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W
Definicin: Los microorganismos necesitan la presencia de agua, en una forma disponible, para crecer y
llevar a cabo sus funciones metablicas. La mejor forma de medir la disponibilidad de agua es mediante
la actividad de agua (a
w
). La a
w
de un alimento se puede reducir aumentando la concentracin de solutos
en la fase acuosa de los alimentos mediante la extraccin del agua o mediante la adicin de solutos.
Algunas molculas del agua se orientan en torno a las molculas del soluto y otras quedan absorbidas por
los componentes insolubles de los alimentos. En ambos casos, el agua queda en una forma menos
reactiva.
Varios mtodos de conservacin utilizan estos conceptos. La deshidratacin es un mtodo de
conservacin de los alimentos basado en la reduccin de la aw (lo que se consigue eliminando el agua de
los productos). Tambin el agregado de solutos desciende la aw lo cual se da durante el curado y salado,
as como en el almbar y otros alimentos azucarados.
La a
w
de un alimento o solucin se define como la relacin entre la presin de vapor del agua del alimento
(p) y la del agua pura (po) a la misma temperatura
A medida que una solucin se concentra, la presin de vapor disminuye y la a
w
desciende a partir de un
valor mximo de 1 para el agua pura (en ausencia de capilares o fuerzas de adsorcin). La a
w
est
relacionada con el punto de congelacin y con el de ebullicin as como con la humedad relativa en
equilibrio (HRE) y la presin osmtica.
Relacin entre la Actividad de Agua y la Humedad relativa en equilibrio (HRE):
La HRE se refiere estrictamente a la atmsfera en equilibrio con una solucin o alimento y constituye una
expresin menos apropiada que la a
w
como forma de medir el agua disponible.
La HRE, como la a
w
, es la relacin entre la presin de vapor de la solucin y la del agua pura pero
expresadas en porcentaje. Por ello
Relacin entre la Actividad de Agua y la presin osmtica:
La presin osmtica * est relacionada con la a
w
a travs de la expresin
donde R es la constante de los gases, T la temperatura absoluta, loge a
w
el logaritmo natural de la a
w
y V
el volumen molar parcial del agua. El uso de la presin osmtica presupone la presencia de una
membrana con unas caractersticas de permeabilidad adecuadas.
Relacin entre la Actividad de Agua y la concentracin de solutos: La ley de Raoult puede expresarse de
la siguiente forma
es decir, la relacin entre la presin de vapor de la solucin y la del solvente puro es igual a la fraccin
molar del solvente, donde p y po son las presiones de vapor de la solucin y del solvente, respectivamente
y n1 y n2 el nmero de moles del soluto y del solvente, respectivamente. Para una solucin 1 molal de un
soluto ideal, a
w
= 0.9823 Sin embargo, los solutos nunca son ideales. Por una parte, las interacciones entre
las molculas pueden reducir el nmero efectivo de partculas en la solucin, mientras que por otra, la
disociacin puede incrementar realmente dicho nmero. Tales factores conducen a desviaciones del
sistema ideal que son realmente grandes para los no electrolitos a concentraciones superiores a 1 molal y
para los electrolitos a cualquier concentracin. Los coeficientes osmticos hallados experimentalmente se
utilizan para contrarrestar el comportamiento no ideal y los valores de a
w
se calculan a partir de la
expresin.
donde m es la concentracin molal del soluto, v es el nmero de iones generado por cada molcula de
soluto y * es el coeficiente osmtico molal.
Relacin entre la Actividad de Agua y el contenido de agua
: La relacin entre la composicin de un alimento y su a
w
es bastante compleja. Para conocer esta relacin
lo habitual es determinar los valores de la a
w
del alimento a diferentes concentraciones de agua, los que se
representan grficamente con el fin de obtener la isoterma de sorcin de agua (ver Figura)
. Los factores que reducen la presin de vapor de agua en los alimentos y, por tanto, la a
w
son la adsorcin
de las molculas de agua a las superficies, las fuerzas capilares y las sustancias disueltas que se han
mencionado anteriormente. Normalmente se acepta que el primer ascenso de la isoterma representa la
adsorcin del agua formando una monocapa de molculas en los lugares de adsorcin del producto slido.
Al aadir ms agua, la isoterma crece rpidamente a medida que los solutos se disuelven y se llenan los
espacios capilares. Estos fenmenos se solapan y algunos pueden no estar representados en la isoterma.
Puede no verse la monocapa en los alimentos que contienen poco material estructural si las fuerzas
capilares tienen poca influencia.
Relacin entre la Actividad de Agua y la Temperatura:
La actividad de agua depende de la temperatura dado que sta influye tambin sobre la presin de vapor
de agua de las soluciones pero el efecto es pequeo con la mayora de los solutos salvo que las soluciones
sean saturadas. En tales casos, las cantidades de algunas sustancias de la solucin, y, por tanto, la a
w
,
pueden variar marcadamente con la temperatura.
Grupos principales de alimentos en relacin con su a
w
1. Tienen a
w
de 0,98 o superior las carnes y pescados frescos, las frutas, hortalizas y verduras frescas, la
leche, las hortalizas en salmuera enlatadas, las frutas enlatadas en jarabes diluidos. Existen muchos
alimentos con un alto contenido en agua entre los que se encuentran los que tienen un 3,5 % de NaCl o un
26 % de sacarosa en la fase acuosa. En este rango de a
w
crecen sin impedimento alguno todos los
microorganismos causantes de toxiinfecciones alimentarias y los que habitualmente dan lugar a
alteraciones, excepto los xerfilos y halfilos extremos.
