Documenti di Didattica
Documenti di Professioni
Documenti di Cultura
Universidade de So Paulo
Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz
Caracterizao de linhagens selvagens de Saccharomyces
cerevisiae isoladas de processos fermentativos para
produo de etanol
Vanda Renata Reis
Dissertao apresentada para obteno do ttulo de
Mestre em Cincias. rea de concentrao: Cincia e
Tecnologia de Alimentos
Piracicaba
2011
4
Vanda Renata Reis
Engenheira Agrnoma
Caracterizao de linhagens selvagens de Saccharomyces cerevisiae isoladas de
processos fermentativos para produo de etanol
Orientador:
Prof. Dra. SANDRA REGINA CECCATO-ANTONINI
Dissertao apresentada para obteno do ttulo de
Mestre em Cincias. rea de concentrao: Cincia e
Tecnologia de Alimentos
Piracicaba
2011
Dados Internacionais de Catalogao na Publicao
DIVISO DE BIBLIOTECA - ESALQ/USP
Reis, Vanda Renata
Caracterizao de linhagens selvagens de Saccharomyces cerevisiae isoladas de
processos fermentativos para produo de etanol / Vanda Renata Reis. - - Piracicaba,
2011.
80 p. : il.
Dissertao (Mestrado) - - Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz, 2011.
1. Contaminao 2. Etanol - Produo 3. Fermentao alcolica 4. Leveduras
5. Saccharomyces I. Ttulo
CDD 589.23
R375c
Permitida a cpia total ou parcial deste documento, desde que citada a fonte O autor
3
Aos meus pais, Vanda e Valdemir,
agradeo pela dedicao, pelo companheirismo, pela caminhada, pela luta, pela
lida.
Agradeo pela vida, pelos ensinamentos, pelos sermes, e principalmente pelos
exemplos,
eles so valiosssimos!
Agradeo pelos agrados e principalmente pelos desagrados.
Assim, eu pude ver que na vida nem tudo como a gente quer.
Aprendi a ter limites, a ser mais gente.
Aprendi com vocs a ter coragem, a no desanimar, a saborear a vitria.
Agradeo por tudo o que vocs planejaram e fizeram, por tudo que planejaram e
no fizeram e o que fizeram sem planejar.
Aos meus irmos Junior, Vincius e Vanessa,
que sempre me incentivaram desde o incio da minha caminhada em busca dos
meus ideais.
Ao meu namorado Rafael, pelo companheirismo, amor, pacincia e apoio.
minha querida amiga Ana Paula, pela amizade incondicional.
A todos vocs dedico!
4
5
AGRADECIMENTOS
Agradeo a Deus por me dar foras para alcanar meus objetivos e sonhos e me amparar e
me confortar nos momentos difceis.
prof. Dra. Sandra Regina Ceccato Antonini, pela oportunidade, confiana, orientao e,
principalmente, pelo grande aprendizado que me proporcionou nesses seis anos de
convvio no laboratrio. Admiro muito seu carter e a forma que realiza seu trabalho, com
muito afinco e muito amor.
minha famlia, por sempre me apoiar, me aconselhar e estar ao meu lado
independentemente da minha deciso.
prof. Dra. Silvana Perissatto Meneghin, pela amizade, carinho e alegria.
prof. Dra. Marcia Maria Rosa Magri, pela amizade e ajuda durante o trabalho.
minha grande amiga Ana Paula, por estar presente em todos os momentos da minha
vida, nas alegrias, nas tristezas, na sade, na doena e principalmente nas fermentaes.
minha querida pupila Jssica, pela amizade, carinho e por estar sempre disposta a me
ajudar. Agradeo do fundo do meu corao tanta dedicao e lhe desejo muito sucesso.
s tcnicas do LAMAM (UFSCar), Lcia T. Picollo Silva e Afra Vital Matos Dias Gabriel,
pela colaborao, convivncia, sugesto e amizade.
s Lamanzetes Ana Silvia, Carolina Brito, Carolina, Cristina, Daiane, Gisele, Juliana,
Raizza e Tatiany por fazerem do Lamam um timo local para trabalhar.
minha amiga de mestrado, Marite Del Ostro, pelos timos momentos que passamos e
pelas caronas.
6
s minhas velhas amigas Juliana, Michelli, Aline e Priscila por compartilharem minhas
vitrias e derrotas.
s minhas novas amigas Dulce, Cristina, Vanessa, Milene, Silene, Bruna, Crisla, Ariane e
Zeli (Fermentec) por me ouvirem todos os dias falando da minha dissertao.
Ao querido estagirio Renato, pela amizade, conversas e ajuda na elaborao do trabalho.
Ao Centro de Cincias AgrriasCCA/UFSCar, pela oportunidade de execuo da parte
experimental deste trabalho.
querida professora de Ingls Daniela Corbanezi, pela grande dedicao e por me fazer
estudar ingls.
Aos professores, funcionrios e colegas da Ps-graduao do Departamento de
Agroindstria, Alimentos e Nutrio da Escola Superior de Agricultura Luis de Queiroz.
Aos professores do Departamento DETAIZER/CCA/UFSCar, em especial o Prof. Vico, Prof.
Clvis e Prof. Jorge, pela amizade, incentivo a carreira acadmica e oportunidades.
Aos professores, funcionrios e colegas do Departamento de Parasitologia, Laboratrio
PANGENE da UNESP, campus Botucatu, em especial Dra. Dbora Colombi, Prof. Dr.
Paulo Ribola e Ana Teresa Burlamarqui Faraco Antonangelo, pela ajuda na realizao dos
testes moleculares.
CAPES pela concesso da bolsa de estudo e FAPESP pelo auxlio pesquisa
(2009/14617-4).
7
Tudo tem a sua ocasio prpria, e h tempo para todo propsito
debaixo do cu.
H tempo de nascer, e tempo de morrer; tempo de plantar, e tempo de
arrancar o que se plantou;
tempo de matar, e tempo de curar; tempo de derribar, e tempo de
edificar;
tempo de chorar, e tempo de rir; tempo de prantear, e tempo de
danar;
tempo de espalhar pedras, e tempo de ajuntar pedras; tempo de
abraar, e tempo de abster-se de abraar;
tempo de buscar, e tempo de perder; tempo de guardar, e tempo de
deitar fora;
tempo de rasgar, e tempo de coser; tempo de estar calado, e tempo de
falar;
tempo de amar, e tempo de odiar; tempo de guerra, e tempo de paz.
(Ec 3: 1-8)
8
9
SUMRIO
RESUMO....................................................................................................................... 11
ABSTRACT ................................................................................................................... 13
1 INTRODUO .......................................................................................................... 15
2 DESENVOLVIMENTO ............................................................................................... 17
2.1 Reviso Bibliogrfica ................................................................................................ 17
2.1.1 Sistemas de produo de etanol no Brasil ............................................................ 17
2.1.2 Linhagens selecionadas para a fermentao ........................................................ 19
2.1.3 Microrganismos contaminantes da produo de etanol ........................................ 22
2.1.4 Influncia das condies ambientais no processo fermentativo ............................ 26
2.2 Material e Mtodos ................................................................................................... 29
2.2.1 Identificao molecular das leveduras .................................................................. 29
2.2.1.1 Extrao e quantificao do DNA ....................................................................... 29
2.2.1.2 PCR .................................................................................................................... 30
2.2.1.3 Purificao e seqenciamento ........................................................................... 31
2.2.2 Linhagens de leveduras selecionadas................................................................... 31
2.2.3 Armazenamento das linhagens de leveduras ........................................................ 32
2.2.4 Caracterizao morfo-fisiolgica das linhagens de leveduras ............................... 35
2.2.4.1 Crescimento Invasivo ......................................................................................... 35
2.2.4.2 Capacidade fermentativa .................................................................................... 35
2.2.4.3 Floculao .......................................................................................................... 36
2.2.4.4 Fentipo killer ..................................................................................................... 37
2.2.5 Caracterizao das linhagens de leveduras quanto ao estresse .......................... 37
2.2.5.1 Resistncia temperatura .................................................................................. 37
2.2.5.2 Resistncia ao pH .............................................................................................. 37
2.2.5.3 Resistncia ao etanol ......................................................................................... 38
2.2.5.4 Resistncia altas concentraes de glicose .................................................... 38
2.2.5.5 Resistncia ao actidione ..................................................................................... 38
2.2.6 Caracterizao gentica ........................................................................................ 39
2.2.7 Efeito do tratamento cido sobre o crescimento das leveduras ............................ 40
2.2.8 Teste fermentativo com reciclo celular e tratamento do fermento ......................... 40
2.2.8.1 Plaqueamento .................................................................................................... 41
10
2.2.8.2 Acares redutores totais (ART) ........................................................................ 41
2.2.8.3 Teor alcolico..................................................................................................... 42
2.2.8.4 Clculo de eficincia fermentativa ..................................................................... 42
2.2.9 Anlise estatstica ................................................................................................. 43
2.2.10 Meios e solues utilizados ................................................................................ 44
2.3 Resultados e Discusso .......................................................................................... 49
2.3.1 Identificao molecular das leveduras .................................................................. 49
2.3.2 Caracterizao morfo-fisiolgica das linhagens de leveduras .............................. 49
2.3.2.1 Crescimento invasivo ......................................................................................... 49
2.3.2.2 Capacidade fermentativa ................................................................................... 52
2.3.2.3 Floculao ......................................................................................................... 53
2.3.2.4 Fentipo killer..................................................................................................... 55
2.3.3 Caracterizao das linhagens de leveduras quanto ao estresse .......................... 55
2.3.3.1 Resistncia temperatura ................................................................................. 56
2.3.3.2 Resistncia ao pH .............................................................................................. 56
2.3.3.3 Resistncia ao etanol ......................................................................................... 57
2.3.3.4 Resistncia concentraes de glicose ............................................................ 59
2.3.3.5 Resistncia ao actidione .................................................................................... 60
2.3.4 Caracterizao gentica ....................................................................................... 61
2.3.5 Efeito do tratamento cido sobre o crescimento das leveduras ............................ 64
2.3.6 Teste fermentativo com reciclo celular e tratamento do fermento ........................ 66
3 CONCLUSES/CONSIDERAES FINAIS ........................................................... 73
REFERNCIAS ............................................................................................................. 75
11
RESUMO
Caracterizao de leveduras selvagens de Saccharomyces cerevisiae
isoladas de processos fermentativos para produo de etanol
Dentre as leveduras selvagens mais comumente encontradas na fermentao
alcolica, destaca-se o gnero Saccharomyces apresentando colnias rugosas com
clulas dispostas em cachos (pseudohifas). Este bitipo de levedura tem sempre sido
associado com problemas na indstria, ocasionando queda no rendimento fermentativo.
