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ISSN 1980-3540

04.01, 25-32 (2009) www.sbg.org.br

CDIGO GENTICO: O CDIGO DOS VINTE


Lyria Mori1, Maria Cristina Arias2, Cristina Yumi Miyaki3 e Eliana M. B. Dessen4
1- lmori@ib.usp.br, 2- mcarias@ib.usp.br, 3- cymiyaki@ib.usp.br, 4- embdesse@ib.usp.br Departamento de Gentica e Biologia Evolutiva do Instituto de Biocincias da Universidade de So Paulo

Introduo Assuntos e conceitos genticos tornaram-se mais frequentes no cotidiano de um pblico bem mais amplo. Conceitos como DNA, genoma, clonagem, Projeto Genoma, organismos geneticamente modificados esto presentes com frequncia na mdia falada e escrita. uma oportunidade importante para que o pblico em geral entre em contato com os avanos ocorridos nessa rea da cincia e possa posicionar-se de modo consciente em relao s novas possibilidades de diagnsticos e de terapias, ao uso de organismos geneticamente modificados, ao emprego de melhoramento gentico das espcies comestveis, entre tantas outras aplicaes. Porm, frequente encontrar artigos na mdia, apresentada por leigos, em que so discutidos conceitos de gentica empregados de modo equivocado. No deve ser fcil para os divulgadores de temas cientficos a transmisso correta de conceitos da rea de gentica, uma rea do conhecimento que trata de entidades invisveis, de uma srie de mecanismos que no podem ser visualizados no momento em que ocorrem e cujas consequncias podem ser inferidas somente na gerao ou nas geraes que se seguem. Entretanto, importante ressaltar tais impropriedades e/ou erros, principalmente pelo fato de tais artigos serem utilizados, muitas vezes, como fonte de informao para professores de ensino mdio. Um exemplo marcante de erro nos artigos da mdia leiga o emprego do conceito de cdigo gentico. Em uma rpida varredura, em maio de 2009, no stio de busca Google com as palavras cdigo gentico de 121 citaes analisadas (excetuando aquelas de definio do termo), 105 empregavam o conceito incorretamente. O erro mais frequente a utilizao de cdigo gentico como sinnimo de genoma. A figura 1 apresenta alguns exemplos: O cdigo gentico das bactrias fica guardado num nico cromossomo... (Brincando de Deus? Revista

