Documenti di Didattica
Documenti di Professioni
Documenti di Cultura
La Medicina Genmica avanza a nivel global y Mxico no es la excepcin. A diez aos de la publicacin de la primera secuencia del genoma humano y en el marco de la apertura de la sede permanente del Instituto Nacional de Medicina Genmica (INMEGEN), celebramos el Encuentro Internacional de Medicina Genmica: Retos en Investigacin e Impacto social. Este evento cientfico contar con la participacin de especialistas nacionales e internacionales de excelencia acadmica en genmica, en el que se abordarn diversos temas de actualidad como la genmica poblacional, la epigentica, la protemica mdica, la genmica de enfermedades autoinmunes, diabetes mellitus, adicciones y enfermedad mental, la genmica funcional de la oncognesis, la educacin y la medicina personalizada, la innovacin en ciencias de la vida y se revisarn los retos ticos y legales a los que nos enfrenta esta nueva disciplina. Dr. Xavier Sobern Mainero Presidente del Encuentro
Directorio
Presidente
Dr. Xavier Sobern Mainero
Instituto Nacional de Medicina Genmica (INMEGEN), Mxico
Comit Organizador
Coordinador Dr. Santiago March Mifsut
Junta de Gobierno
Dr. Jos ngel Crdova Villalobos Dr. Romeo Sergio Rodriguez Surez Dr. Adolfo Martnez Palomo Dr. Rubn Lisker Yourkowitzky Dr. Misael Uribe Esquivel Dra. Teresita Corona Vzquez Lic. Jos David Mndez Santa Cruz Dr. Francisco Bolivar Zapata Lic. Carlos Eduardo Represas De Almeida Lic. Enrique Jos Garcini Elizondo Lic. Mnica Zendejas ngeles Maria Del Carmen lvarez-Buylla Roces Lic. Carlos Gracias Nava Lic. Mara de Los ngeles Carrera L.C. Carlos Ruiz De Esparza Cervera
Act. Cuauhtmoc Valds Olmedo Ma. del Carmen lvarez-Buylla Roces Lic. Juan Manuel Garca Rocha Lic. Paulino Jaime Arzate Lic. Alejandro Lpez Franco Mtra. Nancy lvarez Vzquez Ing. Carlos Dvila Garca Ing. Francisco Vega Torres Ing. Rodrigo Garca Herrera Mtro. Alejandro Rodrguez Torres Lic. Jos Bedolla Castro Lic. Antonio Torres Macas Lic. Berenice Gonzlez Miranda Jos Luis vila Moreno Ing. Juan Carlos Macas Romero Lic. Anglica Martell Rodrguez Lic. Rumi Tsumura Garca Tec. Francisco Machargo Oviedo Tec. Gloria Arvalo Hernndez Lic. Beatriz Romero ngeles Mtra. Elia Rodrguez Barraza Lic Yadira Padilla Monterrubio Lic. Diana Mara Rodrguez Arzate Lic. Gabriela Burgoa Gutirrez Jorge Enrique Blando Hernndez Mario Moreno Barranco Sara Echnove Ortiz Comit Cientfico Dra. Alessandra Carnevale Cantoni Dr. Rubn Lisker Yourkowitzky Dr. Fabio Salamanca Gmez Dr. Jorge Melndez Zajgla Dra. Lorena Orozco Orozco
Patronato
Lic. Carlos Eduardo Represas de Almeida
Presidente
Lic. Emilio Azcrraga Jean C.P. Luis Germn Crcoba Garca Min. Dr. Jos Ramn Cosso Daz Lic. Henry Davis Sigoret Lic. Csar Salvador de Anda Molina Sra. Laura Diez Barroso de Laviada Sr. Augusto Elas Paullada Lic. Pablo Escandn Cusi Ing. y Lic. Pierre Froidevaux Chavan Lic. Claudio X. Gonzlez Guajardo Dra. Mercedes Juan Lpez Ing. y M. en A. Marcos Martnez Gavica Dr. Guillermo Ortz Martnez Lic. Ernesto Rubio del Cueto Dr. Jaime Serra Puche Sra. Nina Zambrano
Conferencias Magistrales 1. 2.
Caracterizacin de algunos fenmenos moleculares asociados al Cncer: una oportunidad para su mejor control Dr. Alejandro Mohar Betancourt
Instituto Nacional de Cancerologa, Mxico.
3.
De los estudios de Asociacin del Genoma Completo a la Secuenciacin de Nueva Generacin Dr. Ivo Glynne Gut
Centro Nacional de Anlisis Genmico, Espaa.
4.
Las Alianzas Pblico-Privadas en Genmica para Beneficio de la Salud Pblica Dr. Roberto Tapia Conyer
Instituto Carlos Slim de la Salud, Mxico.
Programa Acadmico
Jueves 21 Octubre
9:00 10:30 10:45 Inauguracin Conferencia Magistral 1 Receso Simposio 1 Genmica del Cncer Receso Simposio 2 Retos y Tendencias Comida Conferencia Magistral 2
Cocktail de bienvenida
Viernes 22 Octubre
9:00 9:50 10:05 11:35 11:50 14:20 Conferencia Magistral 4
Simposio 4 La Medicina Genmica en la Educacin Mdica del Siglo XXI Receso Sesin de Clausura Genmica y Sociedad Clausura
Simposios
Jueves 21 de Octubre de 2010
Simposio No 1. Genmica del Cncer Horario: 10:45 a 12:15 hrs. Horario 1. 2. 10:45 10:55 10:55 11:15 Ponencia Introduccin Genmica Funcional de la Oncognesis mediada por Kras Medicina personalizada en el cncer Aneuploidas y Cncer: El origen gentico de las aneuploidas Preguntas y Respuestas Retos y Tendencias Coordinador: Dr. Xavier Sobern Mainero, INMEGEN Horario: 12:30 a 14:00 hrs. Horario 1. 2. 3. 4. 5. 12:30 12:40 12:40 13:00 13:00 13:20 13:20 13:40 13:40 14:00 Ponencia Introduccin La participacin de la epigentica en el genoma y la fisiologa celular Modelaje biolgico y computacional de la regulacin gentica microbiana Anlisis protemico basado en la espectometra de masas Preguntas y Respuestas Genmica de Enfermedades Complejas Horario: 16:40 a 14:00 hrs. Horario 1. 16:40 16:50 Ponencia Introduccin Ponente Dr. Rubn Lisker, Instituto Nacional de Ciencias Mdicas y Nutricin Salvador Zubirn Dra. Mara Teresa Tusi Luna, Instituto Nacional de Ciencias Mdicas y Nutricin Salvador Zubirn Dra. Lorena Orozco Orozco, Instituto Nacional de Medicina Genmica Dr. Humberto Nicolini, Universidad Autnoma de la Ciudad de Mxico Ponente Dr. Xavier Sobern Mainero, INMEGEN Dr. Flix Recillas Targa, Instituto de Fisiologa Celular, UNAM Dr. Julio Collado Vides, Centro de Ciencias Genmicas, UNAM Dr. Csar Ferreira Batista, Instituto de Biotecnologa, UNAM Ponente Dr. Fabio Salamanca Gmez, Instituto Mexicano del Seguro Social Dr. Alejandro Sweet Cordero, Stanford University School of Medicine, California, EUA. Dr. Jorge Melndez Zajgla, Instituto Nacional de Medicina Genmica Dr. Luis Herrera Montalvo, Instituto Nacional de Cancerologa Coordinador: Dr. Fabio Salamanca Gmez, Instituto Mexicano del Seguro Social
3. 4. 5.
Simposio No 2.
Simposio No 3.
Coordinador: Dr. Rubn Lisker, Instituto Nacional de Ciencias Mdicas y Nutricin Salvador Zubirn
2.
16:50 17:10
Arquitectura gentica de la diabetes tipo 2 y otros rasgos metablicos en la poblacin mestiza mexicana Anlisis genmico de enfermedades autoinmunes en nios mexicanos Genmica de las adicciones y la enfermedad mental Preguntas y Respuestas
3. 4. 5.
La Medicina Genmica en la Educacin Mdica del S. XXI Coordinador: Santiago March Mifsut, INMEGEN Horario: 10:05 a 11:35 hrs.
Horario 1. 2. 3. 10:05 10:15 10:15 10:35 10:35 10:55 10:55 11:15 11:15 11:35
Ponencia Introduccin al tema Educacin para la medicina personalizada Licenciatura en Ciencias Genmicas: Educacin estratgica de nivel internacional Formando los Profesionales de la Salud del futuro en el presente Preguntas y Respuestas
Ponente Dr. Santiago March Mifsut, Instituto Nacional de Medicina Genmica Dr. Alberto Lifshitz Guinzberg, Instituto Mexicano del Seguro Social Dr. Rafael Palacios de la Lama, Centro de Ciencias Genmicas, UNAM Dr. Luis Felipe Abreu Hernndez, Facultad de Medicina, UNAM
4. 5.
