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Classificao e Nomenclatura
Taxonomia
A cincia da classificao dos organismos Proporciona nomes universais dos
Terminologia Taxonmica
Taxon- um grupo taxonmico de qualquer nvel (plural:
taxa). Sinnimo- dois ou mais nomes que se aplicam ao mesmo taxon. Basionmio- o nome original de um taxon. Autor(es)- a(s) primeira(s) pessoa(s) de descrever o taxon. Revisionary author/s- a(s) pessoa(s) que modificaram o nome. Etimologia- a derivao, origem, ou historia de uma palavra. Espcime tipo- a espcime designado para servir como ponto de referencia para um nome cientfico.
Holtipo Lecttipo
Sistemtica
Musgos Samambaias
Pinheiros
Ips Flores
causar cause ambiguidade ou confuso Evitar a criao suprflua de nomes novos Promover a preciso e certeza gramtica
Os Cdigos Diferentes
1) Os cdigos tinham datas diferentes de
implementao
Botnico : Species Plantarum : Linnaeus, 1753. Zoolgico : Systema Naturae : Linnaeus, 1758; Araneae swecici Clerck, 1757, Bacteriolgico : 1 de janeiro de 1980 (nomes mais velhos somente quando includos na lista
2) Os cdigos so independentes
=> homnimos entre cdigos so possveis, permitidos, e comum Lactarius nonfungus Nolf e Bajpai 1992: peixe Lactarius nonpiscis Verbeken 1996: fungo
Os Cdigos Diferentes
Princpio da coordenao: Nomes estabelecidos a qualquer nvel dentro dos grupos de Famlia, Gnero ou Espcie so considerados estabelecidos a qualquer nvel dentro do grupo
Grupo de Famlia: Super-,Famlia, sub-, Tribo, subGrupo de Gnero: Gnero, subGrupo de Espcie: Espcie, sub-
Somente na Zoologia
Os Cdigos Diferentes
Princpio da coordenao Tautnomios
(Bison bison, Glis glis, Mops mops...)
permitido na zoologia;
Os Cdigos Diferentes
Cdigos de Nomenclatura
Cdigos em andamento
Comit Internacional da Taxonomia de Vrus (ICTV)
Princpios da Nomenclatura
Nomenclatura = ferramenta de dar nome
14
Procariotos
Cobra os nveis de Classe a subespcie. Nveis de Reino e Filo (Domnio) no so tratados no
cdigo.
apropriado aos organismos classificados. Classificao: a teoria e processo de ordenao de organismos, a base de propriedades compartilhadas, em grupos. Identificao: obteno de dados sobre as propriedades do organismo (caracterizao) e a determina a qual espcie pertence. Isso se baseia na comparao direta de grupos taxonmicos conhecidos.
Cdigos de Nomenclatura
Cdigo Internacional da Nomenclatura de Bactria (ICNB)
Governa os nomes cientficos de bactria Cdigo bacteriolgico inicial em 1947 descartado, e o ICNB foi estabelecido em 1980 Fixa 1 de janeiro de 1980 como comeo oficial Governado pelo Comit Internacional da Sistemtica dos Procariotos (ICSP)
Classificao de Bactria
1735 Reinos Plantae e Animalia 1857 Bactria e fungos alocados no Reino Plantae Flora 1866 Reino Protista proposto para bactria, protozoa, alga, e fungo 1937 Prokaryote introduzido para clulas sem um ncleo" 1961 Prokaryote definida como uma clula na qual a nucleoplasma no rodeada por uma membrana nuclear 1959 Reino Fungi 1968 Reino Procarioto proposto 1969 1978 Dois tipos de clulas procariotas encontradas
Espcies de Bactria
Uma cepa da espcie designada como a cepa do tipo. Outras cepas com parentesco alto so da mesma espcie. No existe um mtodo completamente objetivo para delimitar espcies. O padro aceito atualmente uma hibridizao de 70% DNA-DNA (DDH)
Nomes de Bactria
Bacillus subtilis (Ehrenberg 1835) Cohn 1872 Rhizobium meliloti Dangeard 1926
et
Sinnimos
9612 Nomes de Espcies mas somente 8062 Espcies?
Combinao Nova (mudana taxonomica) Rhizobium meliloti -> Ensifer meliloti
Hibridizao de DNA
DNA de organismo 1 DNA de organismo 2
Combinar cadeias Separadas de DNA Esfria para permitir a Renaturalizao de DNA De duas cadeias
Hibridizao completa Hibridizao parcial Sem hibridizao Organismos idnticos Organismos com parentesco Organismos sem parentesco
Stackebrandt, E. and J. Ebers. (2006) Taxonomic parameters revisited: tarnished gold standards. Microbiology Today :152-155.
