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DE ACTIVIDAD
INSTITUTO
POLITCNICOENZIMTICA
Y EFECTO DE LA
CONCENTRACIN
DE
Instituto
Politcnico Nacional
NACIONAL
Unidad Profesional Interdisciplinaria de Biotecnologa
UNIDAD
PROFESIONAL
ENZIMA, PH,
TEMPERATURA
Y FUERZA
Laboratorio
de Bioconversiones
INICA EN LAINTERDISCIPLINARIA
ACTIVIDAD ENZIMTICA (DE BIOTECNOLOGA
AMILASA).
PROFESORES:
Dra. Mara del Carmen Oliver S.
Dr. Luis Fernndez Linares
IBT. Jocelyn Snchez Arellano
GRUPO: 5BM1
EQUIPO: 6
ALUMNOS:
1.3.1 Introduccin.................................................................................................16
1.3.2 Objetivos.....................................................................................................16
1.3.3Metodologa.................................................................................................17
1.3.4Discusin......................................................................................................19
1.3.5 Conclusiones...............................................................................................19
1.3.6Bibliografa...................................................................................................19
1.4 Determinacin de crecimiento celular por turbidimetra o Densidad ptica
(D.O), peso seco y cuenta directa en cmara de Neubauer...................................20
1.4.1 Introduccin.................................................................................................20
1.4.2. Objetivos....................................................................................................21
1.4.3Materiales y reactivos..................................................................................21
1.4.4. Metodologa...............................................................................................22
1.4.5. Resultados.................................................................................................22
1
Micropipeta 1L - 10L
Micropipeta 2L - 20L
Micropipeta 20L - 200L
Micropipeta 100L - 1000L
Puntas para micropipetas
Balanza analtica
Tubos eppendorf
Agua destilada
Glicerol
Diclorometano
Calibracin de micropipetas
Se ajust una micropipeta de 100L - 1000L a un el volumen de 600L ,se
tomaron 5 alcuotas de agua destilada como se muestra en la ilustracin 1 y
se pesaron en balanza analtica, utilizando un tubo eppendorf como contenedor
Calculo del error sistemtico y aleatorio de micropipetas.
Con los obtenidos se calcul el error sistemtico que proporciona la Exactitud
(proximidad de la medida a su valor real) y el error aleatorio, que nos
expresar la Precisin (grado de reproducibilidad de las medidas) de la pipeta.
Para el clculo del error sistemtico, se consider previamente el factor de
correccin del agua, considerando la presin atmosfrica de la ciudad de
Mxico de 80kPa y una temperatura de 23.5 C. Los factores de correccin se
muestran en la Tabla 1.
Tabla 1Factor Z (g/L) EN ISO 8655 para agua
destilada en funcin de la temperatura y presin
atmosfricas
x =
valores medidos
n nmero de valores medidosZ
(1)
e s=100
x xnominal
( 2 )
x nominal
xix 2
(3)
N
i=1
=
Es necesario calcular la desviacin estndar como un valor porcentual
(coeficiente de variacin).
S% =
*100 (4)
1.1.4 Resultados
Las Tablas 2 muestran los resultados de las mediciones de la masa de los
volmenes tomados con la micropipeta
Volumen
500L
0.4870g
1.1.5. Discusin
La norma EN ISO 8655 establece los lmites permisibles de error en las
micropipetas, la Tabla 4 muestra tales datos. Al realizar la comparacin entre el
error obtenido con las micropipeta del laboratorio de bioconversiones y los
establecidos en la norma, se observan diferencias significativas, esto hace
suponer que el equipo est mal calibrado.
1.1.6. Conclusiones
Para el manejo de soluciones densas como el glicerol o para lquidos voltiles,
es necesario seguir el protocolo de operacin para asegurar tomar el volumen
adecuado.
El uso adecuado y la calibracin de una micropipeta es un punto clave para
asegurar la exactitud y precisin durante la toma de la muestra.
1.1.7 Referencias
Sica, A. , Constantino, P., Heijo, G., Fabretti, J. A G.antino, P., & Santo, C.
G.antino, P, (2009). Evaluacin del error debido a la evaporacin en el
mtodo gravimtrico de calibracin de micro pipetas. Revista del
laboratorio tecnolgico del Uruguay , 4, 15-18.
10
- bc
11
1.2.2 Objetivos
12
1.2.3 Metodologa
Materiales, reactivos y equipos.
Espectrofotmetros
Se mostr de forma terica el protocolo de operacin del espectrofotmetro. Se
indic la fuente de luz utilizada para los rangos de luz visible y ultravioleta.
Pasos:
1. Prender el espectrofotmetro y esperar a que se caliente entre 10 y
minutos.
2. Antes de realizar una medida, el aparato debe calibrarse, para lo cual
introduce una CELDA (o cubeta) con el blanco y se lleva a cien
transmitancia y a cero de absorbancia.
3. Posteriormente, se introdujo una celda con la muestra y se ley
absorbancia a = 597 nm
15
se
de
la
La lmpara de deuterio es usada para medidas con longitud de onda dentro del
rango visible, por otro lado las lmparas de tungsteno son usadas para
mediciones en el rango de UV.
Consideraciones que hay que tener en el manejo:
13
Limpiar las celdas con papel liso y asegurarse de que las celdas no posean
partculas, manchas o huellas dactilares.
14
Se deben limpiar los rotores despus de su uso para evitar que exista
desequilibrio al momento de usar la centrfuga nuevamente.
15
Se deben limpiar los rotores despus de su uso para evitar que exista
desequilibrio al momento de usar la centrfuga nuevamente.
1.2.4 Resultados
Se midi la absorbancia de soluciones con diferentes concentraciones del
colorante azul de tripano, los resultados se muestran en la tabla x.