2. Tienen a
w
entre 0,98 y 0,93 la leche concentrada por evaporacin, el concentrado de tomate, los
productos crnicos y de pescado ligeramente salados, las carnes curadas enlatadas, los embutidos
fermentados (no secos), los embutidos cocidos, los quesos de maduracin corta, queso de pasta semidura,
las frutas enlatadas en almbar, el pan, las ciruelas con un alto contenido en agua. La concentracin
mxima de sal o sacarosa en la fase acuosa de estos alimentos est entre el 10% y 50%, respectivamente.
Todos los microorganismos conocidos causantes de toxiinfecciones alimentarias pueden multiplicarse al
menos a los valores ms altos de a
w
comprendidos en este intervalo.
3. tienen a
w
entre 0,93 y 0,85 los embutidos fermentados y madurados, el queso Cheddar salado, el jamn
tipo serrano, la leche condensada azucarada. A este grupo de alimentos pertenecen aquellos con un
contenido en sal superior al 17% y los que contienen concentraciones de sacarosa a saturacin en la fase
acuosa. Entre las bacterias conocidas, slo una (Staphylococcus aureus) es capaz de producir intoxicacin
alimentaria a estos niveles de a
w
pero pueden crecer muchos mohos productores de micotoxinas.
4. Tienen a
w
entre 0,85 y 0,60 los alimentos de humedad intermedia, las frutas secas, la harina, los
cereales, las confituras y mermeladas, las melazas, el pescado muy salado, los extractos de carne, algunos
quesos muy madurados, las nueces. Las bacterias patgenas no crecen en este intervalo de a
w
. La
alteracin, cuando ocurre, se debe a microorganismos xerfilos, osmfilos o halfilos.
5. Tiene a
w
inferior a 0,60 los dulces, el chocolate, la miel, los fideos, las galletas, las papas fritas, las
verduras secas, huevos y leche en polvo. Los microorganismos no se multiplican por debajo de una a
w
de
0,60 pero pueden permanecer vivos durante largos perodos de tiempo.
ASPECTOS GENERALES DE LOS AMINOCIDOS
Desde el punto de vista qumico, los aminocidos (AA) son cidos orgnicos con un grupo
amino en posicin alfa.
Segn esta definicin, los cuatro sustituyentes del carbono alfa (C ) en un aminocido son:
el grupo carboxilo
un grupo amino
un tomo de hidrgeno
una cadena lateral R, que es caracterstica de cada AA
Constituye una excepcin el AA prolina, con un anillo pirrolidnico, que puede considerarse
como un -aminocido que est N-sustitudo por su propia cadena lateral (Figura superior
derecha)
En todos los AA proteicos, excepto en la glicina (Gly), el carbono es asimtrico y por lo
tanto, son pticamente activos. Esto indica que existen dos enantimeros (ismeros pticos),
uno de la serie D y otro de la serie L . Los AA proteicos son invariablemente de la serie L
En algunos casos muy concretos se pueden encontrar AA de la serie D: en los peptidoglicanos
de la pared celular, en ciertos pptidos con accin antibitica y en pptidos opioides de
anfibios y reptiles.
Cuando un ser vivo se muere, sus AA (de la serie L) experimentan un proceso de racemizacin
(se van convirtiendo poco a poco en una mezcla racmica con D-aminocidos y L-aminocidos.
Este proceso ocurre con una velocidad caracterstica y, en algunos casos, se puede estimar de
manera aproximada la fecha de la muerte a partir del contenido en D-aminocidos
PROPIEDADES DE LOS AMINOCIDOS
Como ya se vi en el captulo dedicado a los amortiguadores, los AA son excelentes
amortiguadores, gracias a la capacidad de disociacin del grupo carboxilo, del grupo amino y
de otros grupos ionizables de sus cadenas laterales (carboxilo, amino, imidazol, fenol,
guanidino, etc).
