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COO¯
+
H3N Cα H
R
Formas de los Aminoácidos
COOH COO¯
+
H2N C H H3N C H
R R
Íon híbrido
zwitterión
Predomina a pH fisiológico
Isomerismo de los Aminoácidos
(excepto la glicina)
COO¯ COO¯
+ +
H3N C H H C NH3
CH3 Carbono CH3
asimétrico
L- Alanina D- Alanina
Aminoácidos no proteicos:
todos los demás (ornitina, citrulina, ácido gamma-
aminobutírico (GABA), etc.)
2) Según su capacidad de interaccionar con en
agua:
Apolares neutros
Alifáticos: glicina, alanina, valina, leucina, isoleucina
y prolina.
Aromáticos: fenilalanina, tirosina y triptófano.
Fenilalanina, Phe, F
Serina, Ser, S
Treonina, Thr, T Cisteína, Cys, C
Aspartato, Asp, D
Glutamato, Glu, E
Aminoácidos Básicos:
Histidina, His, H
Lisina, Lys, K
Arginina, Arg, R
3) Esencialidad nutricional
Nutricionalmente esenciales:
no sintetizados por el organismo (valina, leucina, isoleucina,
treonina, metionina, lisina, fenilalanina y triptófano).
Nutricionalmente no esenciales:
pueden ser sintetizados por el organismo (glicina, alanina,
prolina, serina, glutamato, glutamina, aspartato, asparagina).
Nutricionalmente semiesenciales:
a) Sintetizados a partir de aminoácidos esenciales (cisteína, a
partir de metionina y tirosina, a partir de fenilalanina).
R-COOH R-COO¯ + H+
R-NH3+ R-NH2 + H+
pH Ácido pH Básico
pKA -+NH3
pKA Imidazol
pKA -COOH
Equivalentes de ¯OH
Propiedades químicas de los
aminoácidos
1. Formación de sales
Ácido + base sal + agua
2. Formación de ésteres
Ácido + alcohol éster + agua
+
α
Glicina Alanina
Enlace α +
peptídico Agua
Glicilalanina, Gli-Ala, GA
Formación de un dipéptido
HOH
COOH COOH O COOH
H2N C H + H2N C H CN C H
CH3 H CH
H H2N C H 3
• Es un híbrido de
resonancia con electrones
deslocalizados a lo largo
de los enlaces (C – N) y
(C – O).
• Presenta un carácter
parcial de doble enlace.
Representación de los péptidos
1. En zig-zag, con extremo amino a la izquierda.
Carboxilo terminal
O CH2 H O
Amino terminal H
H3N+ C C N C O¯
C N C C
H H H
CH2 O CH2
COO¯ OH
Asp-Tir-Ser DYS Aspartil-tirosil-serina
Nomenclatura de los péptidos
Los péptidos se nombran comenzando por el extremo N y
se les da el sufijo “il” a los aminoácidos excepto al último,
es decir, se nombran como derivados del aminoácido del
extremo carboxilo
Por ejemplo:
Alanil-seril-cisteinil-lisil-fenilalanil-histidil-treonina
SH
O CH2 H H O
C C N C O¯
CH2 N C C
H H
CH2 H O
H3N+ C H
COO¯
Funciones:
Descomposición del H2O2.
Metabolismo de sustancias tóxicas.
Antioxidante intracelular.
Transporte de aminoácidos
Péptidos de importancia fisiológica
Hormonas pancreáticas
Insulina:
Conformada por 2 cadenas, con un total de 51
aminoácidos, responsable de la entrada de
glucosa en las células del tejido muscular y
adiposo.
Glucagón:
Es una cadena de 29 aminoácidos, aumenta los
niveles de glucosa en sangre.
Insulina Humana:
S S
Gli-Ile-Val-Glu-Gln-Cis-Cis-Tre-Ser-Ile-Cis-Ser-Leu-Tir-Gln-Leu-Glu-Asn-Tir-Cis-Asn
S S
S S
Fen-Val-Asn-Gln-His-Leu-Cis-Gli-Ser-His-Leu-Val-Glu-Ala-Leu-Tir-Leu-Val-Cis-Gli-Glu-Arg-Gli-Fen-Fen-Tir-Ter-Pro-Lis-Ala
Insulina Bovina:
S S
Gli-Ile-Val-Glu-Gln-Cis-Cis-Ala-Ser-Val-Cis-Ser-Leu-Tir-Gln-Leu-Glu-Asn-Tir-Cis-Asn
S S
S S
Fen-Val-Asn-Gln-His-Leu-Cis-Gli-Ser-His-Leu-Val-Glu-Ala-Leu-Tir-Leu-Val-Cis-Gli-Glu-Arg-Gli-Fen-Fen-Tir-Ter-Pro-Lis-Ala
Péptidos de importancia fisiológica
Hormonas hipotalámicas
Hormona liberadora de tirotropina (tripéptido).
