Chi cuadrado

La prueba de Chi cuadrada (X2)

Un mtodo estadstico usado para
determinar bondad de ajuste goodness of
fit
La prueba de bondad de ajuste se refiere a como
la data observada esta cercano a la predichas
por la hiptesis

Nota:
La prueba del Chi cuadrada no prueba que la
hiptesis sea correcta
Este evala se si o no la data y la hiptesis tienen una
bondad de ajuste

La prueba de Chi cuadrada (X2)

La formula general

c2 = S

Donde :

O = la data observada en cada categora

E = la data observada en cada categora basada en la
hiptesis del experimento
S = La suma de todos los clculos en cada categora

 Considere este ejemplo de Drosophila melanogaster

El gene que afecta la forma El gene que afecta el color

del ala
del cuerpo
+
+
c = ala normal
e = normal (gris)
c = ala curveadas
e = ebony
Nota:
El tipo salvaje es designado con el smbolo +
Los alelos recesivos mutantes son designados con
letras minsculas

El cruce:

Se hace un cruce entre dos moscas de raza pura (c+c+e+e+

y ccee). La moscas de la generacin F1 se le permite
cruzarse entre ellos para producir una generacin F2.

El resultado

Generacin F1
Todos los hijos tienen alas rectas y cuerpo gris
Generacin F2
193 alas rectas, cuerpo gris

69 alas rectas, cuerpo ebony

64 alas curveadas, cuerpo gris

26 alas curveadas, cuerpo ebony

352 total de moscas

Aplicar la prueba del Chi cuadrada

Paso 1: Proponer una hiptesis que permita calcular los

valores esperados basados en la ley de Mendel
Dos rasgos se sortean en forma independiente

Paso 2: Calcular los valores esperados de los 4

fenotipos, basado en la hiptesis
De acuerdo a la hiptesis, debe tener una razn
9:3:3:1 en la generacin F2
Fenotipo

Alas rectas,
cuerpo gris
Alas rectas ,
cuerpo ebony
Alas curveadas
cuerpo gris
Alas curveadas,
cuerpo ebony

Probabilidad
esperada
9/16

Nmero esperado

3/16

3/16 X 352 = 66

3/16

3/16 X 352 = 66

1/16

1/16 X 352 = 22

9/16 X 352 = 198

Paso 3: Aplicar la formula del Chi cuadrado

c2 =

(O1 E1)2

E1

(193 198)2
2
c =

198

(O2 E2)2
E2

E3

(69 66)2

(64 66)2

66

c2 = 0.13 + 0.14 + 0.06 + 0.73

c2 = 1.06

(O3 E3)2

66

(O4 E4)2
E4

Step 4:Interpretar el valor del Chi cuadrado

El calculo del valor del chi cuadrado puede ser usado para
obtener probabilidades, o valores P values, de la tabla de
Chi cuadrado

Estas probabilidades permiten determinar la similaritud que las

desviaciones observadas se deban a solo un chance al azar

Valor bajo del chi cuadrado indica una alta probabilidad que
las desviaciones observadas se deban solo la chance al
azar
Alto valor del chi cuadrado indica una baja probabilidad las
desviaciones observadas se deban solo la chance al azar
Si el valor del chi cuadrado resulta en una probabilidad que
es menos de 0.05 (ie: menos del 5%)
Se rechaza la hiptesis

Paso 4: Interpretar el valor del Chi cuadrado

Antes de usar la tabla del Chi cuadrado, hay que determinar

los grados de libertad (df) degrees of freedom
El df es una medida del numero de categoras que son
independientes de cada
df = n 1
donde n = el nmero total de categoras
En el experimento, existen 4 fenotipos/ categoras
Por lo tanto, df = 4 1 = 3

1.06

Paso 4: Interpretar el valor del Chi cuadrado

Con un df = 3, el valor de Chi cuadadro de 1.06 es un poco

mayor que 1.005 (el cual corresponde a P= 0.80)

A P = 0.80 significa que el valor es igual o mayor que 1.005

se espera que ocurra 80% de las veces basado en solo un
chance al azar

Por eso, es algo probable que las desviaciones entre los

valores esperados y observados en el experimento puedan
ser explicados por un error en el muestreo al azar