Gentica- CMA 2013-2014

Frequncias genotpicas e allicas

Equilbrio de H&W
Carolina Lemos
1
Gentica das Populaes
1. Conceitos bsicos. Frequncias genotpicas e
frequncias allicas
Equilbrio de Hardy e Weinberg
Da clula ao gene
1665 (Hook) - clula
1838 (Schleiden & Schwann) - teoria celular
1858 (Virchow) - diviso celular
1859 (Darwin) - A Origem das Espcies
1865 (Mendel) - publicao de Mendel
1869 (Miesher) - isolamento do DNA
1875/1879 (Stasburger/Fleming) - observao mitose (vegetal/animal)
1890 (Hertwig e Boveri) - descoberta a meiose (1905, Farmer&Moore)
1900 (deVries, Correns, Tschermak) - redescoberta das leis de Mendel
1900 (K.Landsteiner) - grupo ABO
1902 (W.Sutton e T.Boveri) - teoria cromossmica da hereditariedade
1902 (Garrod) - alcaptonria
1903 (Farabee) - famlia de braquidactilia
1906 (Bateson) - Gentica ("hereditariedade, variao e evoluo)
1908 (Garrod) - erros inatos do metabolismo
1908 (Hardy e Weinberg) - fundao da gentica das populaes
1909 (Morgan) - estudos com Drosophila (interaces gnicas)
1910 (Johannsen) - gene
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Frequncias genotpicas e allicas
Equilbrio de H&W
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2
3
Gentica das Populaes:
em que consiste?
Genes e populaes
Criao e manuteno da variabilidade gentica (ao
nvel da populao)
Estuda a regulao no tempo da estrutura gentica
de uma populao
a) de uma gerao para a outra
b) evolutivo
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Frequncias genotpicas e allicas
Equilbrio de H&W
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3
Gentica das Populaes
A gentica das populaes trata das consequncias
das leis de Mendel na composio das populaes,
sobretudo dos efeitos da mutao, seleco,
migrao e flutuaes ao acaso das frequncias
gnicas que, no seu conjunto, determinam a estrutura
gentica das populaes
5
Mendelismo e populaes
Mendelismo (indivduos e famlias) - nfase no
fentipo e no tipo de cruzamento
(ex. AA x BB F1 x F1 F2)
Gentica das populaes - sem restries de
cruzamentos; nfase no comportamento dos genes
(descrio de populaes de genes, suas trocas e
transmisso s geraes futuras, quaisquer que
sejam as propores)
6
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Frequncias genotpicas e allicas
Equilbrio de H&W
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4
Gentica Mendeliana e Gentica das Populaes
Gentica Mendeliana
- Genes em famlias
- Restries na forma dos
acasalamentos
Gentica Populacional
- Populaes de indivduos,
gmetas e genes (alelos)
- Restries removidas
7
A Gentica das Populaes constitui uma
extenso da Gentica Mendeliana (factorial)
Base Mendeliana da
Gentica das Populaes (1)
A teoria da Gentica das Populaes baseia-se no
postulado que o funcionamento dos genes em
populaes se faz segundo as leis de Mendel:
1. Hereditariedade funciona atravs de elementos
(factores) que transmitem a informao entre
geraes
2. Os organismos tm reproduo sexuada
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Frequncias genotpicas e allicas
Equilbrio de H&W
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5
Base Mendeliana da
Gentica das Populaes (2)
3. Os genes existem em dose dupla nos organismos
(diplides) e segregam para doses simples nos
gmetas (haplides)
4. A fertilizao corresponde juno de gmetas e
constituio de novos organismos (zigotos)
5. Pode haver dominncia (uma cpia do gene
suficiente para a manifestao do fentipo)
9
Genes e gentipos
Indivduo Gentipo
Gmeta Gene
(alelo)
Zigoto Gentipo
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Diplide
Haplide
Diplide
Gerao seguinte
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6
Genes e gentipos
Gentipos so conjuntos transitrios, dependem da
forma como os alelos se arrumam nos indivduos,
desfazem-se e formam-se de novo a cada gerao
Genes tm continuidade na populao, visto serem
transmitidos de uma gerao para a outra
gentica populacional ocupa-se das populaes
de genes, da sua troca entre populaes e da sua
transmisso s geraes seguintes
11
Genes
(alelos)
Frequncias gnicas
(allicas)
Gmetas
Permanentes
Genes e gentipos
Gentipos
Frequncias genotpicas
Zigotos
Transitrios
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7
13
Gentica das Populaes
A Gentica das Populaes consiste essencialmente
em dois grandes ramos:
(1) a descrio da composio gentica das
populaes
(2) a tentativa de compreenso das foras que
determinam mudanas nessa composio.
Populao mendeliana
e pool gentico
Populao mendeliana - grupo de indivduos da
mesma espcie, que partilham uma mesma
"reserva gentica" (pool gentico), e que
potencialmente ou realmente se cruzam entre si
Abordagem quantitativa (propores de genes e
de gentipos) de caractersticas qualitativas
(fentipos mendelianos)
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15
Pool
Gentico
A
A
E
A
D
C
A
A
C
A
E
A
E
B
A
E
A
A
C
A
A
E
A
B
B
A
C
A
A
C
A
A
C
E
A
A
D