Tabla x. Absorbancias a 597nm
las diluciones del colorante azul
de tripano
Diluci
Abs (597 nm)
n
1:10
0.386
1:20
0.252
1:30
0.170
Grfica x. Absorbancias a 597nm de las diluciones del colorante azul de tripano
1.2.5 Discusin
En el anlisis espectrofotomtrico ordinario se lee la absorbancia, pues sta es
directamente proporcional a la concentracin, si se cumple la ley de LambertBeer (Walton et. al, 1983).
En la Tabla 1 se observa una disminucin en la medida de la absorbancia de las
diluciones realizadas, conforme disminuye la concentracin del colorante azul
de tripano. Lo anterior concuerda con la ley de Lambert-Beer.
1.2.6 Conclusiones
La disminucin de las lecturas de absorbancia es directamente proporcional a
la concentracin del colorante azul de tripano.
1.2.7 Bibliografa
Duymovich, C., Acheme, R., Sesini, S., & Mazziotta, D. (2005).
Espectrofotmetros y fotocolormetros gua prctica de actualizacin.
Acta bioqum. cln. latinoam. v.39 n.4
16
1.3
Preparacin de reactivos requeridos en el laboratorio de
Bioconversiones
1.3.1 Introduccin.
Todos los reactivos y soluciones que se usan en el anlisis biotecnologo para
realizar las pruebas descriptas en las practicas, tanto de principios activos
como de productos formulados deben ser preparados a partir de material de
calidad o grado analitico.
Los reactivos son sustancias empleadas como tales o como elementos
constitutivos de soluciones y se emplean para la realizacin de las pruebas y
valoraciones, los reactivos especiales son los que se utilizan en una prueba en
particular y su preparacin se encuentra descripta junto con dicha prueba.
Por otro lado los Indicadores son reactivos empleados para determinar el punto
final de una reaccinn quimica, para medir la concentracinn de ion hidrogeno
(pH) o para indicar un cambio de pH. Se enumeran junto con los indicadores.
Las soluciones reguladoras son soluciones reguladoras de pH, soluciones
Colorimtricas- Son soluciones empleadas en la preparacin de estndares
colorimtricos para comparacin, se abrevian (SC).
Las Soluciones de Reactivos son soluciones de reactivos en solventes y
concentraciones definidos, apropiados para los fines especificados, se abrevian
(SR).
Las soluciones volumtricas son soluciones de reactivos de concentracin
conocida, empleadas principalmente en determinaciones volumtricas. Las
concentraciones se expresan generalmente en funcin de la normalidad, se
abrevian (SV).
17
1.3.3Metodologa
Reactivo de Bradford
Se disolvieron 100 mg de azl brillante de Coomasie G-250 en 50mL de etanol
al 95%. A esta solucin se le aadieron 100mL de cido fosfrico al 85%(w/v).
La solucin resultante se diluy a un volumen final de 1L. Una vez terminado el
reactivo se verifico que su color fuera caf. Las concentraciones finales en el
reactivo fueron 0.01%(w/v) de azl brillante de Coomasie G-250, 4.7% de
etanol y 8.5%(w/v) de cido fosfrico.
Reactivo DNS
Se disolvieron 30g de tartrato de sodio y potasio en agua destilada has obtener
un volumen final de 50mL. Se agregaron 1.6g de NaOH previamente disueltos
en 10mL de agua destilda, a continuacin se aadi 1g de DNS previamente
disuelto en 20mL de agua destilada. Se afor la solucin a 100mL y se guard
en obscuridad en frasco mbar.
Solucin de almidn 1%(p/v)
Se suspendi 1g de almidn en 100mL de regulador de fosfatos 0.1M con pH
7.0, posteriormente se desnaturaliz calentando en bao de agua a 60 C
durante 15 min.
Solucin de acetatos 0.05M
Se disolvieron 5.103g de acetato de sodio en 750mL de agua destilada y 1.5mL
de cido actico en 500 mL de agua destilada. Se aadi cuanto fue necesario
hasta alcanzar un pH 5 de la solucin de cido actico a la solucin de acetato
de sodio.
18
Solucin de alfa-amilasa.
La alfa-amilasa degrada
el
almidn
en
una
mezcla
de disacridos: maltosa, maltotriosa trisacrido (la cual contiene dos (1-4)residuos de glucosa) y oligosacridos conocidos como dextrinas, que contienen
la (1-6)- ramas de glucosa.
Solucin de antrona.
Es una solucin reguladora, con aplicaciones variadas, ya sea actuando sola o
con mltiples componentes en homogenizacin, as
como los reactivos
mencionados.
19
Clculos de acetatos.
Preparacin de reactivos.
136.08gr--------1M1L
60.05mL------1L---1M
6.804gr--------0.05M750mL
30.025mL-----1L---0.5M
1.3.4Discusin
Un mtodo rpido y exacto para la estimacin de la concentracin de
protenas es esencial en muchos campos de estudios como la caracterizacin y
purificacin de protenas y enzimas, estudio de la expresin de una protena y
diagnstico clnico.
Bradford se ha vuelto el mtodo preferido en los laboratorios debido a su
mayor rapidez y sensibilidad, la buena tcnica en la preparacin de reactivos,
mostr resultados viables en las siguientes prcticas.
Segn el mtodo Miller, los azcares reductores pueden reducir el cido 3,5dinitrosaliclico (DNS) bajo determinadas condiciones. Cuando el cido 3,5dinitrosaliclico es reducido en presencia de calor, por los azcares reductores
que entran en contacto, con l se desarrolla un cambio de color parecido al
caf. El cambio de coloracin puede entonces determinarse por lecturas de
densidad ptica, ledas por espectrofotometra a una determinada longitud de
onda que se realizaron en las prcticas siguientes.
