Gua de estudio para el tercer parcial de Biologa Molecular

Regulacin gentica.
1.- Define los siguientes conceptos brevemente:
a) Regulacin
e) Represor
k) Potenciador o
positiva
f) Activador
enhancer
b) Regulacin
g) Inductor
l) Silenciador
negativa
h) Correpresor
m) Transactivador
c) Operon
i) Coactivador
n) Atenuacin
d) Sitio operador
j) Inactivador
o) Reguln
p)
q) 2.- Explique cmo funciona la regulacin positiva y negativa en el
opern de la lactosa
r) 3.- Explique cmo funciona la regulacin por atenuacin
s) 4.- Explique cmo funciona el reguln SOS
t) 5.- En qu consiste la respuesta de austeridad
u) 6.- Una mutacin en la regin promotora de un gen puede provocar
tanto una sobreexpresin como una subexpresin de los genes
correspondientes. Explique los dos fenmenos desde el punto de vista
molecular
v) 7.- Clulas de E. coli son colocadas en un medio de cultivo que
contiene lactosa; indique cules de las siguientes circunstancias
afectara la expresin del opern de la lactosa provocando ya sea un
aumento, una disminucin o bien si no se producira ningn cambio
w)
a) Adicin de altos niveles de glucosa
b) Una mutacin que inactive a la galactosidasa
c) Una mutacin que inactive a la galactsido permeasa
d) Una mutacin en el represor Lac que evite la disociacin del mismo
del sitio operador
e) Una mutacin que evite la unin de la protena CRP a su sitio de unin
cerca del promotor lac
x) 8.- Explique brevemente
a) Por qu hay un retraso en el crecimiento celular cuando las bacterias
son cambiadas de un medio que contiene glucosa a uno que solo
contiene lactosa?
b) Cundo el medio contiene tanto glucosa como lactosa, cules
protenas estarn unidas a la regin reguladora del opern lac?
c) Si solamente hay lactosa en el medio cules protenas estarn
unidas a la regin reguladora del opern lac?
y) 9.- Describa brevemente las caractersticas y los mecanismos de
accin de los miRNA, los siRNA y los lncRNA en la regulacin de la
expresin
z) 10.- Cul es el papel de la remodelacin cromatnica en la regulacin
de la expresin gentica?
aa)
ab)
ac)
ad)
ae)
af)
ag)

ah)
ai)
aj)
ak)
al) Traduccin
am)
an)
11.- Defina los siguientes conceptos:
ao)
a) Codn
i) Aminoacil
b) Anticodn
tRNA sintetasa
c) Marco
de
j) Peptidil
lectura abierto
transferasa
d) Hiptesis del
k) Sitio
P
bamboleo
ribosomal
e) Codn
de
l) Sitio
A
inicio
ribosomal
f) Codn
de
m) Factores
de
terminacin
traduccin
g) Cdigo
n) Sitio de unin
gentico
al
ribosoma
h) Degeneracin
(RBS)
del
cdigo
o) Secuencia
gentico
Kozac

p) IRES
q) Pptido seal
r) Partcula
de
reconocimient
o de seal
s) Destinacin de
protenas
t) Modificacin
postraduccion
al
u)

v)
w) 12.- Ha aislado un fragmento de DNA viral que codifica para al menos
dos protenas de 120 y 80 aminocidos cada una. El fragmento es de
400 pares de bases
a) Por qu considerara inusual esto?
b) Al secuenciar las dos protenas no hay homologa en sus secuencias.
x) Proponga un modelo que explique estos hallazgos
y) 13.- A continuacin se muestra un fragmento de una cadena molde
de transcripcin
z)
aa)
5 CTTTGATAAGGATAGCCCTTC3
ab)
a) Escriba la secuencia de bases del fragmento de mRNA transcrito a
partir de esta cadena
b) Cul es la secuencia de aminocidos que sera codificada por este
fragmento iniciando por el primer marco de lectura en el extremo 5
c) Suponga que la cadena complementara es la que se usa como molde
de transcripcin. Cul sera la secuencia de aminocidos del pptido
resultante, otra vez iniciando del extremo 5 en el primer marco de
lectura
ac)14.- Cules son TODOS los resultados posibles del cambio de una
base en una cadena de mRNA?
ad)
15.- La siguiente secuencia de 4 aminocidos es parte de un
polipptido encontrado en la especie silvestre (wild type) de un
organismo: Leu-Ser-Ile-Arg. Se aislaron varias mutantes, cada una de
las cuales contiene una mutacin simple (de un solo nucletido). Las
secuencias de aminocidos correspondientes son:
ae)
a) M-S-I-R
b) L-W-I-R c) L-S-R-R d) L-S-I-P e) L-S-I-W
af)
ag)
Cul es la secuencia de nucletidos del fragmento de mRNA
silvestre que codifica para el pptido original?
ah)
Cules fueron los cambios que produjeron cada una de las
secuencias mutantes?
ai)
aj) 16.- Explique por qu si existen 61 codones que codifican para 20
aminocidos, la mayora de los organismos solamente utilizan 32
diferentes tRNAs para reconocer a los 61 diferentes codones
ak)
al) 17.-Un mRNA dado puede ser traducido en uno de tres diferentes
marcos de lectura. Describa cmo los procariontes y los eucariontes
determinan el marco de lectura correcto
am)
an)
18.- Describa brevemente el papel de los siguientes
componentes en la sntesis de protenas bacteriana
ao)
a) Factor de inicio 2 (IF-2)
b) RNA 16S
c) Factores de terminacin
d) Factor de alargamiento 2 (EF-2, antes EF-G)
ap)
aq)
19.- Numere los siguientes eventos de la sntesis de protenas
bacteriana en el orden correcto
ar)

as) _____Unin del aminoacil-tRNA al sitio A

at) _____ El tRNA desacilado sale del ribosoma
au) _____ La formacin del enlace peptdico provoca una translocacin del
pptido creciente del sitio P al sitio A
av) _____ La subunidad 50S se une al complejo de inicio formado por la
subunidad 30S y el mRNA
aw) _____ El factor de inicio 2 acarrea al fMet-tRNA al sitio P
ax)
ay) 20.- Describa brevemente el papel de las molculas de rRNA 23S (28S
en eucariontes) y 16S (18S en eucariontes) durante la sntesis de
protenas
az)
ba) 21. Mediante un esquema o diagrama de flujo, describa la serie de
eventos que ocurren entre la transcripcin de un mRNA para una
protena secretada y la llegada de esa protena al lumen del retculo
endoplsmico
bb)