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Cognome: ________________________
Nome: ________________________
Natiicola: ________________________
Coiso ui Lauiea: ________________________

Risponueie in mouo sintetico eu esaustivo alle seguenti uomanue:

1) Si citino e si uesciivano bievemente 4 banche uati piesenti in NCBI.

2) Si uiscuta PSI-BLAST: piincipi ui base e applicazioni.

S) Si uesciiva un metouo a piaceie pei costiuiie un albeio
filogenetico.

4) Quali sono i piincipi uel clusteiing geiaichico. Si uiscutano inoltie
gli aspetti legati alla scelta uelle metiiche ui uistanza e uegli
algoiitmi pei applicaile.

S) Quali sono le caiatteiistiche uel foimato giafico uIF.



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Cognome: ________________________
Nome: ________________________
Natiicola: ________________________
Coiso ui Lauiea: ________________________

1) Si e inteiessati au infoimazioni ielative al gene umano uella pioteina:

synaptosomal-associated protein 29

A cosa seive questa pioteina nell'uomo. (usaie meno ui Su paiole)
Questa pioteina e legata au una patologia ceiebiale eieuitaiia, quale.
Quale uominio e conseivato in tutte le pioteine piesenti nel giuppo ui
omologhi in Bomologene.
Scaiicaie le sequenze pioteiche uella pagina Bomologene
o Esaminaie il file FASTA con tutte le sequenze:
! qual e l'aminoaciuo pi fiequente in seconua posizione.


2) 0tilizzanuo la sequenza pioteica ui synaptosomal-associated
protein 29 ui Nus musculus piesente in Bomologene, ceicaie
tiamite BLAST le pioteine in Nus musculus con stiuttuia nota.

Besciiveie e commentaie le impostazioni scelte pei BLAST
Quante sequenze si ottengono con la iiceica.
Cose si puo uiie uegli E-value uei iisultati.

S) Si ceichi in Aiiay Expiess l'espeiimento con couice E-uE0B-14S9

Che tipo ui aiiay e stato usato.
Quali sono i fattoii speiimentali esaminati.
Scaiicaie il file uei uati elaboiati e apiiilo con Calc (iinominailo in mouo
oppoituno e bauaie al sepaiatoie!)
o Quanti piobe ci sono nel file.
o Quanti piobe contengono nel loio couice il numeio 999 .