1.

Introduccin
Al igual que las disciplinas experimentales que han surgido como rama comn que
es la biologa, tiene una historia propia construida a travs de observaciones,
experiencias, pruebas y teoras. Se inici con el estudio de los procesos de
fermentacin y de putrefaccin y Antoine-Laurent Lavoiser (1743- 1794) fue el
primero en plantear sobre bases cuantitativas el proceso de la fermentacin
alcohlica al observar una relacin entre cantidad de azcar presente y productos
formados durante el proceso. Sostuvo que la fermentacin poda ser considerada
como una reaccin qumica cualquiera. No obstante Pasteur demostr pronto que
los procesos de putrefaccin y fermentacin eran provocados por la presencia de
bacterias y levadura.
2. Evolucion de la enzimologia
Si bien algunos qumicos consideraron esos procesos como metamorfosis de
sustancias que provocaban excitaciones en otras que estaban cerca de ellas, esta
cuestin fue, como ya se ha dicho, definitivamente resuelta por Buchner hacia
finales del siglo XIX; exprimiendo masas celulares de Saccharomyces cerevisie
obtuvo un liquido sin clulas, capaz de producir la mismas reacciones qumicas
que se obtenan utilizando la suspensin de clulas, es decir, la transformacin del
azcar en alcohol y anhdrido carbnico. Por tanto, de la levadura se poda extraer
una sustancia capaz de regular un proceso qumico concreto.
Esto obligo a replantear las investigaciones contrarias a la teora de que el
proceso digestivo fuese debido a la trituracin de la s sustancias digeridas hasta el
punto de reducirlas a partculas lo suficientemente finas para poder ser asimiladas.
En efecto, en el siglo XVIII R.A de Reaumur (1683- 1757) haciendo ingerir a un
halcn una cpsula de hierro agujereada, que contena alimento, observ que este
qued completamente disuelto por los jugos gstricos y que, por tanto, no era,
molturado de modo mecnico por la robusta musculatura del robusto animal, pues
la cpsula quedo intacta.
Mas adelante se constato que el almidn era degradado a monosacrido y
disacrido por la accin del jugo salival (ptialina) y se describi la presencia de la
pepsina en el jugo gstrico. Posteriormente, fueron aisladas sustancias de
carcter fermentativo a partir de numerosas especies vegetales. Se observo que el
extracto de algunas races tenan capacidad para modificar el color azul de
determinadas sustancias y que el extracto de trigo era capaz de transformar el
almidn en disacridos y dextrina.
La va para el estudio de esas sustancias estaba ya abierta. Jons Jacob Berzelius
(1779 1848) interpreto su accin como si se tratase de unos catalizadores que
favorecan determinada reaccin qumica sin ser destruidos y sin aparecer en los
productos finales. Richard Kuhne (1900-1967) fue el primero en dar a tales
sustancias el nombre enzimas, tomado del griego, que significa literalmente "en la
levadura".
3. Las enzimas
La Enzima Como Unidad Fundamental De Vida
Cada clula y cada tejido tienen su actividad propia, lo que comporta continuos
cambios en su estado bioqumico, en la base de la cual estn las enzimas, que
tienen el poder de catalizar, facilitar, y agilizar determinados procesos sintticos y
analticos. Los propios genes son reguladores de la produccin de las enzimas;
por tanto, genes y enzimas pueden considerados como las unidades
fundamentales de la vida.
Este concepto poco difundido casi hasta el siglo XX, se ha desarrollado y
concretado cada vez mas, y constituye un componente esencial de diversas
disciplinas: la microbiologa, la fisiologa, la bioqumica, la inmunologa y la
taxonoma, formando adems parte del campo aplicado, en gran variedad de
industrias. El rasgo particular de las enzimas es que pueden catalizar procesos
qumicos a baja temperatura, compatible con la propia vida, sin el empleo de
sustancias lesivas para los tejidos. La vida es, en sntesis, una cadena de
procesos enzimticos, desde aquellos que tienen por sustratos los materiales mas
simples, como el agua (H2O) y el anhdrido carbnico (CO2), presentes en los
vegetales para la formacin de hidratos de carbono, hasta los mas complicados
que utilizan sustratos muy complejos.
La formacin de los prtidos, los glcidos y los lpidos es un ejemplo tpico: Son a
la vez degradados y reconstruidos por otras reacciones enzimticas, produciendo
energa a una velocidad adecuada para el organismo, sin el gasto energtico que
exigen los mtodos qumicos de laboratorio.
4. Importancia biomedica de las enzimas
Sin enzimas, no sera posible la vida que conocemos. Igual que la biocatlisis que
regula la velocidad a la cual tienen lugar los procesos fisiolgicos, las enzimas
llevan a cabo funciones definitivos relacionadas con salud y la enfermedad. En
tanto que, en la salud todos los procesos fisiolgicos ocurren de una manera
ordenada y se conserva la homeostasis, durante los estados patolgicos, esta
ltima puede ser perturbada de manera profunda. Por ejemplo, el dao tisular
grave que caracteriza a la cirrosis heptica pueden deteriorar de manera notable
la propiedad de las clulas para producir enzimas que catalizan procesos
metablicos claves como la sntesis de urea. La incapacidad celular para convertir
el amoniaco txico a urea no txica es seguida por intoxicacin con amoniaco y
por ultimo coma heptico. Un conjunto de enfermedades genticas raras, pero con
frecuencia debilitantes y a menudo mortales, proporciona otros ejemplos
dramticos de las drsticas consecuencias fisiolgicas que pueden seguir al
deterioro de la actividad enzimtica, inclusive de una sola enzima.