1.3.5 Conclusiones
Se realizarn los clculos correspondientes para la elaboracin de los reactivos
descriptos.
En el laboratorio de bioconversiones se usa el reactivo de Bradford para la
cuantificacin de protenas.
En el laboratorio de bioconversiones se usa el reactivo DNS para la
cuantificacin de azcares reductores.
1.3.6Bibliografa
Bailey (1998) Applied Microbiology and Biotechnology Volumen 29 VTT,
Biotechnical Laboratory, Tietotie 2, SF-02150, Espoo, Finland
20
21
22
1.4.2. Objetivos
1.4.3Materiales y reactivos.
Micropipeta 2L - 20L
Micropipeta 20L - 200L
Micropipeta 100L - 1000L
Centrfuga
Balanza analtica
Espectrofotmetro
Microscpico
Cmara de Neubauer
Puntas para micropipetas
Charolas de aluminio
Tubos eppendorf
Agua destilada
23
1
.4.4. Metodologa
Densidad ptica (D.O.)
Se emple una muestra de levadura de panadera, a partir de la cual se realizaron diluciones
para obtener un intervalo de lectura de densidad ptica menor a 1.
6. Se realizaron diluciones: 1:100, 1:200, 1:400 1:500 con muestra cultivo de levadura.
7. Se prepar el espectrofotmetro para leer muestras a 600 nm.
8. Se utiliz como blanco una muestra de aproximadamente 1 mL. de medio sin inoculo.
9. Despus se obtuvo la densidad ptica de cada muestra (1mL de cada dilucin) a 600 nm.
10.Para realizar la curva de calibracin (D.O. vs dilucin) se tomaron muestras con lecturas de
absorbancia menores a 1.
Camara de Neubauer
Para la cuenta directa en cmara de Neubauer, se tom un volumen de muestra celular,
posteriormente se realiz una dilucin, se coloc 0.1 mL de la muestra de ultima dilucin entre la
cmara y el cubreobjetos, que por efecto de capilaridad, toda la cmara se cubri de muestra.
Se observ la cmara con muestra al microscopio, el cual, para localizar las divisiones de sta,
fue necesario utilizar el objetivo de 10x y posteriormente, para observar el nmero de clulas, se
cambi el objetivo a 40x; donde seguidamente se procedi a realzar un conteo de clulas
individuales vistas por cuadrante. Se realiz el clculo necesario y se report el resultado en
Cel. /mL.
Peso seco.
1. Se etiquetaron las charolas de aluminio y se pesaron en la balanza analtica.
2. Se coloc sobre las charolas el volumen a diluir de levadura directo correspondiente a las
diluciones: 1, 1:2, 1:4, 1:8, 1:16, 1:50, 1:100, 1:150, 1:200, 1:250.
3. Se dejaron en una estufa a 100 0C, lo que quemo la pastilla, se enfri en el desecador, y se
peso.
4. El peso seco se obtuvo de la diferencia entre el peso inicial y final de cada charola.
A 600nm
1.5
1
Absorbancia
A 600nm
0.5
0
0
Dilucin
1.4.5. Resultados
Densidad ptica (D.O.)
D.O.
A 600nm
1:100
1.114
1:200
0.529
24
1:400
0.232
1:500
0.185
Peso seco.
F
Peso
Charol
Peso
inicial
a (g)
final (g)
(g)
13.42
0,174
1:02
14.84
4
5
13.24
0,104
1:04
14.285
0
1
13.19
0,049
1.8
13.675
5
95
13.28
0,017
1:16
13.382
4
95
13.59
0,008
1:50
13.690
5
9
13.20
0,003
1:100
13.243
2
75
13.25
0,002
1:150
13.274
2
13.25
0,001
1:200
13.265
2
15
13.27
0,000
1:250
13.288
7
75
Tabla 3. Clculo de
peso seco
Peso seco
Dilucin
mg/mL
1:2
17,45
1:4
10,41
1.8
4,995
1:16
1,795
1:50
0,89
1:100
0,375
1.150
0,2
1:200
0,115
1:250
0,075
Dilucin
25
5
0
0 1 f(x)
2 =3 4 5 6 7 8 9 10
R = 0
Peso seco
Camara de Neubauer
El resultado de la cmara de neubauer es de 1 x108 Cel. /mL.
1.4.6 Discusin
Se obtuvieron estimaciones que no pueden ser del todo correctas, ya que se cometieron
errores en el procedimiento, al dejar a temperaturas de 100 0C las charolas con muestra,
(siendo lo recomendable 650C-48 h 800C-24h), provocando que las muestras se algunas
muestras se quemaran, razn que puede causar variacin en los resultados. Tabla 4.
El peso seco obtenido a partir de una muestra (mg/mL), es una tcnica til para
volmenes grandes de muestra ya que diferencias en orden de miligramos representan un
gran nmero de clulas.
Esta relacin directa entre absorbancia y peso seco slo aplica para soluciones diluidas
que no pueden tener una absorbancia mayor a 1, ya que valores mayores producen
desviaciones y comportamientos no lineales que no se podran evaluar de esta manera.
26
Por otro lado el usar diluciones muy pequeas puede involucrar ms errores, debido a
problemas de manejo de equipo como en el pipeteo, y menor sensibilidad en el
espectrofotmetro por el bajo nivel de absorcin.
1.4.7 Conclusiones
La relacin directa entre absorbancia y peso seco slo se aplica para suspensiones diluidas
con una absorbancia<1.
1.4.7 Referencias
Barer, M. R., and Harwood, C. R. 1999. Bacterial viability and culturability. Adv.
Microb. Physiol.(Vol 41, pp 93137).
