Cules son las consecuencias de la desaparicin de la microbiota humana?

Resumen Los humanos y nuestros ancestros han evolucionado desde los tiempos ms antiguos con una microbiota comensal. La conservacin de especies es un indicador de un nicho de modo especfico a travs de todos los grupos de poblacin estudiados en humanos sugiere que la microbiota le confiere beneficios conservados. Sin embargo, ciertos de estos organismos tienen propiedades patgenas y, a travs de las prcticas mdicas y cambios de estilo de vida, su prevalencia en la poblacin humana est cambiando, a menudo de un grado extremo. En este ensayo, se propone que la desaparicin de estos organismos en indgenas ancestrales, que estn ntimamente implicados en la fisiologa humana, no es del todo beneficiosa y tiene como consecuencia que podran incluir condiciones post-modernas como la obesidad y el asma. "Hemos encontrado al enemigo, y somos nosotros". Walt Kelly, 1953. Esta es una poca de grandes cambios. Estamos explorando los confines del universo y se puede viajar a travs de los continentes en cuestin de horas, pero tambin estamos sobrecalentando la Tierra y el agotamiento de sus ocanos. Estos cambios importantes en nuestra macroecologa representan el precio por el pasado y los avances tecnolgicos del siglo. Estamos tambin empezando a explorar el universo microscpico dentro de nosotros. Es esta la biosfera de menor escala afectada por cambios similares? En particular, el progreso ha reducido la mortalidad infantil y la prolongacin del tiempo tambin caus imprevista alteraciones en nuestro microecologa y, por consecuencia, nuestra salud? En este ensayo, nos centramos en nuestro ntimo interfaz con microorganismos: los residentes y transitorios, y los simbiontes y patgenos. Nosotros estudiaremos cmo nuestra microecologa est cambiando, en analoga con nuestra alterada macroecologa. Qu es nuestra microbiota? Vivimos en un mundo microbiano. Cuando los animales no haban emergido, los microorganismos haca tiempo (> 3 mil millones aos) formaban parte de una vasta comunidad de vida que inclua complejas relaciones endosimbioticas, y se ha calculado que los animales han llevado a los microorganismos residentes por lo menos desde la aparicin de esponjas. Los seres humanos se han convertido en sede de una multitud de microorganismos que se ensamblan en comunidades complejas, en gran parte beneficiosos que superan en nmero a las clulas humanas por diez veces. La formas dominantes de interaccin entre humanos y microorganismos son aquellos en los que estos benefician al husped sin causar dao (relaciones comensales) y aquellos en los que tanto se beneficia el anfitrin como microorganismo (o relaciones simbiticas mutualistas). Co-evolucin, co-adaptacin y la codependencia son caractersticas de nuestras relaciones con nuestra microbiota indgena La microbiota de los vertebrados puede ser caracterizada como: antiguo, con ascendencias profundas; conservando las especies de acogida, a menudo presentan para eventos definidos por el ciclo de vida o persisten durante vida, acogiendo el nicho especfico. Estas propiedades implican que la microbiota ha sido seleccionada, pero cada vez es ms claro que a pesar de que estn limitados por estas normas tambin son altamente individuales

El microbioma humano es el sujeto de estudios intensivos, incluyendo el proyecto internacional del Microbioma Humano (Cuadro 1). Aunque posiblemente libre de grmenes (gnotobitico) antes del nacimiento, los seres humanos desarrollan una residente microbiota poco despus del nacimiento. En el perodo neonatal, el proceso de montaje en la comunidad es dinmico y est influenciado por la exposicin temprana ambiental (en particular, la madre) y efectos estocsticos. La composicin de la microbiota indgena generalmente se desarrolla de una manera ordenada en respuesta a la dieta y a otros factores ambientales y tambin se ve influida por diversas bases genticas humanas. La diversidad de bacterias en el cuerpo humano llama la atencin en la riqueza de distintas especies y cepas, pero hay que destacar que un limitado nmero de filos se encuentran comnmente en las comunidades microbianas indgenas. Slo 4 de ms de 50 filos bacterianos que se han identificado en el medio ambiente (Firmicutes, Bacteroidetes, Actinobacteria y Proteobacteria) dominan hbitats humanos como la mucosa y cutneas, lo que sugiere que fuerzas selectivas intensas han limitado la diversidad a travs de al menos cientos de miles de aos de co-evolucin. A pesar de este estereotipado proceso de montaje, cada individuo de una sola especie de mamfero, incluyendo Homo sapiens, tiene una microbiota prcticamente nico. La composicin de la microbiota y los fenotipos que se expresan pueden afectar, as como refleja la diversidad biolgica en general de los seres humanos.

