Bioqumica Integrada

Lista de Exerccios sobre Estrutura e Funo de Protenas

1.

Descrever e esquematizar as estruturas regulares que

compe a estrutura secundria de protenas.

2.

Quais os tipos de interao que mantm a estrutura

terciria de protenas?

3.

Como os grupos polares e apolares se distribuem na

estrutura terciria de protenas globulares?

4.

A maioria das protenas globulares so desnaturadas por

uma breve exposio a 65oC, mas algumas delas, com
muitas ligaes dissulfeto, devem ser aquecidas por mais
tempo e a temperaturas mais altas para desnaturarem.
Uma dessas protenas, denominada BPTI, tem apenas 58
aminocidos numa nica cadeia e trs pontes dissulfeto.
Aps a desnaturao trmica e resfriamento da soluo, a
atividade da BPTI restaurada. Qual a base molecular
dessa propriedade?

5.

Considere a sequncia abaixo e responda:

a.

Onde pode ser predita a formao de dobras na

protena? Por qu?

b.

Onde ligaes covalentes intra-cadeia podem ser

formadas?

c.

Assumindo que esta sequncia parte de uma protena

globular maior, onde na estrutura tridimensional (no
interior ou exterior da protena) poderiam ser
encontrados os seguintes aminocidos: Asp, Ile,Thr,
Ala, Gln, Lys? E se esta fosse uma protena integral
de membrana?

3. Como os grupos polares e apolares se distribuem na estrutura terciria de protenas

globulares?
4. A maioria das protenas globulares so desnaturadas por uma breve exposio a 65 oC, mas
algumas delas, com muitas ligaes dissulfeto, devem ser aquecidas por mais tempo e a
temperaturas mais altas para desnaturarem. Uma dessas protenas, denominada BPTI, tem
d. apenasQue
tipo denuma
interaes
fazer
os aminocidos
58 aminocidos
nica cadeiapodem
e trs pontes
dissulfeto.
Aps a desnaturao
trmica e resfriamento
da soluo,
a atividade
BPTI
restaurada.
a base molecular
numerados
como
5, 8,da16,
27
e 28 naQual
estrutura
dessa propriedade?

terciria da protena?

5. Considere a sequncia abaixo e responda:

a. Onde pode ser predita a formao de dobras na protena? Por qu?

6.

queligaes
so grupos
um exemplo,
b.OOnde
covalentes prostticos?
intra-cadeia podemD
ser formadas?

citando as

c.funes.
Assumindo que esta sequncia parte de uma protena globular maior, onde na
estrutura tridimensional (no interior ou exterior da protena) poderiam ser encontrados
os seguintes aminocidos: Asp, Ile,Thr, Ala, Gln, Lys? E se esta fosse uma protena
Apenas
20 aminocidos so utilizados na sntese de
integral de membrana?

7.

protenas nos ribossomos, mas existem protenas com

d. Que tipo de interaes podem fazer os aminocidos numerados como 5, 8, 16, 27 e 28

aminocidos
diferentes
na estrutura terciria
da protena?desses 20. Explique e d um

exemplo.
6. O que
so grupos prostticos? D trs exemplos, citando as funes.
7. Apenas 20 aminocidos so utilizados na sntese de protenas nos ribossomos, mas existem
Seda,
e queratina
so
protenas
com
protenas
comcolgeno
aminocidos diferentes
desses 20.
Explique
e d exemplos.

8.

caractersticas
as semelhanas
e
8. Seda,
colgeno e queratinacomuns.
so protenasDescreva
com caractersticas
comuns. Descreva as
semelhanas
e diferenas
entre
elas.
diferenas
entre
elas.

9. Algumas protenas esto em contato com as membranas celulares. Como elas podem se
organizar
espacialmente
em relao
membrana
e que tiposcom
de estruturas
secundrias so
Algumas
protenas
esto
em contato
as membranas
comuns
nessas protenas?
celulares.
Como elas podem se organizar espacialmente

9.

10. Discuta:
estrutura primria
de uma protena
determina
suade
forma
tridimensional.
emarelao
membrana
e que
tipos
estruturas
11. O que
so domnios? Um
mesmo
domnio pode
ser encontrado
em protenas de funes
secundrias
so
comuns
nessas
protenas?
diferentes? Explique.
12. QualDiscuta:
o papel das a
chaperonas?
10.
estrutura primria de uma protena determina
13. Algumas
conformao alterada so causa de doenas degenerativas, como
suaprotenas
formacom
tridimensional.
Alzheimer e a encefalopatia espongiforme (doena da vaca louca). Comente.

11.

O que so domnios? Um mesmo domnio pode ser

encontrado em protenas de funes diferentes? Explique.

12.

Qual o papel das chaperonas?

13.

Todas as protenas tem uma estrutura quaternria? O que

a estrutura quaternria? D um exemplo de uma protena
com estrutura quaternria.

14.

Discuta o que leva a diferentes curvas de afinidade da

mioglobina e da hemoglobina com oxignio.

15.

O que o efeito Bohr? Qual sua importncia no papel da

hemoglobina?

16.

Explique os efeitos da mutao que causa a anemia

falciforme na estrutura e funo da hemoglobina.