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Loja, Ecuador

Julio 26 al 31, 2010

LA INGENIERA DE BIOPROCESOS
Fernando Mrida
Ingeniero Qumico, Universidad de San Carlos de Guatemala MSc. Ingeniera Qumica, Universidad de Puerto Rico

AGENDA
1. Introduccin y definiciones 2. Estructura y funcin celular 3. Base bioqumica 4. Enzimas y cintica enzimtica 5. Cintica de fermentacin 6. Bioseparaciones 7. Procesos bioqumicos industriales

Mdulo I: Introduccin y Definiciones

INTRODUCCIN

Ciencias biolgicas
Bioqumica - Ingeniera Bioqumica - Bioingeniera - Biotecnologa Ingeniera Qumica - Ing. Bioprocesos - Ing. Biolgica

Ciencias qumicas

Ingeniera

Mdulo I: Introduccin y Definiciones

INTRODUCCIN
Penicillium notatum

Bilogos + Ingenieros
Staphylococcus aureus

!1939: 1 ppm penicilina !Tanques sumergidos !1945: 100 mil pacientes/ao !Merck: Ing. Qumico + Microbilogo Produccin industrial de penicilina en la 2 guerra mundial !2000: 50 g/L penicilina

Ingeniero de Bioprocesos

Mdulo I: Introduccin y Definiciones

Mdulo I: Introduccin y Definiciones

Qumica Biologa

Qumica Bioqumica Microbiologa Diseo de Reactores

Ingeniera Qumica Ingeniera Mecnica Ingeniera Industrial

Operaciones Unitarias
(Extraccin, Filtracin, Centrifugacin)

Cromatografa Intercambio inico Seguridad Industrial Control de Produccin Diseo de Plantas Empaque

DEFINICIONES
Biotecnologa:

Mdulo I: Introduccin y Definiciones

Cualquier aplicacin tecnolgica que usa sistemas biolgicos, organismos vivos o derivados de ellos, para hacer o modificar productos o procesos para un uso especfico.

Aplicacin de los principios de Ingeniera para hacer frente a los retos en los campos de Biologa y Medicina. Ingeniera Biolgica: nfasis en plantas y animales

Bioingeniera:

Ingeniera Biomdica: Aplicacin de los principios y


tcnicas de ingeniera a los campos de la medicina. Brecha muy corta entre ingeniera y medicina

DEFINICIONES
Ingeniera Bioqumica:

Mdulo I: Introduccin y Definiciones

Rama de la Ingeniera Qumica o Ingeniera Biolgica que trata principalmente con el diseo y construccin de equipos que involucran organismos vivos y/o biomolculas.

Fusin entre biotechnologa y nanotecnologa. Uso de biomolculas para aplicaciones en nanotecnologa. Tecnologa sinttica basada en las rutas y principiios qumicos de los organismos vivos.

Bionanotecnologa:

Ingeniera de Bioprocesos: Rama de la Ingeniera


Bioqumica que adems incluye el trabajo de otras reas de la Ingeniera para el diseo y desarrollo de procesos basados en el uso de clulas vivas

MOTIVACIN
Qu hace un Ingeniero de Bioprocesos?

Mdulo I: Introduccin y Definiciones

!Investigacin para la Industria Farmacutica Alimentos Cosmticos Biocombustibles Pinturas Agricultura Investigacin aplicada
North Carolina Community College Systems

!Ing. Qumicos -Bioprocesos!Eva Nelly Rubio: Universidad de Puerto Rico, Biotecnologa Industrial.

!Vitaminas, antibiticos, queso, pan, vino, tinta, cosmticos, shampoo, pinturas, etc.

Mdulo II: Estructura y Funcin Celular

DIVERSIDAD BIOLGICA

Dominios Bacteria Archea Eukarya Protista Fungi

Reinos

Plantae

Animalia

Mdulo II: Estructura y Funcin Celular

Procariotas

Eucariotas

!0.5 3 m dimetro !Bacteria y Archea !Nucleoide !ADN circular en citoplasma !No organelos !Ejemplo: Escherichia coli

!5 20 m dimetro !Protista, fungi, plantae y animalia !Ncleo con membrana !ADN en ncleo y organelos !Organelos especializados !Ejemplo: S. cerevisiae

Insulina Humana

Bebidas Alcohlicas

Mdulo II: Estructura y Funcin Celular

Clulas eucariotas

Micrografa de un glbulo blanco humano, amplificada 40,500 veces (organelos en proyeccin)

Micrografa de la clula de una hoja de rbol, amplificada 14,000 veces (organelos proyectados)

Mdulo II: Estructura y Funcin Celular

Organelos Eucariotas
NCLEO: NUCLEOLO:
Material gentico (ADN) ! Cromosomas Sntesis de ribosomas y rARN
Rugoso Liso

RETCULO ENDOPLSMICO:

Complejo de membranas incrustadas en el citoplasma. Rugoso: Ribosomas en superficies interiores Liso: Sntesis de Lpidos

APARATO DE GOLGI: Secrecin de protenas y glicosilacin. Sistema de transporte de molculas LISOZOMAS: Vesculas. Reparacin organelos. RIBOSOMAS: Sntesis de protenas

Mdulo II: Estructura y Funcin Celular

Organelos Eucariotas (cont..)


