Seminar despre principiul HARDY-WEINBERG

Echilibrul Hardy-Weinberg Enun: "ntr-o populaie mare n care mperecherea este ntmpltoare, frecvena genelor i fenotipurilor sunt constante din generaie n generaie n absena mutaiei, migraiei i seleciei, iar frecvena genotipurilor este determinat de frecvena genelor" (Hardy, 1908; Weinberg, 1908). Tabelul 1 sintetizeaz observaiile cu privire la echilibru i condiiile n care acesta are loc (Falconer i Mackay, 1996). Tabelul 1. Cadrul n care are loc echilibrul Hardy-Weinberg
(The frame of the Hardy-Weinberg equilibrium) Pasul (Step) Observabile (Observables) Condiii (Conditions) 1a Frecvena genelor la prini (1) Segregarea normal a genelor Frecvena genelor la descendeni (2) Fertilitate egal a prinilor 1b Frecvena genelor n gameii care formeaz (3) Capacitate egal de fertilizare a gameilor zigoii (4) Populaie mare 2 Frecvena genotipic la zigoi (5) nmulire ntmpltoare (6) Frecvena egal a genelor la prini 3 Frecvena genotipic la descendeni (7) Viabilitate egal 4 Frecvena genelor la descendeni

Detalierea pailor prezentai n Tabelul 1 este: 1. De la frecvena genelor la prini, la frecvena genelor gameilor produi de acetia. Fie ca generaia parental s prezinte urmtoarele frecvene de gene i genotipuri (pasul 1a din Tabelul 1): a. Gene parentale A1(p); A2(q); Genotipuri filiale A1A1(P); A1A2(H); A2A2(Q); b. Frecvena genelor n zigoi este neschimbat i determin gamei cu diferite alele care nu difer prin capacitatea de fertilizare; zigoii formai reprezint un eantion mai mare a gameilor prinilor (pasul 1b, Tabelul 1): A1A1(p2); A1A2(pq); A1A2(pq); A2A2(q2); 2. De la frecvena genelor din gamei la frecvena genotipurilor n zigoi: mperecherea ntmpltoare ntre indivizi este echivalent cu unirea ntmpltoare a gameilor acestora: A1A1(p2); A1A2(2pq); A2A2(q2); Dac prinii sunt mperecheai la ntmplare, frecvena genotipurilor n generaia parental depinde numai de frecvena genelor n generaia parental. 3. De la zigoi la aduli: frecvena genotipurilor la zigoi dedus pe baza legii Hardy-Weinberg este: Gene la prini: A1(p), A2(q); Genotipuri la descendeni: A1A1(p2); A1A2(pq); A2A2(q2); Procesul deductiv nu se ncheie aici, deoarece aceste frecvene nu pot fi observate dect dac capacitatea de supravieuire a zigoilor este egal pn cnd acetia se pot clasifica pentru genotip. 4. De la frecvena genotipurilor la frecvena genelor n generaia filial: demonstreaz c frecvena genelor nu s-a modificat. Proporia genotipului A1: p2 + (2pq) = p(p+q) = p Observaii: Deoarece frecvena genelor este identic n generaia parental i filial, relaia dintre frecvena genelor i genotipurilor se aplic doar unei singure generaii. Frecvena genotipurilor n generaia filial depinde doar de frecvena genelor din generaia parental (indiferent de frecvena genotipurilor). Proprietile unei populaii, ce decurg din legea Hardy-Weinberg, referitor la un singur locus sunt: Populaie mare, cu mperechere ntmpltoare, n absena mutaiei, migraiei i seleciei - este stabil n ceea ce privete frecvena genelor i a genotipurilor. Frecvena genotipurilor la descendeni obinui prin mperecherea ntmpltoare a indivizilor din generaia parental, este determinat numai de frecvena genelor la prini. O populaie n echilibru prezint n orice generaie relaia ntre frecvenele genelor i ale genotipurilor indiferent de frecvena genotipurilor prinilor.

Frecvena mperecherilor Fie un locus cu dou alele la care frecvenele genelor i genotipurilor la prini sunt cele prezentate. Exist 9 posibiliti de mperechere, pentru care frecvena n situaia mperecherii la ntmplare este prezentat n Tabelul 2. Tabelul 2. Frecvena mperecherilor aleatorii mam-tat
(Frequency of random mother-father hibridizations) Genotipul A1A1 A1A2 A2A2 (Genotype) Frecvena P H Q (Frequency) 2 A1A1 P P PH PQ A1A2 H PH H2 HQ A2A2 Q PQ HQ Q2

