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Canhos & Manfio.

Recursos Microbiolgicos para Biotecnologia

Recursos Microbiolgicos para Biotecnologia


Vanderlei Perez Canhos 1 e Gilson Paulo Manfio 2
1

Centro de Referncia em Informao Ambiental (CRIA, http://www.criabr.org.br), Av. Romeu Trtima 388, Cidade Universitria, CEP 13084-520, Campinas (SP); 2 Coleo de Culturas Tropical (CCT), Fundao Andr Tosello, Rua Latino Coelho 1301, CEP 13087-010, Campinas (SP). E-mail: vcanhos@criabr.org.br / Fone/Fax: (19) 3288-0466

Resumo. O presente documento traz uma avaliao do impacto dos recentes avanos em sistemtica e ecologia microbiana, e bioinformtica no desenvolvimento da biotecnologia. A diversidade microbiana representa uma fonte importante de recursos genticos para o avano da biologia e biotecnologia. Estudos recentes em ecologia molecular microbiana demonstram que a extenso da diversidade microbiana na natureza muito maior do que previamente pensado. Estratgias tradicionais de isolamento e seleo de microrganismos tem garantido o desenvolvimento de novos frmacos e aplicaes nas reas de sade, agricultura, indstria e meio ambiente. Novas abordagens de trabalho, envolvendo metodologias de bioinformtica e biologia molecular, permitem a prospeco in silico de informaes a partir de dados genmicos em bases de dados, e a anlise de microrganismos sem a necessidade de isolamento e cultivo, a partir da clonagem direta de DNA de amostras ambientais. Com isso, possvel a caracterizao e descoberta de novos genes, enzimas, metablitos bioativos e frmacos associados rica diversidade de organismos ainda no-cultivados e desenvolvimento de novas estratgias de seleo e triagem de novos produtos, alvos e ensaios a partir do conhecimento da genmica e expresso gnica de organismos diversos.

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ndice
1. 2. 3. DIVERSIDADE MICROBIANA: ESCOPO, DIMENSO E APLICAES ...................................... 2 BIOTECNOLOGIA NO SCULO 21............................................................................................................... 6 A MUDANA DE PARADIGMA....................................................................................................................... 8

4. RECURSOS GENTICOS MICROBIANOS PARA A BIOTECNOLOGIA NA ERA PSGENMICA........................................................................................................................................................................ 9 4.1. 4.2. 4.3. 4.4. 4.5. 4.6. 4.7. 5. IMPORTNCIA DA SISTEMTICA COMO FERRAMENTA ................................................................................9 ECOLOGIA MICROBIANA: BIOGEOGRAFIA E BIODIVERSIDADE.................................................................10 BIOINFORMTICA E INFORMTICA PARA BIODIVERSIDADE : A INTEGRAO DE DADOS......................11 GENMICA FUNCIONAL: CHAVE PARA NOVAS DESCOBERTAS E APLICAES .......................................11 M ETAGENOMA : EXPLORAO DO POTENCIAL BIOTECNOLGICO DE ORGANISMOS NO-CULTIVADOS 12 CENTROS DE RECURSOS BIOLGICOS (CRB S) .........................................................................................15 NOVAS EMPRESAS DE BASE TECNOLGICA ................................................................................................16

RECOMENDAES ...........................................................................................................................................16 5.1. 5.2. 5.3. 5.4. 5.5. CONSOLIDAO DA CAPACIDADE INSTITUCIONAL....................................................................................18 A POIO A PROJETOS INTEGRADOS..................................................................................................................18 ESTABELECIMENTO DE REDES DE INFORMAO ESPECIALIZADAS .........................................................19 A POIO AO ESTABELECIMENTO DE EMPRESAS EMERGENTES DE ALTA TECNOLOGIA.............................19 A POIO CONSOLIDAO DA REDE BRASILEIRA DE CENTROS DE RECURSOS BIOLGICOS................19

6.

ESTRATGIAS .....................................................................................................................................................21 6.1. 6.2. 6.3. 6.4. 6.5. 6.6. DIAGNSTICO DA CAPACIDADE INSTITUCIONAL E DETALHAMENTO DA ESTRATGIA NACIONAL......21 CAPACITAO DE RECURSOS HUMANOS.....................................................................................................22 W ORKSHOPS PARA DEFINIO DE ESTRATGIAS.......................................................................................22 ESTABELECIMENTO DE REDES TEMTICAS ESPECIALIZADAS E INTEGRADAS........................................22 ESTABELECIMENTO DE CENTROS TEMTICOS...........................................................................................23 PROGRAMAS DE APOIO A CONSRCIOS DE BIOTECNOLOGIA ....................................................................23

7.

PRIORIDADES ......................................................................................................................................................23 7.1. 7.2. 7.3. PRIORIDADES IMEDIATAS (2001-2002).......................................................................................................23 PRIORIDADES DE M DIO PRAZO (3-5 A NOS)..............................................................................................24 PRIORIDADES DE LONGO PRAZO (5 A 10 A NOS)........................................................................................24

8.

REFERNCIAS.....................................................................................................................................................25

1. Diversidade Microbiana: Escopo, Dimenso e Aplicaes


Os microrganismos apresentam uma imensa diversidade gentica e desempenham funes nicas e cruciais na manuteno de ecossistemas, como componentes fundamentais de cadeias alimentares e ciclos biogeoqumicos (Myers, 1996; Schimel, 1995). Apesar de sua grande importncia na manuteno da biosfera, estima-se que menos de 10% dos microrganismos existentes no planeta tenham sido caracterizados e descritos (Staley, 1998).

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A grande maioria dos esforos de estudo e uso sustentvel da biodiversidade tem sido enfocada em macrorganismos (mamferos, aves, peixes e plantas). Estimativas recentes indicam que os microrganismos e invertebrados constituem quase que 90% das espcies da biosfera e desempenham um papel fundamental no funcionamento de ecossistemas (Figura 1). Conhecemos mais de 80% das plantas e mais de 90% dos vertebrados existentes na natureza, enquanto que conhecemos menos de 1% das bactrias e vrus, e menos que 5% dos fungos. Embora sejam menos estudados, muitos grupos de microrganismos so essenciais para a sobrevivncia das formas de vida na terra (Hamond, 1995).

Figura 1. Representao filogentica da diversidade de organismos vivos, evidenciando a abrangncia dos principais grupos de microrganismos.