MITOCONDRIAS: Respiracin celular y fosforilacin oxidativa. Tienen su propio ADN CENTRIOLOS: Pares cilndricos. Intervienen en la divisin celular. VACUOLAS: Digestin, regulacin osmtica y almacenamiento de desperdicios. pH acdico. CLOROPLASTOS: Rodeados por membrana. Sitios donde ocurre la fotosntesis. Tienen clorofila. MEMBRANA PLASMTICA: Formada por fosfolpidos. Permeabilidad selectiva PARED CELULAR: Capa rgida de peptidoglicano. No presente en animales y protistas

Mdulo II: Estructura y Funcin Celular

LOS VIRUS
!Agentes o partculas biolgicas !No son organismos vivos !No son clulas ni constan de ellas !Infectan clulas procariotas y eucariotas

Lisis celular Bacteria

Ensamblaje

Absorcin o fijacin

Replicacin del virus vegetativo

Inyeccin material gentico viral

ADN viral integrado al bacterial

Reproduccin de bateria lisognica

Mdulo II: Estructura y Funcin Celular

BACTERIAS EN LA INDUSTRIA
PRODUCCIN DE INSULINA HUMANA
Fermentacin
!Tanques sucesivos !Protena de fusin !Disrupcin celular !Centrifugacin !Lavado con agua

Aislamiento de protena Plegamiento de protena Purificacin y concentracin Cristalizacin y liofilizacin

!Solucin de urea !Cistena !Adsorcin/Desorcin !Propanol !Cromatografa doble !Cristalizacin !Re-disolucin !Re-cristalizacin !Secado por congelacin

Mdulo II: Estructura y Funcin Celular

FUNGI EN LA INDUSTRIA
PRODUCCIN DE CERV CERVEZA RV RVEZA
a) PREPARACIN DEL INCULO DE LEVADURA

Saccharomyces cerevisiae

b) PROCESO DE PRODUCCIN

Mdulo II: Estructura y Funcin Celular

ANIMALIA EN LA INDUSTRIA
PRODUCCIN DE VACUNA CONTRA INFLUENZA
Clulas MDCK: Clulas epiteliales de rin canino Clulas VERO: Clulas de rin de mono verde africano

!Cultivo de clulas MDCK en matraces !Escalamiento en botellas de lab. !Inculo: 2E5 cel/mL !Biorreactores de 5 a 20 L !Medio con nutrienets y microcarriers !Cultivo y lavado de clulas !Adicin de virus Instituto Max Planck (Alemania) !Produccin de la vacuna

Aventis Pasteur, Francia

Mdulo II: Estructura y Funcin Celular

VIRUS EN LA INDUSTRIA
PRODUCCIN DE SPRAY CON BACTERIFAGOS !Intralytix Inc: nica compaa aprobada por la FDA !Bacterifagos lticos !Seguridad alimenticia !Controles ambientales !Terapias en medicina veterinaria y medicina humana
!Uno de los virus utilizados para la erradicacin de E. coli O157:H7

!6 diferentes fagos !Listeria monocytogenes !Salchichas, jamones, etc. !Rociar directamente !Superficies de trabamo

!3 diferentes fagos !Escherichia coli O157:H7 !Salchichas, jamones, etc. !Solucin salina fosfatada

Mdulo III: Base Bioqumica

AMINOCIDOS
!Bloques constructores de protenas !Amino, Carboxilo y tomo de Hidrgeno !Residuo diferente en cada aminocido !Polaridad, ionizacin, aromaticidad o funcin especial
Curva de titulacin de lisina Enlace peptdico
!Slo L-aminocidos en protenas !D-aminocidos son raros (pared celular, celular antibiticos)

Hidrgeno

Amino

Residuo Carboxilo

!Zwitterion: Carga + y !Punto isoelctrico: Ninguna carga neta

Mdulo III: Base Bioqumica

AMINOCIDOS ESENCIALES
Glutamato: Mejorador de sabor

Aspartame: Mejorador de sabor

Arginina: Suplemento para deportistas

Mdulo III: Base Bioqumica

PROTENAS
!Polmeros hechos de aminocidos !Dos aminocidos: Dipptido !Tres aminocidos: Tripptido !Polipptido: Peso molecular <10,000 !Protena: PM>10,000 (miles de aminocidos)
Dipptido Nonapptido Protena

Funciones: Catlisis,
defensa, transporte, movilidad y regulacin

Aspartame: Fenilalanina y Acido Asprtico (metil-ester) Oxitocina Hemoglobina

Mdulo III: Base Bioqumica

PROTENAS: Estructura
Primaria: Secuencia lineal de los
aminocidos

Secundaria:

Extensin de la cadena. Resultado de puentes de Hidrgeno entre los residuos cercanos. Pueden formar lminas plegables y hlices

Terciaria: Interacciones entre los


residuos ms separados que hacen que las cadenas de aminocidos se doblen (covalente, disulfuro, H, hidrofbicas, hidroflicas)

Cuaternaria: Ms de una cadena


polipeptdica (subunidad) y las interacciones entre ellas.

Mdulo III: Base Bioqumica

CARBOHIDRATOS
MONOSACRIDOS: Los ms simples. !Almacenamiento de energa y estructura Contienen de 3 a 9 carbonos !C:H:O ! 1:2:1 Frmula: (CH2O)n
Ismeros estructurales y pticos

!Origen: Fotosntesis en plantas y algas

C6H12O6

Glucosa: El ms importante monosacrido y el ms abundante en los sistemas vivos.