Sica, A. , Constantino, P., Heijo, G., Fabretti, J. A G.antino, P., & Santo, C. G.antino,
P, (2009). Evaluacin del error debido a la evaporacin en el mtodo. Revista del
laboratorio tecnolgico del Uruguay , 4, 15-18.
27
1.5.2 Objetivos
Conocer la metodologa para realizar el mtodo de Miller (DNS) para cuantificar azucares
reductores.
23
1.5.3 Metodologa
Materiales y reactivos
Agua destilada
Reactivo DNS
Micropipeta de 20 - 200 L
Micopipeta de 200-1000 L
Espectrofotmetro
Parrilla
Flotador
Tubos Eppendorf
Agua corriente
Hielo
Un contenedor
24
Tubo
1
(blan
co)
2
3
4
5
6
7
8
9
10
Concent
racin
de
maltosa
en la
muestra
(g/L)
Vol.
de la
soluci
n de
malto
sa
de
2g/L
(mL)
0.0
0.00
0.2
0.4
0.6
0.8
1.0
1.2
1.4
1.6
1.8
0.1
0.2
0.3
0.4
0.5
0.6
0.7
0.8
0.9
No
de
mu
est
ra
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
Volum
en de
agua
destila
da
(mL)
1.00
0.9
0.8
0.7
0.6
1.5.4 Resultados
0.5
Ajustando la longitud de onda a 540nm cada una de
0.4
las muestras para realizar la curva tipo fue leda,
0.3
obtenindose los resultados que se muestran en la
0.2
tabla 2.
0.1
Concen Absor Absor Absor
Pro
tracin bancia bancia bancia medi
de
1
2
3
o
maltos
a [g/L]
0
-0.08 -0.022 -0.002
0.035
0.2
0.027
0.031
0.013 0.024
0.4
0.092
0.09
0.096 0.093
0.6
0.228
0.192
0.198 0.206
0.8
0.148
0.162
0.101 0.137
1
0.273
0.294
0.278 0.282
1.2
0.398
0.394
0.334 0.375
1.4
0.483
0.355
0.407 0.415
1.6
0.491
0.457
0.574 0.507
1.8
0.477
0.529
0.572 0.526
25
pues se comportaban de la manera esperada y poder as realizar una curva patrn adecuada
que ser necesaria para la cuantificacin de azucares reductores para prcticas futuras.
0.3
0.2
0.1
0
-0.1
Concentracin de maltosa(g/L)
Dnde
Abs= Absorbancia
x= concentracin de maltosa en la muestra
Entonces, con el promedio de las absorbancias obtenido gracias a las lecturas realizadas por
duplicado de cada muestra, se puede conocer la concentracin de azucares reductores en cada
muestra realizando un simple despeje de la ecuacin anterior
x=
|+0.024|
0.3196
1.5.5 Discusin
La Espectrofotometra es una de las tcnicas analticas ms utilizadas ya que se puede
determinar la cantidad de azucares en una muestra de estudio ,comparndola despus con la
radiacin absorbida por un blanco .En este caso, es de gran utilidad para poder determinar la
cantidad de azucares reductores disueltos en una muestra, midiendo la cantidad de radiacin
absorbida por la misma.
La base en la determinacin de azucares reductoras por este mtodo es la reaccin de esos
carbohidratos con reactivos como el DNS que forman un complejo coloreado que puede ser
detectado y cuantificado en un espectrofotmetro.
26
1.5.6 Conclusiones
El mtodo de determinacin de azucares reductores usando DNS es una tcnica sencilla y rpida,
que permite la cuantificacin de stos compuestos con facilidad.
27
1.5.7 Referencias
Vinagre, J. (2002). Calidad de Mtodos Analticos. FAO, 137-145. [En lnea] disponible
en: ftp://ftp.fao.org/docrep/fao/010/ah833s/AH833S07.pdf
28
1.6.2 Objetivos
1.6.3 Metodologa
Materiales, reactivos y equipos
Micropipeta 1L - 10L
Micropipeta 2L - 20L
Micropipeta 20L - 200L
29
Mtodo de Bradford
1. Se prepararon diferentes concentraciones de BSA de 0 a 200 g/ml como se muestra en la
tabla X.
Tabla X. Concentraciones de BSA para lecturas a 595 nm
(BSA) 200 g/mL
(mL)
Agua destilada
(mL)
Concentracin de
BSA (g/mL)
0
0.2
5
0
0.02
5
0.22
5
20
0.0
5
0.2
0
40
0.07
5
0.17
5
60
0.1
0
0.1
5
80
0.12
5
0.12
5
100
0.1
5
0.1
0
120
0.17
5
0.07
5
140
0.2
0
0.0
5
160
0.22
5
0.02
5
180
0.2
5
0.0
200
1.6.4 Resultados
Mtodo de Bradford
Se realizaron lecturas por triplicado a distintas muestras de concentracin conocida, tomando
como blanco para calibrar la curva estndar: 0.25 mL de agua destilada y 0.75 mL de reactivo de
Bradford. Se obtuvieron los datos de la Tabla X, los cuales se usaron para elaborar la curva
estndar que sirve para determinar la concentracin de protenas por el mtodo de Bradford.
