Operacins sinxelas con secuencias

Ensayos Biotecnolgicos
IES A Sardieira

Dada la secuencia:
0001 ATGTGCGACCATACCAAGCTGAAAATACTG 0030
0031 CATCCCGTCTGATCTGCACAGTCAAGCAGC 0060
0061 TTAGGGCCCAGTCAGTAGTGCGGTGGGGGA 0090
0091 CCATGCGCGAACATTGTGGTGTTGCACTTA 0120
0121 TGTGCGACCATACCAAGCTGAAAATACTGC 0150
0151 ATCCCGTCTGATCTGCACAGTCAAGCAGCT 0180
0181 TAGGGCCCAGTCAGTAGTGCGGTGGGGGAC 0210
0211 CATGCGCGAACATTGTGGTGTTGCACTTAT 0240
0241 GTGCGACCATACCAAGCTGAAAATACTGCA 0270
0271 TCCCGTCTGATCTGCACAGTCAAGCAGCTT 0300
0301 AGGGCCCAGTCAGTAGTGCGGTGGGGGACC 0330
0331 ATGCGCGAACATTGTGGTGTTGCACTTATG 0360
0361 TGCGACCATACCAAGCTGAAAATACTGCAT 0390
0391 CCCGTCTGATCTGCACAGTCAAGCAGCTTA 0420
0421 GGGCCCAGTCAGTAGTGCGGTGGGGGACCA 0450
0451 TGCGCGAACATTGTGGTGTTGCACTT 0476

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Isabel Marfany Medn
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IES A Sardieira

Secuencia reversa (segundo a pauta de lectura 3'->5')

0001 TTCACGTTGTGGTGTTACAAGCGCGTACCA 0030
0031 GGGGGTGGCGTGATGACTGACCCGGGATTC 0060
0061 GACGAACTGACACGTCTAGTCTGCCCTACG 0090
0091 TCATAAAAGTCGAACCATACCAGCGTGTAT 0120
0121 TCACGTTGTGGTGTTACAAGCGCGTACCAG 0150
0151 GGGGTGGCGTGATGACTGACCCGGGATTCG 0180
0181 ACGAACTGACACGTCTAGTCTGCCCTACGT 0210
0211 CATAAAAGTCGAACCATACCAGCGTGTATT 0240
0241 CACGTTGTGGTGTTACAAGCGCGTACCAGG 0270
0271 GGGTGGCGTGATGACTGACCCGGGATTCGA 0300
0301 CGAACTGACACGTCTAGTCTGCCCTACGTC 0330
0331 ATAAAAGTCGAACCATACCAGCGTGTATTC 0360
0361 ACGTTGTGGTGTTACAAGCGCGTACCAGGG 0390
0391 GGTGGCGTGATGACTGACCCGGGATTCGAC 0420
0421 GAACTGACACGTCTAGTCTGCCCTACGTCA 0450
0451 TAAAAGTCGAACCATACCAGCGTGTA 0476

Secuencia complementaria.
0001 TACACGCTGGTATGGTTCGACTTTTATGAC 0030
0031 GTAGGGCAGACTAGACGTGTCAGTTCGTCG 0060
0061 AATCCCGGGTCAGTCATCACGCCACCCCCT 0090
0091 GGTACGCGCTTGTAACACCACAACGTGAAT 0120
0121 ACACGCTGGTATGGTTCGACTTTTATGACG 0150
0151 TAGGGCAGACTAGACGTGTCAGTTCGTCGA 0180
0181 ATCCCGGGTCAGTCATCACGCCACCCCCTG 0210
0211 GTACGCGCTTGTAACACCACAACGTGAATA 0240
0241 CACGCTGGTATGGTTCGACTTTTATGACGT 0270
0271 AGGGCAGACTAGACGTGTCAGTTCGTCGAA 0300
0301 TCCCGGGTCAGTCATCACGCCACCCCCTGG 0330
0331 TACGCGCTTGTAACACCACAACGTGAATAC 0360
0361 ACGCTGGTATGGTTCGACTTTTATGACGTA 0390
0391 GGGCAGACTAGACGTGTCAGTTCGTCGAAT 0420
0421 CCCGGGTCAGTCATCACGCCACCCCCTGGT 0450
0451 ACGCGCTTGTAACACCACAACGTGAA 0476

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Trnscrito de ARN.
0001 AUGUGCGACCAUACCAAGCUGAAAAUACUG 0030
0031 CAUCCCGUCUGAUCUGCACAGUCAAGCAGC 0060
0061 UUAGGGCCCAGUCAGUAGUGCGGUGGGGGA 0090
0091 CCAUGCGCGAACAUUGUGGUGUUGCACUUA 0120
0121 UGUGCGACCAUACCAAGCUGAAAAUACUGC 0150
0151 AUCCCGUCUGAUCUGCACAGUCAAGCAGCU 0180
0181 UAGGGCCCAGUCAGUAGUGCGGUGGGGGAC 0210
0211 CAUGCGCGAACAUUGUGGUGUUGCACUUAU 0240
0241 GUGCGACCAUACCAAGCUGAAAAUACUGCA 0270
0271 UCCCGUCUGAUCUGCACAGUCAAGCAGCUU 0300
0301 AGGGCCCAGUCAGUAGUGCGGUGGGGGACC 0330
0331 AUGCGCGAACAUUGUGGUGUUGCACUUAUG 0360
0361 UGCGACCAUACCAAGCUGAAAAUACUGCAU 0390
0391 CCCGUCUGAUCUGCACAGUCAAGCAGCUUA 0420
0421 GGGCCCAGUCAGUAGUGCGGUGGGGGACCA 0450
0451 UGCGCGAACAUUGUGGUGUUGCACUU 0476