Mdulo III: Base Bioqumica

CARBOHIDRATOS (cont..)
DISACRIDOS: Condensacin de dos
monosacridos formando enlace !-1,4glicosdico.

POLISACRIDOS: Ms de dos
monosacridos formando enlace glicosdico tipo !-1,4

Bio-polisacridos importantes Amilosa

Celulosa Amilopectina

Mdulo III: Base Bioqumica

LPIDOS
!Insolubles en ambientes acuosos !Presentes en membrana plasmtica celular !Mayores componentes: cidos grasos
Esteroides

Triglicridos

Fosfolpidos

Mdulo III: Base Bioqumica

CIDOS NUCLICOS
NUCLOTIDO Estructura tridimensional
Puentes de hidrgeno entre pares de !Enlace fosfodister bases nitrogenadas !C-5 ! C-3 en azucar

!Nucleosido: Nucletido sin el fosfato

Mdulo III: Base Bioqumica

CIDOS NUCLICOS (cont..)


CIDO RIBONUCLICO (ARN) CIDO DESOXIRIBONUCLICO (ADN)

!Formado por transcripcin de ADN !Sntesis de peptidos y protenas !Molcula larga no ramificada !ARN en clula es 6 veces ADN !Varias especies de ARN: t, m, n

!Estructura 3D en doble hlice !Bases nitrogenadas: Info gentica !Dimetro de hlice: 2 nm !Adenina se une siempre a Timina !Guanina se une siempre a Citosina

Mdulo III: Base Bioqumica

REPLICACIN DEL ADN


Mecanismo por el cual una molcula de ADN se duplica, creando copias idnticas de la molcula original

Mdulo IV: Enzimas y cintica enzimtica

QUE SON LAS ENZIMAS?


!Protenas de alto peso molecular (15000 millones) !Catalizan sustratos especficos sin consumirse !Sitios activos donde se forma complejo enzima-sustrato !Adicin del sufijo asa al final del sustrato

El modelo llave-y-cerradura

k1

+ E + S

k2

ES

Mdulo IV: Enzimas y cintica enzimtica

ENZIMAS
!HOLOENZIMAS: Apoenzima + Co-factor
Protena con ms de una subunidad polipeptdica

Zinc: Cofactor

Anhidrasa carbnica

!ISOZIMAS: Forma molecular distinta pero catalizan la misma reaccin

Glucoquinasa

Glucosa

Hexoquinasa

Mdulo IV: Enzimas y cintica enzimtica

ENZIMAS (cont..)
Fosforilacin de glucosa por hexoquinasa
1. Oxidoreductasas: Transf de electrones. Ej. Alcohol deshidrogenasa Transf grupos funcionales Ej. Glucoquinasa Reacciones de hidrlisis Ej. Sacarasa Adicin o eliminacin de grupos para formar o romper doblesenlaces. Ej. Piruvato descarboxilasa Reacc. de isomerizacin Ej. Glucosa isomerasa Formacin de enlaces C-C, C-S, C-O, C-N Ej. DNA polimerasa

2. Transferasas:

3. Hidrolasas:

Primera reaccin de la ruta metablica Gluclisis

4. Liasas:

5. Isomerasas:

6. Ligasas:
Cambio de conformacin de la enzima (Se cierra hacia los lados)

Mdulo IV: Enzimas y cintica enzimtica

CINTICA ENZIMTICA

E + S

k1 k-1

ES

k2

E + P

Postulados:
!Sustrato limita la velocidad de reaccin ![S] bajas ! V aumenta linealmente ![S] altas ! V aumenta muy lentamente !Vo nunca llega a su valor mximo !Km: Valor al cual Vo es ! de su mximo Constante de Michaelis-Menten

[S]: Concentracin de sustrato V: Velocidad de reaccin Vm: Velocidad mxima de reaccin Km: Constante de saturacin

Mdulo IV: Enzimas y cintica enzimtica

DERIVACIN DE LA ECUACIN DE M-M


[ES] no se puede medir

Tasa de variacin del complejo ES:

Asuncin del estado cuasiestacionario:


En un reactor batch, a t=0 [Eo] es tan pequea, por lo que d[ES]/dt"0

Asuncin de equilibrio rpido:


Constante de equilibrio:

Mdulo IV: Enzimas y cintica enzimtica

DERIVACIN DE LA ECUACIN DE M-M (opc b)


[ES] no se puede medir

Paso 1: Anlisis del complejo enzima-sustrato Velocidad de formacin de [ES] = Velocidad de ruptura de [ES] = Paso 2: Equilibrio rpido

Paso 4: Vo en funcin de [ES]

Vmax ! Enzima saturada [ES] = ET ! Vmax=k2[ET]

Paso 3: Resolver para [ES]

Km: [S] a la cual Vo es la mitad de Vmax.