Sendo assim, o presente trabalho teve por objetivo realizar a caracterizao gentica,
morfo-fisiolgica e da resistncia ao estresse de linhagens de Saccharomyces
cerevisiae que apresentam colnias rugosas e mucosas, buscando alternativas que
possam contribuir para o manejo dessas leveduras selvagens (rugosas) na fermentao
alcolica. Foram realizados testes de caracterizao para crescimento invasivo,
atividade killer, temperatura, pH, concentrao de etanol e acar, presena de
actidione, floculao e capacidade fermentativa, utilizando-se 22 linhagens de leveduras
(11 rugosas e 11 mucosas) selecionadas previamente por seqenciamento da regio
ITS do DNA ribossomal. O efeito do tratamento cido em diferentes valores de pH sobre
o crescimento de duas linhagens (52 rugosa e PE-02 mucosa) foi tambm avaliado,
seguido do monitoramento do crescimento em meio de caldo de cana aps tratamento
cido. Em seguida, testes fermentativos em meio de caldo de cana foram conduzidos
em culturas puras e mista dessas linhagens. Os testes de caracterizao morfo-
fisiolgica mostraram que a invasividade em meio YEPD Agar ocorreu em baixa
freqncia dentre as 22 leveduras testadas; dez dentre onze leveduras rugosas
apresentaram taxa de floculao expressiva, e entre as mucosas a floculao foi
praticamente inexistente; nenhuma das linhagens apresentou produo de toxina killer;
as linhagens com colnias rugosas apresentaram capacidade fermentativa
significativamente inferior s linhagens com colnias mucosas, em sistema de batelada
com ciclo nico de 48 horas em meio de caldo de cana, demonstrando velocidade mais
lenta de fermentao. Quanto resistncia ao estresse por temperatura, pH, etanol e
concentrao de acar, as linhagens mucosas tiveram maior resistncia acidez do
meio, enquanto as linhagens rugosas foram mais resistentes s concentraes
elevadas de etanol e acar. Nenhuma levedura foi resistente ao actidione. A anlise
gentica, atravs dos loci microssatlites, revelou a presena de dois grupos principais
relacionados geneticamente, sendo o primeiro ramo constitudo principalmente de
colnias rugosas (67%), contendo, no entanto, a linhagem PE-02, apresentando
linhagens com alta taxa de floculao e tolerncia s altas concentraes de acar e
etanol; o outro grupo (com trs subgrupos) compreendeu principalmente colnias
mucosas, apresentando pouca resistncia s situaes estressantes aqui estudadas. A
levedura com colnia rugosa (linhagem 52) foi bastante afetada pelo tratamento cido
em valores de pH 1,0 e 1,5, ao contrrio da levedura com colnia mucosa (PE-02). A
fermentao em sistema de batelada com reciclo celular e tratamento cido conduzido
em pH 1,5 teve efeito sobre o crescimento da levedura rugosa quando em cultura mista
com a levedura mucosa, no resultando em prejuzo eficincia fermentativa, quando
comparada com a cultura pura da PE-02. Em cultura pura da levedura rugosa,
constatou-se eficincia fermentativa por volta de 60%, confirmando o baixo
desempenho destas leveduras. O conhecimento das respostas das leveduras rugosas
12
s situaes estressantes pode ajudar a manejar a fermentao alcolica para
minimizar o efeito da levedura contaminante.
Palavras-chave: Eficincia fermentativa; Contaminantes; Estresse
13
ABSTRACT
Characterization of wild yeasts of Saccharomyces cerevisiae isolated from
fermentative processes for ethanol production
Among the wild yeasts more commonly found in the alcoholic fermentation,
wrinkled colonies with pseudohyphal morphology belonging to Saccharomyces genus
are highlighted. This yeast biotype has been associated with industrial problems,
resulting in the decrease of the fermentative yield. In this context, this work aimed to
perform the genetic, morphological/physiological characterization and stress tolerance of
Saccharomyces cerevisiae strains which exhibited wrinkled and mucous colonies,
searching for alternatives that could contribute to the management of these wild yeasts
(wrinkled colonies) in the alcoholic fermentation. Characterization tests for invasiveness
in Agar medium, killer activity, temperature, pH, ethanol and sugar concentration,
actidione, flocculation and fermentative capacity were carried out with 22 strains (11
wrinkled and 11 mucous colonies), which were screened previously by the sequencing
of the ITS region of the ribosomal DNA. The effect of the acid treatment using different
pH values over the growth of two strains (52 wrinked and PE-02 mucous) was also
evaluated, following the growth monitoring in sugar cane juice after acid treatment.
Fermentative tests in sugar cane juice were carried out with pure and mixed cultures of
these strains. The morphological/physiological tests showed that the invasiveness in
YEPD Agar medium occurred in low frequency among the 22 strains tested; ten out of
eleven wrinked yeasts exhibited expressive flocculation, and among the mucous, the
flocculation was near zero; none of the strains showed killer activity; the wrinkled
colonies presented lower fermentative capacity comparing to mucous colonies, in a 48-
hour cycle in batch system using sugar cane juice, with slower fermentation rate.
Concerning the resistance to temperature, pH, ethanol and sugar concentration, the
mucous colonies were more resistant to low pH, while the wrinkled colonies were more
resistant to the elevated ethanol and sugar concentrations. None of the yeasts were
resistant to actidione. The genetic analysis by microsatellite loci revealed the presence
of two main genetic related groups, the first branch comprised mainly of wrinkled
colonies (67%), containing however the PE-02 strain, showing strains with high
flocculation rate and tolerance to high concentration of sugar and ethanol; the other
group (with three subgroups) comprised mainly mucous colonies, showing lower
resistance to the stressing conditions here studied. The yeast with wrinkled colony
(strain 52) was severely affected by the acid treatment in pH values of 1.0 and 1.5, but
the same did not occur with the mucous colony (PE-02). The batch fermentation with cell
recycle and acid treatment in pH 1.5 had effect over the wrinkled yeast growth when in
mixed culture with the mucous yeast, and did not impair the fermentative efficiency
comparing to the pure culture of PE-02. In pure culture with the wrinkled colony, a
fermentative efficiency as low as 60% was observed, confirming the low performance of
these yeasts. The knowledge of the response to stressful conditions exhibited by the
yeasts with wrinkled colonies can help to manage the alcoholic fermentation in order to
minimize the effect of the contaminant yeast.