Goris, J., Konstantinidis, K.T., Klappenbach, J.A., Coenye, T., Vandamme, P., Tiedje, J.M. (2007) DNA DNA hybridization values and their relationship to whole-genome sequence similarities. IJSEM 57:8191. doi:10.1099/ijs.0.64483-0
Referencias de Taxonomia
NCBI Taxonomy
Cdigos de Nomenclatura
Cdigo Internacional da Nomenclatura Botnica (ICBN)
Governa os nomes cientficos das plantas e fungos Estabelecido em 1867, e formalizado em 1930 Fixa 1 de maio de 1753 como comeo oficial (Species Plantarum) Governado pelo Congresso Internacional de Botnica (IBC) Conduzido pela Associao Internacional da Taxonomia vegetal Revisada a cada 6 anos no IBC (atualmente 2006 Cdigo de Viena)
Nomenclatura Botnica
As regas da nomenclatura vegetal so enunciados no Cdigo Internacional da Nomenclatura Botnica (ICBN) Angiospermas,Gimnospermas, Pteridfitos, Brifitas, Algas, Fungos, Cianobactria, Protistas fotossintticas, Fosseis e hbridos
Regras e Cdigos
As primeiras regras da nomenclatura vegetal eram propostas por A.P. De Candolle em 1867. As regras atuais so coordenadas pela Comit de Nomenclatura do Congresso Internacional de Botnica (IBC) O primeiro congresso do IBC foi realizado em Viena em 1908 O ltimo cdigo foi publicado em 2000 resultante do congresso em 1999 do IBC
A nomenclatura botnica independente das nomenclaturas de zoologia e bactria A aplicao de nomes de grupos taxonmicos ids determined by means de tipos da nomenclatura A nomenclatura de um grupo taxonmico se baseia na prioridade da publicao Cada grupo taxonmico with a particular circumscription posio e nvel podem ter somente um nome coreto Os nomes cientficos so escritos em Latim independentemente de sua derivao As regras da nomenclatura so retroativas ao menos que so limitadas expressamente
Os Cdigos
Existem cdigos de nomenclatura para outros grupos maiores de organismos:
Plantas cultivadas Animais
(International code of Nomenclature of cultivated plants) (International Code of Zoological Nomenclature)
Bactria
texto usando a palavra typus ou holotypus Aps de 1 de janeiro de 2001 a designao precisa incluir a frase aqui designado O trabalho precisa ser publicado efetivamente A designao se aplica somente ao nvel do taxon publicado
O conceito do tipo
A cadeia do tipo
Famlia
Gnero
Espcie
Princpio da Tipificao
Art. 61.1 Cada taxon nominal nos grupos de famlia, gnero ou espcie tem atualmente ou potencialmente um tipo que leva o nome. A fixao do tipo que leva o nome de um taxon nominal proporciona o padro objetivo da referencia da aplicao do nome que leva. 61.1.1. O nome vlido do taxon determinado pelo(s) tipo(s) que levam o nome 61.1.2. Objetividade pela tipificao continua na hierarquia dos nomes, do grupo de espcies a famlias 61.1.3. Tipos que levam o nome (geralmente) so estveis e proporcionam uma continuidade objetiva na aplicao de nomes (ICZN)
=> Identidade de um nome depende somente de seu tipo,e no de sua descrio ou diagnose
Princpio da Tipificao
Tipos de tipos que levam nomes (no grupo de espcies)
(Fixada na publicao original)
Designao original
Designao subsequente
(No fixada na publicao original)
Paralectotipos: cada
espcime da serie dos sintipos que sobram aps a designao do lectotipo (= isolectotipo)
designado como o tipo que leva o nome quando acredita que no existe o espcime do tipo mas
Princpio da Tipificao
Termos no regulados pelos Cdigos Altipo: uma espcime designada do sexo oposto do holtipo Cotipo: um termo anteriormente usado para sintipo ou partipo Gentipo: um termo anteriormente usado para designar o espcie tipo de um gnero (generotipo) Toptipo: uma espcime originando da localidade do tipo da espcie ou subespcie, independentemente de se a espcime parte da serie de tipos Casos particulares: Cleptotipo, Iconotipo, Tipo do nome de famlia = Gnero Tipo do nome de um gnero = espcie
Como funciona?
