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E2 - transacetilasa de dihidrolipoilo, que cataliza la transferencia del grupo acetilo a CoASH, usa cido
lipico y CoASH como cofactores.
citrato 3- + HS-CoA + H+
citrato 3-
isocitrato 3-
isocitrato 3- + NAD+ + H+
a KG 2- + CO2 + NADH + H+
a KG 2- + NAD+ + HSCoA + H+
L-malato + NAD
La Keq igual a 5x105 y el Go igual a - 7,7 Kcal mol-1, indican la irreversibilidad de la reaccin,
determinada por la hidrlisis de citril - CoA.
El fluorocitrato es una de las molculas ms txicas conocidas (LD 50 = 0,2 mg k-1 de peso
corporal en ratas). Se encuentra en hojas de algunas plantas venenosas de frica, Australia y
Sudamrica.
2. Aconitasa.
Cataliza la interconversin ente los cidos tricarboxlicos: citrato, cis-aconitato e isocitrato. En
un primer paso hay una eliminacin de una molcula de agua, sale el grupo hidroxilo del C-3 y
un H+ del C-4 formndose el cis-aconitato, en un segundo paso de adicin de agua al doble
enlace, queda el grupo hidroxilo en el C-4 del cido formado. De los dos estereoismeros
posibles del isocitrato slo se forma uno. La enzima transfiere el grupo hidroxilo del citrato a un
carbono adyacente, y convierte al citrato, alcohol terciario de difcil oxidacin, a isocitrato,
alcohol secundario fcilmente oxidable.
El Go igual a + 2,04 Kcal mol-1, es por lo tanto una reaccin reversible en la que el equilibrio
favorece la formacin del citrato.
5. Succinil-CoA sintetasa.
Enzima conocida tambin como succinato tioquinasa, que cataliza la hidrlisis del compuesto
succinil-CoA y la sntesis acoplada del un nuclesido trifosfato de alta energa (fosforilacin a
nivel de sustrato).
Es una reaccin reversible, con una Keq igual a 3,7 y Go igual a 0,7 kcal mol-1.
6. Succinato deshidrogenasa.
Las reacciones restantes del ciclo oxidan al sucinato a oxalacetato, ste al regenerarse,
permite otra vuelta del ciclo. La succinato deshidrogenasa cataliza la oxidacin
estereoespecfica del enlace - CH2 CH2 del succinato a doble enlace trans, dando el
fumarato.
La enzima est formada por 4 cadenas polipeptdicas, tiene un PM = 400 kD. La reaccin es
reversible cuya Keq es igual a 4,5. En la direccin inversa la enzima participa en la eliminacin
de agua del L-malato (no del D-malato) formndose el ismero geomtrico trans, el fumarato
(no el ismero cis).
8. L-malato deshidrogenasa.
Dada esta constante de equilibrio es esencial para la operacin del ciclo que la reaccin
catalizada por la citrato sintasa sea irreversible. Hay isoenzimas de la malato deshidrogenasa
fuera de la mitocondria. En el citosol y en la matriz del peroxisoma est asociada al NAD +, en el
estroma de cloroplastos la enzima es dependiente del NADP +.
Como el rol primario del Ciclo es oxidar grupos acetilo a CO2, el ciclo es sensible a la
disponibilidad de su sustrato Acetil-CoA, la disponibilidad de Oxalacetato que es el
metabolito regenerante, y al nivel de acumulacin de sus productos NADH y ATP. Los
principales puntos de regulacin, representan puntos de vinculacin del Ciclo con otras
vas metablicas. El punto de regulacin de la Isocitrato Deshidrogenasa es
precisamente uno de esos casos, ya que mediante su regulacin, se controla el ritmo
de produccin de Acetil-CoA en el citoplasma de la clula.