Tabla X. Lecturas de absorbancia a 595 nm
30
Concentracin
de BSA (g/mL)
Lectura
1
0
0.260
0.428
0.674
0.738
0.773
0.810
0.838
0.817
0.849
0.839
0
20
40
60
80
100
120
140
160
180
200
Absorbancia (A)
Lectura Lectura
2
3
0
0
0.182
0.190
0.340
0.550
0.632
0.666
0.759
0.760
0.810
0.972
0.888
0.835
0.886
0.777
0.899
0.834
0.827
0.910
0.856
0.846
Promedio
0
0.210
0.439
0.657
0.752
0.851
0.844
0.833
0.850
0.862
0.847
f(x) = 0x + 0.26
R = 0.73
0.8
0.7
0.6
Absorbancia (A)
0.5
0.4
0.3
0.2
0.1
0
0
50
100
150
200
250
Se eliminaron algunos datos debido a que en la grafica de la regresin lineal original se percibe
que las ultimas concentraciones tienen una absorbancia muy similar. Quedando de la siguiente
manera:
31
0.9
0.8
0.7
0.6
0.5
Absorbancia (A) 0.4
0.3
0.2
0.1
0
0
20
40
60
80
100
120
Figura X. Curva estndar de BSA para determinacin de protenas por el mtodo de Bradford.
y = 0.008x + 0.049
Donde: y= absorbancia, x= concentracin de BSA
1.6.5 Discusin
El rango de sensibilidad de U.V. con respecto al mtodo de Bradford para determinar la
concentracin de protena se usaron concentraciones de 0 200 g/mL para la curva estndar
del ensayo.
Sin embargo, una no linealidad intrnseca compromete la sensibilidad y la precisin del mtodo
de Bradford, es decir, hay un grado de curvatura en un amplio intervalo de concentraciones de
protena en la curva estndar de BSA a una =595. Por lo tanto, solo es posible utilizar una
estrecha gama de concentraciones relativamente altas de protena (2-10 mg/mL de BSA); a estas
concentraciones se garantiza un ajuste de regresin lineal mejor (Ernst O., 2010).
La no linealidad representa un inconveniente cuando las cantidades de microgramos de protena
no estn disponibles en la curva estndar, y que a menudo requiere mltiples diluciones de las
muestras desconocidas.
La fuente de la no linealidad est en el propio reactivo, ya que hay un solapamiento en el
espectro de las dos formas diferentes de la coloracin del colorante (Bradford, 1976).
Existen tres formas del azul brillante de Coomassie que est en equilibrio cido-base con el pH
cido habitual del ensayo. Las formas de color rojo, azul, y verde tienen mximos de absorbancia
a 470, 590, y 650 nm, respectivamente. El azul es la forma que se une la protena, formando un
complejo que absorbe intensamente la luz a 595 nm.
El mtodo de Bradford de cuantificacin de protenas est basado en el cambio de color del
colorante Coomassie brilliant blue G-250 en respuesta a diferentes concentraciones de protenas.
32
1.6.6 Conclusiones
El mtodo colorimtrico de Bradford, es un ensayo sencillo y de relativa sensibilidad debido al
inconveniente de la presencia de detergentes o sales que interfieren con la interaccin del
complejo protena-colorante.
Existe una curvatura grande en la grfica original de la regresin lineal, por lo tanto se
eliminaron estos ltimos datos que la ocasionan. La segunda grfica, que fue una modificacin
de la primera, se muestra con una ecuacin mucho mejor.
Referencias
Ernst, O., Zor, T (2010). Linealizacin del ensayo de protenas Bradford. J. Vis. Exp. (38),
e1918.
33
1.7.1 Introduccin
Las amilasas (E.C. 3.2.1.1) se encuentran entre las enzimas ms importantes y de gran
significado para la industria biotecnolgica, constituyendo toda una clase de enzimas
industriales teniendo entre el 20-30% del mercado mundial de enzimas (Azad et al. 2009;
Rajagopalan & Krishnan 2008).
El trmino amilasa fue usado originalmente para designar a una enzima extracelular capaz de
hidrolizar enlaces -1,4-glucosidicos en polisacridos contenedores de 3 o ms unidades de
glucosa 1,4- ligadas como se describe en la ilustracin 1. La enzima acta en almidn,
glicgeno y polisacridos de manera aleatoria liberando grupos reductores.
1.7.1Materiales y mtodo
Micropipeta 1L - 10L
Micropipeta 20L - 200L
Micropipeta 200L - 1000L
Puntas para micropipetas
Balanza analtica
Tubos eppendorf
Espectrofotmetro
Celdas para espectrofotmetro (uv y visible)
Solucin de almidn 1% p/v
Regulador de fosfatos pH 7.0, 0.1M
Reactivo de DNS
-amilasa
Reactivo de Bradford
34
1.7.2 Objetivos
1.7.3 Metodologa
1.7.4 Resultados
El grupo realizo el mtodo de Bradford para determinar de manera directa la cantidad de
protenas presentes en la muestra los cuales se encuentran en la tabla que se muestra a
continuacin
Tabla 1 Absorbancias obtenidas en el metdo de Bradford de el grupo
Equipo
01:10
01:20
1
0.345
0.364
0.194
0.191
2
0.17
0.163
0.098
0.173
3
0.126
0.472
0.241
0.349
4
0
0.275
0.15
0
5
0.527
0.542
0.464
0.843
6
0.146
0.165
0.063
0.105
7
0.817
0.871
0.389
0.421
As mismo se realizaron pruebas de DNS de las muestra a diferentes tiempos para observar de
esta manera la actividad de la amilasa al medir
Tabla 2Resultados de absorbancia para medir actividad enzimtica a 0,3,6 min
Absorbancia DNS
(540nm)
35
0min 3min
6min
0.215
0.119
0.256
0.212
0.235
0.168
promedio
0.221
0.143
0.256
x=( y+0.0093)/0.