Recuadro 1 | El Proyecto del microbioma humano En los ltimos aos, ha habido un creciente reconocimiento de la importancia de las poblaciones microbianas comensales en los seres humanos. En conjunto, estas poblaciones se han denominado "el microbioma humano", originalmente por Joshua Lederberg, y tambin como 'microbiota humana ". Debido a los avances tecnolgicos y mejoras en la bioinformatica en la secuenciacin del ADN, ha llegado a ser posible caracterizar el gran diversidad de la microbiota humana. En 2007, los EE.UU. Institutos Nacionales de Salud (NIH) lanz el Proyecto Microbioma Humano (Ver ms informacin) como una de sus iniciativas ms importantes para el plan de trabajo, destinaron ~ EE.UU. $ 140 millones para su realizacin. Este importante esfuerzo cientfico tiene los siguientes objetivos: Determinar si las personas comparten un microbioma humano bsico; Entender si los cambios en el microbioma humano puede ser correlacionado con cambios en la salud humana; Desarrollar las herramientas tecnolgicas para apoyar estos objetivos; Para hacer frente a las repercusiones ticas, jurdicas y sociales de la investigacin microbioma humano. Un valor del Proyecto del microbioma humano es que puede ayudarnos a determinar hasta qu punto la microbiota ha ido cambiando. Se est trabajando actualmente en curso, con la Unin Europea y otros pases que estn comprometidos con proyectos similares, todos estn trabajando bajo el paraguas de la Internacional Consorcio Microbioma Humano (Ver ms informacin).

La mayora de la investigacin se ha enfocado en la definicin de los elementos centrales de la microbiota que son compartidos por todos, o al menos la mayora, de los humanos. Hasta la fecha, las reglas que rigen la vida en los seres humanos son poco conocidos, y estamos todava en las primeras etapas de discernir las funciones de la microbiota en la salud y enfermedad. La microbiota humana facilita la extraccin de energa de los alimentos, proporcionan factores accesorios de crecimiento, promover la terminacin despus del nacimiento en la diferenciacin de la estructura de la mucosa y la funcin, estimular el sistema inmunolgico tanto la innata y el adaptativo, y proporcionar "la Colonizacin de resistencia" contra la invasin de patgenos.

Sin embargo, los estudios de gnotobitico en animales han demostrado que los microorganismos (o al menos las bacterias) no son necesarios para la vida o para la realizacin de un ciclo en la vida animal. Paradjicamente, por lo tanto, no parece existir ningn requisito absoluto para una microbiota funcional o residente, pero tampoco la gnotobiosis se produce en la naturaleza. Aunque la relacin entre animales y su microbiota es residente y se cree que es en gran medida til, pero tambin puede llegar a ser perjudicial. En los seres humanos, -hemolticos los estreptocos son comensal y pueden colonizar la boca y el tracto intestinal y, en parte, los protegen contra las incursiones de los patgenos estreptococos. Sin embargo, estos organismos comensalistas a menudo estan transitoriamente presente en el torrente sanguneo despus de masticar la comida, nos lavamos los dientes o defecamos. Si se daa el tejido presente, tal como una vlvula de corazn envejeciendo, estos residentes de larga duracin pueden causar una infeccin fatal. Por lo tanto, nuestra microbiota beneficiosa en general tiene la capacidad de causarnos la muerte. La manda se diluye, en particular si la defensa normal que tienen los microorganismos se encuentra en peligro y se ve comprometida de alguna manera. Est claro que compartimos una relacin biologica compleja con nuestro microscpico compaeros. Son estos organismos simbiontes o parsitos? (RECUADRO 2). El ecologista Theodor Rosebury cre el trmino 'amphibiosis "para describir las relaciones que pueden ser simbitica o parasitarias, dependiendo del contexto biolgico. Este concepto es el principio bsico para lo que resta de este ensayo. Cuando la influenza barre todo el mundo, infectando a millones y causa enfermedad y a veces la muerte, estamos de acuerdo que el virus es un patgeno, como es Yersinia pestis, la causa de la peste bubnica. Sin embargo, la distincin entre un microorganismo comensal residente y un patgeno puede ser borrosa a veces, en parte debido a que algunos comensales pueden causar enfermedad, aunque a menudo en anfitriones inmunocomprometidos, mientras que algunos de los ms temidos patgenos pueden persistir en el ser humano para toda la vida sin causar sntomas. Por ejemplo, varios miembros de la microbiota nasofaringe, incluyendo Streptococcus pneumoniae y Neisseria meningitidis, regularmente causan enfermedad. Tales comensales patgenos colonizan una proporcin sustancial de la poblacin humana, la mayora de los cuales son portadores asintomticos. Son estos organismos patgenos, o deben considerarse ser miembros de la microbiota indgena que han evolucionado para vivir en lugares peligrosos, tal como en las vas respiratorias asociada tejido linftico? Desde este punto de vista, la microbiota indgena es especfica en tales nichos regularmente en contacto con elementos del sistema inmune que sostiene a raya la mayor parte del tiempo, pero que en ocasiones no lo hacen, lo que resulta en la enfermedad. La inmunizacin contra estos microorganismos no slo protege contra la enfermedad, sino tambin impide la colonizacin de acogida, de un antgeno de manera especfica (revisado en ref. 29). El reemplazo de serotipo es un perjudicial reconocido efecto de los programas de inmunizacin, pero puede haber otros efectos deletreos que todava tenemos que descubrir? Es crucial mejorar nuestra comprensin de las relaciones entre los seres humanos y nuestra microbiota, para que podamos evaluar los riesgos, adems de los beneficios potenciales, de la modificacin de la composicin de la microbiota deliberadamente o inadvertidamente. El uso de molecular de postulas de Koch pueden ayudar en esta evaluacin de riesgos.

