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Hay tres categoras del catabolismo de los aminocidos. Los aminocidos son designados glucognicos si pueden ser convertidos a glucosa, cetognicos si pueden ser convertidos a cuerpos cetnicos, y tanto glucognicos como cetognicos si pueden ser convertidos a ambos compuestos. Los aminocidos glucognicos son catalizados a piruvato intermediarios del ciclo de Krebs. Loa aminocidos cetognicos son catalizados a acetil-CoA, acetoacetil-CoA, o ambos, desvindose del piruvato o del intermediarios del ciclo de Krebs. El metabolismo del triptfano, un aminocido que representa casi 2% por peso de todos los aminocidos encontrados en las protenas, incluye ms de 20 reacciones. Por lo tanto el metabolismo del triptfano es ms complejo que la glucolisis o que el ciclo de Krebs.
Familias de aminocidos de C2 y C3
La alanina sufre una reaccin de transaminacin con el -cetoglutarato para formar piruvato y glutamato. La serina sufre deshidratacin seguida de hidrolisis, catalizada por la deshidratacin de serina, una enzima que requiere fosfato de piridoxal para producir piruvato. El metabolismo de la glicina esta ntimamente asociado al tetrahidrofolato la cual reacciona para producir serina. La cistena reacciona con oxigeno para producir sulfinato de cistena, que a su vez sufre transicin isoergnica para producir -sulfinilpiruvato. Este ltimo es sometido a hidrolisis exergnica para producir piruvato y sulfito. El sulfito es oxidado y da por resultado sulfato.
Familia de aminocidos de C5 El glutamato puede ser oxidado para producir -cetoglutarato puede ser convertido a malato y oxalacetato por el ciclo de Krebs. La degradacin de la glutamina empieza con la hidrolisis exergnica al grupo amino para producir glutamato y amonio La arginina sufre una reaccin de hidrolisis exergnica catalizada por la arginasa para formar ornitina y urea. El catabolismo de la prolina empieza con una oxidacin dependiente de flavoproteina para formar 1-pirrolina 5-carboxilato. Se aade agua al derivado y el anillo se abre no enzimticamente para formar glutamato semialdehido este sufre oxidacin dependiente del NAD que incluye agua para formar glutamato. La histidina contiene seis tomos de carbono. Un tomo es transferido a la poza de derivados de tatrahidrofolato de un carbono y los otros cinco son convertidos a glutamato.