Protena codificada (estructura primaria). Cuantas soluciones posibles hay para la secuencia
problema? Por qu?
Reading Frame RF1
MCDHTKLKILHPV*SAQSSSLGPSQ*CGGGPCANIVVLHL
CATIPS*KYCIPSDLHSQAA*GPVSSAVGDHARTLWCCTY
VRPYQAENTASRLICTVKQLRAQSVVRWGTMREHCGVALM
CDHTKLKILHPV*SAQSSSLGPSQ*CGGGPCANIVVLH
Reading Frame RF2
CATIPS*KYCIPSDLHSQAA*GPVSSAVGDHARTLWCCTY
VRPYQAENTASRLICTVKQLRAQSVVRWGTMREHCGVALM
CDHTKLKILHPV*SAQSSSLGPSQ*CGGGPCANIVVLHLC
ATIPS*KYCIPSDLHSQAA*GPVSSAVGDHARTLWCCT
Reading Frame RF3
VRPYQAENTASRLICTVKQLRAQSVVRWGTMREHCGVALM
CDHTKLKILHPV*SAQSSSLGPSQ*CGGGPCANIVVLHLC
ATIPS*KYCIPSDLHSQAA*GPVSSAVGDHARTLWCCTYV
RPYQAENTASRLICTVKQLRAQSVVRWGTMREHCGVAL
Puesto que hay cuatro bases diferentes su combinacin ordenada en grupos de tres da lugar a
64 posibilidades diferentes. Esto parece indicar que, puesto que slo hay 20 aminocidos
esenciales, muchas de estas posibilidades o no se emplean, o se emplean para otros fines o
combinaciones distintas de bases pueden codificar el mismo aminocido.

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ESTADISTICA SE SECUENCIAS
-%nucletidos.
A: 112 nucletidos 23,52%
C: 120 nucletidos 25,21%
G: 136 nucletidos 28,57%
T: 108 nucletidos 22,68%
- Porcentaxe de dmeros (parejas de bases diferentes)
AA:
24 dimers 5.04%
AC:
28 dimers 5.88%
AG:
32 dimers 6.72%
AT:
28 dimers 5.88%
CA:
48 dimers 10.08%
CC:
28 dimers 5.88%
CG:
20 dimers 4.2%
CT:
24 dimers 5.04%
GA:
20 dimers 4.2%
GC:
44 dimers 9.24%
GG:
32 dimers 6.72%
GT:
40 dimers 8.4%
TA:
19 dimers 3.99%
TC:
20 dimers 4.2%
TG:
52 dimers 10.92%
TT:
16 dimers 3.36%
- Porcentaxe de tripletes (codones)
AAA:
8 trimers 1.68%
AAC:
4 trimers 0.84%
AAG:
8 trimers 1.68%
AAT:
4 trimers 0.84%
ACA:
8 trimers 1.68%
ACC:
12 trimers 2.52%
ACG:
0 trimers
0%
ACT:
8 trimers 1.68%
AGA:
0 trimers
0%
AGC:
12 trimers 2.52%
AGG:
4 trimers 0.84%
AGT:
16 trimers 3.36%
ATA:
8 trimers 1.68%
ATC:
8 trimers 1.68%
ATG:
8 trimers 1.68%
ATT:
4 trimers 0.84%
CAA:
8 trimers 1.68%
CAC:
8 trimers 1.68%
CAG:
16 trimers 3.36%
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CAT:
CCA:
CCC:
CCG:
CCT:
CGA:
CGC:
CGG:
CGT:
CTA:
CTC:
CTG:
CTT:
GAA:
GAC:
GAG:
GAT:
GCA:
GCC:
GCG:
GCT:
GGA:
GGC:
GGG:
GGT:
GTA:
GTC:
GTG:
GTT:
TAA:
TAC:
TAG:
TAT:
TCA:
TCC:
TCG:
TCT:
TGA:
TGC:
TGG:
TGT:
TTA:
TTC:
TTG:
TTT:

16 trimers
16 trimers
8 trimers
4 trimers
0 trimers
8 trimers
4 trimers
4 trimers
4 trimers
0 trimers
0 trimers
16 trimers
8 trimers
8 trimers
8 trimers
0 trimers
4 trimers
16 trimers
4 trimers
16 trimers
8 trimers
4 trimers
4 trimers
16 trimers
8 trimers
4 trimers
12 trimers
20 trimers
4 trimers
0 trimers
8 trimers
8 trimers
3 trimers
8 trimers
4 trimers
0 trimers
8 trimers
8 trimers
24 trimers
8 trimers
12 trimers
7 trimers
0 trimers
8 trimers
0 trimers

3.36%
3.36%
1.68%
0.84%
0%
1.68%
0.84%
0.84%
0.84%
0%
0%
3.36%
1.68%
1.68%
1.68%
0%
0.84%
3.36%
0.84%
3.36%
1.68%
0.84%
0.84%
3.36%
1.68%
0.84%
2.52%
4.2%
0.84%
0%
1.68%
1.68%
0.63%
1.68%
0.84%
0%
1.68%
1.68%
5.04%
1.68%
2.52%
1.47%
0%
1.68%
0%
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IES A Sardieira

Bibliografa
http://www.dnai.org/geneboy/
http://www.uib.cat/facultat/ciencies/prof/josefa.donoso/campus/modulos/modulo5/modulo
5_5.htm

Fuentes
Internet:
Navegador www.google.es
Geneboy de www.bioxeo.com

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