Hormonas hipofisiarias
Vasopresina u hormona antidiurética:
nonapéptido, promueve la resorción de agua
desde los túbulos renales distales.
Oxitocina:
nonapéptido, promueve la expulsión de leche
de las glándulas mamarias y la contracción
del músculo liso uterino.
Proteínas
Cadenas polipeptídicas de mas de 100
aminoácidos, con estructuras primaria,
secundaria y terciaria por lo menos (algunas
también cuaternaria).
Transporte y almacenamiento
Protección inmune
b) Fibrosas:
Relación longitud/ancho > 10
Insolubles en soluciones salinas acuosas.
Ejemplos: Colágeno, queratina.
2) Según su función
a) Catalítica (enzimas)
b) Transportadoras (hemoglobina, lipoproteínas)
c) Almacenadoras (mioglobina, ferritina)
d) Protectoras (inmunoglobulinas)
e) Estructurales (colágeno)
f) Reguladoras (hormonas, proteínas unidas a ADN)
g) Contráctiles o de movimiento (actina, miosina)
3) Según su composición
a) Simples: formadas solamente por residuos de
aminoácidos.
Ejemplo: Albúmina
Ejemplo:
Mioglobina
Ejemplo:
Hemoglobina (tetramérica)
5) Según su solubilidad
Lys
Lys
Gly Estructura terciaria Estructura cuaternaria
Gly
Leu
Val
Ala
His
Fuerzas que estabilizan los niveles
estructurales de las proteínas
1) Enlaces covalentes (fuertes) compartición de electrones:
a. Enlace peptídico: entre el grupo alfa NH2 de un aminoácido y el
grupo carboxilo de otro aminoácido
b. Enlace disulfuro: entre 2 cisteínas, inter o intra-cadena
Timina
Adenina
Estructura Primaria
Es la secuencia lineal de los residuos de aminoácidos
Las láminas -antiparalelas son más estables debido a que se forman puentes
de hidrógenos colineales
Láminas plegadas beta antiparalelas
Estructuras supersecundarias
Son combinaciones de estructuras secundarias de hélices
alfa y láminas beta
Unidades : Están constituidas por dos láminas -plegadas
paralelas interconectadas por un segmento de -hélice
Unidades : Están constituidas por dos -hélices sucesivas
separadas por un segmento no helicoidal.
Meandros: Están constituidos por láminas -plegadas anti-
paralelas interconectadas por segmentos de
aminoácidos polares y glicina que producen un cambio
brusco de la dirección de la cadena polipeptídica
Barril : Se produce cuando varias configuraciones de láminas
-plegadas se repliegan sobre ellas mismas.
Llave Griega: Se producen cuando una lámina -plegada anti-
paralela se dobla sobre sí misma.
Estructuras supersecundarias
Unidades : Unidades : Meandros:
Puente salino
Interacciones
hidrofóbicas
Puente
disulfuro
Puente de hidrógeno
Estructuras tipo de las proteínas globulares
Predominio Hélices Predominio Láminas Mezcla de Hélices y
Láminas
Estructura Cuaternaria
Es el ensamble de dos o más cadenas polipeptídicas
separadas que se unen por medio de interacciones no
covalentes y por entrecruzamientos covalentes.
1. Interacciones hidrófobas
3. Puentes de hidrógenos
Hemoglobina Inmunoglobulina
Niveles estructurales de la hemoglobina
Lys
Lys
Gly
Gly
Leu
Val
Ala
Estructura Estructura
His terciaria cuaternaria
Estructura
secundaria
Estructura
primaria
Desnaturalización de las proteínas
Pérdida de la estructura tridimensional de la proteína (estructuras
secundaria, terciaria y cuaternaria) por exposición a agentes físicos y/o
químicos.