Despus del dao tisular grave (por ejemplo, infarto del miocardio o pulmonar,
trituracin de un miembro) o siguiendo a multiplicacin celular descontrolada (por
ejemplo, carcionoma prostatico), las enzimas propias de tejidos especficos pasan
a la sangre. Por lo tanto, la determinacion de estas enzimas intracelulares en el
suero sanguineo proporciona a los medicos informacion valiosa para el
diagnostico y el pronostico.
5. Caracteristicas de las enzimas
Desde el punto de vista qumico, las enzimas estn formadas de carbono (C),
Hidrgeno (H), oxigeno (O), Nitrgeno (Ni), y Azufre (S) combinados, pero siempre
con peso molecular bastante elevado y comn propiedades catlicas especificas.
Su importancia es tal que puede considerarse la vida como un "orden sistemtico
de enzimas funcionales". Cuando este orden y su sistema funcional son alterados
de algn modo, cada organismo sufre mas o menos gravemente y el trastorno
puede ser motivado tanto por la falta de accin como por un exceso de actividad
de enzima.
Las enzimas son catalizadores de naturaleza protenica que regulan la velocidad a
la cual se realizan los procesos fisiologicos, producidos por los organismos vivos.
En consecuencia, las deficiencias en la funcion enzimatica causan patologias.
Las enzimas, en los sistemas biolgicos constituyen las bases de las complejas y
variadas reacciones que caracterizan los fenmenos vitales. La fijacin de la
energa solar y la sntesis de sustancias alimenticias llevadas a cabo por los
vegetales dependen de las enzimas presentes en las plantas. Los animales, a su
vez, estn dotados de las enzimas que les permiten aprovechar los alimentos con
fines energticos o estructurales; las funciones del metabolismo interno y de la
vida de relacin, como la locomocin, la excitabilidad, la irritabilidad, la divisin
celular, la reproduccin, etc. Estn regidas por la actividad de innumerables
enzimas responsables de que las reacciones se lleven a cabo en condiciones
favorables para el individuo, sin liberaciones bruscas de energa a temperaturas
fijas en un medio de pH, concentracin salina, etc.; prcticamente constante.
A diferencia de un catalizador inorgnico que interviene en numerosas reacciones
las enzimas producidas por los organismos vivos habitualmente solo catalizan un
tipo de reaccin o solo una reaccin determinada; la especificidad de las enzimas
es tan marcadas que en general actan exclusivamente sobre sustancias que
tienen una configuracin precisa; por ejemplo, si solo atacan a los aminocidos
que tienen su carbono a , asimtrico, con estructura L-, no muestran la menor
actividad sobre formas idnticas de dichos aminocidos, pero que sean del tipo D-.
En los sistemas biolgicos se llevan a cabo diversas reacciones a partir de la
misma sustancia; por ejemplo algunos microorganismos convierten la glucosa en
alcohol y bixido de carbono, al paso que otros grmenes la convierten en cido
lctico o cido pirvico o acetaldehido. Esto quiere decir que la glucosa puede
descomponerse en distintos productos y aunque todas las posibilidades son
tericas y prcticamente posibles la presencia de ciertas enzimas favorece uno de
los caminos que llevan a la acumulacin de determinados compuestos.
Las enzimas, por lo tanto, se consideran como catalizadores altamente especficos
que:
Modifican la velocidad de los cambios promovidos por ellas.
Determinan que sustancias particulares, de preferencia a otras distintas son las
que van a sufrir los cambios.
Impulsan dentro de los distintos cambios posibles que pueda seguir una
sustancia, cual de ellos en especial, ser el utilizado.
Las enzimas representan las sustancias encargadas de graduar la velocidad de
una reaccin determinada en el interior de las clulas; como en las diversas
clulas se realizan infinidad de reacciones, ya que en una de ellas se encuentran
varios miles de sustancias, se deduce, tambin, la presencia de varios miles de
enzimas. Es posible, por lo tanto, que la mayor parte de esta estructura protenica
celular est formada por enzimas, encargadas de las diversas funciones de
sntesis, degradacin, oxidacin, etc. caractersticas de la actividad vital de los
distintos organismos.
6. La estructura enzimtica
Por su estructura y composicin qumica puede afirmarse que el origen de las
enzimas esta vinculando al origen de las sustancias proteicas. Al hablar del origen
de la vida se ha citado el xito de los experimentos realizados en el laboratorio
para la produccin de aminocidos; estos aminocidos son los que precisamente
constituyen la base del edificio proteico. Tambin en el laboratorio se ha intentado
la sntesis de protenas a partir de aminocidos.