Gnero Pinus Lineu, 1753 (pinheiros) Taxonomia: cinco gneros distintos
Gnero 1 : P. cedrus
Gnero 2 : P. larix
Gnero 3 : P. picea, P. balsamea Gnero 4 : P. abies Gnero 5 : P. sylvestris, P. pinea, P. cembra, P. strobus, P. taeda.
Como funciona?
Gnero Pinus Lineu, 1753 (pinheiros) Taxonomia: cinco distinct gneros distintos
Gnero 1 : P. cedrus Gnero 2 : P. larix Gnero 3 : P. picea, P. balsamea Gnero 4 : P. abies Gnero 5 : P. sylvestris, P. pinea, P. cembra, P. strobus, P. taeda.
1. Tipo de Pinus : P. sylvestris. = (5) 2. Outros: nomes novos (Cedrus, Larix, Abies e
Picea, respectivamente).
Eptipo
Princpio da Tipificao
Tipo: nico que carrega a identidade de um nome Descrio, diagnose, srios, mas irrelevantes (para propsitos da nomenclatura)
O Conceito de Basinimo
Na Zoologia:
Anthias ventralis Randall 1979 Anthias hawaiiensis Lubbock 1985 Pseudanthias ventralis (Randall 1979) Pseudanthias hawaiiensis (Lubbock 1985)
Na Botnica:
Anthias ventralis Rand. Anthias hawaiiensis Lub. Pseudanthias ventralis (Rand.) R.Pyle Pseudanthias hawaiiensis (Lub.) R.Pyle
intencionalmente (n. sp., gen. nov., nom. nov.,) Fixao explcita de tipos que levam o nome designao e deposio
Prioridade botnica
Famlia e Gnero
O nome correto o nome legitimo mais antigo ao
nvel designado.
Espcie e inferior
O nome correto a combinao do gnero ou
Para ser aplicado quando a circunscrio de um taxon contm mais de um tipo Usado mais frequentemente quando existe uma unio entre dois taxa
O Conceito de Autoridade
Na Zoologia:
Pseudanthias ventralis (Randall 1979) Pseudanthias hawaiiensis (Lubbock 1985) Anthias ventralis Randall 1979 ex Thompson
Na Botnica:
Anthias ventralis Rand. Anthias hawaiiensis Lub. Pseudanthias ventralis (Rand.) R.Pyle Pseudanthias hawaiiensis (Lub.) R.Pyle Anthias ventralis Thomp. ex Rand.