Mdulo IV: Enzimas y cintica enzimtica

PARMETROS CINTICOS
El plot del doble-recproco

Grfico de Lineweaver-Burk
y = m x + b

VENTAJAS Y LIMITACIONES DEL MTODO !Buena estimacin para Vm !No es la mejor estimacin para Km !Se basa en mediciones a concentraciones bajas de sustrato: No es tan exacto

Mdulo IV: Enzimas y cintica enzimtica

PARMETROS CINTICOS (continuacin)


Eadie-Hofstee Hanes-Woolf Cintica Batch

!Se usa cuando no hay varios experimentos batch a diferentes [S]

Km es funcin de T y pH

y=

b +

m x

y=

b +

m x

Vmax es funcin de k2 y de [Eo]

!Errores ambos lados contienen Vo: !Menos desviaciones a bajas [S]

!El mtodo ms usado para determinar Vmax con mayor exactitud

Mdulo IV: Enzimas y cintica enzimtica

SUMARIO DE Km y Vmax
"!Km da una idea del rango de [S] al cual la reaccin ocurre. Mientras ms alta sea Km, ms dbil ser la anidad del sustrato para unirse a la enzima.! "!Vmax da una idea de qu tan rpido ocurre la reaccin bajo circunstancias ideales.! "!k2 / Km da una idea prctica de la eciencia cataltica, por ejemplo, qu tan a menudo una molcula de sustrato que est unida, reacciona para dar productos.!

Mdulo IV: Enzimas y cintica enzimtica

INHIBICIN ENZIMTICA
COMPETITIVA NO COMPETITIVA UNCOMPETITIVA

Mdulo IV: Enzimas y cintica enzimtica

MODELOS COMPLEJOS
Inhibicin competitiva Inhibicin No competitiva
Vm,ap Km,ap
!Incremento en Km,ap !Reducc de velocidad !Solucin: Alta [S]

Inhibicin Uncompetitiva

Km,ap
!Reduccin en Vm !Reducc de velocidad !Alta [S] no es solucin !Reducc en Vm y Km

ENZIMAS ALOSTRICAS
Determinacin de n:

n = Coef de cooperatividad

m x

Mdulo IV: Enzimas y cintica enzimtica

EFECTOS DE pH & T
VARIACIONES DE pH
!Grupos inicos en sitios activos !Cambios en actividad de enzima !El sustrato tambin puede ionizarse
E- + H+ K2 EH + S Km EHS k2 EH + PZ

VARIACIONES DE TEMPERATURA
!Grupos inicos en sitios activos !Cambios en actividad de enzima !El sustrato tambin puede ionizarse

+
H+ K1 EH+2

Desnaturalizacin

Aumento de 30C a 40C


!Aumenta 1.8 veces actividad enzimtica !Aumenta 41 veces la desnaturalizaci{on

EJERCICIO DE CINTICA ENZIMTICA

Mdulo IV: Enzimas y cintica enzimtica

ENZIMAS INMOVILIZADAS

!Restriccin de la enzima en un espacio cerrado !Reutilizacin de la enzima (Ahorro) !Recrear reacciones enzimticas biolgicas !Eliminar etapa de purificacin !La cintica enzimtica cambia por los efectos de difusin

Mdulo IV: Enzimas y cintica enzimtica

ENZIMAS INMOVILIZADAS -AplicacionesAplicacin


Jarabe de maz alto en fructosa Industria de vinos y jugo de frutas Edulcorantes Aceite de palma

Sustrato
Glucosa

Enzima
Glucosa isomerasa #-glucosidasa Termolisina Lipasa

Producto
Isomerizacin de glucosa a fructosa Monoterpenos Aspartame Aceites ms ligeros

Terpenos cido Asprtico Triglicridos

Bio-sensores

Mdulo IV: Enzimas y cintica enzimtica

BIOENERGTICA
Catabolismo: Degradacin de una molcula compleja a una ms simple. Produce energa

Anabolismo: Sntesis de molculas complejas a partir de una ms simple. Requiere energa.

Almacenamiento y transferencia de energa

Intercambio de electrones e hidronios en la produccin de energa

Mdulo IV: Enzimas y cintica enzimtica

RUTAS METABLICAS
Secuencia de reacciones bioqumicas, catalizadas eficientemente por una enzima especfica.
Catabolismo aerbico de glucosa
1.! Gluclisis o Ruta Embden-Meyerhof-Parnas (EMP) 2.! Ciclo de Krebs (Ciclo del cido ctrico o TCA) 3.! Fosforilacin oxidativa o Respiracin

Otras rutas
! Gluconeognsis (mas o menos lo contrario a Gluclisis) ! Fotosntesis

Mdulo IV: Enzimas y cintica enzimtica

GLUCLISIS

Reaccin General de la Gluclisis:

Mdulo V: Crecimiento microbiano y fermentacin

Macronutrientes:
Concentraciones mayores de 10-4 M !Carbono ! Fotosntesis, azcares, molculas orgnicas
!Nitrgeno ! Amonio, urea, aminocidos, protena !Oxgeno ! O2 o aire !Hdrgeno ! Carbohidratos !Fsforo ! Fosfatos inorgnicos

Micronutrientes:
Concentraciones menores de 10-4 M (elementos traza) !Fe, Zn, Mn ! Cofactores de enzimas intracelulares
!Cu, Co, Mo, Ca, Na, Cl, Ni, Se ! Cofactores !B, Al, Si, Cr, V, Sn, Be, F, Ti, Ga, Ge, Br, Zr, W, Li, I ! son raramente requeridos. (Txicos a ms de 10-4 M ) !Vitaminas y hormonas

Mdulo V: Crecimiento microbiano y fermentacin

Substratos + clulas ! productos extracelulares + ms clulas

!Sustratos !Prod. Secund

!S + X

!P + nX
Substrato P1 P2

!Temperatura !pH !Aereacin ![S]

