Em Desterro (antiga denominao de Florianpolis) Fritz Mller pde
desenvolver a parte mais importante de sua obra cientfica. Estudou e descreveu com notvel perfeio vrios grupos zoolgicos, principalmente invertebrados marinhos, em especial crustceos. Tinha um talento incomum para o desenho e suas descries eram sempre permeadas de magnficas ilustraes de incrvel detalhamento.
Estabelece uma correspondncia contnua com vrias eminncias cientficas da poca, entre os quais, Max Schultze, Herman von Ihering, August Weismann, Louis Agassiz, Ernst Krause, Ernst Haeckel (pai do termo Ecologia), Hermann Mller (seu irmo botnico, a quem F. Mller escrevia assiduamente, sendo que 286 cartas esto preservadas) e em especial com Charles Darwin, cuja extensa e contnua correspondncia se estende por 17 anos, at a morte de Darwin.
Fritz Mller encontra na praia de Armao da Piedade um exemplar gigante de hemicordado, Balanoglossus, e o envia provavelmente para Spengel que publica uma breve nota no Informativo da Estao Zoolgica de Npoles e o classifica posteriormente (1899, aps a morte de F. Mller) como Balanoglossus gigas, constituindo o maior espcime deste grupo animal.
O atual Centro de Biologia Marinha da Universidade de So Paulo (CEBIMAR USP), no litoral de So Sebastio, So Paulo, foi ali edificado em homenagem a Fritz Mller, por ter sido encontrado naquele local, um fragmento de B. gigas pelo Prof. Besnard do Instituto Oceanogrfico, semelhante ao encontrado por Fritz Mller.
1861 Fritz Mller recebe um exemplar do revolucionrio livro de Charles Darwin A origem das espcies, publicado em 1959 (ingls) e traduzido para o alemo. Fritz Mller fica fascinado e decide ir a campo para testar a teoria de Evoluo de Darwin, selecionando para tal o grupo dos crustceos.
1864 Publica o livro Fr Darwin (em favor de Darwin), em Leipzig na Alemanha. Neste pequeno livro, cheio de fatos novos em consonncia com a teoria recm-proposta por Darwin (The Origin - 1859), Fritz Mller aplica a campo a Teoria da Evoluo das espcies por Seleo Natural, utilizando em especial o desenvolvimento ontogentico (do estgio embrionrio at o adulto) de uma espcie de camaro de gua-doce. O livro (12 captulos) trouxe novos subsdeos, fortalecendo de forma decisiva a teoria darwiniana. Foi atravs deste livro, que as idias de Darwin foram divulgadas na culta Alemanha, suscitando uma forte reao contrria. Fritz Mller desenvolve ainda neste livro, a fascinante tese da Recapitulao Ontogentica da Filogenia, que foi fortemente corroborada e adaptada por E. Haeckel.
1865 Darwin tem acesso ao livro Fr Darwin e sente-se imensamente honrado com o trabalho de Fritz Mller. Escreve a Fritz Mller (primeira carta): .... Muitos de seus argumentos me parecem excelentes e muitos de seus fatos maravilhosos.... Carta de 10 de agosto, 1865.
Inicia-se ento, uma intensa correspondncia entre F. Mller e C. Darwin que durou por 17 anos, at a morte de Darwin. Ambos naturalistas nunca se conheceram pessoalmente, apenas por cartas e fotos. Darwin referia-se carinhosamente ao amigo Fritz Mller como Prncipe dos Observadores. A correspondncia de ambos naturalistas foi publicada em portugus (Dear Mr. Darwin - 43SA-Grfica e Editora, So Paulo) por Cezar Zillig em 1997, por ocasio do centenrio da morte de F. Mller.
1867 1897 (Retorno Colnia de Blumenau) Fritz Mller retorna a Colnia de Blumenau na funo de Pesquisador do Vale do Itaja-Au.
1868 A Universidade de Bonn, Alemanha, confere o ttulo de Doutor Honoris Causa a Fritz Mller.
1869 Darwin escreve a Fritz Mller: ... Vejo a publicao de seu ensaio (Fr Darwin), como uma das maiores honras que jamais me foram conferidas... Nada pode ser to profundo e surpreendente do que suas observaes.... Carta de 18 de maro de 1869.
Darwin convence seu prprio editor John Murray a publicar uma traduo em ingls do Fr Darwin (intitulado: Facts and Arguments for Darwin), cobrindo ele prprio todas as despesas da impresso. Darwin escreve a Fritz Mller 18/03/1869 ..
Nas novas edies do livro Origem das espcies, Darwin cita dezesseis vezes as observaes de Fritz Mller.
1874 A Universidade de Tbingen, Alemanha, confere a Fritz Mller o ttulo de Doutor Honoris Causa.
1879 F. Mller publica um artigo original na revista Kosmos, expondo um fenmeno que posteriormente veio a ser conhecido como Mimetismo Mlleriano e que estudado atualmente nas escolas de todo o mundo.
1882 A morte do amigo Charles Darwin entristece Fritz Mller de forma profunda.
1884 Recebe o Ttulo de Scio Honorrio da Entomological Society de Londres e o Ttulo de Scio Correspondente da Sociedade Nacional de Cincias de Buenos Aires.
1892 A pedido do Dr. Peter Vogel de Mnchen, Fritz Mller escreve sua autobiografia, publicada na Revista de Geografia e Etnologia.
1897 Morre o naturalista Fritz Mller aos 75 anos. Em seus timos anos dedicou-se em especial ao estudo de orqudeas e bromlias e s interaes inseto-planta. Sua morte foi publicada no obiturio do peridico cientfico de renome Nature. No obiturio questiona-se se algum outro naturalista, com exceo do prprio Charles Darwin, teria dado ao mundo um conjunto to amplo e original de observaes capazes de fundamentar o processo de seleo natural de forma to consistente e decisiva, quanto Fritz Mller.
1915-1921 (Coletnea da Obra) A quase totalidade da obra Fritz Mller foi reunida e organizada por seu sobrinho-primo, o miclogo alemo Alfred Mller: mais de 250 escritos (memrias, artigos cientficos e monografias), incluindo quase toda a zoologia de invertebrados e grande parte da botnica da zona sul do Brasil. uma obra monumental, publicada em 3 volumes, por ocasio da primeira grande guerra: Mller, A. Fritz Mller. Werke, Briefe und Leben, Jena, 1915-1921.