O DNA do DNA

Cientista brasileiro participante do megaconsrcio Encode explica a revoluo que resgatar o injustiado 'DNA lixo', responsvel na verdade por grande parte dos caprichos genticos

Se temos 21 mil lmpadas iluminando nosso jeito de ser, where the hell esto os interruptores? Fora do lixo em que os botaram. Esse foi o resultado sustentvel do Encode, consrcio de 442 pesquisadores da Amrica do Norte, sia e Europa que nessa semana derrubou a ideia de que 98% do DNA no tinha funo. Nosso genoma no seria composto de apenas 21 mil genes, 2% de seus 3 bilhes de "letras" qumicas, mas tambm de uma srie de elementos que ligam e desligam esses genes. Coisa fina, de grande complexidade, mas que animou o povo especialmente quanto ao diagnstico e tratamento de doenas. O recifense Marcelo Nbrega estava entre esses pesquisadores que contaram com R$ 375 milhes do governo americano para elaborar o "guia do genoma humano". H 17 anos nos Estados Unidos, ele chefia um laboratrio na Universidade de Chicago que estuda bases genticas de distrbios causados exatamente por variaes fora dos genes. "No sou especializado numa doena, mas num processo biolgico", diferencia. Mdico formado na UFPE, ele fez Ph.D. em fisiologia e gentica molecular em Wisconsin e ps-doc em Berkeley, at criar raiz em Chicago, onde aguarda a chegada do primeiro filho para daqui a dois meses. Nesta entrevista, Marcelo conta o que a comunidade cientfica j intua sobre o genoma humano e o que foi a grande surpresa do projeto. Tambm destaca o papel da epigentica, resposta rpida de adaptao ao ambiente que poderia estar por trs de certos casos de obesidade. Esse recifense de 40 anos ainda anuncia o financiamento de um novo Encode e o barateamento provocado pelas novas tecnologias: "Hoje sequencio num nico dia mais DNAs que todo o projeto do genoma humano sequenciou em 30 anos". Isso, diz ele, num laboratrio que nem de outro mundo, mas num que a evoluo genmica lhe deu. O resultado do consrcio foi um achado de exame ou desde o incio do projeto j se pesquisava se o 'DNA lixo' tinha funo? O consrcio foi formado para identificar at que grau o genoma codifica funes alm daqueles 2% de cdigo gentico conhecido. J se sabia, h dcadas, que os 98% restantes no correspondiam a genes. Mas se perguntava: o que seriam esses 98%? H estudos, desde a dcada de 70, portanto muito antes do acesso ao genoma, que foram fundamentais ao comparar o DNA de humanos com o de chimpanzs. Ainda que de forma grosseira, via-se o nvel de semelhana entre

eles. Ambos eram virtualmente idnticos. Se o DNA dessas duas espcies, de grau extremo de similaridade, to diferente comportamental e morfologicamente falando, isso supostamente significa que existem funes alm dos genes para justificar as diferenas. E nem precisa usar a analogia entre chimpanzs e humanos. A gente tem cerca de 21 mil genes no nosso genoma e dentro de cada clula esse material gentico idntico. Mas cada clula usa de 7 mil a 15 mil genes. Nenhuma vai usar mais que 15 mil e nenhuma sobrevive com menos de 7 mil. A complexidade : o que faz com que uma clula cardaca lance mo de cerca de 10 mil genes de clula cardaca e uma clula de osso use outros 10 mil genes, alguns dos quais idnticos aos das clulas cardacas e outros diferentes? A gente sabia que nesses 98% havia sequncias importantes, que regulam se um gene est ativo ou no. Ento qual foi a grande surpresa do Encode? A surpresa o grau de funcionalidade que se achou. No se sabia se nesses 98% iramos aferir funes a 2% ou 5% deles. Esses estudos aferiram funes a 80%. A ideia de que uma parte grande do genoma seria lixo caiu por terra. Muitas dessas sequncias s sero funcionais em um tipo especfico de clula, e em determinado momento, mas, se olhar o organismo como um todo, quase o genoma inteiro ter funo. Isso foi uma surpresa tremenda, no se imaginava que se chegaria a esse nvel, no. Logo depois da apresentao dos resultados, muitos afirmaram que a natureza sbia. Ela nunca desperdia material? Bobagem, isso no tem nenhum cabimento. A natureza no sbia, a natureza no econmica, a natureza no eficiente. H certamente pedaos de DNA no funcionais, 80% um nmero quase certamente inflacionado. Explicando melhor os resultados do Encode: em quanto do genoma a gente consegue encontrar pelo menos uma evidncia de que determinada sequncia tem funo? A resposta 80%. No significa jamais que descobriram a funo desses 80% do genoma. A grande maioria dessas sequncias tem uma evidncia fraca de que aquilo seja funcional. De qualquer maneira, j ficou estabelecido na comunidade que a frao do genoma com alguma funcionalidade maior que 2%. Achar que a natureza no deixaria um pedao intil do genoma ser mantido e transmitido adiante no corresponde verdade, inclusive porque uma frao considervel do nosso genoma so resqucios de batalhas anteriores, pedaos de DNA virais que se integraram ao genoma humano. Cada vez que se pega uma infeco viral, o vrus junta ao genoma dele a nossa clula e usa toda a maquinaria dela para se replicar. Isso permite que, em alguns casos, a infeco viral ocorra em clulas germinativas e seja transmitida s geraes seguintes. Grande parte dessas partculas virais no tem funo e outras continuam ativas. Como se ainda fossem vrus, conseguem fazer cpias delas mesmas e se integrar repetidamente ao genoma. Por que se diz que esses elementos regulatrios explicariam que um gmeo idntico poderia desenvolver um tipo de cncer e o outro no? Gmeos idnticos no teriam tambm os mesmos elementos regulatrios?