Coenzima
Enzima
Tipo de
reaccin
Inhibidor Activador
Citrato,
NADH,
SuccinilCoA
Producto
AcetilCitrato sintasa
CoA, agua
Condensacin
2a Citrato
Deshidratacin
2b cis-Aconitato
Agua
Hidratacin
Isocitrato
3a Isocitrato
NAD+
Oxidacin
Oxalsuccinato,
NADH
Oxalacetato
3b Ossalsuccinato H+
Aconitasa
Isocitrato
deshidrogenasa
Descarboxilacin
NADH,
ATP
Ca2+, ADP
Citrato
cis-Aconitato,
acqua
cetoglutarato,
CO2
Cetoglutarato
NAD+,
CoA-SH
NADH,
Descarboxilacin
cetoglutarato
Succiniloxidativa
deshidrogenasa
CoA
Ca2+
Succinil-CoA,
NADH, CO2
Succinil-CoA
GDP,
Fosfato
Succinil-CoA
sintetasa
Succinato,
GTP, CoA-SH
Succinato
FAD
Succinato
Oxidacin
deshidrogenasa
Fumarato,
FADH2
Fumarato
Agua
Fumarasa
L-Malato
L-Malato
NAD+
Malato
Oxidacin
deshidrogenasa
Oxalacetato,
NADH
Trasferencia
fosfato
Hidratacin
de
Importancia que posee el ciclo en los organismos vivientes, relacin con los medicamentos y
patologas mas frecuentes asociadas.
Donadores de electrones
En la biosfera actual, los donadores de electrones ms comunes son las molculas orgnicas. Los organismos
que usan molculas orgnicas como fuente de energa son conocidos como organotrofos. Sin embargo,
existen procariotas que son capaces de utilizar fuentes inorgnicas como fuente de energa y se les conoce
por ello con el nombre de litotrofos. Estos donadores inorgnicos incluyen al hidrgeno, al monxido de
carbono, el amonio, el nitrito, sulfuro, y el ion ferroso. Los litotrofos se han observado creciendo en
formaciones de rocas a centenares de metros bajo la superficie de la Tierra. El uso de donadores de
electrones inorgnicos como fuente de energa es de particular inters en el estudio de la evolucin. Este tipo
de metabolismo tuvo que ser el predecesor de los actuales modelos de organotrofos.
Deshidrogenasas
Las bacterias pueden usar un gran nmero de donadores de electrones. Cuando utilizan materia orgnica
como fuente de energa, el donador puede ser el NADH o el succinato, en tal caso los electrones entran a la
cadena de transporte mediante la NADH deshidrogenasa, que es similar al complejo I mitocondrial, o bien
mediante la succinato deshidrogena, que es similar al complejo II. Otras deshidrogenasas pueden ser
utilizadas dependiendo del donador; ejemplos pueden ser la formato deshidrogenasa, la lactato
deshidrogenasa, la gliceraldehdo-3-fosfato deshidrogenasa, H2 deshidrogenasa, tambin conocida por el
nombre de hidrogenasa, y etc. Algunas de estas deshidrogenasas tambin actan como bombas de protones,
otras simplemente donan los electrones al reservorio de quinonas. La mayora de las deshidrogenasas son
sintetizadas solo en caso de necesidad, por lo que dependiendo del ambiente en el que se encuentra
podremos detectar una o varias de estas deshidrogenasas. Las bacterias son capaces por tanto de realizar una
regulacin transcripcional de las mismas.
Transportadores de quinona
Las quinonas son transportadores mviles liposolubles. En general desempean las mismas funciones que la
quinona mitocondrial, aunque las bacterias presenten quinonas especficas como son por ejemplo la
ubiquinona o la menaquinona.
Bombas de protones
Se considera una bomba de protones cualquier proceso que genere un gradiente de protones a travs de la
membrana. Los protones pueden ser movidos fsicamente a travs de la membrana como es el caso de los
complejos I y IV de las mitocondrias. El mismo efecto es observado cuando los electrones se mueven en la
direccin opuesta, El resultado es la desaparicin de protones de la matriz y la aparicin de protones en el
espacio intermembrana. Este es el caso del complejo III de las mitocondrias, en el cual se observa el ciclo Q.