14
Keywords: Fermentative efficiency; Contaminant; Stress
15
1 INTRODUO
As leveduras constituem indubitavelmente o grupo mais importante de
microrganismos comercialmente explorados, especialmente em funo de sua
capacidade fermentativa. Muito se conhece sobre a bioqumica da fermentao
alcolica, porm os mecanismos de controle do processo para que se possa obter o
mximo de eficincia ainda carecem de estudos, uma vez que na indstria, a levedura
convive com populaes de bactrias e leveduras selvagens que competem pelo
substrato e produzem metablitos que afetam o desempenho do fermento. Uma das
principais preocupaes na indstria sucroalcooleira combater os microrganismos
contaminantes do processo de produo de lcool, os quais so causadores de
problemas como consumo de acar, queda de viabilidade de clulas de levedura
devido s toxinas excretadas no meio, floculao do fermento que acarreta perda de
clulas de levedura pelo fundo de dorna ou na centrfuga, e queda no rendimento
industrial (AMORIM; OLIVEIRA, 1982).
Como os substratos adicionados s dornas de fermentao (melao e/ou caldo de
cana) no so esterilizados, a fermentao etanlica considerada um processo
complexo com sucesses intensas de linhagens de leveduras. Isto favorece o
desenvolvimento de linhagens de leveduras selvagens de Saccharomyces cerevisiae e
no-Saccharomyces, que podem causar a diminuio da produtividade e outros
problemas operacionais (AMORIM; BASSO; LOPES, 2004; SILVA FILHO et al., 2005;
ANDRIETTA et al., 2007). Muitas vezes estas leveduras selvagens apresentam
fentipos como floculao, formao de espuma, pseudohifas, biofilme e crescimento
invasivo, as quais so caractersticas indesejveis para a indstria (FIGUEIREDO,
2008).
Observaes feitas por Ceccato-Antonini e Parazzi (2000) no monitoramento
microbiolgico da fermentao etanlica em unidades industriais e safras diversas,
indicaram a presena de um bitipo de levedura com clulas dispostas em cadeias,
apresentando colnias opacas, superfcie crespa, pertencendo espcie S. cerevisiae.
Esse bitipo apresentou caracteristicamente alto crescimento, permanecendo na
superfcie das dornas, formando uma espcie de espuma grossa, pegajosa, causando
extravasamento de mosto das dornas e conseqentemente perda de acar e lcool.
16
Ceccato-Antonini e Parazzi (1996) verificaram uma proporo de 1:1 entre
leveduras rugosas e no-rugosas no fermento e no vinho, ocasionando uma queda de
10% no rendimento fermentativo e 18% na produo de lcool, numa destilaria de Ja
(SP). Para a retomada do rendimento a valores como 89,5%, o fermento teve que ser
substitudo.
Essas leveduras com colnias rugosas so muito freqentes na fermentao
etanlica, mas pouco se conhece sobre seu poder competitivo em comparao com
linhagens tpicas, que apresentam colnias mucosas, lisas, brilhantes e clulas
isoladas, com brotamento normal.
Sendo assim, este trabalho teve por objetivo realizar a caracterizao gentica,
morfo-fisiolgica e da resistncia aos fatores estressantes de linhagens de
Saccharomyces cerevisiae que apresentam clulas em cachos (pseudohifas) e colnias
rugosas, e verificar sua competitividade em processos fermentativos em comparao
com leveduras que apresentam colnias mucosas, com clulas dispersas, no intuito de
buscar alternativas para manejar a fermentao alcolica quando ocorrer perda no
rendimento fermentativo.
17
2 DESENVOLVIMENTO
2.1 Reviso Bibliogrfica
2.1.1 Sistemas de produo de etanol no Brasil
O etanol pode ser obtido por trs vias: destilatria, sinttica e fermentativa, sendo
que no Brasil, a via fermentativa a maneira mais importante para produo de lcool,
cujo princpio a transformao de acares em etanol e dixido de carbono (LIMA;
BASSO; AMORIM, 2001).
De acordo com LIMA, AQUARONE e BORZANI (1986), qualquer produto que
contenha acar ou outro carboidrato, constitui-se em matria prima para obteno de
etanol. Entretanto, para que seja vivel economicamente, preciso considerar seu
volume de produo, o rendimento industrial e o custo de fabricao. Para o nosso
pas, enquanto no houver concorrncia do lcool de sntese, as nicas matrias-
primas de importncia econmica imediata so os melaos e o caldo de cana-de-
acar.
Dois tipos de destilarias de lcool podem ser encontrados, as anexas e as
autnomas, sendo as primeiras partes integrantes de uma usina de acar, podendo
utilizar o caldo ou mis, e as segundas so independentes, com matria-prima prpria.
O processo tecnolgico de fabricao de etanol formado por uma seqncia de
operaes industriais que resumidamente seriam: extrao da sacarose dos colmos de
cana; preparo do mosto; fermentao; e destilao (Figura 1).
Figura 1 - Fluxograma do processo de produo de lcool direto da cana (LOPES, 2009)
18
A fermentao alcolica o fenmeno por meio do qual os acares so
transformados em lcool e gs carbnico, principalmente por ao das leveduras da
espcie Saccharomyces cerevisiae. No entanto, h vrias maneiras de se conduzir a
fermentao. O reator biolgico pode ser operado de forma descontnua, semicontnua,
descontnua alimentada (ou batelada alimentada) ou contnua, todos podendo trabalhar
com ou sem recirculao do fermento. Atualmente, a maior parte da produo industrial
de lcool em grande escala ocorre em processos fermentativos em batelada e
contnuos, representados na Figura 2. Segundo Amorim (2005), 85% das unidades
produtoras de etanol do pas funcionam em sistema de batelada, e somente 15% em
sistema contnuo. A explicao desses nmeros est nas vantagens que o sistema em
batelada apresenta como maior rendimento na fermentao, melhor mensurao do
rendimento da fermentao, causa menos choques no fermento, obteno de maior
teor alcolico na fermentao, sistema mais flexvel (caso ocorra acidentes), possibilita
melhor assepsia das dornas e maior controle das vazes.
Figura 2 - (A) Esquema simplificado do processo Melle-Boinot de fermentao. (B) Esquema do
processo de fermentao contnua para produo de lcool (FERREIRA, 2008)
No sistema em batelada Melle-Boinot, responsvel por grandes avanos
tecnolgicos, inicia-se a fermentao com a inoculao do p-de-cuba nas dornas,
sendo o mosto alimentado com uma vazo definida, de modo a minimizar os efeitos de
inibio pela alta concentrao de acar no substrato (FERREIRA, 2008). A
fermentao do mosto ocorre durante a alimentao da dorna, e continua aps o
A
B
19
trmino do enchimento da mesma, terminando quando o teor de acares
fermentescveis (ou ART) se torna desprezvel (CARIOCA; ARORA, 1984). O tempo de
alimentao em torno de 4 a 5 horas e o tempo de morte da dorna varia de 4 a 7
horas.
Terminada a fermentao, o mosto fermentado, denominado de vinho ou vinho
bruto, encaminhado para uma dorna volante e segue para as centrfugas para
separao do fermento. O vinho delevedurado (centrifugado) enviado s colunas de
destilao, enquanto o creme ou leite de leveduras vai para a cuba de tratamento. O
processo de tratamento cido do leite de levedura varia bastante conforme a unidade
produtora, mas de modo geral sofre inicialmente uma diluio com gua (at a
proporo de 1 parte de leite de levedura para 1 parte de gua) e a seguir recebe a
adio de cido sulfrico at atingir um pH na faixa de 2,0 a 3,0. A seguir, o fermento
tratado vai para a cuba de descanso, onde permanece por 2,0 a 3,0 horas (FERREIRA,
2008).
2.1.2 Linhagens selecionadas para a fermentao
Apesar dos esforos visando a utilizao de outros microrganismos para a
obteno de etanol nas destilarias brasileiras, a utilizao da levedura Saccharomyces
cerevisiae continua sendo a mais adequada, pois por se tratar de processos no
estreis, necessita-se de um microrganismo robusto, capaz de suportar condies
drsticas.
As leveduras S. cerevisiae apresentam alta eficincia fermentativa, um
crescimento rpido, eficiente metabolizao de acares, habilidade na produo e
consumo de etanol, tolerncia a altas concentraes de etanol e baixos nveis de
oxignio, osmotolerncia, tolerncia a grandes variaes de temperatura, e atividade
celular em ambientes cidos que so fundamentais na sua utilizao industrial
(ANDRIETTA et al., 2007).
Alm disto, conseguem sobreviver e se adequar a ambientes inspitos e
estressantes atravs da sua capacidade de formar filamentos, de apresentar
crescimento invasivo sob a forma de pseudohifas, de flocular, de formar espuma e de
desenvolver biofilmes. Este microrganismo no s pode explorar novos ambientes
20
procura de nutrientes, como tambm consegue se fixar e persistir naqueles adequados
ao seu desenvolvimento (CECCATO-ANTONINI, 2008).
