Aula 3B Biomoleculas

Biomolculas
Biologia Celular Molecular 2010-11
Aula N3B
Sumrio
Organizao molecular da clula Noo de molcula e macromolcula Acares cidos Nucleicos Protenas e Lpidos
H;C;N;O constituem 99% do total do numero de tomos presentes no corpo Humano.

3
tomo
Protes Ncleo Neutres Electres Orbitais Electrnicas Massa atmica Nmero atmico
Os electres da camada mais externa determinam como os tomos interagem
Modelo Atmico
Nuvem electrnica
Biologia Celular Molecular 2010-11 5
Nveis de Energia nos tomos
Uma parte importante para perceber a vida est em entender como a energia armazenada e move se de molcula para molcula
Energia = capacidade para produzir trabalho
Nuvens electrnicas podem ficar grandes Para aumentar em tamanho, deve ser absorvida energia
Energia Potencial
Analogia Cataratas
Energia Cintica
Gerador de turbina , Gravidade (centro TERRA) Calor desperdcio (uma vez alcance fundo)
7
Electres Armazenam Energia
Energia qumica potencial est dentro das ligaes qumicas!
Downloaded from: StudentConsult (on 24 September 2010 11:48 AM) 2005 Elsevier
Ligaes qumicas
Noo: Fora atractiva que une dois tomos para formar uma molcula
10
Formao de Ligaes Covalentes
Uma ligao covalente formada quando electres so compartilhados entre tomos

Exemplos Ligaes Covalentes
Ligaes Covalentes so fortes
Envolvem um nmero de electres que so partilhados entre tomos
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Molcula No-Polar
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Ligaes Covalentes Polar H
Na ligao covalente polar os electres so compartilhados de maneira desigual.

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Ligaes Hidrognio
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Ligaes Inicas
Uma ligao inica formada quando os electres so transferidos de um tomo a outro.
As ligaes inicas representam um extremo de polaridade

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Ligaes Inicas
Resultam da atraco electrosttica entre dois ies portadores de cargas opostas. Nesta ligao, no h partilha de electres.
17
Table: Important Ions of the Body

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Interaces hidrofbicas
Molculas
polares tm afinidade entre si
Molculas apolares tm afinidade entre si, aproximando-se mais umas das outras em presena de gua Interaces hidrofbicas Foras de van der Waals ocorrem entre 2 tomos muito prximos pertencentes a molculas apolares as nuvens electrnicas tendem a repelir-se, formando um dipolo
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Forma molecular crucial em biologia porque determina como molculas biolgicas reconhecem e respondem uma a outra com especificidade
Morfina/Endorfina
20
Somente as molculas com formas complementares podem ligar-se por ligaes fracas."
Fosfolipidos
Interaces Van der Waals
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Produtos
Metabolismo
Reagentes
O metabolismo a soma de todas as reaces qumicas que se do dentro dos organismos
Energia de activao:
Energia necessria a fornecer ao sistema para se iniciar uma reaco qumica.
" movie
23
Concentrao de Ies de hidrognio (pH) em Bio sistemas

cido - contribui H+ para a soluo (CO2 + H2O <=> H2CO3 <=> H+ + HCO3- ) Base - diminui H+ na soluo ( NH3 + H2O <=> NH4+ OH-) Tampo minimiza mudanas de pH
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Concentrao de Ies de hidrognio (pH) em Bio sistemas
:pH
scale
25
A abundncia de elementos na crosta terrestre difere radicalmente da abundncia nos tecidos animais
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Elementos no Corpo
Os elementos de trao so encontrados em quantidades menores mas no obstante so essenciais a uma existncia saudvel
27
As clulas so formadas por relativamente poucos tipos de tomos
28
30 Monmeros Mais Comuns nas Clulas

Molcula Aminocidos No. Presente 20 Nomes Molculas Ala (A) Asp (N) Phe (F) Gln (Q) Thr (T) His (H) Val (V) Leu (L) Arg (R) Lys (K) Met (M) Asp (D) Cys (C) Pro (P) Ser (S) Glu (E) Gly (G) Trp (W) Tyr (Y) Ile (I) Regra na clula Monmeros de protenas
Bases Aromtico Aucares
5 2
Adenina Timina Citosina Uracilo Guanina Ribose Glucose
Monmeros para cidos nucleicos Componente de cidos nucleicos Metabolismo Energia Componentes de fosfolipidos
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Lipidos
Colina Glicerol Palmitato
Estrutura e propriedades da gua

