La estructura de los genes y genomas

Naturaleza del ADN

El ADN es una estructura lineal, una hlice doble con aspecto de escalera de caracol molecular. La hlice doble est formada por dos cadenas entrelazadas de unas unidades bsicas denominadas nucletidos. Cada nucletido consiste en un grupo fosfato, una molcula de azcar desoxirribosa y una de cuatro bases nitrogenadas adenina, guanina, timina y citosina-. Cada uno de los cuatro nucletidos se nombra habitualmente con la primera letra de la base que contiene: A, G, T y C. Los nucletidos estn entrelazados unos a otros en el ADN por sus posiciones 3 y 5, por tanto, decimos de cada cadena que tiene polaridad, con un extremo que contiene un grupo fosfato 5 y otro extremo que contiene un grupo OH 3. Los enlaces que conectan los grupos sucesivos de azcar y fosfato se denominan enlaces fosfodister. Las polaridades de las dos cadenas de nucletidos entrelazadas son opuestas, es decir, antiparalelas. Las dos cadenas de nucletidos se mantienen unidas mediante enlaces dbiles, denominados puentes de hidrgeno, entre las bases. El establecimiento de tales enlaces es muy especfico, debido al encaje a modo de llave y cerradura entre la forma y las cargas atmicas de las bases. La adenina se empareja slo con la timina, y la guanina slo con la citosina. Se dice de las bases que forman estas parejas que son complementarias, as, un segmento de ADN de secuencia arbitraria sera: 5-CAGT-3 3-GTCA-5 Porqu estos ltimos enlaces deben ser dbiles? Las dos cadenas deben separarse en algn momento para que se produzca el proceso de replicacin. Los pares de bases, que corren por el interior de la hlice doble, son estructuras hidrfobas

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planas que tienden a apilarse debido a la exclusin de las molculas de agua. Este aplanamiento obliga a las dos cadenas entrelazadas del ADN a adoptar su conformacin helicoidal. Para que se produzca la replicacin, las dos cadenas de la hlice doble deben desenrollarse en una direccin, al modo de la apertura de una cremallera. Las dos cadenas expuestas de nucletidos actan entonces como guas de alineacin, o moldes, en la colocacin de nucletidos libres. Estos nucletidos se han sintetizado en la clula y llegan al ncleo por difusin. Su polimerizacin en una nueva cadena es catalizada por la enzima polimerasa de ADN. Esta enzima se une inicialmente al ADN de doble cadena en una secuencia especfica de nucletidos llamada origen de replicacin, desplazndose luego a lo largo del ADN para polimerizar las cadenas nuevas. El punto crucial de este proceso es que, debido a la complementariedad de las bases, las dos molculas hijas de ADN son idnticas una a otra, y a la molcula original. Sin embargo, cada molcula hija es mitad vieja y mitad polimerizada de nueva. Esta forma de replicacin se denomina semiconservativa.

Naturaleza de los genes

Un gen es un segmento corto de ADN, que le dice al cuerpo cmo producir una protena especfica. Hay aproximadamente 30.000 genes en cada clula del cuerpo humano y la combinacin de todos los genes constituye el material hereditario para el cuerpo humano y sus funciones. La composicin gentica de una persona se llama genotipo. Los genes estn localizados en hebras de ADN, de manera similar a una sarta de cuentas. Las hebras de ADN conforman los cromosomas. Los cromosomas son pares apareados de una copia de un gen especfico. El gen se encuentra en la misma posicin en cada cromosoma.

