp. catch all.
CTGTCAGAGGTGAAATTCT

Reverse Line Blot Hybridization para la deteccin


e identificacin de Babesia spp y Anaplasma spp.

Deteccin de polimorfismo en la sonda especfica


para B. bigemina
Observations

Name

Currenly used probe

MEXICO
BgM2P

Pathogenic B. bigemina from Chavarria,


Corrientes, Argentina

BgS1A
BgS1A
BgS2P
BgS2P.clone1
Pathogenic B. bigemina

G
G
G

T
T
T

T
T
T

T
T
T

T
T
T

T
T
T

T
T
T

Sequence
C C C T
C C C T
C C C T

BgM2P

Possible options for BgM2P sequences

Attenuated B. Bigemina

C
C
C

BgS2P.clone2
BgS2P.clone3
BgS2P

Attenuated B. Bigemina from Alen-Cue,


Corrientes, Argentina

BgM1A

Pathogenic B. bigemina from Alen-Cue,


Corrientes, Argentina

BgM1P

C
C
C
C
C
C

G
G
G
G
G
G

T
T
T
T
T
T

T
T
T
T
T
T

T
T
T
T
T
T

T
T
T
T
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T

T
T
T
T
T
T

T
T
T
T
T
T

C
C
C
C
C
C

C
C
C
C
C
C

C
C
C
C
C
C

T
T
T
T
T
T

C
C
C
C
C

G
G
G
G
G

T
T
T
T
T

T
T
T
T
T

T
T
T
T
T

T
T
T
T
T

T
T
T
T
T

T
T
T
T
T

C
C
C
C
C

C
C
C
C
C

C
C
C
C
C

T
T
T
T
T

B. bigemina from Brasil

Details
T
C
C
G
T
C
T
G
C
G
G
C
C
C
C
C
C
C
G
G
C
T
G
T
C

T
T
T
G

T
T
T

G
T
T
G

T
T
T

T
C
T
C

G
G
G

T
T
G
G
G
G

T
T
T
T
T
T

T
G
T
T
T
T

T
G
T
T
T
G
G
T
G
T

T
T
T
T
T

T
G

T
T
T
T
T
T

C
T
T
T
T
T

G
G
G
G
G
G

G
G
G
G
G
G

T
T
T
T
T

T
T
T
T
T

G
G
G
G
G

G
G
G
G
G

C
T
C
C
C
T
T

T
G

T
G

T
T
G
G

T
T
T
T

G
T
T
T

T
T
T
T

T
C

T
C
T
T

G
G
G
G

G
G
G

B. bigemina P
B. bigemina A
B. bigemina T

C
C
C
C

G
G
G
G

T
T
T
T

T
T
T
T

T
T
T
T

T
T
T
T

T
T
T
T

T
T
T
T

C
C
C
C

C
C
C
C

C
C
C
C

T
T
T
T

T
C
G
C

CLONED

Jul-04

PCR

Nov-04

PCR

Nov-04

CLONED

Jul-04

PCR

Sep-II-04

CLONED

Jul-04

CLONED

Sep-04

CLONED

Sep-04

CLONED

Sep-04

PCR

Sep-II-04

PCR

Nov-05

PCR

Nov-05

PCR

Nov-05

Secuencias para membrana


B. bigemina M

Reference sample

G
G
G
G

Reverse Line Blot Hybridization para la deteccin


e identificacin de Babesia spp y Anaplasma spp.

Deteccin de B. bigemina por PCR:

Inmunosensor ptico basado en MSP5 para el


diagnstico de A. marginale

Distribucin de Unidades Arbitrarias de Fluorescencia (F.A.U) de 12 sueros


negativos (barras negras) y 9 sueros de bovinos infectados con A. marginale.
7

Anaplasma spp uninfected cattle


Anaplasma spp infected cattle

Number of sera

6
5
4

Valor de corte: 40 F.A.U


Sensibilidad 95%
Especificidad 83%

3
2
1

>1
01

91
-1
00

81
-9
0

71
-8
0

61
-7
0

51
-6
0

41
-5
0

31
-4
0

21
-3
0

10
-2
0

F.A.U at 670 nm

Comportamiento del inmunosensor en muestras de campo: concordancia con el


ELISAc como gold standard
Negativos
Positivos
Positivos

25

Negativos

IS

Concordancia entre las dos


pruebas: 88%

En qu trabajamos?