A pergunta bem pertinente e o conceito perfeito. Mas sabemos que uma srie de variaes fisiolgicas, de comportamento e at mesmo de aparncia entre indivduos dada no por diferenas genticas entre eles, mas por um fenmeno chamado epigentica. Epigentica uma resposta rpida de adaptao a ambientes modificados em que se consegue alterar funes biolgicas sem modificar o material gentico propriamente dito. Isso um fenmeno importantssimo. No incio do sculo 20, por exemplo, houve uma seca na Sucia, algo transitrio, mas que gerou fome. Durou de um a dois anos. Depois de algum tempo, os suecos notaram que mulheres que eram adolescentes durante a seca e que depois vieram a se alimentar normalmente davam luz bebs com peso abaixo do normal. Essas crianas cresceram e tiveram filhos. Mas seus filhos tm uma suscetibilidade muito maior a doenas cardiovasculares e obesidade que suas mes, que no passaram fome. Ou seja, enquanto aquela criana estava no tero e ele estava repleto de nutrientes, houve uma reprogramao epigentica naquela me para que ela aumentasse a economia de energia, para que as calorias se transformassem em gordura, para que fossem mais eficientemente guardadas. Aquela reprogramao foi transmitida para o filho dela. E esse filho, que nunca teve restrio calrica, que pode ter tido uma vida extremamente saudvel, passou o resto da vida com aumento de suscetibilidade a essas doenas que a gente assumia serem basicamente determinadas por variaes genticas. Na nossa cabea, s diferenas no cdigo gentico justificariam isso. Agora a gente v que no bem assim. Os gmeos idnticos so o melhor exemplo para explicar isso. Isso acentua o papel dos fatores ambientais?

Claro! Imagina as repercusses sociais disso. Se a gente j acha que um problema uma gerao inteira de jovens ir direto ao McDonald's ou, pior ainda, de pessoas no terem com o que se alimentar, os efeitos deletrios de ambas as situaes so provavelmente muito mais profundos do que a gente imagina. de se supor que alguns indivduos obesos tenham na explicao da sua obesidade hbitos alimentares dos seus avs. Tudo isso vem tona com esse projeto do Encode. Posso agora pegar gmeos idnticos em que um tenha obesidade e outro no, ou que um tenha diabetes e outro no e, sabendo no existir diferena gentica entre eles, procurar diferenas epigenticas, o que at ento era absolutamente impossvel porque a gente no tinha ideia de onde essas modificaes aconteciam no genoma. O Encode lanou um mapa disso da. Fez-se uma analogia geogrfica dizendo que, enquanto o projeto Genoma Humano era uma vista espacial da Terra, o Encode seria como o Google Maps, especificando onde esto as estradas, como est o trfico... Chega mesmo a essa preciso? uma metfora apta, mas tambm exagerada, porque o Encode fez Google Maps de uma cidade que ningum visita. Voc tem no seu organismo centenas de tipos celulares: clulas musculares cardacas, neurnios de vrios tipos, clulas sseas. O que o Encode fez foi usar sete tipos delas. So clulas meio frankstein, que no existem no organismo humano, a maioria cancergenas e comercialmente disponveis. As clulas cancergenas se multiplicam