Equilibrios de ionizacin de los grupos ionizables de un AA Valores de pK
a
de los aminocidos
Los grupos cido-base dbiles presentan una capacidad tamponadora mxima en la zona
prxima al pK
a
. La tabla de la derecha muestra los pK
a
de los 20 AA proteicos. Hay que
destacar el hecho de que estos valores de pK
a
calculados para los AA en disolucin pueden
verse ligeramente modificados en el entorno proteico. Se observa que el nico grupo lateral
con un pK
a
prximo al pH fisiolgico es la cadena lateral de la histidina. Por ello, las protenas
ricas en este AA se comportarn como excelentes amortiguadores fisiolgicos
El comportamiento cido-base de los AA es
el que va a determinar las propiedades
electrolticas de las protenas, y de ellas dependen, en gran medida, sus propiedades
biolgicas. En el modelo de interaccin protena-ligando, la carga elctrica de una y otro
juegan un papel fundamental. Por este motivo, la funcin de las protenas es
extraordinariamente sensible al pH:
A pH bajo, la mayor parte de los grupos disociables estarn protonados, y por lo tanto
habr un gran nmero de cargas positivas en la protena
A pH elevado, los grupos disociables no estarn protonados, con lo cual habr mayor
nmero de cargas negativas
Cambios en el pH se traducen en cambios en el nmero de cargas de la protena, y estos
cambios pueden inhibir la interaccin de la protena con un ligando determinado. Por este
motivo, muchas protenas (enzimas, sobre todo) slo pueden funcionar en un margen
relativamente estrecho de pH. Aqu radica la importancia del mantenimiento de valores
contantes de pH en el medio interno del organismo
CLASIFICACIN DE LOS AMINOCIDOS
Aunque la mayora de los AA presentes en la Naturaleza se encuentran formando parte de las
protenas, hay algunos que pueden desempear otras funciones. Hay, por tanto, dos grupos de
AA:
1. Aminocidos proticos
2. Aminocidos no proticos
Los AA proteicos se dividen, a su vez, en dos grupos:
Aminocidos codificables o universales, que permanecen como tal en las protenas
Aminocidos modificados o particulares, que son el resultado de diversas
modificaciones qumicas posteriores a la sntesis de protenas
AMINOCIDOS PROTEICOS CODIFICABLES
Los AA proteicos codificables son 20:
Alanina (Ala, A), cistena (Cys, C), asprtico (Asp, D), glutmico (Glu, E), fenilalanina (Phe, F)
,glicina (Gly, G), histidina (His, H), isoleucina (Ile, I), lisina (Lys, K), leucina (Leu, L), metionina
(Met, M), asparragina (Asn, N), prolina (Pro, P), glutamina (Gln, Q), arginina (Arg, R), serina
(Ser, S), treonina (Thr, T), valina (Val, V), triptfano (Trp, W), tirosina (Tyr, Y).
De estos 20 AA, la mitad pueden ser sintetizados por el hombre, pero el resto no, y por lo
tanto deben ser suministrados en la dieta: son los AA esenciales.
Los AA proteicos se pueden clasificar en funcin de:
La naturaleza y propiedades de la cadena lateral R
La polaridad de la cadena lateral R
AMINOCIDOS PROTEICOS MODIFICADOS
Una vez que los AA codificables han sido incorporados a las protenas, pueden sufrir ciertas
transformaciones que dan lugar a los AA modificados o particulares. Entre las modificaciones
ms frecuentes destacan:
1. HIDROXILACIN: Ejemplos tpicos son la 4-hidroxiprolina o la 5-hidroxilisina, que se
encuentran en proporcin importante en el colgeno. Estos AA se incorporan a la
protena como P o como K, y son posteriormente hidroxilados.
2. CARBOXILACIN: El E, por carboxilacin post-sinttica se convierte en cido -
carboxiglutmico.
4-hidroxiprolina 5-hidroxilisina
-carboxiglutmico
3.
4. ADICIN DE IODO: En la tiroglobulina (una protena del tiroides), la Y sufre diversas
reacciones de iodacin y condensacin que originan AA como la monoiodotirosina,
diiodotirosina, la triiodotirosina o la liotirosina.
5. FOSFORILACIN: La actividad de muchas protenas se puede modificar mediante
reacciones de fosforilacin (catalizadas por las enzimas quinasas) o desfosforilacin
(catalizadas por las enzimas fosfatasas). Los residuos que se suelen fosforilar son la
serina y la tirosina.
6. GLICOSILACIN: Las glicoprotenas son protenas unidas a cadenas de oligosacrido.
stas se unen mediante un enlace O-glicosdico a un residuo de serina o treonina o
mediante un enlace N-glicosdico a un residuo de asparagina.
7. CONDENSACIN: La cistina es el resultado de la unin de dos C por medio de un
puente disulfuro (-S-S-).
AMINOCIDOS NO PROTEICOS
Se conocen ms de un centenar, sobre todo en plantas superiores, aunque su funcin no
siempre es conocida. Se pueden dividir en tres grupos:
1.- D-AMINOCIDOS: La D-Ala y el D-Glu forman parte del peptidoglicano de la pared celular
de las bacterias. La gramicidina S es un pptido con accin antibitica que contiene D-Phe. En
ciertos pptidos opioides de anfibios y reptiles tambin aparecen D-aminocidos.
2.- -AMINOCIDOS NO PROTEICOS: La L-ornitina y la L-citrulina son importantes
intermediarios en el metabolismo de la eliminacin del nitrgeno y la creatina (un derivado de
la G) juega un papel importante como reserva de energa metablica. Tambin pertenecen a
este grupo la homoserina y la homocistena
3.- -AMINOCIDOS: En estos AA, el grupo amino sustituye al ltimo carbono (carbono ),
no al carbono . La Alanina forma parte de algunos coenzimas, y el cido --aminobutrico
es un importante neurotransmisor
PPTIDOS: ASPECTOS GENERALES
La unin de dos o ms aminocidos (AA) mediante enlaces amida origina los pptidos. En los
pptidos y en las protenas, estos enlaces amida reciben el nombre de enlaces peptdicos y son
el resultado de la reaccin del grupo carboxilo de un AA con el grupo amino de otro, con
eliminacin de una molcula de agua (Figura de la izquierda). Cuando los AA se encuentran
formando parte de una cadena polipeptdica se suelen denominar residuos, para diferenciarlos
de su forma libre.