Sesin de Clausura
Genmica y Sociedad Coordinadora: Dra. Alessandra Carnevale Cantoni, INMEGEN Horario: 11:50 a 14:20 hrs.
Ponente Dr. Emilio Sacristn, Centro Nacional de Investigacin en Instrumentacin e Imagenologa, Universidad Autnoma Metropolitana. Dr. Fernando Cano Valle, Instituto de Investigaciones Jurdicas, UNAM Dra. Ellen Wright Clayton, Vanderbilt University, EUA
2. 3.
Aspectos jurdicos de la medicina genmica Retos ticos para las aplicaciones clnicas de la medicina genmica
Instituciones participantes
Instituto Nacional de Medicina Genmica Fundacin Mexicana para la Salud Instituto Mexicano del Seguro Social Instituto Carlos Slim de la Salud Iniciativa Slim en Medicina Genmica Centro Nacional de Anlisis Genmico
Vanderbilt University Stanford University Universidad Autnoma Metropolitana Universidad Nacional Autnoma de Mxico Universidad Autnoma de la Ciudad de Mxico Secretara de Salud, Mxico
Patrocinadores
Ponentes
11
13
15
17
Pertenece a diversas asociaciones y destaca su participacin como cofundadora de la Asociacin de Biologa Molecular en Medicina (AMBMM), la Sociedad de Medicina Genmica (SOMEGEN) y de la Asociacin Mexicana de Egresados de los National Institutes of Health de los Estados Unidos (AMENAC). As tambin ha ocupado diversos cargos destacando su labor como Presidente de la Asociacin de Biologa Molecular en Medicina y como Presidente de la Asociacin Mexicana de Gentica Humana.
19
21
22
02 - Fases en el anlisis de datos de un proyecto con microarreglos de expresin Ivn Imaz Rosshandler, Claudia Rangel Escareo La tecnologa de microarreglos ha impulsado el desarrollo de diversos y complejos algoritmos enfocados al anlisis de datos genmicos provenientes de diferentes tipos de experimentos. Adems de traba jar con volumenes masivos de datos, dichos algoritmos manejan decenas de miles de medidas de expresin utilizando un pequeo nmero de replicados. En general, el anlisis de expresin gnica se puede dividir en tres fases. La primera fase corresponde al procesamiento de datos y consiste en la preparacin de estos para un correcto anlisis, a su vez, esta puede dividirse en cuatro etapas (control de calidad, correccin de fondo, normalizacin y generacin de niveles de expresin). En la segunda fase clasificacin, se deben identificar dentro de los resultados del experimento, los genes que presentan cambios significativos. Debido a la naturaleza de los datos, los mtodos estadsticos ms utilizados en esta fase se basan en modelos Bayesianos. En la tercera fase, la prediccin, se aplican mtodos de agrupamiento para identificar o bien descubrir patrones de expresin similares. En este trabajo, presentamos una revisin de las distintas fases y mostrar el impacto de la eleccin del mtodo de normalizacin sobre los posibles resultados o lista de genes diferencialmente expresados.
04 - Evaluation of microRNAs in urine samples as indicators of prostate cancer occurrence Slido-Guadarrama I, Miranda-Ortiz H, Garca-Tobilla P, Solrzano-Rosales S, Saavedra- Briones D, Morales-Montor G, Snchez-Alarcn M and Rodrguez-Dorantes M. Prostate Cancer (PCa) is the second cause of death in men in industrialized countries. In Mexico, ~40% of men between 60-69 years old suffer from this disease. To date serum prostate specific antigen (PSA) remains the only molecular marker used as indi-
cator in the detection and management of PCa; although very sensitive, it suffers from low specificity. Androgens are essential for normal differentiation and malignant growth of the prostate is related to alterations in androgen signaling. At the beginning of the disease the most effective therapy is radical prostatectomy and androgen ablation, unfortunately many of these patients cross to androgen independence, developing very aggressive tumors with poor prognosis. New markers that differentiate BPH from PCa to decrease false-positive rates and improve early detection are needed. The important role of microRNAs (miRNAs) and the consequences of their deregulation in the progression of human cancer have been well established. Our data could suggest that miRNAs could have an important role in prostate cancer to predict biopsy outcome in patients with suspected prostate cancer promising to be a tool for molecular urine analysis in patients, with great potential in reducing the number of unnecessary biopsies.
librio para los procesos de regulacin de la transcripcin gentica. Los mecanismos de regulacin transcripcional presentan una fenomenologa compleja y son de importancia extrema en el desarrollo celular de los organismos y en los procesos asociados a patognesis de enfermedades complejas. Comprender de qu manera funciona la regulacin de la expresin gentica a nivel energtico, resulta de suma importancia para construir redes regulatorias y tambin para conectar stas con fenmenos de mltiples escalas como el metabolismo, en un enfoque integrador del tipo de Biologa de Sistemas. En este proyecto analizamos 3 mecanismos simples de estmulo gentico, un pulso instantneo, una seal bioqumica peridica y un proceso de saturacin con una cintica sigmoidal del tipo MichaelisMenten y la respuesta irreversible que el sistema presenta en la forma de estallidos transcripcionales anmalos.
23
05 - Anlisis de variantes farmacogenmicas en la poblacin mexicana utilizando la plataforma de microarreglos dmet Laura I. Uribe-Figueroa, Alfredo Hidalgo-Miranda, Juan Carlos Fernandez-Lopez, Francisco Sanchez-Girn, Claudia Rangel-Escareo, Dan J. Gutierrez-Fuentes, Kevin Long2, Howard McLeod La farmacogenmica se define como el estudio de la variabilidad genmica interindividual y su relacin con la eficacia y seguridad de los tratamientos. En los pases desarrollados, ya se integran recomendaciones para la administracin de frmacos de acuerdo a caractersticas farmacogenmicas individuales1. Sin embargo, en los pases en desarrollo, la utilidad de los estudios farmacogenmicos se proyecta a largo plazo1. El proyecto PGENI (Pharmacogenomics for every nation initiative) es una iniciativa cuyo objetivo es generar los perfiles farmacogenmicos de los grupos poblacionales ms comunes en las naciones con una infraestructura de salud aceptable, pero que no cuenta con el presupuesto para incorporar la genotipificacin de sus pacientes en la practica clnica. Nuestro pas, participa en dicha iniciativa y se presentan algunos de los resultados del anlisis de un grupo de individuos de la poblacin mexicana.
07 - Fsica biolgica y analisis de expresin en la Regulacin Transcripcional en Cncer Karol Baca Lpez, Enrique Hernndez Lemus El cncer de mama constituye un problema de salud pblica y es la primera causa de incidencia (una de cada 10 mujeres) y mortalidad por cncer en la mujer adulta en nuestro pas. Nos encontramos ante un problema de gran magnitud para el que pocos han sido los avances de carcter preventivo y clnico debido a la complejidad de la patologa. Dicha complejidad surge en la descripcion del problema a nivel molecular o gentico, adems el gran nmero de factores ambientales. El anlisis de las interacciones bioqumicas relacionadas se basa frecuentemente en la consideracin de las relaciones de regulacin gentica. Puesto que la regulacin gentica es un proceso fuera del equilibrio, la inferencia y el anlisis de sta puede hacerse siguiendo los principios de la termodinmica irreversible y la mecnica estadstica fuera del equilibrio. El enfoque tradicional de la mecnica estadstica es inferir la distribucin de probabilidad conjunta para los estados del sistema en trminos de un modelo para las interacciones. Un problema inverso en mecnica estadstica consiste en considerar una realizacin de la distribucin de probabilidad y emplearla para inferir las interacciones entre las partculas. Tomamos este enfoque para analizar 261 experimentos de expresin de mRNA de genoma completo, en pacientes con cncer de mama y, a travs de una medida basada en la teora de la informacin descubrir el conjunto de interacciones transcripcionales asociadas. Mostramos cmo aplicar las herramientas de la fsica estadstica no-lineal para generar hiptesis (es decir, el conjunto de interacciones inferidas) que pueden ser probadas en ensayos clnicos y bioqumicos con relacin a la fenomenologa del cncer.
06 - Transporte hiperblico en Procesos de Regulacin Transcripcional Mara D. Correa Rodrguez, Enrique Hernndez En este trabajo estudiamos los fenmenos de memoria y transporte irreversible en un modelo de termodinmica fuera de equi-
que combinen el anlisis de alta resolucin con un anlisis estadstico astringente. Con el fin de identificar las alteraciones en el nmero de copias de DNA estadsticamente significativas en tumores de mama, analizamos el DNA de 100 muestras pareadas; usando la plataforma de microarreglos SNP 6.0 de Affymetrix.
