Nucletidos y cidos Nucleicos

Nucletidos
Los nucletidos son la base de los cidos nucleicos. Estn constituidos por una base
nitrogenada, una pentosa y un cido fosfrico. La pentosa en el ADN es desoxirribosa y
en el ARN es ribosa.
En la imagen del lado est
representado un nucletido de
forma grfica. Se observa el
grupo fosfato forma
des!idrogenada del cido
fosfrico"# la base nitrogenada y
la pentosa. En este caso
observamos Ribosa# debido a
$ue el %& del carbono ' $ue
est se(alado con color ro)o
presenta un grupo %&. En el
caso de la desoxirribosa se
observa un &.
Las bases nitrogenadas $ue se pueden unir a la pentosa pueden ser Purinas
Pirimidinicas.
Las bases Pirimidinicas son las ms simples y estn basadas en la
Pirimidina: un anillo !eterociclo de * tomos con dos nitrgenos. Los
nitrgenos# al tener + electrones de valencia# conservan un par de
electrones no enla,antes. ver imagen"
En los animales se sinteti,a este anillo constituyendo las bases pirimid-nicas.
Citosina /0amino '0cetopirimidina"# Timina '#/0diceto +0metilprimidina" y
Uracilo '#/0dicetoprimidina presente en ARN".
La base nitrogenada se une a la pentosa a trav1s del nitrgeno de ms aba)o el $ue
esta como arriba del nombre ". Se forma un enlace N-Glucosdico.
Las bases 23ricas o 2ur-nicas estn basadas en la 2urina# $ue es un !eterociclo de
anillos fusionados o condensados. La 2urina corresponde a la fusin de una
primidina especificada en el punto anterior" con un imidazol !eterociclo de +
tomos con dos nitrgenos".
Al igual $ue la pirimidina# la purina es un compuesto aromtico de carcter bsico
debido a su facilidad para aceptar protones. En los organismos animales# este anillo
se sinteti,a para formar las bases pur-nicas mencionadas anteriormente.
Adenina *0aminopurina" y 4uanina '0amino *0cetopurina". Estas se unen a las
pentosas en el nitrgeno 5 de la base. el $ue est como al lado del nombre "
La unin de una base nitrogenada con una pentosa se denomina Nuclesido. Se
denominan.
6itosina 6itidina. Adenina Adenosina.
7racilo 7ridina. 4uanina 4uanosina.
8imina 8imidina
Al unirse un nuclesido con un grupo fosfato se origina un Nucletido.
Los nucletidos se encuentran
formando pol-meros# de forma
libre o asociados a en,imas
actuando como coen,imas en el
metabolismo celular. El ATP
Adenos-n 8rifosfato" es el
Pirimidina Imidaol
nucletido ms abundante considerado como mol1cula de la energ-a. 6omo
coen,imas se encuentra el NA! Nicotinamida adenin dinucletido" y el "A!
9lavin adenin dinucletido" $ue son transportadores de !idrgeno important-simos
para las v-as metablicas celulares.
NAD: 9AD:
Nicotinamida 9lavin
adenin adenin
dinucletido" dinucletido"
El 9AD# a diferencia del NAD puede cargar !#$ tomos de %idrgeno.
Adems# existen formas c-clicas de los nucletidos. el A&Pc Adenosin
;onofosfato c-clico" por e)emplo# es un nucletido en el $ue el residuo de
fosfato forma un diester en los carbonos <= y += de la pentosa. 2articipa
como segundo mensa'ero de (arias %ormonas. La en,ima fosfodiesterasa
lo transforma devuelta en A;2. >er imagen"
cidos Nucleicos:
Los nucletidos pueden encontrarse adems formando parte de los cidos nucle-cos# $ue
son pol-meros de varios nucletidos $ue se unen mediante enlace fosfodiester entre el
carbono <= de una a,3car y el += de la otra. Las bases con los a,3cares se unen mediante
enlaces n)glucos*dicos entre un nitrgeno de la base y el carbono ?= de la pentosa. El grupo
fosfato est unido a la mol1cula en el carbono +=.
7na mol1cula de cido nucleico consiste en una cadena de nucletidos unidos por
enlaces fosfodiester. En el caso del ADN se forma una doble !ebra y en el ARN una !ebra
3nica.

