RIBOSOMAS

Las protenas no son solamente elementos o componentes estructurales, sino que en forma
de enzimas median en los procesos metablicos dentro de la clula. Adems, muchas
clulas sintetizan protenas, bien como pro-hormonas, bien como hormonas, que van a
actuar en otros lugares del organismo. En la sntesis de protenas, hay 2 orgnulos
implicados: uno es el ncleo y otro es el ribosoma.
Los ribosomas son orgnulos citoplasmticos descritos por primera vez por PALADE, en el
M.E, donde aparecen como partculas esfricas, densas con un dimetro de 150 A y es
donde tiene lugar la sntesis de protenas y estn compuestos de un 60% de RNA y un 40%
de protenas.
Se encuentran tanto en procariotas como eucariotas. Sin embargo en las clulas bacterianas
al no existir sistemas internos de membranas, los ribosomas se encuentran libres en el
citoplasma o bien asociados a la parte interna de la membrana citoplasmtica., pero en
cualquier caso, estn constituidas por 2 subunidades, una grande y otra pequea, que se
distinguen por su coeficiente de sedimentacin, obtenido por ultracentrifugacin y
expresado en unidades SVEDBERG. Cada subunidad consiste en una hebra de rRNA con
protenas asociadas: ambas se pliegan para formar una estructura globular.
Los ribosomas pueden estar presentes en el citoplasma, bien aislados, bien asociados a
molculas de mARN, en cuyo caso forman agregados que reciben el nombre de
polirribosomas o polisomas. A su vez ambas formas pueden estar adheridas a la superficie
del extenso sistemas del Retculo Endoplsmico.
Los ribosomas de las clulas procariotas estn formados por dos subunidades de diferente
tamao: 50 S y 30 S que conjuntamente forman el ribosoma bacteriano 70 S (S = Svedberg
units, unidades de sedimentacin donde influyen el tamao y la forma):50 S y 30S.
Los de las clulas eucariotas son de 80S. La subunidad pequea tiene un valor de
sedimentacin de 40S y est compuesta por 33 protenas y un rRNA 18S. Adems, tiene un
sitio para la fijacin del mRNA, sitio P, porque es donde se fija el peptidil tRNA y un sitio
A para la fijacin del aminoacil tRNA. El valor de la subunidad grande es de 60S y consiste
en 49 protenas y 3rRNA.
Ambas subunidades se encuentran en el citosol de manera individual y no formarn un
ribosoma hasta que se inicie la sntesis proteica. Una vez que constituyen el ribosoma, se
convierten en estructuras altamente activas con protenas receptoras especficas,
conteniendo 3 lugares de unin para molculas de RNA: uno para mRNA y 2 para tRNA.

El lugar de unin peptidil-tRNA o lugar P acoge la molcula de tRNA que est unida al
extremo de la cadena polipeptdica en crecimiento. El lugar de unin aminoacil-tRNA o
lugar A acoge a la molcula de tRNA entrante cargada con el aminocido. Para que una
molcula de tRNA se una fuertemente a cualquiera de estos dos lugares es necesario que su
anticodn forme los pares de bases adecuados con el codn complementario de la molcula
de mRNA que est unida al ribosoma. Los lugares A y P estn tan cerca uno del otro que las
dos molculas de tRNA se ven forzadas a aparearse con codones adyacentes de la molcula
de mRNA.
El proceso de elongacin de la cadena polipeptdica sobre un ribosoma se puede considerar
como un ciclo de 3 etapas:
1.- Etapa 1. En ella una molcula de aminoacil-tRNA queda unida al lugar A vacante del
ribosoma (adyacente al lugar P, que est ocupado) mediante la formacin de pares de bases
con los nucletidos del mRNA (codn) que estn expuestos en el lugar A.
2.- Etapa 2. En ella el extremo carboxilo de la cadena polipeptdica se desacopla de la
molcula de tRNA del lugar P y se une a travs de un enlace peptdico al aminocido que se
halla unido a la molcula de tRNA que se halla en el lugar A. Esta reaccin central de la
sntesis de protenas est catalizada por una enzima peptidil transferasa. En dicha catlisis
interviene una regin especfica de la molcula mayor del rRNA de la subunidad mayor del
ribosoma.
3. Etapa 3.En esta fase el nuevo peptidil-tRNA del lugar A se transloca al lugar P cuando el
ribosoma se desplaza a lo largo de la molcula del mRNA. Esta etapa requiere energa y
est impulsada por series de cambios conformacionales de uno de los componentes del
ribosoma, mediante la hidrlisis de una molcula de GTP.