Cuando el pptido est formado por menos de 15 AA se trata de un oligopptido (dipptido,
tripptido, etc.)
Cuando contiene entre 15 y 50 AA
se trata de un polipptido y si el
nmero de AA es mayor, se habla
de protenas. En los seres vivos se
pueden encontrar protenas
formadas por ms de 1000 AA.
Independientemente de la longitud
de la cadena polipeptdica, siempre habr un grupo NH
2
que no ha reaccionado (el extremo
amino) y un grupo COOH que tampoco ha reaccionado (el extremo carboxilo).
La formacin de los enlaces peptdicos da lugar a la cadena principal o esqueleto de la
protena, en la que la unidad repetitiva bsica est formada por el -NH- (del grupo amino), el
C (con su hidrgeno y su
cadena lateral) y el -CO- del
grupo carboxilo (recuadro de
color morado en la figura
superior). A partir del
esqueleto se proyectan las
cadenas laterales,
responsables de sus
propiedades qumicas.
A la hora de nombrar un
oligopptido se considera como AA principal al que conserva el grupo carboxilo. El resto de
los AA se nombran como sustituyentes, comenzando por el AA que ocupa el extremo amino.
Por ejemplo, el tripptido de la figura superior es Ser-Tyr-Cys se denominar seril-tirosil-
cistena.
Para nombrar polipptidos y protenas, se recurre a nombres triviales que, en la mayora de
los casos, hacen referencia a su funcin.
Se denomina secuencia de un pptido o de una protena al orden de los AA que lo integran. La
secuencia viene determinada por:
1.- qu AA forman el pptido o protena
2.- el orden en que estn ensamblados
Los trminos polipptido y protena no
siempre son equivalentes, puesto que
algunas protenas estn formadas por
ms de una cadena polipeptdica. Es el
caso de la hemoglobina (Figura de la
izquierda). En este caso:
cada polipeptdo no se considera
como una protena, sino como una
subunidad de una protena, y est
representado de un color distinto en la
figura
el trmino protena se refiere a la
asociacin funcional de las 4 subunidades
PROPIEDADES DE LOS PPTIDOS
Los pptidos son estructuras intermedias entre los AA y las protenas. Sus propiedades fsicas y
qumicas suelen reflejar en mayor o menor medida las de los AA que lo componen. Sin
embargo, al enmascararse mutuamente los grupos hidroflicos (carboxilo y amina) que forman
parte de los enlaces peptdicos, el carcter polar o apolar de los pptidos depende de la
naturaleza de los grupos de las cadenas laterales de los AA que lo integran (Figura de la
derecha). Anlogamente, los valores de pK de los grupos ionizables a menudo se ven alterados
por la proximidad de otros grupos polares
Los pptidos presentan a menudo ciertas peculiaridades estructurales que no aparecen en las
protenas. Los grupos NH
2
y COOH terminales pueden encontrarse bloqueados. As, es
frecuente encontrar grupos amino terminales que estn acetilados o en forma de cido
piroglutmico (un residuo de Glu N-sustitudo por su propia cadena lateral) y grupos carboxilo
terminales en forma de amidas. Este bloqueo de los grupos terminales confiere al pptido
resistencia frente a exopeptidasas. Un ejemplo de pptido que presenta estas modificaciones
es la hormona liberadora de tirotropina (TRH): piroglutamil-histidil-prolinamida (Figura de la
izquierda).
En hongos y bacterias pueden encontrarse pptidos cclicos, en los que pueden aparecer
algunos AA de la serie D, como es el caso del antibitico gramicidina S (Figura de la derecha)
cuya secuencia es:
--[L-Val - L-Orn - L-Leu - D-Phe - L-Pro]
2
FUNCIONES DE LOS PPTIDOS
En los animales superiores llama la atencin el hecho de cmo unos pocos AA que no
presentan actividad alguna en forma aislada son capaces de desencadenar respuestas
biolgicas tan intensas. Los pptidos se producen generalmente mediante la hidrlisis de
protenas precursoras, aunque en hongos y bacterias existen sistemas de sntesis peptdica no
ribosmica, en los cuales los AA son activados a travs de una va diferente.
Entre las funciones biolgicas ms importantes que realizan los pptidos podemos destacar las
siguientes:
agentes vasoactivos
hormonas
neurotransmisores
antibiticos
antioxidantes
AGENTES VASOACTIVOS
El agente hipertensor ms potente que se conoce es la angiotensina II, un octapptido que se
origina mediante la hidrlisis de una protena precursora que se llama angiotensingeno, y que
no tiene actividad vasopresora.
Otros pptidos son agentes hipotensores (tienen actividad vasodilatadora). Uno de los mejor
conocidos es la bradiquinina, un nonapptido que se origina mediante la hidrlisis de una
protena precursora que se llama quiningeno. En la figura inferior se omiten los dobles
enlaces de la bradiquinina.