Dac sexul printelui nu influeneaz frecvena mperecherilor aleatorii, atunci exist tipuri de mperechere similare i numrul tipurilor de mperechere se reduce la 6. Genotipurile i frecvena acestora la descendeni este redat n Tabelul 3. Tabelul 3. Genotipuri i frecvena la descendeni
(Genotypes and their frequencies in progenies) Tipul de mperechere Frecvena Frecvena la descendeni (Descendants frequencies) (Crossover type) (Frequency) A1A2 A2A2 A1A1 A1A1 A1A1 P2 P2 A1A1 A1A2 2PH PH PH A1A1 A2A2 2PQ 2PQ 1 A1A2 A1A2 H2 /4H2 H2 H2 A1A2 A2A2 2HQ HQ HQ A2A2 A2A2 Q2 Q2 2 2 2 Total P +PH+H PH+2PQ+H +HQ H2+HQ+Q2 Total (P+1/2H)2 2(P+1/2H)(Q+1/2H) (Q+1/2H)2 2 2pq q2 Total p

Se demonstreaz c frecvenele din echilibrul Hardy-Weinberg sunt pstrate dup o generaie de mperechere la ntmplare, indiferent de frecvena genotipurilor la prini. Alele multiple Dac q1 i q2 sunt frecvenele a doua alele A1 i A2 dintr-o serie multipl atunci frecvena genotipurilor conform legii Hardy-Weinberg sunt (Li, 1955): A1A1 - q12; A1A2 - 2q1q2; A2A2 - q22. Aceste frecvene sunt, de asemenea, atinse dup o generaie de mperecheri la ntmplare. Dac toate alelele sunt co-dominate, astfel toate genotipurile sunt reflectate n fenotipuri, frecvena genelor se poate determina din fenotipuri prin simpl numrare. Dac una sau mai multe gene sunt recesive, frecvena genelor nu poate fi obinut prin numrarea alelelor, ci trebuie estimat prin metoda maximizrii ansei (maximum-likelihood; Weir, 1990). Gene legate de cromozomii de sex Legtura dintre frecvena genelor i frecvena genotipurilor la sexul homogametic este aceeai ca i la genele autosomale; sexul heterogametic prezint ns numai 2 genotipuri, fiecare individ purtnd o singur gen n loc de dou. Astfel, 2/3 din genele legate de sex din populaie sunt purtate de sexul homogametic i 1/3 de sexul heterogametic. Fie dou alele A1 i A2 cu frecvenele p i q. Frecvenele genotipurilor la cele dou sexe sunt urmtoarele (vezi i Tabelul 4): Feminin: A1A1 (P); A1A2 (H); A2A2 (Q); Masculin: A1 (R); A2 (S); Tabelul 4. ncruciri ntr-o generaie oarecare pentru numr diferit de alele
(Cross overs in a generation for different number of alleles) A1 A2 F M A1A1 A1A2 A2A2 1 A1A1 A1 P R 1/2PR /2PR 1 1 A1A1 A2 P S /2PS /2PS 1 A1A2 A1 H R 1/4HR 1/4HR /4HR 1/4HR 1 1 1 A1A2 A2 H S /4HS /4HS /4HS 1/4HS

Frecvena lui A1 la genul feminin este pf = P + 1/2H iar la sexul masculin de pm = R. Frecvena genei A1 n ntreaga populaie este: p = 2/3pf + 1/3pm = 1/3(2pf+pm) = 1/3(2P+H+R) Deoarece frecvenele genelor la sexul feminin i masculin sunt diferite, populaia nu este n echilibru. Frecvena genelor n populaia luat n ansamblu nu se schimb, ns distribuia ntre cele dou sexe alterneaz n timp ce populaia se apropie de echilibru. Masculii primesc genele lor legate de sex numai de la mamele lor (pm = pf-ant, unde pf-ant = frecvena genelor din populaia anterioar), n timp ce femelele primesc genele lor legate de sex n mod egal de la ambii prini (pf = media(pf-ant, pm-ant)). Diferena ntre frecvene la cele dou sexe este: pf - pm = 1/2(pf-ant + pm-ant) - pf-ant = - 1/2(pf-ant - pm-ant) Distribuia genelor ntre cele dou sexe oscileaz, ns diferena este njumtit n generaii succesive, nct populaia se apropie rapid de starea de echilibru, n care frecvenele celor dou sexe sunt egale (vezi Figura 1).
1000 1000

A2A2 A1 Q A2A2 A2 Q

R S

/2QR -

/2QS

/2QR /2QS

a i

a0 i ai

1000 0 .. 10
1

1.

