Assenza di legami H Calore di evaporazione: quantit di energia termica necessaria per far passare 1 g di una sostanza dallo stato liquido a quello gassoso Calore specifico: quantit di energia termica necessaria per far aumentare di 1C la temperatura di 1 g di una sostanza
Sono entrambi elevati nellacqua a causa
dei legami H Ghiaccio Reticolo cristallino ordinato, grazie a legami H stabilizzati e numerosi. galleggiamento Ampi spazi vuoti
H2O Stato fisico e propriet
Liquido Legami a idrogeno pi labili, meno numerosi (16%). Reticolo collassa, spazi vuoti invasi, aumento densit. Forza residua legami H sufficiente a determinare: Alto calore specifico Coesione Adesione Potere solvente
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Stabilit termica Tensione superficiale Capillarit Mezzo delle soluzioni (reazioni)
H2O Stato fisico e propriet
H2O come solvente
H2O determina solvatazione (idratazione) di sostanze idrofile: Composti ionici (sali, come NaCl) Composti covalenti polarizzati (acidi) Composti polari (alcoli)
I composti idrofobi (apolari) sono insolubili in H2O
I composti anfipatici si comportano in modo sia idrofili che idrofobo, avendo una porzione apolare e una porzione polare
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Acidi e Basi pH: logaritmo negativo , in base 10, della
, in concentrazioni base 10, diequivalenti: 10-7 7
[H ] = [OH ]
pH = 7 Neutro
Al crescere della concentrazione di ioni H+ (es.
++Cl-; H SO H++ HSO -) 4, ecc)di( Acqua pura + 6Acido (donatore protoni: 1/10 ; 1/10 OH-)HClH , il valore di pH + [H ] >[OH ] pH tra 1 e 7 Acido diminuisce (6, 4, ecc.) 2
, Acqua pura + Base (accettore di protoni: NaOH Na++OH KOH K +OH- ; Al diminuire della concentrazione di- ;ioni H+ +(es. -) NH 8 113 + H2O NH4+ +OH -
1/10 ; 1/10 , +ecc) (OH
) , il valore di pH aumenta [ H ] < [OH ] pH tra 7 e 14 Basico (8, 11, ecc.)
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Scala di pH Molte reazioni chimiche (e biochimiche) sono influenzate dallacidit della soluzione in cui esse avvengono. Affinch una reazione possa avvenire, o possa avvenire con una determinata velocit si deve controllare il pH al quale la reazione avviene
pH e Sistemi Tampone Il pH nei viventi mantenuto costante 6-8 (stomaco 2) mediante sistemi tampone
Sistemi tampone composti donatori e accettori di H+ (tipicamente, acidi deboli) H2O + CO2
H+ + HCO3
H2CO3
Ione bicarbonato
Acido carbonico +
H2O H+ + HCO3
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H + OH -
H2CO3
LA COMPOSIZIONE CHIMICA DEI VIVENTI
Chimica del Carbonio
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Chimica del Carbonio
Legami covalenti semplici e doppi
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Gruppi funzionali Alcolico/Ossidrile (-OH)
R-OH Alcoli
Carbossilico (-COOH)
R-COOH Acidi
Amminico (-NH2)
R-NH2 Ammine
Gruppo funzionale Ossidrile o
Alcolico (-OH) R-OH
= Alcoli
CH3OH = Alcol metilico
Formula di struttura
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H H C OH H
Gruppo funzionale Carbossilico (-COOH)
O C = Gruppo carbossilico OH R-COOH = Acidi organici CH3COOH
Formula di struttura
= Acido acetico
H H O O HC C HC C H OH H O- + H+
Gruppo funzionale Carbonilico (-CO)
O C = Gruppo aldeidico H C C C = Gruppo chetonico O
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Gruppo funzionale Amminico (-NH2)
H N = Gruppo amminico H R-NH2 = Ammine CH3NH2 = Metilammina
Formula di struttura
H H H C N + H+ H H
H H H C N H H H
La composizione dei viventi
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Gli organismi viventi sono formati dagli stessi elementi della
materia non vivente, ma in proporzioni completamente differenti
Glucosio Il gruppo aldeidico del glucosio (C glicosidico) reagisce con il 5atomo
Anello alfa ()
Anello beta ()
di C e la molecola diviene ciclica assumendo due possibili configurazioni: e
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Struttura semplificata del glucosio
Struttura semplificata del glucosio