4047
1.7.5 Discusin.
Utilizando el promedio de las mediciones de absorbancia se calcul la actividad enzimtica
correspondiente a los tiempos de 6 y 3 minutos utilizando las siguientes ecuaciones:
U=
[ Producto ] t 1[ Producto ] t 0
U esp=
[ Producto ] t 1[ Producto ] t 0
t [ Protena ]
tiempo
Act enz
mol/ml
3 0.22066
667
6
0.1435
0.7
f(x) = - 0.04x + 0.67
0.6 R = 0.96
0.5
0.4
Glucosa[mol/ml]
0.3
0.2
0.1
0
0
Tiempo[min]
36
tiempo
Act enz
Act esp
3 0.220666
0.0733
67
6
0.1435
0.0239
1.7.6Conclusiones
Factores como la temperatura o condiciones del ensayo pudieron haber afectado este
resultado. Pero estos no fueron considerables,
1.7.7 Referencias
Deb, P., Talukdar, S. A., Mohsina, K., Sarker, P. K., & Sayem, S. A. (2013). Production and partial
characterization of extracellular amylase enzyme from Bacillus amyloliquefaciens P-001.
SpringerPlus, 2.
Azad MA, Bae JH, Kim JS, Lim JK, Song KS, Shin BS, Kim HR. Isolation and characterization
of a novel thermostable alpha-amylase from Korean pine seeds. N Biotechnol.
2009; 26:143149. doi: 10.1016/j.nbt.2009.09.006. [PubMed] [Cross Ref]
Rajagopalan G, Krishnan C. Alpha-amylase production from catabolite derepressed
Bacillus subtilis KCC103 utilizing sugarcane bagasse hydrolysate. Bioresour
Technol. 2008; 99(8):30443050. doi: 10.1016/j.biortech.2007.06.001. [PubMed]
[Cross Ref]
37
pH
Concentracin de la enzima
La -amilasa (1,4, -glucanohidrolasa) es una enzima extracelular que hidroliza los enlaces 1-4
glicsidicos de polisacridos, tales como el almidn, glicgeno o productos de degradacin de los
mismos (1). Tiene una actividad enzimtica que oscila entre 53-129 U/L, su peso molecular va de
los 40 000 a 50 000 Da, su actividad requiere de la presencia de iones cloruro (2). Esta enzima
38
1.8.2 Objetivos
Determinar el efecto de la concentracin de enzima en la actividad enzimtica
Determinar la concentracin de la enzima mediante la tcnica de Bradford
Solucin de almidn al 1%
Pesar 1g de
almidn
Suspender en
100 ml de
regulador de
fosfatos 0.1M pH
7.0
Desnaturalizar en
agua a 60 C por
15 min.
39
Preparar un
blanco con 0.25
ml del regulador
de fosfatos y
0.75ml de
Bradford
Determinar la
concentracin
Tomar 0.25 ml
de cada
concentracin y
adicionar 0.75
ml de Bradford
Leer
absorbancia a
595nm
Realizar por
duplicado para
cada
concentracin
de amilasa
Esperar 5 min.
Prepara tubos
eppendorf como
lo indica la tabla
Tomar 0.1ml de
la reaccion y
adicionarlo a un
tubo con 0.1ml
de DNS
Adicionar por
triplicado 0.95ml
de la solucin a
diferentes
concentraciones
Incubar por 5
min en un bao a
25C
Adicionar 0.05ml
de solucion de
amilasa, excepto
al testigo
Utilizar un
intervalo entre
cada tubo, de
30s.
TUBO
Sol. De amilasa
(mg/ml)
Vol. De la solucin de
Testigo
--
3P1
1
3P2
2
3P3
3
3P4
4
3P5
5
0.95
0.95
0.95
0.95
0.95
0.95
40
Sustrato
(ml)
Vol. De la solucin de
Enzima en PO4
(ml)
0.05
0.05
0.05
0.05
0.05
0.05
1.8.4 Resultados
Efecto de la concentracin de enzima en la actividad enzimtica de una amilasa
Tabla 8.2 Lecturas de absorbancias a 540 nm a distintas concentraciones de enzima.
Tubos
a
distintas P1
concentraciones de enzima
4mg/m
L
Promedio de absorbancias (nm)
0.293
P2
3mg/m
L
0.337
P3
2mg/m
L
0.262
P4
1mg/m
L
0.262
P5
0.5mg/
mL
0.166
0.5
0.4
0.3
Absorbancia a 540nm
0.2
0.1
0
0
0.2
0.4
0.6
0.8
1.2
1.4
1.6
1.8
-0.1
Concentracin de maltosa(g/L)
fig. 1 Curva de
calibracin de DNS, en sta grfica se muestra el comportamiento de la absorbancia en funcin
de la concentracin de la muestra
41
x=
y+ 0.024
0.3196
ncentracin de amilasa
sorbancias (nm)
ncentracin de
ductores
4mg/mL
0.293
azcares 0.9918
g/L
3 mg/mL 2mg/mL
1mg/mL
0.337
1.1295
g/L
0.262
0.8948
g/L
0.262
0.8948
g/L
0.5mg/
mL
0.166
0.5944
g/L
1.2
1
0.8
Fig 3
Concentracin de
amilasa (mg/ml)
0.5
1
2
3
4
actividad enzimtica(g/L
*min)
0.0990
0.0500
0
0.0391
-0.0229
comportamiento
42
1.8.5 Discusin
En la tabla 8.2 observamos la absorbancia a diferentes concentraciones de enzima en mg/ml,
mediante la grfica 8.2 se determina la concentracin de enzima como lo vemos en la tabla 8.3,
dichos resultados no son satisfactorios, debido a que desde la lectura de la absorbancia se
present irregularidad a lo esperado bibliogrficamente, sin embargo se observa que la
concentracin va aumentando desde [0.5] a [3] manteniendo una relacin ascendente.
Por otro lado se observa que la actividad enzimtica respecto a la concentracin de enzima, no
concuerda con la actividad normal con respecto a la concentracin, ya que entre ms
concentracin de enzima, mayor actividad debera de mostar.
Sin embargo se observa que la mayor actividad enzimtica se encuentra a una concentracin de
0.5 mg/ml (ya que como valor de producto 0, se toma al cero como tal.) y un pH de 7 (pH ptimo
de la amilasa) y a 24C de temperatura. Y la menor actividad, se encuentra entre
concentraciones de 4mg/ml, causando completa controversia al encontrar la menor actividad en
la mayor concentracin de enzima.