O conhecimento da diversidade de microrganismos sensu estricto (bactrias, arqueas, fungos e protozorios), parasitas intracelulares (vrus) e invertebrados microscpicos (nematides e caros) limitado e heterogneo, sendo detalhado a seguir. Bactrias e Arqueas (Archaea). Estima-se que so conhecidos menos que 1% das bactrias e arqueas existentes na biosfera. O nmero de espcies de bactrias descrita na literatura vem crescendo nos ltimos anos em virtude do desenvolvimento de ferramentas de biologia molecular, que possibilitam a anlise de seqncias de DNA a partir de material genmico extrado diretamente de amostras ambientais. As novas tcnicas evidenciaram a enorme diversidade gentica de bactrias presentes em apenas um grama de solo. Estima-se que em 1 g de solo ocorram entre 20 e 40 mil espcies bacterianas. Considerando-se que so descritas cerca de 5.000 espcies de bactrias, cuja maioria no de solos, h uma enorme lacuna de conhecimento a ser preenchida em estudos de biodiversidade. Fungos. Estima-se que apenas 5% dos fungos existentes tenham sido descritos. Os fungos esto envolvidos em inmeras relaes mutualistas, amensais, comensais e competitivas com outros organismos. Muito progresso tem sido feito com relao catalogao de fungos superiores, que formam sistemas de reproduo macroscpicos (cogumelos). J os fungos

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micorrzicos, que formam relaes mutualistas com plantas, foram muito pouco estudados. Os fungos micorrzicos arbusculares so comuns em todo o mundo, porm apenas as espcies associadas a plantas de interesse agrcola foram estudadas de maneira adequada. Protozorios. Estima-se que apenas 10% dos protozorios so conhecidos. Eles so, juntamente com os nematides, os principais predadores de microrganismos dos ecossistemas terrestres. Os protozorios poderiam ser classificados de acordo com sua preferncia alimentar (bactrias ou fungos), preferncia de habitat (acidfilo ou neutrfilo), ou importncia ecolgica. Vrus. Os vrus podem ser conceituados como agentes infecciosos muito pequenos, sem estrutura celular, contendo um s tipo de cido nuclico. Os vrus so parasitas intracelulares obrigatrios, apresentam um processo de multiplicao sem paralelo com a reproduo dos demais organismos e, de modo geral, a definio de espcies virais no claramente determinada, uma vez que se encontram em processo constante e rpido de evoluo. Nematides. Os nematides so invertebrados microscpicos que vivem nas pelculas de gua formadas ao redor de partculas do solo. Estima-se que mais de 100.000 espcies de nematides ainda esto para ser descritas (NSF, 1997). Estes animais so muito importantes para as cadeias trficas em solos. So melhores conhecidas as espcies de nematides parasitas de plantas de interesse agrcola, uma vez que causam reduo da produtividade das culturas, afetam a translocao de gua e nutrientes pela planta, alm de diminuir a qualidade e o tamanho de frutos e tubrculos. Devido alta importncia destes organismos para o equilbrio ecolgico dos solos, um grande esforo e incentivo deveria ser dado a pesquisas visando descrio e o conhecimento das espcies de nematides de vida livre. caros. So conhecidos 45.000 espcies de caros. Estima-se que este nmero representa apenas 5% do total de espcies existentes. Os caros so o grupo de artrpodes de maior diversidade, o que reflete na sua grande diversidade de hbitos alimentares.

A evoluo das metodologias de biologia molecular aplicada ao estudo do meio ambiente tem contribudo significativamente para um grande avano do conhecimento sobre a diversidade microbiana. Resultados de estudos independentes de isolamento e cultivo, baseados em amplificao e sequenciamento de fragmentos do genes de rRNA 16S (rDNA 16S), demonstraram que a diversidade de microrganismos em amostras ambientais vasta. Contudo, apenas uma pequena frao destes (<10% em solos e <1% em ambientes aquticos) usualmente recuperada em estudos baseados em isolamento e cultivo. A aplicao destas metodologias no estudo da diversidade de bactrias tem permitido a descoberta de uma gama extensa de novas linhas evolutivas neste grupo (Divises). Como resultado destes estudos, o nmero de Divises foi ampliado de 12, em 1984, para 36, em 1991 (Hugenholtz et al., 1998a, b). Mtodos independentes-de-cultivo tendem a substituir mtodos baseados em isolamento e cultivo para a realizao de levantamentos e comparao da

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composio, diversidade e estrutura de comunidades microbianas (Hugenholtz & Pace, 1996; Hugenholtz et al., 1998a, b). Resultados de estudos moleculares de solos, ambientes marinhos e comunidades de ambientes extremos tem demonstrado que populaes de microrganismos isolados em cultivo a partir de amostras destes habitats no representam necessariamente os organismos dominantes nos ambientes naturais (Hugenholtz et al, 1998a). Uma das razes para esta discrepncia o fato de que os mtodos de cultivo tradicionalmente utilizados em laboratrio no representam as condies encontradas em ambientes naturais e tendem a selecionar microrganismos de crescimento rpido adaptados ao meio de cultivo utilizado. Frente vasta diversidade microbiana representada pelos organismos ainda no-cultivados e s limitaes de cultivo e manipulao de microrganismos extremoflicos em laboratrios (hipertermfilos, psicrfilos e baroflicos, entre outros), torna-se premente a necessidade de adoo novas estratgias para a explorao plena da biodiversidade microbiana. importante ressaltar que grande parte dos avanos da biotecnologia moderna e agricultura so derivados das descobertas recentes nas reas de gentica, fisiologia e metabolismo de microrganismos (Manfio et al., 1998). A diversidade gentica e metablica dos microrganismos tem sido explorada h muitos anos visando a obteno de produtos biotecnolgicos, tais como a produo de antibiticos (estreptomicina, penicilina, etc.), de alimentos (e.g., cogumelos), processamento de alimentos (queijo, iogurte, vinagre, etc.), bebidas alcolicas (vinho, cerveja, etc.), cidos orgnicos (ctrico e fumrico), lcoois (etanol), alimentos fermentados (molho de soja), tratamento e/ou remediao de resduos (esgotos domsticos, lixo), e, na agricultura, na fertilizao de solos (fixao biolgica de nitrognio) e controle biolgico de pragas e doenas (controle da lagarta da soja, da cigarrinha da cana de acar, de fitopatgenos como Rhizoctonia e outros). Os benefcios cientficos esperados de um maior conhecimento sobre a diversidade microbiana so extensos (Colwell, 1997; Hunter-Cevera, 1998), entre outros, a melhor compreenso das funes exercidas pelas comunidades microbianas nos ambientes terrestres e o conhecimento das suas interaes com outros componentes da biodiversidade, como por ex., as plantas e animais. Os benefcios econmicos e estratgicos esto relacionados com a descoberta de microrganismos potencialmente explorveis nos processos biotecnolgicos para: novos antibiticos e agentes teraputicos; probiticos; produtos qumicos; enzimas e polmeros para aplicaes industriais e tecnolgicas; biorremediao de poluentes; e biolixiviao e recuperao de minrios. Outros benefcios incluem o prognstico e preveno de doenas emergentes em seres humanos, animais e plantas, e a otimizao da capacidade microbiana para a fertilizao dos solos e despoluio das guas.