As clulas de S. cerevisiae, quando submetidas a condies de estresse,
desenvolvem uma rpida resposta molecular para reparar danos e proteger as
estruturas celulares dos efeitos causados pelo estresse (RUIS; SCHLLER, 1995;
SWAN; WATSON, 1998; ESTRUCH, 2000). Essa resposta caracterizada pela sntese
de protenas especficas, aumento do nvel celular de trealose e glicerol, alterao da
composio lipdica da membrana plasmtica e da atividade da ATPase (BIRCH;
WALKER, 1999).
Em culturas de S. cerevisiae ocorre o acmulo de trealose em resposta a uma
mudana na temperatura de 30C para 44C, quando a concentrao de trealose atinge
valores intracelulares mximos (CARVALHEIRO; ROSEIRO; GIRIO, 1999). A resposta
ao choque trmico caracterizada pela sntese de protenas especficas denominadas
de protenas de choques trmico ou Hsp (heat shock proteins), que funcionam como
chaperonas nos processos de desnaturao e recuperao de protenas danificadas
(JAKOBSEN; PELHAM, 1991). Alm de choques trmicos, so induzidas por outras
formas de estresse como altas concentraes salinas e etanol, estresse oxidativo,
baixos valores de pH, escassez de nutrientes e presena de metais pesados no meio
(KIANG; TSOKOS, 1998; ESTRUCH, 2000).
Diferenas substanciais entre linhagens de S. cerevisiae justificam a seleo de
linhagens mais apropriadas para o ambiente da fermentao alcolica industrial.
Atualmente existe o fornecimento por unidades produtoras de biomassa, de grandes
volumes de leveduras previamente isoladas de unidades brasileiras durante o perodo
da safra, sendo que essas leveduras recebem o nome de leveduras selecionadas.
Na Tabela 1 so apresentadas, como exemplos, caractersticas de alguns tipos de
leveduras S. cerevisiae selecionadas, como SA-1 (Copersucar), BG-1 (Copersucar),
CAT-1 (Fermentec/ESALQ) e PE-2 (Fermentec/ESALQ). Estas so leveduras
selecionadas pela tcnica de cariotipagem a partir de processos industriais de produo
de etanol, das usinas Santa Adlia, Barra Grande, Usina VO (Grupo Virgolino de
Oliveira) Catanduva e Usina da Pedra, respectivamente (AMORIM, 2005; BASSO et al,
2008).
21
Na Tabela 2 apresentada uma comparao entre algumas leveduras
selecionadas com a levedura de panificao, evidenciando a influncia dos teores de
glicerol e trealose na viabilidade celular.
Tabela 1 - Algumas caractersticas de leveduras selecionadas (FERREIRA, 2008)
Parmetro Referncia SA-1 BG-1 CAT-1 PE-2
Y
X/S
0,04 0,044 0,0463 0,0409 0,0479
Y
P/S
0,46 0,4665 0,4642 0,4694 0,4637
Prod 2,50 2,6579 2,1971 2,5674 2,5113
VCS 5,80 6,0803 5,0518 5,8369 5,7802
Conv 90 93,96 79,07 90,48 89,82
Prod esp 0,48 0,4420 0,4183 0,4799 0,4042
VCS esp 1,05 0,9535 0,9069 1,0288 0,8772
Legenda: YX/S = rendimento de clulas; YP/S = rendimento de produto; Prod = produtividade; VCS =
velocidade de consumo de substrato; Conv = converso de substrato; Prod esp = produtividade
especfica; VCS esp = velocidade de consumo de substrato especfica.
Tabela 2 - Comparao de algumas leveduras selecionadas com levedura de panificao (PAN)
(FERREIRA, 2008)
Parmetros PE-2 VR-1 CAT-1 PAN
Rendimento (%) 91,0 90,5 91,2 88,1
Glicerol (%) 3,38 3,20 3,54 4,70
Trealose (%) 9,5 10,6 10,3 6,0
Viabilidade Final (%) 94,0 95,0 97,0 61,0
Uma comparao entre os rendimentos Y
P/S
na Tabela 2 mostra pouca diferena
entre as quatro leveduras selecionadas, estando estes rendimentos em termos
percentuais em torno de 90 91%. Mas quando comparadas com a levedura de
panificao para a produo de etanol, tal rendimento cai para a faixa dos 88%. Outro
aspecto interessante com relao viabilidade celular, que se situa na faixa de 94 a
97% para as selecionadas, contra 61% para as leveduras de panificao, sendo
tambm estas ltimas maiores produtoras de glicerol (FERREIRA, 2008)
Embora a utilizao de uma levedura qualquer selecionada seja uma alternativa
vivel para o incio da safra, o uso de leveduras provenientes do prprio processo a
22
expectativa para o futuro das usinas brasileiras. A estabilidade microbiolgica em
relao s leveduras do processo de produo de lcool est relacionada utilizao
de inculo de uma levedura isolada do prprio processo (STROPPA; ANDRIETTA;
ANDRIETTA, 2003).
2.1.3 Microrganismos contaminantes da produo de etanol
A contaminao por microrganismos um fato comprovado na maioria das usinas
produtoras de lcool do pas, nas quais o problema pode ser agravado em razo do
processo utilizado, que fornece as condies ideais de desenvolvimento da populao
desses microrganismos (ALTHERTUM et al, 1984).
De acordo com Alquati (1990), a planta da cana-de-acar, como todo organismo
vivo, possui uma microbiota caracterstica distribuda tanto no sistema vascular como
em sua camada perifrica. A presena macia de microrganismos tem origem no
campo, estes adentrando nos colmos atravs da ocorrncia de infestao de pragas ou
por danos provocados nos colmos pelas operaes de corte/carregamento/transporte,
facilitando assim a infeco. As canas saudveis podem conter de 10
1
a 10
8
bactrias/g
e 10
1
a 10
3
bolores e leveduras/g (GALLO, 1989).
Esta microbiota levada juntamente com o caldo bruto no momento de sua
obteno atravs da moagem das plantas. O nmero total de bactrias presentes no
caldo bruto de cana-de-acar pode ser aumentado sensivelmente tanto por perodos
prolongados entre o corte e a moagem da planta como pela falta de assepsia na
moenda, filtros, bombas e tubulaes que entram em contato direto com o referido
material. Bovi e Marques (1983) tambm destacam que alguns microrganismos podem
adentrar a indstria pela gua utilizada em alguns processos, como na lavagem da
cana, no preparo do p-de-cuba e na limpeza dos equipamentos.
Os microrganismos mais comumente encontrados no caule da cana so bactrias
dos gneros Flavobacterium, Xanthomonas, Pseudomonas, Enterobacter, Erwinia,
Leuconostoc, Bacillus e Corynebacterium, alm de bolores e leveduras como Candida,
Saccharomyces, Torula e Pichia (GALLO, 1989).
Os efeitos causados pelas bactrias na fermentao alcolica so consumo de
acares, excreo de compostos txicos s leveduras, acmulo de cidos no decorrer
23
dos ciclos fermentativos, aumento do tempo de fermentao, sobra de acares no final
da fermentao e diminuio do rendimento fermentativo (ALCOOBRAS, 2005).
As bactrias podem tambm induzir a floculao das leveduras do processo. A
formao de flocos compromete a converso de acar em etanol e CO
2
pela reduo
da superfcie de contato direto entre as clulas e o meio. Alm disso, nas unidades que
realizam o reaproveitamento de clulas, as operaes de recuperao de fermento
ficam prejudicadas pela presena dessas estruturas, comprometendo seriamente o
desempenho industrial (LUDWIG; OLIVA NETO; ANGELIS, 2001).
As pesquisas aplicadas fermentao alcolica tem se concentrado,
preferencialmente, em problemas relativos s contaminaes bacterianas,
permanecendo as infeces por leveduras selvagens (leveduras que no foram
inoculadas na fermentao), pouco estudadas e conhecidas.
Se para o controle da contaminao bacteriana possvel a utilizao de agentes
antimicrobianos, o mesmo no pode ser dito, em relao s leveduras selvagens ou
invasoras. Algumas unidades industriais tm se deparado com problemas atribudos
presena de leveduras contaminantes que, altamente competitivas dentro das
condies existentes, passam a predominar na populao de clulas presentes
(CECCATO-ANTONINI; SILVA, 1998). Quando isso ocorre, o processo industrial se
torna mais lento e a destilaria acaba por produzir menor quantidade de etanol por dia,
em comparao com os dias em que no h esse tipo de contaminao. Dessa forma,
uma fermentao mais lenta impe uma diminuio da moagem da cana, que, por sua
vez, diminui o descarregamento desta no ptio da indstria, causando problemas no
cronograma de colheita. Tudo isso provoca custos diretos e perda de receita diria para
a indstria (AGROSOFT BRASIL, 2008).
