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Biotecnologa Nuestro grupo est interesado en el estudio de la fisiologa microbiana y la aplicacin del conocimiento generado al desarrollo de nuevas y mejores

tecnologas biolgicas. Tomando como modelos principales a las bacterias Escherichia coli y Bacillus subtilis , realizamos estudios que nos estn ayudando a entender los procesos celulares relacionados al transporte de fuentes de carbono, el metabolismo central, las vas de sntesis de compuestos aromticos y la resistencia a diferentes tipos de estrs. Con base en estos estudios, se han desarrollando cepas modificadas mediante ingeniera de vas metablicas y procesos fermentativos para la produccin de varios compuestos de inters industrial. Los compuestos aromticos son una clase de productos qumicos con aplicaciones en varias reas de la industria. Actualmente la mayora de estos compuestos son producidos mediante sntesis qumica a partir del petrleo como materia prima. Nuestro grupo desde hace ya varios aos ha aplicado las herramientas de la ingeniera metablica para generar cepas de E. coli con la capacidad de producir compuestos aromticos con un alto rendimiento a partir de glucosa. Durante los dos ltimos aos hemos enfocado nuestro esfuerzo a la generacin de cepas de E. coli con la capacidad de producir el aminocido aromtico L-tirosina (L-Tir). Este aminocido se emplea en la alimentacin humana y como precursor para la sntesis de otros compuestos de inters industrial. Con el propsito de lograr canalizar carbono de la va comn de sntesis de compuestos aromticos hacia la va especfica de sntesis de L-Tir, fue necesario eliminar la regulacin alostrica existente en la enzima que cataliza los primeros dos pasos de la va. La enzima bifuncional corismato mutasa/prefenato deshidrogenasa (CM/PDH), codificada por el gen tyrA, cataliza los dos primeros pasos en la va especfica de sntesis de L-Tir. La actividad de esta enzima es inhibida por L-Tir. Para incrementar el flujo en la va hacia L-Tir es necesario eliminar la inhibicin ejercida por este aminocido sobre la CM/PDH. Esto se logr mutagenizando al azar la regin de tyrA que codifica para la actividad PDH. Las variantes obtenidas fueron seleccionadas por complementacin funcional en una cepa de E. coli tyrA- pheA-. Varias de las mutantes obtenidas han sido caracterizadas, encontrndose que tres de ellas muestran resistencia parcial a inhibicin por L-Tir. Ests mutantes sern expresadas en cepas de E. coli que poseen otras modificaciones para dirigir flujo de carbono hacia la va comn de sntesis de compuestos aromticos y se determinar la capacidad de produccin de L-Tir en las cepas resultantes. Una estrategia alternativa consisti en expresar enzimas de la va de sntesis de L-Tir que naturalmente fueran insensibles a inhibicin alostrica. Esto se logr expresando simultneamente en E. coli los genes que codifican para el dominio de corismato mutasa de la enzima nativa corismato mutasa/prefenato deshidratasa y la enzima ciclohexadienil deshidrogenasa de Zymomonas mobilis. Esta construccin gentica fue introducida a una cepa de E. coli modificada para dirigir flujo de carbono hacia la va comn de sntesis de compuestos aromticos. En cultivos en fermentador con esta cepa se produjeron 3 g/L de L-Tir con un rendimiento de 66 mg L-Tir/g glucosa. Nuestro grupo tambin tiene el inters en el desarrollo http://www.ibt.unam.mx/server/PRG.base?tipo:doc,dir:PRG.grupo,par:Ggg,tit:_Grupo_del__Dr._Guillermo_Gosset

Ecosistema RESUMEN La diversidad microbiana en ambientes naturales es enorme y difcil de determinar. Estas comunidades microbianas podemos considerarlas como constitutidas por unos pocos microorganismos muy abundantes y un gran nmero de microorganismos diferentes muy poco abundantes o raros. Se plantea la hiptesis de que los microorganismos minoritarios son importantes en ecosistemas naturales. El estudio de estos microorganismos minoritarios es esencial para determinar el papel funcional de las comunidades microbianas en un entorno espacial y temporal, as como para comprender el porqu de la enorme diversidad microbiana existente. Se propone seleccionar microorganismos adaptados a desarrollarse en condiciones extremas (alta temperatura, bajo o alto pH) a partir de ecosistemas moderados, para lo que se han seleccionado, principalmente, sedimentos de las lagunas del Parque Nacional de Doana. Se determinarn variables ambientales y se analizarn los cambios en las comunidades microbianas a lo largo del proceso de seleccin. Se utilizarn mtodos moleculares de deteccin de microorganismos basados tanto en tcnicas de fingerprinting como de secuenciacin, as como mtodos de deteccin in situ. Tambin se abordar el cultivo de los

microorganismos seleccionados. Se identificarn los microorganismos, Bacteria y Archaea, seleccionados y se caracterizarn sus propiedades fisiolgicas. Tambin se estudiar su distribucin espacial y todo ello llevar a deducir su posible funcin dentro del ecosistema estudiado. Se analizar la posibilidad de que las condiciones ensayadas pudieran representar situaciones naturales. Los procesos analizados representarn un modelo de la dinmica de las comunidades microbianas como consecuencia de cambios ambientales y su posible respuesta tanto en el ecosistema como en los ciclos biogeoqumicos globales.