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En las mujeres, un cromosoma obtiene su gen de la madre y el otro cromosoma apareado tiene el gen del padre. En los hombres, un slo cromosoma X proviene de la madre y un cromosoma Y no apareado proviene del padre. Los rasgos genticos, como el color de los ojos, se describen como dominantes o recesivos: Los rasgos dominantes son controlados por un gen en el par. Los rasgos recesivos requieren que ambos genes en el par de genes trabajen juntos para controlar el rasgo. Muchas caractersticas personales, como la estatura, son determinadas por ms de un gen. Sin embargo, algunas enfermedades, como la anemia drepanoctica, pueden ser ocasionadas por un cambio en un solo gen. Un gen es una unidad de expresin y siempre dar lugar a un RNA. Algunos RNA dan lugar a protenas (mRNA 6%), otros funcionan como RNA en la clula (rRNA 80%), tRNA (15%) y 5nRNA (RNA del ncleo, muy pequeo, algunos con funcin cataltica y otros que no se sabe bien su utilidad). El proceso por el cual se obtiene RNA es la transcripcin. El lugar donde se inicia la transcripcin es el promotor. Asociado a cada gen hay elementos reguladores que tienen que estar delante del promotor y constan de dos partes: Una protena. Algo en el gen donde se une la protena. En los genes procariotas cada promotor tendr un opern. Ahora el elemento regulador estar tras el promotor y se le conoce como operador. En los genes eucariotas se copia todo y luego el mensajero pierde los intrones en un proceso que se conoce como maduracin del mensajero. Una vez eliminados los intrones se procede a la transcripcin.

Tipos de genes

Un gen es una secuencia o segmento de ADN necesario para la sntesis de ARN funcional, como el ARN de transferencia o el ARN ribosomal. Sin embargo, estos dos tipos de ARN no codifican protenas, lo cual es hecho por el ARN mensajero. Para ello, la transcripcin genera una molcula de ARN que posteriormente sufrir traduccin en los ribosomas, proceso por el cual se genera una protena. Muchos genes se encuentran constituidos por regiones codificantes (exones) interrumpidas por regiones no codificantes (intrones) que son eliminadas en el

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procesamiento del ARN. En clulas procariontes esto no ocurre pues los genes de procariotas carecen de intrones. La secuencia de bases presente en el ARN determina la secuencia de aminocidos de la protena por medio del cdigo gentico. Otros genes no son traducidos a protena, sino que cumplen su funcin en forma de ARN. Entre stos, encontramos genes de ARN transferente, ARN ribosmico, ribozimas y otros ARN pequeos de funciones diversas. Algunos genes han sufrido procesos de mutacin u otros fenmenos de reorganizacin y han dejado de ser funcionales, pero persisten en los genomas de los seres vivos. Al dejar de tener funcin, se denominan pseudogenes, y pueden ser muy parecidos a otros genes del mismo organismo que sean funcionales.

Funcin del Gen

La funcin del gen es determinar cuales proteinas deben sintetizarse para dar cierta forma, estructura y modalidad al organismo. Por ello el genotipo -estructura gentica determina el fenotipo - caractersticas fsicas visibles en el individuo de acuerdo a sus genes. ejemplo color de ojos. Contiene ADN que est formado por una secuencia de bases puricas y pirimidicas. Esta secuencia constituye el cdigo gentico y determina ciertas caractersticas del individuo. Dependiendo de la secuencia se formaran determinadas protenas y o enzimas que conformarn la estructura del mismo y sus caractersticas diferenciales, color de piel, ojos, etc. Hay 3 propiedades fundamentales que cabe exigir a los genes y al ADN del que se componen. 1. Replicacin. Las molculas hereditarias deben ser susceptibles de replicarse en dos fases crticas del ciclo de vida. La primera es la generacin del tipo celular que asegurar la continuacin de una especie de una generacin a la siguiente. En plantas y animales estas clulas son los gametos: vulo y espermatozoide. La otra fase se produce cuando la primera clula de un nuevo organismo sufre mltiples rondas de divisin para generar un organismo multicelular. En plantas y animales, sta es la fase en la que el ovulo fecundado, el cigoto, se divide repetidamente para producir una compleja apariencia orgnica que reconocemos. 2. Generacin de forma. Podemos pensar en las estructuras funcionales que constituyen un organismo como forma o sustancia. Visto as, el ADN posee informacin esencial; aquello que es necesario para dar forma.