HORMONAS
Las hormonas son seales qumicas que ejercen su accin sobre rganos y tejidos situados
lejos del lugar donde se han sintetizado. Muchas hormonas tienen estructura peptdica, como
por ejemplo:
Oxitocina: nonapptido (CYIQNCPLG) segregado por la hipfisis. Provoca la
contraccin uterina y la secrecin de leche por la glndula mamaria, facilitando el
parto y la alimentacin del recin nacido
Vasopresina: nonapptido (CYFQNCPRG) que induce la reabsorcin de agua en el
rin (tambin se llama hormona antidiurtica)
Somatostatina: tetradecapptido que inhibe la liberacin de la hormona del
crecimiento
Insulina: Hormona compuesta por 51 AA sintetizada en el pncreas. Estimula la
aborcin de glucosa por parte de las clulas. Su ausencia es causa de diabetes. La
insulina fue el primer pptido que se secuenci por mtodos qumicos. Por ese
trabajo, Frederick Sanger recibi el Nobel de Qumica en 1958. Est formada por dos
cadenas polipeptdicas unidas entre s mediante tres puentes disulfuro
Glucagn: Hormona compuesta por 29 AA liberada por el pncreas cuando los niveles
de azcar en sangre son altos. Hace que en el hgado, el glucgeno se hidrolice para
generar glucosa. Sus efectos son los contrarios a los de la insulina
NEUROTRANSMISORES
Los neurotransmisores son seales qumicas producidas en un terminal nervioso presinptico,
y que a travs de un receptor especfico ejercen su accin sobre la neurona post-sinptica
(figura de la derecha). Son neurotransmisores peptdicos las encefalinas (pentapptidos), la
endorfina (de 31 aminocidos) y la sustancia P (un decapptido):
ANTIBITICOS
La valinomicina y la gramicidina S son dos pptidos cclicos con accin antibitica. Los dos
contienen aminocidos de la serie D, adems de otros aminocidos no proteicos.
La valinomicina es un ionforo: es capaz de transportar iones potasio (en color verde en la
figura) a travs de las membrana biolgicas.
ANTIOXIDANTES
El glutation (H- -Glu-Cys-Gly-OH) es un tripptido que acta como antioxidante celular.
Reduce las especies reactivas del oxgeno (como el perxido de H) gracias a la enzima glutatin
peroxidasa, la cual cataliza la siguiente reaccin:
H
2
O
2
+ 2GSH GSSG + 2 H
2
O
CLASIFICACIN DE LAS PROTENAS
-aminocidos con amplia variabilidad estructural y
funciones biolgicas muy diversas. La variedad de protenas es elevadsima, y para su
clasificacin se suele recurrir a:
Criterios fsicos
Criterios qunicos
Criterios estructurales
Criterios funcionales
Es difcil hacer una clasificacin ms descriptiva o conceptual. Sin embargo, los criterios que
hemos descrito son muy tiles desde el punto de vista prctico, y nos permiten definir al
colgeno como una protena simple, fibrosa y oligomrica, y al citocromo c como una protena
conjugada, globular y monomrica.
CRITERIO FSICO
El criterio fsico ms utilizado es la solubilidad. As se distinguen
1. albminas: protenas que son solubles en agua o en disoluciones salinas diludas
2. globulinas: requieren concentraciones salinas ms elevadas para permanecer en
disolucin
3. prolaminas: solubles en alcohol
4. glutelinas: slo se disuelven en disoluciones cidas o bsicas
5. escleroprotenas: son insolubles en la gran mayora de los disolventes
CRITERIO QUMICO
Desde un punto de vista qumico, existen dos grandes grupos de protenas:
protenas simples: formadas exclusivamente por -aminocidos, como es el caso de la
ubiquitina, una proteasa intracelular formada por 53 AA.
protenas conjugadas: que contienen adems de la cadena polipeptdica un
componente no aminoacdico llamado grupo prosttico, que puede ser un azcar, un
lpido, un cido nucleico o simplemente un in inorgnico. La protena en ausencia de
su grupo prosttico no es funcional, y se llama apoprotena. La protena unida a su
grupo prosttico es funcional, y se llama holoprotena (holoprotena = apoprotena +
grupo prosttico). Son protenas conjugadas la hemoglobina, la mioglobina, los
citocromos, etc. En la figura inferior derecha se representa el citocromo c, donde el
grupo prosttico (representado en color verde) es el grupo hemo
CRITERIO ESTRUCTURAL (DE FORMA )
En cuanto a su forma molecular, podemos distinguir:
protenas globulares: la cadena polipeptdica aparece enrollada sobre s misma dando
lugar a una estructura ms o menos esfrica y compacta.
protenas fibrosas: si hay una dimensin que predomina sobre las dems, se dice que
la protena es fibrosa. Las protenas fibrosas, por lo general, tienen funciones
estructurales
CRITERIO FUNCIONAL
Desde un punto de vista funcional se distinguen:
protenas monomricas: constan de una sola cadena polipeptdica, como la
mioglobina.
protenas oligomricas: constan de varias cadenas polipeptdicas. Las distintas cadenas
polipeptdicas que componen una protena oligomrica se llaman subunidades, y
pueden ser iguales o distintas entre s. Un ejemplo es la hemoglobina, formada por 4
subunidades, cada una representada de distinto color en la figura inferior.