Vrios autores tm se empenhado na identificao de leveduras contaminantes da
fermentao alcolica. Neder (1957) identificou leveduras dos gneros Saccharomyces,
Pichia e Candida a partir de caldo de cana e de mosto em fermentao, sendo
identificadas espcies como S. cerevisiae, S. carlsbergensis, S. chevalieri, Candida
krusei, C. guilliermondii, C. tropicalis e Pichia membranaefaciens, entre outras.
A anlise de amostras de caldo bruto, caldo misto e gua de embebio em usina
de acar de cana, realizada por Lima et al. (1974), permitiu a identificao das
24
espcies Candida diddensiae, C. fabianii, C. intermedia, C. santamariae, Cryptococcus
kuetzingii, Hansenula polymorpha, Kloeckera corticis, Rhodotorula pallida, R. rubra, S.
uvarum, Torulopsis norvegica e Trichosporon cutaneum.
Oliveira e Pagnocca (1988) detectaram as leveduras Hansenula anomala,
Saccharomyces kluyveri e S. cerevisiae como contaminantes em uma unidade industrial
a partir de amostras de fermento centrifugado, fermento tratado e mosto em
fermentao.
Castro (1995) isolou e identificou, a partir de amostras de vinhos e fermento
centrifugado, principalmente os gneros Candida (42,8%) e Saccharomyces (38,1%).
Observaes feitas por Ceccato-Antonini e Parazzi (2000) no monitoramento
microbiolgico da fermentao etanlica, em unidades industriais e safras diversas,
indicaram a presena de um bitipo de levedura com clulas dispostas em cadeias,
apresentando colnias opacas, superfcie crespa, pertencendo espcie S. cerevisiae.
Esse biotipo apresentou caracteristicamente alto crescimento, permanecendo na
superfcie das dornas, formando uma espcie de espuma grossa, pegajosa, causando
extravasamento de mosto das dornas e conseqentemente perda de acar e lcool.
H trabalhos que mostram que leveduras com estas caractersticas tem baixo potencial
fermentativo (BASSO; AMORIM; OLIVEIRA, 1996), porm h suposio que possam
ser mais resistentes agentes antimicrobianos, como dixido de cloro, por exemplo
(MENEGHIN, 2008).
Ceccato-Antonini e Parazzi (1996) verificaram uma proporo de 1:1 entre
leveduras rugosas e no-rugosas no fermento e no vinho, ocasionando uma queda de
10% no rendimento fermentativo e 18% na produo de lcool, numa destilaria de Ja
(SP). Para a retomada do rendimento a valores como 89,5%, o fermento teve que ser
substitudo.
Trabalho realizado durante 3 safras consecutivas sobre as caractersticas de 300
leveduras selvagens isoladas de 46 destilarias mostrou que 57% das colnias
apresentavam borda lisa e 43% borda rugosa. Todas as leveduras apresentando
colnias com borda rugosa mostraram problemas na fermentao como espuma em
excesso, floculao e/ou sobra de acar no vinho. Entre as leveduras de colnias de
borda lisa, 65% apresentaram pelo menos um dos problemas citados (FERMENTEC
25
NEWS, 2005).
Figueiredo (2008) analisou fenotipicamente 17 linhagens de S. cerevisiae isoladas
diretamente das dornas de fermentao industrial quanto produo de espuma,
floculao, presena de pseudohifas, biofilme e crescimento invasivo, verificando a
possvel correlao com a hidrofobicidade celular e polimorfismos em genes envolvidos
com estes fenmenos. As melhores correlaes observadas foram entre a
hidrofobicidade celular, floculao e formao de biofilme, sendo este ltimo parmetro
inversamente correlacionado com o crescimento invasivo no gar em 70% das
linhagens analisadas.
As leveduras rugosas ou tambm chamadas de leveduras floculantes possuem a
habilidade de se agregarem espontaneamente e formar flocos. Stewart e Russel (1975)
descreveram a floculao como sendo uma agregao de clulas inicialmente livres,
que aps se unirem, sedimentam no meio ou flotam. Esse fenmeno ocorre devido a
fatores intrnsecos, como o controle gentico (genes que expressam protenas
conhecidas como floculinas que permitem que essas leveduras cresam de forma
floculada) e a fatores extrnsecos, como as condies do meio em que se encontram e
sua interao com a estrutura da parede celular.
Segundo Calleja (1974), a floculao pode ser dividida em passiva e ativa. A
floculao passiva ocorre quando h formao de cadeias ou cachos de leveduras
devido a no separao das clulas aps a diviso (as leveduras estudadas neste
trabalho encaixam-se nesta definio), enquanto que a formao de agregados estveis
como conseqncia da coliso chamada de floculao ativa.
Quando as clulas de uma nica linhagem se agregam chama-se de
autofloculao, enquanto que agregaes entre diferentes linhagens ou entre diferentes
espcies provocam a co-floculao, podendo ser entre leveduras de cepas diferentes
ou at mesmo entre leveduras e bactrias (ESSER, HINRICHS; KUES, 1987).
O processo de floculao das leveduras pode ser observado em indstrias de
bebidas como um fenmeno benfico, que pode facilitar a separao do fermento da
suspenso de bebida fermentada (JIN; SPEERS, 1998), enquanto que na indstria do
lcool este processo considerado desfavorvel, pois ocasiona problemas durante a
26
etapa de fermentao e de separao do fermento nas centrifugas (YOKOYA; OLIVA-
NETO, 1991).
Desta forma, a instalao de leveduras selvagens na fermentao pode acarretar
srios problemas operacionais. A eliminao de linhagens invasoras, quando detectado
prejuzo considervel ao processo, consiste na substituio do fermento contaminado
por fermento adaptado, melhoria na assepsia das tubulaes, controle da qualidade da
gua utilizada na diluio do mosto, maior eficincia do tratamento trmico/qumico do
caldo e controle da temperatura de fermentao (CECCATO-ANTONINI, 1998).
A deteco das leveduras contaminantes no processo e a diferenciao destas
em relao levedura do processo no so tarefas fceis. Vrios mtodos tm sido
propostos, incluindo tcnicas moleculares como a cariotipagem, por exemplo. Porm a
utilizao de uma ou vrias tcnicas concomitantemente depende das condies de
trabalho nas destilarias e de pessoal treinado no s para executar como tambm para
interpretar os resultados (CECCATO-ANTONINI, 2010).
2.1.4 Influncia das condies ambientais no processo fermentativo
A habilidade de um microrganismo de crescer e sintetizar um produto em um dado
ambiente determinada pelas caractersticas genticas do organismo. Sendo assim, o
desenvolvimento bem sucedido de um processo fermentativo depende primeiramente
da obteno de uma boa cepa por seleo e mutao, e segundo em elucidar o efeito
dos parmetros ambientais no crescimento e formao do produto, tais como pH,
temperatura, concentrao de acares, oxignio e lcool.
O pH um fator significativo para as fermentaes industriais devido sua
importncia tanto no controle da contaminao bacteriana quanto ao seu efeito sobre o
crescimento da levedura, taxa de fermentao e formao de subprodutos (SOUZA,
2009).
Os valores de pH dos mostos industriais geralmente se encontram na faixa de 4,5
a 5,5, com uma boa capacidade tampo, porm as leveduras mantem uma homeostase
de forma quase independente dos valores do pH do meio, por isso toleram o tratamento
cido (LIMA; BASSO; AMORIM, 2001).
27
Segundo Maia (1989), o pH interno da clula se mantem na faixa de 5,8 a 6,9,
seja qual for o pH extracelular na faixa de 2 a 7. Entretanto, baixos valores de pH
tornam o meio mais agressivo, uma vez que exigem das leveduras um maior dispndio
de energia na manuteno do pH interno, alm de afetar as protenas de transporte da
membrana citoplasmtica que ficam expostas ao meio externo. O pH do meio externo
tambm afeta a velocidade de crescimento das leveduras, a qual atinge um mximo
quando o pH est compreendido entre 5 e 6 (STECKELBERG, 2001).
A temperatura uma das condies ambientais que mais afetam a atividade de
microrganismos, influenciando o crescimento, metabolismo, capacidade fermentativa e
viabilidade celular em leveduras (BATISTA, 2001). As temperaturas timas para a
produo industrial de lcool situam-se na faixa de 26 a 35C, mas no raramente, a
temperatura nas destilarias alcana 38C, dependendo das condies climticas da
regio. medida que a temperatura aumenta, eleva-se a velocidade da fermentao,
mas favorece a contaminao bacteriana, ao mesmo tempo em que a levedura fica
mais sensvel toxidez do lcool, levando formao de metablitos secundrios como
o glicerol. Alm disso, as temperaturas elevadas permitem maior perda de lcool por
evaporao em dornas abertas (LIMA; BASSO; AMORIM, 2001)
Quanto concentrao de acares, o estresse induzido pelo aumento da
osmolaridade externa leva reduo em crescimento e perda da viabilidade das clulas
das leveduras, devido s perturbaes no gradiente osmtico atravs da membrana
plasmtica. Isto leva, por sua vez, a perdas em volume das clulas que se contraem por
causa de diferenas em presso osmtica entre o exterior e o interior das clulas
(SOUZA, 2009).
