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MANUAL DE LABORATORIO
SEMESTRE ENERO – JUNIO 2009
PRÁCTICA AUTORIZACIÓN
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ESCUELA SUPERIOR DE MEDICINA, I.P.N. DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA
ÍNDICE
1 INTRODUCCIÓN AL LABORATORIO 4
2 SOLUCIONES 8
3 ELECTROLITOS Y pH 14
4 SOLUCIONES REGULADORAS 17
5 PROTEÍNAS 21
6 CINÉTICA QUÍMICA Y CATÁLISIS 28
7 CINÉTICA ENZIMÁTICA 35
8 GLÚCIDOS 41
9 OXIDACIONES BIOLÓGICAS 46
10 LÍPIDOS 51
11 ÁCIDOS NUCLEICOS 55
1. INTRODUCCIÓN AL LABORATORIO
DE BIOQUÍMICA MÉDICA I
Se revisan conceptos y procedimientos de importancia para el trabajo en el laboratorio.
El alumno deberá previamente haber leído, entendido, comprendido, estar de acuerdo con,
y sujetarse al reglamento de la Academia de Bioquímica.
b) Rotule cada pieza identificada con una etiqueta de masking tape. Reúna en la charola el
material de nombre y/o empleo desconocidos, o de cuyo estado tenga duda, y pregunte
a su profesor. Espere a que su profesor compruebe que su identificación del material es
correcta.
c) Una vez revisado todo el material, complete los datos solicitados en el vale, (fecha,
grupo, equipo, responsable, etc.) y entréguelo al personal técnico de laboratorio.
EJERCICIO 5b
a) Prepare una serie de 4 tubos de ensayo. Numere los tubos del 1 al 4. Coloque en el
tubo número uno 2.5 mL de agua. En el tubo número dos, 1.25 mL de agua. En tanto
que en el tubo número tres deposite 0.8 mL de agua y en el tubo número cuatro,
deposite 0.6 mL de agua.
b) Utilice para cada tubo de ensayo una pipeta de capacidad adecuada. Repita este
ejercicio hasta que pueda realizarlo con seguridad y precisión.
1. Elabore un esquema que describa este experimento.
EJERCICIO 5c
a) Monte el dispositivo de titulación según indicaciones de su profesor y aprenda a
manejar con soltura y seguridad la llave de su bureta. Familiarícese con el
procedimiento de dejar gotear el líquido de la bureta, en este caso agua, o dejar salir de
la misma cantidades fijas como por ejemplo, de un mL cada vez, de 5 mL cada vez, etc.
Asimismo, deberá aprender a leer con precisión la escala de la bureta.
EJERCICIO 6
a) Prepare una charola de papel usando una hoja de papel limpio, de preferencia
encerado. Esta charola se prepara doblando el papel aproximadamente a un centímetro
de cada borde y colocándolos en ángulo recto para formar una pared en la periferia del
papel. El tamaño de la charola depende de la cantidad de reactivo a pesar.
b) Encienda la balanza y espere a que se estabilice la lectura. Coloque la charola de papel
en el plato de la balanza. Cuando se estabilice, por medio del botón de tarar, tare a
cero la balanza.
c) Abra el recipiente del reactivo y coloque la tapa sobre la mesa, boca arriba, para evitar
la contaminación.
d) Por medio de espátula saque el reactivo del recipiente y colóquelo sobre la charola de
papel. Si se rebasa la cantidad deseada, regrese el exceso de reactivo al respectivo
recipiente usando la espátula. Nunca regrese al recipiente original un reactivo que caiga
fuera de la charola de papel o sobre la mesa.
e) Pese la cantidad de cloruro de sodio que le indique su profesor y colóquela en el sobre
de papel que se le proporciona. Escriba en el sobre el nombre y la cantidad de reactivo
que contiene.
f) Cierre inmediatamente el frasco de reactivo para evitar que se hidrate o contamine.
Asegúrese de que la mesa y la balanza queden limpias.
2. SOLUCIONES
FRACCIÓN MOLAR (Xi). Número de moles de una sustancia en una solución entre la suma de
los moles de todos los componentes de la misma.
PORCENTUAL (%). Expresa el porcentaje de soluto en una solución. Existen diferentes tipos:
DIFUSIÓN, ÓSMOSIS,DIÁLISIS.
Las propiedades dinámicas de las soluciones son: Difusión Simple, y Difusión a través de
membranas (Ósmosis, y Diálisis).
Difusión es el proceso físico químico por el cual las moléculas, ya sea en estado de gas o
líquido, tienden a distribuirse uniformemente por todo el espacio de que disponen formando un
medio homogéneo.
En el caso de los gases, la difusión está sujeta a la “Ley General de la Energía”, la cual
establece que la velocidad con que se mueve una partícula es inversamente proporcional a
la raíz cuadrada de su masa.
En los líquidos la velocidad de difusión es afectada por varios factores. Entre ellos tenemos:
Graham hizo notar estos factores que influyen sobre la difusión y Fick, de acuerdo con los
mismos estableció la siguiente relación:
dm dc
v= = KQ
dt ds
v = velocidad de difusión K = Constante de Difusión dm = cantidad de sustancia que difunde
dt = tiempo que tarda en efectuarse la difusión dc = concentración de la sustancia que difunde.
ds = espacio que recorre la sustancia al difundir.
Así, la velocidad de difusión es directamente proporcional al gradiente de concentración y al
área de sección. A temperatura, gradiente de concentración y área constantes, cada sustancia
tiene una velocidad de difusión característica con relación al peso molecular por lo que se
incluye una constante K llamada constante de difusión.
EXPERIMENTO 2
No existe membrana semipermeable perfecta, pero las
que más se acercan a esto son las de ferrocianuro de cobre y
las de pergamino. Aquí se utilizará una membrana dialítica de
colodión que nos dará una medida aproximada de la presión
osmótica en el dispositivo llamado OSMÓMETRO.
1) Graficar tiempo en las abscisas (eje x) y altura en milímetros en las ordenadas (eje y).
La columna de sacarosa ejercerá finalmente una presión que se opone al paso del agua
(Presión Hidrostática). Calculando ésta, se puede conocer la presión osmótica ya que ambas son
iguales.
Esto se hace mediante la fórmula:
π = hρg
1 Pa
1 atm =
1.013 × 105
1) ¿Cuándo deberá detenerse el proceso osmótico?
2) ¿Depende sólo de la altura la presión osmótica? Explique.
3) ¿Influye el radio del capilar en la presión osmótica? Explique.
4) ¿La sacarosa y el colorante dializan?
DIÁLISIS
EXPERIMENTO 3
Humedezca por inmersión en agua destilada durante 10 minutos la sección del tubo de
colodión o celofán de aproximadamente 6 cm de largo por 2.5 cm de diámetro y cierre un extremo
atándolo con hilo de algodón. Llénelo con una mezcla de 1 mL de solución de NaCl al 2%
preparado en el experimento 1b y 10 mL de solución de almidón al 1%.
Ate cuidadosamente el otro extremo del saco y suspéndalo en un vaso de precipitados con
agua destilada. Se determinará almidón por medio de la prueba del yodo y cloruros con solución
de nitrato de plata en el líquido del vaso de precipitados que rodea al saco, a tiempo cero, a la
hora y a las dos horas.
Prepare dos tubos de ensayo, uno ellos con 2 mL de NaCl al 2% y agréguele 5 gotas de
AgNO3 (nitrato de plata), al otro tubo agréguele 2 mL de solución de almidón al 1% y 2 gotas de
solución de Lugol. Rotúlelos como testigo de cloruros y testigo de almidón respectivamente
Pasado este tiempo repita las dos pruebas en el líquido contenido en el saco.
1) ¿Ha dializado el almidón a través de la membrana?
2) ¿Dializó el cloruro de sodio?
3) Explique este fenómeno.
PREPARACION DE SOLUCIONES
EXPERIMENTO 4
Preparación de una solución 0.5M de ácido acético (CH3-COOH). Prepare 100 mL de
una solución de ácido acético 0.5M tomando como base los siguientes datos: El ácido acético
tiene un peso molecular de 60, la pureza del reactivo es de 99.7% y la densidad a 20°C es de 1.06
g/mL. Una vez preparada consérvela para utilizarla en el experimento siguiente.
1) Describa detalladamente los cálculos que hizo para conocer el volumen de ácido acético
concentrado que utilizó para preparar los 100 mL de dicha solución.
R = _________ mL de CH3-COOH.
% (p/v) =
normalidad =
mmoles/L =
gramos/L =
mEq % =
osmolaridad =
EXPERIMENTO 5
En este experimento se utilizará la solución de ácido acético (solución problema) que se
preparó en el experimento 4.
En un matraz Erlenmeyer de 250 mL se colocan 10 mL de la solución de ácido acético
problema, midiéndolos con la máxima exactitud posible. Añada 2 gotas de fenolftaleína y titule
utilizando solución de NaOH 0.2N. Recuerde que el punto de titulación se observará cuando
persista por más de un minuto un ligero color rosa.
2) De acuerdo con los resultados que obtuvo y considerando que la solución de NaOH es
exactamente 0.2N. ¿Cuál es la verdadera normalidad del ácido acético problema?
R = _________ N.
3. ELECTROLITOS y pH
ELECTROLITOS
C
uando una corriente eléctrica circula por una solución acuosa de cloruro de sodio (NaCl),
hay una transferencia de materia, la cual consiste en partículas con carga llamadas iones.
Los iones que se mueven hacia el ánodo (polo positivo) son los aniones, los que migran
hacia el cátodo (polo negativo) son los cationes y hay liberación de hidrógeno y cloro, evidencia
de la descomposición del agua, proceso al cual se le llama electrolisis.
Las sustancias que en solución acuosa permiten el paso de la corriente se conocen como
electrolitos y a los que no manifiestan esta propiedad como no electrolitos. A esta capacidad de
dar paso a la electricidad se le conoce como conductancia.
Los electrolitos de clasifican en fuertes y débiles según su potencia para conducir la
corriente eléctrica.
Los electrólitos fuertes son muy disociables como las sales minerales, los hidróxidos de
metales alcalinos, y los ácidos minerales. En los líquidos del organismo encontramos como
ejemplo de electrolitos fuertes al cloruro de sodio (NaCl), cloruro de potasio (KCl) y cloruro de
calcio (CaCl2), entre otros.
Son electrólitos débiles la mayor parte de los compuestos orgánicos (como los ácidos
láctico, pirúvico, etc.), y los compuestos nitrogenados. En el agua corporal hay muchos ejemplos
de compuestos no electrolitos como glucosa, urea y creatinina.