Autoridade
O autor da publicao que tem a descrio vira o autor do nome do taxon A data da descrio a data da publicao foi disponvel ao pblico
No necessariamente a mesma da data da capa
da publicao
Revistas tem tendncia de serem publicados tardiamente Diferencias de calendrios (Rssia no comeo do sculo 20)
Autoridade
A autoridade muito importante na taxonomia, frequentemente adicionado ao nome
do nvel de gnero e espcie Homo sapiens Linnaeus, 1758
Zostera noltii Hornemann Botnica: sem ano
Nveis Infraespecficos
Na Zoologia:
Anthias ventralis Randall 1979 Anthias hawaiiensis Lubbock 1985 Pseudanthias ventralis (Randall 1979) Pseudanthias hawaiiensis (Lubbock 1985)
Anthias ventralis Randall 1979 ex Thompson 1950 Anthias ventralis hawaiiensis Lubbock 1985
Na botnica:
Anthias ventralis Rand. Anthias hawaiiensis Lub. Pseudanthias ventralis (Rand.) R.Pyle Pseudanthias hawaiiensis (Lub.) R.Pyle
Anthias ventralis Thomp. ex Rand. Anthias ventralis subsp. hawaiiensis (Lub.) J.Smith Anthias ventralis var. hawaiiensis (Lub.) B.Jones Anthias ventralis subsp. hawaiiensis var. typus (Br.) Rand. Anthias ventralis subsp. typus (Br.) R.Pyle Anthias hawaiiensis subsp. typus (L.) R.Pyle
Princpios de Nomeao
Princpio da Prioridade
Princpio de Homonomio
Assim:
Testudinella tridentata Smirnov, 1931 f. curvata Wulfert 1965
vira
vira
cientficos:
adjetivo
( eira n, vora o, )
Sinnimos
Sinnimos Objetivos
Nome preocupado Sinnimos objetivos tem o mesmo tipo
Sinnimos Subjetivos
Um autor descreve um taxon, e depois outro autor
afirma que as espcimes da espcie pertencem a um taxon que foi descrito anteriormente
samabaia
Lactarius nonfungus Nolf e Bajpai 1992: peixe Lactarius nonpiscis Verbeken 1996: fungo
Sinnimos e Homnomos
Sinnimos: 2 ou mais nomes = 1 taxon
Lecane ludwigii (Eckstein, 1883) Lecane stokesi (Pell, 1890) Lecane ohioensis (Herrick, 1885)
Sinnimos e Homnomos
Homnomos: 1 name = 2 or more taxa
Lecane ornata (Harring & Myers, 1926) Lecane ornata (Daday, 1897) (syn. van L. ludwigii (Eckstein, 1883) Problema: nome de L. ornata (Harring e
Myers, 1926) non (Daday, 1897)?
Nenhum Bobo mais velho disponvel! Nomen novum necessrio: Soluo: L. myersi
Sinnimos e Homnomos
Sinnimos: 2 ou mais nomes = 1 taxon Homnomos: 1 nome = 2 ou maix taxa
Princpio da Prioridade:
Mas isso pode causar Problemas A comisso pode intervenir! (nomina rejicienda, conservanda)
Sinnimos e Homnomos
Sinnimos: 2 or more names = 1 taxon Nomenclatural (= objective, homotypic)
Taxonomic (= subjective, heterotypic) synonyms
synonyms
Sinnimos e Homnomos
Sinnimos: 2 ou mais nomes = 1 taxon Homnomios: 1 nome = 2 ou mais taxa
Lecane ornata (Harring & Myers, 1926) Lecane ornata (Daday, 1897) (sinnimo de L. ludwigii (Eckstein,
Sinnimos e Homnomos
Sinnimos: 2 ou mais nomes = 1 taxon Homnomios: 1 nome = 2 ou mais taxa
Argus Bohadsch, 1761(gastropodo); Argus Scopoli, 1763 (borboleta); Argus Scopoli, 1777 (borboleta); Argus Poli, 1791 (molusco); Argus Temminck, 1807 (ave); Argus Lamarck, 1817 (Hesperidae); Argus Boisduval, 1832 (Lycaenidae); Argus Walckenaer, 1836 (aranha); Argus Gray, 1847(molusco); Argus Gerhard, 1850 (Lycaenidae))
Sinnimos e Homnomos
Sinnimos: 2 ou mais nomes = 1 taxon
Homnomios: 1 nome = 2 ou mais taxa
Principio da Prioridade:
Disponibilidade
Estabelecido como vlido
Estabelecido como variedade
ou forma
Antes de 1961: disponvel se No explicitamente de nvel infrasubespecfico Usado ao nvel de subespcie antes de 1985 (Kutikova 1970!)
Aps 1961: no disponvel
Publicao
Os nomes precisam ser publicados para serem validos
Regras da validade so parte do cdigo
Nenhuma tese, ou WWW!
nome
Comeo da nomenclatura:
Aps o 1 de janeiro de 1958 um nome vlido ao nvel do gnero o inferior se cria somente se foi publicado com indicao do tipo. Aps o 1 de janeiro de 1990 ao publicar um nome ao nvel do gnero ou inferior a indicao do tipo precisa incluir o termo typus ou holo typus. Aps o 1 de janeiro de 1990 ao publicar um nome ao nvel de espcie ou inferior a indicao do tipo precisa incluir uma indicao do herbrio no qual o tipo is conservado.