B
E
D
A
D
A
E
D
A
E
B
A
A
A
C
D
E
A
Pool (reservatrio) gentico
(descrevemos uma populao
pela frequncia dos seus genes/alelos)
Locus (genes) e alelos
Sem variabilidade (locus A, s alelos A)
Polialelismo (vrias formas allicas):
Locus A: alelos A e a
MN: alelos M e N
Locus ABO: alelos A, B e O
Locus A: alelos A1, A2, A3
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Equilbrio de H&W
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17
Gentica das Populaes:
clculo de frequncias allicas
(genticas)
(organismo diplide, 2 alelos e codominncia)
Frequncias allicas (p , q )
Proporo de cada forma allica (A1, A2, ) em
todas as cpias do gene A nessa populao
Normalmente estimada por amostragem
diplide: 2 alelos
homozigotos: 2 cpias do mesmo alelo
heterozigotos: 1 cpia de cada alelo
haplide: 1 alelo
A
1
e A
2
p = freq(A1) e q = freq(A2)
p + q = 1
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Equilbrio de H&W
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Frequncias allicas
e frequncias genotpicas
Alelos A
1
e A
2
p = freq(A1)
q = freq(A2)
p + q = 1
Gentipos
A1A1 A
1
A
2
A
2
A
2
P H Q
P+ H + Q = 1
19
Locus Autossmico codominante com 2 alelos
20
Gentipo
A
1
A
1
A
1
A
2
A
2
A
2
Total
54 72 24 150
P= 54/150
= 0.36
H= 72/150
= 0.48
Q= 24/150
= 0.16
P+ H + Q = 1
Frequncias genotpicas (P, H, Q)
A1A1 A1A2 A2A2 (2 alelos; 3 gentipos = 3 fentipos
*
)
(
*
A1, branco; A2, vermelho A1A1, branco; A1A2, cor de rosa; A2A2, vermelho )
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Frequncias genotpicas e allicas
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11
Frequncias genotpicas e
frequncias allicas (gnicas)
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A1A1 A1A2 A2A2 Total
Gentipo 54 72 24 150
Alelos 2 x 54
= 108
2 x 72
= 144
2 x 24
= 48 300
Alelos A1 108 72 - 180
Alelos A2 - 72 48 120
Frequncia
A1 (p)
(108 + 72) / 300
= 0.6
Frequncia
A2 (q)
(72 + 48) / 300
= 0.4
22
A1A1 A1A2 A2A2 Total
Gentipo P H Q P+H+Q = 1
Alelos 2 P 2 H 2 Q 2 (P+H+Q)
Alelos A1 2 P H - 2 P + H
Alelos A2 - H 2 Q H + 2 Q
Frequncia A1
(p)
(2 P + H)/2=
= P + H
Frequncia A2
(q)
(H + 2 Q)/2 =
= Q + H
Frequncias genotpicas e
frequncias allicas (gnicas)
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23
AA Aa aa Total
Gentipo P H Q P+H+Q = 1
0,36 0,48 0,16
p = P + H = 0,36 + x 0,48 = 0,6
q = Q + H= 0,16 + x 0,48 = 0,4
p + q = 1
Frequncias genotpicas e
frequncias allicas (gnicas)
Frequncias genotpicas e
frequncias allicas
p + q = P + 1/2 H + 1/2 H + Q =1
codominncia contagem de genes
(determinao directa gentipos)
Frequncias genotpicas iguais
Frequncias gnicas iguais
Frequncias gnicas iguais
Frequncias genotpicas iguais
Populaes com as mesmas frequncias
allicas podem estar associadas a diferentes
frequncias genotpicas
24
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Frequncias genotpicas e allicas
Equilbrio de H&W
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13
25
Gentica das Populaes:
Lei de H&W
Questo
Porque ser que um alelo responsvel
por uma caracterstica dominante no
aumenta de frequncia at substituir na
populao o alelo de tipo selvagem
(wild-type)?
[Pergunta respondida por Hardy (1908) e
Weinberg]
26
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Frequncias genotpicas e allicas
Equilbrio de H&W
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14
Hardy and Weinberg
G H Hardy
(1877-1947)
Wilhelm Weinberg
(1862 1937)
Pool gentico estvel
(no evolui)
28
Pool
Gentico
A
A
E
A
D
C
A
A
C
A
E
A
E
B
A
E
A
A
C
A
A
E
A
B
B
A
C
A
A
C
A
A
C
E
A
A
D
B
E
D
A
D
A
E
D
A
E
B
A
A
A
C
D
E
A
Equilbrio de H&W
populao grande e no estratificada, com
acasalamentos ao acaso; e ausncia de
mutao, migrao e seleco significativas
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Equilbrio de H&W
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Acasalamento
Acasalamento ao acaso (no preferencial) - igual
probablidade de acasalamento (ou auto-fecundao)
ou panmixia
O acasalamento ao acaso para uma dada
caracterstica em populaes grandes e no-
estratificadas em sub-populaes
endogamia PANMIXIA exogamia
29
Alteraes no pool gentico
30
Mutao
Migrao
Seleco
Pool
Gentico
A
A
E
A
D
C
A
A
C
A
E
A
E
B
A
E
A
A
C
A
A
E
A
B
B
A
C
A
A
C
A
A
C
E
A
A
D
B
E
D
A
D
A
E
D
A
E
B
A
A
A
C
D
E
A
B
B
B
X
X
X
Z
Z
Z
Z
Z
Z
Z
Z
A
E
D
D
A
C
D
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Frequncias genotpicas e allicas
Equilbrio de H&W
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16
Lei de Hardy e Weinberg
Condies:
Se a populao for grande
Se os acasalamentos se fizerem ao acaso (para a
caracterstica em estudo) panmixia
Se no houver seleco, mutao ou migrao
As frequncias genticas (allicas e
genotpicas) permanecem constantes de
gerao para gerao
31
G.H. Hardy
(1877-1947)
Wilhelm Weinberg
(1862-1937)
1 Deduo da Lei de Hardy e Weinberg
(a partir frequncias genotpicas)
Frequncias genotpicas parentais

