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Silvia Mrquez Sergio D. Ifrn Nancy Fernndez Gladys Glvez Luis Fernndez
La clula viva se asemeja a una industria qumica donde miles de reacciones ocurren dentro de un espacio,
en este caso, un espacio microscpico. Por ejemplo, los azcares son convertidos en aminocidos y
viceversa. El glucgeno es ensamblado a partir de miles de molculas de glucosas; las protenas a partir
de aminocidos. Por otro lado, estos polmeros sern hidrolizados cuando las necesidades de la clulas as
lo requieran.
El metabolismo (del griego metabole, cambio) es la totalidad de los procesos qumicos de un organismo.
El metabolismo es el mapa de rutas de miles de reacciones qumicas que ocurren en la clula.
Las enzimas dirigen dichas rutas metablicas, acelerando diferencialmente reacciones determinadas.
Como un todo, el metabolismo maneja las fuentes de materia y energa de la clula. Algunas rutas
metablicas liberan energa por ruptura de los enlaces qumicas de molculas complejas a compuestos
ms simple. Estos procesos de degradacin constituyen el catabolismo celular o vas catablicas. Por
otro lado, existen vas anablicas o reacciones qumicas del anabolismo, las que consumen energa para
construir molculas de mayor tamao a partir de molculas ms simples. Las vas metablicos se
interceptan de tal forma que la energa liberada de reacciones catablicas (reacciones exergnicas)
puede utilizarse para llevar a cabo reacciones anablicas (reacciones endergnicas)
As, la transferencia de energa del catabolismo al anabolismo se denomina acoplamiento energtico.
LOS ORGANISMOS SON TRANSFORMADORES DE ENERGA
La energa ha sido definida como la capacidad de realizar trabajo, de producir una modificacin en la
materia. Puede adoptar la forma de calor, luz, electricidad, movimiento, etc.
Se reconocen dos clases principales de energa:
Energa potencial
Energa cintica
qumicos de los glcidos, lpidos y protenas. Esta energa potencial que guardan los enlaces qumicos,
puede ser aprovechada parcialmente por el organismo cuando se rompen esos enlaces qumicos. La
energa que no puede ser atrapada por el organismo, se disipa como calor.
En condiciones experimentales controladas, puede medirse y compararse la cantidad de energa que
entra y sale de un sistema determinado.
LA TERMODINMICA ES EL ESTUDIO DE LA ENERGA
El anlisis de las transformaciones energticas que ocurren en la materia viva se llama termodinmica.
Los investigadores llaman sistema para denotar una porcin de materia bajo estudio. El resto del
universo (todo aquello fuera del sistema) es el entorno.
Los organismos son sistemas termodinmicos obligatoriamente abiertos, es decir intercambian materia
y energa con el entorno.
La termodinmica tiene dos leyes fundamentales que gobiernan las transformaciones energticas de la
materia y por lo tanto tambin rigen para los seres vivos.
La Primera Ley de Termodinmica o de la Conservacin de la Energa establece que la energa puede
convertirse de una forma en otra, pero no se la puede crear ni destruir. La energa total de un sistema y
su ambiente, por lo tanto se mantiene constante a pesar de todos los cambios de forma.
En todas las conversiones energticas, cierta energa til se convierte en calor y se disipa. De todos
modos, en una reaccin qumica, la energa de los productos de la reaccin ms la energa liberada en la
misma, es igual a la energa inicial de las sustancias que reaccionan.
Fig. 3.1 - Flujo de energa y materia en un ecosistema. Las mitocondrias de los eucariotas (incluso
plantas!) utiliza las molculas orgnicas producto de la fotosntesis como combustible para la respiracin
celular, pero tambin consume el oxgeno liberado en la fotosntesis. La respiracin libera la energa
almacenada en las molculas orgnicas y genera ATP, el cual se utiliza para el trabajo celular. Los
productos de desecho de la respiracin, CO2 y H2O, son las molculas que los cloroplastos utilizan como
sustrato de la fotosntesis. Por lo tanto, las molculas esenciales de la vida son recicladas, pero la
energa no. La energa ingresa al ecosistema como energa lumnica y sale como energa calrica.