24
10 - El perfil de expresin de 86 micrornas permite diferenciar entre tumores de mama y tejido mamario normal Romero-Cordoba S.L., Rodriguez-Cuevas S, Quintanar-Jurado V, Bautista-Pina V, Ciceron-Arellano I, Rebollar-Vega R.G., Jimenez-Sanchez G, Uribe-Figueroa L, Hidalgo-Miranda A. Las alteraciones en la regulacin de la expresin gnica, tanto de RNAs mensajeros como de microRNAs juega un importante papel en el desarrollo de los tumores mamarios. Las firmas moleculares basadas en la expresin de un nmero limitado de miRNAs son capaces de diferenciar tejido normal del tumoral y distinguir los fenotipos clinopatolgicos de los tumores de mama. En este trabajo analizamos los perfiles de expresin de microRNAs en tejidos mamarios sanos y los comparamos contra los de tejido tumoral, mediante el uso de una plataforma que permite evaluar un mayor nmero de microRNAs que otras plataformas reportadas. Este anlisis nos permiti identificar un grupo de microRNAs diferencialmente expresados cuyo papel en la carcinognesis mamaria no ha sido descrito.
09 - Anlisis de alta resolucin de alteraciones en el nmero de copias de dna en tumores de mama Rebollar, R., Rodrguez, S., Romero, S., Quintanar, V., Bautista, V., Cicern, I., Uribe, L., Hidalgo, A El cncer de mama representa la segunda causa de muerte relacionada con cncer en la poblacin femenina de Mxico. Un perfil especfico de alteraciones en el nmero de copias de DNA ha sido descritos en los tumores de mama, el cual se ha asociado a diversas variables clnicas y patolgicas. El anlisis de estas alteraciones en el nmero de copias de DNA se ha llevado a cabo con diferentes mtodos, incluyendo la hibridacin genmica comparativa y recientemente, a travs del uso de arreglos de oligonucletidos de alta densidad para genotipificacin de SNPs. El uso de una microarreglos con una mayor densidad, as como la introduccin de mtodos estadsticos para evaluar la significancia de las alteraciones en el nmero de copias, ha permitido la deteccin de genes especficos involucrados en el desarrollo de diversas neoplasias. Sin embargo, en el caso del cncer de mama, existen muy pocos estudios 11 - Anlisis de IL-1 en pacientes con leishmaniasis cutnea localizada y difusa Edith Fernndez-Figueroaa, Valeria Espinosa-Mateosb, Norma Salaiza-Suazoa, Karol Carrillo-Snchezb, Valeria QuintanarJuradob, Santiago March-Mifsutb, Claudia Rangel-Escareob, Ingeborg Beckera. aDepartamento de Medicina Experimental, Facultad de Medicina, UNAM., bInstituto Nacional de Medicina Genmica. Leishmania mexicana es el parasito causante de la leishmaniasis cutnea localizada (LCL) y difusa (LCD), cada ao se diagnostican en nuestro pas 400 casos nuevos. Poco es lo que se sabe acerca de la inflamacin y su papel en esta enfermedad. En este trabajo se analiz la susceptibilidad de pacientes con LC a travs del anlisis de SNPs (IL-1 (-511), CXCL8 (-251) e IL-1RA 2018) en 58 pacientes mestizos mexicanos con LCL, 6
pacientes de DCL y 123 controles. Tambin se analiz la produccin in vitro de IL-1 en monocitos y en lesiones de ambos grupos de pacientes. Nuestros resultados muestran resultados estadsticamente significativos en el SNP para IL-1 (-511 C / T) entre pacientes y controles (OR= 3.23, IC del 95% (= 1.2, 8.7) y p-value = 0,0167), adicionalmente, la produccin de IL-1 en monocitos y en lesiones de los pacientes se correlaciona directamente con la gravedad de la enfermedad, siendo el ms alto en los pacientes de LCD gravemente infectados con Leishmania mexicana. Estos datos sugieren que la citocina pro-inflamatoria IL-1, esta posiblemente, jugando un papel importante en la susceptibilidad a la enfermedad y an est por establecerse si esto se relaciona con una respuesta inflamatoria exacerbada en estos pacientes.
13 - Variaciones en el nmero de copias de TLR8 pero no de TLR9 se asocian a la susceptibilidad a desarrollar Lupus Eritematoso Sistmico en poblacin peditrica mexicana Rafael Velzquez Cruz1, Humberto Garca Ortiz1, Francisco Espinosa Rosales2, Vicente Baca3, Lorena Orozco1. 1Laboratorio de Enfermedades Multifactoriales, INMEGEN. 2Servicio de Inmunologa Instituto Nacional de Pediatra. 3Hospital de Pediatra CMN Siglo XXI, IMSS. SS. Introduccin: Los receptores Toll-like (TLR) juegan un papel clave en la respuesta inmune innata, de los cules TLR7 y TLR8 reconocen molculas de RNA derivadas de virus y TLR9 molculas de DNA. No obstante, estos receptores tambin son capaces de reconocer cidos nucleicos endgenos contenidos en complejos inmunes y pueden contribuir en el desarrollo de autoinmunidad. Recientemente demostramos que variaciones en el nmero de copias (CNVs) del gen TLR7 se asocian con el riesgo a desarrollar lupus eritematoso sistmico (LES) peditrico, probablemente a travs de la induccin de la expresin de IFN-. Objetivo: El objetivo del presente estudio fue determinar si CNVs de TLR8 y TLR9 se encuentran asociadas al desarrollo de LES en la poblacin peditrica mexicana. Material y Mtodos: Se incluyeron un total de 328 pacientes con diagnstico de LES antes de los 16 aos de edad, 269 (82%) fueron femeninos y 59 (18%) masculinos. Como grupo control se incluyeron 403 individuos sanos (85% femeninos y 15% masculinos). La cuantificacin del nmero de copias (NC) se llev a cabo por PCR en tiempo real utilizando dos pares de oligonucletidos especficos para TLR8 y TLR9 y dos genes endgenos como controles. As mismo, se midieron los niveles de expresin de TLR8, TLR9 e IFN en una muestra de 31 pacientes con LES con nmero conocido de copias. Alternativamente, se evalu la actividad de IFNa en un modelo in vitro estimulando clulas Wish con suero de pacientes y midiendo los niveles de expresin de tres genes especficamente inducidos por IFNa (MX1, PKR e IFIT1). Resultados: Los pacientes mostraron un incremento significativo en el NC de TLR8 cuando se compararon con el grupo control (P=0.0065) en cambio, no se observaron diferencias significativas en el NC de TLR9 entre los casos y los controles (P=0.529). Sin embargo, cuando se estratific por gnero, slo el grupo de pacientes femeninos mostr diferencias significativas en el NC del gen TLR8 cuando se compar con los controles femeninos (P=0.0008). La presencia de ms de 2 copias del gen TLR8 (3 a 5) confiri un OR de 1.66 (95% I.C. = 1.39-1.98) en el grupo femenino. Por otra parte, se encontr una correlacin altamente significativa con el NC y los niveles de mRNA de TLR8 (P= 0.002, r=0.55) y TLR9 (P=0.0001, r=0.65); sin embargo, slo los niveles de expresion de TLR8 correlacionaron con los niveles de expresin de IFN-a (p=0.017 , r=0.49) y su actividad (p=0.008, r=0.54). Conclusiones: Nuestros resultados muestran que la dosis gnica de TLR8 pero no la de TLR9 es un factor de riesgo para el desarrollo de LES peditrico y sugieren que el mecanismo es a travs de la induccin de IFN-a.
25
12 - Anlisis e identificacin de protenas diferencialmente expresadas en sueros de pacientes con leishmaniasis cutnea localizada y difusa Edith Fernndez-Figueroaa, Karla Caldern-Gonzlezb, Isabel Ruiz-Olmedob, Claudia Rangel-Escareob, Ingeborg Becker-Fausera, Juan Pablo Reyes-Grajedab. aDepartamento de Medicina Experimental, Facultad de Medicina, UNAM., b Instituto Nacional de Medicina Genmica. La leishmaniasis cutnea (LC) incluye diferentes manifestaciones clnicas dando lugar a diversas intensidades en el infiltrado inflamatorio drmico. En Mxico la LC puede presentarse en dos formas clnicas polarmente opuestas: la localizada (LCL) y la difusa (LCD). Pacientes con LCL presentan una intensa respuesta inmune celular, que limita al parsito al sitio de la picadura de la mosca transmisora, mientras que pacientes con LCD presentan una anergia de la respuesta inmune celular especfica contra el parsito, permitiendo la propagacin del mismo a toda la piel, formando ndulos que contienen abundantes macrfagos intensamente parsitados. Experimentos realizados en nuestro laboratorio con clulas NK y monocitos de pacientes analizando diferentes protenas (citocinas, receptores y factores de transcripcin) demuestran que existen diferencias en la expresin de las mismas en cada grupo de pacientes. El objetivo de este trabajo es analizar el perfil e identificacin de protenas mediante geles 2D y espectrometra de masas utilizando sueros de ambos grupos de pacientes y controles del estado de Tabasco. Los resultados preliminares muestran que existen protenas diferencialmente expresadas entre los grupos de casos y controles, entre ellas se identificaron protenas involucradas en la inflamacin como: Apolipoprotena AI y AII, Haptoglobina y C3 y C4 del sistema de complemento.