Frequncias allicas

Frequncias gamticas (= allicas)

Frequncias genotpicas nos zigotos

Frequncias allicas na gerao seguinte
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Frequncias genotpicas e allicas
Equilbrio de H&W
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17
Lei de Hardy e Weinberg
Formao dos gmetas:
Freq. genotpicas: AA Aa aa
(na gerao 0) P H Q
Frequncias allicas: A a
(na gerao 0) p(A)=P+1/2H q(a)=Q+1/2H
p+q=1
Freq. gamticas: A a
(na gerao 0) p(A)=P+1/2H q(a)=Q+1/2H
p+q=1
33
Unio dos gmetas (ao acaso):
34
Aa

Aa
A
p
a
q
A
p
AA
p
2
Aa
pq
a
q
Aa
pq
aa
q
2
Frequncias genotpicas: AA: p
2
Aa: 2pq aa: q
2
(na gerao 1) (P) (H) (Q)
Lei de Hardy e Weinberg
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Frequncias genotpicas e allicas
Equilbrio de H&W
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18
Frequncias allicas resultantes (gerao 1)
A: p
1
= P+1/2H = p
2
+pq = p(p+q) = p
a: q
1
= 1/2H+Q = pq+q
2
= q(p+q) = q
... aps uma gerao de acasalamento
ao acaso!
35
Lei de Hardy e Weinberg
2 Deduo da Lei de Hardy e Weinberg
(a partir frequncias acasalamentos)
36