Recuadro 2 | Qu es un patgeno? Los patgenos microbianos pueden variar desde las bacterias hasta los metazoos a los virus o priones. Todos los patgenos son excelentes bilogistas celulares, aprovechando las grietas en la armadura de sus anfitriones para propagarse. No hay ninguna diferencia intrnseca entre un patgeno y un simbionte, solo en contexto. Sin embargo, hay huellas digitales que son suficientemente caractersticos de patgenos o simbiontes a ser usados para ayudar a distinguir entre ellos: Los patgenos son generalmente clonal Los patgenos inducen respuesta en el hospedero. Por lo general, no puede obrar sin dejar rastro. La infeccin con un patgeno a veces pueden causar la enfermedad, que es una funcin de la interaccin entre el patgeno y el husped especfico, como se determina por una matriz de circunstancias del hospedero, microbio y el medio ambiente. El conjunto de genes del hospedero incluye los genes de sus microorganismos residentes, que pueden ser por qu muchos miembros de la microbiota son seleccionados por el hospedador: para prevenir la colonizacin en lugar de patgenos.

Glosario
Relacin de comensalismo Un ntimo, aunque generalmente benigna, la relacin entre un microorganismo residente y su husped. Probablemente el producto de una interaccin entre el tiempo evolutivo del microorganismo y el husped. La relacin no necesita ser simbitica. Transferencia de genes La transferencia de genes individuales o sus componentes, islas de los genes, organismos enteros, o comunidades de organismos de padres a hijos (transmisin vertical) o entre los individuos de no linaje directo (transferencia horizontal). Microbioma Los genomas colectivos de los microorganismos que residen en un nicho ambiental. Equilibrio de Nash En la teora de juegos, un concepto de solucin en la que los jugadores de un juego son conscientes de las estrategias de los otros jugadores, pero no se desva de su propia, ya que no tienen nada que ganar, sino que ser desventajoso para desviarse (para "engaar"). Pan-genoma El conjunto de todos los genes que se encuentran en los miembros de una sola especie. Parsito Un organismo que disminuye la capacidad reproductiva de otro organismo o beneficios de otro organismo sin reciprocidad. Patgeno En la medicina, cualquier organismo que causa la enfermedad. En trminos de la biologia, un patgeno es un microorganismo que tiene la inherente capacidad de atravesar las barreras anatmicas y resistir las defensas del hospedador que normalmente restringen a otros microorganismos.

Simbionte Un organismo que tiene una relacin biolgica con uno o ms organismos que conduce a un beneficio mutuo. Interacciones sintropicas Interacciones en el que los organismos hacen ms juntos que solos. Virulencia Una estimacin cuantitativa de la capacidad de un organismo a daar a otro.