ESTRUCTURADO:

Representacin celular multicomponente

NO ESTRUCTURADO: Representacin celular como un solo componente Asume: Crecimiento balanceado

SEGREGADO: Clulas heterogneas discretas NO SEGREGADO: Propiedades celulares en promedio

No Estructurado

Estructurado

No segregado
COMPLEJIDAD

Soluto de un solo componente Caso + idealizado Un solo componente, Clulas heterog e individuales REALIDAD

Promedio celular multicomponente Heterogeneidad multicomponente clula a clula Caso real

Segregado

Mdulo V: Crecimiento microbiano y fermentacin

Hemocitmetro

Conteo en plato

Contador de partculas

Citometro de flujo

Mtodo gravimtrico

Volmen de clulas empacadas

Densidad ptica

Mdulo V: Crecimiento microbiano y fermentacin

!OD no discrimina entre clulas viables y no viables !Inculo pobre ! Fase de adaptacin larga !Inculo: 10% del volumen total de fermentacin

Fase Exponencial

Fase Estacionaria

Fase de Muerte

Velocidad especfica de crecimiento celular

Cte. de metabolismo endgeno

Cte. de muerte celular

Mdulo V: Crecimiento microbiano y fermentacin

!No estructurado No segregado !Dependencia de un nico sustrato !El sustrato limita velocidad de X !Cintica de saturacin !Similar a Michaelis Menten

Un nico sistema enzimtico controla el consumo del sustrato


max: Velocidad mxima especfica dd de crecimiento celular g = max cuando [S] >> KS KS: Constante de saturacin g = ! max cuando [S] = KS

max: Tipo de organismo, depende ffffffff de pH y T KS: Naturaleza del substrato

Mdulo V: Crecimiento microbiano y fermentacin

-!Regresion exp -!Pendiente: g -!net = g - kd y = b + m x

Plot Lineweaver-Burk Varios experimentos batch para diferentes concentraciones de sustrato

Inhibicin por substrato

Inhibicin por producto

Inhibicin por toxicidad

Mdulo V: Crecimiento microbiano y fermentacin

Substrato 2

!Interacciones entre subcomponentes celulares. !Algunos se enfocan en un crecimiento no balanceado

Substrato 1

Modelo Ciberntico

Cintica aditiva de Monod:

!Aproximacin muy simple !Pobre cuantificacin !No toman en cuenta la dinmica intracelular

Mdulo V: Crecimiento microbiano y fermentacin

!Simultneamente con el crecimiento celular !Formacin es directamente proporcional a g!Ejemplo: Produccin de etanol

!Resultado de mantenimiento intracelular !Toma lugar en la etapa estacionaria, donde g=0 !Ejemplo: Metabolitos secundarios, antibiticos

!Etapa estacionaria o previa a ella !Ejemplo: cido Lctico, Xantanos, Metabolitos secundarios

Mdulo V: Crecimiento microbiano y fermentacin

TEMPERATURA
! disminuye por encima de la T optima ! se duplica aprox a cada $T=10C !Afecta tambin formacin de producto

pH
!pH ptimo para cada tipo de clula !Fluctuacin aceptable de pH 1 a 2 !Cercano a 7.00 !Control importante por medio de buffers

Oxgeno disuelto
!Fermentacines aerbicas !Baja solubilidad de O2 !Concentracin depende de agitacin !Velocidad de transferencia !Velocidad de consumo

Mdulo V: Crecimiento microbiano y fermentacin

Frmula celular
Un mol de material biolgico se define como la cantidad que contiene 1 gramo-tomo de C, por ejemplo CH1.8O0.5N0.2

Conversin de sustratos a biomasa

Carbohidrato

Material celular

Composicin de E. coli (92% de su masa seca)

Balances molares

Mdulo V: Crecimiento microbiano y fermentacin

Reflejan la cantidad de producto (P) clulas (X) formadas por unidad de substrato (S) consumido por las clulas. $S = $S(clulas) + $S(producto) + $S(energia) + $S(mantenim)

Molar
YX/S = mol C-equiv en cel producidas mol-C equiv en subs consumido = 1

Msico
YX/S = masa cel producidas masa subs consum = -$X

!
%

$S
= -$P

YP/S = mol C-equiv en prod acumulado = mol-C equiv en subs consumido

YP/S = masa prod acumulado masa subs consum

!
%

$S

YP/X = mol C-equiv en prod acumulado = mol-C equiv en cel producidas

YP/X = masa prod acumulado masa cel produc

$P

$X

Mdulo V: Crecimiento microbiano y fermentacin

DETERMINACIN GRFICA DE COEFICIENTES TOTALES

Mdulo V: Crecimiento microbiano y fermentacin

Proceso catablico de oxidacin incompleta total o casi totalmente anaerbico, cuyo producto final es un compuesto orgnico

Mdulo V: Crecimiento microbiano y fermentacin

In + Generation = Out + Accumulation

Clulas
Muerte celular

Substrato
Formacin de producto Crecimiento celular Mantenimiento

Producto
Asociado a crecimiento

@ t = 0, X(0) = Xo

@ t = 0, S(0) = Xo

@ t = 0, P(0) = Po

Mdulo V: Crecimiento microbiano y fermentacin

!Predecir el comportamiento de X, S, P !Optimizacin !Control del proceso y diseo de plantas Sistema diferencial no lineal de primer orden