AA
P
Aa
H
aa
Q
AA P P
2
PH PQ
Aa H PH H
2
HQ
aa Q PQ QH Q
2
Se a probabilidade de acasalamento for igual
para todos os indivduos (ao acaso), a frequncia
de encontros entre gentipos funo apenas
das frequncias desses gentipos na populao
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Frequncias genotpicas e allicas
Equilbrio de H&W
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Tipo de acasalamento e frequncias genotpicas na
gerao seguinte (descendncia)
37
Tipo de
acasalamento
(gera0 0)
Freq. Descendncia (gera0 1)
AA Aa aa
AA x AA P
2
P
2
- -
AA x Aa
Aa x AA
2PH PH PH
AA x aa
aa x AA
2PQ - 2PQ -
Aa x Aa H
2
H
2
H
2
H
2
Aa x aa
aa x Aa
2HQ - HQ HQ
aa x aa Q
2
- - Q
2
= (P+1/2H)
2
= 2 (P+1/2H)
(Q+1/2H)
= (Q+1/2H)
2
= p
2
= 2pq = q
2
Estabelece uma relao directa entre as
frequncias allicas e as frequncias genotpicas:
Partindo de frequncias allicas (p e q) e
genotpicas arbitrrias (P, H e Q), as frequncias
genotpicas esperadas, aps uma gerao de
acasalamento ao acaso, so
P = p
2
H = 2 p q Q = q
2
ou seja, so determinadas pelo produto das
frequncias allicas na gerao anterior!
38
Lei de Hardy e Weinberg
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Frequncias genotpicas e allicas
Equilbrio de H&W
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20
Equilbrio de H&W para
diferentes frequncias allicas
Curvas mostrando as
propores de
homozigotos AA,
homozigotos aa e
heterozigotos Aa, em
populaes em equilbrio
de H&W, para diferentes
frequncias allicas
Consequncias do equilbrio de Hardy
e Weinberg
Lei de H&W analisa o efeito da reproduo sexuada na
composio gentica de uma populao, ou seja, nas
frequncias allicas e genotpicas
A variao gentica existente na populao no se
perde como resultado da reproduo da populao
a variao gentica da populao conservada
indefinidamente (na ausncia de efeitos de seleco,
mutao e efeitos de amostragem)
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Frequncias genotpicas e allicas
Equilbrio de H&W
Carolina Lemos
21
O equilbrio de H&W um equilbrio indiferente: se por
qualquer razo, as frequncias allicas forem alteradas, o
equilbrio vai ser atingido com novas frequncias (desde que
as restantes condies se mantenham)
No equilbrio, a estrutura gentica relativa a um locus
autossmico com 2 alelos pode ser definida por um nico
parmetro p. Isto porque q = 1-p e as frequncias
genotpicas so derivadas das frequncias allicas.
apenas 1 grau de liberdade
Consequncias do equilbrio de Hardy
e Weinberg
Implicaes da lei de H & W
1. Uma populao em equilbrio de Hardy e Weinberg
no evolui, ou seja, a reproduo sexuada, por si s,
no garante a evoluo
2. Se a populao estiver em equilbrio de H&W, as
frequncias genotpicas dependem apenas das
frequncias allicas.
A frequncia de heterozigotos mxima (H=
0.5) quando p= q =0.5
Para frequncias allicas baixas, a maioria dos
alelos est nos heterozigotos
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Frequncias genotpicas e allicas
Equilbrio de H&W
Carolina Lemos
22
Implicaes da lei de H & W
3. No caso de um locus autossmico, as frequncias
no equilbrio so atingidas em apenas uma
gerao de acasalamentos ao acaso.
O facto de uma populao estar em equilbrio no
quer dizer que esteja ao abrigo de mutao,
migrao ou seleco, mas apenas que estas foras
no actuaram desde os ltimos acasalamentos ao
acaso.
Desvios do equilbrio de H & W
Os desvios em relao s propores esperadas
podem ser devidos a:
1. Acasalamento no ao acaso
2. Seleco actuou entre os acasalamentos e a
formao dos zigotos
3. A amostra no foi retirada de uma populao,
mas de uma mistura de duas populaes com
diferenas nas frequncias allicas (efeito de
Wahlund), o que implica uma reduo no nmero
de heterozigotos
4. A probabilidade de serem includos na amostra
diferente para os diferentes gentipos
44