CONDUCTIVIDAD
1
I=
2
∑ Cz 2
a) Anote las reacciones que se llevan a cabo en cada uno de los electrodos.
b) Esquematice el proceso de la electrólisis del agua.
EXPERIMENTO 2
Coloque la solución de ácido clorhídrico (HCl) 0.5M en un vaso de precipitados en cantidad
suficiente para que tenga contacto con los electrodos en una tercera parte de su longitud.
Introduzca los electrodos conectados a una fuente de energía y observe el paso de la corriente
eléctrica manifestado por la intensidad de la luz emitida por el foco. Observe también la intensidad
luminosa con relación a la distancia entre los electrodos, sin ponerlos en contacto.
Repita el experimento usando ácido acético (CH3COOH) 0.5M. Anote sus resultados:
Variación con la
Solución Intensidad luminosa
distancia
HCl 0.5M
CH3COOH 0.5M
Los ácidos o las bases se clasifican en débiles o fuertes según su grado de disociación, así
los electrólitos fuertes son los que están más disociados y por lo tanto la concentración molar del
ión hidrógeno o del ión hidroxilo en sus soluciones será igual a la normalidad, lo que simplifica el
cálculo de su pH.
pH = -log [H+] y pOH = -log [OH-]
Pero en el caso de los ácidos y bases débiles, los cuales están parcialmente disociados,
además de conocer la normalidad del ácido o base, deberá conocerse el grado de disociación de
la sustancia, o sea, la constante de disociación ácida Ka o básica Kb, la cual es diferente para cada
sustancia. En el cálculo del pH se deberá aplicar la fórmula en la que se toman en cuenta la
constante K de disociación respectiva y la molaridad C de la solución.
EXPERIMENTO 3
Empleando la fórmula que corresponda, calcule las cantidades adecuadas para preparar
250 mL de cada una de las siguientes soluciones de ácido clorhídrico de pH = 1.3, 1.6 y 2 a partir
de HCl al 37% de pureza y densidad de 1.18 g/mL y 250 mL de cada una de las siguientes
soluciones de ácido acético a pH de 3.02, 3.17 y 3.37 a partir de CH3-COOH al 99.7% de pureza,
densidad de 1.06 g/mL y pKa = 4.74. Prepare el par de soluciones que le indique su profesor y
consérvelas para el siguiente experimento.
EXPERIMENTO 4
Determine con papel indicador el pH de cada una de las soluciones que preparó en el
experimento anterior. A continuación determine el pH potenciométrico de cada una de ellas.
Posteriormente, mida exactamente 20 mL de cada una y colóquelos en matraces Erlenmeyer,
añada 2 gotas de solución de fenolftaleína y titúlelas con NaOH 0.1N.
Anote sus resultados en el siguiente cuadro:
HCl
CH3COOH
4. SOLUCIONES REGULADORAS
L
as soluciones a las cuales se les puede añadir cantidades relativamente grandes de ácidos o
álcalis sin alterar de manera significativa su pH, se les llama soluciones reguladoras,
amortiguadoras, buffer o tampón.
Esta acción amortiguadora se debe a la presencia en la solución de un sistema formado por
un ácido o una base débil y sus sales correspondientes.
Si se toma como ejemplo una solución que contenga un ácido débil, al que
representaremos por HA y su sal, representada por BA los hidrogeniones existentes en ella
procederán únicamente de las moléculas ácidas, que se disocian como sigue:
HA H++ A-
[H+] [A- ]
--------------------- = Ka
[HA]
La relación entre estas dos constantes es, sin embargo, tan sensiblemente constante en
condiciones ordinarias que podemos afirmar que la concentración de A- es igual a la concentración
de la SAL. Sustituyendo una expresión por otra en la ecuación anterior tenemos:
[Ácido]
+
[H ] = Ka ---------------
[Sal]
Ahora bien, si -log [H+] es igual a pH, por analogía podemos decir que –log de Ka es igual
a pKa por lo que:
[Ácido]
pH = pKa – log ---------------
[Sal]
Por otra parte por las leyes de los logaritmos, las expresiones –log de ([Ácido]/[Sal]) y
+ log de ([Sal]/[Ácido]) son iguales y la segunda puede reemplazar a la primera, de tal modo que
hechas todas las modificaciones la ecuación queda finalmente como sigue:
[Sal]
pH = pKa + log ----------
[Ácido]
solución de cloruro de potasio (KCl) 0.5M en tanto que en los tubos número 3 ponga una mezcla
formada por 2 mL de solución de fosfato diácido de potasio (KH2PO4) ) 0.01M y 3 mL de solución
de fosfato monoácido disódico (Na2HPO4) 0.01M. En los tubos número 4 ponga 2 mL de solución
de KH2PO4 0.1M y 3 mL de solución de Na2HPO4 0.1M. A continuación compruebe en la serie 1
que el pH de las soluciones es aproximadamente neutro, para ello haga uso del método
colorimétrico empleando rojo de fenol (rosa); agregue cinco gotas de indicador a cada uno de los
tubos de la serie y observe el color característico amarillo o rojo (pH 6.8 a 8.2).
A los cuatro tubos de la serie 2 adicione cinco gotas de verde de bromocresol, indicador
de zona ácida. A continuación agregue 10 gotas de HCl 0.01M al tubo número 1 y observe el
cambio de color que se opera (de verde a amarillo). Enseguida vea el número de gotas de la
misma solución de HCl 0.01M que es necesario agregar al tubo 2 de la serie en cuestión para
igualar la coloración (aunque no la intensidad) con el tubo número 1. Ahora, cuente el número de
gotas de solución de HCl 0.1M que es necesario agregar a los tubos 3 y 4 para igualar la
coloración con el tubo número 1.
A los cuatro tubos de la serie 3, adicione cinco gotas de azul de timol, indicador de zona
alcalina que vira de amarillo a azul fuerte (pH 8.0 a 9.6). A continuación agregue 10 gotas de
solución de NaOH 0.01M al tubo número 1 y observe también el cambio de coloración (de amarillo
a azul).
Existen sustancias de mucha importancia en bioquímica como son los aminoácidos y las proteínas
los cuales tienen grupos titulables y que actúan como anfolitos aceptando iones H+ o iones OH-.
En este experimento se determinarán las curvas de titulación de glicina con HCl y con NaOH.
EXPERIMENTO 2
En dos vasos de precipitados de 150 mL coloque 30 mL de solución de glicina 0.1N,
agregue una barra magnética y colóquela sobre el agitador, tómeles el pH y titule, como se indica
en la tabla, uno con NaOH 0.1N y el otro con HCl 0.1N.
Agregar HCl 0.1N Glicina 0.1N Agregar NaOH 0.1N Glicina 0.1N
30 ml 30 ml
ml Acumulativo pH ml Acumulativo pH
0 0 0 0
2 2 2 2
3 5 3 5
4 9 4 9
5 14 5 14
5 19 5 19
5 24 5 24
1 25 1 25
1 26 1 26
1 27 1 27
1 28 1 28
0.5 28.5 0.5 28.5
0.5 29 0.5 29
Grafique dando a los valores acumulativos de HCl signo negativo y a los de NaOH signo
positivo, en el eje de las x y el pH en el eje de las y.
pK1 + pK 2
pI =
2
PREPARACIÓN DE SOLUCIONES REGULADORAS
EXPERIMENTO 3
Empleando la fórmula de Henderson Hasselbalch, calcule los volúmenes
necesarios para preparar soluciones amortiguadoras con los valores de pH que le indique su
profesor, empleando fosfato diácido de potasio (KH2PO4) 0.1M y fosfato monoácido de sodio
(Na2HPO4) 0.1M (pK2 = 7.2); posteriormente prepárelas y compruebe sus resultados midiendo
el pH potenciométrico.
5. PROTEÍNAS
E
l nombre de proteínas deriva del griego protos que significa “primero”, “primordial” o
fundamental y son los componentes principales del protoplasma y las membranas
celulares, tanto de animales como de vegetales.
Las proteínas contienen en su molécula C, H, O, N y en ocasiones P y S; El nitrógeno
constituye aproximadamente el 16%; poseen además la característica de que por hidrólisis se
desdoblan dando como producto final α aminoácidos, los cuales varían en número, cantidad y
posición en cada proteína. La estructura de una proteína está determinada por cuatro niveles de
organización o niveles estructurales que se designan como estructuras primaria, secundaria,
terciaria y cuaternaria.
La estructura primaria depende del número y secuencia de aminoácidos que se unen entre sí
por el enlace peptídico (-CO-NH-) covalente.
La estructura secundaria consiste en que la cadena polipeptídica puede enrollarse sobre sí
misma formando estructuras helicoidales u otro tipo de conformación, estabilizada por puentes
de hidrógeno
La estructura terciaria es una cadena polipeptídica ya enrollada que adopta en el espacio la
conformación más estable, o sea, sufre un súper enrollamiento
La estructura cuaternaria puede estar constituida por más de una cadena polipeptídica y la
asociación de estas cadenas en el espacio adoptan una estructura tridimensional característica
que les da actividad biológica.
Tanto la estructura terciaria como la cuaternaria carecen de enlaces definidos, ya que participan
todos los tipos de enlaces químicos, fuertes o débiles, en estos niveles estructurales.
Existen muchos tipos de proteínas en un organismo, cada una con una función específica;
algunas son estructurales, otras actúan como catalizadores, hormonas, transportadores de
gases, transportadores de solutos a través de la membrana, transportadores de electrones,
en mecanismos de defensa, mecanismos genéticos, en el mantenimiento del balance
hidroelectrolítico,(presión oncótica), etc.
Las proteínas tal como existen en la naturaleza se denominan proteínas nativas; si se modifican
por cualquiera de los agentes anteriores en su conformación, se transforman en proteínas
desnaturalizadas, las cuales generalmente pierden su actividad, modifican su solubilidad y
precipitan
REACCIÓN DE MILLÓN
La reacción de Millón es específica para el grupo fenólico y por lo tanto, la dan positiva
todas las sustancias que poseen esta función, como el fenol, ácido salicílico, timol, tirosina y
todas aquellas proteínas que contengan tirosina.
EXPERIMENTO 1
Prepare una serie de cuatro tubos de ensayo numerados, coloque en cada uno, 2 mL de
una de las soluciones siguientes:
Tubo Proteína (al 2%)
1 Peptona
2 Caseína
3 Gelatina
4 Albúmina
Posteriormente añada 5 gotas del reactivo de Millón. Caliente ligeramente hasta que la
solución hierva. ¡Precaución!. La presencia de tirosina se pone de manifiesto por la aparición de
un precipitado blanco el cual por acción del calor se vuelve rojo. La presencia de sales así como
soluciones muy alcalinas pueden interferir en esta reacción.
