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Departamento de Ciencias Profesora Vernica Fonseca Biologa.

Gua de Trabajo 4Medio Transcripcin Nombre:_________________________________________ Fecha:_____________ Habilidades: Comprender, Identificar, Interpretar, Describir, Determinar on!enido: Transcripcin del ADN

T"#N$ "%& %'N ( &") *$) &)$T+ T"#N$ "%& %)N#, Ya conocemos la estructura del ADN y sus componentes, junto con el concepto de gen y cmo la expresin de stos se relaciona con la s ntesis de las prote nas !ue componen el fenotipo de un indi"iduo, en la forma de un flujo de informacin !ue puede ser expresado mediante el siguiente es!uema general#

$abemos tambin !ue el ADN y los ribosomas, org%nulos encargados de la s ntesis proteica, se encuentran separados en dos compartimientos celulares independientes, por lo !ue las instrucciones contenidas en el ADN son copiadas en una molcula mensajera !ue pueda ser transportada al citoplasma celular y entregar la informacin de la secuencia proteica a los ribosomas& 'sta molcula es el A(N mensajero, y la copia de informacin de ADN a A(Nm recibe el nombre de transcripcin& (ecordar !ue adem%s del A(Nm existe el A(Nt y A(Nr !ue si bien cumplen otras funciones, tambin son producidos en el proceso de transcripcin, en este caso nos centraremos en el A(Nm ya !ue es el !ue forma parte del flujo de informacin& T"#N$ "%& %'N 'ste proceso, como sucede generalmente en el %mbito biolgico, es resultado de la interaccin, espec fica y coordinada, de una serie de elementos )eterogneos, !ue trabajando de forma conjunta logran producir una acti"idad biolgica determinada&

*ara la transcripcin necesitamos los siguientes elementos# + Hebra molde de #-N !ue determine un gen espec fico + #"N polimerasa + Fac!ores de !ranscripcin + Nucle!idos ,a cadena o )ebra de ADN molde, como su nombre lo dice, sir"e de molde en base al cu%l ser% generada la cadena de A(N& 'n el contexto de la transcripcin, aparte de la secuencia !ue determina el gen !ue se ser% transcrito, debemos considerar otras secuencias anexas, !ue si bien, no son parte del mensaje, son "itales para !ue la interaccin entre los elementos, de la !ue )abl%bamos anteriormente, pueda ocurrir& 'l gen, m%s estas secuencias anexas pueden ser representadas de la siguiente forma#

-n buen obser"ador, notar% dos cosas importantes# en la imagen slo se muestra una de las dos cadenas !ue componen la molcula de ADN y la orientacin de esta cadena es de ./ 0/& 'n el proceso de la transcripcin este )ec)o se fundamenta en la forma en !ue trabaja la en1ima encargada de sinteti1ar la cadena de A(N# slo pueda ensamblar los nucletidos en una sola direccin, y esta es de 0/ ./, por lo tanto la cadena de ADN !ue le sir"e de molde debe tener la orientacin contraria, esto es de ./ 0/, como se muestra en la imagen& 'sta en1ima encargada de la s ntesis de A(N recibe el nombre de A(N polimerasa, de la cual, in"olucradas en la transcripcin existen . distintas, denominadas A(Npol I, A(Npol II y A(Npol III&

Nue"amente )ay !ue tener en cuenta !ue la informacin contenida en el ADN permite la s ntesis de distintos tipos de A(N# el A(N mensajero, encargado de transportar la informacin para la s ntesis proteica, el A(N ribosomal !ue forma parte de los ribosomas, org%nulos en donde se ensamblas las prote nas en base a la informacin !ue proporciona el A(N mensajero pro"eniente de la transcripcin del ADN, y el A(N de transferencia, !ue lle"a los amino%cidos )asta el ribosoma para ser ensamblados en la cadena poli pept dica& 2stos distintos A(N no son producidos por la misma A(N polimerasa por esto existen los . tipos distintos, en donde la A(Npol II es la encargada de sinteti1ar el A(Nm& 'ste proceso en el cu%l la A(Npol II copia la informacin contenida en el ADN re!uiere un contacto f sico entre la en1ima 3A(Npol II4 y la )ebra molde de ADN, por lo tanto se re!uiere un sitio de unin en el ADN con una secuencia espec fica !ue sea reconocida por la en1ima, esta 1ona de reconocimiento y de unin se conoce como 1ona promotor& A esta 1ona promotor no solo se une la A(Npol II, existen otras prote nas denominadas factores de transcripcin !ue se deben unir con antelacin a la secuencia promotor para permitir la posterior unin de la A(Npol II, los factores de transcripcin son un mtodo de controlar la s ntesis de A(N y por lo tanto constituyen reguladores de la expresin gentica, al igual !ue la secuencia reguladora !ue mediante la unin con prote nas espec ficas puede controlar la "elocidad a la !ue sinteti1a A(N la A(Npol& -na "e1 unidos los factores de transcripcin y la A(Npol II a la secuencia promotor, comien1a la transcripcin, !ue consistir% en el a"ance de la en1ima a lo largo de la )ebra de ADN a medida !ue "a separando las )ebras, leyendo la )ebra molde y copiando su informacin en forma de A(Nm, )asta !ue la en1ima se encuentre con la secuencia de trmino, lo !ue pro"ocar% !ue sta se desensamble de la )ebra de ADN poniendo fin a la transcripcin 35ig& .4&