El ADN como se ve
mostrado en esta imagen#
est compuesto por ' !ebras
antiparalelas unidas la una
a la otra mediante puentes
de %idrgeno entre las
bases nitrogenadas
Adenina con
8imina@7racilo y 6itosina
con 4uanina".
2odemos ver $ue el ADN contiene desoxirribosa por la falta de un tomo de ox-geno en el
carbono '= de la pentosa.
La unin de los a,ucares y los grupos fosfato constituyen el es$ueleto de la !ebra y las
bases el punto de unin con la !ebra antiparalela paralela a la otra !ebra pero en direccin
opuesta# una de += a <= y la otra <= a +=".
Las iguales proporciones de 8imina0Adenina y 6itosina04uanina en distintas
muestras experimentales establecen la complementariedad de bases. Esto establece $ue la
Adenina se une con la 8imina al ser complementarias# uni1ndose mediante ' puentes de
!idrgeno y la 6itosina con la 4uanina se unen tambi1n siendo complementarias mediante
< puentes de !idrgeno. En el caso del ARN# la complementariedad de la Adenina se da con
el 7racilo. Esta caracter-stica es de particular importancia para procesos como la
Replicacin# 8ranscripcin y tambi1n para la estructura del ADN# permitiendo la asociacin
entre las ' !ebras.
+attson y Cric, fueron $uienes establecieron $ue la estructura del
ADN era una doble !ebra %elicoidal enrollada sobre s- misma. Es una
doble !1lice dextgira es decir $ue si alguien la ve desde aba)o# podr-a
notar $ue las !ebras se enrollan siguiendo el sentido de las agu)as del
relo)". Adems# la doble !1lice presenta dos tipos de surcos externos. unos
anc!os y profundos $urcos mayores" y unos estrec!os y poco profundos
$urcos &enores". (Ver imagen)
La estructura !elicoidal es posible gracias a $ue en la misma !ebra# las bases
nitrogenadas adyacentes reali,an interacciones hidrfobas y adems# gracias a su
interaccin con la !ebra antiparalela por puentes de hidrgeno. Sin embargo# esta estructura
se altera fcilmente con un simple aumento de T-.
6uando el ADN se calienta lo suficiente ocurre una desnaturalizacin de este#
transformndose en una mol1cula de una !ebra. 2ero no ocurre solo por calor. otro agente
desnaturali,ante es el p& elevado.
En cuanto a la temperatura# se denomina Temperatura de fusin a la temperatura en la
cual el ADN se desnaturali,a. Esta est condicionada por la cantidad de uniones 80A y 604.
Las segundas aumentan la 8A de fusin debido a $ue es necesaria ms temperatura para
poder romper los enlaces triples de la unin 604.
El ADN# sin embargo se puede renaturaliar estando en condiciones bastante espec-ficas.
Es un proceso al a,ar# por lo $ue pueden )untarse mol1culas de ADN de distinto origen e
incluso !ebras de ADN con !ebras de ARN. Este fenmeno se denomina %ibridacin.
Adems la forma del DNA puede variar seg3n otro tipo de condiciones. El ADN presentado
por Battson y 6ricC es la estructura adoptada por este en condiciones de 5'D de !umedad
relativa. el .)!NA. 2ero tambi1n puede adoptar otras estructuras.
El A)!NA es el ADN menos !idratado# con una leve inclinacin y mayor dimetro.
El /)!NA es el ADN $ue observamos cuando se
alternan purinas y pirimidinas en la cadena# esta
estructura gira en sentido inverso y es de dimetro
menor.
A$u- observamos las distinas estructuras del DNA. la
primera es la A# la segunda la E y la tercera la F.
Mutaciones
Las bases nitrogenadas pueden sufrir modificaciones importantes.
La desaminacin de la 6itosina la convierte en 7racilo
La 6itosina puede ser atacada por un agente aluilante! $ue le a(ade un grupo
metilo. 2osteriormente puede sufrir una desaminacin convierti1ndose la +0
;etil6itosina en 8imina. Ambos procesos mencionados !acen $ue la 6itosina
posteriormente modificada" termine empare)ndose con Adenina# desencadenando
alteraciones.
La Adenina puede sufrir una desaminacin convirti1ndose en hipo"antina# esta se
empare)a con la 6itosina# por lo $ue provoca errores en el ADN.
(#ipo"antina)
La 4uanina puede sufrir una desaminacin convierti1ndose en "antina! la $ue se
empare)a con 8imina produciendo erroes.
