bDNA assays:

un ensayo de ADN ramificado es un ensayo de amplificacin de la seal (en comparacin

con un ensayo de amplificacin de la diana) que se utiliza para detectar molculas de
cido nucleico.
El sistema de ensayo de 8 bDNA se utiliz para medir la carga viral en 87
muestras de pacientes infectados por el VIH en diversos regmenes de
tratamiento,incluyendo la triple terapia de drogas consiste en nelfinavir, AZT y 3TC.
http://nar.oxfordjournals.org/content/25/15/2979.full.pdf

Classical qualitative PCR:

En qPCR cuantitativa, una qumica especfica o no especfica de deteccin permite la
cuantificacin del producto amplificado. La cantidad detectada en un punto determinado
de la carrera est directamente relacionado con la cantidad inicial de diana en la muestra.
Software PCR cuantitativa utiliza la fase exponencial de PCR para la cuantificacin. PCR
es inicialmente un proceso exponencial pero eventualmente alcanza una fase de meseta,
cuando uno de los reactivos se ve limitada. Las reacciones pueden estabilizarse a
diferentes niveles, incluso si tienen la misma concentracin de partida de la diana.
http://www.eurogentec.com/uploads/qpcr-guide.pdf

Cleavace-invader Technology:
Tecnologa / invasor Cleavase es un mtodo de amplificacin de la sonda que se basa en
el reconocimiento especfico y la escisin de las estructuras particulares de ADN por los
miembros de la solapa endonucleasa-1 familia de ADN polimerasas (Lyamichev, 1999).
Los cientficos necesitan rpida, rentable, y las pruebas de fcil uso para la deteccin de
mutaciones. En 1993, Third Wave desarroll un sistema que incluye mtodos novedosos y
enzimas para la deteccin y la escisin de ADN y ARN
http://www.expertconsultbook.com/expertconsult/ob/book.do?
method=display&type=bookPage&decorator=none&eid=4-u1.0-B978-1-4377-09742..00066-X--s0075&isbn=978-1-4377-09742#lpState=open&lpTab=contentsTab&content=4-u1.0-B978-1-4377-0974-2..00066-X-s0080%3Bfrom%3Dtoc%3Btype%3DbookPage%3Bisbn%3D978-1-4377-09742&search=none
http://www.atp.nist.gov/eao/sp950-3/third_wave.pdf
Cycling Probe Technology:
Tecnologa de sonda de ciclo (CPT) es un mtodo rpido, simple, isotrmica para la
deteccin de secuencias diana especficas. CPT utiliza una nica secuencia de la sonda
quimrica de ARN-ADN-ADN que proporciona un enlace escindible sensible a la RNasa H
cuando se hibridan a una secuencia de ADN diana complementaria. En presencia de ADN
diana, la reaccin de ciclacin convierte de longitud completa de la sonda quimrico en
fragmentos de sonda escindidos, que se acumulan y se cuantifican

Un ciclo de sonda Tecnologa (CPT) de ensayo con un dispositivo de flujo lateral (tira) fue
desarrollado para la deteccin del gen mecA de Staphylococcus aureus (MRSA) culturas
resistentes a la meticilina.
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0890850899902359
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC86959/
Degnerate Oligomucleotide PCR (DOP-PCR):
La reaccin en cadena de la polimerasa cebado oligonucletido degenerado (DOP-PCR)
fue desarrollado con el fin de amplificar de forma representativa ADN para estudios
citogenticos. DOP-PCR es una herramienta fiable para amplificar el ADN con precisin y
de manera uniforme. Ha sido ampliamente utilizado para amplificar el ADN de FACS
ordenados cromosomas o de micro diseccionado bandas cromosmicas.
C. Kiss et al. / Biomolecular Engineering 19 (2002) 31/34
Digital PCR:
PCR digital funciona mediante la particin de una muestra de ADN o ADNc en muchos
individual, las reacciones de PCR paralelas; algunas de estas reacciones contienen la
molcula diana (positivo), mientras que otros no lo hacen (negativo). Una sola molcula
puede ser amplificado de un milln de veces o ms.
Aplicaciones dPCR:
Absoluta La cuantificacin de la carga viral
Absoluto Cuantificacin de Normas de cido nucleico
Absoluta Cuantificacin de Next Gen Secuenciacin Bibliotecas
Deteccin alelo raro
Low Fold Copy Number Discriminacin
Enriquecimiento y la separacin de mezclas
http://www.lifetechnologies.com/mx/es/home/life-science/pcr/digital-pcr.html
DNA Cloning:
Para obtener mltiples copias de un gen o de otra pieza de ADN debe aislar, o "corte", el
ADN de su fuente y luego "pegar" en un vector de ADN que puede replicarse (o copiar) en
s.
Trabajar a cabo la funcin del gen
Investigar las caractersticas de un gen (tamao, expresin, distribucin tisular)
Mira cmo las mutaciones pueden afectar la funcin de un gen
Hacer grandes concentraciones de la protena codificada por el gen
http://biotechlearn.org.nz/themes/dna_lab/dna_cloning