La Segunda Ley de la Termodinmica establece que todos los intercambios y conversiones de energa, si
no entra ni sale energa del sistema en estudio, la energa potencial del estado final siempre ser menor
que la energa potencial del estado inicial. Por ejemplo las piedras ruedan siempre cuesta abajo, nunca lo
hacen haca arriba.
En termodinmica se designa como energa dependiente de un alto grado de ordenamiento a la energa
potencial, mientras que a la energa cintica molecular se la considera como energa con un grado
reducido de ordenamiento. A medida, entonces, que la energa potencial se transforma en cintica, el
desorden aumenta y utilizamos la expresin ENTROPA, para caracterizar el grado de desorden de un
sistema (las clulas NO estn desordenadas, as que tienen baja entropa).
En la naturaleza, el desorden es un estado ms probable que el orden y la entropa, como medida del
desorden, se convierte en una funcin que tiende a crecer constantemente.
Sabemos que el contenido de energa potencial de los compuestos qumicos est representados por la
fuerza que mantiene unidos a los tomos y molculas y cuando las sustancias qumicas reaccionan, parte
de esta energa se libera como calor y otra parte puede ser convertida en trabajo. Esta fraccin de
energa disponible para el trabajo se denomina ENERGA LIBRE O ENTALPA. En otras palabras es el
monto mximo de trabajo que puede obtenerse de un sistema.
La energa libre: un criterio para cambio espontaneo
Los organismos solamente pueden vivir a expensas de la energa libre adquirida del entorno.
La cantidad de energa libre de un sistema se simboliza con la letra G. Hay dos componentes para G: la
energa total del sistema (H) y su entropa (S). La energa libre se relaciona con estos factores de la
siguiente manera:
G = H - TS
con T (temperatura, en grados Kelvin) para temperaturas absolutas. Como se ve, la temperatura aumenta
el trmino de la entropa en la ecuacin. Esto tiene sentido si se recuerda que la temperatura mide la
intensidad del movimiento de las molculas al azar (calor), lo que provoca desorden. Entonces, esta
ecuacin enuncia queno toda la energa almacenada en un sistema (H) est disponible para el trabajo. El
desorden del sistema, el factor de entropa (S), se resta a la energa total para calcular la mxima
capacidad del sistema para realizar trabajo til.
Cmo el concepto de energa libre ayuda a determinar si un proceso determinado puede ocurrir
espontneamente? En la ecuacin de ms arriba, la energa libre (G) es considerada como una medida de
inestabilidad del sistema, o sea su tendencia a cambiar a un estado ms estable. Por lo tanto, aquellos
sistemas que tienden a cambiar espontneamente a uno ms estable son los que tienen mayor energa,
baja entropa o ambos. La ecuacin de G considera estos dos factores los cuales estn consolidados en el
contenido de G del sistema en estudio. Ahora se puede establecer un criterio para cambio espontneo: en
cualquier proceso espontneo la energa libre de un sistema decrece.
Los cambios de energa libre cuando un sistema va desde un estado inicial a un estado final es
representado por DG:
G=
H - T.
Finalmente, para que un proceso ocurra espontneamente, el sistema debe ceder energa (decrece H) o
perder orden (se incrementa S), o ambos. Cuando los cambios en H o en S son grandes, DG tiene un valor
negativo.
LAS REACCIONES METABLICAS SON EXERGNICAS O ENDERGNICAS
Las reacciones metablicas pueden ser clasificadas en exergnicas (aquellas que liberan energa) o
endergnicas (aquellas que consumen energa) tomando en cuenta sus cambios de energa libre.
En una reaccin exergnica hay una liberacin neta de energa libre. Puesto que los reactantes pierden
energa libre (G), DG es negativa para una reaccin exergnica. En otras palabras, las reacciones
exergnicas ocurren espontneamente.
Las reacciones endergnicas toman G de su entorno. Esto se debe a que esta clase de reacciones
almacenan ms energa libre (G) en las molculas, por lo tanto DG es positivo. Tales reacciones no son
espontneas.
De lo anterior, se concluye que si un proceso qumico es exergnico en una direccin, entonces el proceso
inverso debe ser endergnico.