Quanto utilizao de oxignio, as leveduras S. cerevisiae tm caractersticas
facultativas, podendo seguir rotas metablicas tanto na ausncia (fermentao) como
na presena de oxignio (respirao). Porm, quando h altas concentraes de
acares ocorre a inibio da atividade de enzimas respiratrias, levando produo
de lcool na presena de oxignio, processo denominado Efeito Crabtree (LIMA;
AQUARONE; BORZANI, 1986).
A fermentao alcolica inibida na presena de grandes concentraes de
oxignio, fenmeno este denominado Efeito Pasteur. Este efeito est intimamente
28
associado ao estado fisiolgico da clula, sendo que se manifesta principalmente nas
leveduras que no esto na fase de crescimento (fase estacionria) nas quais ocorre
ntida diminuio do consumo especfico de glicose (STECKELBERG, 2001).
O efeito inibitrio do lcool produzido por S. cerevisiae durante a fermentao
complexo e resulta no principal fator que desencadeia fermentao incompleta e
conseqentemente diminuio no rendimento do processo. O lcool retarda o
crescimento da levedura, reduz viabilidade e habilidade fermentativa (FERREIRA,
2002). Os fatores que influenciam a sensibilidade ao lcool (temperatura, aerao,
composio do meio) agem direta ou indiretamente sobre as propriedades da
membrana plasmtica (STECKELBERG, 2001).
Algumas anlises evidenciaram que o crescimento celular no inibido em
concentraes de lcool inferiores a 26 g/L, mas inibido totalmente quando a
concentrao de lcool atinge 68,5 g/L no meio da fermentao (SOUZA, 2009).
29
2.2 Material e Mtodos
2.2.1 Identificao molecular das leveduras
Foram selecionadas 52 linhagens de leveduras isoladas de diferentes unidades
produtoras de etanol, dessas, 27 linhagens apresentavam colnias mucosas e clulas
dispersas e o restante apresentava crescimento pseudohifal (clulas em cachos) e
colnias rugosas. As leveduras foram identificadas por seqenciamento da regio ITS
incluindo o gene 5,8S do DNA ribossomal (Figura 3), para seleo daquelas da espcie
S. cerevisiae.
Esses testes moleculares foram realizados na seguinte ordem: extrao do DNA,
quantificao do DNA, PCR (Polymerase chain reaction), purificao e seqenciamento,
conforme os itens descritos a seguir e foram realizados na UNESP - Campus de
Botucatu (Departamento de Parasitologia, Laboratrio PANGENE- Pesquisas e
Anlises Genticas).
Figura 3 - Localizao dos primers (grifado em preto) para amplificao da regio ITS do rDNA
(circulo vermelho). Fonte: WHITE et al. (1990)
2.2.1.1 Extrao e quantificao do DNA
Para a extrao do DNA, utilizou-se um eppendorf com 10 L de tampo TE e
adicionou-se a linhagem de levedura com um palito estril. Em seguida, o eppendorf foi
colocado em um freezer (por 1 hora a - 80C ou overnight). Aps esse processo,
colocou-se as amostras em um monobloco a 99C por 20 minutos.
Depois do choque trmico, centrifugou-se as amostras, o sobrenadante foi
recuperado e quantificado. A quantificao foi realizada utilizando-se um
espectrofotmetro (ND-100 Nanodrop), fazendo a leitura em 260 nm e utilizando-se 2
L da amostra.
30
2.2.1.2 PCR
Para a realizao do PCR foi necessrio diluir as amostras de DNA para
aproximadamente 50 ng/L. Antes de iniciar o PCR realizou-se um gradiente de
temperatura para determinao da temperatura de anelamento. A reao de
amplificao foi realizada em um volume de 10 L, contendo 5 L de Go taq Green Mix,
0,5 L de primer ITS-1 (10 mM), 0,5 L de primer ITS-4 (10 mM), 2 L de DNA e 2 L
de gua Milli-Q estril. As seqncias e a localizao dos primers na regio alvo esto
descritas na Tabela 3 e Figura 3, respectivamente. Utilizou-se termociclador modelo
Biometra TGradient Thermal Cycler (USA), cujo programa de amplificao est descrito
na Tabela 4.
Tabela 3 - Primers (Invitrogen) utilizados nas reaes PCR para amplificao da regio ITS
incluindo o gene 5,8S do DNA ribossomal
Nome Seqncia (5 3) Orientao
ITS-1 TCCGTAGGTGAACCTGCGG Forward
ITS-4 TCCTCCGCTTATTGATATGC Reverse
Tabela 4 - Programa utilizado no termociclador para amplificao da regio ITS do DNA
ribossomal, incluindo o gradiente de temperatura para determinao da
temperatura de anelamento
Fase Temperatura Tempo Etapa
1 95C 5 minutos Desnaturao inicial
2** 95C 1 minuto Desnaturao
3** *Gradiente de T:
51C a 61C
45 segundos Anelamento
4** 72C 1 minuto Extenso
5 72C 1 minuto Finalizar a atividade
da taq
6 4C Indefinido Manter as amostras
*Gradiente: 51; 51,2; 51,9; 53; 54,2; 55,4; 56,6; 57,8; 59; 60,1; 60,8 e 61C.
As fases assinaladas com ** foram repetidas por 35 ciclos
Os produtos PCR obtidos foram submetidos eletroforese em gel de agarose 1%
(p/v) dissolvida em tampo TAE 1X e gel RED (1 L/10 mL de gel). O gel foi submetido
a uma voltagem de 80V e corrente de 120 mA, por 90 minutos (fonte EPS301
31
Amersham Biotech). A visualizao do DNA foi feita em transiluminador de UV e as
imagens registradas em cmera digital.
A partir do gradiente de temperatura realizou-se ento o PCR das amostras,
utilizando-se a reao de amplificao com volume de 10 L (Tabela 5) no PCR teste e
com volume de 25 L (Tabela 6) nas amostras que apresentaram bandas no PCR
anterior.
Tabela 5 - Componentes da reao PCR teste
Reagentes Quantidade para 1 reao ( L)
Go taq Green Master Mix 5
Primer ITS-1 0,5
Primer ITS-4 0,5
Agua Milli-Q 1
DNA (120-150 ng) 3
Total 10
Tabela 6 - Componentes da reao PCR posterior
Reagentes Quantidade para 1 reao ( L)
Go taq Colorless 12,5
Primer ITS-1 0,75
Primer ITS-4 0,75
Agua Milli-Q 8
DNA (120-150 ng) 3
Total 25
2.2.1.3 Purificao e seqenciamento
Os produtos PCR foram purificados e enviados Macrogen-Coria
(http://dna.macrogen.com/eng/) para sequenciamento da regio ITS. As seqncias
(forward e reverse) foram analisadas atravs do programa BlastN para identificao das
mesmas junto ao banco de dados do Genbank (http://ncbi.nlm.nih.gov/blast.cgi).
2.2.2 Linhagens de leveduras selecionadas
Foram selecionadas 22 linhagens de S. cerevisiae, sendo 11 apresentando
colnias rugosas e 11 colnias mucosas (Tabela 7, Quadro 1).
32
Tabela 7 - Linhagens de S. cerevisiae selecionadas para os testes nas tabelas
Cdigo Local de isolamento Cdigo de isolamento Morfologia da colnia
2 Usina Santa Adlia VF4 Mucosa
3 Usina Santa Adlia VF5 Mucosa
4 Usina Santa Adlia VF6 Rugosa
6 Usina Santa Adlia VF8 Rugosa
7 Usina Santa Adlia VF9 Rugosa
8 Usina Santa Adlia VF10 Rugosa
9 Usina Santa Lcia 45 Rugosa
10 Usina Santa Lcia 47 Rugosa
12 Usina Santa Lcia 51 Mucosa
15 Usina Santa Lcia 2 Mucosa
16 Usina Diamante 385 Rugosa
17 Usina da Pedra PE-02 Mucosa
18 Usina Santa Lcia FM Mucosa
19 ** URC Rugosa
33 Usina Santa Adlia A1 Mucosa
35 Usina Santa Adlia M1 Rugosa
36 Usina Santa Adlia M2 Mucosa
37 Usina VO Catanduva CAT1 Mucosa
38 Usina Barra Grande BG1 Mucosa
39 Usina Santa Adlia SA1 Mucosa
47 Usina Santa Adlia VF1 Mucosa
52 Usina Santa Adlia SA9-1 RUGOSA Rugosa
**Cedida pela UNESP-Rio Claro (Profa. Dejanira F. Angelis)
2.2.3 Armazenamento das linhagens de leveduras
As leveduras foram armazenadas de trs formas: em slants, nitrognio liquido e
em gua.