Produccin de antgenos recombinantes para


determinaciones serolgicas
Desarrollo de nuevos mtodos de diagnstico
Herramientas para aplicar a estudios epidemiolgicos

Estudios bsicos
Protenas de exportacin y factores de virulencia
en Anaplasma
- Familia de Perforinas en Babesia sp.

Bsqueda de nuevos antgenos


Sistemas de expresin heterloga

Muestreo NEA y NOA

Diseo del muestreo: Establecer zonas de riesgo en funcin del nmero


de generaciones de garrapatas que nos permite definir 3 regiones de baja,
media y alta transmisibilidad respectivamente, las cuales se asocian
indirectamente las condiciones climticas, uso de garrapaticida, etc.

Hiptesis de trabajo: Definir marcadores moleculares que permitan


asociar los indicadores de riesgo con la variabilidad gentica de los
aislamientos.

Marcadores moleculares
Regiones repetidas en tandem en genes que codifican para
protenas de superficie: A. marginale (MSP1a), B. bovis (Bv80, TRAP,
P200, Antigen 3, Desmoyokin), B bigemina (P200, PLP)
Primer For

MACF
Primer Rev

1 2 3 4 5 6 7 8 9

PCR amplification of the repeat region from


different isolates of B. bigemina. 1:BgS2P,
2:BgS1A, 3:BgM1P, 4:BgM1A, 5 and 6:BgMx
(Jg29), 7:BgBr, 8:BgM2P, 9:negative control.

Marcadores moleculares
VNTR (Variable number of tandem repeats) : A. marginale (AMTR 15 y
AMTR11). En desarrollo para Babesia sp

MLST (Multilocus Sequence Typing): seleccin de los genes blanco


(housekeeping
genes),
determinacin
de
la
especificidad,
secuenciacin de los fragmentos amplificados, bsqueda de
polimorfismo de nucletidos simples (SNPs), determinacin de la tasa
de sustitucin para verificar que los genes seleccionados respondan a
modelos de evolucin neutra.

DataBase
The ACCESS data base (DB) includes information about
4189 bovine samples from Northeast (1198) and
Northwest (2991) Argentina.
DB fields correspond to information describing sampling
(date, responsible, place of work), the field (region,
province, locality, department, field coordinates), the
cattle (breed, age, tick control strategies), the sample
evaluation (ELISA, PCR, RLBH), molecular
characterization: Polymorphic genes, VNTR, MLST.
Based on the information required, different queries were
designed. These queries enable the DB user to easily
extract information about the 4189 samples.

RLBH detection
NE A
NOA
100

T ota l

90
80
70
60
50
40
30
20
10

Eo
m

bi
A
B
bo

B
%

bo
A

iA

Eo

Eo
m

bi
Eo
Bb
%

bo
B

B
%

bo

bi
A

Eo

o
iE

Am
%

Bb
%

bi
A
B

bo

Eo

bi

bo
B
%

bo

eg

Eo
%

m
A

i%

Bb

bi

o-

B
Bb

%
%

A+

bo

to
t
%

Eo

to
t
%

bi
%

B
%

bo

to
t

to
t

La proporcin de animales co-infectados con A. marginale y Babesia sp result


significativamente alta (P<0.001). Posteriormente se estudi la asociacin entre el
status de co-infeccion y factores que pudieran influenciar el riesgo de co-infeccin
usando un modelo de regresion lineal multivariado. Los factores que se consideraron
fueron el lugar de origen y la edad de los bovinos.

En qu trabajamos?