En la tabla 8.4 se puede observar los resultados de la actividad enzimtica, los cuales muestran
un comportamiento no esperado bibliogrficamente, debido al mal manejo que se llev a la hora
de preparar las muestras provocando una lectura errnea en el espectrofotmetro.
Con respecto a la velocidad, para sacar los valores de la velocidad se debe linealizar la grfica, y
la pendiente es equivalente a la velocidad.
Por otro lado, analizando las posibles causas de los errores, se puede decir que la tcnica de DNS
necesita concentracin y un buen manejo de los espacios y el material, ya que puede existir
error al momento de agregar la soluciones o incluso en el tiempo en el que acta el DNS e
incluso en la temperatura optima a la que se debe trabajar.
La actividad enzimtica es una medida de la cantidad de enzima activa presente y del nivel de la
actividad de la misma, por lo que la medida de la actividad es dependiente de las condiciones
1.8.6 Conclusiones
Con el fin de obtener respuesta a la actividad enzimtica en funcin de la concentracin, se
realiz la metodologa mostrada anteriormente, mediante la tcnica de DNS se determin dicha
actividad enzimtica.
La cuantificacin de la actividad enzimtica siempre est en funcin de ciertas condiciones que
si se modifican afectan el ensayo enzimtico. Dichas condiciones las comenzamos a ver con la
variacin de concentracin de enzima.
X=
y +0.024
0.3196
X ( 0.5 )=
0.166+ 0.024
=0.5944
0.3196
43
X ( 1 )=
0.262+0.024
=0.8948 g /L
0.3196
X ( 2 )=
0.262+0.024
=0.8948 g /L
0.3196
X ( 3 )=
0.337+ 0.024
=0.1295 g/ L
0.3196
X ( 4 )=
0.293+0.024
=0.9918 g / L
0.3196
g
L del producto.
U 0.5=
U 1=
=0.0990 g / Lmin
[ 0.8948 ]t 1[ 0.5944 ]t 0
U 1=
U 1=
[ 0.5944 ]t 1 [ 0 ] t 0
=0.0500 g /L min
[ 0.8948 ]t 1[ 0.8948 ] t 0
6
[ 0.9918 ]t 1[ 0.8948 ] t 0
6
=0 g/ L min
=0.0229 g / Lmin
1.8.8 Bibliografa
44
Figura 1.
sobre la actividad enzimtica
Los enzimas poseen grupos qumicos ionizables
(carboxilos -COOH; amino -NH2; tiol -SH; imidazol,
las cadenas laterales de sus aminocidos. Segn el
medio, estos grupos pueden tener carga elctrica
negativa o neutra. Como la conformacin de las
depende, en parte, de sus cargas elctricas, habr
el cual la conformacin ser la ms adecuada para
actividad cataltica. Este es el llamado pH ptimo.
Efecto de la temperatura
etc.) en
pH del
positiva,
protenas
un pH en
la
correcto
bioqumicas
como, a
formados
tampn o
aadir
45
un cido dbil y una sal del mismo cido con una base fuerte (por ejemplo, cido actico y
acetato sdico)
una base dbil y la sal de esta base con un cido fuerte (por ejemplo, amonaco y cloruro
amnico)
1.9.2 Metodologa
Metodologa para la preparacin de buffer de fosfatos a pH 7
Para realizar la preparacin de la solucin de buffer a pH 7, se pesaron 4.3544 g de fosfato
dibsico de potasio (K2HPO4) equivalentes a 0.1 M para 250 mL de buffer. Se transfirieron estos a
un matraz aforado de 250 mL y se afor con agua destilada. Despus, se llev a pH 7 con una
solucin de fosfato monobsico de potasio (KH 2PO4) 0.1 M.
Metodologa para la preparacin de solucin de almidn a pH 7
Para preparar solucin de almidn a pH 7, se mezclaron 0.1 gramos de almidn por cada 10 mL
de buffer a pH 7, y se agit hasta que se disolvi completamente el almidn. Posteriormente se
llev a un horno para que el almidn se disolviera completamente y el volumen de muestra
evaporado fue compensado al adicionarle agua destilada.
Efecto del pH en la actividad enzimtica alfa- amilasa
En el desarrollo de la prctica se prepararon soluciones buffer de pH 5.0, 6.0, 7.0, 8.0 y 9.0, para
determinar la actividad enzimtica a estos valores. Con la ayuda de esto se llev a preparar seis
muestra madre en la cual se agreg 0.95 mL de solucin de almidn al 1% y 0.05 mL de enzima
alfa- amilasa, con intervalos de 30 segundos. Esto se realiz por duplicado en tiempos de 3 y 6
minutos.
Primeramente se coloc a cada tubo de reaccin 0.95 mL de solucin de almidn al 1% y a los
tubos para anlisis de actividad enzimtica 0.1 mL re reactivo DNS. Una vez teniendo todo esto
listo se prosigui a iniciar la experimentacin. En tiempo cero se agreg al primer tubo 0.05 mL
de mezcla de reaccin, se dej pasar 30 segundos para poder agregar al otro tubo 0.05 mL de
mezcla de reaccin y as sucesivamente hasta llegar a los 6 diferentes tipos de buffer.
Exactamente en el minuto 3 se agreg 0.1 mL de la nueva mezcla al tubo que se le haba
colocado previamente 0.1 mL de DNS. Y de nuevo se prosigui sucesivamente de esta manera
hasta los 8.3 min, colocando cada muestra madre con sus respectivos tubos como se muestra en
la siguiente tabla. Todo esto se realiz por duplicado de cada regulador de pH.
