"Operaciones sencillas con secuencias" Ensayos biotecnolgicos

1. SECUENCIA INICIAL DE ADN

ATGTGCGACCATACCAAGCTGAAAATACTGCATCCCGTCTGATCTGCACAGTCAAGCAGCTTAGGGCCCAGTCAGTAGTGCGGT GGGGGACCATGCGCGAACATTGTGGTGTTGCACTTATGTGCGACCATACCAAGCTGAAAATACTGCATCCCGTCTGATCTGCAC AGTCAAGCAGCTTAGGGCCCAGTCAGTAGTGCGGTGGGGGACCATGCGCGAACATTGTGGTGTTGCACTTATGTGCGACCATA CCAAGCTGAAAATACTGCATCCCGTCTGATCTGCACAGTCAAGCAGCTTAGGGCCCAGTCAGTAGTGCGGTGGGGGACCATGC GCGAACATTGTGGTGTTGCACTTATGTGCGACCATACCAAGCTGAAAATACTGCATCCCGTCTGATCTGCACAGTCAAGCAGCTT AGGGCCCAGTCAGTAGTGCGGTGGGGGACCATGCGCGAACATTGTGGTGTTGCACTT

2. a)SECUENCIA REVERSA
TTCACGTTGTGGTGTTACAAGCGCGTACCAGGGGGTGGCGTGATGACTGACCCGGGATTCGACGAACTGACACGTCTAGTCTG CCCTACGTCATAAAAGTCGAACCATACCAGCGTGTATTCACGTTGTGGTGTTACAAGCGCGTACCAGGGGGTGGCGTGATGACT GACCCGGGATTCGACGAACTGACACGTCTAGTCTGCCCTACGTCATAAAAGTCGAACCATACCAGCGTGTATTCACGTTGTGGT GTTACAAGCGCGTACCAGGGGGTGGCGTGATGACTGACCCGGGATTCGACGAACTGACACGTCTAGTCTGCCCTACGTCATAA AAGTCGAACCATACCAGCGTGTATTCACGTTGTGGTGTTACAAGCGCGTACCAGGGGGTGGCGTGATGACTGACCCGGGATTC GACGAACTGACACGTCTAGTCTGCCCTACGTCATAAAAGTCGAACCATACCAGCGTGTA

b)SECUENCIA COMPLEMENTARIA
TACACGCTGGTATGGTTCGACTTTTATGACGTAGGGCAGACTAGACGTGTCAGTTCGTCGAATCCCGGGTCAGTCATCACGCCA CCCCCTGGTACGCGCTTGTAACACCACAACGTGAATACACGCTGGTATGGTTCGACTTTTATGACGTAGGGCAGACTAGACGTG TCAGTTCGTCGAATCCCGGGTCAGTCATCACGCCACCCCCTGGTACGCGCTTGTAACACCACAACGTGAATACACGCTGGTATG GTTCGACTTTTATGACGTAGGGCAGACTAGACGTGTCAGTTCGTCGAATCCCGGGTCAGTCATCACGCCACCCCCTGGTACGCG CTTGTAACACCACAACGTGAATACACGCTGGTATGGTTCGACTTTTATGACGTAGGGCAGACTAGACGTGTCAGTTCGTCGAAT CCCGGGTCAGTCATCACGCCACCCCCTGGTACGCGCTTGTAACACCACAACGTGAA

c)ARN
AUGUGCGACCAUACCAAGCUGAAAAUACUGCAUCCCGUCUGAUCUGCACAGUCAAGCAGCUUAGGGCCCAGUCAGUAGU GCGGUGGGGGACCAUGCGCGAACAUUGUGGUGUUGCACUUAUGUGCGACCAUACCAAGCUGAAAAUACUGCAUCCCGUC UGAUCUGCACAGUCAAGCAGCUUAGGGCCCAGUCAGUAGUGCGGUGGGGGACCAUGCGCGAACAUUGUGGUGUUGCAC UUAUGUGCGACCAUACCAAGCUGAAAAUACUGCAUCCCGUCUGAUCUGCACAGUCAAGCAGCUUAGGGCCCAGUCAGUA GUGCGGUGGGGGACCAUGCGCGAACAUUGUGGUGUUGCACUUAUGUGCGACCAUACCAAGCUGAAAAUACUGCAUCCCG UCUGAUCUGCACAGUCAAGCAGCUUAGGGCCCAGUCAGUAGUGCGGUGGGGGACCAUGCGCGAACAUUGUGGUGUUGC ACUU