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2. Biotecnologia no Sculo 21
A biotecnologia baseada na busca e descoberta de recursos biolgicos industrialmente explorveis. Uma abordagem clssica das etapas do processo de busca e descoberta biotecnolgica passa resumidamente pela coleta de material biolgico adequado, seguida da seleo e triagem de materiais com os atributos desejados, seleo final do(s) melhor(es) candidato(s) a partir de uma lista reduzida de opes e culmina com o desenvolvimento de um produto comercial ou processo industrial (Bull et al, 2000). Este conceito clssico de explorao de recursos biolgicos ainda se mantm vlido nos dias de hoje e constitui o modelo utilizado em diversos setores da indstria de biotecnologia mundial. No escopo das aplicaes microbianas em biotecnologia tradicional, o valor dos microrganismos geralmente avaliado pelo potencial aplicao direta nos processos biotecnolgicos ou valor de mercado dos produtos (Tabela 1). O valor indireto das biotecnologias baseadas em processos microbianos, contudo, raramente contemplado, tal como: benefcios ambientais e sociais decorrentes do tratamento de resduos industriais e poluio ambiental. Avanos cientficos e tecnolgicos alcanados nos ltimos anos vem revolucionando as abordagens tradicionais de explorao de recursos biolgicos. O processo de busca e descoberta biotecnolgica em si vem sofrendo profundas alteraes em funo das mudanas de modelos desencadeadas pelos avanos em biologia molecular, genmica e bioinformtica. As principais foras indutoras e direcionadoras do desenvolvimento em biotecnologia so a demanda econmica, direcionada pela indstria, polticas nacionais e internacionais, frequentemente influenciadas pela presso pblica, e os avanos em cincia e tecnologia. Juntos, estes componentes catalisam o desenvolvimento da biotecnologia, com a gerao de novos mercados, soluo de problemas crnicos e emergentes, e a melhoria da eficincia e custo de processos industriais. Biotecnologia um exemplo primo de inovao radical, no sentido em que proporciona tecnologias inteiramente novas para atividades industriais existentes e permite a gerao de novas indstrias (Bull et al., 2000). A biotecnologia reconhecida como uma das tecnologias-capacitadoras para o sculo 21, frente s suas caractersticas de inovao radical, impacto atual e potencial frente a problemas globais (doenas, nutrio e poluio ambiental) (ten Kate, 1999) e promessa de desenvolvimento industrial sustentvel (utilizao de recursos renovveis, tecnologia limpa, reduo do aquecimento global) (Bull et al., 1998).

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Tabela 1. Alguns exemplos de utilizao direta de microrganismos em processos biotecnolgicos em diferentes segmentos da indstria.
Indstria de alimentos produo e preservao de alimentos produo de bebidas aromas e essncias aditivos para alimentos (emulsificantes e espessantes) alimentos funcionais (nutracuticos) Indstria farmacutica compostos farmacologicamente ativos antibiticos, antimicrobianos e antivirais vitaminas e hormnios vacinas e probiticos biopolmeros de aplicao mdica (e.g., pele artificial) biotransformaes em qumica fina Agro-Indstria aumento de fertilidade do solo fixao biolgica de nitrognio controle biolgico de insetos e patgenos promotores de crescimento de plantas promotores de crescimento animal anti-parasiticidas, antibiticos, antimicrobianos, antivirais vitaminas e hormnios vacinas e probiticos compostagem e tratamento biolgico de resduos Indstria Qumica biotransformaes em qumica fina e produo de matrias-primas assimilao de metano e enxofre em processos industriais surfactantes matrias-primas industriais diversas: polissacardeos, polmeros, cidos orgnicos, aminocidos enzimas de aplicao industrial (detergentes, texteis, papel e celulose) Ambiental biorremediao de vazamentos de petrleo e resduos txicos monitoramento de poluentes (biosensores) tratamento de resduos industriais e guas residurias biominerao (recuperao de metais pesados e radioistopos) recuperao de reas degradadas (micorrizas e bactrias fixadoras de nitrognios) Energia gerao de combustveis: lcool e biorefino de petrleo

A perspectiva de desenvolvimento da biotecnologia no sculo 21 em diferentes setores industriais bastante heterognea (Tabela 2). At o momento, o impacto maior da biotecnologia foi no setor farmacutico, mas evidente que um potencial de desenvolvimento significativo existe para os demais setores industriais (WFCC, 1998), apesar das projees de curto termo (Bull et al., 2000) no evidenciarem uma mudana de cenrio para os setores com contribuio de mercado menor que 1%.

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Tabela 2. Fatias de mercado de setores selecionados do mercado mundial de biotecnologia.* Setores Qumica Farmacutica/ qumica fina Papel e polpa Alimentos Textil Couro Energia
*Dados de Bull et al. (2000).

Fatias de mercado (%) 1996 Previso para 2005 <1 <1 511 1022 5 35 12 24 <1 <1 <1 <1 <1 <1

3. A Mudana de Paradigma
Os recentes avanos em cincia e tecnologia esto conduzindo a uma reviso e re-orientao de metodologias, permitindo que questes antigas e atuais sejam abordadas sob uma nova tica (Wei, 1999). A mudana de paradigma observada nos ltimos anos nas reas de biologia e biotecnologia exemplificada pela transio do enfoque da biologia tradicional para o enfoque da bioinformtica e informtica para biodiversidade. Na abordagem de biologia tradicional, a estratgia de busca e descoberta baseada na coleta de espcimes, na observao do sistema e na experimentao laboratorial, visando a organizao sistemtica do conhecimento e a formulao de conceitos. Os resultados desta abordagem podem ser ilustrados pelo processo de descoberta de antibiticos ou pela estratgia de desenvolvimento de ensaios de seleo e triagem de inibidores enzimticos (Umezawa, 1972). A abordagem de bioinformtica baseada na coleta e armazenamento e de dados em bases de dados e na anlise e sntese da informao ( data mining), visando a gerao de conhecimento. A mudana conceitual consiste na gerao de conhecimento, ou seja, o entendimento do que importante em uma dada situao, a partir da informao e dos dados disponveis (o conjunto de tudo o que se sabe sobre a situao em foco). Bases de dados para bioinformtica incluem seqncias de DNA (genomas), RNA e protenas, proteomas, estruturas moleculares, diversidade qumica, biotransformaes e biocatlises, vias metablicas (metabolomas), biodiversidade e sistemtica. Assim, experimentos inovadores podem ser realizados in silico ao invz de in vivo ou in vitro, reduzindo a um mnimo essencial a necessidade de realizao de experimentos com modelos biolgicos em laboratrio. Os resultados desta abordagem podem ser exemplificados pelo

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processo de gerao de novos alvos farmacolgicos via dados de genmica funcional. A abordagem da informtica para biodiversidade tem como alvo a integrao de dados ambientais e biogeogrficos com informaes taxonmicas e dados complementares de interaes biticas, abiticas, bibliografia, bibliotecas digitais e outras, atravs da construo de sistemas de informao inter-operveis. Um modelo deste tipo de base de dados em microbiologia, voltado para o foco de taxonomia foi desenvolvido pelo Center for Microbial Ecology (http://www.cme.msu.edu), Michigan State University em 1997 (Larsen et al, 1997; Olivieri et al., 1995). Esta mudaa de paradigma sustentada por uma combinao de fatores crticos, incluindo: o ritmo acelerado de avanos tecnolgicos em reas distintas (e.g., bioinformtica, qumica combinatria, seleo e triagem de alto desempenho, bioeletrnica); a demanda da indstria e sociedade por descobertas inovadoras; presso para reduo do prazo e custos na descoberta de novos produtos; e, fatores de mercado ligados re-estruturao das indstrias de biotecnologia no cenrio global (aquisies e fuses).

