EXERCCIOS TURMA: NOME:

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ESTRUTURA DOS CIDOS NUCLEICOS
1) Quais so as diferenas de composio e estrutura entre RNA e DNA? Escreva os nomes das bases,
ribonucleosdeos, desoxirribonucleosdeos, ribonucleotdeos e desoxirribonucleotdeos do DNA e RNA.
Resposta:
Composi o
DNA RNA
Nucleosdeo Nucleotdeo Nucleosdeo Nucleotdeo
Pentose Desoxirribose Desoxirribose Ribose Ribose
Bases pricas
Adenina Desoxiadenosina Desoxiadenilato Adenosina Adenilato
Guanina Desoxiguanosina Desoxiguanilato Guanosina Guanilato
Bases
pirimdicas
Citosina Desoxicitidina Desoxicitidilato Citidina Citidilato
Timina Timidina ou
desoxitimidina
Timidilato ou
desoxitimidilato

Uracila Uridina Uridilato
2) O que se entende por orientao anti-paralela das fitas de DNA?
Resposta: Significa que as duas cadeias polinucleotdicas de uma mesma molcula de DNA so invertidas uma em
relao outra, isto , se em uma extremidade de uma delas se encontrar o radical fosfato (que ocupa a posio 5 do
nucleotdeo), na mesma extremidade da outra fita ser encontrado o radical hidroxila (da posio 3).
3) Num organismo diploide um pesquisador verificou que uma molcula de DNA continha 22% de guanina. Com base
nesta informao determine qual o percentual de cada uma das outras bases.
Resposta: %Guanina=%Citosina G =22%; C =22% (44% G +C). Assim, 100 44 =56% para A +T.
Como %Adenina=%Timina, teremos T =28%; A =28%.
4) Se o contedo de AT em uma molcula de DNA de 36%, quais so os contedos de todas as bases?
Resposta: A+T=36%. Como %Adenina=%Timina, teremos: A =18%; T =18%. Assim, 100 36 =64% para G +C.
%Guanina=%Citosina G =32%; C =32%.
5) Um vrus, cujo material consiste de uma fita de RNA, tem aproximadamente 22% de seus RNA nucleotdeos
consistindo de uracila. E possvel determinar o contedo de adenina? J ustifique.
Resposta: No h como determinar, uma vez que o RNA viral de fita simples, no sendo as bases pareadas.
6) Escreva a sequncia de bases da fita complementar do DNA dupla fita que apresenta uma fita com a sequncia:
(5') ATGCCGTATGCATTGCATTC (3')
(3') TACGGCATACGTAACGTAAG (5')
Exprima, em porcentagem, a composio de bases do DNA de fita dupla.
Resposta: Total de bases das 2 fitas =40
Ento, 40 =100%. Aplicando a regra de 3, teremos:
%Adenina=%Timina
40 100% X= 27,5% de cada
11 X
%Guanina=%Citosina
40 100% X= 22,5% de cada
9 X
7) Uma molcula de cido nucleico tem a seguinte composio de bases: C=24,1%; G=18,5%; T=24,6% e A=32,8%.
O que se pode afirmar sobre a natureza desta molcula? J ustifique para validar a questo.
Resposta: uma molcula de DNA fita simples. Como tem timina, DNA; porm no DNA fita dupla as quantidades de
guanina e citosina e de adenina e timina so iguais.
8) RNA facilmente hidrolizado por lcali, enquanto DNA no o . Por qu?
Resposta: O grupamento 2 hidroxila do acar (ribose) do RNA est diretamente envolvido neste processo, pois os
grupamentos hidroxila so os primeiros a serem rapidamente hidrolisados pela ao de um lcali, produzindo uma
mistura de nucleosdeos 2 e 3 monofosfatos. Como o DNA no possui o grupamento 2 hidroxila (desoxirribose), no
facilmente hidrolisado em condies alcalinas, o que torna o esqueleto do DNA mais estvel quando comparado ao
RNA.
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9) O valor de Tm para o DNA pode ser calculado usando-se a frmula: Tm =69,3 +0,41 (%GC), onde GC a
porcentagem de Guanina +Citosina. Sobre o tema e assuntos correlatos, responda:
a) O que Tm? Qual o seu significado?
Resposta: Tm=temperatura de fuso (melting) ou desnaturao, ou seja, a temperatura na qual 50% da dupla fita do
DNA encontra-se desnaturada em fita simples.
b) DNA de E. coli contm 50% GC. Calcular o Tm para o DNA desta bactria.
Resposta: Tm
(E.coli)
=69,3 +0,41 (GC%) =69,3 +0,41 (50) =69,3 +20,5 =89,8C
c) As curvas de fuso da maioria dos DNAs que ocorrem naturalmente revelam que o Tm normalmente maior do
que 65
o
C. Por que isto importante para a maioria dos organismos?
Resposta: Visto que a estabilidade da dupla hlice resulta em parte do grande nmero de pontes de hidrognio entre
os pares de bases, o valor de Tm indica a estabilidade da dupla fita do DNA. Como Tm a temperatura necessria
para desnaturar 50% da fita dupla do DNA e isto ocorre pelo rompimento das pontes de hidrognio, isto indica que o
DNA da maioria dos organismos se mantm estvel a temperaturas superiores a 65C, o que muito importante pois,
exceto em alguns vrus, o DNA contm os genes, responsveis pelo comando da atividade celular e pelas
caractersticas hereditrias.
d) Explique por que o DNA desnaturado quando submetido a altas temperaturas ou pHs extremos. Como estas
molculas podem ser renaturadas?