Dependiendo del grado de desnaturalización, la molécula puede
perder parcial o totalmente su actividad biológica.
Ejemplos:
Queratinas
Colágeno
Elastina
Fibroína
Queratinas
α-QUERATINA: proteína fibrosa estructural.
Dímero enrollado
Protofilamento superenrollado:
Colágeno
Función: Glucoproteína fibrosa estructural del tejido conjuntivo.
Interacciones de
Van der Waals
Abundante en
glicina, (uno de
cada dos residuos
es glicina)
Proteínas Globulares
1. Forma esférica
4. Múltiples funciones
(catálisis, transporte,
regulación, protección),
excepto la función
estructural
Mioglobina Hemoglobina
(monomérica) (multimérica)
Mioglobina
Hemoproteína globular monomérica
Función: Almacena oxígeno en las mitocondrias del
músculo esquelético y cardíaco.
Carboxilo terminal
Amino terminal
Hemoglobina
Hemoproteína polimérica de los eritrocitos
Función: Transporte del oxígeno desde los pulmones hacia los tejidos y del
CO2 y protones desde los tejidos hacia los pulmones para ser
excretados.
Ubicación: Eritrocitos.
Estructura primaria: rica en todos los aminoácidos
Estructura secundaria: 8 alfa hélices (75%).
Estructura terciaria: globular, superficie polar e interior no polar, excepto las 2
histidinas cercanas al grupo hemo. Un grupo hemo en el
centro de cada monómero.
Estructura cuaternaria: tetrámero, 2 cadenas alfa (141 aa) y dos cadenas beta
(146 aa) Fija 4 moléculas de oxígeno (una por cada
Hemo).
Efecto cooperativo: La oxigenación de 1 cadena altera la conformación de la
segunda cadena favoreciendo su oxigenación y así
sucesivamente.
Estructura del grupo hemo
Consta de un anillo de
porfirina, formado por
cuatro pirroles, con un
átomo de Fe+2 en el
centro.
Imagen ampliada del bolsillo del
grupo hemo
Fibrinógeno
Funciones:
a) Ayuda a mantener la presión osmótica de la sangre.
b) Transporta ácidos grasos libres, algunas hormonas esteroideas
por la sangre, bilirrubina y una porción del triptófano plasmático y
una gran variedad de fármacos (aspirina, penicilina G,
sulfonamidas, etc).
c) Fija el calcio (50%) en la sangre y alrededor del 10% de cobre.
Estructura primaria: rica en aminoácidos proteicos.
Estructura secundaria: Predominantemente láminas beta antiparalela.
Globulinas
Proteínas plasmáticas globulares complejas.
Lugar de síntesis: hígado.
Clasificación:
• Alfa-1: lipoproteína de alta densidad (HDL:transporta colesterol)
• Alfa-2: Haptoglobulina, ceruloplasmina (transporte plasmático
de cobre).
• Pre-beta: lipoproteína de muy baja densidad (VLDL:transporte
de triglicéridos).
• Beta-1: Transferrina(transporte plasmático de hierro),
lipoproteína de baja densidad (LDL: transporte de colesterol).
• Gamma: anticuerpos
Inmunoglobulinas plasmáticas
(gamma globulinas)
Glucoproteínas de por lo menos 4 cadenas.
Dominio
variable
Dominio
constante
Tipos de Inmunoglobulinas
El tipo de cadena H determina la clase de la inmunoglobulina.
A 66 KD
B 52 KD
46 KD
Cadena polipeptídica
Fibrinopéptido A
Fibrinopéptido B
Puente disulfuro
Lugar de corte de la Trombina
Actina
Polímero de doble hélice (actina F) de una proteína
globular (actina G)
Sitios de unión:
1. Con el ATP por un monómero de actina G,
conduciendo a la polimerización, hidrolizándose el
ATP.
2. Con la miosina en cada subunidad.
Cola fibrosa
Nucleótidos
Compuestos nitrogenados orgánicos,
formados por una base heterocíclica
aromática, un monosacárido y por lo menos
un ácido fosfórico.