EXPERIMENTO 2
Prepare una serie de 4 tubos de ensayo numerados, coloque en cada uno 1 mL de las
siguientes soluciones:
Tubo Proteína (al 2%)
1 Peptona
2 Caseína
3 Gelatina
4 Albúmina
Esta reacción se debe a la formación de nitro derivados aromáticos por reacción del
ácido nítrico sobre grupos bencénicos que poseen algunos aminoácidos como la fenilalanina,
la tirosina y el triptófano. Por lo tanto, la dan positiva todas aquellas proteínas que tengan
aminoácidos aromáticos en su molécula.
EXPERIMENTO 3
Prepare una serie de 4 tubos de ensayo numerados, coloque en cada uno 2 mL de una
de las siguientes soluciones:
Tubo Proteína (al 2%)
1 Peptona
2 Caseína
3 Gelatina
4 Albúmina
Añada 1 mL de ácido nítrico (HNO3) concentrado ¡con cuidado!, caliente ligeramente y
observe una coloración amarilla característica. Deje enfriar esta solución y añada cuidadosamente
gotas de hidróxido de amonio (NH4OH) concentrado, haciéndolas resbalar cuidadosamente por las
paredes del tubo, para estratificar. En la interfase se observará un anillo naranja.
1) Anote sus resultados en la tabla que se encuentra al final del capítulo.
2) ¿Se puede considerar esta reacción general para todas las proteínas?
3) Explique por qué se tiñe de amarillo la piel al contacto con el HNO3.
EXPERIMENTO 4
Prepare una serie de cuatro tubos de ensayo numerados, coloque en cada uno 2 mL de una
de las siguientes soluciones:
Tubo Proteína (al 2%)
1 Peptona
2 Caseína
3 Gelatina
4 Albúmina
REACCIÓN DE NINHIDRINA
Esta es una de las reacciones más sensibles que se conocen para identificar aminoácidos
en general, ya que puede poner de manifiesto una parte de cualquier aminoácido en 1 500 000
partes de agua. Los aminoácidos y muchas aminas primarias dan un color violeta característico.
La prolina da coloración amarilla. Por su sensibilidad esta reacción se emplea para valoración
cuantitativa de aminoácidos por colorimetría. La valoración de aminoácidos en orina, por
ejemplo, tiene importancia en medicina ya que en algunas enfermedades como hepatopatías,
infecciones agudas o diabetes mellitus en las que se presenta hiperaminoacidemia se ve
acompañada por aminoaciduria paralela. Algunas enfermedades metabólicas congénitas dan
lugar a la eliminación anormal de algunos aminoácidos en la orina (p. ej. fenilcetonuria) .
EXPERIMENTO 5
Se utilizarán cuadros de papel filtro Whatman no. 1 de 2 x 2 cm, sobre los cuales se colocarán
gotas de las siguientes soluciones:
cuadro Sustancia:
1 Glicina
2 Peptona
3 Gelatina
4 Caseína
5 Albúmina
¡Precaución! Use guantes o pinzas para manipular el papel. Anote debajo de cada muestra
el nombre del compuesto y añádale una gota de solución de ninhidrina en butanol al 0.1%.
Coloque el papel en el horno a 110 °C durante 5 minutos.
REACCIÓN
AMINOÁCIDOS
SUSTANCIA MILLON BIURET XANTOPROTÉICA NINHIDRINA
AZUFRADOS
GLICINA
GELATINA
PEPTONA
CASEÍNA
ALBÚMINA
Muchas de las propiedades químicas de las proteínas son comunes a varias especies
debido a que contienen el mismo tipo de aminoácidos, por lo que es necesario estudiar sus
propiedades físicas y biológicas si se desea caracterizar una proteína. Las propiedades
fisicoquímicas de las proteínas dependen fundamentalmente del peso molecular, de su carga
eléctrica neta y de la conformación que adopte la molécula.
DESNATURALIZACIÓN DE PROTEÍNAS
EXPERIMENTO 6
Prepare una serie de 4 tubos de ensayo conteniendo 1 mL de peptona al 2% y rotúlelos
como P1 – P4 (por peptona). Prepare otra serie de 4 tubos, ésta vez con gelatina al 2%. Rotúlelos
como G1 – G4 (por gelatina) y agregue lo que se indica en la tabla. Anote sus observaciones en la
misma, evaluando por medio de cruces (de x a xxx según la turbiedad del precipitado):
Observaciones:
Serie Serie
P G Metal Pesado: Precipitado: Con exceso:
Agregar 2 gotas de Serie Serie Serie Serie
Tubos: solución al 2% de: P G P G
1 1 FeCl3
2 2 AgNO3
3 3 HgCl2
4 4 Pb(CH3COO) 2
1) ¿Tiene alguna influencia el pH en el efecto de los metales pesados sobre las proteínas?
2) ¿Tienen todos los metales pesados el mismo efecto precipitante sobre las proteínas?
Los ácidos fuertes son capaces de desnaturalizar a las proteínas formando productos de
desnaturalización insolubles conocidos como metaloproteínas.
EXPERIMENTO 7a
Coloque en 4 tubos de ensayo numerados, 3 mL de las siguientes soluciones: peptona,
gelatina, caseína y albúmina al 2% y añada un volumen igual de ácido tricloroacético
(CCl3COOH) al 5%.
1) Anote sus resultados al final del capítulo.
2) ¿Cómo puede explicar el efecto desnaturalizante del ácido tricloroacético y en general
de cualquier ácido?
EXPERIMENTO 7b
Prepare dos tubos de ensayo y márquelos como orina normal y orina de paciente
nefrótico, coloque en ellos 3 mL de la orina correspondiente. Agregue enseguida, resbalando
cuidadosamente por la pared del tubo, para estratificar, 2 mL de la mezcla HNO3 – metanol.
EXPERIMENTO 8
Coloque en tubos de ensayo numerados, 2 mL de las siguientes soluciones: peptona,
caseína, gelatina y albúmina al 2%, estratificando cuidadosamente, agregue 3 mL de alcohol de
96° (CH3CH2OH) y observe lo que ocurre en la interfase.
1) ¿Observa turbidez en todos los tubos?
2) Anote sus resultados en la tabla:
Las proteínas al igual que los aminoácidos son moléculas anfotéricas. Es decir, pueden
reaccionar con ácidos o con álcalis. En medio ácido las proteínas se combinan con los iones
hidrógeno y quedan con carga positiva. En medio alcalino liberan protones y quedan con carga
negativa. El pH en el cual una proteína no posee carga eléctrica neta se denomina punto
isoeléctrico, a este pH la proteína presenta su mínima solubilidad y generalmente precipita,
teniendo además una viscosidad máxima, propiedades que tomaremos en cuenta para el
siguiente experimento.
EXPERIMENTO 9
Prepare una serie de 9 tubos de ensayo siguiendo las instrucciones de la tabla:
Añada primero la caseína, posteriormente el agua y al final el ácido acético. Agite
todos los tubos y observe el grado de turbidez o la precipitación que se produce en cada tubo
inmediatamente y después de 15’ y 30’.
1) Anote sus observaciones en la tabla valorando con cruces.
2) Calcule el pH teórico de cada tubo, aplicando la ecuación de Henderson - Hasselbalch y
anótelo en la tabla.
Tubo 1 2 3 4 5 6 7 8 9
Caseína al 5% en acetato de sodio 0.1N ml 1 1 1 1 1 1 1 1 1
Agua destilada ml 8.4 7.8 8.8 8.5 8.0 7.0 5.0 1.0 7.4
Ácido acético 1N ml - - - - - - - - 1.6
Ácido acético 0.1N ml - - 0.2 0.5 1.0 2.0 4.0 8.0 -
Ácido acético 0.01N ml 0.6 1.2 - - - - - - -
pH teórico
Observación a los 15 minutos
Observación a los 30 minutos
D
e acuerdo con la Ley de Acción de Masas, la velocidad de una reacción química depende
de la concentración de las sustancias que intervienen en la reacción. Esta Ley establece
que: “La magnitud de una reacción es proporcional a la masa activa de las
sustancias reaccionantes presentes en ese momento”.
El término masa activa significa la concentración molecular o sea, la cantidad presente por
unidad de volumen. Si reaccionan:
V1
A + B ←→ C + D
V2
La velocidad V1 con que reaccionan A y B para producir C y D depende de la concentración
de cada reactivo y de la afinidad que tengan para reaccionar entre sí, pero como esto se puede
considerar constante, podemos decir que:
V1 = k1[A][B]
La velocidad V2 con que reaccionan C y D para producir A y B depende a su vez, de la
concentración de C y D y de la afinidad. Por lo tanto podemos decir también que:
V2 = k2[C][D]
Cuando se alcanza el equilibrio químico, las dos velocidades son iguales. Es decir:
V1 = V2
Sustituyendo estos valores por sus equivalentes, tenemos:
k1[A][B] = k2[C][D]
k1 [C][D]
---- = ---------
k2 [A][B]
Como el cociente de dos constantes es siempre igual a una constante podemos decir que:
[C][D]
keq = ---------
[A][B]
Que es la expresión matemática de la Ley de Acción de Masas y keq se conoce como
Constante de Equilibrio.
EXPERIMENTO 1
En un vaso de precipitados de 600 mL de capacidad, añada 100 mL de agua destilada, 1
mL de solución de sulfocianuro de amonio (NH4SCN) 0.2M y 1 mL de solución de cloruro férrico
(FeCl3) 0.2M en HCl 0.1N mezclando hasta lograr la homogeneidad. Observará la aparición de
una coloración roja, debida a la formación de sulfocianuro férrico (Fe(SCN)3).
A B
Bimoleculares cuando participan dos moléculas. Ejemplo:
A + B AB
Trimoleculares cuando participan tres moléculas simultáneamente. Ejemplo:
A + B + C ABC
Las reacciones trimoleculares son muy raras y reacciones de más de tres reaccionantes no
se conocen.
Cuando se estudia la cinética de una reacción, tiene mas importancia conocer el orden de
la reacción que el tipo. El orden de una reacción nos indica la relación entre la velocidad y la
concentración de los reactivos, por lo que se clasifican en:
Reacciones de orden cero. Su velocidad no es afectada por la concentración. Está
determinada por algún otro factor limitante como absorción de luz, velocidad de difusión, etc.
Reacciones de primer orden. Su velocidad de reacción es directamente proporcional a la
concentración de una de las sustancias reaccionantes.
Reacciones de segundo orden. Su velocidad de reacción es proporcional a la concentración
de dos sustancias reaccionantes.
