Bioqumica - 2 curso Lic.

en Biologa

Gua Docente Curso 2007/08

Gua Docente de Bioqumica de 2 Curso de Biologa 1. Identificacin........................................................................................................ 2 1.1. De la asignatura............................................................................................. 2 1.2. Del profesorado............................................................................................. 2 2. Presentacin........................................................................................................... 3 3. Conocimientos previos.......................................................................................... 3 4. Competencias......................................................................................................... 3 5. Contenidos.............................................................................................................. 4 6. Metodologa docente y estimacin volumen de trabajo del estudiante... 8 6.1. Metodologa docente..................................................................................... 8 6.2.Estimacin del volumen de trabajo del estudiante (ECTS)................. 9 7. Temporalizacin o cronograma......................................................................... 10 8. Evaluacin.............................................................................................................. 10 9. Bibliografa recomendada................................................................................. 12

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Universidad de Murcia Facultad/Escuela de Biologa Titulacin de Licenciado en Biologa

1-Identificacin 1.1. De la asignatura

Curso Acadmico 2007/08

Nombre de la signatura Cdigo Curso Tipo Crditos LRU Estimacin del volumen de trabajo del alumno (ECTS)* Duracin Idiomas en que se imparte 1.2 Del profesorado:
Nombre y rea / Despacho y Apellidos Departamento Facultad dnde se ubica.
Mercedes Bioqumica y Jimnez Biologa Atinzar Molecular A (coord.) Juana Bioqumica y Cabanes Cos Biologa Molecular A Fco. Javier Bioqumica y Campoy Biologa Menndez Molecular A Josefa Bioqumica y Escribano Biologa Cebrin Molecular A Encarnacin Bioqumica y Muoz Biologa Delgado Molecular A

Bioqumica 08B4 2 Troncal Tericos: 9 Prcticos: 5 320 horas (12.8 crditos ECTS) 14x5x60/326.5=12.8 Anual Castellano

Telfono

Correo electrnico y pgina web

Horario de atencin al alumnado

Jueves y Viernes de 10 a 13 h

Ala C 968 364767 mja@um.es F. Veterinaria

Ala C 968 364761 jcabanes@um.es Jueves y F. Veterinaria Viernes de 10 a 13 h Ala E 968 367607 fjcampoy@um.es Jueves y F. Veterinaria Viernes de 10 a 13 h Ala C 968 364762 pepa@um.es Jueves y F. Veterinaria Viernes de 10 a 13 h Ala E 968 364769 encarna@um.es Jueves y F. Veterinaria Viernes de 10 a 13 h

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J. Neptuno Bioqumica y Rodrguez Biologa Lpez Molecular A Francisco Garca Cnovas Rafael Melendreras Gimeno Manuela Prez Gilabert

Ala E 968 398284 neptuno@um.es Jueves y F. Veterinaria Viernes de 10 a 13 h Ala E F. Veterinaria Ala E F. Veterinaria Ala C F. Veterinaria 968 364764 canovasf@um.es

Bioqumica y Biologa Molecular A Bioqumica y Biologa Molecular A Bioqumica y Biologa Molecular A

968 364768

melenraf@um.es

968 364837

mpg@um.es

2-Presentacin La Bioqumica es, literalmente, el estudio de la qumica de la vida. Aunque se superpone con otras disciplinas, la Bioqumica se centra fundamentalmente en un nmero limitado de temas: Estudio de las estructuras qumicas y tridimensionales de las molculas biolgicas. La interaccin de las molculas biolgicas entre s. Sntesis y degradacin de las molculas biolgicas en las clulas. Utilizacin y conservacin de la energa en las clulas. Mecanismos que organizan las molculas biolgicas y coordinan sus actividades. Almacenamiento, transmisin y expresin de la informacin gentica. La Bioqumica revela el funcionamiento del mundo natural, y nos permite conocer y apreciar la vida a nivel molecular. 3-Conocimientos previos - Nociones bsicas de qumica incluyendo: procesos cido/base, reacciones redox, propiedades de los distintos grupos funcionales. - Conceptos bsicos de termodinmica. - Conocimientos bsicos de Biologa. 4-Competencias - Identificar la Bioqumica como la Ciencia que estudia la base molecular de los fenmenos vitales. - Conocer la naturaleza qumica, estructura, propiedades y funcin de los componentes de la materia viva, as como su organizacin y distribucin en clulas y organismos, con especial nfasis en la relacin entre estructura y funcin.

