Modelado de sistemas

biolgicos
Eugenio Jacobo Hernndez Valdelamar
http://es.scribd.com/jackhv
SSE !" Sinaloa
#oviembre" $%&$

'genda

(iolog)a: nuevos en*o+ues , herramientas

-odelado de sistemas biol.gicos

/onceptos

0+u1 modelar2

03ara +u1 modelar2

0c.mo modelar2

/asos de estudio

4aboratorio virtual de botnica 5gramticas , modelos *ractales de

crecimiento de plantas6

E7plorador de ecosistemas 5dinmica de poblaciones6

/entro de medicina deportiva 5sistema circulatorio6

/omentarios *inales


8n modelo es la representaci.n de un sistema. Es un marco de
trabajo donde colocar datos , ponerlos a trabajar.
En varios casos" solo es necesario considerar a+uellos
aspectos del sistema +ue a*ectan el problema +ue se investiga.
3or lo anterior se dice +ue un modelo es una simpli*icaci.n del
sistema , solo contiene los componentes relevantes al estudio.
3ueden re+uerirse varios modelos del mismo sistema mientras
la investigaci.n progresa.

Escala nteracciones
-or*olog)a
5*orma6
/omportamiento /omunicaci.n
'spectos
9uncionamiento

03ara +u1 modelar2

3redicci.n

:ise;o

E7perimentaci.n

-ejorar la comprensi.n

n*ormar a la opini.n p<blica

0/.mo hacer un modelo2
-1todo cient)*ico
=
Sistema *ormal de representaci.n
=
>ecnolog)a

3regunta relevante
-odelo ?esultados del modelo
/onclusiones
derivaci.n
anlisis
interpretaci.n
'daptado de http://thearto*modelling.@ordpress.com/$%&$/%&/%&/overvie@/

Abservaci.n
4a Abservaci.n consiste en
e7aminar atentamente los
hechos , *en.menos +ue
tienen lugar en la naturaleza
, +ue pueden ser percibidos
por los sentidos.
/uando un cient)*ico encuentra un hecho o *en.meno interesante lo primero +ue hace es
observarlo con atenci.n.
4a ciencia se basa en evidencias veri*icables. BEvidenciaC es una observaci.n objetiva +ue
cual+uiera puede ver" pesar" medir , veri*icar con e7actitud.
4a observaci.n cient)*ica no es lo mismo +ue simplemente mirar las cosas.
http://@@@.polivirtual.ipn.m7/esia/2pDEEF

Hip.tesis GH variables del modelo
:espu1s de las observaciones" el cient)*ico se
plantea el c.mo , el por+u1 de lo +ue ha ocurrido
, *ormula una hip.tesis.
9ormular una hip.tesis consiste en elaborar una
e7plicaci.n provisional de los hechos observados
, de sus posibles causas.
Las variables de la hiptesis tienen que ser
comprensibles, estar bien definidas y ser lo
ms concretas posible.
La relacin entre variables propuesta por una
hiptesis debe ser clara y verosmil.
Los trminos de la hiptesis y la relacin
planteada entre ellos, deben poder ser
observados y medidos.

:atos GH E7plicaci.n GH -odelo
4os datos recopilados pueden
mostrar patrones o
tendencias" las cuales dan pie
a una posible e7plicaci.n.
4a e7plicaci.n plantea las
relaciones entra las variables
identi*icadas" lo cual puede
dar como resultado:
= e7presiones en un sistema
*ormal
= 8na *unci.n
= un sistema de ecuaciones
= un algoritmo 5aut.mata6
= un mecanismo
:atos GH 3recisi.n del modelo
3ocos datos harn +ue el modelo sea poco precisoI mejorar la calidad
, el volumen de los datos permitir mejorar el modelo.

/omplementando la caja
5negra/blanca6
Sistema
5modelo6
Entradas Salidas
:atos e7perimentales
:atos hist.ricos
Herramientas ,
t1cnicas de
medici.n
Herramientas ,
t1cnicas de
representaci.n
Variables de la hip.tesis Variables de la hip.tesis
E7perimentos

E7perimentaci.n
8na vez *ormulada la hip.tesis" el cient)*ico debe comprobar si es cierta. 3ara ello realizar
m<ltiples e7perimentos modi*icando las variables +ue intervienen en el proceso ,
comprobar si se cumple su hip.tesis.
E7perimentar consiste en reproducir , observar varias veces el hecho o *en.meno +ue se
+uiere estudiar" modi*icando las circunstancias +ue se consideren convenientes.
:urante la e7perimentaci.n" los cient)*icos acostumbran a realizar m<ltiples medidas de
di*erentes magnitudes *)sicas. :e esta manera pueden estudiar +u1 relaci.n e7iste entre
una magnitud , la otra.

E7perimentaci.n por *uerza bruta
'nalizar un genoma haciendo e7perimentos manuales puede llevar una
eternidad. 4as computadoras , las m+uinas son ms e*icientes al realizar tareas
repetitivas.