15 - Sub-cellular Proteomic Analysis in Breast Cancer Gutierrez-Najera N., Alvarado-Nuo A., Calderon-Gonzalez K., Cruz J. L., Gallegos J. L., March S. and Jimenez-Sanchez G. Department of Medical Proteomics, National Institute of Genomic Medicine (INMEGEN). In breast cancer, genetic alterations lead to abnormal expression patterns, as well as changes in the structure and function of proteins involved in several pathways. We used a proteomic approach to identify differences in protein profiles aiming to identify potential disease biomarkers. We studied protein profiles of cell cultures from adenocarcinomas by DIGE (Differential in Gel Electrophoresis). We obtained total protein extracts from human MCF-7 , Hs578t and Hs578Bst (normal breast epithelium). Also soluble and membrane proteins were extracted by differential centrifugation and separated by DIGE. Proteins were identified by mass spectrometry. Our results indicated that 77% of the spots found by 2D-gel in normal breast tissue did not show any change compared to cancer. We identified differential proteins between cancer and normal breast and we found 17 proteins in membrane fraction and 4 in soluble fraction. The use of subcellular fractionation in order to find breast cancer biomarkers is a useful strategy in proteomics of cancer.
26
16 - Potential biomarker in breast cancer derived from proteomic analysis: biochemical caracterization of pyruvate-kinase M2 (PK-M2) Daz-Tufinio, Carlos Alejandro, Cruz-Coln, Jos Luis, GallegosPerez Jos Luis, Calderon-Gonzlez Karla, Gutirrez-Njera, Nora Andrea Medical Proteomics Unit, National Institute of Genomic Medicine, Mexico Breast cancer is one of the main feminine death causes in Mexico. In this study after a comparative proteomic analysis in differential two-dimensional gel electrophoresis (DIGE) of three pure breast cancer cell lines (MCF7 , Hs578t, MDA-MB23), we identified pyruvate-kinase M2 isozyme (PK-M2). We performed biochemical characterization of this enzyme.We achieved yields greater than 80% of the enzyme in chromatography purification steps, as well as fractions with purity factors about 50. With the addition of fructose-1,6-diphosphate (F-1,6-dP), we induced an increase of the PK activity. With this, we confirmed the effect, already reported in the literature, PK-M2 tetramerization and an increased enzymatic activity in presence of high F-1,6-dP concentration, a common molecular mechanism in advanced cancer stages.
17 - Estudio protemico de los cambios en fosforilacin y glicosilacin en cncer de mama Merino-Vaquero J. C.c, Cruz-Coln J. L.a, Mendoza-Hernndez G.b, Quintanar-Jurado V.a y Gutirrez-Njera, N.a aInstituto Nacional de Medicina Genmica, bDepartamento de Bioqumica, c Facultad de Qumica, Universidad Nacional Autnoma de Mxico En la actualidad las tasas de mortalidad por cncer de mama son altas. Se han observado cambios en la fosforilacin y en la N-glicosilacin de protenas durante el desarrollo del cncer. El objetivo de este trabajo fue encontrar protenas que en cncer de mama se modifican por fosforilacin o glicosilacin. Utilizamos clulas de cncer de mama, las lneas Hs578t, MCF7 , MDAMB231 y de mama normal, Hs578BsT. De stas se extrajeron protenas de fracciones celulares y se comparararon a travs de su separacin por electroforesis. Del anlisis de los geles de la electroforesis se seleccionaron bandas y stas se identificaron espectrometra de masas. Entre las protenas identificadas como fosforiladas estn la piruvato cinasa, la citoqueratina 9 y la isoforma 2 de la actina y de las glicosiladas VLA-3, CD44E, el precursor de la reticulocalbina-1 y la citoqueratina 9.
identificaron 6 protenas que se presentaron como incrementadas en estos sueros y al menos unas 20 protenas del anlisis con el microarreglo de anticuerpos cuyos niveles cambiaron en sueros de cncer de mama. Estas protenas podran ser candidatas a detectarse en estudios de diagnstico temprano.
19 - Implementacin de la plataforma MALDI-IMAGING en cerebro de ratn Caldern-Gonzlez K.G.*1, Regalado-Santiago D.J.*1, 2, LpezLuna A.2, Monroy Nez G. Y.1,3 Quintanar-Jurado V.1, PrezCarren J. I.1, Gimeno M.2, Brzana E.2, Villanueva-Gonzlez P.2, Gallegos-Prez J. L.1 1Instituto Nacional de Medicina Genmica, 2Facultad de Qumica, Universidad Nacional Autnoma de Mxico, 3Facultad de Qumica, Universidad Autnoma de Baja California. *Ambos autores contribuyeron de igual forma en este trabajo. Matrix Assisted Laser Desorption/Ionization-Imaging Mass Spectrometry (MALDI-IMS), es una poderosa herramienta para investigar la distribucin de protenas y pequeas molculas dentro de sistemas biolgicos a travs del anlisis in situ de tejidos. Cientos de pptidos y protenas pueden ser simultneamente mapeados en un tejido con una resolucin de aproximadamente 30 a 50 m. La intensidad de cada seal genera un mapa de los compuestos presentes sobre la superficie. El objetivo de este trabajo fue implementar MALDI-IMS y optimizar la aplicacin de la matriz sobre cerebro de ratn para obtener ptimas seales de espectros de masas. Los resultados mostraron que la deposicin de la matriz por sublimacin presenta una adecuada distribucin de la misma sobre el tejido, favoreciendo la deteccin de masas correspondientes a molculas de naturaleza lipdica.