En la mayora de las clulas, la sntesis de protenas consume ms cantidad de energa que

cualquier otro proceso biosinttico, ya que para sintetizar cada uno de los enlaces
peptdicos se utuilizan por lo menos 4 enlaces fosfatos ricos en energa: dos de ellos se
requieren para cargar cada molcula de tRNA con su amioncido y dos que impulsan las
etapas del ciclo de reacciones que tienen lugar en el ribosoma durante la sntesis
propiamente dicha.
En clulas eucariotas, normalmente slo se sitetiza un tipo de cadena polipeptdica sobre
cada molcula de mRNA. Los RNA de eucariotas, a excepcin de los que se sintetizan en
las mitocondrias y cloroplastos, son profundamente modificados en el ncleo
inmeditamente despues de la transcripcin. Dos de estas modificaciones ms generales son
laadicin de una estructura de capucha compuesta por un residuo de 7-metilguanosina
unido al trifosfato del extremo 5 y la adicin de una cadena de 200 residuos adenlicos al

extremo 3?. La subunidad pequea del ribosoma se une primero al extremo 5 de una cadena
de mRNA ayudada por el reconocimiento de la capucha . entonces dicha subunidad se
desplaza a lo largo de la cadena de mRNA transportando su molcula de tRNA iniciador en
busca del codn AUG de iniciacin. Cuando es seleccionado dicho codn ya no se utilizar
otros de los muchos codones AUG ms alejados de la cadena. Como resultado de todo esto,
normalmente y en general sobre cada molcula de mRNA tan slo se sintetiza un tipo de
cadena polipeptdica (hay excepciones).
La unin de varios ribosomas a una misma molcula de mRNA genera polirribosomas. La
sntesis completa de una protena dura entre 20 y 60 segundos de promedio. En cuanto un
ribosoma ha traducido una secuencia de aa suficientemente larga como para dejar libre el
camino, un nuevo ribosoma salta sobre el extremo 5?de la molcula de mRNA.
La fidelidad de la sntesis de protenas est incrementada gracias a dos procesos
independientes de correccin de galeradas. El porcentaje de errores en la sntesis de
protenas pueden estimarse siguiendo la frecuencia de incorporacin de un aminocido en
una protena que normalmente carece de dicho aminocido. La fidelidad del proceso
decodificador depende de la precisin de los dos principales mecanismos de adaptacin,
que consumen energa. Por un lado y para mejorar la exactitud de la unin del aminocido
al tRNA corre a cargo de las aminoacil-tRNA sintetasas. Estas tienen dos lugares activos
diferentes. En uno se lleva a cabo la reaccin de carga y el otro es quien reconoce un
aminocido incorrecto que se halle colocado en una molcula de tRNA y lo libera por
hidrlisis. Para ser efectivo este tipo de correccin tambin se ha de liberar una fraccin
apreciable de aminocidos colocados correctamente, siendo un proceso costoso.
El otro proceso, denominado correcin cintica de pruebas se utiliza para mejorar la
fidelidad del apareamiento codon-anticodon. Cuando las molculas de tRNA se han unido
al aminocido, forman un complejo con una protena abundante denominada factor de
elongacin (EF) que se une fuertemente al extremo aminoacil del tRNA y a una molcula
de GTP. Dicho complejo es el que se acopla con el codon apropiado en una molcula de
mRNA. El factor de elongacin que se ha unido es quien permite que se produzca el
apareamiento codon-anticodon a la vez que impide que el aminocido se incorpore a la
cadena peptdica en crecimiento. Sin embargo el reconocimiento inicial del codn activa el
factor de eleongacin para que hidrolice el GTP que lleva unido, de tal forma que el factor
puede disociarse del ribosoma sin llevarse el tRNA al que estaba unido y de esta forma
permite que se produzca la sntesis de la protena. Adems, caractersticamente el factor de
elongacin produce un retraso en el apareamiento codon-anticodon y la elongacin de la
cadena polipetdica. Dicho retraso sirve para que las molculas de tRNA colocadas
incorrectamente abandonen el ribosoma sin ser utilizadas para la sntesis de protenas,
aumentando de esta forma la relacin de aminocidos incorporados correctamente y los
incorporados incorrectamente. Muchos inhibidoresde la sntesis de protenas en procariotas
resltan tiles como antibiticos.