Dot Blot:
Un dot blot es una tcnica en la biologa molecular utilizado para detectar biomolculas, y
para la deteccin, anlisis, y la identificacin de protenas. En una transferencia puntual
las biomolculas que se detecten no se separan primero por electroforesis. En su lugar,
una mezcla que contiene la molcula a detectar se aplica directamente sobre una
membrana en forma de punto, y luego se detecta a travs de plantillas circulares
directamente sobre la membrana o sustrato de papel.
Dot blot se utiliza para detectar anticuerpos Antidiacyltrehalose en pacientes tuberculosos
y la fiebre tifoidea. Este examen podra aumentar el nmero de vidas salvadas que se ven
afectados con estas enfermedades.
http://docsetools.com/articulos-noticias-consejos/article_136440.html
General Hybridization:
Hibridacin normal requiere el aislamiento de ADN o ARN, que lo separa en un gel, que
secante sobre nitrocelulosa y sondaje con una secuencia complementaria.
La composicin de la solucin de hibridacin es crtica en el control de la eficiencia del
proceso de hibridacin. La hibridacin depende de la capacidad del oligonucletido para
hibridarse a una cadena de mRNA complementario justo por debajo de su punto de fusin
(Tm). El valor de la Tm es la temperatura a la que un medio del oligonucletido est
presente en una forma monocatenaria.
http://www.genedetect.com/insitu.htm
General PCR Primers:
Las reacciones de PCR requieren cebadores, u oligonucletidos (oligos), para comenzar
la replicacin del ADN hebra. Un cebador de PCR incorrecta puede conducir a una
reaccin-fracasado en el que se sintetiza el fragmento del gen mal o ningn fragmento.
El anlisis de secuencia del virus del papiloma humano (VPH) de cebador general de GP5
/ 6 productos de PCR mediadas revel la presencia de secuencias cortas altamente
conservadas adyacentes a los extremos 3 'de ambos cebadores.
http://learn.genetics.utah.edu/content/labs/pcr/
Journal of General Virology (1995), 76, 1057-1062. Printed in Great Britain
Helicase-Dependant Amplification:
es un mtodo de amplificacin de ADN isotrmica que es similar a la PCR convencional,
sino que utiliza la accin de una enzima helicasa termoestable, en lugar de calor para
separar los cidos nucleicos y permitir cebadores marcados para hibridarse a la plantilla
de ADN y alargar bajo la accin de la polimerasa.
Helicasa dependiente de amplificacin para el diagnstico ms simple de la
tripanosomiasis africana humana
http://www.quidel.com/molecular-diagnostics/helicase-dependent-amplification-tests

Hot start PCR:

Se utilizan cada vez para mejorar el rendimiento de la PCR. Desde el inicio del arranque
en caliente como un medio de bloqueo de extensin de ADN polimerasa a temperaturas
ms bajas, un nmero de enfoques han sido desarrollados que se dirigen a los
componentes de reaccin esenciales, tales como iones de magnesio, ADN polimerasa,
cebadores de oligonucletidos, y dNTPs.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20301005
Hybrid Capture assay:
Hybrid Capture es una tcnica de amplificacin de la seal, lo que significa que la seal
quimioluminiscente o fluorescente se amplifica para ayudar a la deteccin, en lugar de el
ADN diana se amplifica por PCR. El ensayo HC2 utiliza hibridacin de cidos nucleicos y
deteccin quimioluminiscente de microplacas.
Ser utilizado desde abril de 2012 como mtodo de deteccin de cepas de VPH de alto
riesgo en el programa de cribado de citologa cervical NHS.
http://www.ganfyd.org/index.php?title=Hybrid_capture_assay
http://www.medscape.com/viewarticle/727399_11
In Isu Hybridization:
La hibridacin in situ (ISH) es un tipo de hibridacin que utiliza un ADN o ARN de cadena
complementario marcado (es decir, la sonda) para localizar un ADN especfico o
secuencia de ARN en una parte o seccin de tejido (in situ) o en el tejido entero (todo el
montaje ISH). Localizacin de las transcripciones endgenos es un enfoque deseable
para confirmar los patrones de expresin.
En combinacin con inmunocitoqumica, hibridacin in situ puede relacionarse
microscpica informacin topolgica a la actividad del gen en el ADN, ARNm, y el nivel de
protena.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23681627
http://nhjy.hzau.edu.cn/kech/zwswjs/kc/ziliao/FISH.pdf
Inverse PCR:
Se puede utilizar para amplificar de manera eficiente y rpidamente regiones de
secuencia desconocida que flanquean cualquier segmento identificado de ADNc o ADN
genmico, los investigadores no tienen que construir y cribar bibliotecas de ADN no
identificado para obtener informacin de la secuencia de ADN adicional utilizando esta
tcnica. Algunos fagos recombinantes o plsmidos pueden ser inestables en bacterias y
bibliotecas amplificados tienden a perderlos. IPCR elimina este problema.
http://link.springer.com/protocol/10.1385%2F1-59259-177-9%3A301
Isothermal PCR:
Protocolos de amplificacin isotrmica son variadas y tienen variadas ventajas. Sin
embargo, algunas ventajas comunes son que las tcnicas isotrmicas son
extremadamente rpido y que no requieren termocicladores.
https://www.neb.com/applications/dna-amplification-and-pcr/isothermal-amplification

Ligase chain reaccin:

es un mtodo similar a la PCR, pero basndose en la funcin de una ligasa termoestable
(normalmente la ligasa de Thermus aquaticus).Al igual que con la PCR, con la LCR se puede
amplificar una secuencia de ADN concreta, as como determinar una mutacin de una base
nucleotdica.

Esta tcnica se limita a la deteccin de cambios de pares de bases de A-TFF-A

de
G-C / C-G o viceversa. Por ejemplo, LCR con huecos no poda distinguir 13 A
globina a partir de [3 B globina (A-- ~ T transversion) porque no hay diferencia
en
las bases necesarias para llenar la brecha. Un principio similar se aplica
tambin en el
reaccin en cadena de la reparacin (RCR), que se ha utilizado para la
deteccin del virus del papiloma humano (VPH) 16.
http://es.wikipedia.org/wiki/Reacci%C3%B3n_en_cadena_de_la_ligasa
http://genome.cshlp.org/content/3/4/S51.full.pdf+html
Northern bolt:
una transferencia de Northern es una herramienta eficaz, los protocolos de transferencia
de Northern tradicionales son complicados, que consume tiempo, y por lo general un
inconveniente para los usuarios. Mtodos lquidos de transferencia de Northern son
rpidos pero requieren instrumentos para la deteccin de seales fluorescentes. A
continuacin, describimos un protocolo alternativo, la hibridacin lquido y el desarrollo de
color (LHCD), basado en la rapidez de la hibridacin lquido y la amplificacin de la seal
de complejo avidina-biotina (ABC) para la deteccin. LHCD puede distinguir una
diferencia de un nucletido dentro de una familia miARN y permitir la deteccin sensible
de 2,5 f mol de miRNAs. Adems, LHCD no slo es simple y rpido, pero la deteccin es
visual y por lo tanto no requiere equipo costoso. LHCD es fcil de aprender y conveniente
para los anlisis de miRNA.
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1046202312001818
loop-mediated isothermal amplification:
una tcnica de amplificacin de cidos nucleicos isotrmica. En contraste con la
tecnologa de reaccin en cadena de la polimerasa (PCR) en el que se lleva a cabo la
reaccin con una serie de pasos alternados de temperatura o ciclos, la amplificacin
isotrmica se lleva a cabo a una temperatura constante, y no requiere un ciclador trmico.
Mientras que LAMP est siendo ampliamente estudiado para detectar enfermedades
infecciosas, como la tuberculosis, la malaria y la enfermedad del sueo en las regiones en
desarrollo, que todava tiene que ser ampliamente validada por otros patgenos comunes
http://en.wikipedia.org/wiki/Loop-mediated_isothermal_amplification