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Conocer la estructura y funcin de las membranas biolgicas y el transporte a travs de ellas. Comprender los fundamentos de la catlisis enzimtica y el papel de las enzimas, reconociendo la importancia de los mecanismos reguladores de su actividad. Usar los conceptos de la Bioenergtica para razonar cmo los seres vivos obtienen, almacenan y emplean la energa. Ver el modo en que los seres vivos almacenan, transmiten y expresan la informacin gentica. Conocer los procesos de transformacin de las biomolculas por los que los seres obtienen su energa, fabrican sus componentes, y eliminan sus desechos, identificando los metabolitos y las enzimas que intervienen en las distintas rutas metablicas, relacionndolas y viendo su ubicacin en clulas y organismos, as como su balance de energa y metabolitos, y comprendiendo su regulacin. Saber cmo tienen lugar a nivel molecular procesos vitales, como pueden ser el transporte de oxgeno. Motivarse por la Bioqumica, reconociendo su poder para desentraar los secretos de la vida a nivel molecular, y su aplicacin en otros campos del saber para la vida diaria. Aprender el manejo de disoluciones en el laboratorio. Aprender a determinar diferentes metabolitos en fluidos biolgicos, y a elaborar rectas de calibrado. Saber utilizar diferente instrumental y tcnicas bsicas en Bioqumica.

5-Contenidos TEORA Tema 1. Aminocidos. Estructura. Aminocidos de las protenas. Propiedades en disolucin. Otros aminocidos. Tema 2. Protenas. Enlace peptdico. Niveles de estructuracin de las protenas. Clasificacin de las protenas. Estructuras secundarias: hlice , hoja plegada , otras. Propiedades de las protenas en disolucin. Tema 3. Enzimas (I). Naturaleza y propiedades de las enzimas. Clasificacin. Complejos enzima-sustrato. Centro activo. Actividad enzimtica. Cintica enzimtica. Cintica michaeliana. Significado y clculo.

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Tema 4. Enzimas (II). Modificadores de la actividad enzimtica. Efecto del pH y temperatura. Activadores e inhibidores. Su cintica. Regulacin de la actividad enzimtica. Tema 5. Coenzimas y vitaminas. Coenzimas, grupos prostticos, vitaminas y cofactores. Relaciones entre ellos. Clasificacin. Naturaleza y forma de actuacin de algunos coenzimas y grupos prostticos. Tema 6. La hemoglobina como ejemplo de relacin estructura-funcin. Estructura. Propiedades: cooperatividad y alosterismo. Base molecular del alosterismo. Mutaciones. Tema 7. Carbohidratos. Monosacridos. Disacridos de inters biolgico. El enlace glicosdico. Polisacridos y proteoglicanos. Tema 8. Lpidos cidos grasos. Triacilgliceroles. Fosfolpidos y glicolpidos. Prostaglandinas, tromboxanos y leucotrienos. Ceras. Terpenos. Esteroides. Tema 9. Membranas Biolgicas y Transporte. Modelos de membrana. El ncleo lipdico. Protenas ligadas a membranas. Transporte de metabolitos a travs de membranas. Difusin simple. Difusin facilitada y sus caractersticas. Transporte activo. Mecanismo de accin de algunas protenas de transporte. Tema 10. cidos Nucleicos Bases pricas y pirimidnicas. Nuclesidos. Nucletidos. ADN. Tipos de ADN (B, A y Z). Ribonucletidos. ARN. Tipos de ARNs. ARNs catalticos. Tema 11. Replicacin del DNA Caractersticas del proceso de replicacin. Replicacin en procariotas. DNA polimerasas y otras enzimas que participan en el proceso. Sntesis del DNA. Replicacin en eucariotas. Tema 12. Transcripcin del DNA Caractersticas del RNA. Transcripcin en procariotas. RNA polimerasa. Transcripcin en eucariotas. Procesos de maduracin del RNA. Inhibidores de la transcripcin.

