Transcripcin y Procesamiento del RNA

Transcripcin Sntesis de RNA a partir de DNA DNA

Transcripcin
Otros snRNA, snoRNA, siRNA, miRNA

RNA de transferencia tRNA

RNA mensajero mRNA

RNA ribosomal rRNA

Estructura qumica del RNA

RNA puede formar estructuras secundarias

Transcripcin
Solamente los segmentos de DNA que corresponden a genes son copiados a RNA
Una de las dos cadenas de DNA es copiada a RNA
Cadena codificante

Cadena molde

La secuencia de RNA es complementaria a la cadena molde e idntica a la cadena codificante

RNA polimerasa procariotes

RNAP holoenzima 2 460 kDa La RNA pol cubre aprox.60 nt 40 upstream y 20 downstream

Gen rpoA rpoB rpoC rpoD

Producto 2 subunidades (37kDa) Subunidad (151kDa) (157kDa) (32-90kDa)

Funcin ensamblaje de las unidades Centro cataltico Centro cataltico Reconocimiento del promotor (especificidad)

Promotores bacterianos
Promotor

Secuencia -10 o caja Pribnow TATAAT Secuencia -35 TTGACAT

 Secuencias conservadas en promotores de procariontes

Promotor fuerte

Promotor dbil

Factores sigma
Fac. 70 32 24 54 28 Gen Masa (kDa) Uso rpoD 70 general rpoH 32 choque trmico rpoE 24 choque trmico rpoN 54 nitrgeno fliA 28 flagelar

Etapas de la transcripcin
Iniciacin

Elongacin

Terminacin

Reconocimiento y formacin del complejo cerrado

Burbuja de 17pb

Elongacin

Termino de la transcripcin Terminadores intrnsecos

Termino de la transcripcin Dependiente de Rho

Fidelidad de la transcripcin

Las RNA polimerasas no tienen actividad de edicin por tanto son menos fieles

Transcripcin en eucariotes
Eucariotes tienen 3 tipos de polimerasas nucleares Tipos I II III Localizacin Nucleolo Nucleoplasma nucleoplasma Transcritos mRNA tRNA y rRNA 5S Copias/ cl 40,000 20,000

rRNA 18S, 5.8S y 28S 40,000

Todas las RNA polimerasas eucariotas son protenas grandes en forma de agregados de 500 kDa ms. Generalmente tienen de 8 a 14 subunidades

Promotores eucariotes

Caja TATA o caja Hogness -25 / -35 Elementos regulatorios URE Enhancers

Todas las RNA polimerasas requieren factores transcripcionales basales (TF)

Formacin del complejo de iniciacin RNApol II

Factores transcripcionales basales de RNA pol II

Polimerasa RNA pol I RNA pol III

Promotor No tiene caja TATA Promotores internos

Factores transcripcionales basales UBF, SL1 TBP TF III A, TF III B y TF IIIC rRNA 5S TF III B y TF IIIC tRNA

Tambin existen factores moduladores

PROCESAMIENTO POST-TRANSCRIPCIONAL DEL RNA

 RNA ribosmico rRNA

Ms abundante en la clula Principal componente de los ribosomas Procariotes 16S, 23S , 5S Eucariotes 18S, 28S, 5.8S, 5S

RNA transferencia tRNA

Ms pequeo 75nt Transporta aminocidos hasta el ribosoma Extremo 3 tiene el triplete caracterstico CCA Independientemente del aminocido que transporte

Procesamiento RNA transferencia y ribosomal

Eucariotes y procariotes

Procesamiento RNA ribosomal procariote

Regin espaciadora

30S
Metilacin preRNA

II II

II III II II III
Corte especfico RNasaIII, RNasaP y Rnasa E

II II II II

II III II II III
Otras nucleasas

II III II II III

Procesamiento RNA ribosomal eucariote

Nucleolo
Regin espaciadora

45S

II II

II III II

II III

II II II II

II III II II III II

II III II III

Los cortes son catalizados por RNAs pequeos del nucleolo snoRNAs y protenas del spliceosoma

Procesamiento RNA transferencia eucariote

Cortes endonucleolticos seguidos reaccin de ligacin

Procesamiento RNA transferencia

Procesamiento del extremo 5 RNasa P Se encuentra en todos los organismos Ribonucleopotena RNA (ribozima) 377 nt (actividad cataltica)
Nucleasas RNasa D

Procesamiento extremo 3 Nucleasas eliminan un grupo de bases RNasa D elimina nucletidos restantes

Protena 20kDa

Procesamiento RNA transferencia

tRNA nucleotidiltransferasa Transfiere la secuencia CCA caracterstica de TODOS los tRNA maduros Metilacino desaminacin de bases Bases pseudouracilo y dihidrouracilo

Bases modificadas presentes en los tRNA

Procesamiento mRNA eucariote

Capping

Procesamiento mRNA eucariote

Poliadenilacin 3

Procesamiento mRNA eucariote

Splicing Remocin de intrones

Procesamiento mRNA eucariote Splicing Remocin de intrones

Splicing alternativo

Resumen procesamiento mRNA eucariote