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Monosaccaridi
Fruttosio H H
OH
OH
C OH
C OH
C OH
6 CH2OH
1 CH2OH
Ribosio e Deossiribosio
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DISACCARIDI
OH OH
prodotti di demolizione di polisaccaridi
Legame disaccaridico
H2 O
naturali
Saccarosio
Glucosio-Fruttosio
legame 1-2
Lattosio
Galattosio-Glucosio legame 1-4
Maltosio
Glucosio-Glucosio
Cellobiosio
Glucosio-Glucosio legame 1-4
legame 1-4
POLISACCARIDI Omopolisaccaridi Cellulosa Amido
Lineare = Amilosio
Glicogeno Ramificato = Amilo-pectina
Eteropolisaccaridi Mucopolisaccaridi
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1 - 6 nelle porzioni ramificate
Glicogeno n[Glu - Glu 1 - 4] = n (maltosio)
Amido
n[Glu - Glu 1 - 4] = n (maltosio)
Cellulosa
n[Glu - Glu 1 - 4] = n (cellobiosio)
Lipidi Classe di molecole che formano sostanze untuose, insolubili in solventi acquosi, associate a strutture e funzioni diverse Funzioni Riserva energetica: 9.3 kcal/g (contro le 3.8 kcal/g dei glucidi) Componenti strutturali: membrane, tessuto nervoso Metabolismo: Vitamine (A, E), Colesterolo Ormoni: Cortisolo, Steroidi (estrogeni, testosterone, ecc.)
Lipidi complessi Quando le molecole anfipatiche vengono immerse in un mezzo acquoso (come linterno e lesterno della cellula) tendono a disporsi in modo da escludere le parti idrofobe dal contatto con lacqua Questo comportamento alla base della struttura delle membrane biologiche che sono costituite da un doppio strato di fosfolipidi
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Code idrofobe
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Lipidi Steroidi
Glucosio
Acido oleico
Saccarosio
Ac. Linoleico
Colesterolo
Testosterone
Sfingomielina
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PROTEINE Le proteine sono le macromolecole da cui dipendono tutte le attivit della cellula
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Eterogeneit nella forma
Eterogeneit nella funzione
Altissima specificit
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MODELLO TRIDIMENSIONALE DI DUE PROTEINE ENZIMATICHE
MODELLO TRIDIMENSIONALE DELLA MIOSINA
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Modello tridimensionale dellactina
Proteine Macromolecole complesse e altamente variabili Funzioni strutturale (componenti strutturali della cellula) funzionale (enzimi, ormoni, proteine di trasporto) Composte da unit molecolari, gli amminoacidi prevalentemente introdotti con lalimentazione (digestione delle proteine) e organizzati dal DNA in polipeptidi nel processo di sintesi proteica. Hanno valore energetico (ca 4 kcal/g), ma lorganismo utilizza a questo scopo le proprie proteine solo in condizioni critiche.
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Proteine Amminoacidi R H
O N
C OH
Esistono in natura 20 differenti tipi di amminoacidi, che si distinguono per il gruppo R
H Parte variabile R
-H = Glicina -CH3 = Alanina
Gli aminoacidi differiscono per la dimensione e
polarit dei gruppi R
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Gli aminoacidi differiscono per la dimensione e
polarit dei gruppi R
Proteine Legame peptidico R1
R2
O N C
O N C
OH
O N C
OH
-H2O
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R3 C
...
OH H
-H2O
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Proteine Polipeptide R1 O
R2 O
R3 O
H N C
N C
N C
...
H H
H+ H
Estremit amino-terminale
H+ H H
H N
Estremit carbossi-terminale HO
Nella sintesi biologica delle proteine sono
utilizzati esclusivamente gli L- aminoacidi
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Proteine Livelli di organizzazione Struttura primaria Struttura secondaria Struttura terziaria (globulare enzimi) Struttura quaternaria
Successione aa polipeptide Ripiegamenti spaziali polipeptide (p.es. - elica, -foglietto) Stabilizzata da interazioni idrofobe e in alcune proteine da ponti disolfuro (S-S) Aggregazione di pi subunit (p.es. Hb: 4 subunit)
Esempi di proteine: collagene (ossa, tendini, cartilagini),
cheratina (capelli, unghie), actina-miosina.