rapidamente e por isso so timas para usar em laboratrio. Uma das utilizadas no projeto a HeLa, que veio de uma mulher chamada Henrietta Lacks. Henrietta era uma americana negra, jovem, que constitua famlia quando foi acometida por um cncer de colo do tero. O cncer a matou logo. Mas fortuitamente, no Johns Hopkins Hospital, tiraram uma parte de suas clulas e descobriram que elas cresciam loucamente. Eles as botavam numa incubadora e no dia seguinte a incubadora estava lotada de clulas. Essa mulher morreu h mais de meio sculo e se calcula que a quantidade de clulas que j cresceram a partir das originais daria uma massa celular dez vezes mais pesada que o Empire State Building. A grande imoralidade do assunto que a coleta foi feita sem a permisso dessa paciente. Ganharam bilhes de dlares em cima disso e a famlia de Henrietta vive miservel at hoje. Se usaram clulas frankstein, como transferir o resultado para clulas especializadas? De fato, essas clulas no refletem mais a biologia de nenhum tipo celular humano exatamente. O Encode lanou mapas detalhados de clulas em que pouca gente est interessada. Aquelas de que realmente precisamos so clulas primrias humanas, cujo mapa ainda no existe. Mas as tecnologias que o Encode desenvolveu so extremamente teis para que possamos replicar nossa clula favorita no prprio laboratrio, e o tipo de informao que ele pegou j reproduzvel em muitos aspectos para outras clulas. J se pensa numa segunda verso do Encode?

Ele acabou de ser financiado para uma nova etapa, que deve ser anunciada nos prximos meses. Fizeram Google Maps de uma cidade que ningum visita e agora vo expandir isso para coisas mais relevantes. Trata-se de uma escala maior, mais rpida e mais barata do que aquilo que foi feito nos ltimos quatro anos. Por que fica mais barato?

Porque as tecnologias alcanaram um nvel tal No meu laboratrio sequencio mais DNAs num dia do que o projeto do genoma humano sequenciou em 30 anos. E meu laboratrio no do outro mundo, mdio. nesse nvel que as coisas evoluem. Um projeto que custou bilhes de dlares entre o incio dos 1980 e a primeira dcada de 2000 hoje sai por milhares de dlares. Sequenciar um genoma atualmente 1 milho de vezes mais barato que h 12 anos. No tem muita coisa no mundo que custe 1 milho de vezes menos nesse tempo. Muita gente no tem ideia de quo revolucionrio isso tem sido na genmica. O dinheiro investido no Encode veio apenas do governo federal? Veio 100% do governo federal americano. O Encode pesquisa bsica, gerao de reagentes que vo ser usados pela comunidade biomdica do mundo inteiro, fundamentais para o tipo de pesquisa que ser feita por iniciativa particular e por indstrias que tm por objetivo novas terapias e novos diagnsticos de doenas. A pesquisa que lana as bases para as descobertas com fins comerciais tem que ser financiada pelo governo. Isso bem estabelecido nos EUA, onde

tem sido mantida uma relao muito bem casada entre a iniciativa do governo e a privada. Todos os laboratrios necessariamente? participantes so de gentica

No. Muitos dos laboratrios que participaram so de qumica, de cincias da computao, de matemtica, de teoria de jogos, de inteligncia artificial. As estratgias de anlise desses resultados em larga escala so extremamente complexas. Lanou-se mo de expertises extremamente dspares. Ningum pode realizar um negcio desses sozinho. Quando sai esse resultado dando tanta importncia aos elementos regulatrios, d alento pensar que descobriram um novo caminho para o tratamento de doenas, mas agora no so mais apenas 2% para estudar. A gente fica otimista porque finalmente est entendendo o mecanismo molecular de vrias dessas doenas, o que tende a levar a novas descobertas teraputicas. Porm, cada vez que procuramos mais, descobrimos mais. Conhecemos melhor essas doenas do que h poucos anos, mas tambm temos visto que elas so muito mais complexas do que havamos antecipado. Por isso irresponsvel, ao lanar esses resultados, falar em coisas num horizonte imediato. Nesse aspecto cruel. O sequenciamento do genoma humano nos deu um livro que no sabamos ler. Agora estamos lendo esse livro. uma fase inicial. PROFESSOR DO DEPARTAMENTO UNIVERSIDADE DE CHICAGO DE GENTICA HUMANA DA