Para o preparo dos slants, em tubos de falcon de 15 mL estreis verteu-se YEPD
e estes foram deixados inclinados at endurecimento do meio. Em seguida, a levedura
foi inoculada e incubada a 30C por 48h, sendo os tubos armazenados em geladeira.
33
Quadro 1- Morfologia da colnia (desenvolvida em placas contendo YEPD) e das clulas das linhagens
de leveduras selecionadas (imagem ao microscpio em aumento de 400X) (continua)
34
Quadro 1- Morfologia da colnia (desenvolvida em placas contendo YEPD) e das clulas das linhagens
de leveduras selecionadas (imagem ao microscpio em aumento de 400X) (continuao)
Para armazenamento em nitrognio lquido, em um falcon de 15 mL estril
colocou-se 3 mL de YEPD lquido e um palito estril, que foi previamente colocado em
contato com a levedura. O tubo falcon foi colocado na incubadora a 28C e 240 rpm,
por cerca de 18 horas. Aps esse processo, transferiu-se o material para um eppendorf
e centrifugou-se, sendo o sobrenadante descartado.
35
Preparou-se uma soluo de YEPD liquido + 15% de glicerol (v/v) e em cada
eppedorf acrescentou-se 1.000 L. Em seguida, o eppendorf foi colocado em nitrognio
liquido e armazenado em freezer a 80C.
Para o armazenamento em gua destilada, aps crescimento em YEPD, a colnia
de cada amostra de levedura foi transferida para um eppendorf contendo gua destilada
esterilizada. Em seguida armazenou-se em temperatura ambiente (MARIANO, 2006).
Antes da realizao de qualquer teste, as leveduras foram reativadas em placas
com YEPD slido e incubadas a 30C por 48 h.
2.2.4 Caracterizao morfo-fisiolgica das linhagens de leveduras
2.2.4.1 Crescimento Invasivo
As linhagens de leveduras foram ensaiadas quanto invasividade em meio
slido. As clulas foram semeadas em placas de Petri contendo YEPD e mantidas a
30C por 3 dias, e a temperatura ambiente por mais 2 dias. As placas foram
fotografadas e em seguida, a superfcie do gar foi lavada com gua para retirada das
colnias. As placas foram fotografadas novamente, para verificao da presena das
marcas da colnia no gar (sinal de invasividade no meio de cultura). Foram feitos
cortes transversais no meio de cultura, paralelamente s marcas para visualizao
das estruturas filamentosas ao microscpio.
2.2.4.2 Capacidade fermentativa
A avaliao da capacidade fermentativa das linhagens com colnias rugosas e
mucosas selecionadas foi realizada em meio de fermentao, em estufa a 30C, em
condies de semi-aerobiose (frascos tamponados com algodo), por 48 horas,
retirando-se amostras de 15 mL a cada 12 horas. Foram analisados Brix por
refratmetro de campo; pH em pH-metro digital (Corning); e teor alcolico (g/100 mL),
aps destilao das amostras e leitura do teor alcolico em densmetro digital Anton-
Paar (DMA-45).
O inculo de multiplicao foi preparado em duas fases de cultivos sucessivos. Na
primeira fase, a de pr-inculo, a levedura foi transferida para uma placa de Petri com
meio de reativao YEPD e posteriormente incubada a 30C por 48 horas.
36
Na segunda fase, para obteno do inculo, foram transferidas duas aladas de
clulas da placa de Petri para erlenmeyer de 125 mL contendo 50 mL de meio de
multiplicao. Esses frascos foram mantidos em incubadora a 30 C, sob agitao de
160 rpm, por 24 horas. Para cada linhagem foram utilizados 10 tubos falcons, a fim de
se obter a quantidade de massa mida necessria para a fermentao.
Em seguida, o material foi centrifugado por cinco minutos a 3400 rpm, o
sobrenadante foi descartado e as clulas foram ressuspendidas em 5 mL de meio de
multiplicao. Este volume foi inoculado em erlenmeyers de 125 mL contendo 45 mL
de meio de multiplicao, a 30C e 160 rpm, tambm por 12 horas. Em seguida o
volume do erlenmeyer foi transferido para tubos falcons de 50 mL autoclavados e
tarados. Esses foram centrifugados a 3400 rpm por 5 minutos, novamente o
sobrenadante foi descartado e as clulas foram lavadas duas vezes com gua
destilada. Aps a ltima lavagem, os tubos foram pesados em balana analtica para
estimativa do peso da massa mida no total. Utilizou-se a proporo de 10 g de massa
mida/ litro de meio de fermentao, sendo necessrios, portanto, 2 g de massa mida/
frasco de fermentao, ou seja, 6 g de massa mida (experimentos em triplicata). Essa
quantidade de massa mida foi ressuspendida em 120 mL de meio de fermentao em
um erlenmeyer estril e constituiu-se o inculo da fermentao.
2.2.4.3 Floculao
O ensaio de floculao foi adaptado do trabalho de Wang et al. (2008).
Aps o crescimento em meio de multiplicao, as clulas foram coletadas por
centrifugao (4000 rpm, 5 min), lavadas duas vezes com tampo citrato de sdio (50
mM; pH 3,0) contendo 5 mM EDTA, e mais duas vezes com gua a 4C. As clulas
lavadas foram ressuspensas em gua destilada a 4C at atingir uma densidade ptica
(a 600 nm) igual a 2,0. A floculao (sedimentao) das clulas foi determinada na
ausncia ou presena de soluo de cloreto de clcio a 10 mM. Aps uma agitao
vigorosa dos tubos, amostras foram retiradas da parte superior do tubo para
determinao da densidade ptica a 600 nm no tempo 0 e aps 10 minutos da
suspenso ter sido colocada em repouso.
37
A porcentagem da floculao foi calculada da seguinte forma:
Floculao (%) = (A
0
A
10
) x 100
A
0
onde,
A
0
: absorbncia medida no tempo 0
A
10
: absorbncia
medida aps 10 min
2.2.4.4 Fentipo killer
As linhagens de leveduras selecionadas foram caracterizadas quanto produo
de atividade killer em meio YEPD-azul de metileno, a 30C, conforme procedimento
descrito em Meneghin (2007). As leveduras a serem testadas foram inoculadas sobre o
meio de cultura inicialmente inoculado com as linhagens sensveis CCA003 (S.
cerevisiae NCYC1006) e CCA039 (Torulopsis glabrata ATCC15126). A atividade killer
foi evidenciada pela presena de um halo de inibio e zona azul ao redor da colnia
testada.
2.2.5 Caracterizao das linhagens de leveduras quanto ao estresse
2.2.5.1 Resistncia temperatura
Foi retirada uma alada de uma placa contendo YEPD e a levedura e transferida
para um tubo de ensaio contendo 9 mL de soluo salina. Esta suspenso foi
homogeneizada e contada em cmara de Neubauer para determinao do nmero de
clulas. Ajustou-se a suspenso para 1x10
8
clulas/mL e desta foram retirados 10 L,
os quais foram cuidadosamente depositados na superfcie do meio YEPD. As placas
foram incubadas em estufa nas seguintes temperaturas: 30, 33, 36, 39 e 42C por 4
dias.
2.2.5.2 Resistncia ao pH
Foi retirada uma alada de uma placa contendo YEPD e a levedura e transferida
para um tubo de ensaio contendo 9 mL de soluo salina. Esta suspenso foi
homogeneizada e contada em cmara de Neubauer para determinao do numero de
clulas. Ajustou-se a suspenso para 1x10
8
clulas/mL e desta foram retirados 10 L
que foram cuidadosamente depositados na superfcie do meio YEPD ajustado para os
38
seguintes valores de pH: 6,0; 5,0; 4,0; 3,0; 2,0; 1,75; 1,5; 1,25; 1,0, com soluo de
cido clordrico 6N ou soluo de hidrxido de sdio 1N. Os meios acidificados foram
autoclavados separando-se a soluo nutritiva da soluo aquosa de Agar, logo que
saram da autoclave os dois frascos foram juntados em um nico e ento os meios
foram vertidos em placas de Petri. As placas inoculadas foram incubadas em estufa a
30C por 7 dias.