d)PROTENA CODIFICADA
RF1 : MCDHTKLKILHPV*SAQSSSLGPSQ*CGGGPCANIVVLHL CATIPS*KYCIPSDLHSQAA*GPVSSAVGDHARTLWCCTY VRPYQAENTASRLICTVKQLRAQSVVRWGTMREHCGVALM CDHTKLKILHPV*SAQSSSLGPSQ*CGGGPCANIVVLH RF2 : CATIPS*KYCIPSDLHSQAA*GPVSSAVGDHARTLWCCTY VRPYQAENTASRLICTVKQLRAQSVVRWGTMREHCGVALM CDHTKLKILHPV*SAQSSSLGPSQ*CGGGPCANIVVLHLC ATIPS*KYCIPSDLHSQAA*GPVSSAVGDHARTLWCCT RF3: VRPYQAENTASRLICTVKQLRAQSVVRWGTMREHCGVALM CDHTKLKILHPV*SAQSSSLGPSQ*CGGGPCANIVVLHLC ATIPS*KYCIPSDLHSQAA*GPVSSAVGDHARTLWCCTYV RPYQAENTASRLICTVKQLRAQSVVRWGTMREHCGVAL

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untas soluciones posibles hay para la secuencia problema? Seis Por qu? Porque en el cdigo gentico se leen secuencias de ADN en grupos de tres pares de bases, esto significa que, en una molcula de ADN de doble hebra, hay 6 posibles sentidos en los que pueden abrirse marcos de lectura (tres en la secuencia inicial y tres en la complementaria).

e)RESULTADOS:
Porcentaje de nucletidos A: 112 nucletidos 23,52% C: 120 nucletidos 25,21% G: 136 nucletidos 28,57% T: 108 nucletidos 22,68%

30 25 20 15 10 5 0 A C G T

Porcentaje de dmeros AA: 24 dmeros 5.04% AC: 28 dmeros 5.88% AG: 32 dmeros 6.72% AT: 28 dmeros 5.88% CA: 48 dmeros 10.08% CC: 28 dmeros 5.88% CG: 20 dmeros 4.2% CT: 24 dmeros 5.04% GA: 20 dmeros 4.2% GC: 44 dmeros 9.24% GG: 32 dmeros 6.72% GT: 40 dmeros 8.4% TA: 19 dmeros 3.99% TC: 20 dmeros 4.2% TG: 52 dmeros 10.92% TT: 16 dmeros 3.36%

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Porcentaje de codones AAA: 8 codones 1.68% AAC: 4 codones 0.84% AAG: 8 codones 1.68% AAT: 4 codones 0.84% ACA: 8 codones 1.68% ACC: 12 codones2.52% ACG: 0 codones 0% ACT: 8 codones 1.68% AGA: 0 codones 0% AGC: 12 codones 2.52% AGG: 4 codones 0.84% AGT: 16 codones 3.36% ATA: 8 codones 1.68% ATC: 8 codones 1.68% ATG: 8 codones 1.68% ATT: 4 codones 0.84% CAA: 8 codones 1.68% CAC: 8 codones 1.68% CAG: 16 codones3.36% CAT: 16 codones 3.36% CCA: 16 codones 3.36% CCC: 8 codones 1.68% CCG: 4 codones 0.84% CCT: 0 codones 0% CGA: 8 codones 1.68% CGC: 4 codones 0.84% CGG: 4 codones 0.84% CGT: 4 codones 0.84% CTA: 0 codones 0% CTC: 0 codones 0% CTG: 16 codones 3.36% CTT: 8 codones 1.68% GAA: 8 codones 1.68% GAC: 8 codones 1.68% GAG: 0 codones 0% GAT: 4 codones 0.84% GCA: 16 codones 3.36% GCC: 4 codones 0.84% GCG: 16 codones 3.36% GCT: 8 codones 1.68% GGA: 4 codones 0.84% GGC: 4 codones 0.84% GGG: 16 codones3.36% GGT: 8codones 1.68% GTA: 4 codones 0.84% GTC: 12 codones 2.52% GTG: 20 codones 4.2% GTT: 4 codones 0.84% TAA: 0 codones 0% TAC: 8 codones 1.68% TAG: 8 codones 1.68% TAT: 3 codones 0.63% TCA: 8 codones 1.68% TCC: 4 codones 0.84% TCG: 0 codones 0% TCT: 8 codones 1.68% TGA: 8 codones 1.68% TGC: 24 codones5.04% TGG: 8 codones 1.68% TGT: 12 codones 2.52% TTA: 7 codones 1.47% TTC: 0 codones 0% TTG: 8 codones 1.68% TTT: 0 codones 0%

3.FUENTES USADAS:
http://personales.upv.es/jcanizar/bioinformatica/conocimientos_previos.html http://www.dnalc.org/resources/geneboy.html http://www.genome.gov/GlossaryS/index.cfm?id=146 http://www.marcoregalia.com/STUFF/UDISTRITAL/Bioinformatica/Actividades/Resumenes%20Clases/Openreadingf rames.html

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