poca), O prximo passo substituir o cdigo gentico original do ncleo de um vulo de elefanta pelo material gentico retirado do fssil do mamute (O corpo est intacto. Mas no d para clonar Revista poca), ... os gmeos univitelinos que tm cdigo gentico idntico,... (Eu, meu melhor amigo Revista Veja), ... and drive how complex our genetic code really is (Science). O cdigo gentico a correspondncia entre uma determinada trinca de pares de nucleotdeos do DNA e um determinado aminocido na protena. Os nucleotdeos, as unidades estruturais dos cidos nucleicos, so molculas compostas de uma base nitrogenada, um acar e um grupo fosfato. A informao gentica em uma molcula de DNA est contida e determinada pela ordem e combinao dos quatro nucleotdeos: adenina, timina, citosina e guanina (A, T, C, G, respectivamente). O RNA possui as mesmas bases, com exceo da timina (T) que substituda pela uracila (U). A leitura da informao contida no RNA mensageiro (RNAm) se d em trincas (cdons), ou seja, cada sequncia de trs bases do RNAm est associada a um dos 20 diferentes aminocidos ou a um sinal de incio ou de parada da sntese de protenas. O cdigo gentico possui 64 cdons, pois so 64 as combinaes possveis dos quatro tipos de nucleotdeos em trincas. Durante a traduo do cdigo, os cdons do RNAm so lidos de maneira no sobreposta, como se houvesse uma janela que deslizasse de trinca em trinca, permitindo a chegada dos RNA transportadores (RNAt) carregando os aminocidos. Estes so ligados, posteriormente, uns aos outros obedecendo a ordem determinada pela ordem dos cdons do RNAm. Esta associao entre os cdons e os aminocidos correspondentes constitui o cdigo gentico. A tarefa de decifrar o cdigo gentico foi um dos mais importantes avanos da biologia molecular. Isso foi feito por meio de experimentos realizados no
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final da dcada de 50 e na dcada de 60, que mostraram a composio de bases dos cdons, a natureza geral do cdigo (Crick e col. 1961; Speyer e col., 1962; Leder e col., 1963) e sua universalidade (com raras excees). O que caracteriza a universalidade do cdigo gentico sua utilizao pelas diferentes formas de vida e pelo fato de sua linguagem ser traduzida de acordo com regras universais (reviso em Nirenberg, 1963). As sequncias do genoma que podem ser traduzidas em protenas correspondem a genes. O cdigo gentico no pode ser usado como sinnimo de genoma por duas razes. A primeira delas porque o genoma corresponde a todo o material gentico de uma clula haplide do organismo, isto , o genoma equivale sequncia completa de nucleotdeos, quer de segmentos gnicos ou no. Alm disso, o genoma corresponde sequncia da informao e no s regras (cdigo) com que tais sequncias devem ser traduzidas. Bastante frequente tambm em artigos da mdia a referncia errnea decifrao do cdigo gentico como sinnimo de soletramento do genoma ou da determinao da sequncia de bases do genoma. Exemplos desse tipo de incorreo esto apresentados na Figura 1: Quando a corrida para decifrar o cdigo gentico da vida,... (Mistrios da Vida Scientific American Brasil), baseando-se na anlise do cdigo gentico de cada paciente (Com Fome de Gordura Revista Veja). O sequenciamento, ou soletramento, do genoma de diferentes organismos permite determinar a ordem dos nucleotdeos na molcula de DNA. Essa ordem corresponde informao contida no DNA, seja ela referente s regies de cdigo de protenas, de controle da atividade gnica, ou de outros elementos repetidos que compem um genoma. Porm, essa ordem no permite a decifrao do cdigo gentico. O cdigo nico para todos os organismos e foi decifrado na dcada de 60 como anteriormente apresentado. No s o termo cdigo gentico usado de forma errada, como tambm os mritos dessa descoberta so erroneamente atribudos a outros pesquisadores que se dedicaram a estudos correlatos. Recentemente Marshall W. Nirenberg, um dos descobridores do cdigo gentico, desabafou a sua revolta ao comentar o livro de autoria de Matt Ridley (2006) cujo ttulo : Francis Crick: discoverer of the genetic code. Nessa entrevista, publicada na Scientific American Brasil em dezembro 2007, Nirenberg ressalta o trio Marshall W. Nirenberg, Robert Holley e Gobind Khorana (laureados com o prmio Nobel de 1968) como os responsveis pela interpretao do cdigo gentico e de sua funo na sntese de protena.

Uma das maneiras de inibir o uso indiscriminado do conceito de cdigo gentico compreend-lo corretamente. A presente atividade, uma oficina, tem por objetivo possibilitar que o participante construa o conceito de cdigo gentico, saiba us-lo corretamente e adquira uma atitude crtica perante as colocaes incorretas desse conceito. A oficina foi concebida para ser aplicada em sala de aula de ensino mdio ou ensino superior, dependendo do nvel de detalhamento que se pretenda. Preparando a atividade para uso em sala de aula A atividade simula a traduo de RNA mensageiros de dois genes (A e B) em duas espcies diferentes (representados por uma flor e um gato Figura 2). Ela realizada com peas que se encaixam como em um quebra-cabeas. Portanto, o ideal trabalhar com, no mximo, oito alunos por grupo, sendo distribudos em duplas, e cada dupla dever traduzir um RNAm. Cada grupo receber os quatro envelopes (Figura 4) contendo os RNAt correspondentes aos cdons de cada um dos RNAm (Figura 3). O material para os estudantes deve ser preparado como abaixo descrito: Imprimir para cada grupo de 8 alunos as tabelas 1 e 2 e as figuras 2 e 3 do anexo; Colar as figuras 2 e 3 em cartolina para que fiquem mais resistentes ao manuseio. Recortar suas margens de modo a obter quatro tiras de RNA mensageiros (referentes a dois genes A e B e a duas espcies diferentes, flor e gato) e quatro conjuntos de RNA transportadores; Identificar quatro envelopes com a denominao do gene (A ou B) e do organismo (flor ou gato). Usar nessa identificao os smbolos dos organismos e dos genes, como apresentado na figura 4. Preencher cada envelope com os RNA transportadores correspondentes a cada gene e organismo; Colar uma fita adesiva larga na parte posterior (costas) de cada tira de RNA mensageiro. Metade da parte aderente da fita dever estar colada tira do mensageiro e a outra metade estar livre para colar os RNA transportadores que se associam aos cdons durante o processo de traduo; Distribuir para cada grupo de 8 alunos: o Quatro RNA mensageiros o Quatro envelopes contendo os RNA transportadores
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o Uma tabela de cdigo gentico (Tabela 2) o Uma tabela para ser preenchida (Tabela 1) o Um folheto com os procedimentos (veja item abaixo) o Questes para serem respondidas aps a realizao da atividade Cada dupla deve fazer a traduo de um RNA mensageiro. Procedimento Escolher um RNA mensageiro para ser traduzido e encontrar o envelope que contm os RNA transportadores correspondentes; Iniciar a traduo do RNA mensageiro da esquerda para a direita, encontrando um RNA transportador que se encaixe no primeiro cdon, ou seja, aquele que tenha um anticdon complementar; Encaixar o RNA transportador no segundo cdon e assim sucessivamente at o final da mensagem; Comparar as sequncias de aminocidos obtidas nas tradues dos genes A de flor e de gato. Repetir o procedimento para os genes B de flor e de gato; Preencher a tabela I, anotando para cada trinca de bases (cdon) qual o aminocido correspondente. Para descobrir essa correspondncia verificar a ordem de bases do cdon no RNA mensageiro, em seguida consultar a tabela que fornece a correspondncia entre a ordem de bases do RNA e o aminocido. Entendendo a atividade Aps realizar o procedimento, responder as seguintes questes, discutindo com os colegas do grupo: 1. O que cdon? 2. Qual o cdon de inicializao do gene A e do gene B de flor e de gato? 3. Existe um aminocido associado ao cdon de parada? 4. Quantos sinais de parada existem no cdigo gentico? 5. Quantos sinais de incio existem no cdigo gentico? 6. Quais so os nucleotdeos que compem o cdon da histidina? 7. Por que se considera o cdigo gentico universal (com raras excees)? 8. Por que se considera que o cdigo gentico degenerado?