Una vez que se tuvieron todos los tubos preparados se llevaron a bao mara durante 5 minutos,
transcurrido este tiempo se pasaron inmediatamente a bao de agua fra. Ya que se tuvieron
fros los tubos se coloc 1 mL de agua destilada y se llevaron a leer en el espectrofotmetro a
540 nm.
Efecto de la temperatura en la actividad de la enzima alfa- amilasa
Para la determinacin del efecto de la temperatura se utiliz una muestra de la enzima a un
pH=7. Las temperaturas a determinar fueron 24, 35, 45, 55 y 65C.
46
Se prepararon 4 tubos de reaccin con 0.95mL de solucin de almidn a pH= 7en una gradilla
para tubos de 1.5 mL. En la misma gradilla para cada tubo de reaccin se prepararon 4 tubos
con 0.1mL de reactivo DNS y un tubo sin enzima como blanco.
Al inicio del proceso los tubos de reaccin con 0.95mL de solucin de almidn y el blanco
correspondiente se colocaron previamente dentro de un bao por 5 minutos para que alcanzaran
la temperatura de determinacin.
Se comenz en un tiempo cero adicionando 0.05mL de solucin de enzima al cada tubo de
reaccin en las temperaturas antes mencionadas.
Pasados 3 minutos, se adicion 0.1mL de la mezcla de reaccin del tubo a los tubos con DNS.
Pasados 6 minutos desde el tiempo cero, se adicion 0.1mL de la mezcla de reaccin de los
tubos a los que contienen DNS.
Se vaciaron los tubos de reaccin con DNS en celdas espectrofotomtricas y se procedi a leer la
absorbancia a 540nm como lo indica el mtodo de determinacin con DNS.
1.9.3 Resultados :
Se analiz la actividad enzimtica de la enzima -amilasa a diferentes temperaturas y distintos
pH para conocer su comportamiento de acuerdo a las condiciones fisicoqumicas presentes,
obteniendo una diferencia de actividad notable y velocidades variables (Tabla 1 y 2), observando
que las condiciones si afectan la funcin de la enzima.
Tabla 1. Determinacin de actividad enzimtica de -amilasa a diferente pH.
Ph
5
6
7
8
9
Velocidad Promedio
(g de Glucosa/L * min)
0.2544
0.2636
0.1675
0.0000
0.0000
U
1.4133
1.4647
0.9304
0.0000
0.0000
Concentracin
Proteica Muestra (mg)
0.1000
0.1000
0.1000
0.1000
0.1000
U/mg de
protena
14.1330
14.6469
9.3042
0.0000
0.0000
47
16
14
12
10
U/mg de proteina (mol/min*mg)
8
6
4
2
0
5.0
6.0
7.0
8.0
9.0
10.0
pH
Temperatura
C
24.1
35
55
65
Velocidad Promedio
(g de Glucosa/L *
min)
0.1675
0.0728
0.2193
0.1417
0.9304
0.4047
1.2184
0.7870
Concentracin
Proteica Muestra
(mg)
0.1000
0.1000
0.1000
0.1000
U/mg de
proten
a
9.3042
4.0472
12.1844
7.8695
14
12
10
8
U/mg de proteina (mol/min*mg)
6
4
2
0
2025303540455055606570
Temperatura (C)
48
1.9.4 Discusin
Todas las enzimas tienen un pH ptimo en donde tienen mayor actividad, y a medida que se
alejan de ese pH (ya sea alcalino o cido) disminuye su actividad. Esto se debe a que unos restos
aminoacdicos de las enzimas tienen cargas y pueden ser los responsables tanto de mantener la
estructura tridimensional de la protena como de interaccionar con el sustrato. El pH del medio
puede modificar las cargas de estos aminocidos y de este modo desnaturalizar a la enzima.
En la figura 2 puede verse que el pH ptimo donde la enzima alfa- amilasa alcanza una actividad
enzimtica ptima y por ende una velocidad cataltica alta es en un pH cercano a 6. Si el medio
es cido, la actividad enzimtica no tiene una repercusin tan fuerte en comparacin con medios
alcalinos.
Por tanto, se puede decir que a pH extremos, la alfa- amilasa deja de funcionar o al menos
disminuye notablemente su actividad enzimtica.
En la figura 3, existe cierta incongruencia en los datos, ya que segn la grfica la temperatura
ptima de la enzima alfa- amilasa es de 55C. Pero el comportamiento de la grfica es sigmoidal,
indicando en un principio que a una temperatura baja (en comparacin a su ptima) hay buena
actividad enzimtica, quiz no la mejor, pero si funciona bien en la conversin de sustrato
producto, luego la temperatura aumente y la actividad enzimtica vuelve a verse afectada.
El pH ptimo y la temperatura ptima son de 5-6 y de 60C respectivamente. Ambos casos se
pudieron comprobar en la prctica, pero el comportamiento de las dems temperaturas no es
claro.
Aun que si se compara la grfica obtenida con la bilbiografa, se aprecia que el comportamiento
es similar
}
Figura 4. Efecto de la temperatura en la hidrlisis de almidn por la enzima alfa- amilasa
1.9.5 Conclusiones
Al trmino de la prctica, se concluye que:
49
La temperatura ptima para la hidrlisis de almidn por alfa- amilasa es de 55C, pero no
quiere decir que slo a temperaturas elevadas realiza una buena funcin, sino tambin en
temperaturas bajas puede tener un funcionamiento bueno.
En medios cidos, la actividad enzimtica de alfa- amilasa es mejor que en medio alcalinos.
1.9.6 Bibliografa
Manuel Tena Aldave y Jess Jorrn Novo. Estudio cintico de la actividad de invertasa de levadura
de panadera. Departamente de Bioqumica y Biologa molecular.
50