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Tema 13. Sntesis de Protenas. El cdigo gentico. Activacin de los aminocidos. Sntesis de protenas en procariotas. Sntesis de protenas en eucariotas. Inhibidores de la sntesis de protenas. Modificaciones postraduccionales. Destino celular de las protenas. Tema 14. Introduccin a la Bioenergtica. Flujos de energa en los seres vivos. Energa libre y espontaneidad. Energa libre de una reaccin qumica. Acoplamiento de reacciones. Compuestos con alta energa de hidrlisis: ATP. Oxidaciones y deshidrogenaciones biolgicas. Tema 15. Bioqumica de la respiracin celular (I). Complejo piruvato deshidrogenasa, mecanismo de accin y regulacin. Ciclo de los cidos tricarboxlicos. Mecanismo de accin. Balance material y energtico. Paso de metabolitos a travs de la membrana mitocondrial. Naturaleza anfiblica del ciclo. Reacciones anaplerticas. Regulacin del ciclo. Ciclo del glioxilato y de los cidos dicarboxlicos. Tema 16. Bioqumica de la respiracin celular (II). Transportadores electrnicos mitocondriales. Complejos respiratorios. Ruta del transporte electrnico mitocondrial. Inhibidores. Fosforilacin oxidativa. Desacopladores e inhibidores. Mecanismo molecular de la fosforilacin mitocondrial. Otros usos de la energa de la cadena respiratoria. Tema 17. Transporte electrnico y fotofosforilacin. Organizacin estructural del cloroplasto. Pigmentos fotosintticos. Transportadores electrnicos. Composicin de los fotosistemas. Flujo electrnico no cclico y generacin de poder reductor. Transporte de electrones cclico. Mecanismo de la fotofosforilacin. Tema 18. Regulacin metablica. Mecanismos bsicos de regulacin y control metablico. Hormonas como reguladores metablicos. Cascadas de transduccin de seales: AMPc y fosfatidil inositoles. Receptores con actividad tirosina quinasa: Actuacin de la insulina. Hormonas esteroides. Tema 19. Metabolismo de glcidos (I) Degradacin digestiva de los glcidos. Catabolismo de monosacridos. Glicolisis. Camino hasta piruvato. Regulacin Transformaciones desde piruvato. Fermentaciones. Balances energticos. Interconversiones entre monosacridos.

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Tema 20. Metabolismo de glcidos (II) Neoglucognesis. Significado fisiolgico. Regulacin. La va de las pentosas fosfato. Significado material y energtico. Otros caminos degradativos. Tema 21.Metabolismo de glcidos (III) Metabolismo de disacridos. Metabolismo del glucgeno. Los sistemas en cascada. Regulacin del metabolismo del glucgeno en mamferos. Tema 22. Fase oscura de la fotosntesis. Fase oscura: el aprovechamiento metablico del proceso fotoqumico. Ruta de Calvin-Benson. Regulacin de la fotosntesis. Ruta de HatchSlack. Papel de los cidos dicarboxlicos C4 en algunas plantas. Fotorrespiracin y su significado. Tema 23. Metabolismo de lpidos (I). Digestin y absorcin de los lpidos de la dieta. Transporte de los lpidos: lipoprotenas. Movilizacin de las grasas. Activacin y transporte intracelular de los cidos grasos. -oxidacin mitocondrial de los cidos grasos. Otras rutas oxidativas de los cidos grasos. Metabolismo de los cuerpos cetnicos. Tema 24. Metabolismo de lpidos (II). Biosntesis de cidos grasos. Sntesis del palmitato. Origen de los grupos acetilo y del NADPH. Elongacin e insaturacin. Regulacin de la sntesis de cidos grasos. Biosntesis de triacilgliceroles y su regulacin. Obesidad. Tema 25. Metabolismo de lpidos (III). Sntesis del colesterol. Lipoprotenas y transporte del colesterol. Regulacin del metabolismo del colesterol. Hipercolesterolemia y su tratamiento. Derivados del colesterol: sales biliares, hormonas esteroides, vitamina D. Tema 26. Metabolismo de lpidos (IV). Metabolismo de glicerolpidos y esfingolpidos. Tema 27. Catabolismo de Protenas. El metabolismo nitrogenado. Digestin de protenas y absorcin intestinal de los aminocidos. Catabolismo intracelular de protenas. Mecanismos de degradacin.