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3. Mutacin. Un gen que ha pasado de una forma allica a otra ha sufrido mutacin, un hecho raro, pero que ocurre de forma regular. La mutacin no es slo la causa de variacin dentro de una especie, sino, a largo plazo, la materia prima de la evolucin.

Naturaleza de los genomas

Un genoma es el nmero total de cromosomas, o sea todo el ADN (cido desoxirribonucleico) de un organismo, incluido sus genes, los cuales llevan la informacin para la elaboracin de todas las protenas requeridas por el organismo, y las que determinan el aspecto, el funcionamiento, el metabolismo, la resistencia a infecciones y otras enfermedades, y tambin algunos de sus procederes. En otras palabras, es el cdigo que hace que seamos como somos. Un gen es la unidad fsica, funcional y fundamental de la herencia. Es una secuencia de nucletidos ordenada y ubicada en una posicin especial de un cromosoma. Un gen contiene el cdigo especfico de un producto funcional. El DNA es la molcula que contiene el cdigo de la informacin gentica. Es una molcula con una doble hebra que se mantienen juntas por uniones dbiles entre pares de bases de nucletidos. Los nucletidos contienen las bases Adenina(A), guanina (G), citosina (C) y timina (T). La importancia de conocer acabadamente el genoma es que todas las enfermedades tienen un componente gentico, tanto las hereditarias como las resultantes de respuestas corporales al medio ambiente. El genoma humano contiene alrededor de 3.000 millones de pares de bases (A, C, T y G). Por trmino medio los genes contienen 3.000 pares de bases, pero el tamao vara mucho, el ms grande conocido en el humano es el de la distrofina, con 2,4 millones de pares de bases. Se desconoce la funcin de ms del 50% de los genes descubiertos. La secuencia del genoma humano es casi (99,9%) exactamente la misma en todas las personas. Alrededor del 2% del genoma codifica instrucciones para la sntesis de protenas. Las secuencias repetidas que no codifican protenas forman alrededor del 50% del genoma humano.

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Se cree que las secuencias repetidas no tienen una funcin directa, pero mantienen la estructura y el dinamismo de los cromosomas. El cromosoma 1 (el cromosoma humano ms grande) tiene la mayor cantidad de genes (2.968), y el cromosoma Y la menor (231). Se han identificado alrededor de 3 millones de localizaciones en el genoma donde existen diferencias de una base entre distintos humanos. Esta informacin promete revolucionar el proceso de hallazgo de secuencias de ADN relacionadas con enfermedades del tipo: cardiopatas, diabetes, artritis y cnceres.

Complejidad del genoma

Tamao de algunos tipos de genomas Tamao Genoma (pares de bases) 5104 4106 2107 8107

Organismo Fago Escherichia coli Levadura Caenorhabditis elegans

Drosophila melanogaster 2108 Humano 3109

Nota: El ADN de una simple clula tiene una longitud aproximada de 1,8A. Las investigaciones llevadas a cabo hasta ahora sugieren que la complejidad del genoma humano no radica ya en el nmero de genes, sino en cmo parte de estos genes son usados para construir diferentes productos en un proceso que es llamado ayuste alternativo (alternative splicing). Otra importante razn de esta complejidad radica en el hecho de que existan miles de modificaciones qumicas para fabricar protenas as como del repertorio de mecanismos que regulan este proceso.

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Qu beneficios puede traer el estudio del genoma? Diagnstico y prevencin de enfermedades o Prueba gentica: las pruebas basadas en el ADN son casi el primer uso comercial y de aplicacin mdica de los nuevos descubrimientos en gentica. Estos ensayos se pueden usar para el diagnstico de enfermedades, la confirmacin diagnostica, la informacin del pronstico as como del curso de la enfermedad, para confirmar la presencia de enfermedad en pacientes asintomticos y, con variados grados de certeza, para predecir el riesgo de enfermedades futuras en personas sanas y en su descendencia. Estudio de susceptibilidad en las enfermedades Intervencin (tratamiento) sobre la enfermedad: posibilidades de desarrollo de tcnicas o para tratar enfermedades hereditarias. El procedimiento implica reemplazar, manipular o suplementar los genes no funcionales con genes funcionales. En esencia, la terapia gnica es la introduccin de genes en el ADN de una persona para tratar enfermedades. La posible creacin de frmacos a medida del enfermo Terapia gnica y Farmacogenmica. Otros posibles beneficios de la investigacin gentica Medicina molecular Genmica microbiana Valoraciones de riesgo Bioarqueologa, antropologa, evolucin y estudio de migraciones humanas, paleogentica principalmente a partir del ADN fsil Identificacin ADN Agricultura y bioprocesamiento
Tipos de genomas