PROPIEDADES DE LAS PROTENAS
Desde el punto de vista bioqumico, las propiedades de las protenas son:
Precipitacin selectiva
Capacidad amortiguadora
Propiedades osmticas
PRECIPITACIN SELECTIVA DE LAS PROTENAS El agua es el disolvente biolgico por
excelencia. En disolucin acuosa, los residuos hidrofbicos de las protenas se acumulan en el
interior de la estructura, mientras que en la superficie aparecen diversos grupos con carga
elctrica, en funcin del pH del medio (Figura de la izquierda). En torno a los grupos cargados,
los dipolos del agua se orientan conforme a la carga elctrica de cada grupo, de tal manera que
la protena
presenta una
capa de
solvatacin
formada por el
agua de
hidratacin,
que es el agua
retenida por
las cargas
elctricas de la
superficie de las protenas (En color rojo en la Figura superior derecha). Los AA polares sin
carga tambin se disponen en la superficie, donde interaccionan con el agua mediante puentes
de hidrgeno (Figura superior izquierda).
Cualquier factor que modifique la interaccin de la protena con el disolvente disminuir su
estabilidad en disolucin y provocar la precipitacin. As, la desaparicin total o parcial de la
envoltura acuosa, la neutralizacin de las cargas elctricas de tipo repulsivo o la ruptura de los
puentes de hidrgeno facilita la agregacin intermolecular y provocar la precipitacin. La
precipitacin suele ser consecuencia del fenmeno llamado desnaturalizacin
CAPACIDAD AMORTIGUADORA DE LAS PROTENAS
Esta propiedad se debe a la existencia de:
Grupos ionizables de las cadenas laterales de los aminocidos Asp, Glu, Lys, Arg, His,
Tyr, Cys.
Grupos COOH y NH
2
terminales .
Por este motivo, las protenas poseen un considerable poder amortiguador en una amplia zona
de pH. Aunque cada AA tiene unos grupos ionizables con unas constantes de ionizacin (pK
a
)
caractersticas, el valor de dichas constantes puede verse ligeramente modificado por el
entorno proteico. El grupo imidazol del AA histidina es el principal responsable del poder
amortiguador de las protenas a pH fisiolgico, ya que su pK
a
est prximo a 7.
Cuando el pH es bajo, los grupos ionizables estn protonados, y la carga neta de la protena es
de signo positivo. Cuando el pH es alto, los grupos ionizables estn desprotonados, y la carga
neta es de signo negativo. Entre ambas zonas, habr un pH en el cual la carga neta de la
protena es nula. Es el pH isoelctrico o punto isoelctrico, y es caracterstico de cada protena
(Tabla de la izquierda).
A valores de pH por debajo del pH isoelctrico la carga neta de la protena es positiva, y a
valores de pH por encima del pH isoelctrico, la carga neta de la protena es negativa. La
mayora de las protenas intracelulares tienen carga negativa, ya que su pH isoelctrico es
menor que el pH fisiolgico (que est prximo a 7). Se llaman protenas cidas a aquellas que
tienen un punto isoelctrico bajo (como la pepsina), y protenas bsicas a las que tienen un
punto isoelctrico alto (como las histonas).
pH bajo: carga neta positiva
pI: carga neta nula
pH alto: carga neta negativa
PROPIEDADES OSMTICAS DE LAS PROTENAS
Como todo soluto molecular o inico, las protenas ejercen un efecto osmtico cuando existen
barreras que limitan su libre difusin, como puede ser una membrana semipermeable (Figura
de la izquierda), que permite el paso del agua, pero no de los solutos. Si tenemos dos
compartimentos acuosos separados por una membrana semipermeable y uno de ellos
contiene protenas, stas tienden a captar agua del compartimento vecino (Figura de la
derecha). Este efecto osmtico es proporcional al nmero de partculas dispersas.
El valor de la presin osmtica se puede calcular mediante la frmula de Van't Hoff: = cRT,
donde es la presin osmtica, c es la concentracin, R es la constante de los gases y T es la
temperatura absoluta.
En el caso de las protenas, el efecto osmtico se ve amplificado por otros dos factores.
Por un lado, el agua de hidratacin que forma la envoltura acuosa de las protenas tambin
contribuye a la presin osmtica (Figura de la derecha).
Por otro lado, las protenas se comportan como polianiones, cuyas cargas estn neutralizadas
por iones Na
+
o K
+
(Figura inferior izquierda). Las membranas biolgicas son permeables a
estos iones y a sus contraiones, con lo cual su concentracin a ambos lados de la membrana se
equilibra. Sin embargo, la existencia de protenas en slo uno de los compartimentos provoca
la retencin permanente de iones difusibles en ese lado de la membrana (efecto Donnan), lo
que incrementa el efecto osmtico (Figura inferior derecha).
Efecto Donnan: Situacin inicial Efecto Donnan: En el equilibrio
Se denomina presin coloidosmtica o presin onctica al efecto osmtico conjunto de las
protenas, que es el resultado de:
(1) la presin osmtica (que slo depende del nmero de partculas)
(2) la presin provocada por el agua de hidratacin
(3) la presin provocada por el exceso de iones debido al efecto Donnan
La mayor parte del agua en el sistema circulatorio est retenida por el
efecto osmtico de las protenas del plasma. Cuando por cualquier
circunstancia patolgica disminuye la concentracin de protenas en el
plasma, el agua puede fluir libremente hacia los tejidos, provocando un
edema (Figura de la derecha).