La sede de las enzimas es el citoplasma. Los cloroplastos vegetales contienen
una amplia gama enzimas encargadas de la funcin cloroflica, proceso que a
travs de reacciones qumicas complejas y encadenadas transforman compuestos
inorgnicos, como el agua, y el anhdrido carbnico, en sustancias complejas
adecuadas para ser entre otras cosas el alimento fundamental de los animales.
En las mitocondrias existe un sistema de transporte de electrones que determinan
importantes fenmenos de oxidorreduccin, durante los cuales se forman notables
cantidades de ATP, que es un compuesto altamente energtico del que depende
la mayor parte de metabolismo, y coma, por tanto el trabajo de las clulas; en las
mitocondrias se produce el metabolismo enzimtico de los cidos grasos, los
cuales son en parte elaborados tambin en el citoplasma.
En los ribosomas tiene lugar concretamente todas la s sntesis de las sustancias
proteicas, mientras que en los lisosomas se producen enzimas hidrolticos cuya
misin escindir, con la intervencin del agua, molculas grandes en otras
menores, que pueden a su vez ser utilizadas por las clulas; en cambio, las
enzimas glucolticos estn difundidos en el citoplasma.
La localizacin de las sedes de las distintas operaciones enzimticas antes
mencionadas ha sido posible a travs del sistema de ruptura de las clulas y de la
separacin de los distintos componentes mediante centrifugacin diferencial del
homogeneizado de estas la ruptura celular y la subdivisin de los componentes
subcelulares se realizan actualmente utilizando los tejidos, por ejemplo con saltos
bruscos desde temperaturas inferiores a 0 C hasta temperaturas mas elevadas
con cambios de presin osmtica o mediante ultrasonidos.
7. Naturaleza qumica de las enzimas
Existen numerosas razones para afirmar que las enzimas son proteinas. La
ms importantes son las siguientes:
a. El anlisis de las enzimas obtenidas en forma ms pura, criatalizada, demuestra
que son protenas.
b. Las enzimas son inactivadas a altas temperaturas y, en geeral, la cintica de la
desnaturalizacin trmica de las enzimas da resultados muy parecidos a los
de la desnaturalizacin trmica de las protenas; por ejemplo el Q10 de la
mayora de las reacciones qumicas es de 2 a 3, y, en el casod e las
enzimas, a temperaturas elevadas, alrededor de 60 a 70 C, la actividad
neta aumeta varios cientos, como sucede con la velocidad de la
desnaturalizacin trmica de las protenas.
c. Las enzimas son activadas en unas zona muy restringida de pH, y presenta un
punto ptimo de ph donde su actividad es mayor. Las protenas en su punto
isoelctrico, muestran propiedades parecidas desde el punto de vista de
viscosidad, solubilidad, difucin, etc., que resulta del todo similares a las
propiedades de este tipo que muestran las enzimas.
d. Todos los agentes que desnaturalizan a las protenas tambin destruyen o
inactivan a las enzimas, ya sea el calor, los cidos fuertes, o los metales
pesados que puedesn combinarse con ellas.
e. Los problemas de solubilidad y de precipitacin son comunes a las protenas y
las enzimas; en general, son solubles en agua o soluciones salinas,
insolubles en alcohol, precipitan con determinadas concentraciones de
sales neutras, etc.
8. Composicin qumica de las enzimas
Los conocimientos sobre la composicin qumica de las enzimas constituyeron
materia de numerosas controversias hasta 1926, cuando J.B Sumner (1887-1955)
consigui cristalizar la ureasa, enzima que transforma la urea en anhdrido
carbonico y amoniaco, y demostrar que era una sustancia proteica.
A, partir de entonces fueron aisladas otras enzimas en forma pura, cristalina, y el
anlisis demostraba siempre la presencia de una proteina, simple o conjugada.
Cuando los analisi qumicos demuestran que la enzima es una protena
conjugada, pueden distinguirse en el dos partes bien diferenciadas:
El grupo prosteico (Coenzima)
La proteina (Apoenzima)
En algunas enzimas oxidantes fue observada la presencia de la promoporteinas,
en las cuales el grupo prosptico esta representado por un compuesto que
contiene Fe y otro elemento, el cual desmpea un papel importante en la
combinacin de la proteina con el sustrato; otras veces este grupo prosttico es
derivada de vitaminas (como la vitamina B); 4en muchos casos resulta facil de
separar de la molcula proteica. No obstante una vez separadas, las dos unidades
no muestran actividad enzimtico; por tanto el grupo proteico (coenzima) y el
grupo proteico (apoenzima) han de estar ntimamente ligados entre si para ser
operativos. Por consiguiente, de las enzimas pueden distinguirse los formados por:
Solo protenas, que difieren entre si por la secuencia con que los aminocidos
estn combinados, como la ureasa y las enzimas digestivas (la pepsina y la
tripsina)
Los conjugados, separados en dos entidades qumicas bien definidas: la
coenzima y la apoenzima.
Despus del descubrimiento de Sumner, el numero de la enzimas y el estudio de
sus actividades qumicas proporcionaron un notable impulso en la enzimologa, y
la gran cantidad de las enzimas que rpidamente se acumulaban determinaron la
necesidad de utilizar una clasificacin o nomenclatura para evitar errores y facilitar
la comprensin de futuros investigadores.
