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Manual de Instalao do Gerenciador de Ambiente Laboratorial - GAL Verso 1.

Manual de Instalao
Gerenciador de Ambiente Laboratorial - GAL
Verso 1.0

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Manual de Instalao do Gerenciador de Ambiente Laboratorial - GAL Verso 1.0

Manual de Instalao
Gerenciador de Ambiente Laboratorial - GAL

Verso 1.0
1.Sobre este documento........................................................................................3 Organizao deste documento............................................................................3 Principais captulos..............................................................................................3 2. Sobre o Gerenciador de Ambiente Laboratorial - GAL .................................. 4 2.1. O que o Gerenciador de Ambiente Laboratorial - GAL?.... ..................... 4 2.1.1. Benefcios do Gerenciador de Ambiente Laboratorial - GAL.............. 4 2.1.2. Quem usa o Gerenciador de Ambiente Laboratorial - GAL? ..... .........5 3.Pr-requisitos de software ................................................................................ 6 3.1.Configuraes Adicionais requeridas para os softwares ............................... 6 Apache ........................................................................................................... 6 PHP..6 PostgreSQL.6 4.Instalao do Sistema........................................................................................ 9 4.1.Criao da Base de Dados ............................................................................ 9

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1.Sobre este documento


Este documento foi elaborado com o objetivo de possibilitar a instalao de forma fcil e segura.

Organizao deste documento


Este manual contm um ndice e est organizado em captulos para facilitar a consulta. Os captulos foram divididos em tpicos para melhor detalhar as fases de instalao do Sistema Gerenciador de Ambiente Laboratorial - GAL. Cada captulo descreve uma fase especfica da instalao Todos os ttulos de tpicos e captulos estaro marcados em negrito. Alguns tpicos possuem tambm sub-tpicos que tero seus ttulos escritos em negrito/itlico para indicar que se trata de um sub-tpico. Os nomes de softwares e nomes de pastas estaro marcados em itlico para facilitar o entendimento do texto.

Principais captulos
As informaes necessrias para a instalao do Sistema Gerenciador de Ambiente Laboratorial - GAL esto distribudas ao longo deste documento atravs dos seguintes captulos:

Sobre o Gerenciador de Ambiente Laboratorial - GAL; Pr-Requisitos de Software; Instalao do Sistema

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2. Sobre o Gerenciador de Ambiente Laboratorial - GAL


O sistema Gerenciador de Ambiente Laboratorial - GAL, desenvolvido pela parceria entre as instituies Departamento de Informtica do Sistema nico de Sade DATASUS, na Coordenao de Ateno Bsica - COSAB e pela Secretaria de Vigilncia em Sade - SVS, na Coordenao Geral de Laboratrios de Sade Pblica - CGLAB tem como objetivos principais: Informatizar o Sistema Nacional de Laboratrios de Sade Pblica das Redes Nacionais de Laboratrios de Vigilncia Epidemiolgica e Vigilncia em Sade Ambiental, proporcionando o gerenciamento, acompanhamento dos exames de mdia e alta complexidade realizados nas redes estaduais de laboratrios de sade pblica proporcionando rastreabilidade e segurana na emisso dos resultados; Interligar-se ao Sistema de Informao de Agravos de Notificao - SINAN no envio dos resultados laboratoriais das doenas de notificao compulsria DNC; Auxiliar nas tomadas de decises epidemiolgicas junto as Secretaria Estaduais de Sade e Programas e no gerenciamento da rede de laboratrios de sade pblica.

2.1. O que o Gerenciador de Ambiente Laboratorial - GAL?


O sistema Gerenciador de Ambiente Laboratorial GAL um sistema que tem como principal objetivo gerenciar as atividades desenvolvidas pela rede estadual de laboratrios de sade pblica e conveniado no diagnstico de doenas de interesse de sade pblica.

2.1.1. Benefcios do Gerenciador de Ambiente Laboratorial - GAL.


Custos reduzidos (software livre); Informatizao da Rede Nacional de Laboratrios de Sade Pblica, nas Redes Nacionais de Laboratrios de Vigilncia Epidemiolgica e Vigilncia em Sade Ambiental; Padronizao das requisies de exames na rede nacional de laboratrios de sade pblica e conveniados; Envio dos resultados laboratoriais das doenas de notificao compulsria DNC ao Sistema de Informao de Agravos de Notificao (SINAN) dos casos suspeitos e/ ou confirmados; Coordenao do fluxo de exames recebimento e processamento das amostras de origem humana, animal, ambiental e controle de qualidade analtico na rede estadual de laboratrios de sade pblica e conveniados; Elaborao de relatrios epidemiolgicos e gerenciais nas esferas nacional, estadual e municipal.