Molcula polar, forma pontes de hidrognio Propriedades nicas: Estado slido menor densidade (gelo flutua) Temperatura de fuso alta e temperatura de congelao baixa (intervalo de temperatura alargado no estado lquido) Elevado calor especfico (temperatura da gua muito constante)
Estrutura e propriedades da gua
Elevada temperatura de evaporao (evita
sobreaquecimento do ambiente adjacente)
Coeso e tenso superficial (pontes de hidrognio mantm a coluna de gua unida da raz s folhas de uma planta; pequenos animais podem-se movimentar superfcie da gua)
32
Water Is Lighter as Solid than as a Liquid
This means that ice forms an insulating blanket over water.
33
Carbono: elemento central da qumica da clula
Grupos funcionais em qumica orgnica

34
Ismeros
Ismeros estruturais igual frmula molecular, diferente frmula de estrutura
Ismeros pticos igual frmula molecular e de estrutura, entre si so uma imagem real como uma imagem no espelho (vulgar nos acares simples e aminocidos)
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Ismeros pticos
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Macromolculas
37
Figure 3-5 A GALLERY OF MOLECULES. Space-filling models of proteins compared with a lipid bilayer, transfer RNA, and DNA, all on the same scale. (Modified from Goodsell D, Olsen AJ: Soluble proteins: Size, shape, and function. Trends Biochem Sci 18:65-68, 1993.)
As macromolculas so constitudas a partir pequenas unidades

Protenas:
polmeros de aminocidos
Polissacardeos: polmeros de aucares simples
cidos nucleicos: polmeros de nucletidos
Lpidos complexos: constitudos por diferentes unidades de lpidos simples

39
Reaces de formao e de degradao de macromolculas
40
Protenas
Macromolculas mais importantes e abundantes nas clulas Variedade de funes: Catlise (enzimas) Estrutural Mobilidade celular Comunicao intercelular imunidade
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Protenas executam quase todas funes de clula

Permitem passagem de molculas e es atravs da membrana celular Servem como mensageiros inter e intracelular Actuam como motores moleculares para mover organitos dentro da clula Copiam material gentico Transcrevem e traduzem genes Catalisam reaces de catabolismo Estrutura e Forma
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Colagnio

Protenas
So polmeros de aminocidos 20 aminocidos So macromolculas sintetizadas sob o comando de instrues especficas presentes nos cidos nucleicos (genes) Alteraes nos genes podem causar mudanas na conformao e na aco biolgica das protenas Cada gene codifica uma protena
" Video
43
Letra
A (Ala) C (Cys) D (Asp) E (Glu) F (Phe) G (Gly) H (His) I (Ile) K (Lys) L (Leu) M (Met) N (Asn) P (Pro) Q (Gln) R (Arg) S (Ser) T (Thr) V (Val) W (Trp) Y (Tyr)
Aminocido
Alanina Cisteina cido Aspartico cido Glutmico Fenilalanina Glicina Histidina Isoleucina Lisina Leucina Metionina Asparagina Prolina Glutamina Arginina Serina Treonina Valina Triptofano Tirosina
44 Os aminocidos so designados pelas primeiras trs letras do seu nome em ingls,
45
Aminocidos
O carbono de cada aminocido est ligado a 4 grupos qumicos (um grupo amina, um grupo carboxlico e um hidrognio). A cadeia lateral diferente em cada aminocido. As cadeias laterais variam no tamanho, forma, carga, hidrofobicidade e reactividade.
48
Como o carbono , com excepo do aminocido glicina, assimtrico em todos os aminocios estas molculas possuem dois ismeros (L e D). Apesar das propriedades qumicas destes ismeros pticos serem semelhantes, a sua actividade biolgica distinta. Apenas os ismeros L so encontrados nas protenas
Ligao peptdica
50
Figure 3-4 THE POLYPEPTIDE BACKBONE. This perspective drawing shows four planar peptide bonds, the four participating α-carbons (labeled 1 to 4), the R groups represented by the β-carbons, amide protons, carbonyl oxygens, and the two rotatable backbone bonds . The dotted lines outline one amino acid. (Adapted from Creighton TE: Proteins: Structure and Molecular Principles. New York, WH Freeman and Co, 1983.)
Aminocidos
Os aminocidos podem ser classificados em hidrofbicos e hidroflicos. A diferente solubilidade em gua influenciada pela polaridade das cadeias laterais. Os aminocidos com cadeias laterais polares so hidroflicos e tendem a estar na superfcie das protenas. Aminocidos hidroflicos
Os aminocidos hidroflicos por interaco com a gua fazem com que as protenas sejam solveis.
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Aminocidos Hidrofbicos
Os aminocidos com cadeia lateral no polar so hidrofbicos.

54
55
As protenas existem numa variedade de formas e tamanhos
56
As protenas so macromolculas constitudas por uma ou mais cadeias polipeptdicas e apresentam uma estrutura tridimensional definida. So molculas com vrios nveis de organizao.
Estrutura 3. Estrutura 1. Estrutura 2.