9. Nomenclatura y clasificacion de las enzimas
Cien aos atrs solo se conocian enzimas, muchas de estas, catalizaban la
hidrlisis de enlaces covalentes. Algunas enzimas, de manera especial las que
fueron descubiertas en un principio, recibieron nombres ligados mas bien a su sitio
de procedencia anatmica que no siguen ninguna regla ni sistema; tal es el caso
de la ptialina de la saliva, que ataca al almidn de la pepsina del estmago y de la
tripsina del pncreas, que atacan protenas; de la renina, que cuagula la leche; de
la papaina, enzima proteoltica que se encuentra en la papaya y de las catepsinas,
tambin proteasas, que se encuentran en las clulas. Las enzimas relacionadas
con la cuagulacin de la sangre, como son la trombina, la plasmina, el
plasmingeno, etc. reciben tambin nombres sistematizados.
Al descrubir nuevas enzimas y proceder a su caracterizacin estricta se aplicaron
reglas de nomenclatura basadas en el nombre del sustrato atacado, o en el tipo
general de sustrato, o en la reaccin catalizada y se ha aadido
convencionalmente, la terminacin -asa. Por ejemplo: las lipasas (hidrolizan lipidos
o grasas), las amilasas (hidrolizan almidon), las proteasas (hidrolizan proteinas),
las esterasas (basado en la unin general de tipo ster presentes en muchas
sustancias), colesterol estrerasa (si la esterasa es especfica de los esteres de
colesterol) y acetilcolina esterasa (si la estersa de la acetilcolina). Otros ejemplos:
Las fosfatasas son enzimas que atacan las uniones ster, pero en este caso,
toman su nombre del grupo vecino a la unin que van a atacar, de manera que se
denominan fosfatasas (cuando quitan una molcula de monofosfato),
pirofosfatasas (cuando quitan el cido fosfrico como esteres dobles (pirofosfatos),
o triples, etc.) De la misma manera, las carbohidrasas se denominan as
genericamente, pero pueden comprender enzimas con nombres proveniente del
sustrato particular sobre el que actuan como la amilasa que ataca al almidn y la
celulasa que acta sobre la celulosa y, en otras ocaciones, se denominan de
acuerdo con la unin atacada, como la b -glucosidasa que acta sobre las uniones
b -glucosdicas. Los ejemplos se pueden extender a todos los terrenos de la
actividad enzimtica, como en las enzimas proteolticas, las fosforilasas, las
nucleasas, etc.
Esta manera de llamarlas, se demostro que era inadecuada porque al descubrirse
varias enzimas, notaron que varias enzimas catalizaban reacciones diferentes del
mismo sustrato, por ejemplo, oxidacion o reduccion de la funcion alcohol de un
azucar.
Aunque el sufijo asa continua en uso; actualmente, al nombrar a las enzimas, se
enfatiza el tipo de reaccion catalizada. Por ejemplo: las hidrogenasas catalizan la
eliminacion de hidrogeno y las transferasas, reacciones de transferencia de grupo.
Con el descubrimiento de mas y mas enzimas, surgieron ambiguedades y con
frecuencia no estaba claro cual era la enzima que un investigador deseaba
estudiar. Para remediar esta deficiencia, la Comisin para el estudio de las
enzimas, que constituye con respecto a los sistemas anteriores un punto de vista
ms uniforme, preciso y descriptivo; esta formada por la Union Internacional de
Bioquimica (IUB) adopto, en 1964, un sistema complejo pero inequivoco de la
nomenglatura enzimatica basado en el mecanismo de reaccion.
El sistema se basa en la reaccin qumica catalizada que es la propiedad
especfica que caracteriza a cada enzima las cuales se agrupan en clases, porque
catalizan procesos semejantes, y en subclases que especifican con mayor
exactitud la reaccin particular considerada. En general, las enzimas reciben un
nombre de acuerdo con el sustrato o los sustratos que participan en la reaccin
seguido por el tipo de reaccin catalizada y, por fin, la terminacin -asa. A menudo
los nombres as obtenidos resultan largos y complejos, por lo que es muy dificil
que en la prctica se pueda excluir el uso de los nombres triviales, consagrados
por la costumbre. Sin embargo, con fines de sistematizacin, se reconoce la
necesidad de aceptar el nuevo sistema.
Aunque su claridad y carencia de ambigedad recomiendan al sistema de
nomenglatura IUB para trabajos de investigacion, nombres mas ambiguos, pero
basante mas cortos persisten en libros de texto y en el laboratorio clinico. Por esta
razon, a continuacion solo se presenta principios generales del sistema IUB:
1. Las reacciones y las enzimas que las catalizan se dividen en 6 clases
principales, cada una con 4 a 13 subclases.
2. El nombre de la enzima tiene 2 partes: la primera es el nombre del o los
sustratos; la segunda, con terminacion asa, indica el tipo de reaccion
catalizada.