Reacciones de tercer orden. Su velocidad de reacción es proporcional a la concentración de
tres sustancias reaccionantes.
La mayor parte de las reacciones enzimáticas se caracterizan por seguir el modelo
correspondiente a las reacciones de primer orden. Matemáticamente la reacción puede
representarse así:
dc
----- = Ke
dt
dt = tiempo dc = concentración del material Ke = constante específica de velocidad de reacción
LABORATORIO DE BIOQUIMICA MÉDICA 1 Página: 29
ESCUELA SUPERIOR DE MEDICINA, I.P.N. DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA
EXPERIMENTO 2
Coloque en un matraz erlenmeyer de 250 mL de capacidad, 5 mL de una solución problema
de peróxido de hidrógeno (H2O2) y 2 mL de ácido sulfúrico (H2SO4) (1:6). Caliente la mezcla hasta
casi ebullición ¡PRECAUCIÓN! y así en caliente, titule con una solución de permanganato de
potasio (KMnO4) 0.01M. El punto final de la titulación lo observará cuando persista un ligero color
rosa, por exceso de la solución de permanganato. El H2SO4 y el calentamiento tienen por objeto
impedir la formación de MnO2.
Haga esta determinación por duplicado y haga el promedio de las dos determinaciones.
A continuación prepare una mezcla de 50 mL de sangre desfibrinada al 0.06% y 50 mL de
la solución problema de peróxido de hidrógeno. A los 5, 10, 20, 30 y 40 minutos tome alícuotas
de 10 mL y transfiéralos a un matraz erlenmeyer de 250 mL de capacidad, añada 2 mL de solución
de H2SO4 (1:6) caliente hasta casi ebullición y titule con una solución de permanganato de potasio
(KMnO4) 0.01M en la forma ya explicada.
1) Escriba las reacciones químicas que se han efectuado.
2) Resuma sus resultados en la siguiente tabla:
2.303 a
Ke = ------------ x log --------
t (a – x)
1) Determine el orden de reacción gráficamente.
Desde hace muchos años se sabía en forma empírica que la velocidad de muchas
reacciones aumenta al aumentar la temperatura. Arrhenius encontró una relación que expresa
matemáticamente la forma como la temperatura afecta la velocidad de una reacción, la cual
está dada por la siguiente ecuación:
d(ln K) E
----------- = ----------
dt RT2
La cual indica que el cambio en el logaritmo natural de la constante de velocidad de una
reacción es inversamente proporcional al cuadrado de la temperatura absoluta multiplicada por
la constante de los gases. E es la energía de activación. Actualmente se considera que para
que las moléculas puedan reaccionar deben ser primero activadas, es decir, requieren una
cantidad de energía E.
Integrando entre límites la ecuación de Arrhenius:
K2 E (t2 - t1)
log ------- = -------------
K1 2.3 (R t1 t2)
K2 E (t2 - t1)
log ------- = ----------------
K1 2.3 (1.99) (t1 t2)
K2
antilog log ------- = antilog 0.29
K1
K2
------- = 2
K1
Esto quiere decir que por cada 10°C de aumento la velocidad de la reacción se duplica.
En la mayor parte de las reacciones se observa este aumento bajo ciertas temperaturas
límites.
EXPERIMENTO 3
Coloque en un matraz erlenmeyer de 250 mL de capacidad 0.25 g de yoduro de potasio
(KI) y añada 25 mL de solución de H2SO4 1:6. Agite hasta disolución completa y agregue agua
destilada hasta completar 50 mL. Esta solución se denominará Solución de ácido yodhídrico
HI y se utilizará en este experimento y en el siguiente.
Prepare una serie de 5 vasos de precipitados de 100 mL y agregue los reactivos según la
tabla que se muestra a continuación:
vaso 1 2 3 4 5
solución
HI ml 5 5 5 5 5
Na2S2O3 0.02N ml 1.5 1.5 1.5 1.5 1.5
Almidón gotas 5 5 5 5 5
Preincubar 5 minutos a: 5 °C 25 °C 40 °C 60 °C 90 °C
H2O2 al 0.2% ml 2 2 2 2 2
Deberá medir con la mayor precisión posible el tiempo desde el momento de añadir el
H2O2 al 0.2% hasta el momento en que aparece súbitamente un color azul intenso.
5
25
40
60
90
Se sabe que muchas reacciones químicas son afectadas por el pH del medio, sobre todo
aquellas en las que participan ácidos. Actualmente se acepta que las moléculas deben ser
activadas antes de que puedan reaccionar. Aparentemente el pH ácido favorece la ionización y el
estado iónico se puede considerar como un estado activado.
EXPERIMENTO 4
Vaso 1 2 3 4 5
Solución
HI ml 5 5 5 5 5
Na2S2O3 0.02N ml 1.5 1.5 1.5 1.5 1.5
Almidón gotas 5 5 5 5 5
H2O destilada ml 5
HCl 0.01N ml 5
HCl 0.1N ml 5
HCl 1N ml 5
HCl 2N ml 5
H2O2 al 0.2% ml 2 2 2 2 2
2) Según sus resultados trace una gráfica con el 1/tiempo en segundos en las ordenadas y
la concentración de H+ en las abscisas.
EXPERIMENTO 5
Utilice dos tubos de ensayo y coloque en cada uno 2 mL de solución de sacarosa al 0.05M.
Un tubo quedará como testigo y al otro se agregarán 3 gotas de ácido sulfúrico (H2SO4) (1:6). Se
ponen ambos tubos en baño maría a ebullición durante 15 minutos, complete el volumen si es
necesario. Emplearemos el reactivo de Fehling para lo cual el tubo que contiene el H2SO4 se
neutraliza con 1 ml hidróxido de sodio (NaOH) al 10% y posteriormente se añade 2 mL de la
solución “A” y 2 mL de la solución “B” del reactivo de Fehling mezclándolos perfectamente y se
colocan en baño maría a ebullición por 5 minutos al cabo de los cuales se sacan del baño y se
dejan enfriar y se observa si existe un precipitado rojo de óxido cuproso (Cu2O) en ambos tubos.
Una de las principales diferencias entre los catalizadores inorgánicos y las enzimas es que
los primeros solo son capaces de acelerar un proceso que ya está en marcha, mientras que las
enzimas son capaces de iniciar una nueva reacción.
Para esta práctica emplearemos como enzima la sacarasa, también conocida como
invertasa o fructofuranosidasa la cual es una de las enzimas mejor conocidas y estudiadas.
Actúa hidrolizando los azúcares que contienen fructosa. Así hidroliza la estaquiosa (tetrasacárido),
la rafinosa (trisacárido), y alcanza su máxima velocidad con la sacarosa (disacárido). Se puede
medir la hidrólisis observando el cambio en la rotación óptica o valorando el poder reductor de los
productos obtenidos.
EXPERIMENTO 6
Utilice dos tubos de ensayo y coloque en cada uno 2 mL de solución de sacarosa 0.05M y
1 mL de solución reguladora de acetato de sodio 0.05M a pH de 4.7 Un tubo quedará como
testigo y al otro se le agregan 0.2 mL de la solución de invertasa (solución enzimática). Después
de mezclar bien el contenido de ambos tubos se colocan en baño maría a 40°C durante 15
minutos; cuando se ha completado el tiempo se les agrega a ambos tubos 2 mL de la solución A y
2 mL de la solución B del reactivo de Fehling, mezclándolos perfectamente. Se colocan en baño
maría a ebullición por 5 minutos al cabo de los cuales se sacan del baño y se dejan enfriar.
Observe si existe un precipitado rojo de óxido cuproso Cu2O en ambos tubos.
7. ENZIMAS
FACTORES QUE MODIFICAN LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA
L
a vida depende de una serie de reacciones químicas cuyo curso y velocidad están
determinados por la presencia de diversos catalizadores orgánicos denominados enzimas:
(del griego en = en, zymo = fermento). La mayor parte de las reacciones biológicas serían
cinéticamente insignificantes si no fuera por las enzimas.
Las enzimas desde el punto de vista químico son compuestos que pertenecen al grupo de
las proteínas (aunque algunas solo funcionan asociadas a un grupo no proteico, grupo prostético o
coenzima). Debido a su carácter proteínico, las enzimas son muy sensibles a cualquier cambio
físico, químico, o fisicoquímico. Así, cualquier cambio en la temperatura, en el pH, en la fuerza
iónica, la adición de sales, la presencia de agentes oxidantes o reductores, la presencia de
metales pesados, etc., producen modificaciones profundas en su actividad. En general, cualquier
factor que sea capaz de desnaturalizar a las proteínas será capaz de alterar su actividad.
Estructuralmente todas las enzimas son proteínas simples o complejas. La parte proteínica de las
enzimas se denomina apoenzima, la parte no proteínica puede ser coenzima, si se separa
fácilmente de la proteína. Las coenzimas pueden ser comunes a varias enzimas y no actúan como
catalizadores ya que se transforman en la reacción que catalizan y requieren de otra enzima para
regenerar su actividad. La mayor parte de las coenzimas están relacionadas con las vitaminas. Si
la parte no proteínica se encuentra firmemente unida a la proteína por enlace covalente y no es
posible separarla por diálisis, se denomina grupo prostético.
Hay varios factores que afectan la velocidad de una reacción catalizada por enzimas.
Algunos de ellos son: temperatura, pH, concentración de sustrato, concentración de enzima e
inhibidores.
Temperatura
La velocidad de las reacciones químicas aumenta al incrementar la temperatura, originando
aumento en la energía cinética y en las velocidades medias de las moléculas con el resultado de
una mayor probabilidad de colisiones efectivas. Sin embargo, las enzimas se inactivan y
desnaturalizan a temperaturas elevadas. La mayor parte de las enzimas tienen una temperatura
óptima, en la cual catalizan con una velocidad máxima.
pH
La actividad de la mayoría de las enzimas depende del pH debido a la participación de
iones [H+] o iones [OH+] en las reacciones, además que se afecta la de los grupos funcionales. La
mayoría de las enzimas tienen un pH óptimo en el cual su actividad es máxima.
Concentración de la enzima
La velocidad de una reacción aumenta en proporción directa a la concentración de la
enzima que la cataliza. La interacción enzima – substrato cumple la Ley de Acción de Masas. Se
emplea con frecuencia la velocidad de una reacción como medida de concentración de la enzima
manteniendo fija la concentración de substrato.
Concentración de sustrato
Si se trabaja con una concentración fija de enzima la velocidad inicial de reacción aumenta
incrementando la concentración del sustrato. Con el tiempo se alcanza un máximo y la adición de
más sustrato ya no influye sobre la velocidad, ya que la enzima se saturó.