Produccin de antgenos recombinantes para


determinaciones serolgicas
Desarrollo de nuevos mtodos de diagnstico
Herramientas para aplicar a estudios epidemiolgicos

Estudios bsicos
Protenas de exportacin y factores de virulencia
en Anaplasma
- Familia de Perforinas en Babesia sp.

Bsqueda de nuevos antgenos


Sistemas de expresin heterloga

Inmunogenicidad de protenas de membrana o exportacin


PCR sustractiva
Library phoA

Seleccin de antgenos candidatos

Bibliografa
Bioinformtica

Caracterizacin bioinformtica

Antigeno

Identificacin

Caractersticas

TolC

Library PhoAC

OMP conservada.
Sistema secrecin TipoI.

OMP85

Library PhoAC

OMP conservada.
Antgeno protectivo

OMP 4

Library PhoAC

Familia de antgenos superficie

PhoAc

Library PhoAC

L22

PCR sustractiva

OMP Cluster conservado


patgenos y simbiontes
intracelulares.

Adh

Dominios
transmembrana

Probable adhesina

AM 742

Dominios
transmembrana

Hypotetical protena -

Verificar la transcripcin
Expresin de protenas recombinantes

Ensayos de linfoproliferacin
Perfil de estimulacin de citoquinas
Western blot

Los genes que codifican protenas


exportadas pueden identificarse mediante
fusiones traduccionales al gen de la fosfatasa
alcalina (phoA) de Escherichia coli.
La actividad de fosfatasa alcalina se manifiesta
cuando la enzima se encuentra fuera del mbito
citoplasmtico.
El gen reportero phoA utilizado no posee
su promotor ni la regin que codifica
el pptido seal amino terminal.
La actividad PhoA se detecta fcilmente
utilizando BCIP como sustrato.

Actividad de PhoA de acuerdo con la localizacin subcelular

NH2

MEDIO EXTERNO

NH2

Membrana externa
NH2

PERIPLASMA

NH2
NH2

Membrana interna

CITOPLASMA

NH2
NH2

PhoA enzimticamente inactiva


PhoA enzimticamente activa

Segmento hidrofbico
de transmembrana

Bsqueda de protenas exportables

Clonado y expresin de fusiones a


PhoA en Escherichia coli CC118

Inmunogenicidad de protenas de membrana o exportacin

Seleccin de antgenos candidatos


Caracterizacin bioinformtica
Verificar la transcripcin
Expresin de protenas recombinantes

Ensayos de linfoproliferacin
Perfil de estimulacin de citoquinas
Western blot

Predicted
ORF

Signal
peptide

TM
Domains

TM Pred

ID

Name

Annotation

Nucleotide

Signal P

AM
1108

PhoAC

Hypothetical
protein

2076

AM
127

L22

Hypothetical
protein

3000

AM
216

Adh

Hypothetical
protein

PhoAC Orf

1
2
1

Ortologos

Conserved
domain

Pentapeptide
repeat

B-Lectin

Blast2GO

Uniprot

Pentapeptide
repeat

Pentapeptide
repeat domain
protein
Acetamidase
formamidase
family protein

Conserved
cluster within
Anaplasmas
and Ehrlichias

2529

+
1

L22

Conserved
cluster within
intracellular
pathogens and
endosymbionts

Adh

Inmunogenicidad de protenas de membrana o exportacin


Seleccin de antgenos candidatos
Caracterizacin bioinformtica
Verificar la transcripcin
Expresin de protenas recombinantes

Ensayos de linfoproliferacin
Perfil de estimulacin de citoquinas
Western blot

Confirm la expresin de los


genes candidatos

Inmunogenicidad de protenas de membrana o exportacin


Seleccin de antgenos candidatos
Caracterizacin bioinformtica
Verificar la transcripcin
Expresin de protenas recombinantes