Estrutura 4.
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Estrutura primria
Sequncia de aminocidos unidos por ligao peptdica

Estrutura secundria
a-hlice: ligao de H entre o H + do grupo NH de um aminocido e o O - do grupo C=O de outro aminocido. As cadeias laterais voltam-se para o exterior da hlice
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Estrutura helicoidal
Nas protenas o enrolamento da hlice para a direita
Esquerda Sentido dos ponteiros do relgio
Direita hlice
Sentido contra os ponteiros do relgio
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Estrutura Secundria folha

Conformao alongada em que os aminocidos se dispem numa estrutura em zig zag, estabilizada por pontes de Hidrognio
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Estrutura terciria
A cadeia polipeptdica enrola-se sobre si prpria; enrolamento estabilizado por ligaes de H e covalentes entre grupos SH (cistenas)
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Estrutura terciria
Enrolamento pode ser espontneo ou ajudado por outras protenas (chaperones)
Resulta na conformao nativa (maior estabilidade)
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Estrutura quaternria
Duas ou mais cadeias polipeptdicas combinam-se entre si para formar uma protena (cada cadeia corresponde a uma subunidade)
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Hemoglobina (estrutura quaternria)
66
Protenas Fibrosas mais associadas a

suporte, forma e proteco Colagnio, elastina
Protenas globulares associadas a enzimas

e protenas reguladoras
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Protenas Fibrosas
Insolveis nos solventes aquosos Pesos moleculares muito elevados. Formadas geralmente por longas molculas mais ou menos rectilneas e paralelas ao eixo da fibra.
Colagnio do tecido conjuntivo; queratinas dos cabelos; esclerotinas do tegumento dos artrpodes; conchiolina das conchas dos moluscos;, fribrina do soro sanguneo; miosina dos msculos. Algumas protenas fibrosas, possuem uma estrutura diferente, como as tubulinas, que so formadas por mltiplas subunidades globulares dispostas helicoidalmente.
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Colagnio
Tecido conjuntivo dos tendes , cartilagens, ossos Hlice tripla com 3 aa por volta e enrolamento esquerdo, Coiled coil com 3 filamentos forma uma cadeia alfa (c)
Gly X Pro ou Gly X HyPro

Substituies de Gly por outros aa provocam doenas letais como Osteogenesis imperfecta e sndrome de Ehlers-Danlos
Escorbuto Associado falta Vit C que afecta estabilidade do colagnio 69
Fibrona da seda
Camadas de folhas antiparalelas, ricas em Ala (roxo) e Gly (amarelo) Estabilizadas por pontes de hidrognio e ligaes de Van der Waals
Chaperones
Isolam a protena do meio exterior para permitir o seu enrolamento
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Polipeptideo Cap
Proteina enrolada correctamente
Chaperonin (fully assembled)
Steps of Chaperonin Action: 1 An unfolded polypeptide enters the cylinder from one end.
The cap attaches, causing the The cap comes off, and the properly cylinder to change shape in folded protein is such a way that it creates a released. hydrophilic environment for the folding of the polypeptide. 72
Protenas de Choque Trmico ou Chaperones
A quantidade destas protenas aumenta por exposio das clulas a temperatura elevadas
73
Molculas Chaperones
Auxiliam a formao das complexas molculas proteicas e a destruio das protenas defeituosas No s minimizam a agregao errada das cadeias polipeptdicas, como desfazem as agregaes defeituosas e promovem a eliminao, por hidrlise, das molculas proteicas incorrectamente formadas.
Muitas das tarefas das molculas chaperones so realizadas com gasto de energia fornecida por ATP As principais chaperones so hsp60 e hsp70 (heat shock protein)
74
Outros nveis estruturais
Motivos: associaes de diferentes estruturas secundrias que ocorrem frequentemente (ex: --)
75
Outros nveis estruturais

Domnios: Unidades de enrolamento independente estrutura terciria com
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Muitas protenas so formadas por domnios funcionalmente separados
A maioria das protenas globulares consiste em vrios domnios

Domnios
Estruturas compactas resultantes do arranjo tridimensional das estruturas secundrias, geralmente associados a uma funo. So as unidades bsicas da estrutura terciria. Gliceraldeide fosfato desidrogenase: dois domnios funcionais
Cada polipptido pode conter um ou mais domnios

Protenas globulares com nicos domnios
So mais ou menos esfricas. So geralmente solveis nos solventes aquosos Pesos moleculares situam-se entre 10.000 e vrios milhes. Nesta categoria situam-se as protenas activas como os enzimas, transportadores como a hemoglobina, etc.
79
As protenas podem se conjugar em formas complexas