Adenina
(Base aromática nitrogenada)
Ribosa
(Azúcar C5)
Grupos fosfatos
Anillos de Purina y pirimidina
C C
6 N 4
N 1 5 C 7
N 3 5 C
8 C
2 4 9 2 6
C 3 C C 1 C
N
N N
Purina Pirimidina
Bases Nitrogenadas
• Púricas
NH2 O
Adenina Guanina
C N C N
N C HN C
CH CH
HC C C C
N N H2N N N
H H
• Pirimidínicas:
O NH 2 O
C C C CH3
HN
N C
CH N C
CH HN C
C C
CH C C C C
CH
O N O N O N
Uracilo Citosina Timina
O
Bases nitrogenadas
CH3
H3C C N
N C
CH Café
C C Cafeína (1, 3, 7- trimetil-xantina)
O N N
O
CH3
H3C C N
N C
Té CH
Teofilina (1, 7- dimetil-xantina) C C
O N N
O H
CH3 CH3
C N
HN C
CH Cacao
C C
O N N Teobromina (3, 7- dimeti-xantina)
CH3
Bases nitrogenadas poco comunes
NH 2 NH 2
C CH3 C CH2OH
N C N C
C C C C
O N O N
H 5-metil-citosina
H
5-hidroximetil-citosina
H3C CH3
N
O
CH3
C N C
N C N
HN C
CH
CH
HC C
N C C
N N
H2N N
H
Dimeti-Adenina 7-metil-guanina
Conformaciones syn y anti
syn-Adenosina anti-Adenosina
Fórmula de la Base Nombre de la Base Nombre del Nombre del
nitrogenada nitrogenada nucleósido nucleótido
NH2
C
N C
N
Adenosina 5’
CH Adenina Adenosina monofosfato AMP
HC C
N N
H
O
C N
HN C Guanosina 5’
CH Guanina Guanosina monofosfato GMP
C C
H2N N N
H
HN
N
C
C
CH Uracilo Uridina Uridina 5’
monofosfato UMP
C C
CH
O N
NH 2
C Citidina 5’
N C
CH Citosina Citidina monofosfato CMP
C C
O N
C CH3 Timidina 5’
HN C Timina Timidina monofosfato TMP
C C
CH
O N
1. Nucleósidos: 2. Nucleótidos:
Adenosina 5’ monofosfato
Adenosina AMP
Funciones:
• Principal transductor energético.
• Precursor de coenzimas.
• El AMP es componente de los
Adenosina 5’ trifosfato
ATP ácidos nucleicos.
Hidrólisis del ATP para producir energía
Principal
transductor de
energía
Producto y
Sustrato en la
fosforilación oxidativa
Derivados del AMP
Coenzima R R’ R” n
S-Adonosil-
metionina Metionina* H H 0
Adenilatos de Aminoácido
aminoácidos H H 1
3’ 5’ AMPcíclico H H PO3-2
NAD+ H H 2
NADP+ PO3-2 H 2
FAD+ H H 2
CoA~SH H PO3-2 2
Funciones:
• Succinil CoA Succinato (ciclo
Krebs)
• Regulador y fuente de energía para
la síntesis de proteínas.
Guanosina 5’ Trifosfato • El GMP es componente de los
GTP ácidos nucleicos.
Segundos mensajeros
AMPc GMPc
Funciones:
• Interviene en la síntesis de
fosfoglicéridos.
• El CMP es componente de
los ácidos nucleicos.
Citidina 5’ Trifosfato
CTP
Funciones:
• Intervienen en el metabolismo
de los glúcidos.
• Interviene en reacciones de
conjugación del ácido
glucurónico.
• El UMP es componente del
Uridina 5’ Trifosfato ARN.
UTP
Timidina Timidina 5’ Trifosfato
TTP
Función:
• El TMP es componente del ADN.
ACIDOS NUCLEICOS
Polímeros de nucleótidos monofosfatos púricos y pirimidínicos, unidos
por enlaces fosfodiester.
ribosa Desoxirribosa
ARN ADN
Ácido ribonucleico Ácido desoxirribonucleico
Comparación entre el ADN y el ARN
ACIDO DESOXIRRIBONUCLEICO
(DNA)
5´
3´
3´ 5´
ADN circular
Apareamiento de bases en el ADN
Definición:
3. Según su Función
Trasferencias de hidrógenos
Trasferencias de grupos diferentes al hidrógeno
Vitaminas
• Liposolubles:
Solubles en solventes orgánicos, se acumulan en el
tejido adiposo, produciendo intoxicación.