Ensayos de linfoproliferacin
Perfil de estimulacin de citoquinas
Western blot

Inmunogenicidad de protenas de membrana o exportacin


Seleccin de antgenos candidatos

Ensayos con animales naturalmente


infectados (Mercedes, Corrientes)
N ID

Caracterizacin bioinformtica
Verificar la transcripcin

Infectados/ no
infectados

Msp5-PCR

Control

No
infectado

282

Infectado

Aguda

285

Infectado

Crnico

99

Infectado

Crnico

Expresin de protenas recombinantes

Ensayos de linfoproliferacin
Perfil de estimulacin de citoquinas
Western blot
Confirm la infeccin por pcr diagnostica del gen msp5
Respuesta positiva fuerte para PhoAC ORF y Adh Cterm y
mas dbil para los antgenos L22 N term y Adh Nterm

Inmunogenicidad de protenas de membrana o exportacin


Seleccin de antgenos candidatos
Caracterizacin bioinformtica
Verificar la transcripcin
Expresin de protenas recombinantes

msp5

PhoAC

Adh-

Adh+

Ensayos de linfoproliferacin
Perfil de estimulacin de citoquinas
L22 Cterm

Western blot

PhoAc 5

PhoAC

RT qPCR Citokine expression profile

Factorof UP-regulatation

AM1108 PhoAC ORF

AM216 Adh-

4,5

4,5

3,5

3,5

2,5

2,5

1,5

1,5

0,5

0,5

IL2

IL10

IL12p35

TNF

INF

IL2

IL10

IL12p35

TNF

INF

Results were presented as ratios calculated with the Relative expression software tool (REST@)
application described by Plaffl et al. The value of PCR efficiency for all transcripts was 2, as
calculated following the formula: E = 10[-1/slope].

Regulation factor of cytokine profile


IL2

IL10

IL12p35

TNF

IFN

Enhanced expression

PhoAC

1,18

1,39

1,49

2,71

1,98

TNF, IFN

Adh- (C-term)

1,41

2,27

1,46

1,63

2,52

IL2, IL10, IL12, TNF,


IFN

Inmunogenicidad de protenas de membrana o exportacin

Seleccin de antgenos candidatos


Caracterizacin bioinformtica
Verificar la transcripcin
Expresin de protenas recombinantes

Ensayos de linfoproliferacin
Perfil de estimulacin de citoquinas
Western blot

Identificacin y caracterizacin de nuevos


antgenos candidatos capaces de estimular
una respuesta inmunolgica especfica

Blancos potenciales para ser


estudiados en nuevas
formulaciones vacunales.

Twin arginine translocation pathway: TAT system


Sistema de traslocacin de protenas plegadas a travs de la
membrana interna de bacterias Gram-negativas.

Twin arginine translocation pathway: TAT system

Identificacin de los componentes del sistema: tatA, B y C y su organizacin

en el genoma en las

alphaproteobacterias.

Estudio la transcripcin de los genes y la regulacin .

Funcionalidad de tatABC en sistema heterologo de mutantes de Escherichia


coli.

Identificacin de los componentes del sistema: tatA, B y C y


su organizacin en el genoma

Anaplasma marginale

Brucella abortus

tatAB

Dispersa

Operon

tatBC

tatC-Ser

Funcionalidad de tatABC en sistema heterologo de Escherichia coli


Tat A,B y C

E coli TatA-

Promotor Tat Ecoli


AmaTatA,B,C

pUNIp

E coli TatB-

3404 bp

Anaplasma marginale
E coli TatC-

Brucella abortus

Escherichia coli (Controles)

Viabilidad en SDS 2%

A marginale

B abortus

Tat A

Funcional

TatB

No funcional

Funcional

TatC

No funcional

Funcional

En qu trabajamos?

Produccin de antgenos recombinantes para


determinaciones serolgicas
Desarrollo de nuevos mtodos de diagnstico
Herramientas para aplicar a estudios epidemiolgicos

Estudios bsicos
Protenas de exportacin y factores de virulencia
en Anaplasma
- Familia de Perforinas en Babesia sp.