Uma protena com apenas um sitio de ligao pode formar um dmero com outra protena idntica
Protenas idnticas com dois stios de ligao diferentes formaro um longo filamento helicoidal Se os dois stios estiverem de ligao estiverem dispostos apropriadamente, as subunidades proteicas formaro um anel fechado e no uma hlice.
80
Protenas Conjugadas
Algumas protenas contm outros grupos qumicos para alm dos aminocidos
GLICOPROTENAS
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Ubiquitina
um polipeptdio constitudo por 76 aminocidos Presente nas clulas eucariotas. Marcao das protenas para a degradao. As protenas ubiquitinadas so degradadas a peptidos pelo proteossoma, que solta a cadeia de poliubiquitina, possivelmente ainda ligada a algum resduo, at que alguma enzima desubiquitinase do citoplasma a processe e recicle.
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Degradao Protena via the ubiquitina
O proteossoma degrada protenas de curta durao ou protenas indesejveis nas clulas eucarioticas"
84
Amiloidoses
Modelo estrutural da protena amilide. Aqui esto representadas 4 folhas paralelas.
Placas proteicas insolveis acumuladas nos tecidos, resultantes da conformao anormal de certas protenas.
85
Amiloidoses
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Ribozimas
A maioria das enzimas so protenas, mas conhecem-se algumas que so constitudas por RNA.
87
Desnaturao proteica
Desnaturao: perda da conformao nativa de uma protena perda da funo A conformao de uma protena depende das condies do meio Temperatura pH Elevada concentrao de compostos polares
88
89
Actuao Enzimtica
As enzimas permitem aumentar a velocidade da reaco
Mesmo na presena de enzimas, a velocidade atinge um valor mximo, que se torna constante.
Diminuem a energia de activao das reaces, sem afectar o G.
As enzimas posicionam os reagentes, facilitando a sua converso em produtos.

90
" vdeo
Ocorre uma diminuio da concentrao dos substratos (reagentes), que so consumidos.
Pelo contrrio, ocorre a produo de produtos a partir dos substratos. As enzimas formam um complexo com os substratos, que deixa de existir no final, quando a concentrao de substratos reduzida.
As enzimas catalizam as reaces qumicas, aumentando a velocidade de converso dos substratos em produtos, sem se consumirem nesta reaco.
A concentrao da enzima livre diminui, mas retoma aos valores iniciais no final da reaco.
91
O centro activo da enzima apenas reconhece os reagentes (substratos) especficos.
Ocorrem interaces entre os reagentes e o centro activo da enzima.
Estas interaces permitem um correcto posicionamento dos reagentes que reagem, originando os produtos.
Aps a reaco, os produtos libertam-se e a enzima fica livre para reagir com mais reagentes, no se gastando neste processo.
92
Diversos factores afectam a actividade enzimtica
Concentrao enzimtica
Concentrao do substrato
Temperatura
pH
Cofactores
93
CONCENTRAO DA ENZIMA E DO SUBSTRATO
O aumento do teor de enzimas permite aumentar a velocidade de converso dos produtos.
Para concentraes elevadas, todos os centro activos ficam saturados, com estabilizao da velocidade mxima. Com o aumento da concentrao de substrato verifica-se um aumento da velocidade.
94
Muitas enzimas necessitam de outros compostos para actuarem
Cofactores
Apoenzima
Inorgnicos
Orgnicos
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Indutores Existem compostos que se ligam enzima, afectando a sua funcionalidade:
Artificiais
Inibidores Naturais
Inibio competitiva
Inibio no competitiva
Induo
O inibidor liga-se ao centro activo, competindo com o substrato, e diminuindo a actividade da enzima.
O inibidor liga-se numa regio distinta do centro activo, afectando-o, e diminuindo a actividade da enzima.
A ligao do indutor provoca modificaes no centro activo, permitindo a actuao enzimtica.

96
Importncia Biolgica das Protenas

Funo estrutural: Fazem parte da estrutura de todos os constituintes celulares. Funo hormonal: Muitas hormonas, tem constituio proteica. Funo motora: so os componentes maioritrios dos msculos (miosina, actina) Funo enzimtica: Actuam como biocatalisadores de quase todas as reaces qumicas que ocorrem nos seres vivos Funo imunolgica (defesa): Algumas protenas altamente especificas reconhecem e combinam-se com substncias estranhas ao organismo, permitindo a sua neutralizao. Funo de reserva alimentar: Algumas protenas funcionam como reserva, fornecendo aminocidos ao organismo durante o seu desenvolvimento.
97
Centrifugao pode separar molculas que diferem em massa ou densidade
98
Electroforese bidimensional separa molculas de acordo com a carga e a massa
99
Separao de protenas atravs de tamanho: cromatogafia de filtrao de gel
100
Separao de protenas atravs da carga: cromatografia de troca de ies
101
Separao de protenas ligando especfico para outra molcula: cromatografia de afinidade
102
Enzimas altamente especficas e ensaios de anticorpos podem descobrir protenas individuais
103
Estrutura primria da protena pode ser determinada atravs de mtodos qumicos e de sequencias de gene
Edman degradation!
104
Espectrometria de massa mede a massa de protenas e peptidos
105
Cristalografia raios X
usada para determinar a estrutura tridimensional de uma protena X-ray
diffraction pattern Photographic film Diffracted X-rays X-ray source X-ray beam Crystal Nucleic acid Protein
(a) X-ray diffraction pattern
(b) 3D computer model
106
Carbohidratos
107
Caracterstica estrutural: H-C-OH

