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ORGANIZAO DE
IMAGENS EM
PATOLOGIA
Introduo
Projeto de iniciao cientfica desenvolvido
no mbito do Departamento de Cincia da
Informao (GCI) , do Instituto de Arte e
Comunicao Social (IACS) e do
Departamento de Cincias Bsicas (FCB),
do Campus de Nova Friburgo, da
Universidade Federal Fluminense (UFF).
Objetivo
Investigar princpios de organizao de
imagens biomdicas de cortes
histopatolgicos com fins de
armazenamento e recuperao em bancos
de imagens com objetivos acadmicocientficos, a fim de possibilitar futuras
aplicaes profissionais e educacionais na
rea de Patologia.
Justificativa
Uso de recursos visuais na formao
biomdica nos currculos dos cursos de
graduao.
Predominncia da utilizao de imagens
nas aulas expositivas e laboratoriais
exposio do contedo
descrio morfolgica para a obteno de
diagnstico das leses comuns a diferentes
doenas.
Patologia
Cincia que estuda as causas das
doenas, os mecanismos que as
produzem, as sedes [localizao] e as
alteraes morfolgicas e funcionais
que apresentam (BRASILEIRO FILHO, 2006,
p.1).
Material
Imagens de lminas histopatolgicas de
processos patolgicos gerais
confeccionadas para as aulas prticas da
disciplina de Patologia Geral, do
Departamento de Cincias Bsicas (FCB)
do Campus Universitrio de Nova Friburgo
da Universidade Federal Fluminense
(UFF).
A disciplina de Patologia Geral atende
anualmente 190 alunos dos cursos de
Biomedicina, Fonoaudiologia e Odontologia
Jice Cleide Cardoso Ennes de Souza - joicecardoso@id.uff.br
nome do
pesquisador
email
do pesquisador
Elan Cardozo
Paes
de Almeida
elancardozo@id.uff.br
http://patogeralpunf.wix.com/punfuff
Material
Macroscopia
Microscopia
ESTUDO DE
CASO
CLNICO
Questes
Como organizar o acervo de imagens
digitalizadas de lminas
histopatolgicas?
O que devemos destacar na imagem?
Como garantir a recuperao da
imagem pelo usurio do sistema?
Organizao e Recuperao de
Imagens Biomdicas na Web
Informtica biomdica
campo interdisciplinar que estuda e desenvolve
dados, informaes e conhecimentos para a
pesquisa cientfica e definio de diagnsticos
em sistemas de informao em sade (HSU et
al., 2013, p. 1010).
Organizao e Recuperao de
Imagens Biomdicas na Web
Biomedical imaging informatics (BMII) Informtica de imagens biomdicas
subcampo responsvel pelo processamento
otimizao e uso de imagens e sua aplicao
em pesquisas clnicas diversas.
A BMII tem como finalidade estudar formas de
recuperao da informao nos bancos de
imagens biomdicas, a partir da "interpretao
da imagem" (AMERICAN MEDICAL
INFORMATICS ASSOCIATION, 2014).
Organizao e Recuperao de
Imagens Biomdicas na Web
AMIA (American Medical Informatics
Association)
anlise das imagens com base nas
caractersticas de nvel baixo: atributos
intrnsecos como cor, forma, histograma,
regies homogneas ou textura, promovendo a
indexao de imagens baseada em contedo.
Organizao e Recuperao de
Imagens Biomdicas na Web
Carrare et al. (2006)
Biblioteca Virtual de Imagens em Medicina
(BVIM).
dos 11 repositrios analisados somente um
oferecia consulta por metadados, assunto e
categoria (ilustrao, radiologia ou patologia).
Fundamentao terica
Cincia da Informao - reflexo sobre a
organizao e recuperao da imagem
biomdica e seu potencial comunicacional.
Teoria da Imagem - imagem biomdica e
seu papel como cone por apresentar
semelhana com a realidade,
apresentando qualidade representativa
para o patologista.
Teorias da Classificao Facetada e do
Conceito - identificao de categorias para
a organizao das imagens de lminas
histopatolgicas.
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Elan Cardozo
Paes
de Almeida
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ANLISE DO SITE
http://patogeralpunf.wix.com/punfuff
Imagens organizadas
segundo a forma de
observao
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Paes
de Almeida
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Imagens organizadas
pelo contedo das
aulas, que
corresponde
classificao das
leses, segundo
alteraes
morfolgicas e
funcionais que
surgem nos tecidos
aps agresses.
SUBCLASSES
DIFERENTES
Consideraes finais
A partir da definio de Patologia foram
identificados os aspectos relevantes para
organizao do domnio: causas,
mecanismos, localizao, alteraes
morfolgicas e funcionais.
Na atual organizao do site da disciplina
de Patologia Geral, o contedo exibido
de forma unidimensional.
Consideraes finais
As teorias da Classificao Facetada e do
Conceito proporcionam
multidimensionalidade com o arranjo
sistemtico, permitindo ao usurio fazer as
conexes entre os diferentes aspectos da
Patologia.
A adoo de um princpio para organizao
das imagens de lminas histopatolgicas
no banco de imagens permitir ampliar a
comunidade usuria, uma vez que estaro
acessveis aos demais pesquisadores.
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Paes
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Referncias
BRASILEIRO FILHO, G. Bogliolo Patologia. 7. ed. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, 2006.
HSU, W. et al. Biomedical imaging informatics in the era of precision medicine: progress, challenges,
and opportunities. Journal of the American Medical Informatics Association, [S.l.], v. 20, p.1010
1013, nov. 2013.
KOTHARI , S. et al. Pathology imaging informatics for quantitative analysis of whole-slide images.
Journal of the American Medical Informatics Association, [S.l.], v. 20, p.10991108, nov. 2013.
Obrigada!
Jice Cleide Cardoso Ennes de Souza
joicecardoso@id.uff.br