Algunas deshidrogenasas son bombas de protones, otras no. La mayora de oxidadas y reductasas si lo son,
aunque existen excepciones. El citocromo bc1 es una bomba de protones encontrada en muchas bacterias,
aunque no en todas, por ejemplo Escherichia coli. Cadena de transporte de electrones 6
Citocromos
Los citocromos son protenas que contienen porfirinas que tienen ligado un tomo de hierro. Existen
citocromos que son hidrosolubles, otros que son liposolubles. Otra peculiaridad es que existen citocromos
mviles como por ejemplo el citocromo c. Aunque la gran mayora funcionan asociadas a macromolculas
como pueden ser los complejos III y IV.
reductasa, la nitrito reductasa o la DMSO reductasa dependiendo de si existen esos aceptores en el medio en
el que ests creciendo.
Aceptores de electrones
Al igual que existen un gran nmero de donadores de electrones, tambin existen un gran nmero de
aceptores que pueden ser de ambos tipos, es decir de origen orgnico o inorgnico. Si el oxgeno est
disponible, se usar como aceptor, ya que genera mayor produccin energtica. En los ambientes
anaerbicos, se puede utilizar NO3 -, NO2 -, Fe3+, SO4 2-, CO2 y pequeas molculas orgnicas como por
ejemplo el fumarato.
Enumere los inhibidores de cada complejo y sus mecanismos.
INHIBIDORESEvitan la oxidacin de los sustratos. Los sustratos se quedan
los
reducidosNADH y FADH,
lagluclisis y
en
equivalentes
obtenidos
el ciclo
de
eloxgenomolecular, acoplado
en
Krebs hasta
con
la
sntesis
catalizan
varias
reacciones
de
xido-
fosforilacin
oxidativa
es
un
(catabolismo)
de
oxidativa.
la
bomba
H+
que
moviliza
un gradiante
de
membrana.
La teora quimiosmotica establece que ambos procesos -(F.O y CTe-) estn acoplados
energticamente. Por Ej, la Oligomicina se une a la Fraccin Fo de la Atpasa e inhibe la sntesis de
ATP, por lo tanto detendr tambin a la cadena de transporte de electrones. Por lo tanto disminuir
el consumo de O2. Hay sustancias que actuan como desacoplantes de estos dos procesos, para
que puedan actuar de manera individual. Por ejemplo siguiendo con el caso anterior, si ahora se
agregara 2,4-dinitrofenol, que es un cido dbil que acta como desacoplante, el consumo de O2
se reestablecera, ya que tender a liberar la cadena de transporte de electrones, aunque la
oligomicina continue bloqueando la produccin de ATP. La fraccin Fo est formada por proteinas
transmembrana en la membrana mitocondrial interna (MMI), y es bsicamente un poro que
permite el paso de H+. La fraccin F1 se encuentra del lado interno de la MMI y es la encargada
de utilizar la disipacin del gradiente electroqumico para fosforilar ADP + Pi y liberar ATP.
Los nucletidos entran y salen de la mitocondria a travs de transportadores especficos.
Un gran complejo proteico llamado ATP-sintasa situado en la membrana mitocondrial interna
(MMI), permite a los protones pasar a travs en ambas direcciones; genera el ATP cuando el
protn se mueve a favor de gradiente. Debido a que los protones se han bombeado al espacio
intermembranoso de la mitocondria en contra de gradiente, ahora pueden fluir nuevamente dentro
de la matriz mitocondrial y mediante la va ATP-sintasa, se genera ATP en el proceso. La reaccin
es:
ADP3-
H+
Pi
ATP4-
H2O
Cada molcula de NADH contribuye suficientemente a generar la fuerza motriz de un protn que
produzca 2,5 molculas de ATP. Cada molcula de FADH2 produce 1,5 molculas de ATP.[1] Todas
juntas, las 10 molculas de NADH y las 2 FADH2 provenientes de la oxidacin de la glucosa
(gluclisis, descarboxilacin oxidativa de piruvato en acetil-CoA yciclo de Krebs) a formar 28 de las
36 molculas totales de ATP transportadoras de energa. Hay que decir que estos valores de
molculas de ATP son mximos. En realidad cada molcula de NADH contribuye a formar entre 2 y
3 molculas de ATP, mientras que cada FADH2 contribuye a un mximo de 2 molculas de ATP.