Funes: Fonte de energia Formao de estruturas Componentes de outras molculas
108
Monossacridos
So os glcidos mais simples (3-7
tomos carbono)
As trioses so formadas no decurso da degradao metablica das hexoses As pentoses so constituintes dos cidos nucleicos e de muitas coenzimas As hexoses, glicose, galactose e frutose, tem grande importncia fisiolgica.
109
Monossacridos
Triose sugars Pentose sugars (C3H6O3) (C5H10O5)
H C H C C H OH OH H H H H O H O C C C C C H OH OH OH OH H H HO H H H
Hexose sugars (C6H12O6)

O C C C C C C H OH H OH OH OH H H HO HO H H C C C C C C H O OH H H OH OH
Aldoses
Glyceraldehyde
Ribose
H H C OH C O H H H C OH H H H C OH C O C OH C OH C OH H
Glucose
H H HO H H H
Galactose
C OH C O C H C OH C OH C OH H
Ketoses
Dihydroxyacetone
Ribulose
Fructose
Aldose, o tomo de carbono da funo aldedo o tomo nmero 1; Cetose, o tomo de carbono da funo cetona tem o nmero mais baixo possvel, mas nas cetoses que intervm no metabolismo fundamental, sempre o carbono 2.
111
ISOMERIA
Se observarmos a frmula do gliceraldedo, podem existir duas configuraes, dependendo da posio do oxidrilo do carbono assimtrico, se encontrar direita (D de dextra) ou esquerda (L de levogira). Estes ismeros, designados enantimeros, possuem a caracterstica de serem entre si como um objecto e a sua prpria imagem num espelho. Por razes no esclarecidas, a grande maioria das oses que intervm na composio e no metabolismo das clulas, pertencem s sries D.
112
Monossacardeos com 5 ou 6 carbonos podem formar anis
113
Ciclizao
Os monossacardeos, a partir da tetrose (na srie das aldoses) e da pentose (na srie das cetoses) podem, em soluo aquosa, sofrer uma ciclizao e formar anis de cinco (furanoses) ou de seis lados (piranoses). Esta ciclizao ocorre por eliminao de uma molcula de gua, entre o OH que ficou ligado ao carbono 1 das aldoses (ou carbono 2 das cetoses) e o OH ligado ao penltimo ou ao antepenltimo da estrutura.
piranose
furanose
Ciclizao de uma hexose (D-Glucose a)
114
Monossacarideos
H
1C 2
Pode ser linear Pode formar anis

6CH 2OH 6CH 2OH
H
3
C C
4
OH H H
4C
CH2OH
5C
H H H
4C
5C
O H H
4
6 5
HO H H
5
H
1
H OH
1C
C C
OH
H
2C
H OH
1C
H OH
3 2
OH
OH
3
O OH
3C
H HO
2C
OH
C H
OH H OH
C H
OH
OH
OH
(a) Linear and ring forms. Chemical equilibrium between the linear and ring structures greatly favors the formation of rings. To form the glucose ring, carbon 1 bonds to the oxygen attached to carbon 5. Biologia Celular Molecular 2010-11 115
Monossacardeos
116
Glcidos
117
Dissacardeos
hidrossolveis hidrolisveis Alguns so redutores : Maltose e lactose. Sacarose no redutora
118
Oligosacardeos
Cadeias de 3-20 monosacardeos ligados por ligaes glicosdicas
119
Polissacardeos
insolveis na gua; hidrolisveis .
Funes
: glicognio, nos animais - Reserva amido e glicognio
- Energtica - amido, nas plantas
- Estrutural celulose e quitina

120
Mitochondria
Giycogen granules
0.5 m
Glycogen
Figure 5.6
(b) Glycogen: an animal polysaccharide
121
Celulose homopolmero linear no ramificado,

formado por associao de -D-Glucose
A : disposio das molculas de glucose, unidas por ligaes glicosdicas B: as molculas de glucose assumem a configurao em cadeira e estabelecem entre si pontes de hidrognio
Maior parte dos animais no degrada celulose porque no tem celulases.