Microarray:
Un chip de ADN (del ingls DNA microarray) es una superficie slida a la cual se une una
coleccin de fragmentos de ADN. Las superficies empleadas para fijar el ADN son muy
variables y pueden ser de vidrio, plstico e incluso de silicio.

Estudio de genes, que se expresan diferencialmente en condiciones diversas

(sanos/enfermos, mutantes/salvajes, tratados/no tratados).

Clasificacin molecular en enfermedades complejas. Identificacin de genes

caractersticos de una patologa (firma o signature).

Prediccin de respuesta a un tratamiento

Deteccin de mutaciones y polimorfismos de un nico gen (SNP)

http://es.wikipedia.org/wiki/Chip_de_ADN

Microsphere-based array:
Debido a que cada microesfera est conectada pticamente a una fibra, las interacciones
especficas de cada superficie de las microesferas se pueden monitorizar de forma
independiente. ptica de deteccin basados en microesferas de ADN fibra es una
alternativa viable a otros mtodos de microarrays de alto rendimiento.
Anlisis tpico microarrays implica la comparacin de dos estados fisiolgicos variadas;
Por ejemplo, el tejido canceroso en comparacin con tejido no canceroso. Estos ensayos
se hibridan dos bibliotecas de ADNc representativos simultneamente, empleando dos
colorantes diferentes para representar cada estado. De esta manera, las microesferas que
muestran mayor seal para un colorante se relacionan directamente con mayores
ocurrencias de la transcripcin de genes especficos.
Biosensors and Bioelectronics 18 (2003) 541/546
Nested PCR:
Nested PCR significa que dos pares de cebadores de PCR se utilizaron para un solo
locus. El primer par amplific el locus como se ve en cualquier experimento de PCR. El
segundo par de cebadores (cebadores anidados) se unen en el primer producto de PCR y
producen un segundo producto de PCR que ser ms corta que la primera. La lgica
detrs de esta estrategia es que si el locus mal fueron amplificados por error, la
probabilidad es muy baja que tambin se amplific una segunda vez por un segundo par
de cebadores.
http://www.bio.davidson.edu/genomics/method/NestedPCR.html
Next generation sequencing:
Aprovecha la secuenciacin mediante tecnologa de sntesis (SBS) - el seguimiento de la
adicin de nucletidos marcados como la cadena de ADN se copia - de una manera
paralela masiva.