Cdigo Gentico

El cdigo gentico es el conjunto de normas por las que la informacin codificada en el

material gentico (secuencias de ADN o ARN) se traduce en protenas (secuencias de
aminocidos) en las clulas vivas. El cdigo define la relacin entre secuencias de tres
nucletidos, llamadas codones, y aminocidos. Un codn se corresponde con un
aminocido especfico.

La secuencia del material gentico se compone de cuatro bases nitrogenadas distintas, que
tienen una funcin equivalente a letras en el cdigo gentico: adenina (A), timina (T),
guanina (G) y citosina (C) en el ADN y adenina (A), uracilo (U), guanina (G) y citosina (C)
en el ARN. Debido a esto, el nmero de codones posibles es 64, de los cuales 61 codifican
aminocidos (siendo adems uno de ellos el codn de inicio, AUG) y los tres restantes son
sitios de parada (UAA, llamado ocre; UAG, llamado mbar; UGA, llamado palo). La
secuencia de codones determina la secuencia aminoacdica de una protena en concreto, que
tendr una estructura y una funcin especfica.

El origen del cdigo gentico

A pesar de las variaciones que existen, los cdigos genticos utilizados por todas las formas
conocidas de vida son muy similares. Esto sugiere que el cdigo gentico se estableci muy
temprano en la historia de la vida y que tiene un origen comn en las formas de vida
actuales. Anlisis filogentico sugiere que las molculas ARNt evolucionaron antes que el
actual conjunto de aminoacil-ARNt sintetasas.
El cdigo gentico no es una asignacin aleatoria de los codones a aminocidos. Por
ejemplo, los aminocidoss que comparten la misma va biosinttica tienden a tener la
primera base igual en sus codones y aminocidos con propiedades fsicas similares tienden
a tener similares a codones.

Experimentos recientes demuestran que algunos aminocidos tienen afinidad qumica

selectiva por sus codones. Esto sugiere que el complejo mecanismo actual de traduccin del
ARNm que implica la accin ARNt y enzimas asociadas, puede ser un desarrollo posterior
y que, en un principio, las protenas se sintetizaran directamente sobre la secuencia de
ARN, actuando ste como ribozima y catalizando la formacin de enlaces peptdicos (tal
como ocurre con el ARNr 23S del ribosoma).

Se ha planteado la hiptesis de que el cdigo gentico estndar actual surgiera por

expansin biosinttica de un cdigo simple anterior. La vida primordial pudo adicionar
nuevos aminocidos (por ejemplo, subproductos del metabolismo), algunos de los cuales se
incorporaron ms tarde a la maquinaria de codificacin gentica. Se tienen pruebas, aunque
circunstanciales, de que formas de vida primitivas empleaban un menor nmero de
aminocidos diferentes, aunque no se sabe con exactitud que aminocidos y en que orden
entraron en el cdigo gentico.