Aps a realizao da atividade, o professor poder solicitar aos alunos que analisem de modo crtico os trechos de artigos apresentados na Figura 1, nos quais o conceito de cdigo gentico empregado de modo errado, e que reescrevam corretamente os trechos assinalados em amarelo. Bibliografia Crick, F.H.C.; Barnett, L.; Brenner, S. and WattsTobin, R.J. 1961. General nature of the genetic code for proteins. Nature 192: 1227-1232. Leder, P.; Clark, B.F.; Sly, W.S.; Pestka, S. and Nirenberg, M.W. 1963. Cell-free peptide synthesis dependent upon synthetic oligonucleotides. Proceedings of the National Academy of Science USA 50: 1135-43. Nirenberg, M. W. 1963. The genetic code II. Scientific American 208: 80-94. Regis, E. 2007. O esquecido decifrador do cdigo. Scientific American Brasil 67: 30-31. Ridley, M. 2006. Francis Crick: Discoverer of the Genetic Code (Eminent Lives). Harper Collins Publishers. New York. Speyer, J.F.; Lengyel, P.; Basilio, C.; Wahba, A.J.; Gardner, R.S. and Ochoa, S. 1962. Synthethic polynucleotides and the amno acid code. V. Proceedings of the National Academy of Science USA 48:441-448. Leitura complementar Freeland, S. J. and Hurst, L. D.. 2006. Evoluo em cdigo. Scientific American Brasil, edio especial 16: 10-15. Griffiths, A. J. F.; Miller, J. H.; Suzuki, D. T.; Lewontin, R. C. and Gelbart, W. M.. 1999. An introduction to Genetic Analysis. 7th ed.W. H. Freemann. New York. The Genetic Code - Educational Games. http:// nobelprize.org/educational_games/medicine/ Wallace, B. 1992. The Search for the Gene. Cornell University. Ithaca. Watson, J. D. 2005. DNA, o Segredo da Vida. Companhia das Letras. So Paulo. Agradecimentos Aos inmeros professores e alunos que executaram a atividade no evento Gentica na Praa, no 53o Congresso da Sociedade Brasileira de Gentica (2007), e que fizeram vrias sugestes para melhorar a atividade.

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Figura 1. Recortes de revistas ou matrias de divulgao cientfica utilizando de forma inadequada o termo cdigo gentico.

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Tabela 1. Tabela para ser preenchida com os cdons e respectivos aminocidos encontrados na leitura dos quatro tipos de RNAm. Tabela 1. Tabela para ser preenchida com os cdons e respectivos aminocidos encontrados na leitura dos quatro tipos de RNAm.