Desequilibrio Metablico: Clave de la vida
Las reacciones qumicas del metabolismo son reversibles y podran equilibrarse slo en un medio aislado
como un tubo de ensayo. En los sistemas qumicos en equilibrio DG es cero y sin energa libre no hay
trabajo, por lo tanto una clula que ha alcanzado su equilibrio est muerta.
Este desequilibrio metablico es una de las caractersticas que define a la vida y esto se mantiene
gracias a que en las vas metablicas los productos no se acumulan , siendo sutratos de otras reacciones y
por lo tanto no alcanzndose nunca el equilibrio. Por ejemplo, durante la respiracin celular, la glucosa y
otros combustibles energticos son degradados y el dioxido de carbono es eliminado al medio interno y
luego expelido al exterior con lo cual la clula no alcanza nunca su equilibrio y continua trabajando. Este
simple ejemplo nos sirve para comprender la importancia que reviste para los organismos vivos ser
sistemas abiertos.
LA MOLCULA DE ATP ES RESPONSABLE DE LA MAYORA DE LOS PROCESOS DE ACOPLAMIENTO
ENERGTICO EN LAS CLULAS
Como se recordar, una estrategia clave de la bioenergtica es el acoplamiento energtico, es decir el
uso de un proceso exergnico para llevar a cabo uno endergnico.
El adenosn trifosfato (ATP),la moneda de la clula, transfiere la energa liberada por la ruptura de las
uniones qumicas en los procesos exergnicos hacia las reacciones endergnicas, es decir las reacciones
que consumen energa.
La clula puede realizar tres clases principales de trabajo donde se requiere energa:
Trabajo Mecnico: como el batido de cilias y flagelos, la contraccin de las clulas musculares, el
fluir del citoplasma dentro de la clula o el movimiento de los cromosomas durante la divisin celular.
Trabajo de Transporte: el bombeo de sustancias e iones a travs de la membrana en contra de la
direccin del movimiento espontneo.
Trabajo Qumico: El impulso de reacciones endergnicos, que no ocurriran espontneamente, como la
sntesis de los polmeros a partir de sus monmeros.
Fig. 3.3 - Molcula de ATP. (a) Estructura del ATP. (b) Hidrlisis de la molcula de ATP
El enlace entre el segundo y el tercer fosfato es un enlace rico en energa. Para establecerlo se necesit
de un gran aporte energtico, esto es, de la energa libre obtenida del entorno por la clula.
Por otro lado, su ruptura resulta en la liberacin de esta energa, la que puede ser empleada para los
distintos tipos de trabajos celulares.
Fig. 3.4 - El ciclo del ATP. La energa liberada en las reacciones catablicas se usan para fosforilar ADP,
generando ATP. La energa almacenada en el ATP se utiliza en la mayora de los trabajos celulares. Por lo
tanto, el ATP acopla los procesos productores de energa de la clula a los consumidores de energa.
Muchos de las reacciones del metabolismos son reacciones de oxido-reduccin
Los electrones poseen distintas cantidades de energa potencial segn su distancia respecto del ncleo
del tomo y la atraccin del ncleo por los electrones. Al aportar energa, el electrn pasa a un nivel
energtico ms alto, pero sin la energa adicional, el electrn permanece en el nivel energtico ms bajo
disponible para l.
Las reacciones qumicas son transformaciones energticas en las cuales la energa almacenada en los
enlaces qumicos se transfiere a otros enlaces qumicos recin formados. En estas transformaciones los
electrones pasan de un nivel energtico a otro. En muchas reacciones los electrones se transfieren de un
tomo o molcula a otro. Estas reacciones muy importantes en los sistemas vivientes, se conocen como
reacciones de oxidacin-reduccin (REDOX). La prdida de un electrn se conoce como oxidacin y el
tomo o molcula que pierde el electrn se ha oxidado. La perdida de electrones se llama oxidacin
porque el oxgeno que atrae con fuerza a los electrones, es la mayora de las veces el receptor de los
mismos.
Reduccin, por el contrario, es la ganancia de electrones. La oxidacin y la reduccin siempre ocurren
simultneamente, porque el electrn que pierde un tomo es aceptado por otro, que se ha reducido en el
proceso.
En los sistemas vivientes muchas veces los electrones son transferidos con un protn, es decir, es un
tomo de hidrgeno. En tal caso la oxidacin implica una perdida de tomos de hidrgeno y la reduccin la
ganancia de estos.