FUNCIONES BIOLGICAS DE LAS PROTENAS
As como los polisacridos se reducen a ser sustancias de reserva o
molculas estructurales, las protenas asumen funciones muy variadas gracias a su gran
hetereogeneidad estructural. Describir las funciones de las protenas equivale a describir en
trminos moleculares todos los fenmenos biolgicos. Podemos destacar las siguientes:
funcin enzimtica
funcin hormonal
funcin de reconocimiento de seales
funcin de transporte
funcin estructural
funcin de defensa
funcin de movimiento
funcin de reserva
transduccin de seales
funcin reguladora
Muchas protenas ejercen a la vez ms de una de las funciones enumeradas: Las protenas de
membrana tienen tanto funcin estructural como enzimtica; la ferritina es una protena que
transporta y, a la vez, almacena el hierro; la miosina interviene en la contraccin muscular,
pero tambin funciona como un enzima capaz de hidrolizar el ATP, y as se podran poner
muchos ejemplos ms.
FUNCIN ENZIMTICA
La gran mayora de las reacciones metablicas tienen lugar gracias a la presencia de un
catalizador de naturaleza proteica especfico para cada reaccin. Estos biocatalizadores
reciben el nombre de enzimas. La gran mayora de las protenas son enzimas.
FUNCIN HORMONAL
Las hormonas son sustancias producidas por una clula y que una vez secretadas ejercen su
accin sobre otras clulas dotadas de un receptor adecuado. Algunas hormonas son de
naturaleza proteica, como la insulina y el glucagn (que regulan los niveles de glucosa en
sangre) o las hormonas segregadas por la hipfisis como la hormona del crecimiento, o la
calcitonina (que regula el metabolismo del calcio).
RECONOCIMIENTO DE SEALES QUMICAS
La superficie celular alberga un gran nmero de protenas encargadas del reconocimiento de
seales qumicas de muy diverso tipo (figura de la izquierda). Existen receptores hormonales,
de neurotransmisores, de anticuerpos, de virus, de bacterias, etc. En muchos casos, los
ligandos que reconoce el receptor ( hormonas y neurotransmisores) son, a su vez, de
naturaleza proteica
FUNCIN DE TRANSPORTE
En los seres vivos son esenciales los fenmenos de transporte, bien para llevar una molcula
hidrofbica a travs de un medio acuoso (transporte de oxgeno o lpidos a travs de la sangre)
o bien para transportar molculas polares a travs de barreras hidrofbicas (transporte a
travs de la membrana plasmtica). Los transportadores biolgicos son siempre protenas.
Para activar la animacin del transporte a travs de membranas, ejecutar el comando
"recargar" apretando el botn derecho del ratn.
FUNCIN ESTRUCTURAL
Las clulas poseen un citoesqueleto de naturaleza proteica que constituye un armazn
alrededor del cual se organizan todos sus componentes, y que dirige fenmenos tan
importantes como el transporte intracelular o la divisin celular. En los tejidos de sostn
(conjuntivo, seo, cartilaginoso) de los vertebrados, las fibras de colgeno forman parte
importante de la matriz extracelular (de color claro en la Figura) y son las encargadas de
conferir resistencia mecnica tanto a la traccin como a la compresin.
FUNCIN DE DEFENSA
La propiedad fundamental de los mecanismos de defensa es la de discriminar lo propio de lo
extrao. En bacterias, una serie de protenas llamadas endonucleasas de restriccin se
encargan de identificar y destruir aquellas molculas de DNA que no identifica como propias
(en color blanco en la figura de la derecha).
En el recuadro inferior se muestra el enzima BamH1 (de Bacillus amyloli) unida al DNA. Este
enlace lleva a una excelente pgina que describe con sumo detalle esta interaccin.
FUNCIN DE MOVIMIENTO
Todas las funciones de motilidad de los seres vivos estn relacionadas con las protenas. As, la
contraccin del msculo resulta de la interaccin entre dos protenas, la actina y la miosina
El movimiento de la clula mediante cilios (foto de la izquierda) y flagelos (figura de la
derecha) est relacionado con las protenas que forman los microtbulos.
FUNCIN DE RESERVA
La ovoalbmina de la clara de huevo, la lactoalbmina de la leche, la gliadina del grano de
trigo y la hordena de la cebada, constituyen una reserva de aminocidos para el futuro
desarrollo del embrin.
TRANSDUCCIN DE SEALES
Los fenmenos de transduccin (cambio en la naturaleza fsico-qumica de seales) estn
mediados por protenas. As, durante el proceso de la visin, la rodopsina de la retina
convierte (o mejor dicho, transduce) un fotn luminoso (una seal fsica) en un impulso
nervioso (una seal elctrica), y un receptor hormonal convierte una seal qumica (una
hormona) en una serie de modificaciones en el estado funcional de la clula
FUNCIN REGULADORA
Muchas protenas se unen al DNA y de esta forma controlan la transcripcin gnica (Figura de
la izquierda). De esta forma el organismo se asegura de que la clula, en todo momento, tenga
todas las protenas necesarias para desempear normalmente sus funciones.
Las distintas fases del ciclo celular son el resultado de un complejo mecanismo de
regulacin desempeado por protenas como la ciclina.