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2.1.2. Quem usa o Gerenciador de Ambiente Laboratorial - GAL?


O sistema GAL atuar na rede estadual de laboratrios de sade pblica e conveniados desde: Laboratrios Locais LL (que no realizam exames de importncia de sade pblica); Laboratrios da Rede LR (realizam exames de interesse de sade pblica em diferentes nveis de complexidades); Laboratrios Centrais de Sade Pblica LACEN (coordenar da rede estadual dos laboratrios de sade pblica e conveniados); Laboratrios Externos LE (laboratrios que realizam exames de diferentes nveis de complexidade fora da rede estadual do estado solicitante); O GAL disponibilizar formato padro de entrada de dados para interface com outros sistemas.

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3.Pr-requisitos de software
Apache 2.2.4 ou superior PHP 5.2.x PostgreSql 8.2.x ou superior

3.1.Configuraes Adicionais requeridas para os softwares


Permisses de diretrio

1. Habilitar permisso de escrita para o usurio que executa o servio do Apache nos diretrios: PATH_GAL/files; PATH_GAL/log;
Apache

Existem quatro possibilidades de instalao: Raiz do servidor web; Diretrio dentro da raiz do servidor web; Diretrio fora da raiz do servidor web, com Alias; Virtual Host;
Configurao comum.:

Habilitar a opo de mod_rewrite Localize e abra o arquivo httpd.conf Localize a linha: #LoadModule rewrite_module modules/mod_rewrite.so Substitua por: LoadModule rewrite_module modules/mod_rewrite.so
Particularidades das configuraes.: Para a instalao com diretrio fora da raiz do servidor web, com Alias

Deve-se retirar o comentrio, abaixo, do .htaccess. Substitua a linha.: #RewriteBase /gal Por.: RewriteBase /gal
Para cada instalao, deve ser alterado o Directory com o caminho do GAL.

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Segue exemplo abaixo, para a instalao no diretrio raiz do servidor web.:

Localize o seguinte trecho:

Localize a linha: AllowOverride None


Substitua por: AllowOverride All

Localize o trecho:


PHP

Localize a linha: AllowOverride None


Substitua por: AllowOverride All

2. A instalao do Gal requer a adio das seguintes extenses do PHP: a. GD2 b. PDO c. PDO_pgsql ou PDO_oci d. SOAP e. Standard PHP Lybrary (SPL) - Opcional f. ZIP g. ICONV
PostgreSQL

3. No caso da aplicao e o banco de dados estarem em servidores diferentes, o PostgreSQL dever estar configurado para aceitar conexes provenientes do servidor da aplicao. Essa configurao poder ser feita no arquivo pg_hba.conf. 4. Caso o formato da data do banco de dados seja alterado do padro, dever ser alterado a varivel timestamp.format.db no arquivo de configurao do javascript PATH_GAL/etc/gal.ini

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Alterar configurao do PATH_GAL/etc/gal.ini para valores do estado correspondente.: Exemplo abaixo para o estado RN.:

[database] db.adapter = PDO_PGSQL db.config.host = localhost db.config.username = gal db.config.password = senha db.config.dbname = gal [estado] nomeGoverno = Governo do Rio Grande do Norte nomeSecretaria = Secretaria Estadual de Sade logoSecretaria = logo-ses.jpg logoGoverno = logo-gov.jpg co_uf = 24 no_uf = Rio Grande do Norte [sinan] prefix = RN

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4.Instalao do Sistema
A ltima verso do sistema est disponvel no CD de instalao.

4.1. Criao da Base de Dados


1. Conecte-se ao SGBD como usurio administrador, que tenha permisses para criar usurios e criar databases. Sugerimos que seja utilizada a ferramenta gratuita PGAdmin III (http://www.pgadmin.org) . 2. Precisamos criar um usurio para manipular os dados do sistema GAL.
3.

Agora devemos criar uma nova base de dados que receber as tabelas do sistema GAL. Sugerimos que a base de dados tenha o nome gal. Execute o cdigo a seguir para criar a base de dados:
CREATE DATABASE gal ENCODING = 'UTF8';

4. Devemos agora dar permisses ao usurio criado para que possa criar e acessar suas tabelas. 5. Para criar as tabelas do sistema, devemos carregar os scripts sql na base de dados gal.

Postgres: 5.1. postgresql-x.x.x.sql; 5.2. postgresql-x.x.x-post-install.sql; 5.3. dados.sql; 5.4. CNES_UF.sql; Oracle: 5.5. oracle.sql; 5.6. oracle-dados.sql; 5.7. CNES_UF.sql;

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