4. Recursos Genticos Microbianos para a Biotecnologia na Era Ps-Genmica


Alguns componentes da mudana de paradigma em biotecnologia requerem especial ateno: sistemtica e ecologia microbiana, bioinformtica e informtica para biodiversidade, genmica e metagenmica, centros de recursos biolgicos e perfil das novas empresas de base tecnolgica. 4.1. Importncia da sistemtica como ferramenta

A sistemtica microbiana aplicada uma ferramenta poderosa na busca da inovao no desenvolvimento da biotecnologia. Em uma abordagem tradicional baseada na estratgia de isolamento e cultivo de microrganismos, ou mesmo em abordagens de bioprospeco molecular independentes de cultivo, a caracterizao da diversidade de espcies (diversidade alfa ou riqueza de espcies) de uma dada amostra ou ambiente pode fornecer informaes crticas para o delineamento de estratgias de explorao biotecnolgica. Inventrios de diversidade taxonmica determinam a extenso da diversidade de organismos presente na amostra e como tal potencial pode ser explorado. Estas informaes se tornam parte integral de uma base de conhecimento sobre a funcionalidade do ecossistema amostrado e este conjunto tem um papel importante no sucesso de um programa de bioprospeco.

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A taxonomia existe em um estado dinmico, onde os esquemas de classificao de microrganismos so modificados em funo do acmulo contnuo de novos dados. Nos ltimos anos, revises radicais foram propostas na classificao de diversos grupos microbianos, tanto em nvel de espcies e gneros, como na categoria de famlias e divises superiores, frente a evidncias fornecidas principalmente por dados moleculares de sequenciamento de DNA. Assim, a sistemtica microbiana pode ser uma ferramenta importante para o desenho de estratgias de busca e descoberta em biotecnologia. A aplicao da sistemtica microbiana em estgios iniciais da prospeco biotecnolgica permite a racionalizao de esforos no sentido de se identificar o novo dentre a diversidade de organismos presentes em uma dada amostra ambiental e, combinada bioinformtica, em um sistema dinmico de aquisio de dados ao longo do programa de bioprospeco biotecnolgica, direcionar a prospeco de forma racional na explorao de novos ambientes, enfocando ambientes e grupos microbianos que apresentem altas taxas de sucesso nos ensaios de seleo e triagem. Esta estratgia de prospeco direcionada por informaes de sistemtica e dados geo-ecolgicos hoje continuamente aperfeioada e aplicada em grandes e pequenas empresas de biotecnologia em diferentes reas. 4.2. Ecologia microbiana: biogeografia e biodiversidade

A biogeografia estuda a distribuio geogrfica dos organismos, tendo se desenvolvido com referncia quase exclusiva ecologia de plantas e de animais. Espcies de ocorrncia restrita a regies geogrficas especficas so denominadas endmicas, enquanto que aquelas que apresentam uma distribuio ampla em diversas regies do globo so denominadas cosmopolitas. O conhecimento sobre a biogeografia de organismos fundamental para se determinar a real extenso da diversidade microbiana, identificao de txons ameaados de extino e identificao de funes ecolgicas de espcies nos ecossistemas (Staley & Gosink, 1999). Para os propsitos de bioprospeco e biotecnologia, o conhecimento de biogeografia importante para a definio de estratgias de busca e descoberta, ou seja, onde procurar por recursos biolgicos potencialmente novos, e na definio de reas de conservao de recursos biolgicos e pools gnicos ricos em diversidade (Bull et al., 2000). A biogegrafia microbiana uma questo bastante controversa entre pesquisadores da rea e existem debates acirrados sobre a aplicao deste conceito em microbiologia. Ecologistas microbianos e taxonomistas tenderam a ser relativamente pouco crticos em relao s colocaes de Beijerinck e BaasBecking (Staley & Gosink, 1999) de que bactrias (e por extenso todos os microrganismos) so cosmopolitas. A afirmao de que tudo est em todo lugar (everything is everywhere ), qual Baas-Becking adicionou e o ambiente seleciona, prepondera ainda hoje em diversos meios da microbiologia. Contudo, enfoques contemporneos de pesquisa contestam estas colocaes tradicionais e evidncias experimentais de que a biogeografia pode ter um papel importante em microbiologia vem se acumulando na literatura. Tiedje (1995) apresentou a questo sobre qual nvel genotpico corresponde ao tudo, se

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no nvel de espcies, como empregado para caracterizao de animais e plantas, ou em nvel de de variedades infra-especficas ou na sequncia de DNA. A escala geogrfica que deve ser aplicada para microrganismos como corresponde ao todo lugar tambm questionada: gro de areia, agregado de solo, metro quadrado ou bioma? Estas questes podem hoje ser estudadas criticamente com a aplicao de mtodos moleculares e anlise qumica de alta resoluo. Alguns autores argumentam que estudos de biogeografia microbiana devam ser conduzidos na escala de variao infra-especfica, dada a forte interrelao entre fatores ambientais e geogrficos e a especiao de microrganismos. O termo geovar (Staley & Gosink, 1999) foi proposto para especificar a variedade de um dado microrganismos endmico a uma rea especfica ou hospedeiro. Para o contexto de bioprospeco e biotecnologia, a biogeografia microbiana pode representar um componente crtico do processo de busca e descoberta, uma vez que propriedades biotecnolgicas, em diversos casos, no se apresentam distribudas uniformemente em todos os organismos de uma dada espcies, sendo associadas a linhagens especficas de uma populao microbiana. A informao de biogeografia pode auxiliar na definio de novas estratgias de explorao dos recursos biolgicos, quando so enfocados, por exemplo, as interao entre microrganismos e as relaes microrganismohospedeiro em interaes simbiticas, parasticas ou mutualismos. 4.3. Bioinformtica e informtica para biodiversidade: a integrao de dados

Conforme mencionado nas sees anteriores, a integrao de dados crtica para a definio e sucesso de estratgias de prospeco biotecnolgica. Contudo, sistemas de informao de domnio pblico com contedo abrangente em microbiologia so raros e restritos a poucos grupos de microrganismos especficos, principalmente relacionados sade humana. Existe uma demanda crescente de integrao entre recursos biolgicos e bases de dados contendo informaes diversas, tais como: seqncias de nucleotdeos, protemica e propriedades tecnolgicas (Tiedje et al, 1995). Centros de recursos biolgicos necessariamente tero que se estruturar para viabilizar estes tipos de integrao. 4.4. Genmica funcional: chave para novas descobertas e aplicaes

Genmica consiste na atividade de sequenciar genomas e derivar informaes tericas a partir da anlise das seqncias utilizando ferramentas computacionais. Em contraste, a genmica funcional define o status do transcriptoma e do proteoma de uma clula, tecido ou organismo sob condies definidas. O termo transcriptoma se refere ao perfil de transcrio gnica (mRNA), enquanto que o termo proteoma define o conjunto de protenas derivado da traduo do genoma, incluindo modificaes ps-transcricionais de protenas, e