3. Informacion adicional, si es necesario aclarar la reaccion, puede seguir el
parentesis. Por ejemplo: la enzima que cataliza L-malato + NAD= = piruvato
+ CO2 NADH + H= , se denomina como 1.1.1.37 L-malato:NAD+
oxidorreductasa (descarboxilante).
4. Cada enzima tiene un numero clave (E.C.) que caracteriza al tipo de reaccion
segn la clase (primer digito), subclase (segundo digito) y subclase (tercer
digito). El cuarto digito es para la enzima especifica. Asi, E.C. 2.7.1.1
denota la clase 2 (una transferasa), subclase 7 (transferencia de fosfato),
sub-clase 1 (una funcion alcohol como aceptor de fosfato). El ultimo digito
denota a la enzima hexocinasa o ATP: D-hexosa-6-fosforotransferasa,
enzima que cataliza la transferencia de fosfato desde el ATP al grupo
hidroxilo de carbono 6 de la glucosa.
Al final de sus y trabajos, clasifico las enzimas en seis grupos principales,
correspondientes por sus trminos a las raciones que cada enzima ejerce sobre el
sustrato. Estos grupos se subdividen en otro, segn el tipo de sustrato y los
tomos concretos que son sensibles a sus acciones. Estos seis grupos son los
siguientes:
1. Oxidoreductasas
2. Transferasas
3. Hidrolasas
4. Isomerasa
5. Liasas
1.Oxido-reductasas: Son las enzimas relacionadas con las oxidaciones y las
reducciones biolgicas que intervienen de modo fundamental en los procesos de
respiracin y fermentacin. Las oxidoreductasas son importantes a nivel de
algunas cadenas metablicas, como la escisin enzimtica de la glucosa,
fabricando tambin el ATP, verdadero almacn de energa. Extrayendo dos
tomos de hidrgeno, catalizan las oxidaciones de muchas molculas orgnicas
presentes en el protoplasma; los tomos de hidrgeno tomados del sustrato son
cedidos a algn captor.
En esta clase se encuentran las siguientes subclases principales:
Deshidrogenasas y oxidasas. Son ms de un centenar de enzimas en cuyos
sistemas actan como donadores, alcoholes, oxcidos aldehidos, cetonas,
aminocidos, DPNH2, TPNH2, y muchos otros compuestos y, como receptores,
las propias coenzimas DPN y TPN, citocromos, O2, etc.
2.Las Transferasas: Estas enzimas catalizan la transferencia de una parte de la
molcula (dadora) a otra (aceptora). Su clasificacin se basa en la naturaleza
qumica del sustrato atacado y en la del aceptor. Tambin este grupo de enzimas
actan sobre los sustratos mas diversos, transfiriendo grupos metilo, aldehdo,
glucosilo, amina, sulfat, sulfrico, etc.
3.Las Hidrolasas: Esta clase de enzimas actan normalmente sobre las grandes
molculas del protoplasma, como son la de glicgeno, las grasas y las protenas.
La accin cataltica se expresa en la escisin de los enlaces entre tomos de
carbono y nitrgeno (C-Ni) o carbono oxigeno (C-O); Simultneamente se obtiene
la hidrlisis (reaccin de un compuesto con el agua)de una molcula de agua. El
hidrgeno y el oxidrilo resultantes de la hidrlisis se unen respectivamente a las
dos molculas obtenidas por la ruptura de los mencionados enlaces. La
clasificacin de estas enzimas se realiza en funcin del tipo de enlace qumico
sobre el que actan.
A este grupo pertenecen protenas muy conocidas: la pepsina, presente en el jugo
gstrico, y la tripsina y la quimiotripsina, segregada por el pncreas. Desempean
un papel esencial en los procesos digestivos, puesto que hidrolizan enlaces
ppticos, estricos y glucosdicos.
4.Las isomerasas:Transforman ciertas sustancias en otras ismeras, es decir, de
idntica formula emprica pero con distinto desarrollo. Son las enzimas que
catalizan diversos tipos de isomerizacin, sea ptica, geomtrica, funcional, de
posicin, etc. Se dividen en varias subclases.
Las racemasas y las epimerasas actan en la racemizacin de los aminocidos y
en la epimerizacin de los azcares. Las primeras son en realidad pares de
enzimas especficas para los dos ismeros y que producen un solo producto
comn. Las isomerasas cis trans modifican la configuracin geomtrica a nivel
de un doble ligadura. Las xido reductasas intramoleculares cetalizan la
interconversin de aldosas y cetosas, oxidando un grupo CHOH y reduciendo al
mismo tiempo al C = O vecino, como en el caso de la triosa fosfato isomerasa,
presente en el proceso de la gluclisis ; en otros casos cambian de lugar dobles
ligaduras, como en la (tabla) isopentenil fosfato isomerasa, indispensable en el
cambio biosintico del escualeno y el colesterol. Por fin las transferasas
intramoleculares (o mutasas) pueden facilitar el traspaso de grupos acilo, o
fosforilo de una parte a otra de la molcula, como la lisolecitina acil mutasa que
transforma la 2 lisolecitina en 3 lisolecitina, etc. Algunas isomerasa actan
realizando inversiones muy complejas, como transformar compuestos aldehdos
en compuestos cetona, o viceversa. Estas ultimas desarrollan una oxidorreduccin
dentro de la propia molcula (oxido rreductasa intramoleculares)sobre la que
actan, quitando hidrgeno, a algunos grupos y reduciendo otros; actan
ampliamente sobre los aminocidos, los hidroxcidos, hidratos de carbono y sus
derivados.