2.2.5.3 Resistncia ao etanol
Foi retirada uma alada de uma placa contendo YEPD e a levedura e transferida
para um tubo de ensaio contendo 9 mL de soluo salina. Esta suspenso foi
homogeneizada e contada em cmara de Neubauer para determinao do numero de
clulas. Ajustou-se a suspenso para 1x10
8
clulas/mL e desta foram retirados 10 L
que foram cuidadosamente depositados na superfcie do meio YEPD, adicionando-se
etanol absoluto nas concentraes finais de 0; 3; 6; 9; 12; 12,5; 13; 13,5; 14; 14,5; 15,
18 e 21% (v/v). O etanol foi adicionado ao meio liquefeito e a temperatura de 50-55C,
vedando as placas com filme plstico. As placas foram incubadas a 30C por 4 dias.
2.2.5.4 Resistncia altas concentraes de glicose
Foi retirada uma alada de uma placa contendo YEPD e a levedura e transferida
para um tubo de ensaio contendo 9 mL de soluo salina. Esta suspenso foi
homogeneizada e contada em cmara de Neubauer para determinao do numero de
clulas. Ajustou-se a suspenso para 1x10
8
clulas/mL e desta foram retirados 10 L
que foram cuidadosamente depositados na superfcie do meio YEPD contendo glicose
nas concentraes finais de 100, 150, 200, 250, 300, 400 e 500 g/L . As placas foram
incubadas a 30C por 4 dias.
2.2.5.5 Resistncia ao actidione
Foi retirada uma alada de uma placa contendo YEPD e a levedura e transferida
para um tubo de ensaio contendo 9 mL de soluo salina. Esta suspenso foi
homogeneizada e contada em cmara de Neubauer para determinao do numero de
clulas. Ajustou-se a suspenso para 1x10
8
clulas/mL e desta foram retirados 10 L
39
que foram cuidadosamente depositados na superfcie do meio YEPD contendo
actidione nas concentraes finais de 1; 2,5; 5;10 e 15 ppm . As placas foram
incubadas a 30C por 4 dias.
2.2.6 Caracterizao gentica
Para a caracterizao gentica das linhagens de leveduras foi utilizada a tcnica dos
microssatlites, a qual foi realizada em parceria com a Dra. Dbora Colombi (Programa de
Ps Graduao em Gentica UNESP Botucatu & Genotyping Biotecnologia).
A extrao do DNA das leveduras foi realizada com resina comercial Chelex Grade
Molecular Biology Resin (Bio-Rad Laboratories). A resina Chelex foi preparada a 5%
conforme instrues do fabricante (0,5 g para 10 mL de TE), distribuida em micro tubos e
armazenada em geladeira (4 C). Uma colnia de levedura isolada em meio slido foi
coletada com um palito estril, ou 200 L de pellet de cultura lquida centrifugada e lavada
com salina, foram transferidos para um micro tubo estril contendo 300 L da resina Chelex.
As amostras foram homogeneizadas com auxlio de um vrtex por 15 s, centrifugadas a alta
velocidade por 15 s e incubadas por 20 minutos 95 C em termobloco Thermomixer
Compact (Eppendorf, Alemanha). Aps este perodo as amostras foram novamente
homogeneizadas em vrtex por 15 s e centrifugadas alta velocidade por 1 minuto. O
sobrenadante foi transferido para um novo tubo estril e armazenado a -20 C.
Para a amplificao dos loci microssatlites foi utilizado um painel de 10 primers
(P1, P2, P3, P4, P5, P6, P7, P8, P9 e P10) cedidos pela empresa Genotyping
Biotecnologia Ltda (Botucatu-SP). As reaes de PCR contendo 20 L foram
constituidas de 2 L de DNA, 10 L de Go Taq Green Master Mix 2X (Promega, USA),
0,5 M de cada oligonucleotdeo (forward e reverse) especfico para os loci
microssatlite e gua ultra pura estril suficiente para completar 20 uL.
Os produtos de PCR para amplificao dos loci microssatlites foram analisados
em aparelho de eletroforese capilar QIAxcel (Qiagen, Alemanha) onde foi utilizado o
mtodo AL320 com um tempo de injeo de 20 segundos. O marcador 15bp-5000bp
foi usado como marcador padro de alinhamento interno e o tamanho das bandas do
produto de PCR foi determinado atravs do marcador FX 174 Hae III 72bp a 3 kb. O
capilar utilizado foi o QIAxcel DNA Screening Kit e os dados foram visualizados
40
usando-se o software BioCalculator (verso 3). A rvore fentica foi construda usando
o software Populao 1.2.31 pelo mtodo de agrupamento UPGMA (Unweighted Pair
Group Method with Arithmetic Mean).
2.2.7 Efeito do tratamento cido sobre o crescimento das leveduras
Para este teste foram escolhidas duas linhagens, 17 (PE-02, colnia mucosa) e
52 (colnia rugosa). Aps crescimento em placa com YEPD, colocou-se 2 aladas da
levedura em erlenmeyer de 125 mL com 50 mL de meio de multiplicao, no perodo de
12 a 14 horas (overnight) sob agitao de 160 rpm, a 30C. Retirou-se uma amostra
para o plaqueamento e em seguida foi feito tratamento com soluo de cido sulfrico
(pH 1,0; 1,5; e 2,0), com agitao de 160 rpm, a 30C, por 2 horas. Aps o tratamento,
as clulas foram centrifugadas, descartando-se o sobrenadante e a massa de
leveduras lavada duas vezes com gua destilada estril. Em seguida, adicionou-se 50
mL do meio de multiplicao, porm antes da sua incubao, retirou-se uma amostra
para o plaqueamento. Os frascos inoculados foram incubados por 36 horas. Foram
assim retiradas amostras antes do tratamento cido e 0, 18 e 36 horas aps o
tratamento cido. As foram convenientemente diludas em tubos com soluo salina,
sendo espalhados 100 L de cada diluio em meio YEPD. As placas foram incubadas
a 30C por 48-72 horas. A seguir foram contadas as colnias, discriminando-se entre
colnias mucosas e rugosas quando foi avaliada a cultura mista. Os resultados foram
expressos em UFC/mL.
2.2.8 Teste fermentativo com reciclo celular e tratamento do fermento
Foram utilizadas duas linhagens de leveduras, 17 (PE-02, mucosa) e 52 (rugosa)
em culturas puras e mista, sendo 50% (v/v) de cada linhagem na cultura mista. As
fermentaes foram conduzidas da forma descrita no item 3.5.2, porm a cada 12
horas o contedo dos frascos foi centrifugado a 3400 rpm por 5 minutos, sendo a
massa celular tratada com soluo de cido sulfrico, pH 1,5, por 2 horas, em agitador
a 30C. Aps o tratamento cido, as clulas foram lavadas duas vezes em gua
destilada e ressuspendidas em 40 mL de meio de fermentao, sendo a seguir
adicionadas a 160 mL do mesmo meio. Foram realizados seis ciclos fermentativos de
41
12 horas cada, realizando-se o tratamento cido do fermento a cada reciclo. No
sobrenadante aps cada ciclo de fermentativo, foi determinado o Brix por refratmetro
de campo; pH em pH-metro digital (Corning); teor alcolico (g/100 mL) aps destilao
das amostras e leitura do teor alcolico em densmetro digital Anton-Paar DMA-45;
plaqueamento em meio de cultura; e determinao dos acares redutores totais.
2.2.8.1 Plaqueamento
As amostras de 1 mL coletadas no incio dos testes fermentativos e ao final de
cada ciclo antes da centrifugao, foram convenientemente diludas em tubos com
soluo salina, sendo espalhados 100 L de cada diluio em meio YEPD. As placas
foram incubadas a 30C por 48-72 horas. A seguir foram contadas as colnias,
discriminando-se entre colnias mucosas e rugosas quando foi avaliada a cultura mista.
Os resultados foram expressos em UFC/mL.
2.2.8.2 Acares redutores totais (ART)
Pipetou-se 1 mL de cada amostra para bales volumtricos de 100 mL, em
seguida adicionou-se 30 mL de gua destilada e 2,5 mL de acido clordrico (HCl)
concentrado e homogeneizou-se. Os bales foram levados para banho-maria a 65C
por 15 minutos. As amostras foram resfriadas em gua corrente e em seguida
adicionou-se 2,8 mL de NaOH 12N e completou-se o volume do balo at o menisco
com gua destilada. Retirou-se 1 mL de cada soluo preparada transferindo-se para
tubos de ensaio, e neste adicionou-se 1 mL da soluo estoque de ADNS e 1 mL de
gua destilada, totalizando um volume de 3 mL. As amostras foram submetidas ao
banho trmico (gua fervente) por 5 minutos, os tubos em seguida foram resfriados em
gua corrente e receberam 5 mL de gua destilada, perfazendo um total de 8 mL.
Homogeneizou-se por exatos 5 segundos em vortex e realizou-se a leitura da
absorbncia a 540 nm em espectrofotmetro digital (Thermo