122
A celulose difcil de digerir As vacas tem micrbios nos seus estmagos para facilitar este processo
Figure 5.9
123
Quitina
Quitina, um outro polissacarideo estrutural importante encontrado no exosqueleto dos artrpodes Pode ser usado como linha cirrgica
CH2O H O OH H H OH H OH H H NH C
CH3
(a) The structure of the chitin monomer.
(b) Biologia Celular Molecular 2010-11
(c) 124
Desoxiaucares
So os aucares que contm o menor nmero de tomos de oxignio que de carbono. Desoxirribose (DNA)
D-Glucose-6-fosfato
126
Amino-Aucares (Hexosaminas)
Aucares contm um grupo amina. D-glucosamina um constituinte do cido hialurnico. D-galactosamina (condrosamina) um constituinte da condroitina. D-manosamina um constituinte da mucoprotena
The Journal of Clinical Endocrinology & Metabolism Vol. 89, No. 10 5132-5137 Copyright 2004 by The Endocrine Society Role of Hexosamines in Insulin Resistance and Nutrient Sensing in Human Adipose and Muscle Tissue Hexosamines, insulin resistance, and the complications of diabetes: current status Am J Physiol Endocrinol Metab, January 1, 2006; 290(1): E1 - E8.
127
GLICOSDEOS
Qualquer composto que contm uma molcula carbohidrato (acar), no qual o grupo hidroxilo ligado ao primeiro carbono substitudo por um grupo alcolico, fenlico ou outro. O nome em relao ao acar contido, como: glicosdeo (glicose), pentosdeo (pentose), frutosdeo (frutose) Galactosideo (galactose), etc. A hidrlise, de glicosdeos, forma um componente acar e um componente no acar (aglicona). Aglicona pode ser o lcool etlico, o glicerol, um esterol, um fenol, etc.
Glicosaminoglicanos
Hialuronato
Sulfato-4 de condroitina
Sulfato de queratano
129
Glicosaminoglicanos
GAG Hyaluronate Chondroitin sulfate Heparan sulfate Heparin Dermatan sulfate Keratan sulfate Localization synovial fluid, vitreous humor, ECM of loose connective tissue cartilage, bone, heart valves basement membranes, components of cell surfaces mast cells lining the arteries of the lungs, liver and skin skin, blood vessels, heart valves cornea, bone, cartilage aggregated with chondroitin sulfates
130
Lpidos
cidos gordos, triglicridos, fosfolpidos e esterides
131
132
Lpidos
Insolveis em gua Solveis em solventes orgnicos , como benzeno, ter e o clorofrmio Lligao: ster Por hidrlise, produzem cidos gordos e outras substancias Funo mista, isto plsticos e energticos.
Lpidos de Reserva
O glicerol ou glicerina, um lcool com 3 grupos (OH) capazes de estabelecer ligaes covalentes com os tomos de carbono dos grupos COOH dos cidos gordos . Ligao ster
cidos Gordos Saturados

Tem o nmero mximo dos tomos de hidrognio possveis No tem ligaes duplas
Stearic acid
(a) Figure 5.12 Saturated fat and fatty acid
A presena ou a ausncia das ligaes duplas faz a diferena entre a margarina dura (saturada) e a mole (poliinsaturada).
cidos Gordos Insaturados

Tem uma ou mais ligaes duplas
Oleic acid
Figure 5.12
(b) Unsaturated fat and fatty acid
cis double bond causes bending
cidos Gordos Poli-insaturados

- Tem
mais que 1 dupla ligao. O local da dupla ligao rgido

136
Lpidos Estruturais
Fosfolipidos
A sua estrutura resulta da ligao de uma molcula de glicerol com dois cidos gordos e com uma molcula de cido fosfrico. So molculas anfipticas.
137
138
Fosfolpidos: principais componentes das membranas biolgicas
139
Estrutura dos Fosfolpidos

Hydrophilic head WATER
Hydrophobic tail
WATER
Em ambiente aquoso, as caudas hidrofbicas dos fosfolpidos Compactam-se entre si, expulsando a gua e formando uma bicamada com a cabea hidroflica de cada fosfolpido voltada para o ambiente aquoso.
Lpidos Estruturais
141
Lpidos com Funo Reguladora

Esteris So caracterizados por uma estrutura carbonada rgida de 4 anis Hormonas Sexuais: Testosterona, progesterona
O colesterol predominante nas membranas plasmticas das clulas animais, tendo por funo estabilizar a membrana
142
Esterides
143
O colesterol e as hormonas esterides tm uma estrutura comum
144
Importncia Biolgica dos Lpidos