5.Las Liasas: Estas enzimas escinden (raramente construyen) enlaces entre
tomos de carbono, o bien entre carbono y oxigeno, carbono y nitrgeno, y
carbono y azufre. Los grupos separados de las molculas que de sustrato son casi
el agua, el anhdrido carbnico, y el amoniaco. Algunas liasa actan sobre
compuestos orgnicos fosforados muy txicos, escindindolos; otros separan el
carbono de numerosos sustratos.
6.Las Ligasas: Es un grupo de enzimas que permite la unin de dos molculas, lo
cual sucede simultneamente a la degradacin del ATP, que, en rigor, libera la
energa necesaria para llevar a cabo la unin de las primeras. Se trata de un grupo
de enzimas muy importantes y recin conocidas, pues antes se pensaba que este
efecto se llevaba a cabo por la accin conjunta de dos enzimas, una fosfocinasa,
para fosforilar a una sustancia A (A + ATP A - + ADP) y una transferasa que
pasara y unira esa sustancia A, con otra, B (A - + B A B + Pi ). A este grupo
pertenecen enzimas de gran relevancia reciente, como las aminocido ARNt
ligasas conocidas habitualmente con el nombre de sintetasas de aminocidos
ARNt o enzimas activadoras de aminocidos que representan el primer paso en el
proceso biosinttico de las protenas, y que forman uniones C-O; las cido-tiol
ligasas, un ejemplo tpico de las cuales es la acetil coenzima. A sintetasa, que
forma acetil coenzima. A partir de cido actico y coenzima A ; las ligasas cido
amoniaco (glutamina sintetasa), y las ligasas cido-aminocido o sintetasas de
pptidos, algunos de cuyos ejemplos ms conocidos son la glutacin sintetasa, la
carnosina sintetasa, etc.
La accin de estas enzimas se manifiesta con la formacin de enlaces entre
tomos de carbono y oxigeno de diversas molculas, o bien entre carbono y
azufre, carbono y nitrgeno y carbono y carbono. Las ligasas utilizan siempre,
para el proceso de reaccin, la energa proporcionada por el ATP o compuestos
homlogos que son degradados, Por consiguiente las enzimas de esta clase son
los nicos que intervienen en reaccin no espontnea desde un punto de vista
termodinmico; Actan sobre los sustratos ms diversos y revisten particular
importancia en el metabolismo de los cidos nucleicos.
Estas reacciones enzimticas se desarrollan en dos tiempos: en el primero se
forma un complejo intermedio con potencia energtica muy alta-, en el segundo
utilizan la energa obtenida para realizar la reaccin de sntesis.

10.Partes del sistema enzimatico
Los sistemas enzimticos en general, estn formados por la enzima propiamente
dicha (apoenzima), el sustrato o los sustratos un grupo proteico ( o coenzimas) y
sustancias activadoras. La estructura formada por la apoenzima y la coenzima se
denomina boloenzima; con cierta frecuencia se reconocen sistemas enzimaticos
que no tienen grupo prosttico o activadores reconocidos.
Apoenzima: concepto del centro activo
La apoenzima es la enzima propiamente dicha, de naturaleza proteica formada por
cadenas de polipptidos, con peso molculas elevado, no dializable y termolbil.
Las estudiadas analticamente hasta ahora, han sido, por razones tcnicas de
peso molecular bajo, 12 a 24 000, tienen una sola cadena polipeptdica
(ribonucleasa, papaina, tripsina, pepcina, etc.) excepto uno o dos casos (a -
quimotripsina y aldolasa) que tienen dos.
El anlisis de los aminocidos que componen a diversas enzimas demuestran que
tienen una estructura similar a la de cualquier protena; existen, de hecho unos
cuantos casos en los que se ha determinado su secuencia completa, es decir, el
orden en el que estn dispuestos todos ellos en la cadena. El anlisis de la
estructura secundaria de la protena, osea el modo como la cadena peptdoica se
dispone a lo largo de su eje mayor y el de la estructura terciaria, osea la forma en
que la cadena se pliega y se acomoda para formar una estructura tridimensional
se conocen muy mal para todas las enzimas. Solo en el caso de la lisozima
(enzima presente en las lgrimas donde funciona como un antisptico suave y que
tiene la capacidad de atacar a los polisacridos que forman la pared de diversas
bactrias) se ha determinado la estructura tridimensional de una enzima; para este
fin se aplican las tcnicas de cristalografa de rayos x, con una solucin de dos ,
lo que demostr que la lisosima es una protena con su cadena de 129
aminocidos ampliamente plegada y en la que se reconoce una hendidura
representante del centro activo donde se acomodan muy bien los inhibidores
ciertos compuestos del tipo de carbohidratos que nulifican su actividad
enzimtica. Se ha demostrado, en este caso, que es cierta regla general de que el
modo como se ordenan y disponen los aminocidos de termoina el arreglo
espacial que permite a las otras partes del sistema enzimtico sustratos,
cofactores, iones, etc. adaptarse, en el espacio, en forma adecuada, para que se
lleve a cabo la accin cataltica. Por lo tanto, las estructuras indispensables que
permiten la combinacin con el sustrato y que confieren propiedades enzimticas
a la molcula se denomina "centro activo". Se acepta que el centro activo no es
una parte muy grande de la enzima completa y, en ciertos sistemas estudiados por
medio de bloqueos qumicos no parece constituir una zona de ms de 20 de
dimetro. Es muy posible que el centro activo est formado por la contribucin de
grupos funcionales de aminocidos situados en distintas cadenas o en diferentes
repliegues de una cadena, asiendo aparecer a dichos grupos muy distantes entre
ellos si se considera el orden que guardan a lo largo de la cadena polipeptdica.