Resolucin del sistema por mtodos numricos, por ejemplo, Runge-Kutta 4 orden

Simulacin de la fermentacin de glucosa con S. cerevisiae

Mdulo V: Crecimiento microbiano y fermentacin

-Yeast Y ! Yeast east Extract: -!Peptone: -!Malt Extract: -!MgSO4: -!(NH4)2SO4: -!KH2PO4: -!Sugar: pH=5.5

3 5 3 2 3 2 25

Inoculacin en varias etapas T = 32C 200 rpm

10% v/v del Volumen total

HPLC

YSI

Cells

V = 800 mL T = 32C 100 115 rpm pH=5.5 Hasta agotamiento de azucar

Medio Cultivo

Cultivo semilla

Inoculacin

Fermentacin

Anlisis

Modelaje

Mdulo V: Crecimiento microbiano y fermentacin

Entrada - Salida + Generac Consumo = Acumulacin Tasa de Dilucin (D) D = Fv / V ! Recproco del tiempo de residencia

Clulas
!Clulas removidas a la misma tasa que su crecimiento !Velocidad de crecimiento celular = Tasa de Dilucin !Manipulacin de g como un parmetro independiente

Si se impone un factor de dilucin D > max, las clulas no se podrn reproducir lo suficientemente rpido para mantenerse. Por lo tanto se lavan o el quimiostato se vaca (washout)

Mdulo V: Crecimiento microbiano y fermentacin

Substrato
Entrada - Salida + Generac Consumo = Acumulacin

Producto
Entrada - Salida + Generac Consumo = Acumulacin

Recordar que:

A diferencia del sistema batch, las ecuaciones que representan X, S y P ahora son algebricas, lo que hace ms facil la resolucin del sistema y su correspondiente simulacin matemtica.

Mdulo V: Crecimiento microbiano y fermentacin

Si aplica el modelo de Monod, despreciando metabolismo endgeno y formacin de productos extracelulares, la productividad ser el factor de dilucin por la concentracin de clulas: DX

Dilucin que maximiza la produccin de clulas se obtiene derivando DX respecto a D y luego igualar a cero: !Ks<<So ! Dop(X) se convierte en D=max !D=max sucede en el punto de wash-out !Usualmente D es menor que Dop(X) ya que es dificil lograr D=max

Mdulo V: Crecimiento microbiano y fermentacin

!Adicin de nutrientes frescos !Reduce inhibicin por substrato !El volumen no es constante en toda la operacin !Habr concentraciones iniciales, intermedias y finales Etapa 1: (Carga)

Al finalizar etapa 1 S<<So y Xo<<Xmax


Etapa 2: (Realimentacin)
Ecuacin para el cambio de volumen

Porque el substrato se consume casi todo

D " porque V #, va disminuyendo continuamente

Mdulo V: Crecimiento microbiano y fermentacin

Etapa 1:

Variacin de las concentraciones, velocidad de crecimiento y volumen en funcin del tiempo para el primer ciclo de un fed-batch

Etapa 2: Realimentacin

Mdulo VI: Biorreactores

Cultivo Batch
1." Preparacin: Limpieza, proceso de esterilizacin, llenado. 2." Sembrado: Inoculacin y perodo de induccin. 3." Crecimiento exponencial 4." Recuperacin de producto
Tiempo ciclo para completar ciclo batch

Cultivo Continuo
! Esterilizacin continua ! Suspensin celular se retira a la misma tasa que la alimentacin de nutrientes ! Volumen se mantiene constante
Concentracin celular ptima:

Productividad ptima: Total cel producidas

Veloc. produccin de biomasa

Mdulo VI: Biorreactores

Proporcin entre velocidades de formacin de clulas


Procesos con E. coli:
!Xm/Xo=20 !tl=5 h !max=1.0 h-1 !Proporcin = 8

Usualmente, Xm/Xo es 10 20

Por qu la mayora son procesos batch?


!La productividad de productos secundarios supera a la de un quimiostato. !Inestabilidad gentica: Quimiostato impone seleccin severa. !Operabilidad y confiabilidad: Cualquier falla en un quimiostato es ms grave y las prdidas son mayores. !Economa: Procesos que requieren pequeas cantidades con demanda dificil de proyectar. El mismo reactor puede usarse para distintos productos

Mdulo VI: Biorreactores

SISTEMAS BATCH
!Etanol celulsico !Antibiticos !Insulina a partir de Escherichia coli !Cerveza !Extracto de levadura (fed-batch) !Acetona-Butanol a partir de C. acetobuylicum

Gases

SISTEMAS CONTINUOS
!Protenas !Procesos con enzimas inmovilizadas !Etanol !Productos a gran escala: cido Lctico

Mdulo VI: Biorreactores

Por qu reciclar clulas? !Incremento de productividad y estabilidad !Minimizacin de efluentes


!:Relacin de reciclo basada en caudales volumtricos c: Factor de concentracin de la relacin de concentracin celular (reciclo/salida) Separador de clulas: Filtracin, centrifugacin o sedimentacin

Balance de clulas
ENTRADA SALIDA + GENERACIN CONSUMO = ACUMULACIN

Mdulo VI: Biorreactores

Balance de substrato
ENTRADA SALIDA + GENERACIN CONSUMO = ACUMULACIN

Dividiendo entre V y con un poco de lgebra:

Dado que:

Usando Monod:

Despejando S:

Mdulo VI: Biorreactores

!Separar crecimiento celular y formacin de productos. !Produccin de metabolitos secundarios, por ejemplo antibiticos. !Fijar diferente pH, T, concentracin de nutrientes, etc en cada uno de los tanques. !Crecimiento desbalanceado: Modelo no estructurado no es el ms apropiado
Ejemplo tpico: Cultivo de clulas modificadas genticamente Primer quimiostato: Produccin de clulas sin promotor Segundo quimiostato: Produccin de la protena (agregando el promotor)

Mdulo VI: Biorreactores

Primer quimiostato

Segundo quimiostato Balance celular: Balance de substrato:

X1/X2 < 1 y 2 < D2

D2 = F/V2 y 2 = (maxS 2 /Ks+S 2)

Mdulo VI: Biorreactores

INMOVILIZACIN CELULAR
!Altas concentraciones celulares !Re-utilizacin celular !Elimina el problema de wash-out a altos D !Altas productividades volumtricas !Minimiza dao celular por esfuerzo cortante Inmovilizacin activa: Fuerzas fsicas y/o qumicas
Atrapamiento en matrices
!Agar !Alginato !Carragenina !Pliacrilamida !Quitosano !Gelatina !Colageno
Cscara de naranja con S. cerevisiae

Cscara de naranja

Encapsulacin

Matrices porosas

Material de la cpsula

!Nylon !Colodin !Poliestireno !Acrilato !Acetato de Celulosa !Polister

Mdulo VI: Biorreactores

Ligamiento a soporte

ADSORCIN: ! Contacto directo entre nutrientes y el material de soporte. !Obtencin de altas cargas celulares ! Proporcin recomendada de dimetros poro/clula: 4 a 5

Soportes

!Vidrio poroso !Slica porosa !Alumina !Gelatina !Carbn activo !Biruta de madera !Resinas de Int. Ionico

Unin covalente !Ms fuerte que la adsorcin: Mas estable ! Necesita un soporte que sea rgido, qumicamente inerte y unir a las clulas firmemente.
!Aldehdos !Aminas !Grupos epoxi !Grupos halocarbonilo !xido de zinc !xido de titanio

Soportes

Mdulo VI: Biorreactores

1. Biorreactores con agitacin mecnica interna


!Clsico CSTR batch o quimiostato !Altos coeficientes de transf de masa !Proporcin de altura-dimetro: 2 3 !Volumen de trabajo: 75% vol total !Flujo axial y radial, y uso de baffles !Desventaja: Formacin de espuma
Produccin de etanol

2. Columnas de burbujas
!Fluidos newtonianos de baja viscosidad !Mejor transferencia de oxgeno !Ambiente con bajo esfuerzo cortante !Desventaja: Coalescencia de burbujas !Desventaja: Rango estrecho flujo de gas.
Produccin de extracto de levadura

Mdulo VI: Biorreactores

3. Biorreactores Loop
!El mezclado y la circulacin de lquido es inducido por la inyeccin de un gas, una bomba mecnica o ambos. !El ms comn: air-lift !Fludos viscosos, no coalescencia !Creacin de microburbujas
Produccin de etanol celulsico

4. Biorreactores Trickle-bed
!Reactores donde coexisten las 3 fases !Lecho empacado de catalizador y un gas esparcindose en el lquido !Alta rea de superficie en el lecho !Fciles de construir !Deventaja: Baja utilizacin del catalizador
!Tratamiento de aguas !Elaboracin de vinagre

Mdulo VI: Biorreactores

VENTAJAS: !Reduccin de contaminacin !Volumen pequeo = Reducc. costos !Fcil separacin de productos !Eficiencia energtica DESVENTAJAS: !Naturaleza heterognea de la mezcla !Pobre control de pH, oxgeno, T

PRODUCTOS PRINCIPALES: !Salsa soya !Miso (arroz y soya) !Hamanatto (soya y trigo) !Enzimas (A. oryzae)

Biorreactor rotatorio para alimentos fermentados

Mdulo VI: Biorreactores

Singularidades: !Tamao grande


!Lento crecimiento !Sensibles a esfuerzo cortante !Concentracin de productos en g/L
REACTORES UTILIZADOS: !CSTR modificado (10 40 rpm) !Lecho fluido y lecho empacado con clulas inmovilizadas por atrapamiento y encapsulacin !Reactores de burbujas y air-lift !Reactores desechables

Requerimientos del biorreactor:


!Levemente agitado y aereado !Riguroso control de pH, T, pO, CO2 !Material de soporte para el anclaje !Remocin amonio y lactato (txicos)

Mdulo VII: Purificacin de productos

!Downstream es el conjunto de etapas del bioprocesamiento industrial que sigue a la fermentacin. !Estas etapas varan dependiendo del producto final

1." Separacin de productos insolubles 2." Aislamiento primario 3." Purificacin 4." Producto final

Mdulo VII: Purificacin de productos

a) Coagulacin y Floculacin
Coagulacin: Formacin de pequeos flculos a partir de coloides. Coagulantes: cidos, Bases, iones multivalentes, carbn activado.

