Shotgun Sequencing (Secuenciacion Escopeta)

En la gentica la secuenciacin escopeta es tambin conocida como clonacin

escopeta este mtodo es utilizados para grandes fragmentos de ADN hebras
se llama as por su analoga de amplia expansin , el patrn de disparo cuasi
aleatoria de una escopeta.
Dado que el mtodo de terminacin de cadena de secuenciacin de ADN slo puede ser utilizado
para hebras bastante cortos (de 100 a 1000 pares de bases), secuencias ms largas deben ser
subdivididos en fragmentos ms pequeos, y posteriormente re-ensamblados para dar la
secuencia global.

: paseo cromosmico , que progresa a travs de toda la cadena, pieza por pieza, y la secuenciacin
escopeta, que es un proceso ms rpido, pero ms compleja, y utiliza fragmentos aleatorios.

 Secuenciacin escopeta era una de las tecnologas precursoras que era responsable de
permitir la secuenciacin del genoma completo. El secuencimiento shotgun
proporciona datos de secuencia rpidamente, pero la tarea de ensamblar los
fragmentos puede ser bastante complicada para genomas muy grandes. En el caso del
Proyecto Genoma Humano, llev varios meses de tiempo de procesador (en una
estacin DEC Alpha de alrededor del 2000) para ensamblar los fragmentos. El shotgun
sequencing es el mtodo de eleccin para todos los genomas secuenciados hoy en da
y los algoritmos de ensamblado genmico son un rea crtica de la investigacin en
bioinformtica.

Ensamblado