1000 1000

2 10 0 i Figura 1. Evoluia (rapid) ctre echilibru a diferenei ntre frecvenele sexelor ((fast) Evolution to equilibrium of the difference between sex frequencies)

ai

0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10

Loci multipli Atingerea echilibrului n frecvena genotipurilor dup o generaie de mperechere la ntmplare se realizeaz pentru locii autosomali considerai separat. S considerm o populaie alctuit dintr-un numr egal de indivizi A1A1B1B1 i A2A2B2B2 de ambele sexe. Cu dou alele pentru fiecare din cei doi loci exist 9 genotipuri posibile, dar doar 3 dintre acestea vor aprea n prima generaie (2 homozigotul dublu original i 1 heterozigot dublu; genotipul A1A1B2B2 va fi absent, dei frecvena sa ntr-o populaie n echilibru este de 1/16). Genotipurile absente vor aprea n generaiile ulterioare, ns nu neaprat cu frecvena lor de echilibru. Dac cei doi loci sunt nlnuii, atingerea frecvenelor de echilibru va necesita mai mult timp, deoarece apariia genotipurilor absente depinde de recombinarea dintre cei doi loci. Dezechilibrul cu respectarea a doi sau mai muli loci se numete dezechilibru gametic de faz sau dezechilibru de nlnuire. Cauzele care pot determina dezechilibru sunt: mperecherea a dou populaii diferite (cu frecvene de gene diferite). ansa: n populaiile mici. Selecia prin favorizarea unei alele, n comparaie cu cealalt alel. Frecvenele de atingere a echilibrului n cazul unei populaii cu mperechere la ntmplare sunt: Gena A1 A2 B1 B2 Frecvena genei pA qA pB qB Tip de gamet A1B1 A1B2 A2B1 A2B2 Frecvena, echilibru pApB pAqB qApB qAqB Frecvena, actual r s t u Diferena de la echilibru +D -D -D +D

Dac populaia e n echilibru, atunci ru = st. Diferena D = ru - st d o msur a gradului de deprtare fa de echilibru. Aceast diferen este njumtit n fiecare generaie succesiv de mperecheri la ntmplare (aa cum s-a reprezentat n Figura 1), apropierea de echilibru fiind astfel destul de rapid. Dac sunt considerai mai mult de 2 loci, apropierea de echilibru devine din ce n ce mai lent, pe msur ce numrul locilor crete. Cnd o populaie cu dezechilibru de nlnuire se mperecheaz aleatoriu, valoarea dezechilibrului se reduce progresiv cu fiecare generaie succesiv. Rata cu care aceasta se ntmpl depinde de frecvena tipului gametic n dou generaii succesive. Aceasta se poate vizualiza uor dac cei doi loci sunt nlnuii pe acelai cromozom. Dezechilibrul n generaia filial se poate obine din frecvena oricrui tip de gamei din cele 4 posibiliti, de exemplu A1B1. Agest genotip poate s apar n generaia filial prin: Non-recombinarea genotipului A1B1/AxBx unde x semnific prezena oricrei alele din cele dou posibile. Frecvena acestui genotip este r(1-c) unde r = frecvena A1B1 n gameii paterni i c = frecvena de recombinare; Recombinare a genotipului A1Bx/AxB1. Dac notm cu pA frecvena cromozomului A1Bx i cu pB = frecvena cromozomului AxB1 frecvena de apariie a lui A1B1 = pApBc. Astfel, frecvena A1B1 n generaia filial este: r' = r(1-c) + pApBc i dezechilibrul n generaia filial este: D' = r' - pApB = r(1-c) + pApB(1-c) = (r - pApB)(1-c) = D(1-c); dup nc o generaie D'' = D(1c)2, iar dup t generaii, dezechilibrul e dat de Dt = D(1-c)t. Cu ct numrul de loci este mai mare, cu att probabilitatea de recombinare este mai mic (pentru 2 loci nenlnuii este de 1/2; pentru 3 este de 1/4, pentru 4 este de 1/8). Astfel, dezechilibrul pe mai muli loci descrete mai repede dect pentru 2 loci, ceea ce va domina dezechilibrul total. O consecin practic decurge imediat: cnd avem la dispoziie un numr de loci pentru studiu, dezechilibrul mai degrab se gsete cu perechi de loci, dect cu un numr mare de loci consecutiv nlnuii. Dezechilibrul nlnuit se poate identifica n populaii naturale ntre loci ntre care recombinarea nu a avut suficient timp s mprtie dezechilibrul iniial. Exemple de nie n dezechilibru ecologic:

 Unni Vik, Marte H. Jrgensen, Hvard Kauserud, Inger Nordal, Anne K. Brysting, 2010. Microsatellite markers show decreasing diversity but unchanged level of clonality in dryas octopetala (rosaceae) with increasing latitude. American Journal of Botany 97(6): 000-000, Vik&others_2010.pdf - Table 5 - TEMA Laborator/Proiect