27
18 - Deteccin de biomarcadores para diagnstico de cncer de mama en muestras de suero por tcnicas protemicas Roman-Tamez M.2, Quintanar-Jurado V.1, Hernndez-Lemus E.1, Mojica-Espinosa R.1, Tirado-Gmez L.3, Antonio-Urrutia G.2, Mendoza-Hernndez G6, Ramrez-Salcedo J.5, Bargallo-Rocha E.4 y Gutierrez-Najera N2. 1Instituto Nacional de Medicina Genmica, 2Facultad de Qumica, 3Coordinacin de Proyectos Especiales, Facultad de Medicina, 4Departamento de Tumores Mamarios. Instituto Nacional de Cancerologa 5Instituto de Fisiologa Celular, Universidad Nacional Autnoma de Mxico, 6Departamento de Bioqumica, Edificio de investigacin 2. Piso, Facultad de Medicina, Universidad Nacional Autnoma de Mxico, Ciudad Universitaria Un alto porcentaje de los casos en cncer de mama se diagnostican a una etapa tarda. Debido a esto se buscan nuevos biomarcadores que podran ser especficos para esta enfermedad. Este trabajo tiene como objetivo establecer un proceso de descubrimiento de biomarcadores de cncer de mama en suero. Se realiz la extraccin de protenas de suero, stas se separaron por electroforesis diferencial en geles 2D (DIGE) y se identificaron por espectrometra de masas. Tambin se analizaron en microarreglo de anticuerpos para protenas de la va de p53. De aqu se
20 - Farmacocintica de la administracin conjunta de albendazol y nitazoxanida en plasma y lquido cefalorraqudeo. Ruiz-Olmedo Mara-Isabel1,2, Franco-Prez Javier3, GonzlezHernndez Iliana3, Ruiz-Ramrez Moiss4, Gallegos-Prez Jos Luis2, Jung-Cook Helgi1,3 1Universidad Nacional Autnoma de Mxico, 2Instituto Nacional de Medicina Genmica, 3Instituto Nacional de Neurologa y Neurociruga, 4Escuela TominagaNakamotokamoto El albendazol es un frmaco ampliamente utilizado en el tratamiento de la neurocisticercosis. Se sabe que presenta una baja solu-
28
21 - Desarrollo y validacin de un mtodo analtico para la cuantificacin de tizoxanida en plasma por HPLC Ruiz-Olmedo Mara-Isabel1,2, Caldern-Gonzalez Karla-Grisel2, Gallegos-Prez Jos-Luis2, Jung-Cook Helgi1,3 1Universidad Nacional Autnoma de Mxico, 2Instituto Nacional de Medicina Genmica, 3Instituto Nacional de Neurologa y Neurociruga
La Nitazoxanida (NTZ) es un frmaco antihelmntico de amplio espectro que al ser administrado se metaboliza a Tizoxanida (TZO) metabolito que ha demostrado actividad cestocida contra cisticercos de Taenia crassiceps. Se cree que los efectos antiparasitarios de este frmaco, son debidos a la interferencia con la piruvato ferrodoxin oxido reductasa enzima que interfiere con la va energtica del parsito. Estudios in vivo han demostrado que la administracin conjunta con el Albendazol (ABZ), frmaco administrado por excelencia en el tratamiento contra la neurocisticercosis, podra llegar a eliminar hasta el 98% de cisticercos de la cepa parasitaria ya mencionada. Debido a que el ABZ presenta una alta variabilidad interindividual, es necesario continuar con la bsqueda de tratamientos seguros y efectivos para esta enfermedad. El presente trabajo tiene como enfoque principal desarrollar y validar un mtodo que permita la cuantificacin de TZO en plasma para poder desarrollar estudios preclnicos de la conjuncin de ABZ y NTZ. Para el desarrollo y la validacin de este mtodo se utiliz un equipo marca Waters-Alliance 2690 con bomba cuaternaria y detector UV-Vis 2996 con arreglo de diodos. La cromatografa se llev a cabo en una columna X-Terra C18 (250mm x 4.6mm con d.i. 5m), con una fase mvil ternaria de MeOH:ACN:KH2PO4 pH 5.7;50mM con un gradiente acuoso-orgnico (90:10 a 10:90) a flujo de 0.4 mL/min y longitud de onda de 416 nm. El estndar interno utilizado fue la nifuroxazida, que present un tiempo de retencin de 18 min y en el caso de TZO fue de 23 min. Para el tratamiento de la muestra se realiz una precipitacin de protenas con ACN a 200 L de frmaco adicionado a plasma y una inyeccin de 100 L de solvente orgnico fue inyectado al sistema cromatogrfico Este mtodo analtico fue validado segn la NOM-177-SSA-1998 (linealidad, exactitud, precisin, especificidad, recobro y estabilidad a corto y largo plazo) en plasma de rata y se verifico su reproducibilidad en muestras de plasma humano. Adems, muestras de un estudio farmacocintico (FC) a dosis nica de 7 .5 mg/Kg de NTZ en un modelo de rata fueron analizadas. El promedio de recobro fue de 103 % para los tres puntos control (70, 400 y 1000 ng/mL). El mtodo fue especfico tanto para muestras de plasma de rata como de humano. Es lineal en un rango de concentraciones de 0.01 a 1280 g/mL y presenta una R 2 de 0.9997 . Demostr ser preciso y exacto con un coeficiente de variacin no mayor al 8% y una desviacin absoluta no mayor al 7 .8 % para cada punto control; el lmite de cuantificacin es de 10 ng/mL y las muestras son estables tanto a corto como a largo plazo(45 das). Los parmetros FC del estudio realizado fueron: Cmax 258 ng/mL, Tmax 0.25 h, AUC de 450.13 ng*mL/h y un tiempo medio de residencia de 2.31 h ajustado a un modelo no compartimental. El mtodo desarrollado es confiable y puede ser utilizado para cuantificar muestras de TZO en plasma provenientes de estudios FC y de monitoreo teraputico de humanos y animales.
22 - Desarrollo y validacin de un mtodo analtico para la cuantificacin de iohexol en plasma por cromatografa de lquidos de alta resolucin Vsquez-Bochm Luz-Xochiquetzalli1,2 , Reyes-Grajeda Juan-Pablo2 Ruiz-Olmedo Mara-Isabel1,2 1Universidad Nacional Autnoma de Mxico, 2Instituto Nacional de Medicina Genmica El Iohexol es un marcador radiolgico no inico, frmaco que despus de ser administrado va intravascular ms del 90% se elimina sin ser modificado por medio de la orina durante las primeras 24 horas. El corto tiempo de vida media de eliminacin y la baja unin a protenas que presenta le confieren propiedades farmacocinticas muy semejantes a la creatinina lo que permite utilizarlo como marcador de la depuracin renal. El presente trabajo tiene como objetivo desarrollar y validar un mtodo que permita la cuantificacin de Iohexol en plasma para poder analizar muestras de pacientes con dao renal de una institucin perteneciente al sistema nacional de salud. Para el desarrollo y la validacin de este mtodo se utiliz un equipo marca Waters-Alliance 2690 con bomba cuaternaria y detector UV-Vis 2996 con arreglo de diodos. La cromatografa se llev a cabo en una columna Spherisorb de 250 mm x 4.6 mm x 5 m a un flujo de 1 mL/min, con una longitud de onda de 245 nm y un gradiente de elucin de 98:2 a 50:50 en 15 minutos de H2O (0.1% TFA): acetonitrilo (v/v). El estndar interno utilizado fue Naproxeno, el cual present un tiempo de retencin de 22 minutos, y en el caso del Iohexol fue de 9.9 minutos para el primer ismero y 10.3 minutos para el segundo con un factor de resolucin mayor a 1 La muestra fue procesada utilizando una precipitacin de protenas con ACN (0.1% TFA) 2:1 con una posterior centrifugacin. Se inyectaron 100 L del sobrenadante al sistema previamente diluidos en una proporcin 10:90 (v/v) con H20 (0.1% TFA). Este mtodo analtico fue validado siguiendo los lineamientos que marca la Norma Oficial Mexicana 177 de la Secretara de Salud (recuperacin absoluta, linealidad, exactitud, precisin, especificidad y estabilidad a corto y largo plazo) en plasma humano. El promedio de recobro fue de 102 % para ambos ismeros en los tres puntos control (30, 140 y 800 g/mL). El mtodo es lineal en un rango de concentraciones de 10 a 1000 g/mL y presenta una r 2 de 0.998. Demostr ser preciso y exacto con un coeficiente de variacin no mayor al 3% y una desviacin absoluta no mayor a 10 % para cada punto control; el lmite de cuantificacin es de 10 g/mL y las muestras son estables tanto a corto como a largo plazo (30 das). El mtodo desarrollado es confiable y puede ser utilizado para cuantificar muestras de Iohexol en plasma humano.
23 - Evaluacin del uso de muestras incluidas en parafina para la bsqueda de biomarcadores protemicos Reyes Grajeda, J.P., Romero Romero, S., Lemus Minor, C., Castellanos-Tapia, L., Caldern-Gonzlez, K., Vera Cruz, S., Quintanar-Jurado, V., Rodrguez Dorantes, M., Gallegos-Prez, J.L., March, S. & Jimnez-Snchez. G. El tratamiento eficiente de diferentes enfermedades requiere de una deteccin e identificacin temprana de biomarcadores confiables en tejidos especficos. Descifrar la identidad qumica de biomarcadores protemicos es necesario si se desea tener pruebas cada vez ms eficientes, robustas y sensibles con la finalidad de detectar, monitorear e incluso encontrar nuevos blancos teraputicos.El anlisis protemico de muestras de tejido fijado en formaldehdo e incluidas en parafina puede darnos entrada a un extenso acervo de muestras clnicas bien caracterizadas a nivel histolgico y poco exploradas a nivel molecular. As, nosotros estamos interesados en la estandarizacin y la bsqueda sistemticade mtodos eficientes de extraccin de protenas (pptidos) para su identificacin por espectrometra de masas a partir de muestras incluidas en parafina en bsqueda de nuevos biomarcadores.
29
24 - Anlisis protemico del estrs oxidativo en un modelo de arteriosclerosis inducido por la dieta Juan Pablo Reyes, Lyssia Castellanos, Karla Grisel Caldern, Jos Luis Gallegos, Azucena Jimnez Corona, Abel Moreno, Gerardo Jimnez-Snchez, Jaime Mas Oliva. La arteriosclerosis es la principal causa de morbilidad en pases desarrollados y en nuestro pas ocupa la segunda causa de muerte. Esta es una enfermedad de etiologa multifactorial que involucra la interaccin de factores tanto genticos como medioambientales. En este aspecto la dieta, en especfico el aumento en las grasas saturadas, juegan un papel importante en la contribucin a la formacin de la placa arteriosclertica. En este estudio realizamos la bsqueda de patrones de expresin diferencial en un modelo animal de arteriosclerosis por mtodos protemicos en geles bidimensionales (DIGE) y espectrometra de masas.
utiliz para la intercruza (AcB55xA/J)F2. Los 90 individuos de la progenie con fenotipos ms extremos fueron genotipificados con marcadores para las regiones candidatas, encontrndose evidencia de ligamiento al fenotipo de restrictividad para los alelos de B6 en una regin de 5 cM localizada en el extremo proximal del cromosoma 2.