Bsqueda de nuevos antgenos


Sistemas de expresin heterloga

Anlisis de la regin que contiene el dominio MACPF

Estudio in silico (colaboracin Natalia Rego y Hugo Naya de la Divisin de


Bioinformtica del Instituto Pasteur de Montevideo)
Prediccin de estructura de los genes con dos gene finders basados en HMM:
Fgenesh entrenado con P. falciparum y Glimmer HMM entrenado con el
cromosoma II y III de B. bovis.
La anotacin pblica de cromosomas de B. bovis y Theileria sp. permiti el estudio de la
ortologa y sintenia entre estos cromosomas y los contigs de B. bigemina
Hasta el momento hemos identificado 6 genes con dominio MACPF y estamos
trabajando en la anotacin y la verificacin de los resultados con estudios in vitro
CDS de 1 Exn:
BbiPLP1 3721 pb; BbiPLP2 3240pb

BbiPLP1
Seal TATA

Pptido seal

BbiPLP2

Regin polimrfica (PLR: perforin like


repeat)
Dominio MACPF (Smart)
BbiPLP1: 623pb y BbiPLP2: 655pb
Sitio Poly A

Verificacin de la expresin de la BbiPLP1


A
RT + RT-

ADNg

B
ADNg RT+ RT-

C
RT+ RT-

ADNg

RT- PCR. A: cDNA Merozotos BbiMx, B: cDNA Merozotos BbiS3 y


C: cDNA Fases sexuales BbiMx

En qu trabajamos?

Produccin de antgenos recombinantes para


determinaciones serolgicas
Desarrollo de nuevos mtodos de diagnstico
Herramientas para aplicar a estudios epidemiolgicos

Estudios bsicos
Protenas de exportacin y factores de virulencia
en Anaplasma
- Familia de Perforinas en Babesia sp.

Bsqueda de nuevos antgenos


Sistemas de expresin heterloga

Identificacin de potenciales nuevos antgenos de B.


bigemina a partir de un anlisis protemico

Optimizacin de la purificacin de protenas totales de merozotos del aislamiento argentino BbiS2P


-Infeccin experimental con BbiS2P de terneros esplenectomizados
- Purificacin de merozotos (estado intraeritroctico) con gradiente de Percoll
- Preparacin del extracto de protenas solubles totales
- Optimizacin del Isoelectroenfoque
- Optimizacin del SDS- PAGE
- Optimizacin del mtodo de deteccin de las protenas (Coomassie coloidal)
-Transferencia de los perfiles proticos a membranas PVDF
- Inmunoscreening con sueros bovinos
A

Gel en 2D teido. IEF: tiras de 7 cm, rango de pH 4-7 y SDSPAGE 10%. A: protenas de merozotos de BbiS2P. B: protena de
eritrocitos no infectados

Descubrimiento de biomarcadores peptdicos para


diagnstico: aplicacin para el diagnostico de la
babesiosis bovina
-Se utilliz una pipeline bioinformatica (desarrollada por Santiago Carmona y Fernan
Agero- IIB UNSAM) diseada para identificar antigenos peptidicos a partir del genoma
anotado de parasitos patgenos.
-La pipeline define una funcin lineal que permite hacer un ranking de pptidos solapados
de 12 residuos aminoacidicos a partir de los fragmentos virtuales provenientes del
proteoma in silico del parasito (Babesia bovis)
-Se consideraron los siguientes atributos para obtener la puntuacin de los peptidos:

Atributos Positivos

-regiones estructuradas vs. no estructuradas


-repeticiones
-sitios de glicosilacin
-localizacin subcelular
-Medida del sesgo en el uso de codones (CAI)

Atributos Negativos
-Secuenciaas conservadas en el proteoma bovino
-Secuencias conservadas en el proteoma de
Theileria

Diseo del microarray de peptidos

Luego de inspeccionar manualmente los peptidos con mayor puntaje se seleccionaron 83


peptidos, entre lo que se incluyen peptidos de reactividad conocida y los nuevos candidatos.
Se imprimieron los vidrios con los 85 peptidos y otros peptidos utilizados como control (JPT
Peptide Technologies, Alemania)
Durante los proximos periodos se interrogar el array con grupos de sueros de bovinos
infectados y sueros control.