Reserva energtica as gorduras constituem uma importante fonte de energia. Funo estrutural alguns lpidos, como os fosfolpidos e o colesterol, so constituintes de membranas celulares. Funo protectora gordura subcutnea Funo vitamnica e hormonal Vitaminas E e K;
Progesterona
145
Combinao Biomolculas
Lipoprotenas (molculas de transporte do sangue) Glicoprotenas (estrutura membrana) Glicolpidos (receptores membrana)
146
cidos nucleicos
147
cidos nucleicos
Toda a informao que uma clula necessita durante a sua vida e a dos seus descendentes, est organizada em forma de cdigo nas cadeias dos cidos nucleicos Constituem o armazm e so os transmissores de informao nos seres vivos. Esta informao traduzida em protenas permite que a clula execute todo o trabalho necessrio sobrevivncia de um organismo. Existem dois tipos de cidos nucleicos cido desoxirribonucleico ou DNA e cido ribonucleico ou RNA Ambos so polmeros lineares de nucleotidios conectados entre si via ligaes covalentes denominadas ligaes fosfodister
Diferenas entre DNA e RNA

DNA Informao gentica Molculas grandes Contem desoxiribose Contem timina Cadeia dupla RNA Expresso da informao gentica (sntese proteica) Molculas mais pequenas Contem ribose Contem uracilo Cadeia simples
149
DNA
Base Purinas Adenina Guanina Pirimidinas Citosina Timina 1base + aucar Desoxicitidina Timidina dCMP dTMP 2base + aucar + fosfato
Nucleosido1
Nucleotido2
Desoxiadenosine Desoxiguanosina
dAMP dGMP
RNA
Base Purinas Adenina Guanina Pirimidinas Citosina Uracilo
1base
Nucleosido1
Nucleotido2
Adenosina Guanosina
AMP GMP
Citidina Uridina
2base
CMP UMP
+ aucar + fosfato
151
+ aucar
Estrutura de um nucletido
RNA
DNA
152
Bases azotadas
153
Nucleosdeos: base + pentose (adenosina, uridina, guanidina, citidina ou (desoxiadenosina, desoxitimidina, ) Nucletidos: nucleosdeos fosfatados
154
155
Estrutura dos cidos nucleicos

DNA e o RNA partilham muitas semelhanas qumicas, uma vez que ambos so polmeros de nucletidos: h 4 tipos de nucletidos, todos possuindo uma estrutura tpica em comum: grupo fosfato pentose base azotada
156
as diferenas entre estas duas molculas (DNA e RNA) reside na composio de: pentose: ribose RNA desoxirribose DNA bases azotadas: adenina (A), citosina (C) e guanina (G) comuns DNA e RNA timina (T) exclusiva do DNA uracilo (U) exclusiva do RNA (em substitio da T)
157
As bases azotadas agrupam-se em:

pirimidinas (C, T e U) 1 anel purinas (A e G) 2 aneis Os nucletidos polimerizam para originar os cidos nucleicos atravs de ligaes fosfodister:
estabelecem-se entre o grupo hidroxilo (C3) de um nucletido e o grupo fosfato (C5) do nucletido seguinte, na orientao 53
o RNA existe na forma de cadeia simples, enquanto que o DNA existe na forma de cadeia dupla consiste na associao de duas cadeias polinucleotdicas que se enrolam no espao para originar uma hlice dupla: os acares ficam projectados para o exterior as bases projectam para o interior
159
a orientao destas cadeias antiparalela as direces 53 so opostas: as duas cadeias mantm-se unidas atravs de pontes de hidrognio (PH) que se estabelecem entre as bases azotadas: A emparelha com T atravs de 2 PH G emparelha com C atravs de 3 PH trata-se do fenmeno de complementariedade
permite manter a estrutura do DNA importante para os processos de transcrio (sntese proteica) e replicao do DNA (diviso celular)
160
Modelo de Watson e Crick

Prmio Nobel 1962 1953 dados qumicos de Chargaff; difraco de raios X de Rosalind Franklin .
duas cadeias nucleotdicas dupla hlica cadeias antiparalelas estrutura fosfato-acar-fosfato : exterior da hlice bases: interior da hlice, plano perpendicular hlice
161
O DNA o responsvel pelo armazenamento e transmisso da informao gentica

Modelo de Watson e Crick

interaces hidrofbicas e de van der Waals entre bases empilhadas ligaes de hidrognio entre bases complementares complementaridade de bases: purinapirimidina, A e T, G e C complementaridade das cadeias espaos adjacentes entre voltas da hlice: depresso maior e menor.
Modelos para as vrias estruturas de DNA conhecidas
A forma B do DNA tem 10.5 pares de bases por volta A forma A a mais compacta, tem 11 pares de bases por volta A forma Z uma hlice dupla que enrola para a esquerda, 12 pares de bases por volta Nota: O DNA pode tambm existir na forma de hlice tripla.
164
Outras caractersticas do DNA dos eucariotas