Resposta: As duas fitas da dupla hlice do DNA podem ser reversivelmente separadas por altas temperaturas ou por
exposio a pH elevado (pH13). Isto porque ocorre ruptura das pontes de hidrognio entre os pares de bases. Esse
processo denominado desnaturao. Durante a desnaturao nenhuma ligao covalente desfeita, ficando,
portanto, as duas fitas de DNA separadas. Quando o pH e a temperatura voltam ao normal, as duas fitas de DNA
espontaneamente se hibridizam, formando novamente o DNA dupla fita, o que chamamos de renaturao. Este
processo envolve duas etapas: a primeira mais lenta pois envolve o encontro casual das fitas complementares de
DNA, formando um curto segmento de dupla hlice. A segunda etapa mais rpida e envolve a formao das pontes
de hidrognio entre as bases complementares reconstruindo a conformao tridimensional.
Lembrete: os agentes desnaturantes tm maior facilidade em romper as duas pontes de hidrognio que ligam as
bases A e T, do que as trs pontes de hidrognio que ligam as bases C e G. Portanto, so necessrias temperaturas
mais elevadas, pH mais alcalino e maiores concentraes de agentes desnaturantes para romper as bases C e G, do
que as bases A e T.
10) Abaixo so apresentadas duas sequncias de DNA que flanqueiam o gene humano da eritropoetina (EPO),
hormnio secretado pelos rins e essencial para a diferenciao terminal dos glbulos vermelhos do sangue na medula
ssea.
(A)
(5') GTCCATTGTGCAGGACACAC (3')
(B)
(5') ATCCTTTGAGCCCAGGAGTT (3')
a) Escreva a sequncia de bases da fita complementar do DNA dupla fita das sequncias apresentadas em (A) e (B).
(A)
(3') CAGGTAACACGTCCTGTGTG (5')
(B)
(3') TAGGAAACTCGGGTCCTCAA(5')
b) Exprima, em porcentagem, a composio de bases do DNA dupla fita de (A) e (B). Demonstre seus clculos para
validar o item.
(A)
Total de bases =40 (100%)
%Adenina=%Timina
40 100%
9 X X= 22,5% de cada
%Guanina=%Citosina
40 100%
11 X X= 27,5% de cada
(B)
Total de bases =40 (100%)
%Adenina=%Timina
40 100%
10 X X= 25% de cada
%Guanina=%Citosina
40 100%
10 X X= 25% de cada
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c) Sabendo-se que o valor de Tm de (A) de 91,85 e de (B) de 89,8, qual das duas sequncias mais estvel? Por
qu? Considere na sua resposta o significado de Tm.
Resposta: A sequncia (A) mais estvel. Visto que Tm a temperatura necessria para desnaturar 50% da fita
dupla do DNA e isto ocorre pelo rompimento das pontes de hidrognio, o valor de Tm indica a estabilidade da dupla
fita do DNA. Como so necessrias temperaturas mais elevadas para romper as 3 pontes de hidrognio entre as
bases C e G, do que as 2 pontes de hidrognio entre as bases A e T, e a sequncia (A) tem maior porcentagem de
CG, ela mais estvel.
11) Em relao estrutura dos cidos nucleicos, responda ao que se pede:
a) Escreva as polaridades e as sequncias de bases das fitas complementares dos DNAs dupla fita que apresentam
fitas com as sequncias especificadas em (A) e (B).
(A)
5' ATGCCGTATGCATTGCATTC 3'
3' TACGGCATACGTAACGTAAG 5'
(B)
5 TGAAGGAGAAGGTGTCTGCGGGA 3
3' ACTTCCTCTTCCACAGACGCCCT 5'
b) Calcule o valor de Tm do DNA dupla fita de (A) e (B). Demonstre seus clculos para validar o item.
Resposta: Tm =69,3 +0,41 (%GC), onde GC a porcentagem de Guanina +Citosina. Assim, teremos:
(A)
Total de bases do DNA=40
CG =18
40 100% x=45%
18 x
Tm =69,3 +0,41(45) =87,75C
(B)
Total de bases do DNA=46
CG =26
46 100% x=56,52%
26 x
Tm =69,3 +0,41(56,52) =92,47C
c) A partir dos valores de Tm calculados no itemb, responda: Qual das duas sequncias mais estvel? Por qu?
Considere na sua resposta o significado de Tm.
Resposta: A sequncia (B) mais estvel. Visto que Tm a temperatura necessria para desnaturar 50% da fita
dupla do DNA e isto ocorre pelo rompimento das pontes de hidrognio, o valor de Tm indica a estabilidade da dupla
fita do DNA. Como so necessrias temperaturas mais elevadas para romper as 3 pontes de hidrognio entre as
bases C e G, do que as 2 pontes de hidrognio entre as bases A e T, e a sequncia (B) tem maior porcentagem de
CG, ela mais estvel.