LA ENERGA DE LAS MOLCULAS ES LIBERADA EN EL TRANSCURSO DE LAS REACCIONES DE
OXIDACIN
Durante el transcurso de sucesivas y graduales reacciones de oxidacin, la mayor parte de la energa
qumica contenida en los alimentos es liberada de manera secuencial. De esta manera, se logra la eficaz
captacin de la energa liberada en enlaces de alta energa como los del ATP.
Como se ha dicho, toda oxidacin de un tomo o de una molcula est asociada a la reduccin de otro
tomo u otra molcula. Durante las reacciones de oxidacin pueden perderse hidrgenos (H). Estos se
pueden disociar en un protn (H+) y en un electrn (e-). En un sentido general, toda remocin de e- de
cualquier tomo o molcula constituye una reaccin de oxidacin. Este e- pudo haber sido removido de un
H. Luego el H+ puede permanecer en la molcula a la que conformaba o puede pasar al medio.
Por otro lado, la reduccin de un tomo o molcula puede implicar la ganancia de hidrgeno o e-.
X+ + NADH + H+
Fig. 3.6 - Perfil de energa de una reaccin exergnica. La curva punteada indica el curso de la reaccin
sin enzima. La curva continua el curso de la reaccin en presencia de la enzima
Segn su naturaleza los catalizadores pueden ser qumicos o biolgicos (Tabla 3.1)
Tabla 3.1 - Diferencias entre catalizadores biolgicos y qumicos
BIOLGICOS
QUMICOS
Son saturables
No son saturables.
Una enzima puede estar formada por una sola cadena de polipptido, consistir en subunidades mltiples o
requerir de componentes no proteicos. En general las reacciones catalizadas por enzimas se llevan a cabo
a presin, temperatura y pH moderado.
CLASIFICACIN
Desde el punto de vista estructural podemos clasificar a las enzimas en simples y conjugadas (de la
misma forma que hemos clasificado a las protenas).
Enzimas conjugadas: tambin llamadas holoenzimas poseen en su estructura una parte no proteica
denominada cofactor y una parte proteica que se denomina apoenzima. Para que estas enzimas acten
como catalizadores es necesario que la apoenzima se una al cofactor. El trmino cofactor puede aplicarse
tanto a un In como a una molcula orgnica de naturaleza variable (grupo prosttico y coenzimas). Las
coenzimas funcionan como portadores de grupos qumicos pequeos como ser acetilo, metilo o bien
protones y electrones. Las coenzimas se unen no covalentemente a la apoenzima permitiendo que la
holoenzima as formada lleve a cabo reacciones que la apoenzima sola no puede efectuar. Por ejemplo,
ninguna de las cadenas laterales de los aminocidos es capaz de transportar electrones pero cuando se
agrega por ejemplo la coenzima FAD+, la protena adquiere esta funcin. Las molculas orgnicas que
estn fuertemente unidas a la apoenzima se denominan grupos prostticos. Muchas coenzimas derivan de
vitaminas solubles en agua como ser las del grupo B (Tabla 3.2).
Tabla 3.2 - Vitaminas hidrosolubles , sus coenzimas derivadas y sus funciones
Vitamina
Tiamina (B1)
Riboflavina (B2)
cido Nicotnico
Coenzima derivada
Abreviatura
Pirofosfato de tiamina
TPP
Flavina mononucletido
FMN
Flavina y adenina
dinucletido
FAD
Nicotinamida y adenina
dinucletido
NAD+
Nicotinamida y adenina
dinucletido fosfato
Descarboxilacin y transferencia
de grupos acilo.
Portadores de hidrgeno y
electrones en oxido-reducciones
NADP
Piridoxina, piridoxal y
piridoxamina (B6)
Portadores de hidrgeno y
electrones en oxido-reducciones
Transaminacin y decarboxilacin
cido Pantotnico
Coenzima A
Biotina
Enlazada covalentemente
a carboxilasas
cido Flico
Tetrahidrofolato
Cobalamina (B12)
Funcin
Coenzima de cobamida
CoASH
Transferencia de acilos
Carboxilacin
TH4
Transferencia de un carbono
Reordenamientos, transferencia de
metilos
Otra forma de clasificarlas es de acuerdo con las reacciones que catalizan, como se indica en la Tabla
3.3, a continuacin.