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La struttura terziaria di una proteina dipende dalla
sua struttura primaria
La struttura quaternaria il risultato di interazione tra pi catene polipeptidiche
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Le interazioni tra proteine diverse dipendono dai legami tra
Carboidrati Lipidi Gruppi fosfato Gruppi eme Nucleotidi flavinici Ioni metallici Acidi nucleici
ACIDI NUCLEICI Acido DesossiriboNucleico DNA Acido RiboNucleico - RNA
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ACIDI NUCLEICI = POLINUCLEOTIDI
Nucleotide = Nucleoside + Gruppo Fosforico Polinucleotide catena derivante dallunione di pi nucleotidi Il nucleoside composto da una base azotata e da uno zucchero pentoso (a 5 atomi di C): Ribosio nellacido Ribonucleico, RNA Deossiribosio nellacido Deossiribonucleico, DNA
Basi Azotate Puriniche
Adenina Guanina Timina (solo nel DNA)
Pirimidiniche
Uracile (solo nel RNA)
Citosina
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Basi Azotate e Zuccheri Pentosi
Basi Puriniche (dalla Purina)
Adenina (A)
Guanina (G)
Basi Pirimidiniche (dalla Pirimidina)
Citosina (C)
Timina (T)
Uracile (U)
Zuccheri
Ribosio
2- deossiribosio
Base
Formazione della catena
polinucleotidica
Zucchero
Base Zucchero
Base Zucchero Estremit 5
Base Zucchero
Nucleotide = Nucleoside + Fosfato
Il nucleotide (pentoso legato in posizione 1 con la base azotata e in posizione 5 con il gruppo fosfato) tende a legarsi ad altri nucleotidi formando un acido nucleico. Acidi nucleici Si formano x polimerizzazione dei nucleotidi: Tra il gruppo ossidrilico (3 del pentoso) di un nucleotide e il gruppo fosfato (5) del successivo si viene a formare un legame fosfodiestere. Si forma cos una catena polinucleotidica (con direzione 5 - 3) NB: Gli atomi di Carbonio dello zucchero pentoso vengono numerati da 1 a 5 e contraddistinti con (1, 2 ecc.) per essere distinti dagli atomi di Carbonio della base azotata.
Estremit 3
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Ribosio Uracile
Ribosio
Adenina
RNA Struttura base LRNA costituito da un singolo filamento
Il pentoso dellRNA il ribosio
Ribosio
Ribosio
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Citosina
Guanina
Al posto della Timina,
lRNA ha unaltra base azotata, lUracile
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Struttura del DNA
Il DNA composto da una doppia elica (due filamenti contrapposti). Una scala a pioli in cui i montanti sono costituiti dal deossiribosio e dai gruppi fosfato e i pioli dalle basi azotate (A,T,C,G) appaiate e unite da legami a H. Lappaiamento delle basi non avviene in modo casuale, ma tra basi complementari
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Complementariet delle Basi Azotate CITOSINA GUANINA C = G ADENINA TIMINA
A=T
(C/G + A/T) = 1
2 nm 5
La distanza tra le basi di 0,34 nm
Il DNA una doppia elica con le basi
allinterno e lo scheletro di zuccheri e fosfati allesterno della molecola
Ciascun filamento compie un giro
completo ogni 10 basi = 3,4 nm 1nm=10-9 cm
0,34 nm
Le basi di filamenti complementari sono unite da legami H (A--T e G---C).
I due filamenti di DNA corrono in direzioni opposte (5-3 e 3-5). Estremit 3
Estremit 5 3,4 nm
Struttura del DNA Estremit 3
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Estremit 5
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Complementariet delle Basi Azotate La sequenza di basi di unelica determina la sequenza di basi dellaltra 3
A T A C G C T G T A T G C G A C
Impalcatura zucchero-fosfato
0,34 nm Solco minore
Solco minore
3,4 nm Solco maggiore
Solco maggiore 0,34 nm
1,0nm Idrogeno
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Ossigeno
Carbonio e azoto nelle basi appaiate
Carbonio
Fosforo
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La catena polinucleotidica singola dell RNA
pu assumere una struttura secondaria e terziaria in relazione ai possibili appaiamenti tra basi complementari