Otro factor interesante a tener en cuenta es que la seleccin natural ha favorecido la

degeneracin del cdigo para minimizar los efectos de las mutaciones y es debido a la
interaccin de dos tomos distintos en la reaccin. Esto ha llevado a pensar que el cdigo
gentico primitivo podra haber constado de codones de dos nucletidos, lo que resulta
bastante coherente con la hiptesis del balanceo del ARNt durante su acoplamiento.

El cdigo est organizado en tripletes o codones:

Cada tres nucletidos (triplete) determinan un aminocido.
Si cada nucletido determinara un aminocido, solamente podramos codificar cuatro
aminocidos diferentes ya que en el ADN solamente hay cuatro nucletidos distintos. Cifra
muy inferior a los 20 [[Aminocido|aminocidos distintos que existen. Si cada dos
nucletidos codificarn un aminocido, el nmero total de dinucletidos distintos que
podramos conseguir con los cuatro nucletidos diferentes (A, G, T y C) seran variaciones
con repeticin de cuatro elementos tomados de dos en dos VR4,2 = 42 = 16. Por tanto,
tendramos solamente 16 dinucletidos diferentes, cifra inferior al nmero de aminocidos
distintos que existen (20).
Si cada grupo de tres nucletidos determina un aminocido. Teniendo en cuenta que existen
cuatro nucletidos diferentes (A, G, T y C), el nmero de grupos de tres nucletidos
distintos que se pueden obtener son variaciones con repeticin de cuatro elementos (los
cuatro nucletidos) tomados de tres en tres: VR4,3 = 43 = 64. Por consiguiente, existe un
total de 64 tripletes diferentes, cifra ms que suficiente para codificar los 20 aminocidos
distintos.
El cdigo gentico es degenerado
Regiones funcionales de cualquier molcula de ARN transferente

Existen ms tripletes o codones que aminocidos, de forma que un determinado aminocido

puede estar codificado por ms de un triplete.Como hemos dicho anteriormente existen 64
tripletes distintos y 20 aminocidos diferentes, de manera que un aminocido puede venir
codificado por ms de un codn. Este tipo de cdigo se denomina: degenerado. Wittmann
(1962) induciendo sustituciones de bases por desaminacin con nitritos, realiz
sustituciones de C por U y de A por G en el ARN del virus del mosaico del tabaco (TMV),
demostrando que la serina y la isoleucina estaban determinadas por ms de un triplete.
Las molculas encargadas de transportar los aminocidos hasta el ribosoma y de reconocer
los codones del ARN mensajero durante el proceso de traduccin son los ARN transferentes
(ARN-t). Los ARN-t tienen una estructura en forma de hoja de trbol con varios sitios
funcionales:
Extremo 3: lugar de unin al aminocido (contiene siempre la secuencia ACC).
Lazo dihidrouracilo (DHU): lugar de unin a la aminoacil ARN-t sintetasa o enzimas
encargadas de unir un aminocido a su correspondiente ARN-t.
Lazo de T C: lugar de enlace al ribosoma.
Lazo del anticodn: lugar de reconocimiento de los codones del mensajero.
Secuencia del ARN transferente de elanina de levadura
Normalmente el ARN-t adopta una estructura de hoja de trbol plegada en forma de L o
forma de boomerang.
La degeneracin del cdigo se explica teniendo en cuenta dos motivos:
Algunos aminocidos pueden ser transportados por distintas especies moleculares (tipos) de
ARN transferentes (ARN-t) que contienen distintos anticodones.
Algunas especies moleculares de ARN-t pueden incorporar su aminocido especfico en
respuesta a varios codones, de manera que poseen un anticodn que es capaz de
emparejarse con varios codones diferentes. Este emparejamiento permisivo se denomina
Flexibilidad de la 3 base del anticodn o tambaleo.