EFECTO DE LA TEMPERATURA SOBRE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA
EXPERIMENTO 1
Se prepara una serie de siete tubos como sigue:
Tubo
Reactivos 1 2 3 4 5 6 7
Sustrato almidón 8 mg/mL mL --- 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5
Solución reguladora de mL --- 1.5 1.5 1.5 1.5 1.5 1.5
fosfatos 0.02M, pH = 7
Agua destilada mL 5 3 3 3 3 3 3
Preincubar 5 minutos a 25°C 5°C 25°C 40°C 50°C 60°C 92°C
Enzima (sol. de amilasa) mL --- 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5
EXPERIMENTO 2
Prepare una serie de 6 tubos de ensayo, siguiendo las instrucciones de la siguiente tabla:
Tubo
Reactivos 1 2 3 4 5 6
Sustrato (sol de almidón 8 mg/mL) mL 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5
Sol. reguladora al pH indicado 7 5 6 7 8 9
mL 4.5 4 4 4 4 4
Enzima (sol de amilasa) mL --- 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5
Mezcle e incube a 40°C por 15 minutos
Terminado este lapso todos los tubos se agitan y se les agrega 1 mL de reactivo de ácido
dinitrosalicílico. Caliéntelos en un baño de agua hirviendo por 10 minutos. Este reactivo desarrolla
un color rojo caoba en presencia de azúcares reductores.
Determine la concentración del azúcar reductor liberado, leyendo la densidad óptica en el
espectrofotómetro a 540 nm (Puede ser necesario diluir la mezcla reaccionante 1 a 6 veces con
agua antes de leer).
1) Basándose en sus resultados diga ¿Cuál es el pH óptimo de la amilasa?
2) ¿Cuál es el azúcar que se libera en la hidrólisis de este polisacárido?
3) Resuma sus resultados en la siguiente tabla y trace con ellos la gráfica correspondiente
(D.O. contra pH)
pH y ACTIVIDAD ENZIMÁTICA
TUBO pH D.O.
1 7
2 5
3 6
4 7
5 8
6 9
S + E [ES] P + E
La velocidad de formación (Vf) del complejo [ES] depende de V1 mientras que la velocidad
de degradación (Vd) depende de V2 + V3. Por lo tanto en el equilibrio tenemos:
Vf = Vd es decir: V1 = V2 + V3
Simplificando:
[E – ES] = [ES]
EXPERIMENTO 3
Prepare una serie de 8 tubos de ensayo como se indica en la siguiente tabla:
Tubo
Reactivos 1 2 3 4 5 6 7 8
Sustrato (almidón 8 mg/mL) mL 0.5 1.0 2.0 3.0 4.0 5.0 7.5 7.5
Sol reguladora de fosfatos 0.02M pH = 7 mL 7.0 6.5 5.5 4.5 3.5 2.5 0.0 0.5
Sol de enzima (amilasa) mL 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.0
Mezcle bien los tubos e incube a 40°C por 15 minutos
Transcurrido este tiempo añada a todos los tubos, con objeto de detener la reacción
enzimática, 1 mL del reactivo del ácido 3,5 dinitrosalicílico; caliente por 10 minutos en baño maría
a ebullición para desarrollar color. Enfríe y lea cada tubo en el espectrofotómetro a 540 nm
empleando el tubo no. 8 como blanco.
1) Resuma sus resultados en la siguiente tabla:
Concentración de Absorbancia
sustrato: mg/mL
0.5
1
2
3
4
5
7.5
Durante mucho tiempo se pensó que los catalizadores eran sustancias que actuaban por
presencia debido a las concentraciones tan pequeñas y a que podían recuperarse inalterados al
final de la reacción. Sin embargo, se sabe que la velocidad de reacción de acuerdo a la Ley de
V = K[E]
EXPERIMENTO 4
Prepare una serie de 6 tubos siguiendo las indicaciones de la siguiente tabla:
Tubo
Reactivo 1 2 3 4 5 6
Sustrato de almidón 8 mg/mL mL 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5
Sol reguladora de fosfatos 0.02M pH = 7 mL 1 1 1 1 1 1
Agua mL 5 4.9 4.8 4.6 4.2 3.4
Preincubar a 40°C durante 5 minutos
Sol enzima (amilasa) mL - 0.1 0.2 0.4 0.8 1.6
Después de mezclar el contenido de los tubos, se colocan a baño maría a 40°C por 15
minutos. Pasado este tiempo añada a cada tubo 1 mL del reactivo de ácido 3,5 dinitrosalicílico. Se
colocan los tubos en baño maría a ebullición por 10 minutos. Enfríe y lea la intensidad del color
como densidad óptica en el espectrofotómetro a 540 nm, empleando el tubo no. 1 como blanco.
1) Con base en sus resultados trace una gráfica con los valores de Absorbancia en las
ordenadas y la concentración de enzima expresada en mg/mL en las abscisas,
según la siguiente tabla:
8. GLÚCIDOS
L
os glúcidos o carbohidratos se definen como derivados aldehídicos o cetónicos reales o
en potencia de alcoholes polivalentes que poseen en su molécula uno o más carbonos
asimétricos. Estos compuestos se encuentran presentes en todos los seres vivos, en
cantidades variables, desempeñando importantes funciones estructurales y energéticas. Debe
recordarse que todas las propiedades químicas de los glúcidos dependen de sus grupos
funcionales, o sea, grupos alcohol y grupo carbonilo (aldehídico o cetónico).
Los glúcidos se clasifican, según el número de compuestos hidrocarbonados simples que
los constituyen, en 3 grupos; monosacáridos, oligosacáridos y polisacáridos.
Los monosacáridos no se pueden desdoblar por hidrólisis en compuestos más sencillos. A
su vez se subdividen, según el número de carbonos que contengan, en: triosas, tetrosas,
pentosas, hexosas, etc.
Los oligosacáridos, por hidrólisis, dan pocas moléculas de monosacáridos. En la
naturaleza existen varios disacáridos (sacarosa, lactosa, maltosa etc.) y unos cuantos trisacáridos,
tetrasacáridos y pentasacáridos libres. Se pueden obtener por síntesis química en el laboratorio o
por degradación hidrolítica de polisacáridos. Los oligosacáridos poseen propiedades físicas
similares a las de los monosacáridos.
Los polisacáridos, por hidrólisis dan muchas moléculas de monosacáridos. Desde el punto
de vista fisiológico se dividen en dos grupos; polisacáridos estructurales y polisacáridos de
reserva. Entre los primeros tenemos en vegetales: la celulosa, los ácidos pecticos y las hemi
celulosas. En animales los más importantes son los llamados mucopolisacáridos, tales como el
ácido hialurónico y el condroitin sulfato, abundantes en varios tejidos y líquidos como el cuerpo
vítreo del ojo, el cordón umbilical, el líquido sinovial, tendones, cartílagos, etc.
Entre los polisacáridos nutrientes o de reserva los más importantes son, en vegetales, los
almidones e inulina y en animales, el glucógeno.
Los glúcidos reciben este nombre debido a que la mayor parte de ellos se caracterizan por
tener sabor dulce. Sin embargo, esta propiedad la presentan solamente los mono y oligosacáridos,
ya que los polisacáridos son generalmente insípidos. Otras propiedades que nos permiten
diferenciar glúcidos de bajo peso molecular (monosacáridos y oligosacáridos) de los de elevado
peso molecular (polisacáridos), son su solubilidad en agua y su capacidad para cristalizar.
ESTRUCTURA CRISTALINA
EXPERIMENTO 1
Examine al microscopio los siguientes glúcidos: glucosa, sacarosa, almidón y celulosa y
haga los esquemas respectivos.
su reactividad química estará ausente. Una característica química de los aldehídos y cetonas es
su carácter reductor, todos los monosacáridos u oligosacáridos que tengan libre el grupo
aldehídico o cetónico serán reductores, mientras que los polisacáridos y oligosacáridos que
tengan bloqueados estos grupos serán no reductores.
Todos los glúcidos formados por varios azúcares (oligo o polisacáridos) se pueden hidrolizar
por acción enzimática o de ácidos dando como producto final los monosacáridos y liberando los
grupos reductores bloqueados. Existen varias reacciones químicas que se utilizan para la
identificación de los glúcidos, algunas son generales y otras son específicas para determinar tipo o
incluso específicas para cada azúcar. Entre las más utilizadas tenemos:
FORMACIÓN DE OSAZONAS
Esta reacción es una de las de mayor utilidad para la identificación de azúcares por ser
específica para cada azúcar. La dan positiva tanto los monosacáridos como los disacáridos
reductores sirviendo para identificarlos el tiempo que tardan en formar la osazona
correspondiente, la forma cristalina de ellas, la solubilidad en caliente o en frío y los puntos de
fusión.
EXPERIMENTO 2
Se colocan en un tubo de ensayo 0.1 g de un carbohidrato, 0.2 g de clorhidrato de
fenilhidracina, 0.3 g de acetato sódico cristalizado y 4 mL de agua, se agita y se tapa el tubo
con un tapón de papel procurando que no quede muy cerrado y se coloca en baño maría
hirviendo, agitando ocasionalmente y observando el tiempo que tardan en aparecer los
precipitados y si lo hacen en frío o en caliente.
1) Observe al microscopio los cristales de la osazona preparada por usted y las preparadas
por sus compañeros de grupo.
2) Haga un esquema de los cristales.
3) ¿Por qué la glucosa, la manosa y la fructosa dan la misma osazona?
4) Escriba la reacción que se efectúa.
EXPERIMENTO 3
Coloque en una gradilla 6 tubos de ensayo, ponga en cada uno 3 mL de cada una de las
siguientes soluciones:
Añada a todos los tubos, 2 gotas de reactivo de Molisch (solución de alfa – naftol al 5% en
alcohol). Mezcle bien. Posteriormente añada a todos los tubos, 1 mL de ácido sulfúrico
concentrado, estratificando (inclinando el tubo y dejando resbalar el ácido por las paredes). La
reacción es positiva si aparece en la interfase un anillo de color violeta.
REACCIÓN DE FEHLING
La mayor parte de las pruebas para el análisis cualitativo y cuantitativo de azúcares se
basan en su propiedad reductora, aunque esta propiedad no sea específica de ellos. Se sabe que
los azúcares reductores son capaces de reducir diversos iones metálicos como el cobre, bismuto,
mercurio, plata, etc. , cuando se encuentran estos en solución alcalina.
Este tipo de reacciones son muy empleadas porque los reactivos son estables, existe poca
interferencia con otras sustancias, las reacciones son sensibles y puede usarse la misma reacción
para un análisis cualitativo o cuantitativo.