Tabla 3.3 - Clasificacin de las Enzimas (segn International Union of Biochemestry)
CLASE
1 - Oxidorreductasas
2 - Transferasas
3 - Hidrolasas
4 - Liasas
5 - Isomerasas
6 - Ligasas
SITIO ACTIVO
Es el sitio en el cual el o los sustratos se unen a la enzima. En general estos sitios se encuentran en el
interior de la estructura proteica, formando hendiduras o bolsas, de manera que el sustrato pueda
experimentar un mximo de interacciones con la enzima. De toda la estructura de la enzima, que en
realidad son molculas enormes, solo una parte muy pequea interacta con el sustrato en general solo
participar cinco o seis aminocidos.
La especificidad de una enzima hacia su sustrato es una de las caractersticas ms notables,
normalmente se propone el modelo de llave y cerradura para explicar la forma complementaria en que
interactan la enzima y el sustrato, sin embargo esto nos hace pensar en una estructura rgida.
Actualmente se sabe que las enzimas son molculas flexibles, por lo tanto el modelo ms correcto sera el
llamado ajuste o encaje inducido, en donde el sitio activo se modifica para hacerse complementario al
sustrato. Una manera de graficar este modelo sera la forma en que un guante se ajusta a la mano, es
decir el guante tiene una forma particular, que al momento de interactuar con la mano se modifica,
1. Concentracin de sustrato
En general a medida que aumenta la cantidad de reactivos o sustratos la velocidad tambin aumenta. En
el caso de las reacciones qumicas conviene aclarar que la velocidad se mide como cantidad de producto
formado por unidad de tiempo, las unidades sern: gr/seg, moles/seg, moles/min, etc. De este modo
cuanto ms reactivo tenemos, ms producto se formar.
En el caso de las reacciones catalizadas por enzimas, el efecto de la cantidad de sustrato es el siguiente:
A medida que aumenta la cantidad de sustrato la velocidad aumenta en forma lineal (zona proporcional),
luego si bien la velocidad contina aumentando ya no lo hace en forma lineal (zona mixta) hasta que
finalmente la reaccin alcanza una velocidad mxima que es constante, se vuelve independiente de la
cantidad de sustrato (zona de saturacin). Esto ocurre debido a que los sitios activos de las enzimas se
encuentran todos interactuando con las molculas de sustrato, por lo tanto hasta que no finalice la
reaccin la enzima no puede unirse a otro sustrato.
Fig. 3.10 - Perfil de una reaccin en presencia de inhibidor COMPETITIVO y sin inhibidor
5.1. Inhibidores irreversibles: estos inhibidores se enlazan con fuerza a la enzima, generalmente se
unen covalentemente a algn aminocido del sitio activo. Existen algunos inhibidores que se conocen como
sustrato suicida, que se enlazan al centro activo y qumicamente se transforma en una especie reactiva
Fig. 3.11 - Perfil de una reaccin en presencia de inhibidor NO COMPETITIVO y sin inhibidor
5.2.b. Los inhibidores no competitivos se enlazan a un sitio distinto del sitio activo, de manera que el
inhibidor se puede unir a la enzima libre o bien al complejo enzima sustrato, pero en ninguno de los casos
obtendremos productos. El efecto de estos inhibidores no se revierte por el agregado de mayor cantidad
de sustrato, de manera que se llega a una velocidad mxima menor que si no tuviera el inhibidor.
No es raro observar algunos inhibidores a los cuales no se les puede comprobar el mecanismo exacto de
inhibicin, siendo en algunos casos un tipo de inhibicin mixta.
REGULACIN DE LA ACTIVIDAD ENZIMTICA
Dentro de las clulas se llevan a cabo infinidad de procesos metablicos, todos ellos relacionados entre
s, de manera que deben estar controlados en forma precisa, para que a cada instante la clula disponga
de los metabolitos necesarios para su funcionamiento. Para lograr esta coordinacin metablica es
preciso disponer de mecanismos de control o regulacin adecuados.
Existen distinto tipos de mecanismos regulatorios de la actividad enzimtica:
1.
2.