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proporciona informaes sobre a distribuio de protenas na clula ou organismo em funo do tempo ou em resposta ao ambiente. Juntas, genmica e genmica funcional proporcionam um mapa molecular preciso de uma dada clula ou organismo, e com isso, fornece informaes para a busca de novos alvos para estratgias de busca e descoberta em biotecnologia. Desenvolvimentos em tecnologia de sequenciamento e biologia molecular hoje permitem o sequenciamento em larga escala de DNA e a coleta em larga escala de dados experimentais atravs de ensaios robotizados e automatizados. Com isso, a quantidade de informao sobre genomas microbianos disponvel em bancos de dados (TIGR Microbial Database, http://www.tigr.org/tdb/mdb/mdb.html) e o potencial de utilizao destas informaes para prospeco de novos alvos para seleo dirigida de molculas com propriedades de interao stio-especfica aumenta em rtmo exponencial. Ocorre hoje uma migrao do in vitro para in silico (bioprospeco por data mining), onde, a partir de uma base de informao, se desenham estratgias para seleo e triagem in vivo. Claramente, o Projeto do Genoma Humano tambm ter um impacto significativo na identificao de alvos potenciais para novas drogas, e estes alvos certamente influenciaro no desenho de estratgias especficas de seleo e triagem para drogas teraputicas. O sucesso da abordagem de desenho racional de seleo realizados com a protease do vrus HIV-1 levaram rapidamente ao desenvolvimento de novas estratgias de desenho racional voltadas para a identificao de novos genes, anlises de vias metablicas e determinao de interaes protena-protena utilizando sistemas diversos, incluindo sistemas hbridos em leveduras, biosensores de protenas fluorescentes e modelagem de estrutura tridimensional. A tecnologia de DNA microarrays acrescentou uma ferramenta poderosa ao estudo de expresso gnica para o estudo da interao de molculas bioativas com clulas, tecidos e organismos. A utilizao destas novas metodologias e estratgias tem a vantagem de serem aplicveis no estudo e caracterizao de genes diversos, conhecidos ou no, incluindo a prospeco de alvos em genomas de organismos ainda no cultivveis ou difceis de se cultivar em laboratrio, tal como Mycobacterium leprae, causador da hansenase, e Treponema pallidum , agente causal da sfilis. 4.5. Metagenoma: explorao do potencial biotecnolgico de organismos no-cultivados

Metodologias moleculares que independem do cultivo, baseadas em extrao direta de cidos nuclicos de amostras ambientais (Figura 2), associada s tcnicas de hibridizao com sondas grupo-especficas e/ou PCR, clonagem e sequenciamento, vm permitindo uma avaliao mais precisa da diversidade microbiana no ambiente e a descoberta de novos grupos de organismos, nunca antes cultivados. Entretanto, estas metodologias no nos permitem ter acesso ao potencial metablico destes novos organismos, uma vez que as etapas de isolamento e cultivo so suprimidas dos estudos.

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Figura 2. Diagrama da estratgia de busca e descoberta de produtos microbianos atravs da clonagem e expresso do DNA extrado diretamente da amostra ambiental (metagenoma) (adaptado de Bruggeman, 1998).

Uma estratgia alternativa para este problema envolve o uso do vetor BAC (Bacterial Artificial Chromosome) para clonagem de fragmentos grandes de DNA (>100 kb) a partir de amostras ambientais (Figura 3). Estes vetores tm a habilidade de manter de maneira estvel fragmentos grandes de DNA exgeno em hospedeiros como Escherichia coli, e tm sido usados em bibliotecas genmicas de eucariotos. O mtodo consiste na clonagem de fragmentos grandes de DNA, originados de DNA da comunidade microbiana total extrado diretamente de ambientes como solo ou sedimento (metagenoma), e anlise das bibliotecas resultantes em busca de uma nova expresso fenotpica na linhagem hospedeira de E. coli. No caso de se usar a estratgia BAC para genomas bacterianos, existe a vantagem de que alguma expresso gnica ocorrer nos clones BAC, pois o DNA inserido procaritico.

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Figura 3. Diagrama da estratgia convencional e estratgia BAC para clonagem e expresso de fragmentos de DNA ambiental (adaptado de Rondon et al., 1999) .

Comparado s estratgias convencionais de clonagem de fragmentos relativamente pequenos de DNA (2-5 Kb), a estratgia BAC abre perspectivas para a descoberta de novos produtos naturais pela expresso por genes localizados em operons ou vias biossintticas extensas. Os genes requeridos para a biossntese de muitos antibiticos e outros metablitos geralmente esto agrupados, juntamente com genes para auto-resistncia, e so comumente grandes e difceis de clonar usando-se estratgias convencionais. Com a estratgia BAC possvel clonar uma via biossinttica inteira em um plasmdio BAC, permitindo a captura, expresso e deteco de produtos naturais a partir de uma biblioteca construda de DNA ambiental. Ainda, a produo de tais compostos em um sistema geneticamente definido como aquele de Escherichia coli torna a manipulao dos genes clonados mais fcil. Bibliotecas BAC oferecem uma ferramenta para assessar de maneira mais abrangente a diversidade total em um dado ambiente, permitindo a anlise de genes funcionais de membros da microbiota, inclusive de microrganismos nocultivados.

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4.6.

Centros de Recursos Biolgicos (CRBs)

Centros de Recursos Biolgicos (CRBs) so parte essencial da infraestrutura de apoio as cincias da vida e biotecnologia, atuando como provedores de servios e repositrios de clulas vivas, genomas de organismos e informao relacionada a hereditariedade e funes de sistemas biolgicos. CRBs contm colees de organismos cultivveis (microrganismos, clulas de plantas, animais e humanas), partes replicveis destas (e.g., bibliotecas genmicas, plasmdeos, vrus, cDNAs), organismos viveis mais ainda no-cultivados, clulas e tecidos, assim como base de dados contendo informao molecular, fisiolgica e estrutural relevantes a estas colees e bioinformtica relacionada (definio baseada no relatrio do Working Party on Biotechnology, fevereiro de 2001). Localizao estratgica e capacitao tcnica e operacional dos CRBs so fatores determinantes para o desempenho das atividades de apoio biotecnologia. No momento, poucos CRBs, com linhas de atuao relativamente restritas, encontram-se instalados nos pases da Amrica Latina (Microbial Resource Centers and Sustainable Development in the Americas, Maio 1998, http://www.bdt.org.br/oea/sib/micwks). Dentre as funes e servios prestados por CRB, destacam-se: Centros de Recursos Genticos conservao e arquivo da diversidade biolgica e variabilidade gentica proviso de insumos par a biotecnologia distribuio de material de referncia para controle de qualidade/competitividade industrial seleo e triagem de material biolgicos para uso industrial aplicaes diversas nas reas de sade, agricultura, meio ambiente e educao Centros de Informao organizao e proviso de dados taxonmicos e tecnolgicos sobre material biolgico disponibilizao da informao sobre acervo par ensino, pesquisa, inovao tecnolgica Centros de Treinamento preservao de material biolgico bioinformtica e informtica para biodiversidade biossistemtica e taxonomia Centros de Servios Especializados caracterizao taxonmica e/ou tecnolgica de material biolgico controle de qualidade de material biolgico e testes de desafio (e.g., atividade antimicrobiana, biocorroso, etc.) depsito de material biolgico inclusive para fins patentrios

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4.7.