Un caso muy ilustrativo sobre lo que significa la estructura del centro activo desde
el punto de vista de la composicin de los aminocidos es el de la triptofano
pirrolasa, enzima ampliamente estudiada en bacterias desde el punto de vista de
la bioqumica gentica. En ella, la modificacin de algunos aminocidos produce
perdida e la actividad enzimtica, que se recupera si vuelve a incluirse los
aminocidos en el orden original; sin embargo, se pueden reemplazar dos de ellos
por otros completamente distintos, y la enzima vuelve a ser totalmente activa. Es
posible que con estos nuevos aminocidos se consigan tambin las condiciones
de distribucin espacial de grupos funcionales y estructuras necesarias para la
actividad enzimtica.
El concepto de arreglo tridimensional adecuado de los aminocidos que forman la
cadena polipeptdica de la enzima para lograr la actividad funcional correcta
permite entender numerosos denmenos: la necesidad de que la molcula
proteica ntegra est preservada en su forma; el hecho de que la desnaturalizacin
de la enzima al permitir la separacin de los pliegues, conduce a la perdida de la
actividad enzimtica; que al calentar una enzima con su sustrato (por ejemplo, la
invertasa con sacaroza, la transaminasa con cido a -cetoglutrico), se impide una
desnaturalizacin que sin ellos se producira, pues es posible que el propio
sustrato contribuya a sostener y reforzar la aproximacin de los pliegues de la
cadena, etc.
Tambin se entiende por que al atacar la ribonucleasa con pepsina y romper una
sola unin peptdica que separa un tetrapptido del extremo con grupo carboxilo
libre se pierde la actividad, mientras que si solo se quita los tres ltimos disminuye
su accin sugiriendo as la importancia del residuo de cido asprtico para
sostener el centro activo en condiciones de eficiencia, o lo que es ms probable,
para formar parte del propio centro activo. Si se parte la ribonucleasa entre los
aminocidos 20 y 21, y se separan los dos fragmentos, ninguno es activo, pero
basta mezclarlos para que se unan en tal forma que se restablece la actividad,
aunque un poco menor que la originalmente observada.
El estudio detallado de la estructura del centro activo se hace por medio de
inhibidores o de reactivos que se combinan de modo especfico, con algunos de
los aminocidos del centro activo tales como el diisopropilfluorofosfato (DFP), que
se combina con el OH del aminocido serina, en diversas esterasas, peptidasas,
etc. , e inactiva el centro activo del que forman parte dicho aminocido; este
inhibidor, an a concentraciones de 10-10 M, inhibe a la acetilcolinesterasa;
mucho de los derivados del DFP se utilizan como gases de guerra o como
insecticidas (parathion), y su utilidad se debe, en rigor a su capacidad para destruir
funcionalmente ciertas enzimas.
La unin del DFP al aminocido cedina es muy estrecha y a permitido el anlisis
de los aminocidos vecinos a l, haciendo un estudio de su ordenamiento en el
centro activo. La secuencia de los centros activos de diversas enzimas hidrolticas
sensibles al DFP, se demuestran que la mayora tienen cerina y a dems un
aminocido dicarboxlico (asprtico o glutmico) y en el otro un aminocido neutro
(alanina o glicina). Tambin se ha demostrado que la histidina, cuando menos
para el caso de la quimotripsina, forma parte del centro activo an cuando el
anlisis de la secuencia no demuestra que exista cerca de la cerina ninguna
histidina; se trata, por lo tanto, de otro ejemplo de una aminocido, alejado e otro,
y en distinto pliegue de la cadena, que integra el centro activo.