Siguiente-gen secuenciacin genera masas de ADN de datos de secuencia que es ms

rica y ms completa que es imaginable con la secuenciacin de Sanger. Sistemas de
secuenciacin de Illumina pueden entregar salida de datos que van desde 300 kilobases
hasta 1 terabase en una nica prueba, dependiendo del tipo y la configuracin del
instrumento
Se pretende que las tecnologas de secuenciacin de alto rendimiento disminuyan los costes
de secuenciacin de las bibliotecas de ADN ms all de lo que se puede hacer con el mtodo
corriente del terminador marcado basado en la separacin del ADN por electroforesis capilar
http://es.wikipedia.org/wiki/Secuenciaci%C3%B3n_del_ADN
http://www.illumina.com/technology/next-generation-sequencing.html
Panbacteral PCR:
Pan-PCR es un algoritmo que utiliza a disposicin del pblico de todo el genoma datos de
la secuencia bacteriana existente para disear automticamente ensayos de tipificacin
PCR multiplex. El usuario selecciona un conjunto de genomas dentro de una especie con
contenido de genes variables, y el programa de ordenador produce un conjunto casi
mnima de cebadores de PCR capaces de distinguir entre las cepas de entrada
En, ensayos de tipificacin basadas en PCR generales, tales como los diseados para
Streptococcus pneumoniae (13), Neisseria meningitidis (14), y Acinetobacter baumannii
(15), son deseables debido a sus ventajas inherentes de bajo costo y alta velocidad.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3592046/
PCR array:
Las matrices de PCR son las herramientas ms confiables para el anlisis de la expresin
de un panel enfocado de genes. Cada placa de 96 pocillos, placa de 384 pocillos o 100
pocillos disco PCR matriz incluye ensayos de primers optimizados SYBR Green para un
panel investigado a fondo de su caso, la va o genes centradas en las enfermedades.
Las matrices de PCR se han utilizado para el cncer, la inmunologa, las clulas madre, la
toxicologa, y muchas otras reas de la investigacin mdica y biolgica. Para ver
ejemplos de aplicacin para el cncer y la investigacin toxicolgica,. Para ver una lista de
publicaciones que citan el uso de la matriz de PCR.
http://www.sabiosciences.com/PCRArrayPlate.php
PCR restriction fragment length polymorphism:
es una tcnica que explota las variaciones en las secuencias de ADN homlogas. Se
refiere a una diferencia entre las muestras de molculas de ADN homlogas de las
diferentes localizaciones de sitios de enzimas de restriccin, y a una tcnica de laboratorio
relacionados por el cual estos segmentos pueden ser ilustradas.
El anlisis de la variacin de RFLP en genomas ha supuesto en el pasado una herramienta
fundamental en el mapeo genmico y el anlisis de enfermedades genticas. }
http://es.wikipedia.org/wiki/Polimorfismos_de_longitud_de_fragmentos_de_restricci
%C3%B3n
http://en.wikipedia.org/wiki/Restriction_fragment_length_polymorphism
Quantitative PCR:
qPCR combina la amplificacin por PCR y la deteccin en un solo paso. Esto elimina la
necesidad de detectar productos utilizando electroforesis en gel, y lo ms importante que
permite que el mtodo para ser verdaderamente cuantitativo. Con qPCR, colorantes
fluorescentes se utilizan para etiquetar productos de la PCR durante el ciclo trmico.

PCR en tiempo real se utiliza para muchas aplicaciones, incluyendo el anlisis de la

expresin gnica, anlisis de microARN, SNP genotipificacin, anlisis CNV, e incluso el
anlisis de protenas.
http://www.lifetechnologies.com/mx/es/home/life-science/pcr/real-time-pcr/qpcreducation.html

Restriction Fragment Length Polymorphism:

es un mtodo utilizado por los bilogos moleculares para seguir una secuencia particular
de ADN, que se transmite a otras clulas. RFLPs se pueden utilizar en muchas
configuraciones diferentes para lograr diferentes objetivos. RFLPs se pueden utilizar en
los casos de paternidad o casos penales para determinar el origen de una muestra de
ADN. RFLPs se pueden utilizar determinan el estado de la enfermedad de un individuo.
RFLPs se pueden utilizar para medir las tasas de recombinacin que puede conducir a un
mapa gentico con la distancia entre loci RFLP medido en centimorgans.
http://www.bio.davidson.edu/genomics/method/RFLP.html
reverse transcription PCR:
es la tcnica ms sensible para la deteccin y cuantificacin de ARNm disponibles en la
actualidad, se puede utilizar para cuantificar los niveles de ARNm a partir de muestras
mucho ms pequeas. De hecho, esta tcnica es lo suficientemente sensible para permitir
la cuantificacin de ARN de una sola clula.
Puede utilizarse como mtodo de deteccin molecular de genes, para estudiar el genoma de
virus de ARN como los retrovirus (tales como el VIH) o el virus de la gripe (virus de la
influenza).
http://es.wikipedia.org/wiki/RT-PCR
http://www.lifetechnologies.com/mx/es/home/references/ambion-tech-support/rtpcranalysis/general-articles/rt--pcr-the-basics.html