EXPERIMENTO 4
En 5 tubos de ensayo se colocan 2 mL de la solución A y 2 mL de la solución B del
reactivo de Fehling, y a cada tubo se le agregan 3 gotas de cada uno de los siguientes azucares:
Se colocan los tubos en baño maría a ebullición y se mantienen por 3 minutos, al cabo de
los cuales se dejan enfriar (no deben enfriarse con agua fría) y se observan.
El mecanismo de reacción se lleva a cabo debido a que algunos compuestos orgánicos que
contienen uno o más grupos alcohólicos en su molécula, en este caso el tartrato de sodio,
reaccionan en solución alcalina con los hidróxidos metálicos, formando un complejo soluble, el
cual se disocia muy poco, pero los iones que deja en libertad son suficientes para que produzcan
las reacciones de coloración. La formación de este complejo es esencial para que se produzca un
precipitado con la mayor parte de los metales pesados.
REACCIÓN DE BARFOED
El reactivo de Barfoed es una solución de acetato cúprico en ácido acético y, una vez más,
se determina la capacidad de los azúcares para reducir el ión cúprico a cuproso (Cu2O).
Esta reacción sirve para diferenciar un monosacárido de un disacárido, ya que los primeros
a los tres minutos reducen el reactivo y los disacáridos necesitan mas tiempo para que se lleve a
cabo la reacción de reducción, mas o menos unos 15 minutos.
EXPERIMENTO 5
Se colocan 4 tubos de ensayo y a cada uno se le agregan 3 mL del reactivo de Barfoed y 1
mL de una de las siguientes soluciones de glúcidos:
REACCIÓN DE BIAL
Esta reacción sirve para diferenciar pentosas de hexosas, este reactivo consiste en una
solución de orcinol en ácido clorhídrico (HCl) concentrado con una pequeñísima cantidad de
cloruro férrico (FeCl3). El fundamento de esta reacción, igual que la reacción de Molisch, la de
Seliwanoff y otras, se basa en la producción de furfural o hidroximetil furfural cuando se calienta
con ácidos concentrados y la reacción de estos con otras sustancias dando productos coloridos,
en este caso las pentosas dan color azul y las hexosas dan color amarillo o café.
EXPERIMENTO 6
En tubos de ensayo se colocan 3 mL del reactivo de Bial ¡PRECAUCIÓN! Añada 0.2 mL de
las siguientes soluciones:
Tubo Solución Clasificación Resultado
1 Glucosa
2 Arabinosa
3 Agua
Caliente los tubos ligeramente sobre la llama del mechero, hasta que se inicie la ebullición,
retire de la flama, diluya cada tubo con 10 mL de agua destilada y agregue 2 mL de butanol. Agite
los tubos, deje reposar y haga su observación.
REACCIÓN DE SELIWANOFF
Esta reacción sirve para diferenciar aldosas de cetosas. Las cetosas reaccionan
rápidamente mientras que las aldosas lo hacen lentamente. El reactivo es una solución de
resorcinol 0.05% en HCl 1:3 recién preparado. Este compuesto es el que se condensa con el
furfural o sus derivados dando productos coloridos.
EXPERIMENTO 7
En 3 tubos de ensayo se coloca 1 mL de los azúcares que se mencionan abajo y agregue a
cada tubo 0.5 mL del reactivo de Seliwanoff y caliente en baño a ebullición exactamente 60
segundos. Anote sus resultados y continúe calentando observando el cambio de color a intervalos
de 1 minuto durante 5 minutos.
Las cetosas dan una coloración rojo fuego y las aldosas la dan muy débil y muy lentamente
EXPERIMENTO 8
En un tubo de ensayo se colocan 2 mL de solución de almidón, en otro se colocan 2 mL de
glucógeno. Añada una gota de lugol y anote el color producido en cada uno de los tubos. El tubo
que contiene el almidón se calienta a ebullición y se deja enfriar nuevamente observando lo que
ocurre con la coloración.
9. OXIDACIONES BIOLÓGICAS
L
a Bioenergética es la manera en que el ser vivo, utiliza y transforma la energía del medio
ambiente. A estos procesos químicos y físicos se les denominaba respiración. Sin embargo
para evitar ambiguedades con el proceso de la entrada y salida de aire de un compartimiento
a otro, se aplica el concepto bioquímico de bioenergética, incluyendo este termino los procesos
fotosintéticos.
Todos los procesos químicos que constituyen la respiración conducen a la oxidación de
sustancias denominadas metabolitos, hasta CO2 y H2O. Por regla general todas las reacciones
de oxidación son exergónicas, es decir, liberan energía cuando se efectúan; en ocasiones toda la
energía se libera en forma de calor, como cuando se quema u oxida un pedazo de madera. Sin
embargo un organismo viviente no es una máquina térmica y, por tanto, debe poseer un
mecanismo enzimático que le permita capturar y almacenar la energía liberada en los procesos de
oxidación. La utilización o captura de la energía involucra la participación de enzimas específicas
capaces de catalizar la conversión del ADP en ATP (reacción endergónica).
Ejemplos de oxidaciones
Oxigenación 2Cu + O2 2CuO
Deshidrogenación H2S S0 + H2
Pérdida de electrones o -1e
ganancia de valencia positiva Fe++ Fe+++
EXPERIMENTO 1
Coloque en un matraz provisto de tapón con válvula de BUNSEN, 0.5 g de fibra de hierro
(Fe°) y 5 mL de H2SO4 al 10%. Caliente a ebullición y observe la disolución parcial del Fe. Deje
enfriar y diluya el sulfato ferroso (FeSO4) obtenido, con 50 mL de agua destilada.
La válvula deja escapar el hidrógeno, pero impide la entrada de aire evitando así la
oxidación de la sal ferrosa formada mediante la siguiente reacción:
La mayor parte de la energía que utilizan los seres vivos deriva de los procesos de
oxidación, y en cada oxidación se desprende una determinada cantidad de energía que el
organismo aprovecha para realizar las funciones vitales y para efectuar fenómenos sintéticos
endergónicos.
Todas las oxidaciones biológicas se caracterizan por su rapidez y por la suavidad con que
se realizan, todas se llevan a cabo en medio acuoso, a pH generalmente neutro y a bajas
temperaturas. Esto hace pensar que todos estos procesos están catalizados por enzimas.
Warburg fue uno de los primeros investigadores que trató de explicar las oxidaciones
biológicas suponiendo una activación del oxígeno.. Actualmente se sabe que en los tejidos
existe un sistema de enzimas que contienen hierro, mediante el cual el oxígeno molecular se
activa y actúa como un agente oxidante.
Wieland Consideraba que el proceso básico en la oxidación de los metabolitos es la
activación del hidrógeno por la acción de enzimas denominadas deshidrogenasas, las cuales
transportan el hidrógeno a diferentes aceptores que pueden ser el oxígeno u otros agentes
oxidantes.
Szent Györgyi concilió las dos teorías al suponer que es necesaria la activación del
hidrógeno y también la del oxígeno. Keilin supuso que interviene como eslabón intermediario
el citocromo.
Sin embargo, las oxidaciones biológicas no son tan sencillas, pues se ha comprobado que
en la oxidación de cada metabolito interviene una gran cantidad de aceptores de hidrógeno.
La glucosa es el más común de los metabolitos debido a que es una molécula altamente
reducida. Cuando se oxida y pierde sus hidrógenos, la liberación de energía de oxidación no se
realiza en forma brusca, sino que intervienen varios transportadores de hidrógeno y se inicia por la
acción de una deshidrogenasa específica que no reacciona directamente con el oxígeno sino que
requiere de intermediarios como el NAD+, flavoproteínas y citocromos.
EXPERIMENTO 3
Cuando el tejido hepático se dispersa en soluciones isotónicas, el núcleo y las mitocondrias
permanecen relativamente inalterados y pueden separarse con facilidad por centrifugación
diferencial.
Al ratón recién sacrificado se le extrae el hígado y se mantiene en hielo hasta el momento
de utilizarlo. Pese el hígado obtenido y fracciónelo finamente con las tijeras y prepare
cuidadosamente un homogeneizado en un mortero previamente enfriado, añadiendo 6
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volúmenes de cloruro de potasio (KCl) 0.15M frío, por cada gramo de hígado. Centrifugue el
homogeneizado en frío a 500 rpm por 15 minutos, separe el sobrenadante y nuevamente
centrifugue éste ahora a 3000 rpm por 15 minutos, separe este segundo sobrenadante y
consérvelo en frío anotando en la etiqueta “SOBRENADANTE DE HÍGADO”. El residuo se
suspende en 6 mL de KCl 0.15M y se conserva también en frío anotando en la etiqueta
correspondiente “SUSPENSIÓN DE HÍGADO”.
Prepare una serie de tubos de ensayo, numérelos y añada los reactivos correspondientes
de acuerdo con las instrucciones de la siguiente tabla.
Tubo 1 2 3 4 5 6
Reactivo
Azul de metileno 0.002M ml 0.3 0.3 0.3 0.3 0.3 0.3
Succinato de sodio 0.1M ml --- 0.5 0.5 --- 0.5 0.5
Malonato de sodio 0.1M ml --- --- 0.5 --- --- 0.5
Agua destilada ml 1.5 1.0 0.5 1.5 1.0 0.5
Suspensión de hígado ml 0.5 0.5 0.5 --- --- ---
Sobrenadante de hígado ml --- --- --- 0.5 0.5 0.5
Mezclar bien el contenido de cada tubo
Vaselina ml 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5
Incubar por 30 minutos a 37°C – 40°C
Una vez agregada la vaselina no agitar el contenido de los tubos e incubar en baño maría
a 37°C y hacer lecturas en los tiempos señalados, anotando en el siguiente cuadro el grado de
coloración, con cruces (de una a tres).
1) Resultados
Tubo 1 2 3 4 5 6
Tiempo
0 min.
10 min.
20 min.
30 min.
2) ¿En cual de las fracciones de hígado deben encontrarse las mitocondrias y por qué?
3) Describa como actúa el malonato de sodio en esta reacción.
4) Explique sus resultados sobre la base del análisis del contenido de cada tubo.
LOCALIZACIÓN Y DEMOSTRACIÓN DE LA
ACTIVIDAD DE LA CITOCROMO - OXIDASA
En el año de 1885 Ehrlich reportó la reacción del indofenol. Observó que inyectando alfa
naftol y dimetil-para-fenilendiamina en animales se formaba en los tejidos una sustancia azul
llamada azul de indofenol. La enzima se denominó indofenol-oxidasa, pero posteriormente se ha
podido comprobar que esta enzima sólo oxida al citocromo c, el cual a su vez oxida al indofenol;
por lo cual ahora se le conoce como citocromo – oxidasa.