30
27 - Sobreexpresin de Hemo-oxigenasa 1 en clulas humanas HepG2 expuestas a arsnico F. Centeno, E. Crdova, E.M. Rojo de la Vega, J.L. Cruz, L. Orozco. Laboratorio de Enfermedades Multifactoriales, Instituto Nacional de Medicina Genmica La exposicin humana a arsnico es un importante problema de salud pblica en diferentes regiones donde se encuentran concentraciones elevadas del metaloide. La exposicin a arsnico se ha asociado a un incremento en el riesgo de varios tipos de cncer y lesiones no malignas en piel. Uno de los principales mecanismos de dao celular generado por la exposicin al arsnico es la generacin de estrs oxidativo. El factor de transcripcin Nf2 regula la expresin de genes que codifican para enzimas antioxidantes y detoxificantes. Se ha propuesto a la activacin de Nrf2 como un mecanismo importante contra el estrs oxidativo generado por arsnico, sin embargo no se ha definido la participacin de los diferentes genes dependientes de Nrf2, por lo que se evalu el papel de un gen altamente responsivo a Nrf2, la enzima Hemo-oxigenasa 1 (HO-1), en clulas HepG2. Se encontr una alta expresin del mensajero y de la protena de HO-1 despus de exposicin del cultivo celular a arsnico, en una forma dependiente de la dosis. Ensayos de gen reportero mostraron que la activacin de HO-1 refleja una alta activacin de su promotor en respuesta a arsnico. El silenciamiento y la sobreexpresin de Nrf2 indican que este factor de transcripcin tienen una participacin importante en la activacin de HO-1 por arsnico. Por otra parte, el silenciamiento de HO-1 incrementa la toxicidad inducida por arsnico, lo que sugiere que la induccin de la expresin de HO-1 a travs de Nrf2 es uno de los principales mecanismos de defensa celular en respuesta al dao inducido por el metaloide.
26 - Identificacin de loci asociados a resistencia a cisticercosis experimental murina: anlisis en el set de cepas recombinantes congnicas AcB/BcA y progenie de la intercruza con la cepa susceptible Rubn Ramrez-Aquino2, Anny Fortin3, Philippe Gros3, Edda Sciutto-Conde2, Gladis Fragoso-Gonzlez2, Irma AguilarDelfin*1. 1Laboratorio de Enfermedades Multifactoriales-INMEGEN, 2Departamento de Inmunologa-IIB/UNAM; 3Centre for the Study of Host Resistance, McGill University. El grado de permisividad al crecimiento del parsito Taenia crassiceps en el peritoneo del ratn es un rasgo cuantitativo que se expresa diferencialmente en cepas singnicas. El fenotipo de restrictividad al parsito se evalu en un conjunto de 36 cepas congnicas recombinantes desarrolladas por el CSHR a partir de A/J y C57BL/6, que han sido genotipificadas para 625 microsatlites. Se definieron dos regiones en los cromosomas 2 y 6 con evidencias de ligamiento a partir del patrn de distribucin de marcadores. La cepa AcB55, que mostr los ms altos niveles de restrictividad de entre las lneas en las que 7/8 del genoma corresponden al de la parental susceptible A/J, se
28 - Expresin de Yin Yang 2 en el cncer de ovario Alejandra Beatriz Cervantes Garduo, Magali Espinosa, Jorge Melndez Zajgla, Vilma Maldonado Lagunas INCan, Ma. Delia Prez Montiel INCan En Mxico, el cncer de ovario ocupa el tercer lugar en mortalidad y el segundo lugar en frecuencia de las neoplasias ginecolgicas. El cncer de ovario es una enfermedad que se diagnostica en etapas avanzadas, por lo tanto es necesario encontrar nuevos marcadores moleculares que permitan un manejo adecuado de esta enfermedad. Las protenas Yin Yang intervienen en diferentes procesos normales y tumorognicos de las clulas. Estos factores regulan diversos genes que participan en procesos como apoptosis, proliferacin, metstasis, carcinogensis, entre otros. La protena Yin Yang 2 (YY2) es un factor de transcripcin que regula la expresin de genes que participan en la regulacin del ciclo celular, tumorogensis, por lo tanto, la protena YY2 podra servir como marcador pronstico en el cncer de ovario. En el presente proyecto se analiz la expresin de YY2 en el cncer de ovario por medio de microarreglos de tejidos. Metodologa. Se analiz la expresin de YY2 en muestras de cncer de ovario por medio de microarreglos de tejido. El anlisis de la expresin se hizo con inmunohistoqumica. Y el anlisis bioestadstico se hizo con el programa Stata. Resultados. YY2 tuvo una expresin significativa en las muestras de tipo seroso y est asociada al subtipo seroso del cncer de ovario. Conclusiones En el proyecto se analiz la expresin de YY2 en muestras de cncer de ovario de diferentes subtipos. En el anlisis se observ que la expresin de YY2 est asociada al subtipo histolgico seroso en 80% de los casos. Este subtipo de cncer el de peor pronstico y el ms agresivo, por lo tanto la expresin de YY2 podra ayudar a diagnosticar este tipo de cncer o para determinar el tipo de tratamiento que se la dar a las pacientes.
Actualmente alrededor del 70% de los mexicanos adultos cursa con sobrepeso u obesidad y la prevalencia de sta en la poblacin infantil es la ms alta descrita a nivel mundial, lo que hace de esta entidad un importante problema de Salud Pblica. Se ha demostrado que polimorfismos de un slo nucletido (SNPs) de genes que codifican para protenas involucradas en la regulacin del gasto energtico, particularmente el gen que codifica para el receptor beta adrenrgico 2 (ADRB2), estn fuertemente involucrados en la fisiopatologa de esta enfermedad. El objetivo de este trabajo es determinar si SNPs del gen ADRB2 se asocian a la susceptibilidad a padecer obesidad en poblacin mexicana. Se realiz un estudio de asociacin en 544 pacientes con obesidad (ndice de masa corporal: IMC >30 kg/m2) y 360 controles con un IMC entre 20-25 kg/ m2, reclutados de tres instituciones del ISSSTE, en la Ciudad de Mxico. Se analizaron cinco polimorfismos del gen ADRB2 mediante discriminacin allica por el mtodo TaqMan. El equilibrio de Hardy Weinberg (HWE) y asociacin de los SNPs y haplotipos fueron evaluados por los paquetes FINETTI, Haploview y EPIINFO, respectivamente. La distribucin de los genotipos en pacientes y controles se observaron en HWE. Al comparar las frecuencias allicas y genotpicas entre casos y controles de los 5 polimorfismos analizados en el gen ADRB2, no se observaron diferencias estadsticamente significativas. En contraste, se encontraron 4 haplotipos que confieren un alto riesgo a padecer obesidad con ORs que van desde 8.44 a 10.19. Nuestros resultados sugieren la presencia de 4 haplotipos en el gen ABRB2 que confieren un alto riesgo a padecer obesidad en poblacin mexicana; todos ellos con valores de OR entre los ms altos descritos a la fecha para esta entidad.
31
29 - Haplotipos en el receptor beta-2-adrenrgico confieren un alto riesgo para desarrollar obesidad en la poblacin mexicana Saldaa-Alvarez Y1, Salas-Martnez MG1,2, Jimnez-Morales S1, Luckie-Duque A3, Garca-Crdenas G4, Vicenteo-Ayala H5, Carnevale-Cantoni A1 y Orozco L1,2. 1Lab. de Enfermedades Multifactoriales-INMEGEN, 2 Posgrado en Ciencias Genmicas,UACM. 3Hospital Regional 1 de Octubre, ISSSTE. 4Clnica de Diagnstico Autorizado, ISSSTE, 5Hospital Regional Adolfo Lpez Mateos, ISSSTE.