Novas empresas de base tecnolgica

Nos ltimos anos, diversas empresas de alta tecnologia foram criadas. Estas empresas se valem de tecnologias proprietrias utilizadas para bioprospeco genmica, baseadas na construo de bibliotecas de genes microbianos e metagenoma, incluindo genomas de organismos ainda nocultivados. Estas bibliotecas so fontes de solues inovadoras para o desenvolvimento de novos frmacos, melhoria de produtos agrcolas e desenvolvimento de processos qumicos e industriais mais eficientes, custoefetivos e de baixo impacto ambiental. As tecnologias proprietrias permitem o isolamento rpido, clonagem e expresso de genomas derivados diretamente de amostras ambientais (metagenoma). Atravs da combinao de ensaios de triagem, seleo de alto desempenho e sistemas robticos, estas empresas tem capacidade para isolar, expressar e sequenciar genes que codificam novos compostos com grande eficincia. Estas abordagens tem permitido a gerao novas molculas para a indstria farmacutica, agricultura e aplicaes industriais em ordens de magnitude muitas vezes superiores de gerao de novos compostos pela biotecnologia tradicional, baseada no isolamento e cultivo dos organismos. A complexidade e novidade de molculas bioativas de ocorrncia natural pode exceder, nestes casos, a das bibliotecas de qumica combinatria. A anlise do perfil das novas empresas de base tecnolgica tem demonstrado a internalizao de tecnologias de ponta nas reas de genmica, tecnologia de informao e robtica, que permitem a explorao de recursos biolgicos de forma inovadora e com alto desempenho. As grandes corporaes de biotecnologia, principalmente as indstrias farmacuticas, passaram a subcontratar as pequenas e mdias empresas de alta tecnologia como fonte de novas molculas para desenvolvimento de novos produtos. Como consequncia, setores tradicionalmente envolvidos no isolamento e cultivo de microrganismos nestas indstrias de grande porte tem sido remodelados ou fechados.

5. Recomendaes
A consolidao da capacidade institucional, com investimento na formao de recursos humanos, associado ao apoio a projetos integrados e consrcios temticos em microbiologia e estudos da biodiversidade microbiana contribuiro para o cumprimento dos compromissos assumidos na ratificao da Conveno da Diversidade Biolgica, fortalecendo o Programa Nacional para o uso sustentvel da diversidade microbiana. Com efeito, os artigos 7 ("identificao e monitoramento"), 8 e 9 ("conservao ex- e in-situ "), 10 e 11 ("utilizao sustentvel de componentes da diversidade biolgica" e "incentivos"), 15 e 16 ("acesso a recursos genticos" e "acesso e transferncia de tecnologia"), 12 e 18 ("pesquisa e treinamento" e "cooperao tcnica e cientfica"), 13 e 17 ("educao

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e conscientizao pblica" e "intercmbio de informaes") e 19 ("gesto da biotecnologia e distribuio de seus benefcios") dependero do desenvolvimento das aes e estratgias governamentais (Kirsop, 1998). Algumas propostas so explicitadas neste documento. As principais lacunas existentes no Pas, que dificultam o atendimento dos compromissos assumidos com a Conveno da Diversidade Biolgica e que limitam o conhecimento pleno sobre a diversidade microbiolgica, esto indicadas no relatrio do Levantamento do Estado do Conhecimento sobre a Biodiversidade, realizado pelo Ministrio do Meio Ambiente e Probio (MMA, 2001). Dentre as lacunas identificadas neste levantamento, destacamos a seguir os tpicos principais relacionados diversidade microbiana. Recomenda-se que um Programa Nacional seja implementado de forma a estimular interaes interdisciplinares, novas iniciativas taxonmicas e o gerenciamento integrado de dados (Tabela 3). Tabela 3. Quadro sumrio das lacunas cientficas e tecnolgicas, metas e estratgias de desenvolvimento para biotecnologia microbiana. Lacunas
Capacidade Institucional, Infraestrutura e Recursos Humanos

Metas
Estabelecimento de uma rede integrada de laboratrios, centros de recursos biolgicos e centros tecnolgicos

Estratgias
Apoio infraestrutura de laboratrios, colees e centros de pesquisa temticos.

Integrao de Projetos Cientficos e Tecnolgicos

Programa induzido de formao de Apoio a programas de psrecursos humanos graduao no pas, e programas induzido de formao de doutores no exterior. Apoio a cursos de curta durao no pas. Estabelecimento de consrcios Realizao de Workshops temticos para pesquisa e para definio de prospeco biotecnolgica estratgias. Editais especficos para projetos cientficos temticos integrados. Editais especficos para projetos tecnolgicos (tipo PADCT/CDT). Definio de padres mnimos para dados. Metadados. Interoperabilidade de sistemas.

Redes de Informaes e Bases de Conhecimento

Estabelecimento de redes temticas sobre diversidade microbiana e capacitao institucional/recursos humanos

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5.1.

Consolidao da capacidade institucional

A coleta, identificao e o monitoramento da diversidade microbiana possvel graas ao desenvolvimento de tcnicas laboratoriais avanadas de sistemtica e ecologia microbiana. No entanto, a infraestrutura existente nas Universidades e Institutos de Pesquisa brasileiros tm capacidade limitada para tal, dada a vasta diversidade destes organismos nos ecossistemas tropicais. Esta limitao ainda mais acentuada na regio Norte, Nordeste e Centro-Oeste, onde concentram-se os ecossistemas pertencentes aos biomas Floresta Amaznica, Cerrados e Pantanal, altamente diversos e ainda inexplorados. Nota-se que a maior parte dos poucos trabalhos de caracterizao da biodiversidade microbiana destas regies realizada nas Instituies e Universidades das regies Sudeste e Sul. Algumas das excees so o INPA (Manaus), Instituto Evandro Chagas (Belm), Universidade Federal de Pernambuco, Universidade de Braslia e as unidades descentralizadas da Embrapa (CPATU, CPAC, CENARGEN e CNPAF), situadas nas regies Norte e Centro-Oeste. H necessidade de melhorar a infra-estrutura dos laboratrios de sistemtica e ecologia de microrganismos j existentes no pas e implantar novos laboratrios em regies carentes. H necessidade tambm de aprimorar a formao de recursos humanos, aumentando o quadro, hoje bastante limitado, de cientistas realizando pesquisa em taxonomia, sistemtica e ecologia de microrganismos. No h no Pas hoje cursos de ps-graduao ou aperfeioamento voltados para a atualizao de cientistas nas mais recentes inovaes tecnolgicas aplicadas ao estudo da biodiversidade microbiana. 5.2. Apoio a projetos integrados

