SONDAS DE ACIDOS NUCLEICOS

ILSE ALEJANDRA SOLIS ALBA

QUE SON??
Las sondas de cidos nucleicos son fragmentos de cido desoxirribonucleico (ADN) o de cido ribonucleico (ARN) marcados con algn elemento que les permite revelar, mediante una seal, su presencia. Estos fragmentos pueden cumplir su tarea como sondas debido a que tienen la capacidad de unirse a fragmentos complementarios presentes en la muestra que se desea analizar.

PARA QUE SIRVE??

Se utilizan en los ensayos de hibridacin

Son marcadores de una secuencia de ADN que permiten identificar la parte de la cadena que se va a estudiar y la que ya se conoce
Se emplean en la deteccin de virus bacterias y hongos

 Las sondas pueden ser usadas para detectar microorganismo directamente de una muestra clnica (expectoracin, orina, etctera). Para confirmar la identificacin de un cultivo que por otros mtodos tarda varios das. Para evaluar la respuesta del husped a un agente infecciosos en particular y tambin para determinar la extensin de la infeccin mediante el estudio de muestras de tejidos de varios rganos.

INDICACIONES
Las pruebas de hibridacin a menudo disminuyen el tiempo necesario para identificar organismos fastidiosos Permiten que los laboratorios puedan aumentar el nmero de patgenos que pueden ser identificados Resultado en un mnimo de tiempo puede significar un ahorro para el paciente y el hospital.

 Con los conocimientos que existen de los genomas de los organismos se generan pequeos fragmentos de DNA (oligonucletidos) que sean complementarios de regiones que nos interesan, por ejemplo de genes especficos de una especie bacteriana. De esta forma, si en una muestra problema se produce la hibridacin entre el oligonucletido y el DNA presente en la muestra, se puede concluir que la bacteria de inters estaba presente en esa muestra. A

estos fragmentos de DNA se les denomina sondas.

Para poder observar si la sonda es hbrida o no con el DNA problema

Es necesario "marcar" la sonda de forma que pueda dar una seal medible

Las sondas son empleadas para la identificacin de patgenos.

Destacan las sondas quimioluminescentes que detectan secuencias especficas de ARN ribosomal

Permiten identificar M.tuberculosis, M. avium , Histoplasma capsulatum y Cryptococcus neoformans.

Se usaron para el diagnstico infecciones por Chlamydia trachomatis y N. gonorrhoeae y se obtuvo:

CHLAMYDIA TRACHOMATIS Sensibilidad: 93.9% Especificidad: 99.1%

NEISSERIA GONORRHOEAE Sensibilidad: 93.3% Especificidad: 99%

TIPO DE PRUEBA

ORGANISMO
Bacterias * Streptococco grupo A *Legionella pneumophila *Chlamydia trachomatis *Neisseria gonorrheae *Tricomonas vaginalis Virus *Papiloma humano Bacteria *Enterococco *Streptococco grupo B *Haemophilus influenzae *Listeria monocytogenes *Neisseria gonorrhoeae *Mycobacterium tuberculosis *Mycobacterium avium *Otras especies de mycobacteria

DETECCION DIRECTA DE LA MUESTRA

CONFIRMACION DE CULTIVO

TIPO DE PRUEBA

ORGANISMO
Hongos *Cryptococcus neoformans *Histoplasma capsulatum *Blastomyces dermatidis *Coccidioides immitis Virus *Papiloma humano

CONFIRMACION DE CULTIVO

DESVENTAJA
Requieren de una cantidad elevada de ADN (aprox un milln de copias), lo que corresponde a un nmero de microorganismos que sobrepasa lo que normalmente se encuentra en la muestra de pacientes.