En qu trabajamos?

Produccin de antgenos recombinantes para


determinaciones serolgicas
Desarrollo de nuevos mtodos de diagnstico
Herramientas para aplicar a estudios epidemiolgicos

Estudios bsicos
Protenas de exportacin y factores de virulencia
en Anaplasma
- Familia de Perforinas en Babesia sp.

Bsqueda de nuevos antgenos


Sistemas de expresin heterloga

Vectores virales: Capaces de estimular las diferentes vas


del sistema inmune generando proteccin efectiva.

Genticamente atenuados.
Llevar secuencias de inters en posiciones que no sean esenciales para la
replicacin viral.

Fcil produccin (bajo costo) y administracin.

Estables, inocuos.

Poxvirus recombinantes: renen estas caractersticas.


En Poxvirus, el ADN forneo se inserta por recombinacin homloga in vivo y
la expresin se consigue insertando el gen de inters bajo regulacin de
secuencias promotoras tempranas de poxvirus.

Vector de transferencia
pE- X - t

poxvirus

Sitio blanco de insercin

pE: promotor temprano de poxvirus


X: gen de inters.
t: terminador de transcripcin y traduccin

poxvirus recombinante

recombinacin
homloga in vivo

pE- X - t

Teniendo en cuenta que:


La eficiencia de transfeccin es baja en cultivos primarios.
La frecuencia de ocurrencia de doble recombinacin (intercambio allico) no se puede cuantificar.
El virus salvaje replica normalmente.

Screening por actividad de una enzima marcadora


Actividad de la enzima B-glucuronidasa codificada por el
gen bacteriano uidA. Screening con X-Gluc (sustrato de la
enzima GUS)

Vector de transferencia

pH6- GUS- t

Poxvirus

pE/L-XX - t

Gen no esencial

recombinacin homloga in vivo

Poxvirus recombinante

pH6-GUS- t

pE/L -XX - t

1- Subclonar el gen de inters en el vector de transferencia.


2- Infeccin de un cultivo celular con el virus salvaje.
3- Transfeccin del VT con las clulas infectadas.
4- Seleccin de los poxvirus recombinantes.

5- Obtencin de un stock
puro.
6- Caracterizacin molecular y biolgica de los recombinantes
seleccionadas.

Objetivo
Disear, construir y caracterizar un MVA recombinante (MVAr) que exprese un
multiantgeno consistente en epitopes de tipo B y T de tres protenas
inmunognicas de B. bovis.
Epitopes T
Espitopes B
Produccin INF -
Estado donde esta presente

Rap-1
S
S
S
Merozoto

Msa-2c
ND
S
ND
Esporozoto

Hsp20
S
S
S
Espor/Mero

Conservacin entre cepas

Localizacin subcelular

Roptrias

Mem. Plsm.

Citosol y MP

ND: No determinado

Construccin del
Multiantgeno
Extraccin de ADNg o ARN de merozotos y amplificacin de los genes
en cuestin con primers especficos.
Clonado en vector de tipo T por separado e ingeniera gentica para
subclonar y fusionar los genes.
Secuenciacin para verificar correcta orientacin.

1- Subclonar el gen de inters en el vector de transferencia.


2- Infeccin de un cultivo celular con el virus salvaje.
3- Transfeccin del VT con las clulas infectadas.
4- Seleccin de los poxvirus recombinantes.
5- Obtencin de un stock puro.

6- Caracterizacin molecular y biolgica de los recombinantes


seleccionados.
1) Anlisis mediante PCR sobre ADN total purificado de FEP infectados o no para
determinar:
A) Presencia del gen de inters, pero stocks no
puros (no homogneo)
M
WT

22
C

23

24

1.8

B) Pureza de stocks recombinantes


(homogneos)
M

21 22 23
WT C

24

WT M 21

1.8

0.54

0.54

Pasaje 5

Pasaje 9

22

23 24

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