Floculacin: Aglomeracin de los flculos en agregados ms grandes. Floculantes: CaCl2 y otros polielectrolitos

b) Filtracin
!El mtodo ms costo-efectivo para separacin !Filtros rotatorios de vaco, los ms utilizados !Separacin de micelios en produccin de antibiticos !Filtracin cruzada se usa con bacterias y levaduras

c) Centrifugacin
!Separacin de partculas 0.1-100 m por accin de fuerza centrfuga. !Flujo del medio de fermentacin es el parmetro ms importante

Mdulo VII: Purificacin de productos

!Cuando el producto deseado es intracelular las clulas necesitan someterse a la ruptura de su membrana (y pared, si aplica) Mtodos mecnicos
Vibracin ultrasnica !Usados para bacterias (pared celular) !Ruptura de bacilos mayor que cocos !No efectivo para hongos !Desventaja: Desnaturalizacin

Mtodos no mecnicos
!Shock osmtico !Ruptura con cristales de hielo !Shock trmico !Liofilizacin despus de tratamiento qumico (acetona, butanol y buffers. !Lisozima: pared celular de bacterias gram-positivas !Productos liberados pueden oxidarse con el aire!! ! Agregar agente reductor con agente quelante (EDTA) !Asepsia rigurosa!!!

Homogenizadores con perlas !2000 kg/h ! 340 dw/h levadura !Las perlas rompen a las clulas !Mejor control de la temperatura

Mdulo VII: Purificacin de productos

!Productos se degradan con la temperatura !Asepsia durante todo el proceso de downstream !Concentraciones altas (productos de alta pureza) Extraccin Lquido-Lquido
! Acetato de amilo o isoamilo como solvente extractor ! Extraccin a T ambiente ! Solvente: No txico, selectivo, barato, inmisicible con el caldo ! Aplicacin: Antibiticos ! Separacin posterior: Centrifugacin o Decantacin

Precipitacin
Precipitar protenas ! ! Adicin de sales inorgnicas Adicin de solventes orgnicos a baja temperatura Desventaja: Solventes pueden causar desnaturalizacin de protenas.

Mdulo VII: Purificacin de productos

Adsorcin
! Fsica: Fuerzas Van der Waals ! Qumica: Inicos fuertes ! Resinas intercambio inico ! Lecho empacado, lecho fluido

Membranas
! Dilisis ! Osmosis Inversa ! Ultrafiltracin ! Microfiltracin

Electroforesis
! Separacin de biomolculas segn su tamao y carga. ! Matriz de gel poliacrilamida ! Protenas cubiertas con surfactante aninico ! Deteccin por tintura

Mdulo VII: Purificacin de productos

Separacin de mezclas en sus componentes puros, utilizando una fase mvil y una fase estacionaria. Cromatografa de Elucin

!Componentes o solutos eluyen a distintos tiempos

Mdulo VII: Purificacin de productos

Cristalizacin

!Bajas temperaturas !Minimiza degradacin trmica !Bajo costo en equipo !Factores de separacin altos !Cristales de alta pureza

Cristalizador Nutsche

Secado

!Remocin del solvente utilizado !Producto sensitivo al calor !% humedad final !Parmetros que afectan el secado: a) Propiedades fsicas b) Propiedades del soluto c) Condiciones del secado d) Parmetros de transf de calor
Liofilizador

Secador de bandejas al vaco

BIOETANOL CAA DE AZCAR


Melaza
!Subproducto de industria azucarera !Rica en hexosas y sacarosa

Mdulo VIII: Bioprocesos Industriales

!Saccharomyces cerevisiae !Fermenta hexosas y disacridos como la sacarosa

BIOETANOL MAZ

Mdulo VIII: Bioprocesos Industriales

PRODUCTOS ALMIDONCEOS

!Un paso extra: Hidrlisis de los enlaces en amilosa y amilopectina. !Actualmente el proceso que produce la mayor cantidad de etanol en el mundo

BIOETANOL LIGNOCELULOSA

Mdulo VIII: Bioprocesos Industriales

Celulosa

Hemicelulosa
Pichia stipitis

Lignina
Pichia stipitis

BIODIESEL DE MICROALGAS
Ventajas del proceso
Chlorella vulgaris

Mdulo VIII: Bioprocesos Industriales

!No compite por utilizacin de espacio !Ms del 70% de biomasa utilizable !Buen reemplazo para soya y canola !Abundancia de especies celulares !No contamina el ambiente

Reactores usados

Reaccin de Esterificacin

Estanques abiertos

Fotobiorreactores tubulares

Extraccin de los aceites con un solvente

SINGLE CELL PROTEIN

Mdulo VIII: Bioprocesos Industriales

Mezcla de protenas (o clulas secas) extradas de cultivos puros o mezclados de algas, levaduras, bacterias u hongos, y son usados para suplementos alimenticios humanos o para animales Substratos utilizados
!Hidrocarburos lquidos y gaseosos !Alcoholes !Productos de desecho: Plantas, madera, almidones, lcteos, etc.

Microorganismos utilizados

Desventaja principal:
!Acumulacin de cidos nuclicos

BIOETANOL

Mdulo VIII: Bioprocesos Industriales

BIOETANOL

Mdulo VIII: Bioprocesos Industriales

BIOETANOL

Mdulo VIII: Bioprocesos Industriales

BIOETANOL

Mdulo VIII: Bioprocesos Industriales

BIOETANOL

Mdulo VIII: Bioprocesos Industriales

BIOETANOL

Mdulo VIII: Bioprocesos Industriales

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Mdulo VIII: Bioprocesos Industriales

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