Vitaminas A, D, E y K.
• Hidrosolubles:
Coenzima Q
Tetrahidrobiopterina
Ácido Lipoico
Nucleótidos
Adenosilmetionina
Citocromos
Coenzimas relacionadas con los Nucleótidos
FAD y FMN
NAD+ y NADP+
Coenzima A
Metilcobalamina
Pirofosfato de tiamina
Fosfato de piridoxal
Biotina
Ácido fólico
Ácido ascórbico
Coenzima Q
Ácido lipoico
Tetrahidrobiopterina
Citocromos
Coenzimas que trasfieren hidrógenos
FAD y FMN
NAD+ y NADP+
Ácido ascórbico
Coenzima Q
Tetrahidrobiopterina
Ácido lipoico
Citocromos
Coenzimas que trasfieren grupos diferentes al hidrógeno
Grupo Coenzima
Aldehído Pirofosfato de Tiamina
Enfermedad carencial:
apetito, crecimiento, queilosis, dermatitis seborreica, conjuntivitis,
ataxia, diarrea.
FLAVIN MONONUCLEÓTIDO (FMN)
Anillo de isoaloxacina
Riboflavina
Ribitol
Fosfato
¯
FLAVIN ADENINA DINONUCLEÓTIDO (FAD)
Precursor vitamínico: Riboflavina (B2)
Fuentes: vísceras, carne, leche, huevos, levaduras, verduras
Composición: Isoaloxacina + Ribitol + pirofosfato + ribosa + adenina
Sitio activo: N1 y N5 de Isoaloxacina
Función: Reacciones de oxidorreducción
Riboflavina
FMN
AMP
NICOTINAMIDA ADENINA DINUCLEÓTIDO (NAD+)
Precursor vitamínico: Niacina (B3) (PP)
Fuentes: vísceras, carne, levaduras, verduras, cereales
Composición: Nicotinamida + ribosa + pirofosfato + ribosa +
adenina
Sitio activo: C4 de nicotinamida
Función: NAD+ + SH2 NADH + H+ + S
Ejemplos: 1) Piruvato y cetoglutarato DHasa
FADH2 + NAD+ FAD + NADH + H+
2) Oxidación de los ácidos grasos
3) Malato DHasa
Enfermedad carencial:
apetito, crecimiento, lengua negra (perro), perosis (aves),
ataxia, pelagra (dermatitis, diarrea, demencia).
NICOTINAMIDA ADENINA DINUCLEÓTIDO (NAD+)
Nicotinamida
D-Ribosa
Pirofosfato
Adenina
D-Ribosa
NICOTINAMIDA ADENINA DINUCLEÓTIDO FOSFATO
(NADP+)
Precursor vitamínico: Niacina (B3) (PP)
Enfermedad carencial:
apetito, crecimiento, lengua negra (perro), ataxia, pelagra
(dermatitis, diarrea, demencia)
NICOTINAMIDA ADENINA DINUCLEÓTIDO FOSFATO
(NADP+)
Nicotinamida
Pirofosfato
D-Ribosa
Adenina
D-Ribosa
Fosfato
ÁCIDO ASCÓRBICO
Precursor vitamínico: Vitamina C
Fuentes: frutas (cítricos), hortalizas
Composición: ácido ascórbico
Sitio activo: C2 y C3
Función: ác. ascórbico + S ác. deshidroascórbico + SH2
Ejemplos: 1) Síntesis de colágeno (hidroxilación de prolina)
2) Síntesis de adrenalina
3) Catabolismo de la tirosina
4) Síntesis de ácidos biliares
5) Antioxidante
6) absorción del hierro
Enfermedad carencial: Escorbuto
ÁCIDO ASCÓRBICO
UBIQUINONA (Coenzima Q)
Función:
Ubiquinona + H semiquinona + H+ ubiquinol
Sitio activo: N3 y N5
Ejemplos:
Complejo de la Piruvato y de la cetoglutarato Dhasa:
Ác. dihidrolipoico + FAD Ác. Lipoico + FADH2
Enzima: dihidrolipoil deshidrogenasa
ÁCIDO DIHIDROLIPOICO
CH2 O
H2C CH – CH2 – CH2 – CH2 – CH2 – C
OH
S S
CITOCROMOS
Composición: Anillo tetrapirrólico + Fe (HEM)
Enfermedad carencial:
beriberi (humano), polineuritis en aves, enfermedad de
Chastek (tiaminasa: pescado crudo)(sistema nervioso y
cardiovascular).