El cdigo gentico es no solapado o sin superposiciones

Un nucletido solamente pertenece a un nico triplete.
Un nucletido solamente forma parte de un triplete y, por consiguiente, no forma parte de
varios tripletes, lo que indica que el cdigo gentico no presenta superposiciones. Por tanto,
el cdigo es no solapado. Wittmann (1962) induciendo mutaciones con cido nitroso en el

ARN del virus del mosaico del tabaco (TMV) pudo demostrar que las mutaciones
habitualmente producan un cambio en un solo aminocido. El cido nitroso produce
desaminaciones que provocan sustituciones de bases, si el cdigo fuera solapado y un
nucletido formar parte de dos o tres tripletes, la sustitucin de un nucletido dara lugar a
dos o tres aminocidos alterados en la protena de la cpside del TMV.
Otra forma de comprobar que el cdigo es sin superposicin es que no hay ninguna
restriccin en la secuencia de aminocidos de las protenas, de manera, que un determinado
aminocido puede ir precedido o seguido de cualquiera de los 20 aminocidos que existen.
Si dos codones sucesivos compartieran dos nucletidos, cualquier triplete solamente podra
ir precedido o seguido por cuatro codones determinados. Por consiguiente, si el cdigo
fuera superpuesto, un aminocido determinado solamente podra ir precedido o seguido de
otros cuatro aminocidos como mucho.
La lectura es "sin comas"
El cuadro de lectura de los tripletes se realiza de forma continua "sin comas" o sin que
existan espacios en blanco.
Teniendo en cuenta que la lectura se hace de tres en tres bases, a partir de un punto de inicio
la lectura se lleva a cabo sin interrupciones o espacios vacos, es decir, la lectura es seguida
"sin comas". De manera, que si aadimos un nucletido (adicin) a la secuencia, a partir de
ese punto se altera el cuadro de lectura y se modifican todos los aminocidos. Lo mismo
sucede si se pierde (delecin) un nucletido de la secuencia. A partir del nucletido
delecionado se altera el cuadro de lectura y cambian todos los aminocidos. Si la adicin o
la delecin es de tres nucletidos o mltiplo de tres, se aade un aminocido o ms de uno a
la secuencia que sigue siendo la misma a partir del la ltima adicin o delecin. Una
adicin y una delecin sucesivas vuelven a restaurar el cuadro de lectura.

El cdigo gentico nuclear es universal

El mismo triplete en diferentes especies codifica para el mismo aminocido. La principal
excepcin a la universalidad es el cdigo gentico mitocondrial.
El desciframiento del cdigo gentico se ha realizado fundamentalmente en la bacteria E.
coli, por tanto, cabe preguntarse si el cdigo gentico de esta bacteria es igual que el de
otros organismos tanto procariticos como eucariticos. Los experimentos realizados hasta
la fecha indican que el cdigo gentico nuclear es universal, de manera que un determinado
triplete o codn lleva informacin para el mismo aminocido en diferentes especies.

Desciframiento del cdigo gentico

La asignacin de un aminocido a cada triplete o el desciframiento de la clave gentica.
Parece lgico pensar que el desciframiento del cdigo gentico se debera haber realizado
comparando las secuencia de nucletidos de un gen y la de aminocidos del polipptido
codificado por dicho gen. Sin embargo, en la poca en la que se realizaron estos trabajos no
era posible todava obtener la secuencia de los cidos nucleicos.
La mayora de los trabajos realizados por los grupos de investigacin consistieron en
sintetizar ARN mensajeros (ARN-m) para utilizarlos posteriormente como mensajeros
artificiales en un sistema acelular de traduccin "in vitro". Estos sistemas acelulares de
traduccin "in vitro" procedan de la bacteria E. coli y contenan todo lo necesario para
llevar a cabo la traduccin: ribosomas, todos los ARN transferentes, aminocidos, enzimas,
etc. Sin embargo, a estos sistemas acelulares se les quitaban los ARN mensajeros de E. coli
y se les aada un ARN sintetizado artificialmente. En estos sistemas acelulares se
sintetizaba un polipptido.