Existncia de famlias de genes. Existncia de grandes extenses de DNA que no codificam protenas. Existncia de sequencias repetitivas. Estas caractersticas contribuem para o aumento da quantidade de DNA sem que haja aumento da quantidade de genes (podem no passar de 3% do total do DNA).
165
Estrutura do DNA de Eucariotas
166
Estrutura do DNA de Eucariotas
167
Histonas
Modelo solenide de uma fibra de cromatina com 30 nm de dimetro
Nucleossoma
O estudo estrutural detalhado mostra que cada nucleossoma composto por um esqueleto central proteico, constitudo pelo octmero de histonas 2x (H2A, H2B, H3 e H4) em torno do qual o DNA se enrola duas vezes. Este duplo enrolamento estabilizado por outra histona (H1).
Estrutura do DNA
DNA circular super enrolado
mitocondrial, viral, bacteriano (super enrolamento negativo)
DNA eucaritico linear super enrolado

compactao do DNA dos cromossomas no ncleo presso do sobre enrolamento facilita a separao das cadeias na transcrio e replicao (topoisomerases)
169
DNA mitocondrial humano
DNA mitocondrial mais pequeno (16kbp) Codifica 2 rRNAs, 22 tRNAs usados na traduo do mRNA Tem 13 sequncias que comeam com o codo ATG Biologia Celular Molecular No possui intres 2010-11
170
Caractersticas estruturais do DNA
Relaxado
Superenrolado
DNA super enrolado: mais compacto, ocupa menos volume, migra ou sedimenta mais rapidamente Biologia Celular Molecular
2010-11
171
Nucleotides, DNA, and RNA
172 Figure 2-18: RNA and DNA
A dimenso do genoma no corresponde a complexidade do organismo Biologia Celular Molecular 173

2010-11
um gene eucaritico composto por fragmentos codificantes de protenas que esto descontnuos exes estes fragmentos, separados pelos intres, tm de ser associados aps a transcrio de modo a originar o mRNA que transportar a informao neles contida para os ribossomas, onde ocorrer a sntese proteica
174
Genes
Um gene uma sequencia de nucletidos do DNA que pode ser transcrita de modo a dar um produto final. Este produto pode ser RNA (rRNA ou tRNA) ou um polipptido
175
O dogma central da biologia molecular
Filme
176
Dogma Central
Clula

Transcrio
Traduo
Tanscrio

Reverse
DNA

mRNA

Ribossoma

Polipeptido
(protena)

Transcrio Eucariotas
Poros
Nucleares

DNA

Citoplasma

Transcrio

RNA

RNA
Processing

mRNA
G

AAAAAA

AAAAAA

Ncleo

Exportao

178
O RNA transfere a informao gentica do DNA para as protenas
Estrutura tpica do RNA, Right handed Bases branco Fosfato amarelo Riboses - verde
179
RNA
RNA mensageiro (mRNA): cadeia simples Sintetizado a partir de DNA, serve de molde para a sntese da cadeia polipeptdica
RNA de transferncia (tRNA) Transporta os aminocidos para o complexo mRNAribossoma (anti-codo complementar ao codo)
RNA ribossomal (rRNA) Entra na constituio dos ribossomas

180
RNA
cadeia simples de ribonucletidos
Tipos de RNA:
mRNA ( 5%): transporta a informao gentica do DNA
at aos ribossomas onde ocorre a traduo.
rRNA ( 85%): associado a protenas entra na constituio

dos ribossomas
tRNA (10%): transporta os aminocidos; assegura a sua

correcta insero de acordo com o cdigo gentico do mRNA.
181
Estruturas secundrias do RNA
182
Transfer RNA (tRNA) Amino Acid attachment site

Acceptor Arm - A specic amino acid is attached to the 3 end

1
2
3
4
5
6
U*
7
Pu
16
17
9
A
17:1
13
12
Py
10
A
C
C
73
72
71
70
69
68
67
Py
59
*
66
A 65
64
63
62
C
49
50
51
52
G
T

TC arm - stands for pseudouridine

Pu

G*

D Arm - Contains dihydrouridine

Py
Pu
22
23
25
47:16
G
A
47:15
26
20
20:2
20:1
27
43
1
44
28
42
45
29
41
46
47
30
40
47:1
31
39
Py*
38
Pu*
U
34
35
36

Extra Arm - May vary in size

183
Biologia Celular Molecular Anticodon

2010-11
rRNA
As molculas de RNA podem conter regies de cadeia dupla
184
FIM
185

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Biologia Celular Molecular 2010-11

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Formao de Ligaes Covalentes

Uma ligao covalente formada quando electres so compartilhados entre tomos

Exemplos Ligaes Covalentes

Ligaes Covalentes so fortes

Envolvem um nmero de electres que so partilhados entre tomos

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