30 - Abordaje genmico del asma en poblacin peditrica mexicana Jimnez-Morales Silvia1, Jimnez-Ruz Juan Luis1, HuertaMagaa Ivan2, Lpez-Ley Diana Y2, Gamboa-Becerra R2, Del Ro-Navarro Blanca Estela3, Martnez-Aguilar Nora Ernestina1, Saldaa-lvarez Yolanda1, Gmez-Vera Javier4, EscamillaGuerrero G5, Orozco Lorena1,2. 1Lab. de Inmunogenmica y Enfermedades Metablicas, INMEGEN, SS; 2Posgrado en Ciencias Genmicas, Universidad Autnoma de la Ciudad de Mxico ; 3Servicio de Alergia, Hospital Infantil de Mxico, SS; 4 Servicio de Alerga, Hospital Regional Adolfo Lpez Mateos, ISSSTE; 5Banco de Sangre, Instituto Nacional de Pediatra. e-mail: lorozco@inmegen.gob.mx Introduccin: El asma es una de las enfermedades crnicas de las vas respiratorias ms comn en nios, de hecho algunos estudios epidemiolgicos estiman que la prevalencia de la enfermedad en la poblacin infantil mexicana puede ser hasta del
32 - Asociacin del marcador gentico de hipersensibilidad a abacavir HLA-B*5701 con HCP5 rs2395029(G) en mestizos mexicanos Francisco Snchez-Girn*, Beatriz Villegas-Torres, Karla Jaramillo-Villafuerte, Irma Silva-Zolezzi, Juan Carlos Fernndez-Lpez, Gerardo Jimnez-Snchez..Instituto Nacional de Medicina Genmica (INMEGEN) Los portadores del alelo HLA-B*5701 tienen un riesgo elevado de desarrollar hipersensibilidad a abacavir (HA). El tamizaje gentico prospectivo de HLA-B*5701 disminuye grandemente o elimina la (HA). En caucsicos, el alelo HCP5 rs2395029(G) est en desequilibrio de ligamiento (DL) completo con HLAB*5701 (R2=1). Para evaluar la frecuencia del HLA-B*5701 y su DL con el alelo HCP5 rs2395029(G), genotipificamos el panel de 300 mestizos mexicanos del Proyecto de la Diversidad Genmica de los Mexicanos (PDGM). La genotipificacin de HLA-B*5701 se hizo por un mtodo de secuenciacin. El HCP5 rs2395029(G) se genotipific con un ensayo TaqMan SNP y se confirm por secuenciacin directa. De la base de datos del PDGM se extrajeron los genotipos de 14 SNPs dentro de la regin del HCP5, se pusieron en fase y se analizaron para caracterizar mejor la estructura del DL. La prevalencia de portadores de HLA-B*5701 fue de 2.0% y la frecuencia allica fue de 0.010. El anlisis de haplotipos mostr que en los mestizos mexicanos el HLA-B*5701 y el alelo HCP5 rs2395029(G) estn en DL completo (r2=1) La genotipificacin de un solo SNP es mas fcil, de menor costo y tiempo de proceso comparado con la secuenciacin. Estos resultados hacen posible tener un programa de farmacogentica de tamizaje prospectivo basado en la genotipificacin del SNP rs2395029 para prevenir la HA en pacientes mexicanos que iniciarn tratamiento con abacavir.
32
31 - Secuenciacin de Nueva Generacin en plataforma SOLiD: Estandarizacin, aplicaciones y abordajes con bibliotecas de Fragmentos y Mate Pair Miranda-Ortz Haydee, Hernandez-Morales Jos Salvador y Carrillo-Sanchez Karol La estandarizacin de protocolos para secuenciacin de nueva generacin en el INMEGEN inici en abril del 2010 en la plataforma SOLiD de Applied Biosystems. Hasta la fecha se han estandarizado 2 tipos de bibliotecas: Fragmentos y Mate Pair, en este trabajo se describen las caractersticas de ambas bibliotecas, sus principales aplicaciones, el abordaje que se utiliz para cada una y la capacidad que posee el equipo SOLiD V4. 33 - Estrategia Integral para la Identificacin de Biomarcadores del Cncer de Hgado Julio Isael Prez Carren1*, Julia Torres Mena1, Ricardo Snchez Rodrguez1, Mnica de la Luz Cruz1, Gloria Bernal Ramos1, Valeria Quintanar Jurado1, Karol Carrillo Snchez1, Salvador Hernndez Morales1, Haydee Miranda Ortz1, Juan Pablo Reyes1, Karla Caldern Gonzlez1, Laura Uribe Figueroa1, Ral Mojica Espinosa1, Nelly Patio Uriostegui1, Rebeca Garca Romn2, Victoria Chagoya3, Sal Villa Trevio4 y Jorge Melndez Zajgla1. 1INMEGEN, 2UV, 3IFC-UNAM, 4CINVESTAV Objetivo: La identificacin de biomarcadores del cncer de hgado es relevante para generar mtodos de tratamiento y/o diagnstico temprano de la enfermedad y as disminuir la eleva-
da mortalidad. Metodologa: Con un equipo multidisciplinario de investigacin, abordamos el estudio del cncer heptico en dos perspectivas: 1) Descubrimiento; en modelos animales de hepatocarcinognesis identificamos cambios moleculares, del transcriptoma y del proteoma, en las lesiones nodulares (pretumores) y en el hepatocarcinoma temprano. 2) Validacin; en muestras de pacientes con enfermedades hepticas exploramos la presencia de aquellos posibles cambios moleculares derivados de la investigacin en los modelos animales. Resultados: Los modelos en animales recapitulan la progresin del cncer de hgado de forma muy similar a como ocurre en el ser humano, con la ventaja de poder estudiar las lesiones tumorales tempranas. Con las muestras experimentales estamos investigando el transcriptoma y se ha esclarecido lo relevante que es el perfil de expresin de genes de varias rutas metablicas relacionadas a la S-Adenosilmetionina. Investigando parte del proteoma, identificamos varias protenas, involucradas en el metabolismo de xenobiticos, que se expresan abundantemente en los tumores. Con las muestras clnicas desarrollamos microarreglos de tejido que nos apoyarn en la validacin de los biomarcadores candidato. Conclusin: La investigacin integral del genoma, el transcriptoma y el proteoma utilizando la tecnologa de vanguardia del Inmegen acelera el descubrimiento de biomarcadores del cncer. La investigacin multidisciplinara y en equipo con un enfoque integral sobre la patologa promete oportunidad de xito en la investigacin.
como Marcadores Informativos de Origen Ancestral o AIMs. El Instituto Nacional de Medicina Genmica (INMEGEN) cuenta como parte del Proyecto de Diversidad Genmica de Mexicanos (PDGM) con una base de datos amplia (>1milln de variantes genticas tipo SNP) acerca de la variabilidad gentica de poblaciones mestizas e indgenas de Mxico, y cuenta tambin con la plataforma de anlisis genmica Illumina, lo que nos enfrenta a la posibilidad de disear un panel de AIMs ptimo para correccin de estratificacin poblacional en mexicanos. El objetivo principal es generar un panel de 384 marcadores de origen ancestral (AIMs por sus siglas en ingls) para la correccin de estratificacin poblacional en estudios de asociacin gentica para el desarrollo de un microarreglo de genotipificacin de mediana capacidad.
33
35 - Sobreexpresin de Protenas susceptibles al diseo de frmacos. Montoya Gama, K.P., Reyes-Grajeda, J.P. , Uribe Figueroa, L. Resumen: En abril del 2009, una nueva cepa virulenta de la gripe infecto a miles de personas en Mxico y los Estados Unidos y se extendi rpidamente por todo el mundo, declarndose como pandemia por la Organizacin Mundial de la Salud el 11 de junio del mismo ao. As, para poder enfrentar un problema de tal envergadura, es necesaria la rpida produccin de vacunas a escala masiva, ya que sta es la manera ms efectiva hasta la fecha para prevenir la morbilidad y mortalidad a gran escala. Sin embargo, el proceso tradicional de produccin de vacunas contra influenza es un proceso lento y laborioso por lo que no cumple con los requerimientos globales de vacunacin para reducir una pandemia de influenza. Basados en estas premisas nosotros nos hemos enfocado mediante tcnicas moleculares a la clonacin y sobreexpresin de la protena Hemaglutinina (HA) del virus de la influenza AH1N1, el cual es el principal antgeno de superficie del virus, pudiendo as usarse como blanco teraputico y/o para el diseo de nuevos frmacos.