Teniendo en cuenta estos hechos, se deduce, por lo tanto, que la actividad de la
enzima depende en parte de la disposicin o arreglos de los aminocidos y grupos
prostticos en determinada regin de la protena. Los aminocidos que componen
a las protenas pueden tener moderadas actividades catalticas, aunque de
ninguna manera comparable en su magnitud, cuando se les considera en forma
aislada, a las que muestran la gran molcula proteica. De hecho para muchos
sistemas enzimticos se han ideado modelos anlogos, osea sustancias qumicas
sencillas que suelen reproducir los efectos ocasionados por la enzima, tal es el
caso de los anlogos, a base de piridoxsal que representan la parte activa de
enzimas descarboxilantes y transaminantes. Esto no significa que
necesariamente, en el estado natural, la enzima funcione como lo hace el anlogo
pues muchos sistemas pudieran tener otro mecanismo de operacin; la hidrlisis
del almidn lo mismo se logra con la adicin del cido que con la enzima
especfica amilasa, an cuando en el primer caso se atacan indiscriminadamente
numerosas uniones glucosdicas, y con la enzima, en cambio solo se desprenden,
uno tras otro fragmentos de dos unidades de glucosa de los extremos de las
ramificaciones.
Conformacin de la enzima y propiedades del centro activo. La propiedad
cataltica de las enzimas parece depender de la facilidad con la que ayudan
a que se pongan en contacto las sustancias reaccionantes para dar el
producto o los productos de la reaccin. Esto implica que el sistema
enzimtico tenga una conformacin especial osea, una disposicin
adecuada de os grupos funcionales aminocidos de la apoenzima y
grupos prostticos, cuando existen estos y de las molculas mismas de
los sustratos que se unirn a aquellos y permitirn que se lleve a cabo la
reaccin qumica. Este acercamiento de las sustancias reaccionantes de los
grupos prostticos y los grupos funcionales fue las razn del modelo de
Ehrlich, conocido clsicamente como de la "llave y la cerradura". As la
enzima sera un molde tridimensional en negativo, de la estructura tambin
tridimensional, en positivo de los reaccionantes que se adaptaran
perfectamente a ala disposicin de la enzima. Sin embargo ha sido
necesario reconsiderar esta situacin y sugerir de acuerdo con Koshland
la teora de un "acomodo inducido".
As las enzimas pueden sufrir un cambio en su estructura desde el momento en
que entran en contacto con los reaccionantes, sustratos y cofactores, y es posible
que todos ellos modifiquen el arreglo tridimensional de la enzima; la enzima los
recibe en un orden determinado y cada uno de ellos al unirse a la enzima modifica
su estructura. La nueva analoga es la del "guante y la mano"; aquel no representa
una estructura de negativo tridimensional mientras no se halla la mano en el, ya
que antes pueden tener diversas formas y disposiciones, una vez que ha entrado
la mano - que a su vez tambin puede adoptar distintas posiciones se ponen en
contacto todas las partes correspondientes, es decir, en el caso de la enzima, las
partes reactivas del sistema enzimtico, con las partes reaccionantes, osea los
sustratos. Se ha preservado con esta nueva idea, el aspecto de la armona
estructural entre el sustrato y la enzima pero se introduce el nuevo concepto de
que es necesario provocar un cambio en la estructura proteica que favorezca la
colocacin adecuada de todos los elementos que interviene en la reaccin
enzimtica. Los cambios de la estructura protica se denominan
"conformacionales". El cambio en la disposicin tridimensional puede hacerse a
distancia y en muchas ocasiones la unin del sustrato a una parte de la enzima
modifica otras zonas de ella y an su estructura completa, debido a plegamientos
que acercan o alejan diversos grupos colocados a lo largo del pptido que forma la
enzima. Esta alteracin mltiple y de tipo flexible, permite entender mejor el
proceso de entrada ordenada de los sustratos, y los cofactores y la reaccin en la
que se participan. Tambin permiten comprender porque un sustrato entra a una
enzima y es atacado y uno que no lo es an muy parecido a l, puede quedar
excluido del centro activo.
Se ejemplifican estas ideas en A se encuentra la enzima en una forma desplegada
con ciertos grupos reactivos (+) y (-), colocados en una zona de la superficie de la
enzima. La entrada de un cofactor F1, modifica una parte del sistema (B); se
introduce en el sistema un nuevo arreglo a base de la reactividad de tipo
electrnico entre la zona (+) y una parte del cofactor F1, recin introducido; por fin
la entrada de un nuevo reaccionate F2 modifica la parte terminal de la enzima de
manera que permite la entrada del otro reaccionante (sustrato) que se acomoda
en un lugar preparado previamente por los reaccionantes F1 y F2, y permite de
esta manera echar a andar la reaccin cataltica. Los cambios conformacionales,
se pueden demostrar con diversos mtodos algunos de tipo fsico, como son las
modificaciones en la rotacin ptica o en el patrn de sedimentacin en el campo
gravitacional de la ultracentrfuga, o qumicos como el aumento o la disminucin
de la actividad enzimtica bajo la influencia de cambios trmicos o la adicin de
agentes desnaturalizantes. Basten unos cuantos ejemplos: la transaminasa a -
cetoglutrica se pude calentar a 65 C. en presencia de su sustrato sin que se
afecte, al paso que la enzima sola es rpidamente degradada, cambia de
configuracin y se precipita; la miosina, protena muscular contrctil, en presencia
de ATP hace ms notable su forma de espiral y permite el reconocimiento de
aminocidos previamente ocultos en sus pliegues; la D-amino oxidasa, al unirse a
su cofactor, el FAD, pasa de la forma espiral en a -hlice, a una disposicin
irregular distribuida al azar.