Os projetos de pesquisa cientfica voltados para a investigao da biodiversidade microbiana realizados no Pas so, em sua maioria, iniciativas isoladas de pesquisadores ou Instituies de Pesquisa. Muitas vezes, o mesmo problema em um mesmo bioma estudado por vrios grupos de pesquisa, mas de forma no-integrada. Em consequncia, h dificuldades para comparar e integrar os diversos resultados de pesquisa devido incompatibilidade de delineamentos experimentais, metodologias de coleta e de anlise de dados. Alm disso, os dados so coletados de forma emprica e pouco detalhada, impossibilitando a integrao e realizao de estudos biogeogrficos e ecolgicos. Na grande maioria dos casos, amostras coletadas e microrganismos isolados e caracterizados no preservados em colees de referncia permanentes, impossibilitando, portanto, o desenvolvimento de estudos posteriores visando o desenvolvimento cientfico e tecnolgico. Faltam iniciativas integradas e interdisciplinares direcionadas a investigar as interaes entre a microbiota e biosfera, efeitos das mudanas globais (de origem natural e antrpica) e relaes inter-especficas no ambiente. Estes estudos devem contemplar no s levantamentos taxonmicos da diversidade de

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espcies, mas tambm avaliar os aspectos de diversidade funcional e processos ecolgicos associados microbiota. Estudos desta natureza contribuiro decisivamente para o conhecimento e o uso da diversidade microbiana para fins biotecnolgicos. 5.3. Estabelecimento de redes de informao especializadas

So poucas as iniciativas de integrao dos dados existentes sobre a biodiversidade microbiana em bases de dados e redes temticas conectadas via Internet. A organizao e acesso informao sobre biodiversidade microbiana so requisitos fundamentais para o desenvolvimento de estratgias de inovao em biotecnologia, conforme descrito anteriormente. importante destacar que sistemas de informao para bioprospeco e biotecnologia devero contemplar a integrao de dados supra-especficos (e.g., clima, caractersticas ambientais, biogeografia, caractersticas tecnolgicas, etc... ) com as caractersticas infraespecficas do material biolgico (e.g., genoma e expresso gnica). 5.4. Apoio ao estabelecimento de empresas emergentes de alta tecnologia

O apoio ao estabelecimento de empresas emergentes de alta tecnologia fundamental para a transferncia do conhecimento cientfico para os setores associados inovao tecnolgica. Isto trar novas oportunidades para que estas empresas de pequeno porte e alta tecnologia possam agregar valor diversidade microbiana brasileira, permitindo que os contratos com as empresas de grande porte, nacionais e internacionais, sejam feitos em bases mais vantajosas para o pas. Isso abrir novas oportunidades para incorporao de recursos humanos altamente qualificados a serem treinados no Programa de Capacitao e gerados por outros programas j em andamento (e.g., genomas). 5.5. Apoio consolidao da Rede Brasileira de Centros de Recursos Biolgicos

Colees de referncia, centros depositrios de material biolgico associados a processos de patentes e colees especializadas da diversidade microbiana tero um papel fundamental no desenvolvimento do Programa de Biotecnologia. Visando um salto qualitativo na capacitao para desenvolvimento da biotecnologia no pas, as seguintes metas devem ser consideradas: estabelecer uma rede integrada de laboratrios de sistemtica, ecologia microbiana e biotecnologia, centros de recursos biolgicos, centros de informao e pequenas empresas de alta tecnologia para fomentar o uso biotecnolgico de microrganismos e material biolgico. estabelecer um programa induzido de formao de recursos humanos voltados para sistemtica aplicada, inovao em ecologia microbiana, bioprospeco e utilizao biotecnolgica de microrganismos.

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estabelecer consrcios temticos de pesquisa tecnolgica em bioprospeco, com investimentos do setor privado no Pas, integrando redes distribudas de seleo e triagem de enzimas, metablitos secundrios, produtos farmacolgicos, num esforo voltado para desenvolvimento de produtos. estruturar redes temticas de informao e pesquisa em diversidade microbiana (e.g., bactrias, fungos, leveduras), integradas a grupos atuantes em levantamentos e inventrios de diversidade de fauna e flora j atuantes no pas. As interaes interdisciplinares sero fundamentais para: estimular a participao de bilogos, eclogos, qumicos e especialistas em informao em projetos de pesquisa associados a biodiversidade microbiana e sua funo em ecossistemas; catalisar o emprego de conceitos e tcnicas de biologia molecular em estudos de biodiversidade de microrganismos; evidenciar a importncia econmica da biota microbiana no meio ambiente, e apoiar a reviso e sntese do valor direto e indireto das comunidades microbianas para a sustentabilidade. As novas iniciativas taxonmicas sero essenciais para: apoiar a anlise e sntese de informaes taxonmicas, ecolgicas e biogeogrficas da microbiota visando a identificao de espcies de importncia econmica e suas funes no ambiente, indicadores de sustentabilidade e avaliao da perda de espcies e descoberta de novas espcies ainda no descritas para a cincia; estimular a ampliao do nmero de especialistas em fisiologia e ecologia microbianas.

Deve ser realizado um levantamento e diagnstico visando subsidiar o fortalecimento das seguintes atividades: estabelecer estratgias inovadoras na formao e aperfeioamento de especialistas em diferentes nveis, incluindo graduao, ps-graduao (mestrado no pas, doutorado pleno no exterior, doutorado sanduche) e cursos de curta durao de treinamento e aperfeioamento no pas com a participao de especialistas internacionais; priorizar o treinamento envolvendo metodologias inovadoras como o emprego de tcnicas moleculares e genmica funcional; estimular o desenvolvimento de novos mtodos que incorporem os recentes avanos tecnolgicos para a deteco, amostragem, coleta, cultivo e identificao de microrganismos; estimular o depsito de amostras, espcimes, seqncias, dados e imagens de microrganismos cultivveis em acervos cientficos e colees de servios e referncia; estimular o gerenciamento e disseminao de dados de colees via Internet.

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O gerenciamento integrado de dados dever ter como meta: incorporar informaes taxonmicas e ecolgicas nos modelos de bases de dados no incio dos programas e projetos de pesquisa; desenvolver protocolos de gerenciamento de informaes de forma a permitir a associao de dados sobre processos ecolgicos com dados de biodiversidade (seqncias, taxonomia, caractersticas de linhagens e espcimes, funes na natureza, etc .); desenvolver padres mnimos e metadados para a organizao da informao sobre processos ecolgicos de forma a facilitar a descrio de ecossistemas e gerenciamento das informaes; estabelecer uma rede na Internet dedicada a biodiversidade microbiana, com bases de dados sobre protocolos de metodologias, repositrios de amostras e seqncias, biblioteca virtual com apontadores para documentos e eventos importantes, chaves taxonmicas com imagens, material para educao e treinamento e um servio de apoio e informaes.