34 - Diseo de un panel de marcadores genticos para la correccin de estratificacin poblacional en estudios de asociacin en poblaciones mestizas mexicanas M. en. C. Juan Carlos Fernndez Lpez, Dra. Irma Silva Zolezzi, Dra. Claudia Rangel Escareo Recientemente los estudios de asociacin de genoma completo (GWAS, por sus siglas en ingls) han acelerado el progreso en la bsqueda de variaciones genticas subyacentes a la herencia y desarrollo de rasgos y enfermedades complejos, tales como obesidad, diabetes, hipertensin, cncer, entre otras . Una de varias fuentes de resultados falsos positivos en estudios de asociacin gentica es la estratificacin poblacional. Diversos anlisis de estructura gentica poblacional han demostrado que los grupos continentales pueden ser identificados si se examinan las diferencias en la frecuencia allica de variantes genticas, as como la existencia de miles de marcadores tipo SNP distribuidos a lo largo del genoma con diferencias muy grandes en frecuencia entre estos grupos, los cuales se conocen
34
37 - EXPRESION DIFERENCIAL DE miRNAS EN PACIENTES CON HIPERPLASIA PROSTTICA BENIGNA Y CNCER DE PRSTATA Alberto Ivn Salido Guadarrama1, Haydee Miranda Ortiz1, Gustavo Morales Montor2, Dorian Saavedra Briones2, Mauricio Rodrguez Dorantes1. 1 Instituto Nacional de Medicina Genmica, 2 Hospital General Dr. Manuel Gea Gonzles El cncer de Prstata (CaP) es la segunda causa de muerte debida a neoplasia en pases industrializados. En Mxico, ~40% de los hombres entre 60 y 69 aos sufren de este padecimiento. A la fecha, el antgeno prosttico especfico (PSA) sigue siendo el nico marcador molecular empleado como indicador en la identificacin y manejo de pacientes con CaP; a pesar de su alta sensibilidad, el PSA presenta una baja especificidad. Es por ello que se tiene la necesidad de encontrar nuevos marcadores que permitan diferenciar la hiperplasia prosttica benigna (HPB) del CaP para disminuir las tasas de falsos positivos y mejorar la deteccin temprana. Se ha establecido la importancia del papel crucial de los microRNAs (miRNAs) y las consecuencias de su alteracin en la progresin del cncer. Estudios recientes han revelado que es posible clasificar diferentes tipos de tumor
con base en su perfil particular de microRNAs. El objetivo de este estudio es evaluar la utilidad potencial de miRNAs en orina como posibles indicadores de la enfermedad prosttica. Se colectaron 36 muestras de orina provenientes de pacientes con diagnostico positivo de CaP o HPB (hiperplasia prosttica benigna) obtenidas despus de la aplicacin de examen recta digital (DRE). Se realiz la extraccin de RNA total, haciendo uso del kit RNAeasy kit (Quiagen Inc.) de acuerdo a las instrucciones del fabricante. La concentracin de RNA se determin por espectrofotometra a 260 nm, utilizando el equipo Nanodrop1000. Se realizaron reacciones de RT y de pre-amplificacin. La cuantificacin relativa de miRNAs se llev a cabo por PCR en tiempo real y el arreglo TaqMan low density array (TLDA) (Applied Biosystems Inc.) que permite medir la expresin simultanea de 667 miRNAs. Pare al anlisis de datos y estadstico se utilizaron, el software DataAssist v 1.0 y Bioconductor. La cuantificacin relativa de miRNAs se determino mediante el mtodo comparativo de Ct (2-Ct). Las diferencias con un valor-p <0.05 se consideraron como estadsticamente significativos. Despus de normalizar los datos de Ct, utilizando como controles endgenos, se realizo una prueba t para encontrar diferencias significativas en la expresin de microRNAs entre el grupo de CaP y el de HPB. Identificamos un grupo de 21 microRNAs diferencialmente expresados, con un valor-p= 0.05. De este conjunto, hsa-miR-150 y hsa-miR-328 se encuentran subexpresados y el resto est sobre-expresado. Particularmente hsamiR-184 ha sido reportado previamente como sobre-expresado en perfiles de expresin de miRNAs en CaP. Otro ejemplo es hsa-miR-100, tambin sobre-expresado en circulacin, como lo reporta Mitchell et.al. 2008. La familia de microRNAs hsa-let7 estn relacionados con actividad supresora de tumores en condiciones fisiolgicas normales y han sido reportados como subexpresados en Cap. De manera interesante, nosotros encontramos una regulacin a la alta de varios miembros de la familia hsa-let7 (let-7b-c-d-e). Un agrupamiento jerrquico supervisado muestra que el perfil de 21 miRNAs seleccionados permite realizar una separacin adecuada entre las 3 muestras del grupo de CaP y las 3 del grupo de HPB. Estos resultados, reflejan el potencial uso de miRNAs obtenidos de muestras de orina como elementos de una firma molecular que permita distinguir a los individuos en riesgo de sufrir de CaP de aquellos con HPB.
38 - UNIDAD DE VALIDACIN DE BIOMARCADORES Valeria Quintanar Jurado y Julio Isael Prez Carren Instituto Nacional de Medicina Genmica Abstract La Unidad de Validacin de Biomarcadores apoya la investigacin biomdica que se realiza en el Inmegen, ofrece servicios en dos especialidades; la histologa y la microscopa. La unidad
tiene la capacidad de identificar protenas dentro de su contexto celular y tisular, cuya presencia o cantidad indique toxicidad o enfermedad en el organismo. As, los biomarcadores son indicadores de los cambios bioqumicos, fisiolgicos o morfolgicos que se asocian a una patologa. La unidad tiene varios alcances experimentales que sern presentados en el cartel.
40 - Identificacin Protemica de Biomarcadores de Nefropata Diabtica Laura del Bosque Plata1, Nora Gutierrez Njera1, Sendi Rafael Adame Garca1, Alejandro Trevio Becerra3, Clemente Meza Coria3, Guillermo Mendoza Hernndez2, Jose Luis Gallegos Prez1, Gerardo Jimnez Snchez1. 1Instituto Nacional de Medicina Genmica, 2Universidad Nacional Autnoma de Mxico y 3Hospital Jurez of Mxico La insuficiencia renal por nefropata diabtica (ND) es la primera causa de insuficiencia renal (IR) en Mxico. Entre los factores de riesgo para la IR se encuentran la susceptibilidad gentica, la hipertensin arterial, la proteinuria y la hiperfiltracin. El dao renal es mediado por glicosilacin de protenas, proteinuria y alteraciones hemodinmicas secundarias a hipertensin arterial y autorregulacin deficiente. Los pacientes presentan sntomas clnicos, como son presin sangunea alta, proteinuria, disminucin progresiva de la filtracin glomerular y eventos cardiovasculares; un incremento de la proteinuria es uno de los primeros signos de la existencia de la ND, la cual se desarrolla en etapas caracterizadas por hiperfiltracin, seguida por microalbuminuria y uremia. No existen predictores de la ND. Las herramientas protemicas han sido aplicadas para explorar la complejidad de los mecanismos asociados con ND y para identificar nuevos biomarcadores y blancos teraputicos. Como estrategia inicial en la bsqueda de biomarcadores tempranos de ND usamos mtodos de shotgun y electoforesis bidimensional, analizando pooles de tres grupos: grupo 1 (control), sin DT2, albumina y creatinina urinarias normales, grupo 2: con DT2, albuminuria y creatinina normales y grupo 3: con DT2, albuminuria > 7 .6 mg/L, creatinina, normal o > 1.3 mg/dL. Los resultados preliminares mostraron varias protenas diferenciales, entre ellas hay algunas expresadas exlusivamente en el grupo de diabticos, la mayora de ellas pertenecen al metabolismo celular y a la respuesta inmune.
39 - Variacin Gentica de Gen TCF7L2 en Poblacin de Origen Mexicano Laura del Bosque-Plata, Berenice Chvez Florencio, Elvia Yamilet Ramrez Vega, Sandra N. Cazaas Padilla, Carolina Acosta Correa, Hayd Miranda Ortiz, Salvador Hernndez Morales, Tulia Monge Czeres, Alma Cristal Hernndez Mondragn, Gerardo Jimnez Snchez. Instituto Nacional de Medicina Genmica, Mxico. Recientemente se ha reportado que variantes en el gene TCF7L2 confieren suscetibilidad a la diabetes tipo 2 (DM2) en mltiples poblaciones, este gene codifica para un factor de transcripcin de la va de sealamiento WNT y previamente se haba asociado al cancer. En poblaciones china y mexicoamericana han descubierto diferentes variantes asociadas con el riesgo a la enfermedad de las inicialmente reportadas en poblacin caucsica, como lo es el SNP rs290487 . Estos reportes muestran que en los estudios de asociacin es esencial secuenciar el gene completo, particularmente si la cohorte de replicacin no es del mismo grupo tnico que la del reporte original, lo que es importante en poblacin mexicana, la cual tiene patrones genticos, demogrficos y de mestizaje complejos, adems de poblaciones aisladas como los indgenas. Se analizaron 30 mestizos mexicanos del Proyecto de Diversidad Genmica de los Mexicanos y tres poblaciones indgenas: 30 zapotecoas, 60 mazatecos y 32 nahuas en 17 exones del gene TCF7L2. En los resultados iniciales hemos identificado patrones complejos de variacin en microsatlites y nuevas variantes en el gene TCF7L2, algunas de estas variantes tienen mayor frecuencia en algunos grupos indgenas en Mxico. Estas variantes se tienen que analizar en un estudo de asociacin (casos-controles) en poblacin mexicana para saber si estn asociadas a DM2.
35
36