Agentes Mutagnicos:
7na mutacin es bsicamente un error en la secuencia del $N%. Esto puede causarnos
diversos problemas $ue se traducen en errores en las prote-nas sinteti,adas# en los ADN
replicados y en todo el metabolismo. Sin embargo# una mutacin no es sinnimo inmediato
de cncer. Diferenciar entre tumor benigno y tumor maligno".
7n e)emplo com3n de agente mutag1nico es la radiacin ultravioleta o Rayos U0, los
cuales producen una reaccin $ue !ace $ue dos bases 8imina
adyacentes estable,can enlaces covalentes entre s- formando
!*meros de Timina.
Estas uniones no permiten al ADN replicarse# por lo $ue deben ser
reparadas por en,imas espec-ficas $ue rompen la unin o retiran el
extracto de ADN da(ado para luego reempla,arlo.
Esto fue todo lo $ue encontr1 en internerd sobre los rayos 7># lo
siento amigos m-os# no tom1 apuntes. Los $uiero )a)a"
&ay agentes mutag1nicos $ue reaccionan con formas espec-ficas de las bases
nitrogenadas. G2ero $u1 formasH Las bases nitrogenadas presentan un equilibrio
tautomrico. 2or e)emplo# este es el e$uilibrio tautom1rico de la 4uanina.
En el carbono 1 encontramos un grupo
carbonilo# el cual puede reorganizarse. El
doble enlace $ue !ay entre el carbono y el
ox-geno puede despla,arse !acia el
nitrgeno ?. El &idrgeno $ue est
enla,ado al nitrgeno ? se enla,a con el
ox-geno transformndolo en un grupo
alco!ol doble enlace : alco!ol se denomina Enol". Esto es lo $ue se denomina como
Tautomer*a Ceto)2nlica. Dentro de la c1lula esta favorecido el e$uilibrio !acia la forma
cetnica. Ambas formas se denominan Tautmeros.
A pesar de estar poco favorecida la forma enlica# esta puede reaccionar con el
!imetilsulfato " metilndose# lo $ue la transforma en %*0;etilguanina. Esta
forma de la guanina no puede devolverse !acia la forma normal# obviamente provocando
una mutacin. 8odos los agentes al$uilantes como el 4as ;osta,a por e)emplo# son capaces
de provocar mutaciones $ue pueden derivar en cncer.
%tro agente mutag1nico es el Nitrito de $odio 3NaN#45 $ue viene del &cido
nitroso &N%'"# $ue es un cido d1bil. El primero es capa, de reaccionar con los
grupos aminos formando Nitrosaminas ver imagen". Es decir el nitrito es capa, de
reaccionar con los grupos aminos presentes en el DNA. 2or e)emplo# existe una
bacteria anaerbica presente en embutidos $ue produce la toxina ms potente de la
naturale,a. G6mo evitamos $ue esta se reprodu,caH 6on Nitrito# produciendo mutaciones
en su material gen1tico# es por esto $ue se dice $ue es un conservante. Este mismo
compuesto se utili,a para !acer $ue la carne se vea ms ro)a. Sin embargo# los excesos de
nitrito pueden ser cancer-genos.
&ay mutgenos $ue act3an intercalndose con el ADN. se introducen en la
estructura intercalndose con las bases nitrogenadas. &ay muc!os antibiticos $ue act3an
intercalndose con el DNA. Estos se denominan como Aductos.
Estructuras y Conformaciones especiales del ADN y ARN:
6uando el ADN forma una estructura $ue es sim1trica de modo de $ue se puede leer para
ambos lados y es una imagen prcticamente especular se le denomina Pal*ndromo. 6omo
la palabra Anilina".
Es posible $ue debido a este tipo de
estructuras palindrmicas exista una
complementareidad de bases dentro de
una misma mono!ebra. Esta
caracter-stica !ace $ue la !ebra se
asocie consigo misma generando una
estructura de !or$uilla.
El ARN tambi1n puede formar tipos de estructuras secundarias especiales y tiene tendencia
a formar una mayor diversidad de ellas por el !ec!o de ser una mono!ebra. 2uede formar
una gran cantidad de !or$uillas en la misma !ebra e incluso estar apareado formando una
estructura %elicoidal en ciertos casos.