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Tema 28. Metabolismo de aminocidos. Transformaciones generales de los aminocidos. Destino del nitrgeno. Ciclo de la urea. Destino del esqueleto carbonado de los aminocidos. Relacin con otras vas metablicas. Aminoacidopatas. Familias biosintticas de aminocidos. Origen del N, C y S. Transformaciones generales. Ejemplos ms significativos de regulacin. Tema 29. Metabolismo de las bases nitrogenadas. Metabolismo de purinas y su regulacin. Metabolismo de pirimidinas y su regulacin. Inhibidores con efectos antitumorales. PRCTICAS 1.-Colorimetra y espectrofotometra. 2.-Determinacin cuantitativa de protenas: pruebas del biuret y FolinCiocalteau. 3.-Determinacin de metabolitos en suero: glucosa y creatinina 4.-Determinacin de metabolitos en orina: urea. Grado de acidez de la orina. 5.-Tcnicas. Cromatografa en gel y en capa fina. Electroforesis en papel. 6.-Hidratos de carbono: determinaciones cualitativas. 7.-Lpidos: solubilidad y determinacin del grado de acidez de una grasa. 8.-Protenas. Dilisis. Reacciones caractersticas. Valoracin potenciomtrica de aminocidos. 9.-Aislamiento y determinacin del pI de la casena de la leche. 10.-Determinacin de vitamina C y calcio en materiales biolgicos. 11.-Actividades enzimticas: tirosinasa, peroxidasa y lipasa. 12.-Determinacin de actividad -amilasa. 6-Metodologa docente y Estimacin del volumen de trabajo del estudiante (ECTS) 6.1-Metodologa docente Las clases tericas se orientarn hacia la explicacin de los temas y a la discusin y participacin de los alumnos para facilitar su asimilacin y aprendizaje. Se pondr a disposicin de los alumnos, a travs de la Aplicacin SUMA y/o como fotocopias, el material grfico utilizado en el aula. Para las clases prcticas se pondrn a disposicin de los alumnos las fotocopias del protocolo a seguir en cada prctica.

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Las clases prcticas se realizarn en el laboratorio, en grupos reducidos, organizados en equipos de trabajo de dos alumnos. En primer lugar, se familiarizar al alumno con las normas de seguridad a seguir en un laboratorio experimental, se explicarn los fundamentos tericos de la prctica y el protocolo para su realizacin. Los alumnos dispondrn del material de laboratorio y de los aparatos de medida necesarios para la realizacin de cada prctica. El profesor supervisar la realizacin de la prctica por parte de los alumnos y al final de cada sesin habr entrega de resultados y correccin de los mismos. 6.2-Estimacin del volumen de trabajo del estudiante (ECTS)

NOMBRE DE LA ASIGNATURA Bioqumica Crditos: 14 LRU=(12.8 ECTS) Volumen de trabajo del alumno Actividad Hora Factor Trabajo Volumen de presencial B Personal trabajo A C (A x B) D (A +C) CLASES TERICAS Leccin magistral 90 1.8 162 252 CLASES PRCTICAS Laboratorio 50 0.1 5 55 TUTORAS Presencial individual 4 4 Realizacin de exmenes 6 9 Total 320 Relacin trabajo/ECTS: 320 / 12.8 crditos = 25 h

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7-Temporalizacin o cronograma REPARTO HORAS CLASES DE TEORIA. BIOQUMICA. 2 BIOLOGA Profesor/a Mercedes Jimnez Encarna Muoz Josefa Escribano Neptuno Rodrguez Mercedes Jimnez Encarna Muoz Juana Cabanes Josefa Escribano Mercedes Jimnez Javier Campoy Neptuno Rodrguez TOTAL Temas * Presentacin T. 1: Aminocidos T. 2: Protenas T. 3-5: Enzimas, Coenzimas T. 6-9: Hemoglobina, Carbohidratos, Lpidos, Membranas y Transporte T. 10-13: cidos nucleicos, replicacin, transcripcin y sntesis de protenas T. 14-17: Bioenergtica, Respiracin celular, Transporte electrnico y fotofosforilacin T. 18-21: Regulacin hormonal y metabolismo de glcidos T. 22: Fase oscura de la fotosntesis T. 23-26: Metabolismo de Lpidos T. 27-28: Metabolismo Nitrogenado Horas 1 hr 2 hr 5 hr 5 hr 12 hr 16 hr 17 hr 12 hr 2 hr 12 hr 6 hr 90 hr