PIROFOSFATO DE TIAMINA
Anillo de
tiazol
Tiamina Pirofosfato
ÁCIDO DIHIDROLIPOICO
Ejemplos:
Complejo de la Piruvato y de la cetoglutarato Dhasa:
Ác. dihidrolipoico + CH3-CO~E Ác. S-acetil-Lipoico + E
Enzima: dihidrolipoil transacetilasa
ÁCIDO DIHIDROLIPOICO
CH2 O
H2C CH – CH2 – CH2 – CH2 – CH2 – C
OH
S S
COENZIMA A
Precursor vitamínico: Ácido pantoténico (B5)
Enfermedad carencial:
Síndrome del pie ardiente, lesiones cutáneas (aves),
parestesia (adormecimiento de manos y pies), paso de parada
(cerdos)
COENZIMA A
ADP con un fosfato 3’
4-Fosfopanteteína
Grupo reactivo
HS
Ejemplos: 1) Transaminación
2) Descarboxilación.
Metabolismo de 3) Treonina glicina
aminoácidos:
4) Glutamato GABA (Glutamato Descarboxilasa)
5) Triptófano ácido nicotínico
Enfermedad carencial:
Rara: alcohólicos, lactantes de madres que consumen
anticonceptivos, isoniacida (antituberculoso).
Pérdida de peso, dermatitis, diarrea, ataxia, convulsiones (GABA)
FOSFATO DE PIRIDOXAL
O
O
¯O–C–N NH
Dieta con
Dieta con clara de huevo
clara de huevo cocida
crudo
(avidina)
Post-suplementación con
biotina: engrosamiento y
endurecimiento de las
paredes
Deficiencia de biotina en rata
Después de 3
meses de
tratamiento
TETRAHIDROFOLATO
Precursor vitamínico: Ácido fólico (pteroilglutamato) (B9)
Fuentes: vísceras, leche, carne, levaduras, cereales,
verduras (hojas)
Composición: pteridina + paraminobenzoato + glutamato (n)
Sitio activo: N5, N10 de la pteridina
Función: Transferir grupos de 1 C (metabolismo de aa,
purinas y ácidos nucleicos (división celular)
Ejemplos: 1) Propionil CoA metilmalonil CoA
2) UDP TDP (timidilato sintetasa)
3) Síntesis de purinas
Enfermedad carencial:
anemia megaloblástica (macrocítica), espina bífida, dermatitis,
parálisis, debilidad, irritabilidad.
Tetrahidrofolato (H4 folato)
- aminobenzoato
6-metil-pteridina Glutamato
METILCOBALAMINA
Precursor vitamínico: Cobalamina (B12)
Fuentes: vísceras, huevos, microorganismos intestinales
Composición: Nucleótido + anillo de corrina (cobalto) + R
R= desoxiadenosina, metilo, OH, CN.
Enfermedad carencial:
Ausencia del factor intrínseco de Castle (gastrectomía),
Anemia perniciosa (megaloblástica), insomnio, Demencia
crónica irreversible
COBALAMINA (B12)
CN B12a (cianocobalamina)
R OH B12b (hidroxicobalamina)
Adenosilmetionina:
Donador de grupos metilo
NUCLEÓTIDOS DE GUANINA
Yema de
Carboxi- huevo N1 del Carboxilación del piruvato y Perosis,
B8 Visceras, imidazol
biotina Carboxilo acetil CoA Despigmen-
carne, tación
levaduras,
cereal
Visceras, N5 y N10 Interconversión glicina- Anemia
H4folato leche, de 1C de la serina megalo-
Bc verduras,
pteridina Síntesis de d-TDP blástica
cereales
Visceras, Metilmalomil CoA
Metil huevos, Metilo El R CH3 Succinil CoA Anemia
cobalamina B12 síntesis Homocisteína perniciosa
bacteriana Metionina
COENZIMAS QUE TRANSFIEREN GRUPOS DIFERENTES AL HIDRÓGENO
PROTEINAS PURAS:
• HOLOENZIMAS:
Una parte proteica (Apoenzima)
SITIO ACTIVO:
SITIO ALOSTÉRICO:
Contenido en los enzimas regulatorios, en donde se fijan efectores o
inhibidores alostéricos, que provocan un cambio conformacional en el
sitio de unión al sustrato o en el sitio catalítico, regulando la actividad
enzimática.