ESTRUCTURA DE LAS PROTENAS
A primera vista podra pensarse en las protenas como polmeros lineales de AA unidos entre s
por medio de enlaces peptdicos. Sin embargo, la secuencia lineal de AA puede adoptar
mltiples conformaciones en el espacio. La estructura primaria viene determinada por la
secuencia de AA en la cadena proteica, es decir, el nmero de AA presentes y el orden en que
estn enlazados. La conformacin espacial de una protena se analiza en trminos de
estructura secundaria y estructura terciaria. La asociacin de varias cadenas polipeptdicas
origina un nivel superior de organizacin, la llamada estructura cuaternaria. Por ltimo, la
asociacin de protenas con otros tipos de biomolculas para formar asociaciones
supramoleculares con carcter permanente da lugar a la estructura quinaria.
Por tanto, podemos distinguir cinco niveles de estructuracin en las protenas:
estructura primaria
estructura secundaria
estructura terciaria
estructura cuaternaria
estructura quinaria (asociaciones supramoleculares)
Los enlaces que determinan la estructura primaria son covalentes (enlace amida o enlace
peptdico), mientras que la mayora de los enlaces que determinan la conformacin
(estructuras secundaria y terciaria) y la asociacin (estructura cuaternaria y quinaria) son de
tipo no covalente.
ESTRUCTURA PRIMARIA DE LAS PROTENAS
La estructura primaria viene determinada por la secuencia de AA en la cadena proteica, es
decir, el nmero de AA presentes y el orden en que estn enlazados (Figura de la derecha).
Las posibilidades de estructuracin a nivel primario son prcticamente ilimitadas. Como en casi
todas las protenas existen 20 AA diferentes, el nmero de estructuras posibles viene dado por
las variaciones con repeticin de 20 elementos tomados de n en n, siendo n el nmero de AA
que componen la molcula proteica.
Generalmente, el nmero de AA que forman una protena oscila entre 80 y 300. Los enlaces
que participan en la estructura primaria de una protena son covalentes: son los enlaces
peptdicos. El enlace peptdico (Figura de la izquierda) es un enlace amida que se forma entre
el grupo carboxilo de una AA con el grupo amino de otro, con eliminacin de una molcula de
agua. Independientemente de la longitud de la cadena polipeptdica, siempre hay un extremo
amino terminal y un extremo carboxilo terminal que permanecen intactos. Por convencin, la
secuencia de una protena se lee siempre a partir de su extremo amino
Como consecuencia del establecimiento de enlaces peptdicos entre los distintos AA que
forman la protena se origina una cadena principal o "esqueleto" a partir del cual emergen las
cadenas laterales de los AA (tomos sombreados en la Figura de la derecha).Los tomos que
componen la cadena principal de la protena son el N del grupo amino (condensado con el AA
precedente), el C (a partir del cual emerge la cadena lateral) y el C del grupo carboxilo (que se
condensa con el AA siguiente). Por lo tanto, la unidad repetitiva bsica que aparece en la
cadena principal de una protena es: (-NH-C -CO-)
ESTRUCTURA SECUNDARIA DE LAS PROTENAS
La estructura secundaria es el plegamiento que la cadena polipeptdica adopta gracias a la
formacin de puentes de hidrgeno entre los tomos que forman el enlace peptdico. Los
puentes de hidrgeno (en color verde en la figura inferior) se establecen entre los grupos -CO-
y -NH- del enlace peptdico (el primero como aceptor de H, y el segundo como donador de H).
De esta forma, la cadena polipeptdica es capaz de adoptar conformaciones de menor energa
libre, y por tanto, ms estables
Se pueden distinguir varios tipos de conformaciones que determinan la estructura secundaria
de una protena:
1. conformacin al azar
2. hlice alfa
3. hoja beta
4. giros beta
5. conformacin del colgeno
6. estructuras supersecundarias
CONFORMACIN AL AZAR
En algunas protenas, o en ciertas regiones de la misma, no existen interacciones de suficiente
consideracin como para que se pueda distinguir un nivel de organizacin superior a la
estructura primaria. En estos casos se habla de conformacin al azar.
La figura de la derecha representa el motivo estructural denominado dedo de zinc, muy
comn en protenas que interaccionan con el DNA
HLICE
Cuando la cadena principal o esqueleto de un polipptido se pliega en el espacio en forma de
helicoide dextrgiro se adopta una conformacin denominada hlice (Figura de la
izquierda, en verde). Esta estructura es peridica y en ella cada enlace peptdico puede
establecer dos puentes de hidrgeno (Figura de la derecha, lneas punteadas). Un puente de
hidrgeno se forma entre el grupo -NH- del enlace peptdico del AA en posicin n y el grupo -
CO- del enlace peptdico del AA situado en posicin n-4. El otro puente de hidrgeno se forma
entre el grupo -CO- del enlace peptdico del AA en posicin n y el grupo -NH- del enlace
peptdico del AA situado en posicin n+4. Cada vuelta de la hlice implica 3,6 AA, con una
translacin media por residuo de 0,15 nm, lo que indica que la hlice tiene un paso de rosca de
0,54 nm. Dicho con otras palabras, una vuelta completa de la h
de 0,54 nm y contiene 3,6 residuos de AA.
Las cadenas laterales de los AA se sitan en la parte externa del helicoide, lo que evita
problemas de impedimentos estricos (Figura de la izquierda). Los AA alanina, glutamina,
leucina y metionina se encuentran frecuentemente formando parte de hlices , mientras
que la prolina, glicina, tirosina y serina no. De hecho, la prolina se considera un terminador de
la hlice (Figura de la derecha) ya que su C