5igura .& 364 -nin de los factores de transcripcin a la secuencia promotor& 374 -nin de la A(Npol II al sitio promotor de la cadena molde y apertura parcial de la doble )ebra a medida !ue a"an1a en direccin 0/& 3.4 'longacin de la cadena de A(Nm& 384 $ecuencia

de la )ebra molde !ue se9ala el trmino de la transcripcin& 304 Nucletidos libres, recordar !ue la Timina es reempla1ada por -racilo en el A(N& M#-."# %'N -*, #"Nm -na "e1 !ue la A(Npol II se encuentra con la secuencia de trmino de la transcripcin, se detendr% la s ntesis de A(Nm y la )ebra simple !uedar% libre en el n:cleo& 'sta )ebra, si bien contiene la informacin de un gen, no posee a:n las caracter sticas estructurales necesarias para poder ser traducida en una prote na& *or lo tanto, re!uerir% ser sometida a una secuencia de modificaciones, cada una con una funcionalidad espec fica& Como sabemos, las molculas de ADN y A(N pueden ser encontradas por ejemplo en bacterias, organismos !ue pueden llegar a representar un riesgo para organismos eucariontes como nosotros, por lo tanto existen mecanismos en las clulas !ue discriminan entre las molculas propias y las ajenas en donde las ajenas una "e1 son identificadas, son eliminadas& ,as bacterias poseen un mecanismo diferente de transcripcin, ya !ue, al no poseer un n:cleo definido y separado por una membrana, el ADN se encuentra en el citoplasma y a medida !ue es transcrito en A(Nm es traducido a prote na inmediatamente& ,os organismos eucariontes como nosotros, apro"ec)an esta caracter stica para diferenciar su A(Nm de A(Nm ajenos, agregando, en el comien1o de la transcripcin, cuando la )ebra de A(Nm tiene una longitud de unas 7; bases, un nucletido modificado al extremo 0/ de la )ebra de A(N, este nucletido modificado corresponde a la <+metil guanina y recibe el nombre de extremo CA* 35ig& 8&a4& 'ste CA* protege al A(Nm de ser degradado por la clula y adem%s es necesario para la unin con el ribosoma a ni"el de citoplasma, esta modificacin preliminar constituye el primer procesamiento del A(N& ,a segunda modificacin se reali1a cuando el A(Nm se encuentra completamente sinteti1ado y libre dentro del n:cleo, la modificacin consiste en una cola !ue se a9ade en el extremo ./ de la )ebra y consiste en una repeticin de )asta 7;; nucletidos de adenina, recibiendo por lo tanto el nombre cola poli+A& 'sta cola sir"e de se9al para !ue la clula transporte el A(N maduro al citoplasma para comen1ar el proceso de traduccin& 'sta s ntesis es responsabilidad de otra en1ima, la A(N poli+A polimerasa& *or :ltimo, otro procesamiento necesario para !ue el A(Nm alcance la categor a de maduro, es el corte de intrones y empalme de exones o $plicing& (ecordemos !ue no toda la secuencia !ue compone un gen sir"e para ser traducida en una prote na funcional, ya !ue, intercaladas entre las secuencias =:tiles> o exones, se encuentran los intrones !ue deben ser cortados y eliminados, con el fin de unir los exones y generar un mensaje funcional 35ig& 84&

5igura 8& ,as tres modificaciones !ue sufre el A(Nm en el proceso de maduracin& 3a4 Ad)esin del CA* al extremo 0/& 3b4 $ ntesis de la cola poli+A& 3c4 Corte de intrones y empalme de exones o $plicing& Al final de la secuencia se muestra un A(Nm maduro con las siguientes caracter sticas# *roteccin frente a la degradacin y 1ona de unin al ribosoma, una se9al de exportacin )acia el citoplasma y una secuencia capa1 de comandar la s ntesis de una prote na funcional& #c!i/idades: 01 %n!erpre!ar las im%genes de transcripcin respondiendo las siguientes preguntas en el espacio en blanco&

5igura 0& A& ?@u sentido tiene la )ebra templadaA

BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB BBBBBBBB

C& ?Cu%l es la funcin de la (NA polimerasaA BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB BBBBBBBBBB

C& ?Cu%l es el sentido del transcriptoA BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB B

D &?De !u manera se relaciona la ADN polimerasa con la A(N polimerasaA BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB BB

'& ?Cu%l es la secuencia de inicio y cu%l de trminoA BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB 5& ?@u funcin reali1a la en1ima girasaA

BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB

D& ?@u estructuras participan en este proceso de transcripcinA BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB BBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBBB B 21 %n!erpre!ar tabla de datos experimentales para resol"er el siguiente problema # G T . ; ; Se obtiene una muestra de DNA, se transcribe a mRNA y se purifica. Se separan entonces las dos hebras del DNA y se analiza la composicin de bases de cada hebra del DNA y del mRNA. Se obtienen los datos recogidos en la tabla de la derecha. Qu hebra del DNA es la hebra transcrita, !ue sir"e como molde para la s#ntesis del mRNA$

hebra -N# 6E& 7F& .6& 7.& n14 0 6 ; ; E hebra -N# 78& .;& 70& 6E& n14 2 7 G < . m"N# 6E& 70& .;& ; E G

; 78&.

31 -e!erminar la respuesta al siguiente problema referido a la transcripcin del DNA

,a regin codificadora de un gen en eucariotas est% formada por cuatro exones de EE, <0, FF y E; nucletidos y tres intrones, intercalados entre los exones, de 80, F. y 87 nucletidos, respecti"amente& Indicar# a4 cu%ntos nucletidos tendr% el A(N m precursorH b4 cu%ntos nucletidos tendr% la regin !ue se traducir% del A(N m maduro y c4 cu%ntos amino%cidos tendr% el pptido codificado&

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