Sitio activo de una enzima
Sustrato: H2O2
Sitio Activo
Sustrato
Sitio Activo
Especificidad de sustrato
Absoluta
Relativa
Especificidad de acción
Absoluta
Especificidad de Sustrato
Cuando están presentes diferentes moléculas de sustrato,
únicamente aquella que tenga la forma específica y
complementaria al sitio activo de la enzima será capaz de
ocupar el sitio activo.
Sustrato
Sitio
Activo
Especificidad Absoluta
DE GRUPO: alcohol, enlace peptídico, enlace éster.
Conformación del
estado de transición
1. ÓXIDOREDUCTASAS
2. TRANSFERASAS
3. HIDROLASAS
4. LIASAS
5. ISOMERASAS
6. LIGASAS
Clasificación de las enzimas de acuerdo a la
Unión Internacional de Bioquímica (UIB)
Clase I. Oxidorreductasas:
Catalizan reacciones de oxido-reducción al adicionar o
sustraer hidrógeno.
NAD+ NADH H+
O O
CH3– CH – CH2 – C – OH CH3– C – CH2 – C – OH
OH O
COOH COOH
COOH NH2– CH COOH O=C
O=C + CH2 NH2 – CH + CH2
CH3 CH2 CH3 CH2
COOH COOH
COOH COOH
NH2– CH NH2– CH
+ HOH + H – NH2
CH2 CH2
CH2 CH2
O = C – NH2 COOH
COOH H
O=C O=C + CO2
CH3 CH3
Clase V. Isomerasas:
Catalizan varios tipos de reacciones en las que hay un
reordenamiento intramolecular.
O O
HO – C C – OH
C–H H–C
H–C H–C
C – OH C – OH
O O
ATP ADP Pi
H O H O H O H H O
H2N – C – C – OH + H2N – C – C – OH H2N – C – C – N – C – C – OH
H CH3 H CH3
HOH
Efectos electrostáticos
La distribución de carga en el sitio activo por lo general
anhídrido puede influir sobre la reactividad química del
sustrato, haciendo su unión más eficaz, lo cual disminuye la
energía libre del estado de transición lo que provoca un
aumento en la velocidad de la reacción.
Factores que intervienen en la catálisis enzimática
Catálisis ácido-básica
Catálisis covalente
¿CÓMO LO HACEN?
Sin cat.
4
5
1 Cat
2. Debe alcanzar un nivel energético más alto que se corresponde con el valor
del estado de transición.
Catálisis covalente:
Ocurre en aquellas reacciones en donde el sustrato o parte de él forma
un enlace covalente con la enzima. La reacción se ejecuta en dos
etapas:
E + A-X → E-X + A
E-X + B → B-X + E
Cinética enzimática:
Es el estudio cuantitativo de la catálisis enzimática, proporciona
información sobre las velocidades de reacción y la afinidad de las
enzimas por los sustratos e inhibidores.
Entre las aplicaciones prácticas de este estudio, están la mejor
comprensión de las fuerzas que regulan las rutas metabólicas y el
diseño de tratamientos mas adecuados.
Unidades de medida de la actividad enzimática
Katal:
Moles de sustrato transformado por segundo
Actividad Específica:
Micromoles de sustrato transformado por minuto por
miligramo de proteína
UI/miligramo de proteína (medida de la pureza de la enzima)
Efecto de la concentración de enzima
sobre la velocidad de la reacción
Velocidad, V
Vmáx
Velocidad, V
0 10 20 30 40 50
Temp. ºC
Temp. óptima
Efecto del pH sobre la velocidad de la
reacción
Vmáx
Velocidad, V
Enzima:
Pepsina
Quimotripsina
0 2 4 6 8 10 12
pH óptimo pH óptimo pH
Efecto del pH sobre la velocidad
de la reacción
Sustrato
Enzima
Pendiente
Tipos de inhibidores de las enzimas
Inhibidores irreversibles: se unen covalentemente a la enzima.
b) No competitivos:
Se unen a la enzima por un sitio diferente al que lo hace el
sustrato, por lo que puede unirse tanto a la enzima libre,
como al complejo E-S. No afecta la afinidad de la enzima por
el sustrato.
c) Acompetitivos:
Se unen al complejo E-S formando un complejo ternario ESI
catalíticamente inactivo. Aumentan la afinidad de la enzima
por el sustrato.