2a LETRA

3a LETRA

U U C A G U
1 L E T R A

C A G U

C A G U

C A G

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RNAm

Gene A

A U G G U C C A U C U C A C A C C U C U G A G C U G A

RNAm

Gene A

A U G G U G C A U C U C A C U C C U C U G A G U U A G

RNAm

Gene B

A U G G G G C U C G U U C A U C U C C C A G A G U G A

RNAm

Gene B

A U G G G C C U C G U G C A U C U G C C U G A A U A A

Figura 2. RNA mensageiros dos genes A e B de flor e de gato.

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Gene A
PA R E

Gli

RNAt

Gene A
RNAt
Met Val His Leu

Pro PA R E

Met

Val

His

Leu

Tre Ser Tre Pro

Pro

Leu

Leu

Ser

Gene B
PA R E

His

RNAt

Gene B
Met Gli

Val

RNAt

PA R E

Met

Gli

Leu

Val

Leu

Val

His

Leu

Pro

Glu

His

Leu

Pro

Glu

Figura 3. RNA transportadores usados para a traduo dos genes A e B de flor e de gato.

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A A
RNAt

Gene B

Figura 4. Exemplo de envelope que dever ser feito para cada conjunto de RNAt das guras. Figura 4. Exemplo de envelope que dever ser feito para cada conjunto de RNAt nos das figuras. Os RNAsenvelopes, transportadores Os RNAs transportadores devero ser recortados e colocados respectivos de devero ser recortados e colocados nos respectivos envelopes, de modo semelhante ao mostrado acima. modo semelhante ao mostrado acima.
Tabela 2. Tabela do cdigo gentico.

Tabela 2. Tabela do cdigo gentico.

2a LETRA
UAU UAC UAU UAA UAC UAG CAC CAU CAA CAC CAG

2a LETRA
A
Tirosina A Tirosina Tirosina Parada Tirosina Parada

G
UGU Cistena G UGC Cistena UGU Cistena UGA Parada UGC Cistena UGG Triptofano U C U A C G C A U G C

U 1

UUU Serina U Fenilalanina UCU C UUC Fenilalanina UCC Serina UUU Fenilalanina UCU Serina U UUA Leucina UCA Serina UUC Fenilalanina UCC Serina UUG Leucina UCG Serina

1 L E T R A

L E C T R A
A

C CUU CUA Leucina Leucina

UUA Leucina CUU Leucina UUG Leucina


CUC Leucina

UCA Serina CCU Prolina UCG Serina

CUC CUG Leucina Leucina CUA AUU Leucina Prolina Isoleucina CCA ACU Treonina CUG AUC Leucina Prolina Isoleucina CCG ACC Treonina
ACA Treonina ACU Treonina ACG Treonina ACC Treonina GCU Alanina ACA Treonina GCC Alanina ACG Treonina

CCC Prolina CCU Prolina CCA Prolina CCC Prolina CCG Prolina

UAA Parada CAU Histidina UAG Parada

Histidina Histidina Glutamina Histidina Glutamina

UGA Parada A CGU Arginina U UGG Triptofano G CGC Arginina CGUArginina Arginina CGA CGCArginina Arginina CGG

3 L E L T R E A T

CAA AAU Glutamina Asparagina CAG AAC Glutamina Asparagina


AAA AAU AAG AAC GAU AAA GAC AAG Lisina Asparagina Lisina Asparagina Aspartato Lisina Aspartato Lisina

Isoleucina AUU AUA Isoleucina AUG Metionina AUC Isoleucina Valina AUA GUU Isoleucina Valina AUG GUC Metionina G

CGASerina Arginina AGU CGGSerina Arginina AGC AGA AGUArginina Serina AGG Arginina
GGU AGA Glicina Arginina GGC Glicina AGG Arginina GGA Glicina GGU Glicina Glicina GGG

AGC Serina

U A C G A U G U A C G A G U

R A

GUU GUG Valina Valina GUC Valina GUA Valina GUG Valina

GUA Valina

GCU Alanina GCG Alanina GCC Alanina GCA Alanina GCG Alanina

GCA Alanina

GAU GAG GAC GAA GAG

GAA Glutamato Aspartato Glutamato

Aspartato Glutamato Glutamato

GGC Glicina GGA Glicina GGG Glicina

C A G
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