EXPERIMENTO 4
Prepare una serie de tubos de ensayo y numérelos. Añada a cada uno los reactivos de
acuerdo a las instrucciones de la tabla siguiente:
Tubo 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
Reactivo
Alfa naftol al 0.15% en etanol al 10% ml 0.5 --- 0.5 0.5 0.5 0.5 --- 0.5 0.5 0.5
Dimetil-para-fenilendiamina al 0.15% ml 0.5 0.5 --- 0.5 0.5 0.5 0.5 --- 0.5 0.5
Agua destilada ml 1.0 1.5 1.5 2.0 0.5 1.0 1.5 1.5 2.0 0.5
KCN al 0.01% NO PIPETEAR ml --- --- --- --- 0.5 --- --- --- --- 0.5
0.5 mL = 10 gotas
Sobrenadante de hígado ml 1.0 1.0 1.0 --- 1.0 --- --- --- --- ---
Suspensión de hígado ml --- --- --- --- --- 1.0 1.0 1.0 --- 1.0
Agite los tubos ocasionalmente, observe la aparición del azul de indofenol y anote sus
resultados en la siguiente tabla:
Tubo
Tiempo 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
min.
0
10
20
30
10. LÍPIDOS
Este es un conjunto heterogéneo de moléculas orgánicas cuyas propiedades comunes son
su insolubilidad en agua y solubilidad en solventes no polares como el benceno, cloroformo, éter,
etc. Por lo que este grupo incluye sustancias de muy diversa estructura. Suelen ser moléculas de
número relativamente alto de átomos de carbono e hidrógeno y bajo en átomos de oxígeno;
ciertos lípidos también poseen átomos de fósforo, nitrógeno y azufre en su molécula.
Cualquier clasificación presenta sus limitaciones y la nomenclatura puede producir falsas
interpretaciones ya que idéntica terminología ha sido empleada por diferentes autores para
denominar a distintos grupos de lípidos. Los lípidos son los compuestos más recientemente
estudiados por ejemplo: prostaglandinas, tromboxanos, leucotrienos, etc., ya que este tipo de
sustancias hace poco se consideraban complejas y de poco interés. Las funciones de los lípidos
son muy variadas y las más aceptadas actualmente son las siguientes:
1. Función estructural, principalmente en las membranas celulares.
2. Actúan como material energético y de reserva.
3. Intervienen en el transporte de compuestos energéticamente activos.
4. Componentes protectores de la pared celular de ciertas bacterias, plantas, insectos y
vertebrados.
5. Sustancias de gran actividad biológica comovitaminas y hormonas. Las cuales se
consideran como verdaderos reguladores metabólicos.
6. Actúan como aislante térmico y protección alrededor de determinados órganos.
REACCIÓN DE HANUS
El grado de insaturación de los ácidos grasos que forman parte de un lípido es uno de los
factores determinantes de sus propiedades físicas, químicas y fisiológicas. Se ha observado
que aparecen más dobles enlaces en los triacilgliceroles de almacenamiento y en los lípidos
estructurales cuando la temperatura ambiente disminuye. Los dobles enlaces disminuyen el
punto de fusión por lo que se cree que sea un mecanismo del organismo para impedir la
cristalización de los lípidos en los tejidos. El reactivo de Hanus es una solución de yodo y
bromo que nos permite determinar el grado de insaturación de un lípido midiendo la capacidad
que tiene para fijar halógenos en su molécula.
EXPERIMENTO 1
Coloque en tubos de ensayo limpios y secos 6 mL de soluciones clorofórmicas al 10% de
aceite de algodón, aceite de cártamo y monoestearilglicerol. Añada a cada tubo 5 gotas del
reactivo de Hanus y agite vigorosamente. Anote cada 30 minutos el grado de decoloración de
cada tubo protegiéndolo de la luz.
Anote sus resultados en la siguiente tabla:
Tiempo minutos
Lípido 30 60 90 120
Aceite de algodón
Aceite de Cártamo
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Monoestearilglicerol
Aceite de ricino
EXPERIMENTO 2
Pese 5 g de cerebro y tritúrelos perfectamente en un mortero con 20 mL de una mezcla
200:100:1 de cloroformo - metanol – ácido clorhídrico por 10 minutos. Una vez obtenido el
homogeneizado agregue 2 mL de HCl 1N, mezcle y centrifugue a 2000 rpm por 10 minutos.
Separe el paquete celular, la fase clorofórmica y la metanólica. Deseche el sedimento. Se
obtienen dos fases:
Clorofórmica, que se usará para la identificación del colesterol, la separación
cromatográfica de fosfolípidos y la formación de membranas.
Metanólica, que servirá para la identificación de cerebrósidos.
EXPERIMENTO 3
Diluya 1:1 con cloroformo, un volumen pequeño (0.5 o 1 ml) del extracto clorofórmico
obtenido en el experimento no. 2. Utilizando una pipeta Pasteur aplique una gota de esta dilución
en tres puntos equidistantes en una cromatoplaca previamente preparada, aproximadamente a 2
cm de altura de la base.
Permita que el cloroformo se evapore y entonces introduzca la placa en una cubeta de
vidrio que contenga como solvente de elución, una mezcla de cloroformo – metanol – ácido
acético – agua (65:25:8:4). Deje desarrollar el cromatograma hasta el frente del solvente ya
marcado; saque la placa de la cubeta y déjela secar. En esta forma se tendrán 3 cromatogramas
idénticos en la misma placa, los cuales se van a revelar con diferentes reactivos. Esto se puede
hacer cubriendo con una placa de vidrio los cromatogramas que no se deseen revelar.
El cromatograma se revelará con ninhidrina que pondrá de manifiesto a los fosfo
aminolípidos. Esta reacccion se lleva a cabo al calentarse a 100°C por 10 minutos.
EXPERIMENTO 4
Utilizando 1 mL del extracto metanólico obtenido en la extracción de lípidos de cerebro,
trate de demostrar la presencia de cerebrósidos utilizando la reacción de Molisch–Udransky
cuya técnica y fundamento ya han sido descritos anteriormente.
REACCIÓN DE LA ACROLEÍNA
EXPERIMENTO 5
Coloque en dos tubos de ensayo secos, un poco de bisulfato de potasio (KHSO4)y añada
de 3 a 5 gotas de glicerina en uno de los tubos y en otro 5 gotas de aceite de algodón, cártamo
o girasol. Caliente cuidadosamente y huela los vapores indirectamente. ¡PRECAUCIÓN!
1) ¿Se puede considerar esta reacción general para cualquier lípido? ¿Por qué?
2) Escriba la reacción que se ha efectuado.
El anhídrido acético se puede condensar con los grupos –OH en posición 3 de los
esteroles como en el colesterol y dar los correspondientes ésteres. Si el esterol tiene un doble
enlace en posición 5, se produce además una epimerización y una deshidratación en
presencia de ácido sulfúrico (H2SO4) concentrado, dando como resultado una serie de
compuestos de estructura desconocida que se caracterizan por tener colores que van del rojo al
azul y del azul al verde. Esta reacción es por lo tanto específica para todos los esteroles que
contengan un OH en posición 3 y un doble enlace en posición 5.
EXPERIMENTO 6
Prepare 2 tubos de ensayo. En el tubo no. 1 coloque 3 mL de solución clorofórmica de
colesterol puro y en el tubo no. 2, 3 mL de solución clorofórmica de colesterol obtenido en la
extracción de lípidos de cerebro en el experimento 2. Añada a los 2 tubos, 1 mL de anhídrido
acético y mezcle bien, finalmente añada lentamente, resbalándolo por las paredes del tubo, 1 mL
de ácido sulfúrico (H2SO4) concentrado.
EXPERIMENTO 7
Preparar 4 tubos de ensayo como se indica en la siguiente tabla colocando las soluciones
con mucho cuidado resbalando por las paredes del tubo para estratificar.
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Tubo
Reactivo 1 2 3 4
Agua destilada ml 5 5 5 5
Azul de metileno mas monoestearato de glicerilo en butanol ml 2 --- --- ---
Azul de metileno mas fosfolípidos en butanol * ml --- 2 --- ---
Azul de metileno mas colesterol en butanol ml --- --- 2 ---
Azul de metileno en butanol ml --- --- --- 2
* 2 mL del extracto clorofórmico obtenido en el experimento 2 se evaporan a
sequedad (cuidando que no se queme), al residuo se le re disuelve con 2 mL de azul
de metileno en butanol y se agrega este contenido al tubo no. 2 de la serie.
Deje los tubos en reposo procurando moverlos lo menos posible y haga observaciones a las
2, 4, y 24 horas.
1) ¿Observó el paso del colorante en todos los tubos?
2) Explique a qué se debe esa diferencia.
E
l control de todos los procesos vitales en la forma tan ordenada que realiza una célula,
como son la transformación de energía en sus diferentes formas, la síntesis de moléculas
propias, la degradación de los metabolitos, el transporte de diferentes materiales a través
de sus membranas, la formación de nuevas células, la diferenciación celular, la creación de
nuevos seres, etc.; se puede explicar debido a la existencia de proteínas específicas,
fundamentalmente enzimas. Sin embargo, para la biosíntesis de proteínas las moléculas que
poseen la información necesaria son el ácido desoxirribonucléico (DNA) y el ácido ribonucléico
(RNA). Estas moléculas son los llamados ácidos nucléicos. Rompiendo la máxima bioquímica de
que todas las enzimas son proteínas, se descubrió que algunos RNA pueden funcionar como
catalizadores.
Los ácidos nucléicos reciben este nombre debido a que en el año de 1871 el químico suizo
Friedrich Miescher logró aislar del núcleo celular una sustancia que llamó nucleína, la cual
debido a su carácter ácido se denominó posteriormente ácido nucleico. Sin embargo, existen
otros tipos de ácidos nucléicos. El ácido desoxirribonucléico se encuentra fundamentalmente en el
núcleo y es el que posee la información genética y la transmite al citoplasma y por ser capaz de
replicarse puede transmitir la información de padres a hijos. En la célula, fuera del núcleo,
normalmente existen tres tipos de ácidos ribonucléicos que son: el ácido ribonucléico ribosomal
(RNAr), el ácido ribonucléico mensajero (RNAm), y el ácido ribonucléico soluble o de transferencia
(RNAt). El RNAr se encuentra en los ribosomas y su peso molecular es de 2,000,000. El RNAm
tiene un peso molecular de 300,000, se forma en el núcleo y lleva la información al citoplasma. El
RNAt tiene un peso molecular de 25,000 a 30,000 y se encuentra disuelto en el citoplasma. El
DNA es una de las biomoléculas más grandes que se conocen hasta ahora y su peso molecular
va de 1,000,000 a 1,000,000,000.