El primero es !elicoidal# el segundo de !or$uilla"
Tipos de ARN
ARNr o ARN Ribosomal6
6uando el ARN se encuentra conformando los
ribosomas# presenta !ebras muy largas y con muc!as
interacciones entre la misma !ebra. Se observa en la
imagen de al lado la gran cantidad de !or$uillas
formadas en este tipo de ARN.
El Ribosoma# adems de ARN est compuesto por
prote-nas.
ARNt o de Transferencia6
Es el ARN $ue transporta los aminocidos $ue van a formar parte de las prote-nas $ue se
formarn en el ribosoma. 2resenta < !or$uillas y unas bases modificadas en el extremo <=
donde se ensamblar el aminocido. 2resenta tambi1n un anticodn $ue se usa para
reconocer al codn $ue determina a la prote-na a formar desde la secuencia original de
ADN.
6ada aminocido tiene su ARNt espec-fico.
La otra forma de representar el ARNt es con forma de IL invertidaJ como aparece ms
arriba# formando estructuras !elicoidales.
ARNm o &ensa'ero6
Es el ARN $ue resulta de la 8ranscripcin. Es una copia complementaria de la !ebra
original de ADN.
Sntesis Proteica y Replicacin:
La s-ntesis de prote-nas parte de la base de $ue toda la informacin necesaria para sinteti,ar
una est en el ADN. 2ero G6mo usar la informacin $ue est en el material gen1tico para
formar una prote-naH Es necesario tomar esa informacin y enviarla fuera del n3cleo.
No s' ue tan especfico pregunten esto! dudo incluso ue lo pregunten (a(a! pero igual lo pongo bien completo.
Transcripcin.
Iniciacin6
La transcripcin es el proceso mediante el cual se sinteti,a ARNm. 8odo comien,a
con la RNA polimerasa II tenemos < tipos de RNA polimerasa"# en,ima $ue debe ser
capa, de locali,ar el sitio de inicio de un gen
fragmento de ADN $ue contiene el material
gen1tico para la s-ntesis de una prote-na
espec-fica". La polimerasa se desli,a por el
ADN !asta encontrar un sitio denominado
promotor $ue contiene la secuencia inicial
del gen en cuestin ca)a 8A8A".
2ara iniciar el proceso# la en,ima necesita de factores transcripcionales $ue se
ensamblan al promotor para $ue se pueda ensamblar la RNA polimerasa KK. 7na ve, $ue se
ensambla correctamente la prote-na# uno de los factores transcripcionales abre
for,adamente la doble !1lice en el punto de inicio de la 8ranscripcin y permite el
comien,o de esta. 2osteriormente los factores deben salir para $ue comience la produccin
de una mol1cula de mRNA. (No creo ue pregunten por los nombres especficos de los factores) *sa
+ea es demasiado biologa celular , especfica para preguntarlo (a(a)
Existen adems agentes reguladores $ue por e)emplo son Protenas acti-adoras
En!ancers en el dibu)o" $ue se fi)an a una secuencia de
ADN denominada acti-ador. Esta prote-na !ace $ue la
RNA polimerasa y los dems factores se sientan atra-dos al ADN para iniciar el proceso o
tambi1n puede atraer a otras prote-nas $ue modifi$uen la estructura de la cromatina
!aci1ndola ms accesible para los factores. 6ada tipo de c1lula tiene distintas protenas
reguladoras $ue determinan cmo se va a expresar un determinado gen# lo $ue se traduce
en la s-ntesis de distintas prote-nas seg3n el tipo celular.
2longacin6
La RNA polimerasa# una ve, comen,ada la transcripcin se despla,a por el ADN
copiando las bases de la secuencia original en direccin += a <=. Esta etapa se desarrolla
!asta $ue la en,ima se encuentra con una secuencia de t1rmino denominada se7al de
terminacin.
Terminacin6
7na ve, finali,ada la s-ntesis del ARNm# la ARN
polimerasa se separa de la secuencia de ADN y el ARNm entra
en el proceso de .aduracin.
&aduracin6
6onsiste en la IseleccinJ de $u1 secuencias espec-ficas
de RNAm se van a expresar 28ones5 y cuales no Intrones5.
Este proceso se denomina $plicing. >er imagen" Los Kntrones
no van a pasar a la siguiente etapa de la s-ntesis proteica.
A veces# el mismo ARNm inmaduro se utili,a en distintos tipos de te)idos para producir
prote-nas distintas# esto ocurre por$ue el ARNm puede sufrir un procesamiento diferencial
seg3n el tipo de prote-na $ue se $uiera sinteti,ar.