Publicao
Validade /invalidade
Provavelmente a parte mais complexa do Cdigo
Publicao
Validade /invalidade - requerimentos
O nome precisa ser publicado efetivamente O nome precisa ser de forma correta A publicao precisa conter uma descrio ou uma diagnose do taxon. (Nomem Nudem) Ser conforme com as provises especiais
Publicao
Validade /invalidade provises especiais
Para os nomes publicados antes de 1908 uma ilustrao com analise uma alternativa aceitvel a descrio ou diagnose. Os nomes novos, excluindo para algas e taxa fosseis publicados aps o 1 de janeiro de 1935 precisam incluir uma descrio ou diagnose em Latim ou conter uma referencia a uma descrio ou diagnose publicado efetivamente. Para nomes de algas, com exceo das algas fosseis, publicados aps do 1 de janeiro de 1958 uma descrio ou diagnose em Latim necessria para uma publicao vlida. Para nomes de plantas fosseis publicados aps o 1 de janeiro de 1996 uma descrio ou diagnose em Latim necessria para uma publicao vlida.
Publicao
Validade/invalidade provises especiais
Os nomes nos nveis alistados na in Apndice V do cdigo so invlidos. Os eptetos especficos quando publicados precisam conter uma referencia clara do gnero ao qual so designados. O nome precisa ser aceita explicitamente pelo autor. Aps o 1 de janeiro de 1953 precisa existir uma indicao clara do nvel do nome
Publicao
Publicao Efetiva
Disseminao precisa ser via matria impressa
(aps 1953) Precisa ser disponvel ao pblico geral Ou Precisa ser registrado numa biblioteca botnica acessvel aos botnicos
Publicao
As trs barreiras da publicao
Publicado Efetivamente
Publicado Validamente
Legtimo
Nveis Extras
Super-, Sub-, Infra-
Subordem, infraordem, superfamlia No para gneros e espcies ( com exceo de
subespcies)
Filo/diviso
classe subclasse superordem ordem subordem superfamilia familia subfamilia tribo subtribo
1:
*
* * * * * - oidea - idae - inae - ini - ina
- phyta/-mycota1
- opsida/-mycetes1/ phyceae - idea/-mycetidae1/phycidae2 - anae - ales - ineae (nao usado) - aceae - oideae - eae - inae - ales - ineae (no usado) - aceae - oideae - eae - inae
fungos; : algas
Sufixos Padronizados
Nvel Divisio Subdivisio Classis Subclassis Ordo Subordo Superfamilia Familia Subfamilia Tribus Subtribus Botnica Bacteriologia Zoologia (-phyta/-mycota) (-phytina/-mycotina) (-phyceae/-mycetes/-opsida) (-phycidae/-mycetidae/-idae) -ales -ales -ineae -ineae (-oidea) -aceae -aceae -idae -oideae -oideae -inae -eae -eae (-ini) -inae -inae
64,419
28,041
Nomes de Gneros de Bactria
Em uso comum
Total
739
50 (6.8%)
29 (3.9%)
15
Em uso comum
701
48 (6.9%)
27 (3.9%)
14
Na Botnica: Publicada com validez Nome correto Sinnimo Homotipico Sinnimo Heteroptipico
Pseudanthias ventralis (Rand.) R.Pyle = Anthias ventralis Rand. = Anthias hawaiiensis Lub.
Cdigos de Nomenclatura
Greuter, W., et al. (eds), 2000. International Code of Botanical Nomenclature (St Louis Code). Regnum Vegetabile 138. Koeltz Scientific Books, Knigstein. ISBN 3-904144-22-7 Trehane, P., et al. (eds). 1995. International Code of Nomenclature for Cultivated Plants. Adapted by the International Committee for the Nomenclature of Cultivated Plants of the I.U.B.S. Regn. Veget. 133. Sneath, P.H.A., et al. (eds), 1992. International Code of Nomenclature of Bacteria. Washington (+ : Skerman, V.D.B. et al., 1980. Approved Lists of Bacterial Names). International Commission on Zoological Nomenclature, 1999. International Code of Zoological Nomenclature, 4th edition. Adopted by the I.U.B.S. The International Trust for Zoological Nomenclature, London.