-odelos biol.gicos , videojuegos
9oldt.>he pla,ers solved an even more important problem. >he, discovered the structure o* a
protein belonging to the -asonG3*izer monke, virus 5-G3-V6" a close relative o* HV that causes
':S in monke,s.
http://blogs.discovermagazine.com/notrocketscience/$%&&/%J/&F/computerGgamersGsolveGproblemGinGaidsGresearchGthatGpuzzledGscientistsG*orG,ears/

/asos de estudio

4os casos de estudio presentados se realizaron

durante el desarrollo de productos educativos.

:ise;ador de
plantas
Kerminador /osechador
:ise;o de *ormas
de tallos , ra)ces
, de*inici.n de
parmetros de crecimiento
/recimiento de plantas
en un ambiente
controlado
/recimiento de plantas
en un ambiente
BrealC
4aboratorio de botnica
'7ioma
?egla de producci.n
:ise;ador de plantas
E7plorador de ecosistemas
L 0Mu1 caracter)sticas tiene un ambiente2
L 0/.mo var)an los recursos del ambiente2
L 0Mu1 tipo de seres vivos viven en un ecosistema2
L 0Mu1 relaciones ha, entre las poblaciones de un ecosistema2
L 0:e +u1 depende el e+uilibrio en un ecosistema2
L 0/.mo varia en el tiempo el numero de individuos de una poblaci.n2 0, de una
comunidad2
L 0/untos nacimientos hubo en una poblaci.n en un a;o2
L 0/untos individuos murieron de una poblaci.n2
L 0Mu1 pasa si no ha, su*iciente comida o agua2
Abjetos
Arganismo
3oblaci.n
Ecosistema
%..N
3roductores
/onsumidores
:escomponedores
-apa
Especie
'mbiente
%..N
&
&
?ecurso
'gua
>ipo de suelo
/olecci.n de
Especies
&..N
Ecosistema
Recursos biticos
Recursos abiticos
Suelo rocoso
Suelo rido
Suelo *1rtil
'gua
3roductor
3roductor
/onsumidor
/onsumidor
/omportamiento abi.tico
3recipitaci.n
>emperatura clida
Ser muerto
:escomponer
(acterias >.7ica
?eglas de comportamiento bi.tico
Mover
omer
!eber
"parear
D vida m7ima Morir
muerto #escomponer
/omportamiento presaGcazador
?ango de percepci.n
3ersecuci.n
Evasi.n
'nlisis de *unciones de un
organismo
3ercibir
ambiente
?eproducir
'limentar
:esplazar
'ctualizar
indicadores
biol.gicos
'parear
v.&.%
0Mu1 es el /-:2
L
El /entro de -edicina :eportiva 5/-:6 es una herramienta
in*ormtica educativa +ue permite al estudiante construir sus
propios conocimientos" comprender , relacionar temas del
cuerpo humano , la salud como:
O
'parato circulatorio , respiratorio.
O
Salud
O Hbitos de ejercicio
$alorar el estado de salud del atleta antes de
someterlo al e%ercicio &medir signos vitales'
(acer que el atleta realice diversos e%ercicios para
me%orar su condicin fsica
Sistema circulatorio
Motor
Conductos
Fluido
Motor = Corazn
Conductos = Venas, Arterias
Fluido = Sangre
Ver video
Sistema de bombeo
Interactan:
-Creando
-Midiendo
-Ordenando
-Consultando
E
n
t
r
a
d
a
s
S
a
l
i
d
a
s
LEdad
L3eso
L9recuencia cardiaca
LVolumen cardiaco
L3armetros circulatorios
LVelocidad de carrera
/lculo de la
resistencia
circulatoria
/lculo de la
presi.n
circulatoria
'ctividad
*)sica
L9recuencia cardiaca
L3resi.n
LVolumen cardiaco
L:istancia recorrida
simula
Experimentan
Modelo del sistema circulatorio
Interactan:
-Experimentando
-Midiendo
-Planeando
-Consultando
LEdad
L'ltura
L3eso
L/ondici.n *)sica
5resistencia6
/lculo de la
asimilaci.n
de energ)a
/lculo del
consumo
de energ)a
'ctividad
*)sica
L3eso
LEnerg)a
L?esistencia
L(alance energ1tico
Simulador
Modelo del sistema
Condiciones
iniciales
'limentaci.n
Entradas
-odelo
Educaci.n
Juego
Herramienta
4aboratorio
3roducto
/omentarios *inales
L 0Mu1 puedo modelar2

>odo o sus partes

L 0:e d.nde obtengo datos2

Salgan al mundo

(ases de datos p<blicas

L 8na observaci.n ms precisa nos lleva a producir tecnolog)as de
medici.n ms so*isticadas.
L P4os libros son un atajoQ Ha, mucho conocimiento" incluso simple"
pero del cual se pueden hacer modelos.
L 3ara obtener un resultado es posible integrar modelos e7istentes.
L 4a simulaci.n complementa la etapa de investigaci.n" permitiendo
realizar un gran volumen de pruebas.
'gradecimientos