Virus Bacterias Eucariotas Genoma citoplasmtico Mitocondrias Plsmidos Cloroplastos Genoma nuclear Organizado en cromosomas

La estructura de los genes y genomas Virus Hay virus con DNA y virus con RNA, pero nunca de las dos cosas a la vez. El genoma de virus de DNA puede ser monohebra (lineal o circular) duplexo (lineal o circular), doble hebra con protenas asociadas covalentemente y puede ser duplexo lineal y con los extremos unidos covalentemente. El genoma de virus de RNA, doble hebra y monohebra pero nunca RNA circular. Hay virus de RNA que en vez de tener el genoma en un solo fragmento lo tiene en varias piezas. Bacterias. Sea el genoma que sea es ms grande que el compartimiento. Esta empaquetado porque es ms grande que el compartimiento. La bacteria tiene dos tipos de genoma, nunca en compartimiento nuclear sino que en el citoplasma de la clula, formando una parte de la clula muy densa, el genoma se denomina nucleoide, est formado por una molcula de DNA circular y convexo, est formado por una pequea molcula de DNA duplexo circular llamados plsmido o plasmidio. Esa estructura esta empaquetada o plegndose. Se observa mide y analiza qumicamente. Se analiza y se propone que el DNA de las bacterias esta estructurado en forma de lazos y estos estn unidos covalentemente a la matriz primera de la mitocondria. En base a esto se propone que el DNA de las bacterias esta resguardado por la otra vrtebra. Se supone que las protege y crean los empaquetamientos. Eucariotas. Genoma citoplasmtico. Mitocondrias: est formado por una molcula de DNA duplexo y circular, en relacin con la trascripcin y replicacin acta independientemente. A una hebra se le llama U y a la otra L. Es una cromatina con una gran densidad gnica. Plsmidos: los hay en eucariotas haploides y en plantas, son pequeas molculas de DNA circular. Contenidos en las mitocondrias haya un plsmido que est en la levadura, en su ncleo, y se llama circulo de 2 micras. Este plsmido es muy til en los experimentos de ingeniera, insertando vectores de clonacin.

La estructura de los genes y genomas Cloroplastos: orgnulos citoplasmtico solo presentes en plantas. El genoma de los cloroplastos es duplexo y circular, se caracteriza por su gran densidad gnica, tiene 3 tipos de secuencias. Tiene secuencias IR (repeticiones invertidas), una misma secuencia esta repetida en sentido contrario, tiene LSC (Long Single Copy) son largas copias nicas y por ltimo las secuencias SSC (Short Single Copy) que son copias nicas cortas. Genoma nuclear. 1. Cromatina: La hiptesis est basada en la observacin de microscopia electrnica, en medicin de las microscopias electrnicas, en el anlisis qumico de las estructuras. Observacin: si se extrae la cromatina interfasica, el contenidos nuclear en interfase, se tie y se observa, se ven que hay regiones ms intensamente teidas y regiones menos teidas, las que se tien mas son heterocromatina y adems constitutiva porque siempre est en forma heterocromtica y la eucromatina se tie menos. La tincin tiene un significado, se tie ms o menos cuando esta mas o menos empaquetada, esto ltimo es porque esta inactiva. La cromatina nuclear eucariota se estructura de la siguiente forma:

Se enrolla alrededor de octmeros de histonas. Se enrolla en forma de solenoide. La fibra se estructura en lazos unidos a la matriz nuclear.