Traduccin:
Es el proceso mediante el cual las bases nitrogenadas del ADN cobran sentido
convirti1ndose en cadenas de aminocidos. 2articipan los ARNr y ARNt# el segundo tiene
un sitio de reconocimiento denominado %nticodn $ue es la versin complementaria del
codn del ARNm# $ue es un triplete de bases nitrogenadas $ue codifican para un
determinado aminocido. El ARNm llega a los ribosomas donde se inicia su traduccin.
Iniciacin6
La sub0unidad menor del ribosoma tiene IcargadoJ el primer ARNt con ;etionina
unido a ciertos factores de iniciacin de la 8raduccin. Es as- como reconoce al codn de
inicio A74# $ue es el $ue codifica para la ;etionina.
2longacin.
7na ve, iniciada la 8raduccin se van uniendo los
distintos ARNt espec-ficos para cada aminocido a medida
$ue avan,a el ARNm. La sub0unidad mayor del ribosoma es
la $ue va formando los enlaces pept-dicos formando de esa
manera las prote-nas.
Terminacin6
7na ve, se llega a un codn de t1rmino se asocia el ribosoma con un factor de
liberacin $ue da t1rmino a la 8raduccin. Se disocian las sub0unidades ribosomales del
ARNm $uedando disponibles para otra traduccin. De esta forma $ueda estructurada una
prote-na.
Replicacin
Es el proceso mediante el cual se crea
una nueva !ebra de ADN a partir de una
!ebra molde. Es un proceso
semiconser(ati(o debido a $ue a partir
de la molde salen dos mol1culas nuevas
$ue tienen una !ebra nueva y una !ebra
del ADN molde. Este proceso permite la
!erencia del ADN a trav1s de la ;itosis o
la ;eiosis.
El proceso de Replicacin es
efectuado por una en,ima denominada
A!N polimerasa la cual a(ade nuevos
nucletidos a una !ebra naciente. Esta
en,ima traba)a en direccin <= a +=#
originando una %ebra nue(a de 9: a ;:.
Sin embargo# para poder iniciar la formacin de la nueva !ebra# se necesita un extremo L
%& <= al $ue se le pueda unir un nucletido# es por esto $ue se sinteti,a un ARN cebador
$ue permite $ue se inicie la formacin de la !ebra nueva. Son los ARN se(alados con
color verde en el dibu)o" Estos fragmentos de ARN son sinteti,ados por la en,ima
Primasa.
Existe un punto denominado origen de
replicacin $ue corresponde a un punto del ADN en
donde se inicia el proceso. A$u- se abre la doble !ebra
separndose ambas cadenas formndose la burbu(a de
replicacin 2or la forma IredondeadaJ $ue toma la
doble !ebra". En cada extremo de esta burbu)a se
forman las horuillas de replicacin $ue son puntos
del ADN superenrollados como consecuencia del
desenrollamiento de la burbu)a. Este proceso es
efectuado por la en,ima %elicasa.
Si bien la ADN polimerasa act3a de <= a +=# en
la otra !ebra de ADN se produce de igual forma la replicacin# pero de forma retrasada. Se
va produciendo discontinuamente formando fragmentos de #,aa,i. 7na ve, $ue termina
la replicacin# la en,ima A!N ligasa se encarga de unir los distintos fragmentos.
El proceso de replicacin es bidireccional. Es decir# !ay dos !or$uillas de
replicacin# produci1ndose una en direccin <= a += la !ebra conductora sin fragmentos" y
la otra en la !ebra antiparalela con fragmentos de %Ca,aCi.
Existen en,imas en el proceso denominadas Topoisomerasas $ue cortan temporalmente el
ADN liberando la tensin producida por el superenrollamiento de los extremos de la
!or$uilla de replicacin. Adems !ay en,imas estabiliadoras $ue mantienen separadas las
dos !ebras de ADN.
7na ve, finali,ada la Replicacin# se forman ' mol1culas de ADN de forma
semiconservativa# como se explic antes.
9KN.
Asdada dudo que pregunten lo de Sintesis de protenas porque es como
de biologa celular lo mismo con lo de Replicacin pero igual lo puse..
con mucho esfuerzo porque no tengo el poer ni apuntes de esto a!a!a
disculpen si est" incompleto eso. Saludos a todos los que #ean esto y
suerte en $u-mica. Nicols ;on oico.