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ESTRUCTURA MOLECULAR DE LOS CIDOS NUCLEICOS

Una estructura para el cido Desoxirribonucleico


Deseamos sugerir una estructura para la sal del cido Desoxirribonucleico (A.D.N.). Esta estructura tiene aspectos novedosos que son de un inters biolgico considerable. Una estructura para el cido nucleico ya ha sido propuesta por Pauling y Corey(1). Amablemente han puesto el manuscrito a nuestra disposicin antes de su publicacin. Su modelo consiste en tres cadenas entrelazadas, con los fosfatos cerca del eje de la fibra, y las bases hacia fuera. En nuestra opinin, esta estructura es poco satisfactoria por dos razones: (1) creemos que el material del que se obtienen los diagramas de rayos-X es la sal, no el cido libre. Sin los tomos de hidrgeno del cido no est claro qu las fuerzas puedan mantener la estructura unida, especialmente porque los fosfatos cargados negativamente cerca del eje se repeleran el uno al otro. (2) Algunas de las distancias de van der Waals parecen ser demasiado pequeas. Otra estructura en cadena triple ha sido sugerida por Fraser (en prensa). En su modelo los fosfatos, estn hacia fuera y las bases hacia dentro, mantenindose unidas por enlaces de hidrgeno. Esta estructura as descrita est ms bien mal definida por lo que no la comentamos. Deseamos ofrecer aqu una estructura radicalmente distinta para la sal del cido desoxirribonucleico. Esta estructura tiene dos cadenas helicoidales enrroscadas en torno al mismo eje (ver diagrama). Hemos hecho las suposiciones qumicas usuales, ms especficamente, que cada cadena consiste en grupos fosfato-dister uniendo residuos de -Ddesoxirribofuranosa con enlaces 3',5'. Las dos cadenas (pero no sus bases) se relacionan por una dada perpendicular al eje de la fibra. Ambas cadenas siguen una hlice dextrgira, pero debido a las dadas las secuencias de tomos en las dos cadenas corren en direcciones opuestas. Cada una de las cadenas, por separado se parece al modelo N 1 de Furberg (2); esto es, las bases estn sobre la parte interna de la espira y los fosfatos en la externa. La configuracin del azcar y los tomos cercanos se aproxima a la "configuracin estndar" de Furberg, el azcar se dispone perfectamente perpendicular a la base adjunta. Hay un residuo sobre cada cadena cada 3,4 en la direccin-z. Hemos asumido un ngulo de 36 grados entre residuos adyacentes en la misma cadena, para que la estructura se repita despus de 10 residuos sobre cada cadena, esto es, despus de 34 . La distancia de un tomo de fsforo desde el eje de la fibra es 10 . Como los fosfatos estn sobre la parte externa, los cationes tienen fcil acceso a ellos. La estructura es abierta, y su contenido de agua es ms bien alto. Para nosotros, a contenidos bajos las bases se acercaran y la estructura sera ms compacta.

El aspecto novedoso de la estructura es la manera en que las dos cadenas se mantienen unidas por bases pricas y pirimidnicas. Los planos de las bases son perpendiculares al eje de la fibra. Se renen en pares, una base de una de las cadenas unida mediante enlaces de hidrgeno a una base de la otra cadena, y as las dos se unen lado a lado con idntica coordenada z. Una del par debe ser purnica y la otra pirimidnica. Los enlaces de hidrgeno se hacen como se indica a continuacin: purina en posicin 1 con pirimidina en posicin 1; purina en posicin 6 con pirimidina en posicin 6 [etc.]

Esta figura es puramente esquemtica. Las dos cintas simbolizan las cadenas azcarfosfato, y las varillas horizontales los pares de bases que sostienen las cadenas unidas. La lnea vertical marca el eje de la fibra.

Si se asume que las bases slo aparecen dentro de la estructura en la forma tautomrica ms plausible (que es, con la configuracin ceto ms que con la enol) se encuentran los pares especficos de bases que pueden unirse. Estos pares son: la adenina (purnica) con timina (pirimidnica), y guanina (purnica) con citosina (pirimidnica). En otras palabras, si una adenina es uno de los miembros de un par, sobre una cadena, entonces el otro miembro debe ser timina; algo similar ocurre para la guanina y la citosina. La sucesin de bases sobre una cadena nica no parece estar restringida de ninguna forma. Sin embargo, si slo pueden formarse determinados pares de bases, se sigue que conociendo la sucesin de bases sobre una de las cadenas, entonces la sucesin sobre la otra cadena queda determinada automticamente. Se ha encontrado experimentalmente (3,4) que la relacin de adenina a timina, y la relacin de guanina a citosina, estn siempre muy cerca de la unidad para el cido desoxirribonucleico. Probablemente es imposible construir esta estructura con un azcar ribosa en lugar de desoxirribosa, el tomo extra de oxgeno la hara demasiado cerrada y formara un enlace de van der Waals. Los datos de rayos-X anteriormente publicados (5,6) sobre el cido desoxirribonucleico son insuficientes para una prueba rigurosa de nuestra estructura. Hasta el momento lo que podemos decir es a grosso modo compatible con los datos experimentales, pero debe observarse como improbado hasta que se haya verificado con resultados ms exactos. Algunos de estos se aportarn en las siguientes comunicaciones. Nosotros no ramos conscientes de los detalles de los resultados presentados cuando ideamos nuestra estructura, que descansa principal aunque no enteramente sobre datos experimentales ya publicados y argumentos estereoqumicos. No se escapa a nuestra comunicacin que el emparejamiento especfico que hemos

postulado sugiere inmediatamente un mecanismo copiador para el material gentico. Todos los detalles de la estructura, incluyendo las condiciones presumidas para su construccin, junto con un conjunto de coordenadas para los tomos, se publicarn con posterioridad. Estamos en deuda con el Dr. Jerry Donohue por las constantes crticas y consejos, especialmente sobre distancias interatmicas. Tambin hemos sido estimulados por el conocimiento general de la naturaleza y los resultados experimentales inditos as como ideas del Dr. M.H.F. Wilkins, la Dra. R.E. Franklin y sus colaboradores del King's College, en Londres. Uno de nosotros (J.D.W.) ha sido subvencionado por una beca de la Fundacin Nacional para la Parlisis Infantil. J.D. WATSON F.H.C. CRICK Medical Research Council Unit for the Study of the Molecular Structure Biological Systems Cavendish Laboratory, Cambridge 2 de Abril

(1) Pauling, L. y Corey, R.B., Nature, 171, 346(1953); Proc.U.S.Nat.Sci., 39, 84(1953). (2) Furberg, S. Acta Chem.Scand., 6, 634 (1952). (3) Chargaff, e. Para la referencia ver Zamenhof, S., Brawerman, G. y Chargaff, E., Biochem. et. Biophys. Acta, 9, 402 (1952). (4) Wyatt, G.R., J. Gen.Physiol., 36, 201 (1952). (5) Astbury, W.T., Symp.Soc.Exp.Biol. 1, Nucleic Acid, 66 (Cambridge University Press, 1947). (6) Wilkins, M.H.F. y Randall, J.T., Biochim. et Biophys. Acta, 10, 192 (1953).

Artculo publicado en la revista Nature, Abril 25, 1953, p. 737.

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