Regulacin alostrica
3.
4.
Regulacin gentica
1. Inhibicin por producto final: Con frecuencia las enzimas son inhibidas en forma competitiva por los
productos de las reacciones que catalizan. Esto es predecible, ya que la estructura del producto es muy
similar a la del sustrato. Esta inhibicin ocurre en las ltimas etapas de la reaccin cuando hay una gran
cantidad de producto y baja concentracin de reactivo o sustrato. En la mayora de los casos, las
reacciones metablicas no ocurren en un solo paso, sino que son varias y encadenadas formando parte de
una ruta metablica, en donde el producto de una reaccin es el sustrato de la siguiente. Generalmente
en estos casos el producto final, es decir el producto de la ltima reaccin de esa va, acta inhibiendo a
las enzimas que intervienen en los primeros pasos.
Fig. 3.13 - Regulacin alostrica. (a) La mayora de las enzimas alostricas se ensamblan a partir de 2 o
ms subunidades. Cada una posee un sitio activo. La enzima oscila entre dos estados: activo e inactivo.
Alejado del sitio activo esta el sitio alostrico, que acta como un receptor especfico regulando la
actividad enzimatica. (b) Se observa el efecto opuesto de un activador y un inhibidor sobre las cuatro
subunidades de la enzima. (c) Efecto de cooperacin: un sustrato unido a uno slo de los sitios activos
(encaje inducido), puede activar toda la enzima.
2. Regulacin alostrica: Este tipo de regulacin ocurre solo en las enzimas alostricas, que son enzimas
que por lo general tienen estructura cuaternaria y adems del sitio activo poseen otro capaz de
reconocer efectores, que se denomina sitio alostrico. Los efectores son sustancias que pueden modular
la actividad de las enzimas, algunos efectores aumentan la actividad enzimtica, de modo que se conocen
como efectores positivos y otros tienen efecto inhibitorio que se denominanefectores negativos.
Las enzimas alostricas presentan curvas de saturacin del sustrato distintas a lo que vimos
anteriormente, dan una curva sigmoidea en lugar de una hiprbola (Fig. 3.14).
Enzima A (inactiva) + P
Enzima A + P (activa)
Enzima B ~ P (inactiva)
Enzima B (activa) + P
Fosforilasa (inactiva)
Fosforilasa ~ P (activa)
Glucgeno
Glucosa
4. Regulacin gentica: Involucra el control a nivel del ADN. El ADN es la molcula que almacena la
2.
3.
Qu es una ribozima?
4.
La temperatura:
a.
b.
c.
d.
e.
ninguna es correcta.
2.
a.
se puede regular
b.
no se puede regular
c.
d.
a y c son correctas
e.
b y c son correctas
3.
Un inhibidor competitivo:
a.
b.
c.
es parecido al sustrato
d.
a y c son correctas
e.
b y c son correctas.
4.
Un cofactor es:
a.
b.
c.
d.
e.
ninguna es correcta
5.
a.
especficas
b.
saturables
c.
termolbiles
d.
regulables
e.
6.
Un grupo prosttico:
a.
b.
c.
d.
a.
b.
se lleva a cabo mediante interacciones dbiles entre el sustrato y el sitio de unin de la enzima.
c.
d.
es bloqueada por los inhibidores competitivos, an frente a altas concentraciones del sustrato.
b.
c.
d.
holoenzimas
b.
c.
d.
10. Cul de las siguientes afirmaciones no es cierta acerca de las conversiones energticas?
a.
b.
c.
endergnicas
b.
exergnicas
c.
exotrmicas
d.
reductiva
e.
oxidativas
exergnicas
b.
oxidativa
c.
exotrmica
d.
reductiva
e.
endergnica
calor.
b.
entropa
c.
d.
entalpa
e.
calor especfico
b.
c.
d.
e.
BIBLIOGRAFA
Alberts, B et al. (1996) Biologa Molecular de la Clula. 3ra Edicin. Ediciones Omega S.A.Barcelona.
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Karp, G.. (1998) Biologa Celular y Molecular. Ed. Mc Graw Hill Interamericana. Mxico.
Kuchel,p y Ralston, G. (1994) Bioqumica General. Serie Schaum. Ed. McGraw-Hill. Mxico.