6. Estratgias
6.1. Diagnstico da capacidade institucional e detalhamento da estratgia nacional

Este diagnstico visa o levantamento completo da capacidade instalada e recursos humanos disponveis no Pas para o estudo e uso da biodiversidade microbiana. A base de informaes deste levantamento poder contemplar a integrao e complementao de bases de dados j existentes no pas, como o Cadastro de Pesquisa e Currculo Lattes do CNPq. O diagnstico deve tambm contemplar os desenvolvimentos da biotecnologia microbiana no cenrio internacional, com especial ateno s novas abordagens empregadas por empresas de alta tecnologia para a utilizao de recursos biolgicos microbianos e definio de tendncias coorporativas no cenrio empresarial. Este diagnstico dever subsidiar a elaborao de um plano estratgico de apoio a programas e projetos de pesquisa integrados e consrcios tecnolgicos para explorao biotecnolgica da biodiversidade microbiana. Este levantamento deve ser realizado de forma integrada e colaborativa com as sociedades cientficas atuantes no setor (e.g., Sociedade Brasileira de Microbiologia). Prazo: segundo semestre de 2001, durao de 6 meses Atividades: levantamento, anlise e processamento de dados, incluindo visita s instituies e reunies do grupo de trabalho para anlise e sntese dos dados e delineamento da estratgia nacional. Custo estimado: R$ 60.000

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6.2.

Capacitao de recursos humanos

Esta estratgia dever ser implementada atravs de programas induzidos visando a formao de recursos humanos especializados e pessoal de apoio tcnico voltados para o conhecimento e explorao da biodiversidade microbiana. As definies de reas estratgicas devero ser embasadas nos levantamentos de capacitao no pas e podero ser complementadas por dados de levantamentos internacionais (Hawksworth & Ritchie, 1993). Estes programas devero possibilitar um aumento significativo do nmero de bolsas e recursos de bancada oferecidos para cursos de ps-graduao e extenso, incluindo: Mestrado e Doutorado no pas Doutorado Sanduche e Doutorado pleno no exterior (continuidade e ampliao do Programa Induzido do CNPq j existente) Cursos de aperfeioamento de curta durao no pas 6.3. Workshops para definio de estratgias

Workshop 1) Proposta de um programa nacional para explorao biotecnolgica da diversidade microbiana Objetivo: Ampliar a discusso do plano estratgico com a comunidade cientfica e empresarial. Data provvel: primeiro semestre de 2002 Custo previsto: R$ 60.000 Workshop 2) Tecnologias e estratgias para bioprospeco, seleo e triagem de microrganismos de interesse industrial Objetivo: Explorao de alianas estratgicas para estabelecimento e desenvolvimento de consrcios tecnolgicos. Data provvel: segundo semestre de 2002 Custo previsto: R$60.000 6.4. Estabelecimento de redes temticas especializadas e integradas

Dever ser dado nfase estruturao de redes temticas na Internet de pesquisadores e informaes, conectando bancos de dados, listas de discusso e bases de informao de projetos de pesquisa, nos seguintes tpicos: diversidade microbiana: incluindo sub-redes especializadas por grupos microbianos (fungos, leveduras, bactrias, etc.) enfoques de pesquisa e atuao temtica: ecologia, genmica, bioprospeco, acervos especializados e aplicaes tecnolgicas Custo: a ser definido.

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6.5.

Estabelecimento de Centros Temticos

Centros de apoio biotecnologia, incluindo Colees de Referncia, Colees de Recursos Biolgicos e Laboratrios de Servios Especializados (e.g., caracterizao taxonmica) devero ser estruturados na forma de uma rede distribuda e integrada. Essa ao dever priorizar projetos de pesquisa integrados e interdisciplinares que enfoquem a elucidao das relaes entre biodiversidade funcional, taxonmica e processos biogeoqumicos, definio de bioindicadores de qualidade e sustentabilidade de ecossistemas, desenvolvimento de metodologias e protocolos de coleta e estruturao e ampliao de bases de conhecimento e acervos especializados em biodiversidade microbiana. Custo: a ser definido. 6.6. Programas de apoio a consrcios de biotecnologia

Esta ao dever ser elaborada tendo como modelos programas j existentes, tais como o PADCT/CDT (projetos de plataforma tecnolgica) e programas PIPE/PITE FAPESP, fomentando a interao de grupos de pesquisa e setor produtivo. Nestes programas, as empresas privadas devero investir no desenvolvimento de tecnologia com contrapartida de investimentos governamentais para a pesquisa aplicada em biotecnologia. O envolvimento do setor produtivo nas primeiras etapas do processo uma estratgia eficiente para o garantir o direcionamento do desenvolvimento de bioprospeco voltado para o mercado e produtos. Custo: a ser definido.

7. Prioridades
Visando atingir resultados tangveis a curto e mdio prazo (3 a 10 anos) necessrio alocar recursos de forma a viabilizar diversas aes. 7.1. Prioridades Imediatas (2001-2002)

1. Consolidao do Plano Estratgico e anlise crtica dos desafios, oportunidades e benefcios associados implementao de um programa nacional. Detalhar cronograma e estimativa de custos para as atividades a serem desenvolvidas. Sugerimos que sejam realizadas duas reunies presenciais de um grupo de trabalho para atender esta prioridade. 2. Induo de capacitao de recursos humanos nos seguintes tpicos prioritrios:

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sistemtica molecular e taxonomia polifsica genmica funcional ecofisiologia microbiana e ciclos biogeoqumicos biogeografia, dinmica de populaes e modelagem bioprospeco, seleo e triagem de microrganismos de interesse industrial.

3. Realizao de dois workshops visando estabelecer: alianas estratgicas para projetos cientficos e tecnolgicos. projetos multinacionais no mbito da CDB, com recursos do GEF. 4. Estabelecimento de Redes Temticas Integradas 7.2. Prioridades de Mdio Prazo (3-5 Anos)

1. Estabelecimento de centros temticos de pesquisa e tecnologia (aos moldes dos centros NSF) e apoio a consrcios temticos, priorizando as seguintes abordagens: emprego de metodologias inovadoras e protocolos padronizados de amostragem. integrao de dados cientficos e tecnolgicos e disponibilizao atravs de redes informatizadas. enfoque no estudo de grupos funcionais, espcies chave e estrutura de comunidades e taxa de interesse tecnolgico 2. Estabelecimento de consrcios e incubadoras de empresas de base tecnolgica priorizando atividades de: bioprospeco seleo e triagem (screening) de microrganismos de interesse industrial e ambiental prestao de servios especializados e consultorias. 7.3. Prioridades de Longo Prazo (5 a 10 Anos)

1. Consolidao das redes integradas de diversidade microbiana composta de: centros temticos de pesquisa e tecnologia colees de referncia (culturas tipo e espcimes para estudos taxonmicos) e Centros de Recursos Biolgicos (CRBs) laboratrios de servios especializados (sequenciamento, sistemtica aplicada) empresas de alta tecnologia em bioprospeco molecular e laboratrios provedores de servios especializados.

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8. Referncias
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