Tanto el DNA como el RNA se encuentran asociados con proteínas fuertemente básicas
(histonas o protaminas) formando las llamadas nucleoproteínas. La estructura química es
similar en todos los ácidos nucléicos, todos están constituidos por bases púricas, bases
pirimídicas, pentosa y ácido fosfórico. El DNA tiene como bases púricas adenina y guanina,
como bases pirimídicas, citosina y timina, como pentosa la 2-desoxiribosa y ácido fosfórico
H3PO4. Los ácidos ribonucléicos tienen como bases púricas la adenina y guanina y como bases
pirimídicas uracilo y citosina, como pentosa la D – ribosa y H3PO4.
Los ácidos nucléicos son macromoléculas formadas por la unión de varios nucleótidos. Un
nucleótido se puede considerar como un éster fosfórico de un nucleósido, que es la unión de
una base púrica o pirimídica con una pentosa. Los mononucleótidos se unen entre sí por
medio de un enlace fosfodiester 3’- 5’, formando los polinucleótidos.
Cuando se desea purificar una sustancia se deben seleccionar las células o tejidos que se
van a utilizar como materia prima. En el caso del DNA esta selección es en especial importante
porque el contenido de DNA es pequeño en la mayor parte de las células. La célula ideal será
aquella que tenga una relación núcleo/citoplasma alta, como en los linfocitos y células del
tumor ascítico de Ehrlich. Sin embargo, no es fácil obtener este tipo de células por lo que
frecuentemente se usan órganos típicamente linfoides como el timo y el bazo.
El primer paso en la extracción del DNA es la homogeneización del tejido. Este paso
puede degradar en parte la molécula del DNA si no se toman las precauciones necesarias, la
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solución reguladora es de citrato 0.01M y NaCl 0.14M, a pH de 7.2 a 7.4; la fuerza iónica de esta
solución hace insoluble a la desoxirribonucleoproteína. Si se centrifuga este homogeneizado, en
el residuo quedarán los restos celulares y las desoxirribonucleoproteínas insolubles. En el
sobrenadante se encuentran compuestos solubles como la mayor parte de los ácidos
ribonucléicos.
Al homogeneizar el tejido se liberan las enzimas de los lisosomas, entre ellas la DNAasa, la
cual hidroliza el DNA. Se sabe que el Mg++ es indispensable para la actividad de esta enzima; si
en la solución existe citrato, éste se une al Mg++ e impide la acción de la DNAasa. Otra forma
de evitar la acción hidrolítica de la enzima es trabajar a temperaturas bajas (0°C a 2°C).
El siguiente paso en la purificación está basado en que las desoxirribonucleoproteínas y
el DNA son solubles en soluciones salinas concentradas, mientras que la mayor parte de las
proteínas precipitan en estas condiciones. Si el residuo se suspende en solución de NaCl 2.6M y
se centrifuga, el residuo insoluble estará formado fundamentalmente por proteínas, mientras que
el DNA permanecerá en solución. Este DNA se puede precipitar selectivamente por la adición
selectiva de 2 volúmenes de alcohol etílico al 95% formándose un precipitado blanco fibroso, el
cual se puede recoger por rotación de un agitador de vidrio con pequeños salientes.
EXPERIMENTO 1
La muestra de bazo se coloca en un mortero, previamente enfriado y se secciona, lo más
finamente posible con una tijera. Se colocan 450 mL de la solución reguladora de citrato 0.01M –
NaCl 0.14M, a pH de 7.2 fría, en una licuadora cuyo vaso haya sido previamente enfriado. Se
hace funcionar la licuadora a baja velocidad y se van añadiendo los trozos de bazo de todos los
equipos, esperando a que se homogeneice completamente el primero antes de añadir el segundo
y así sucesivamente. Una vez terminada la adición, continúe homogeneizando por 30 – 60
segundos más. Se coloca el homogeneizado en tubos de centrífuga apropiados teniendo cuidado
de tarar perfectamente los tubos opuestos ¡PRECAUCIÓN! (CONSULTE A SU MAESTRO). En
frío se centrifuga por 15 minutos a 5 000 rpm. El sobrenadante se desecha. El residuo insoluble
se lava en el mismo tubo con 15 mL de citrato 0.01M – NaCl 0.14M, pH 7.2, agitando hasta
volver a resuspender con ayuda de una varilla de vidrio, si es necesario. Se vuelve a centrifugar a
5 000 rpm por 5 minutos y el sobrenadante se desecha. Al residuo insoluble que contiene el
DNA y residuos celulares se le añaden 15 mL de NaCl 2.6M frío y se homogeneiza por agitación.
El ácido desoxirribonucléico es soluble en esta solución mientras que la mayor parte de las
proteínas son insolubles. Centrifugue a 8 000 rpm por 30 minutos. El líquido sobrenadante
contiene el DNA en solución y el sedimento, que contiene restos celulares y proteínas
insolubles, se desecha. La solución salina sobrenadante se coloca en un vaso de precipitados y
se añaden lentamente dos volúmenes de alcohol etílico al 95%, procurando que la fase
alcohólica quede en la parte superior. Se deberá observar la formación de un precipitado blanco,
denso, en la interfase. Utilizando un agitador con pequeños salientes, agite esta mezcla
lentamente procurando enrollar sobre el agitador las fibras del DNA precipitadas.
1) Explique por qué se utilizó bazo como materia prima y no otro órgano cualquiera.
2) ¿Sería conveniente utilizar solución reguladora de fosfatos para la extracción del DNA?
¿Por qué?
3) ¿Por qué es conveniente trabajar durante toda la extracción a baja temperatura?
Existen varios métodos para identificar y cuantificar a los ácidos nucléicos. El método más
utilizado es el espectrofotométrico, el cual está basado en que tanto el DNA como el RNA
absorben a 260 nm. La absorbancia es proporcional a la concentración del ácido, por lo tanto, el
medir la absorbancia es un método cuantitativo muy sensible y sencillo, pero no distingue entre
DNA y RNA. Es de gran utilidad cuando las muestras están puras.
Una reacción muy utilizada para identificar y cuantificar DNA es la llamada reacción de
Dische, la cual está basada en que el reactivo de difenilamina reacciona específicamente con el
DNA dando una coloración azul cuya intensidad es proporcional a la concentración de DNA.
En realidad, la especificidad de esta reacción no es absoluta, ya que la difenilamina es un reactivo
específico para las 2-desoxipentosas en general, pero en condiciones normales la cantidad de
azúcares capaces de interferir es despreciable.
EXPERIMENTO 2
Prepare una serie de 6 tubos de ensayo y numérelos del 1 al 6. Mida con una pipeta
cuidadosamente 2 mL de solución patrón. Esta solución tiene una concentración de DNA de 1
mg/mL. Colóquela en el tubo no.1. Añada a los tubos 2, 3, 4, 5, 2 mL de agua destilada.
Agregue al tubo no.2, 2 mL de la solución patrón; mezcle perfectamente y transfiera 2 mL de
esta mezcla al tubo no. 3; se mezcla el contenido y se transfieren 2 mL al tubo no. 4. De este
tubo se toman 2 mL y se descartan. El tubo no. 5 será el blanco y en el tubo 6 se colocan 2 mL
de la solución de DNA problema. Añada a todos los tubos 4 mL de reactivo de Dische y agite
vigorosamente y coloque los tubos en baño maría a ebullición por 10 minutos. Inmediatamente
después coloque los tubos en baño maría de hielo – agua durante 5 minutos con objeto de
enfriar su contenido rápidamente.
Los tubos con DNA desarrollan una coloración azul característica con un máximo de
absorción a 600 nm. La intensidad de la coloración se puede determinar cuantitativamente en
el espectrofotómetro. Determine la densidad óptica a 600 nm de todos los tubos utilizando el tubo
no. 5 como blanco.
1) Con los datos de la tabla construya la curva tipo (absorbancia contra mg de DNA)
2) Interpolando la absorbancia del tubo no. 6 encuentre la concentración de DNA (mg/mL)
y calcule la cantidad total de DNA en su problema.
El RNA puede ser cuantificado por espectrofotometría, como ya se explicó. Sin embargo, la
reacción más utilizada para identificar y cuantificar el RNA es la reacción del orcinol, la cual se
caracteriza por dar una coloración verde en presencia de cualquier RNA. La reacción del
orcinol es una modificación de la reacción de Bial para pentosas y es, por tanto, poco específica.
Sin embargo, cuando se trata de muestras razonablemente puras, esta reacción puede ser
utilizada incluso para análisis cuantitativos.
EXPERIMENTO 3
Prepare una serie de seis tubos y numérelos del 1 al 6. Añada a los tubos 2, 3, 4 y 5, 3 mL
de agua destilada; al tubo no.1, 3 mL de la solución patrón de RNA que contendrá 0.300
mg/mL. Añada 3 mL de la misma solución patrón al tubo no. 2, mezcle bien el contenido y
transfiera 3 mL de esta solución al tubo no. 3, mezcle el contenido del tubo no. 3 y añada 3 mL de
esta solución al tubo no. 4. Mezcle bien el contenido y tome 3 mL de esta solución y deséchelos.
El tubo no. 5 será considerado como blanco y al tubo no. 6 se le añaden 3 mL de solución
problema. Añada a todos los tubos 6 mL del reactivo de orcinol ácido y 0.4 mL del reactivo de
orcinol – alcohol. Se mezcla el contenido y se colocan en baño maría a ebullición por 20 minutos.
Una vez fríos se determina la densidad óptica de cada tubo a 660 nm.
Tubo
Reactivo mL 1 2 3 4 5 6
Buffer de acetato 0.1M pH 4.0 7 7 7 7 7 7
Reactivo molibdato ( al 2.5%) 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5
Solución de vitamina C al 1% reciente 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5 0.5
Agua destilada 2
Solución tipo 1 µM/mL 2
Solución tipo 2.5 µM/mL 2
Solución tipo 5 µM/mL 2
Problema DNA 2
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Problema RNA 2
Deje los tubos en reposo a temperatura ambiente por 30 minutos y lea la absorbancia a
660 nm tomando como blanco el tubo no. 1.
1) Con los datos obtenidos con las soluciones tipo, construya la curva tipo para fosfato.
(Densidad óptica contra concentración en mol/mL)
2) ¿Cómo afecta el medio ácido al enlace 3’-5´diéster fosfato?
3) ¿Cómo afecta el medio alcalino al enlace 3’-5´diéster fosfato?