La presentacin consisti en el uso de la metagenmica para detectar patgenos en aguas reclamadas y hacer una comparacin con los patgenos existentes en agua potable. Los resultados fueron sorprendentes para ellos porque la mayora de los virus que se lograron identificar infectaban plantas, animales e insectos. Adems, se habl de como la informacin de los virus presentes en aguas reclamadas podra ser utilizada para la identificacin de nuevos bioindicadores de calidad de agua. La segunda investigacin presentada fue la de el Sr. Jos Cruz la cual se basaba en la Metagenmica en aspectos biomdicos, esta se baso en la presentacin de la metagenmica como una manera eficaz de tener conocimiento de una amplia gama de microorganismos que pueden ser de gran utilidad para aspectos biomdicos. La tercera investigacin presentada fue presidida por el Sr. Jean C. Cruz la misma estaba fundada en la Metagenmica y actividad enzimtica, esta se basaba en la deteccin de la enzima ureasa en las bibliotecas metagenmica generadas por la extraccin de DNA de microorganismos del Bosque seco de Guanica y el Yunque. Hay que recordar que la metagenmica es bien importante para nosotros ya que entendiendo un poco mejor estos procesos podemos entender mejor la relacin humano-ecosistema, adems de entender cmo se modifican los distintos genomas en respuesta a estmulos o cambios. La cuarta presentacin de la maana fue la del Dr. Abel Baerga Ortiz y se titulaba Biosynthesis of omega-3 fatty acids by a polyketide synthase. Los microbilogos han hecho contribuciones a la biologa y a la medicina, especialmente en los campos de la bioqumia, gentica y biologa celular. Los microorganismos tienen muchas caractersticas que los hacen "organismos modelo" ideales:

Son pequeos, por lo cual no consumen muchos recursos. Algunos tienen tiempos de generacin muy cortos (el tiempo necesario para que una clula bacteriana se divida en dos en condiciones ptimas es de 20 minutos aprox. para E. coli en un medio rico y a 37 C. Sin embargo hay bacterias con tiempos de generacin ms largos como Mycobacterium tuberculosis que es de 12 a 24 horas. Las clulas pueden sobrevivir fcilmente separadas de otras clulas. Los eucariontes unicelulares se reproducen por divisin mittica y los procariontes mediante fisin binaria. Esto permite la propagacin de poblaciones clnicas genticamente iguales. Pueden ser almacenados mediante congelacin por grandes perodos de tiempo. Generalmente se preparan alcuotas conteniendo millones de microorganismos por mililitro por lo que an y cuando el 90% de las clulas mueran en el proceso de congelacin, an podran obtenerse clulas viables. APLICACIONES DE LA MICROBIOLOGA Microbiologa Mdica Es la rama de la Microbiologa que se encarga de estudiar los microorganismos causantes de enfermedades (patgenos), tambin se encarga de la prevencin y control de las enfermedades infecciosas. 1. LA MICROBIOLOGA Y SU OBJETIVO

___________________________________________________________________________________________ ______ 4 Microbiologa de Alimentos Estudia tanto los efectos dainos como los efectos beneficiosos de los microorganismos sobre los alimentos. El papel beneficioso incluye el uso de microorganismos en la preparacin de alimentos tales como quesos, salchichas, yogur, encurtidos, etc. Por otra parte, los microorganismos son responsables de algunas de las ms serias intoxicaciones alimentarias y causan tambin la descomposicin de una gran variedad de alimentos.

Microbiologa del Agua Es muy importante que el agua para consumo humano y para otros usos est pura y libre de bacterias patgenas. La Microbiologa del Agua se ocupa de obtener aguas de ptima calidad y utiliza microorganismos con el fin de regenerar las aguas de desecho y hacerlas tiles. Microbiologa Agrcola Los microorganismos juegan un papel muy importante en la agricultura, tanto desde el punto de vista beneficioso como perjudicial. La Microbiologa Agrcola estudia ambos aspectos, entre otros: el papel de los microorganismos en la formacin y fertilizacin de los suelos, el control de los insectos dainos para las plantas mediante el uso de microorganismos, y los efectos dainos de los microorganismos sobre las plantas. Microbiologa Veterinaria Enfermedades infecciosas de varios tipos son responsables de la muerte de muchas mascotas y de animales de granjas. La Microbiologa Veterinaria se encarga de la prevencin y control de esas enfermedades. Microbiologa Industrial Productos de considerable valor econmico se obtienen como resultado del metabolismo microbiano, usando como sustrato desechos agrcolas, desechos industriales y productos naturales de bajo costo. Entre los productos obtenidos de fuentes microbianas tenemos: antibiticos, hormonas, enzimas, etc. http://www.ucv.ve/fileadmin/user_upload/facultad_farmacia/catedraMicro/08_Tema_1_objetivo_micro_e_hist oria.pdf

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