Inhibidor competitivo
Sustrato
Sitio activo de la
enzima
Inhibidor
Sustrato e inhibidor
pueden unirse al
lugar activo
Inhibidor impide la
unión del sustrato
Productos
Inhibidor competitivo
E+S ES P+E
+
I
Vmax/2
1/Vmax
Inhibidor
Productos
Sustrato unido al
lugar activo
EI + S EIS
V 1/V Con inhibidor
Vmax no competitivo
Sin inhibidor
Vmaxi
Con inhibidor Sin inhibidor
no competitivo
Vmax/2
1/Vmaxi
Vmaxi /2
1/Vmax
EIS
V 1/V
Vmax
Con inhibidor
Sin inhibidor acompetitivo
Vmaxi
Con inhibidor
Vmax/2
Vmaxi /2 1/Vmaxi
1/Vmax
1/S (1/mM)
Kmi Km S (mM) -1/Kmi -1/Km
Características de las enzimas alostéricas
Estado T Estado R
b) Modelo secuencial
Estado T Estado R
Cinética de las enzimas alostéricas
Control enzimático
Los seres vivos han producido mecanismos sofisticados para regular
las rutas bioquímicas a través del control enzimático.
No existe un mecanismo único de control, pero la regulación enzimática
desempeña un papel fundamental en el control de todos los procesos
metabólicos.
2. Conservación de la energía:
Las reacciones que generan energía solo son activadas para
satisfacer los requerimientos energéticos de las células.
Control enzimático
A. Regulando el número de moléculas de enzimas
1. Inducción - Represión de la síntesis enzimática.
2. Degradación de las enzimas.
2. Regulación alostérica.
- Homoalosterismo.
- Heteroalosterismo.
3. Modificación covalente.
- Zimógenos o proenzimas
- Fosforilación y desfosforilación
Control por regulación del número de moléculas de enzimas
Ejemplo:
Bacterias que han crecido en un medio con ausencia del
disacárido lactosa inicialmente no pueden metabolizar este
azúcar cuando es introducido al medio de cultivo de la
bacteria. Luego de la introducción de la lactosa se activan los
genes que codifican las enzimas necesarias para utilizar la
lactosa como fuente de energía
ENZIMA
Síntesis Degradación
Precursores
(aminoácidos)
Control por regulación de la eficiencia catalítica de las enzimas
• Compartimentación:
Consiste en la separación espacial de enzimas, sustratos y moléculas
reguladoras en diferentes regiones o compartimentos celulares,
permitiéndole a la célula usar de forma eficaz recursos relativamente
escasos.
• Asociaciones multienzimáticas:
Son organizaciones de varias enzimas que participan en una misma vía
metabólica en asociaciones que pueden ser de naturaleza diversa, con
el fin de lograr sistemas de máximo rendimiento energético. Los tipos
de asociaciones son:
2. Regulación Alostérica:
3. Modificación covalente:
Zimógenos o proenzimas: Algunas enzimas se sintetizan en una
forma catalíticamente inactiva, llamada proenzima o zimógeno.
Para pasar a la forma activa la proenzima debe sufrir una
proteólisis parcial, en la que pierde un fragmento de su molécula y
varía su conformación, de tal manera que se organiza su sitio
catalítico.
Modificació
Modificación covalente reversible:
reversible: algunas enzimas se regulan por
la interconversió
interconversión reversible entre sus formas activa e inactiva.
Estos cambios son producidos por diversas modificaciones
covalentes. La actividad de estas enzimas puede ser controlada
por la unió
unión reversible de grupos fosforilo (en mamí
mamíferos) o de
nucleó
nucleótidos (en bacterias) en residuos especí
específicos de serina y
treonina.
treonina.
Marcadores cardíacos
Marcadores diversos
Fosfatasa alcalina (ALP) Su concentración en suero aumenta en la
osteoporósis, raquitismo y osteomalacia por deficiencia de vit D y en la
mestátasis ósea por cáncer de próstata, pulmonar o glándula mamaria, también
se encuentra elevada en las fracturas .