CLASES PRCTICAS Se realizarn las 12 prcticas descritas en contenidos en 12 semanas distribuidas de la siguiente forma: 8 prcticas en el primer cuatrimestre realizadas en horario de tarde en 8 semanas comprendidas del 22 de octubre al 11 de enero 4 prcticas en el segundo cuatrimestre realizadas en 4 semanas, del 18 de febrero al 14 de marzo. 8-Evaluacin Evaluacin de la parte terica La evaluacin de los conocimientos adquiridos mediante las clases tericas se realizar mediante exmenes de tipo test. En estos exmenes las preguntas en blanco no penalizan pero s las contestadas mal (4 respuestas malas restan 1 bien, cada respuesta mal resta 0.25 bien).

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Se realizarn exmenes parciales que eliminarn esa materia para la convocatoria de junio (de ese curso) si se obtiene una nota igual o superior a 5 sobre 10. Aquellos alumnos con los parciales aprobados no tendrn que realizar un examen final de toda la asignatura. Su nota de teora ser la nota media de la obtenida en cada uno de los parciales. No obstante, podrn presentarse para subir la nota de uno o ms parciales. En el examen final de junio cada alumno se examinar de los parciales que no tenga aprobados. Su nota de teora ser la nota media de la obtenida en cada uno de los parciales, o bien la nota obtenida en el examen final si el alumno va con toda la materia. -Como caso especial, aquellos alumnos que hayan obtenido 5.0 o ms (sobre 10) en un parcial, y 4.5 o ms en los otros dos parciales, y adems la media de esos tres parciales eliminatorios sea 5 o ms, habrn aprobado la asignatura sin tener que presentarse al examen final. Pero, en caso de que la media sea inferior a 5.00 se tendrn que examinar en el examen final de aquellos parciales en los que hayan obtenido una nota inferior a 5.00 puesto que no estarn eliminados. La nota de los parciales no se guarda para septiembre. OPCIN PARA SUBIR NOTA EN JUNIO: Los alumnos que deseen subir nota de algn parcial en el examen final de junio podrn hacerlo y para la media se tendr en cuenta la nota ms alta de las dos. En las convocatorias extraordinarias los alumnos tendrn que examinarse de toda la materia. La presentacin a uno o ms exmenes parciales no supone consumir convocatoria (salvo que se aprueben los tres y por tanto la parte terica de la asignatura). Fechas de exmenes 23 de enero de 2008: 1 Parcial y Examen Final (Convocatoria de Febrero). 25 de abril: 2 Parcial. 1 de julio: 3 Parcial. 10 de julio: Examen Final (Convocatoria de Junio). 3 de septiembre: Examen Final (Convocatoria de Septiembre). Evaluacin de la parte prctica Asistencia obligatoria. Presentacin y discusin de resultados. Se podr hacer un examen final de prcticas para los alumnos que hayan asistido al laboratorio.

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Los alumnos que tengan dos faltas de asistencia no aprobarn las prcticas y por tanto no podrn aprobar la teora. Calificacin global: Nota final de teora, teniendo en cuenta la parte prctica. 9-Bibliografa recomendada Bsica: Bioqumica. Stryer L. et al. 5 Ed. (2003). Revert. Lehninger - Principios de Bioqumica. Nelson, D.L. y Cox M.M. 4 Ed. (2005). Omega. Bioqumica. Mathews, C.K., van Holde, K,E. y Ahern, K.G. 3 Ed. (2002). Addison Wesley Ed. Fundamentos de Bioqumica. La vida a nivel molecular. Voet, D., Voet, J.G. y Pratt, C.W. 2 Ed. (2007). Panamericana. Avanzada: Bioqumica. Devlin 4 Ed. (2004). Revert. Biologa Celular y Molecular. Lodish et al. 4 Ed. (2003). Panamericana. Bioqumica. Voet,D. y Voet, J.G. 3 Ed. (2006). Panamericana.

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